PLoS ONE: High Frequency of Fusion Transkriptejä Ottamalla TCF7L2 kolorektaalisyövässä: Novel Fusion Partner ja silmukointivariantteja
tiivistelmä VTI1A-TCF7L2 ilmoitettiin toistuva fuusio geenin peräsuolen syöpä (CRC), havaittiin ilmentyvän kolmessa 97 primäärisyövästä, ja yksi solulinja, NCI-H508, jossa genominen deleetio liittyy kaksi geeniä [1]. Tämän tutkimiseksi fuusio tarkemmin, olemme analysoineet suuren suoritustehon DNA ja RNA sekvensointi tietoja seitsemästä CRC solulinjoista, ja tunnistettu geeni RP11-57H14.3 (ENSG00000225292) uutena fuusio- kumppani TCF7L2 . Fuusio löydettiin sekä genomista ja transcriptome dataa HCT116-solulinjassa. Kolminkertaisena sisäkkäisiä RT-PCR, testasimme sekä uusia fuusio-transkriptin ja VTI1A-TCF7L2 ilmentämiseen sarjassa 106 CRC kudosten, 21 CRC-solulinjat, 14 on normaalia koolonin limakalvoa,
Read more