PLoS ONE: Vaikutus Disease Development, Genomic sijainti ja biologinen toiminta Kopioi numero Muutokset ei-pienisoluinen keuhkosyöpä
tiivistelmä Keuhkosyöpä, josta yli 80% on ei-pienisoluista, on johtava syy syövän liittyvät kuolemat Yhdysvalloissa. Kopioi numero muutokset (CNAs) keuhkosyövän hoidossa on osoitettu olevan asemallisesti ryhmittyneet tietyillä genomialuetta. On kuitenkin epäselvää, onko geenien kopioluvun muutoksia toiminnallisesti ryhmittyneet. Käyttämällä tiheä yhden emäksen monimuotoisuus array, suoritimme genominlaajuisten kopioluvun analyysit suuri kokoelma ei-pienisoluisen keuhkosyövän kasvain (n = 301). Ehdotimme muodollinen tilastollinen testi CNAs eri ryhmien välillä (esimerkiksi ei-mukana keuhko- vs. kasvaimia, varhaisen vs. myöhäisen vaiheen kasvaimia). Olemme myös räätälöityjä geeni asetettu rikastamiseen analyysi (GSEA)
Read more