PLoS ONE: CMS: Web-pohjainen järjestelmä visualisointi ja analysointi genominlaajuisten metylointi Tiedot ihmisen syövissä
tiivistelmä Background DNA metylaatio promoottori CpG-saarekkeiden liittyy geenisuppression, ja sen ainutlaatuinen genominlaajuisten profiilit on liitetty syövän etenemiseen. Yhdessä suurikapasiteettisten sekvensointiteknologioihin, se voi nyt tehokkaasti määrittää genominlaajuisten metylaatio profiilit syöpäsoluissa. Myös kokeellisia ja laskennallisia tekniikat tekevät mahdolliseksi löytää toiminnallinen suhde syöpäspesifisessä metylaation ja niiden kliinis parametrit. Menetelmät /Principal Havainnot Cancer methylome (CMS) on web -pohjainen tietokanta sovellus on suunniteltu visualisointiin, vertailu ja tilastollinen analyysi ihmisen syöpää erityisiä DNA: n metylaatio. Metylointi intensiteetit saatiin MBDCap-sekvensointi, pre-käsitellään ja tallennetaan tietokantaan. 191 potilaan näytettä
Read more