Krooninen sairaus

tiivistelmä

RAS yhdistys verkkotunnuksen perheen proteiini 1a (RASSF1A) on otaksuttu tuumorisuppressorigeeniä sijaitsevat 3p21, on pidetty pelaa tärkeä rooli säätelyssä erilaisten ihmisen kasvainten. Aiemmat raportit osoittivat, että taajuus RASSF1A metylaatio oli merkitsevästi suurempi potilailla ryhmässä verrattuna kontrolleihin, mutta suhde RASSF1A promoottorin metylaation ja patologisia piirteitä tai kasvaimen virtsarakon syöpä on edelleen kiistanalainen. Siksi meta-analyysi julkaistut tutkimukset vaikutukset on tutkittava RASSF1A metylaatiostatuksen virtsarakon syövän esiintymisen ja yhdistys sekä pTNM (p, patologinen vaiheessa; T, kasvaimen koon, N solmun tila, M, metastaattisen tila) ja kasvaimen arvosana virtsarakon syöpä suoritettiin tutkimus. Yhteensä 10 tukikelpoisten tutkimuksessa, joihin osallistui 543 tapausta ja 217 kontrollia sisällytettiin yhdistetyssä analyyseissä. Alle kiinteiden vaikutusten malli, OR RASSF1A metylaation virtsarakon syöpäpotilailla, verrattuna ei-syöpä valvontaa, oli 8 40 95% CI = 4. 96-14. 23. Yhdistetty TAI kanssa random-vaikutusten malli pTNM ja kasvaimen in RASSF1A metyloituja potilailla verrattuna metyloimatonta potilaille, oli 0. 75 (95% CI = 0. 28-1. 99) ja 0. 39 (95% CI = 0. 14-1. 09). Tämä tutkimus osoitti, että RASSF1A metylaatio näyttää olevan riippumaton ennustetekijä virtsarakon syövän. Esillä olevat havainnot myös pyytää vahvistuksen kautta suunniteltu asianmukaisesti tulevaisuudentutkimusta.

Citation: Gao T, Wang S, hän B, Pan Y, Song G, Gu L, et al. (2012) Association of RAS Association Domain Family Protein1A (RASSF1A) Metylointi valtiot ja virtsarakon syövän riski: järjestelmällinen katsaus ja meta-analyysi. PLoS ONE 7 (11): e48300. doi: 10,1371 /journal.pone.0048300

Editor: William B. Coleman, University of North Carolina School of Medicine, Yhdysvallat

vastaanotettu: 24 heinäkuu 2012; Hyväksytty: 20 syyskuu 2012; Julkaistu: 06 marraskuu 2012

Copyright: © 2012 Gao et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tutkimus tukivat National luonteeltaan Science Foundation of China (81172141 /H1611; https://isisn.nsfc.gov.cn/egrantweb/). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Virtsarakon syöpä on yleisin maligniteetti virtsateiden, ja yhdeksäs yleisin syöpä diagnoosi maailmanlaajuisesti yli 330 000 uutta tapausta vuosittain ja yli 130 000 kuolemantapausta vuodessa. On yleisesti arvioitu, että mies: nainen ilmaantuvuussuhde on 3. 08:01. 0 [1]. Histologinen ja patologinen tyyppi virtsarakon syöpä on pääosin urothelial karsinooma, jota kutsutaan myös siirtymäkauden cell carcinoma, noin 90% [2]. Muunlaiset lukien okasolusyöpä ja adenokarsinooma, osuus on 3-7% ja 2%: lla [3].

DNA: n metylaatio promoottorialueiden on nousemassa suuria mekanismi inaktivaation APT (tuumorisuppressorin geeni). DNA metyloitu vain sytosiinit sijaitsee 5’gua- CpG dinukleotideissä ja DNA: n metylaatio on usein epigeneettiset tapahtuma monissa ihmisen syövissä [4]. Tämä muutos on merkittävä regula-tory vaikutuksia geenien ilmentyminen, varsinkin kun mukana on CpG-rikkaiden alueiden tunnetaan CpG saaret, joka sijaitsee promoottorialueissa monien geenien. Monissa tapauksissa, poikkeava metylaatio CpG-saarekkeen geenit on korreloitu menetys geenin ilmentymisen, ja on ehdotettu, että DNA: n metylaatio tarjoaa vaihtoehtoisen reitin geenin deleetio tai mutaatio menetyksestä TSG-toiminto. Merkkiaineita poikkeava metylaatio voivat edustaa lupaavaa tapa seurata esiintyminen ja etenemiseen syövän. RASSF1 (Ras-yhdistys domain perhe 1) proteiinien perhe edustaa luokan Ras efektorien omistavia kasvain ehkäisevästä ominaisuuksia. RASSF1A, yksi seitsemästä eri isoformeja RASSF1, on oletettu tuumorisuppressorigeenin sijaitsee 3p21, alue yhteisen heterotsygoottisten ja homotsygoottisia deleetioita eri ihmisen kasvaimissa [5] – [6]. Se jakaa korkea sekvenssihomologia tunnetun hiiriproteiinipitoisia (Nore1) ja voi toimia efektori joka välittää apoptoottisen vaikutuksensa sitoutumalla Ras on guanosiinitrifosfaatin riippuvaisella tavalla [6]. Myöhemmät raportit osoittavat, että hypermetylaatiota CpG saarilla RASSF1A promoottorialueen, pikemmin kuin klassinen mutaatio /poisto tapahtumia, ovat suurin syy loss of ilmaisun [6]. Solut, jotka käsitelty demetylaatio aineiden uudelleen express RASSF1A vahvistaa tehtävän DNA: n metylaation inaktivoinnissa RASSF1A kasvainsolulinjoissa [7]. Monissa ihmisen kiinteiden elinten kasvaimet, metylaatio RASSF1 on tunnistettu [Genebank Accession # AC002481, nukleotidit 17730-18370], ja sen taajuus vaihtelee välillä 30% ja 50% [8], [9]. Lisäksi RASSF1A metylaatio raportoitu prognostisena indikaattorina munuaissolukarsinooma, ei-pienisoluinen keuhkosyöpä, neuroblastooma, melanooma, kohdun limakalvon syöpä ja rintasyöpä [10] – [17]. Kaikki nämä havainnot ehdotti, että se voisi olla keskeinen rooli kehitettäessä ihmisen syövän.

Huolimatta useista yksittäisistä tutkimuksista suoritettiin virtsarakon syöpäpotilailla, ennustetyöväline arvo RASSF1A metylaatiostatuksen virtsarakon syöpä potilaan diagnoosin ja suhde RASSF1A metylaatio ja patologisia piirteitä tai kasvaimen virtsarakon syöpä on edelleen kiistanalainen. Siksi systemaattinen tarkastelu suoritettiin kirjallisuuden meta-analyysi saada tarkemman arvioinnin sen ennusteen arvioinnissa virtsarakon syöpään.

Materiaalit ja menetelmät

Julkaisu valinta

Tutkimukset tunnistettiin kautta sähköinen haku PubMed ja EMBASE käyttäen seuraavia avainsanoja: virtsarakon syöpä, UBC, RAS yhdistys domain perhe protein1A, RASSF1A, metylaatio, prognoosi-, ennuste, patologisia piirteitä ja kasvaimen. Olemme myös itse etsinyt viittaukset näistä julkaisuista voidakseen hakea lisätutkimuksia. Vain ne julkaistaan ​​koko teksti artikkeleita ja Englanti olivat mukana ehdokkaina. Haku päivitetty 28. heinäkuuta 2012.

Jokainen piste edustaa erillisen tutkimuksen osoitettuun -alueella. Logor luonnollinen logaritmi OR, vaakasuora viiva keskimääräinen vaikutus koko. Kuva. 1: Begg n suppilo juoni julkaisun bias testin.

ja poissulkukriteereitä

Tutkimukset valittiin analysoitavaksi, jos ne täyttävät seuraavat kriteerit: 1) ne olivat alkuperäisessä epidemiologista tutkimuksia korrelaatio RASSF1A promoottorin metylaation ja ennusteen virtsarakon syöpäpotilailla, patologisia piirteitä tai kasvaimen virtsarakon syöpään; 2) RASSF1A metylaatiostatuksen tutkittiin käyttäen metylaatiospesifinen PCR (MSP) tai kvantitatiivinen MSP (QMSP); 3) aiheista jokaisessa Tutkimukseen potilasta ja ei-syöpä valvontaa; 3) arvioinnit lienevät täysin teksti paitsi tiivistelmiä tarvittavat tiedot louhinta; 4) kun sama potilasryhmässä raportoitu useissa julkaisuissa, vain viimeisin raportti tai täydellisin yksi oli sisällytetty tähän analyysiin välttää päällekkäisyyden ikäryhmät; 5) potilaiden määrä ja tarkastusten jokaisessa tutkimuksessa pitäisi olla yli 3 vastaavasti.

Tiedonkeruu

Kunkin voivat tutkimuksessa keräsimme tietoa tekijöiden, vuosi ja lähde julkaisu, maa alkuperän, mukaanottokriteerinä, poissulkemisperusteet, patologiset ominaisuudet, kasvaimen, RASSF1A metylointi taajuuksien syöpäsolujen valvonta ja potilaiden virtsarakon syöpään ja menetelmä metylaation havaitsemiseen. Kaikki mukana tutkimuksissa käytettiin ei-syöpä ihmisiä kuin kontrolliryhmä, vaikka jotkut niistä eivät toimittaneet määritelmää noncancer. Tutkimuksissa määrittelyssä ei-syöpä ihmisiä, on kaksi määritelmää: (1) normaali terve ihminen; (2) henkilöä, joilla urologisissa tauti, mutta ei ole aiempaa urogenitaalinen maligniteetti. Koska on mahdotonta määritellä uudelleen syöpäsolujen ihmiset yhtenäinen standardi, yhdistimme syöpäsolujen ihmiset meidän meta-analyysi mukaan niiden alkuperäisessä ryhmässä kussakin tutkimuksessa. Näiden tutkimusten, kasvaimen ≤1 määriteltiin matala-asteista, ja kasvaimen ≥2 määriteltiin korkealaatuisesta, jotka on määritelty solun erilaistumisen. Lopullinen oikeutettuja artikkeleita valitaan edelleen meta-analyysissä arvioitiin itsenäisesti kaksi arvioijat. Pieniä epätarkkuuksia ratkaistiin tekijöiden keskusteluun.

Meta-analyysi ja tilastollinen analyysi

Tärkein analyysi tutki eroja taajuutta RASSF1A metylaation välillä virtsarakon syövän potilaiden ja ei-syöpä henkilöitä kerroinsuhde (OR), jossa vastaava 95% CI. Lisäksi vahvuus yhdistyksen välillä RASSF1A metylaatio ja potilaiden pTNM (p, patologinen vaiheessa; T, kasvaimen koon, N solmun tila, M, metastaattisen tila) ja kasvaimen myös arvioi tai vastaavan 95%: n luottamusväli. Arvioida heterogeenisuus tutkimuksissa, tilastollinen testi heterogeenisuus suoritettiin tilastojen perusteella [18]. Jos tutkimukset osoitettiin olevan homogeeninen P 0. 05 Q-tilastot, yhteenveto OR laskettiin jonka kiinteiden vaikutusten malli (Mantel-Haenszel menetelmä), kun Tutkimusten välisten heterogeenisuus oli poissa [19]. Muuten, satunnainen-vaikutusten malli (jäljempänä Dersimonian ja Laird menetelmä) valittiin [20]. Lisäksi ositettu analyysit suoritetaan myös materiaalin ja menetelmän. Lisäksi Herkkyysanalyysien jonka yksi tutkimuksen meta-analyysi poistetaan joka kerta määrittää vaikutuksen yksittäiset tiedot asetetaan yleistä yhdistettyä OR, arvioimiseksi suoritettiin vakautta tuloksia. Mahdollista julkaisu bias tutkittiin visuaalisesti suppilon kuvaajaa, jossa log [OR] vastaan ​​sen keskivirhe (SE), ja epäsymmetria testattiin Egger testillä [21]. Tämä meta-analyysi suoritettiin käyttäen ohjelmistoa STATA version 12. 0. Kaikki P-arvot perustuivat kaksipuolisen testejä ja P-arvo on pienempi kuin 0. 05 pidettiin tilastollisesti merkitsevä.

Tulokset

tutkimus Ominaisuudet

mukaan meidän kriteereillä, yhteensä 10 voivat tutkimusten [22] – [31], joihin liittyy 543 tapausta ja 217 kontrollia sisällytettiin yhdistetyssä analyyseissä. Ominaisuudet Näiden tutkimusten yhteenveto on esitetty taulukossa 1. Näistä tutkimuksista, kuusi tutkimukset tehtiin Aasiassa, kaksi oli Euroopassa, ja loput Yhdysvalloissa, Brasiliassa. Metyloidut RASSF1A tasot havaittiin käyttäen joko metylaatiospesifisen PCR (MSP) [22], [24], [25], [28] – [31], tai kvantitatiivinen metylaatio PCR (QMSP) [23], [26], [ ,,,0],27]. DNA metylaatiostatuksen RASSF1A promoottorin arvioitiin virtsaan tai kasvaimen kudokset. Virtsarakon syöpiä varmistettiin histologisesti tai patologisesti kaikissa tutkimuksissa.

Meta-analyysin

yleensä taajuudet RASSF1A metylaation testattiin kymmenen tutkimuksilla. Tärkeimmät tulokset on esitetty yhteenvetona taulukossa 2. Alle kiinteiden vaikutusten malli, yhdistettyjen OR RASSF1A metylaation virtsarakon syöpäpotilailla, verrattuna ei-syöpä valvontaa, oli 8 40 95% CI = 4. 96-14. 23. kerrostunut analyysi materiaalia, lisäsi merkittävästi riskejä löytyi virtsanäytteistä in detction RASSF1A metylaation virtsarakon syöpä (OR = 7. 29, 95% CI = 4. 20-12. 65) ja kudoksissa (OR = 28 . 76, 95% CI = 3. 73-221. 59). Kuten ositettu analyysi menetelmällä, merkittävästi lisääntyneitä riskejä havaittiin myös MSP (OR 14. 76, 95% CI = 6. 89-31. 61) ja QMSP (OR = 3. 68, 95% CI = 1. 69-8 . 03). Vuonna arvioinnissa RASSF1A metylaation ja pTNM /laatu virtsarakon syövän, kukin toteutettiin kuudessa tutkimuksessa. Tärkeimmät tulokset on esitetty yhteenvetona taulukossa 3. Under the random-vaikutusten malli, yhdistettyjen OR pTNM ja kasvaimen in RASSF1A metyloituja potilailla verrattuna metyloitumattomat potilaille oli 0. 75 (95% CI = 0. 28-1. 99) ja 0. 39 (95% CI = 0. 14-1. 09).

herkkyysanalyysi

Herkkyysanalyysi osoitti, että neljä riippumatonta tutkimusta olivat päälähde heterogeenisyys [22] – [ ,,,0],25]. Sitten heterogeenisuus RASSF1A metylaation virtsarakon syöpäpotilailla, verrattuna ei-syövän valvontaa todettu heikentyvän, kun nämä neljä tutkimukset poistettiin (P = 0,49). Lisäksi, mikään muu yksittäinen tutkimus havaittiin vaikuttavan yhdistettiin OR kuten on esitetty herkkyysanalyyseja.

Julkaisu Bias

Kuten kuviossa 1 on esitetty, muoto suppilon koealojen näytti epäsymmetrisiä metylaatio vertailu virtsarakon syövän potilaiden ja ei-syöpä valvontaa, jotka viittaavat julkaisun puolueellisuudesta. Sitten Egger testi antaa tilastollista näyttöä suppilon juoni epäsymmetrian (t = 5 14, P = 0. 001). Säädä tätä harhaa, trim-ja täyttö kehittämä menetelmä Duval ja Tweedie [32] toteutettiin (kuva 2). Meta-analyysin kanssa tai ilman trim-ja-täyttö tapa ei tehdä erilaisia ​​johtopäätöksiä, mikä osoittaa, että tulokset olivat tilastollisesti varmana. Suppilo juoni ja Egger testi tehtiin arvioimiseksi julkaisun harha tutkimuksissa yhdistyksen välillä RASSF1A metylaatio ja pTNM /laatu, muoto suppilon juoni ei osoittanut mitään merkkejä ilmeinen epäsymmetrisyyttä (kuva ei näy) ja Egger testi ehdotti puuttuessa julkaisun bias (P 0. 05).

keskustelu

tulokset systemaattinen tarkastelu osoitti, että RASSF1A metylaation virtsarakon syövän liittyi kasvaimen riski joko havaittu virtsassa tai kudokseen MSP tai QMSP. Kuitenkin RASSF1A metylointi ei liittynyt lisääntynyt riski kehittää patologisia piirteitä tai kasvaimen virtsarakon syövän verrattuna btween RASSF1A metyloitu virtsarakon cnacer potilaiden ja metyloitumaton potilaat.

Kertyneet tiedot dokumentoitu, että virtsarakon syöpäpotilailla aina näytä RASSF1A metylaatio [31]. Aiemmat raportit osoittivat myös, että geneettinen muunnelmia RASSF1A vaikuttaa virtsarakon syöpä alttiuteen [28] ja taajuus RASSF1A metylaatio havaittiin olevan huomattavasti suurempi potilailla ryhmässä verrattuna kontrolleihin [27], [28]. Edelleen vahvistaa RASSF1A promoottori metylaatiostatuksen virtsarakon syövän potilaan diagnoosin, toteutimme meta-analyysi 10 tutkimuksissa, joissa 543 tapausta ja 217 valvontaa johtaa tarkemman arvion yhdistyksen. Tuloksemme ehdotti, että RASSF1A metylaatio on mahdollinen riskitekijä virtsarakon syöpää havaittu sekä virtsasta ja kasvaimen kudokset. Taajuus RASSF1A metylaation virtsarakon syöpäpotilailla oli 8. 40 kertaa korkeampi kuin ei-syöpä ihmisiä. Kuitenkin MSP on nonquantitative nonfluorometric PCR-menetelmän tutkia promoottorin metylaation. Tämä menetelmä ei ehkä havaita pieniä pitoisuuksia metyloitu alleelien, toisin kuin QMSP joka voi havaita jopa 1/1000 metyloidut alleelit [27]. Tässä meta-analyysissä, molemmat esittää myönteinen vaikutus havaitsemisen RASSF1A metylaatio. Lisäksi usein metylaatio havaittiin RASSF1A merkittäviä yhdistysten kanssa kasvaimen vaiheesta, laatu ja lihasten invasiivisuus [30], [38], jonka ei todettu muissa tutkimuksissa [27], [31]. Voit ratkaista ristiriitaisia ​​tuloksia, myös suorittaa meta-analyysi, joka osoitti, että tiheys RASSF1A metylaation ei korreloinut pTNM tai kasvaimen virtsarakon syöpäpotilailla. Nämä tulokset viittaavat siihen, että inaktivointi RASSF1A voi olla varhainen tapahtuma virtsarakon syövän synnyssä.

Epigeneettiset muutokset ovat tunnusmerkki ihmisen syövän. Erityisesti DNA: n metylaatio on yhteinen mekanismi inaktivoimaan kasvaimeen vaimennin ja muut syövän geenien kasvainsoluissa [33]. Poikkeavan metylaation on käytetty kohteina havaitsemiseksi kasvainsolujen kliinisistä näytteistä, kuten kudosnäytteistä tai ruumiinnesteiden [34]. RAS yhdistys verkkotunnuksen perheen proteiini 1A (RASSF1A) on otaksuttu tuumorisuppressorigeeniä sijaitsevat 3p21, on pidetty pelaa tärkeä rooli säätelyssä erilaisten ihmisen kasvainten [5], [6]. On hyvin dokumentoitu, että Ras proteiinit sitovat monipuolisista efektorimolekyylien ja välittävät kasvaimen tukahduttava vaikutuksia, kuten terminaali- erilaistuminen ja apoptoosin sekä kasvaimia aiheuttavalle vaikutukselle [35], [36]. Lisäksi aktivointi Ras-signalointireitin on merkittävä tapahtuma prosessissa syövän kehittymisen. Mutaatiot sisällä Ras esikasvaintekijän esiintyy yleisesti syövän, mikä sen hyperactivation, poikkeava kasvu signalointi, ja valitsematta soluproliferaatiota. Ehdotettiin, että RASSF1 voi välittää Ras-aktivoitu kasvun inhibition kautta proapoptoottiset toiminta ja RASSF1A inaktivointi voi olla kasvaimia mekanismi, joka on erillään onkogeenisistä aktivointi Ras signaloinnin kasvaimissa [37]. Aikaisemmat tutkimukset ovat myös osoittaneet, että arseeni saastuminen liittyy DAPK ja RASSF1A metylaatio virtsarakon syöpä [39], [40]. Se voi myös olla yksi niistä tekijöistä, jotka edistävät tätä erillisiä metyloinnin epigenotype.

Onhan tämä meta-analyysi on vielä olemassa joitakin rajoituksia. Ensinnäkin valvonta mukaan analyysiin eivät olleet yhteneväiset. Useimmat tarkastukset olivat terveitä väestöstä vaikka jotkut niistä olivat potilaita. Tällä tavoin osittain valvonnan, erityisesti niille, joilla on hyvänlaatuinen sairaus pitäisi olla erilaisia ​​riskejä kärsivät virtsarakon syöpään. Toiseksi, oli vain kaksi tutkimusta havaitseminen kudoksissa alaryhmäanalyysissä. Näytteen koko oli liian pieni on merkittäviä valta tutkia todellisia -alueella. Kolmanneksi oli vain kuusi kirjallisuutta kirjoilla meta-analyysi yhdistyksen välillä metylaation ja pTNM /laatu, ja Tutkimusten välisten heterogeenisuus havaittiin. Näin ollen, yhdistetyt syrjäisimpien laskettiin satunnainen mallin. Neljänneksi, yksityiskohtaiset tiedot (kuten ikä, sukupuoli, ja life-style) ei voitu jäljittää niin, että oikaisematon arvioita olisi vahvistettava lisätutkimuksia.

Johtopäätös

meta-analyysi ehdotti, että havaitseminen RASSF1A metylaation huokoiset virtsassa on mahdollinen ei-invasiivisia diagnostinen työkalu virtsarakon syöpään. On tarpeen suorittaa suuri otoskoko tutkimuksia yhdistyksen välillä RASSF1A metylaatio ja virtsarakon syövän riskiä, ​​joka lopulta johtaa meidän ymmärtää paremmin.