Krooninen sairaus

tiivistelmä

TP53

mutaatioita on osoittautuneet dominoivat munasarjasyövän tutkielma Cancer Genome Atlas (TCGA). Kuitenkin molekyyli ominaisuudet toistuvat munasarjojen syöpien seuraavat hoidon alussa on huonosti arvioitu. Tämä oli tutkia mallia somaattisten pistemutaatioiden Hyväksytty pariksi näytteitä primääristen ja uusiutuvien munasarjan epiteelin syövät, käyttäen OncoMap mutaation havaitsemiseen protokollaa. Olemme mukautettu suurikapasiteettisten genotyyppitestien alustan määrittää mutaatio aseman suuren paneelin tunnettujen syövän geenien. OncoMap v.4.4 arvioimiseksi käytettiin genomista DNA: ta, joka on eristetty joukko 92 formaliinilla kiinnitetyt, parafiiniin upotetut (FFPE) kasvaimet, joka koostuu sovitettu pariksi näytteitä aluksi diagnosoidaan ja toistuva kasvaimia 46 epiteelin munasarjasyöpä (EOC) potilailla. Mutaatiot havaittiin 33,7% näytteistä, 29,3% näistä näytteistä, jossa on yksi mutaatio ja loput 4,3%, jossa on kaksi tai useampia mutaatioita. Niistä 41 geenit analysoidaan, 35 mutaatiot löydettiin neljästä geenistä, nimittäin

CDKN2A

(2,2%),

KRAS

(6,5%),

MLH1

(8,2% ) ja

TP53

(20,7%).

TP53

oli useimmin mutatoitu geeni, mutta ei ollut korrelaatiota läsnä mutaation minkä tahansa geenin ja kliinisen ennusteen. Lisäksi somaattiset mutaatiot eivät eronneet primääristen ja uusiutuvien munasarjakarsinoomat. Jokainen mutaatio läsnä toistuvia näytteissä havaittiin vastaavan perusnäytteen. Yhteenvetona nämä OncoMap tiedot Korean EOC näytteitä, jotka somaattiset mutaatiot löydettiin

CDKN2A

,

KRAS

,

MLH1

, ja

TP53

. Mitään eroja mutaatiostatuksesta riippumatta välillä ensisijainen ja toistuvien näytteiden havaittiin. Ymmärtää biologia kasvaimen uusiutumisen epiteelin munasarjasyöpä, lisää tutkimuksia tarvitaan, kuten epigeneettiset muutokset tai lisälaitteet mutaatiot muissa geeneissä.

Citation: Kim YM, Lee SW, Chun SM, Kim DY, Kim JH, Kim KR, et al. (2014) analyysi ja vertailu Somaattiset mutaatiot Paired Ensisijainen ja Toistuvat epiteelikasvaimet munasarjasyöpä Näytteet. PLoS ONE 9 (6): e99451. doi: 10,1371 /journal.pone.0099451

Editor: Anthony W. I. Lo, Kiinan University of Hong Kong, Hongkong

vastaanotettu: 08 helmikuu 2014; Hyväksytty: 14 toukokuu 2014; Julkaistu: 17 kesäkuu 2014

Copyright: © 2014 Kim et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus tukivat myöntämisestä johtava ulkomainen tutkimuslaitoksen rekrytointiohjelma kautta National Research Foundation of Korea (NRF) rahoittama opetus-, Science and Technology (MEST) (2011-0030105). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Munasarjasyöpä on yleisin kuolinsyy gynekologisia maligniteetteja [1]. Standardi hoito on kirurginen cytoreduction seuraa platinapohjaisen kemoterapian. Kuitenkin useimmat potilaat lopulta relapsi ja kuolevat Chemo-resistenttejä. Valitettavasti käytettävissä meripelastus hoito platinaa tulenkestävä munasarjasyöpä ovat tuottaneet pettymyksen tulosta, koska vastaus on alhainen (20-50%) ja vastaukset ovat kestoltaan lyhyitä. Tämän vuoksi on tarpeen tutkia uusia hoitostrategioiden sekä äskettäin diagnosoitu potilailla sekä potilailla, joilla on uusiutuva syöpä [2]. Erityisesti uusia keinoja molecularly ja geneettisesti luonteenomaiset munasarjasyövän ovat tarpeen mukauttaa ja parantaa hoidon [3].

Somaattiset mutaatiot onkogeenien on havaittu monissa ihmisen syövissä ja tiedetään ennustavan huumeiden herkkyys tai lääkeresistenssi [4]. Somaattisista mutaatioista yli 30 onkogeenien ja tuumorisuppressorigeenit, jotka on liitetty munasarjojen onkogeneesiin havaittiin munasarjan epiteelin syövän (EOC) näytteitä. Geneettisiä muutoksia ajaa muuttunut signalointi että indusoi; inhiboi apoptoosia; lohkot anoikis; lisää liikkuvuutta, tarttuvuus, ja invaasio; ja houkuttelee peruskudoskomponentit, mukaan lukien mesenkymaaliset kantasolut ja verisuonten endoteelisolujen [5]. Tämä onkogeeni riippuvuus luo pohjan hoitoja kohdistamista onkogeenien, kuten menestyksekäs käyttö imatinibin ja erlotinibin syöpiä että satama

BCL-ABL

ja

EGFR

muutoksia vastaavasti. Kuitenkin mutaation spektrin munasarjasyövän on yllättävän yksinkertainen, kuten on esitetty tutkimuksessa The Cancer Genome Atlas (TCGA). Mutaatiot

TP53

vallalla, joita oli vähintään 96% korkealaatuisesta serous munasarjasyövän näytteitä; Lisäksi

BRCA1

ja

BRCA2

mutatoitiin 22%: n kasvaimia, mikä johtuu yhdistelmän ituradan ja somaattisista mutaatioista. Seitsemän muuta merkittävästi mutatoituja geenejä tunnistettiin, mutta vain 2-6% korkealaatuisesta serous munasarjasyöpään näytteitä [6].

Olemme mukautettu suurikapasiteettisten genotyyppitestien alustan määrittää mutaatio aseman suuren paneeli tunnetaan syövän onkogeenien tunnistamiseksi osajoukot munasarjasyöpä potilaille, jotka saattavat hyötyä täsmähoitoihin liittyvät niiden tautitilannetta [7] – [10]. Tämä genotyypityksen alusta, nimeltään OncoMap työllistää massaspektrometrinen-pohjainen genotyypityksen teknologia (Sequenom) tunnistaa 471 onkogeenisen mutaatioita 41 yleisesti muuntunut geenejä (taulukko S1). Tämä tutkimus raportoi tyyppi ja taajuus somaattisten pistemutaatioita pariksi primääristen ja uusiutuvien EOC näytteitä OncoMap.

Methods

Potilaat

ASAN Center for Cancer Genome Discovery (CCGD ), yhteistyössä Dana-Farber Cancer Institute (DFCI), on kehittänyt OncoMap genotyypityksen platform [8]. OncoMap v.4.4 avulla analysoitiin joukko 92 formaliinilla kiinnitetyt, parafiiniin upotetut (FFPE) EOC näytteitä koostuu Hyväksytty pariksi näytteitä aluksi diagnosoidaan ja toistuva kasvaimia 46 potilasta hoidettiin ASANin Medical Center, Korea, tammikuusta 2002 lähtien joulukuuhun 2011. Kaikkia potilaita oli hoidettu aluksi sytoreduktiivisen leikkausta seuraa platinapohjaisen kemoterapian ja sai toisen sytoreduktiivisen leikkausta, koska toistuvat tai etäpesäkkeitä. Kaikki tuumorinäytteet saatu FFPE Tuumorinäytteet perustuu 80%: n katkaisu kasvaimen näytteen puhtauden. Tutkimus hyväksyi ASANin Medical Center Institutional Review Board (AMC IRB), ja valitsimme potilailla, jotka oli kirjoittanut tietoisen suostumuksen käyttävät arkistointiin kudoksia geneettisen testauksen. Kaikki tiedot on poistettu tunnistetiedot.

DNA Extraction

Katsaus kaikki H Sequenom, San Diego, CA), 10 ng per reaktio. Ylimääräinen 50-80 ng DNA: ta käytettiin sitten homogeenisen Mass Extension (HME) validointi mutaation ehdokkaita, jotka tunnistetaan iPLEX reaktion. Multiplex-PCR-monistus suoritettiin 10 ng genomista DNA: ta lopulliseen tilavuuteen 5 ui 384-kuoppalevylle, jossa oli 0,5 U HotStarTaq-DNA-polymeraasia (Qiagen), 0,12 uM kutakin PCR-aluketta, 500 uM dNTP-seosta, ja 3,5 mM MgCl

2, käyttämällä DNA Engine Dyad Cycler (Bio-Rad, USA). Multiplex PCR ajettiin seuraavalla ohjelmalla: 95 ° C 15 minuutin ajan; 45 sykliä 95 ° C 20 sekuntia, 56 ° C 30 sekuntia ja 72 ° C: ssa 60 sekuntia; sitten 72 ° C: ssa 3 min. Jäljellä deoksinukleotidien, että PCR-tuotteet inaktivoitiin inkuboimalla 40 minuuttia 37 ° C: ssa 2 ul: katkaravun alkalista fosfataasia (SAP) päässä iPLEX-Pro kit (# 10142-2; Sequenom, San Diego, CA), jonka jälkeen lisäinkuboinnin 10 min ajan 85 ° C: ssa inaktivoimiseksi SAP. Seuraavaksi yhden emäksen pidennyksestä (SBE), suoritettiin vielä 2 ui iPLEX Gold Chemistry seos (0,1 ui iPLEX päättymisen mix, 1,2 ui laajennus koetinseosta, ja 0,0205 ui iPLEX entsyymiä) seuraavasti: 94 ° C 30 s; 40 sykliä 94 ° C 5 sekunnin ajan ja viisi sisäistä sykliä (52 ° C 5 sekuntia ja 80 ° C: ssa 5 s); ja 72 ° C 3 min. Sen jälkeen, kun SBE, 16 pl DNaasi-vapaata lisättiin tislattua vettä, ja suolanpoisto suoritettiin inkuboimalla 25 minuutin ajan 6 mg kationinvaihtohartsia (Sequenom). Lopuksi, 10 nl suolavapaan tuote nähtiin päälle 384-formaatti SpectroCHIP II kanssa MassARRAY Nanodispenser (Sequenom). Mass määritys tehtiin kanssa MassARRAY Analyzer Compact MALDI-TOF massaspektrometrillä. Genotyypit kutsuttiin käyttämällä klusterianalyysillä algoritmi kehittämä CCGD on DFCI, sitten tarkistetaan manuaalisesti kaksi riippumatonta tutkijaa poistamiseksi epävarmoja puhelut takia clustering esineitä. Näyte laatu arvioitiin toimivaksi analysoitavaksi, jos yli 80% yritetty genotyyppien johti tunnistettavissa tuotteisiin. Validointi ehdokas mutaatioita, erityisiä HME genotyypitys suoritettiin koko näytteitä. Validation altaat HME suunniteltiin käyttäen AssayDesigner ohjelmistoja MassARRAY typer paketti (v4.0). Proksimaalinen SNP suodatettiin, ja spesifisyys PCR-amplifikaation ja myöhemmin primer extension reaktiossa varmistettiin enintään kuuden määritysten kohti altaan. Multiplex PCR-monistus ja SAP käsittely suoritettiin samalla tavalla kuin iPLEX reaktio, paitsi että 5 ng DNA: ta käytettiin multiplex PCR-templaattina. HME Reaktio suoritettiin vielä 2 ul HME master mix (0,2 ui asianmukaista HME ulottaa yhdistelmä, 1 ui MassEXTEND alukeseosta, ja 0,025 ui Thermo- entsyymiä) seuraavasti: 94 ° C 2 min; 75 sykliä 94 ° C 5 sekuntia, 52 ° C 5 sekunnin ajan ja 72 ° C 5 sekunnin ajan; ja 72 ° C: ssa 5 min. Jäljellä olevat vaiheet, mukaan lukien lisäämällä vettä, suolan poisto, tiputtelua, ja analyysi, suoritettiin, kuten varten iPLEX reaktiota. Vain Lihavien puheluja sekä iPLEX ja HME analyysi katsottiin validoitu mutaatioita. Kaikki havaitut mutaatiot vahvistettiin standardin, kaksisuuntainen Sangerin sekvensoinnilla.

Tilastollinen analyysi

eloonjääminen analyysi suoritettiin käyttäen Kaplan-Meier menetelmä ja log rank testi, ja tilastollinen merkitsevyys määritettiin p 0,05. SPSS v21.0 käytettiin kaikissa tilastollisia analyysejä.

Tulokset

Tässä tutkimuksessa 46 paria ensisijainen-toistuvien EOC näytteet (eli 92 EOC näytettä, joista 46 oli peräisin ensisijainen syöpään sivustoja ja 46 saatiin Hyväksytty pariksi toistuvia sivustot) analysoitiin. Kaikki potilaat olivat histologisesti vahvistanut EOC, joista papillaarinen vakavien adenokarsinooma oli yleisintä (67,4%). Kaikki potilaat yhtä lukuun ottamatta saivat adjuvanttia platinapohjaisen kemoterapian välillä tammikuussa 2002 ja joulukuun 2011 perustason ominaisuudet potilasryhmässä on koottu taulukkoon 1.

Niistä 92 FFPE testatussa, 35 mutaatiot tunnistettiin ja validoitu 31 näytettä (33,7%). Yksi mutaatio havaittiin 29,3% näytteistä, ja loput 4,3%: lla oli kaksi tai useampia mutaatioita. 35 mutaatiot, jotka on validoitu tapahtui neljästä geenistä, ja 19 näistä mutaatioista sijaitsivat

TP53

(taulukko 2). Mutaatiot validoitu geeneissä

TP53

(20,7%),

MLH1

(8,7%),

KRAS

(6,5%), ja

CDKN2A

( 2,2%), jossa tuumorisuppressorigeeniä

TP53

yleisimmin mutatoitunut geeni EOC (20,7% näytteistä). Tämä havainto on yhtäpitävä kahdessa äskettäin raportteja, jotka osoittivat, että

TP53

mutaatiot ovat yleisimpiä somaattisen geenimutaatioita korkealaatuisesta serous munasarjasyöpä [6], [10]. Kuitenkin, ei ollut korrelaatiota mutaation

TP53

geeni ja kliinisen ennusteen yhteensä 46 potilasta. Mediaani tautivapaa-eloonjääminen (DFS) oli 20,1 (vaihteluväli 4,7-55,4) kuukautta

TP53

mutaatio-negatiivisten ryhmässä ja 27,9 (vaihteluväli 5,1-40,6) kuukautta

TP53

mutaatio-positiivisten ryhmässä (P = 0,958). Keskimääräinen eloonjäämisaika (OS) oli 47,9 (15,8-177,4) kuukautta entisessä ja 55,0 (37,7-97,1) kuukautta jälkimmäisessä ryhmässä (P = 0,433) (Kuva. 1). Selviytyminen analyysi välillä

TP53

villityypin ja

TP53

mutantti tyyppi saavuttaa saman tuloksen, kun ne sisältyvät vain 31 vakavien näytteitä (Fig. 1).

TP53

mutaatioita ja

MLH1

mutaatioita esiintyi papillien vakavasta adenokarsinooma, ja muutoin

KRAS

mutaatioita ja

CDKN2A

mutaatioita ilmaantui lähinnä mucinous adenokarsinooma (taulukko 3).

Tautivapaa-elossaolo ja kokonaiselossaoloaika eivät eroa

TP53

mutaatio-negatiivinen ryhmä ja

TP53

mutaatio-positiivisia ryhmässä. A ja B, Tautivapaa-elossaolo ja kokonaiselossaoloaika yhteensä EOC potilailla (n = 46, 36

TP53

mutaatio (-) vs. 10

TP53

mutaatio (+)). C ja D, Tautivapaa-elossaolo ja kokonaiselossaoloaika in vakavien adenokarsinooma (n = 35, 27

TP53

mutaatio (-) serous vs. 8

TP53

mutaatio (+) vakavasta).

Seuraavaksi 46 paria primääristen ja uusiutuvien kasvainten näytteitä verrattiin arvioidakseen viskositeettiluku nopeus somaattisten mutaatioiden. Useimmat potilaat osoittivat useita metastaasien ja testattiin toistuvien kasvainnäytteet saatu paikallisen uusiutumisen ja etäpesäkkeiden (taulukko 3). Mielenkiintoista on, että mikä tahansa somaattisista mutaatioista tapahtui vain toistuvia kasvain ei ole havaittu tässä OncoMap analyysi EOC (taulukko 4). Lähes 100% konkordanssin oli havaittu verrattaessa mutaatioiden välillä primääristen ja uusiutuvien kasvainten paria. Vain yksi potilas (tapaus 12) osoitti

TP53

mutaation perusnäytteeseen kuitenkin, että ei ole havaittu toistuvia näytteessä. Lisäksi mutaatioita havaitseminen oli samanlainen primääristen ja uusiutuvien kasvainten. Toisin sanoen, somaattiset mutaatiot eivät vaikuttaneet paikallisen uusiutumisen tai etäispesäkkeiden EOC.

Keskustelu

OncoMap on optimoitu mutaatio profilointi alustan kehitetty tehokkaasti analysoida mutaatioita tunnetaan onkogeenien ja kasvaimen synnyssä, joista monet ovat tunnettuja ennustaa vastetta tai resistenssiä kohdennettua hoitomuotojen [8]. Nykyinen versio OncoMap (v.4.4) kuulustelee 471 mutaatioita 41 geenejä, jotka ovat merkityksellisiä syöpään. OncoMap alusta voidaan käyttää analysoitaessa DNA peräisin sekä makean pakastetut kudoksesta ja FFPE yksilöitä. Herkkyys ja spesifisyys OncoMap olivat 93,8% ja 100%: lla, DNA peräisin tuoreesta-jäädytetty kudos, ja 89,3% ja 99,4%, vastaavasti, FFPE johdetun DNA [8]. Kun FFPE kudosta käytetään, herkkyys ja spesifisyys OncoMap ovat verrattavissa tuloksiin tuoreista-jäädytetty kudos. OncoMap ei ole kehitetty tietylle syövän tyyppiä, joten se on rajoitus, joka sisältää useita geenejä ei olla olennaisia ​​tietyn biologian kunkin syöpä. Kuitenkin, merkittävin etu OncoMap on, että se mahdollistaa seulonnan satoja hotspot mutaatiot FFPE kudoksesta kohtuullisin kustannuksin [8]; Siksi, tämä tekniikka voi helpottaa Lääkäreille seuloa druggable mutaatioiden erilaisia ​​syöpiä. OncoMap on jo raportoitu luotettava menetelmä seulomiseksi somaattisten mutaatioiden useita kiinteän kasvaimen tyypit [7], [9] – [12].

OncoMap Tutkimus suoritettiin EOC mutaatioiden tunnistamiseksi, jotka ovat druggable kanssa uusia biologisia. Vaikka EOC ei ole ominaista tietty geenimutaatioita (paitsi

TP53

mukaan TCGA data) [6], on tarpeen tutkia somaattisia mutaatioita liittyy ero tautitiloissa. Kaiken kaikkiaan 31 (33,7%) 92 FFPE kudosten seulotaan OncoMap oli somaattisia mutaatioita. EOC näytteistä, 20,7% oli

TP53

mutaatioita, ja vastanneet elätellen

MLH1

(8,7%),

KRAS

(6,5%), tai

CDKN2A

(2,2%) mutaatioita.

TP53

on kasvaimia estävä geeni, joka koodaa proteiinia, joka välittää apoptoosia ja keskeytys- toiminto mutaation

TP53

on yksi yhteisiä piirteitä ihmisen syövissä [13]. Vuodesta ensimmäinen kattava kartoitus

TP53

mutaatio korko homogeeninen ryhmä korkealaatuisesta serous munasarjasyöpä potilaille, yleinen

TP53

toimintahäiriö korko lähestyi 100% 123 potilaista. Patogeenisia

TP53

mutaatioita tunnistettiin 96,7% näistä näytteistä sekvensoimalla eksonit 2-11 ja introni-eksoni rajoja kasvaimen DNA [14]. Yhdenmukaisesti näiden julkaistut tulokset,

TP53

mutatoitiin 303 316 näytettä (95,9%) vuonna TCGA tutkimuksessa [6]. Taajuus

TP53

mutaatio oli alhaisempi tutkimuksessamme (20,7%) verrattuna raportoitu aikaisemmissa tutkimuksissa. Koska OncoMap vain tutkii

TP53

mutaatiot seitsemän loci ja ei havaitse poisto tapahtumia, alhaisempaa

TP53

mutaatioita tässä tutkimuksessa havaitut hyväksyy viimeaikaisissa TCGA, joka mainitaan toisessa tutkimuksessa suoritettiin käyttäen OncoMap (Fig. 2) [10]. Tämä edellinen OncoMap Tutkimus suoritettiin joukko 203 FFPE edennyt vaiheittain korkealaatuista vakavasta munasarjasyövän yksilöiden Dana-Farber Cancer Institute, käyttäen OncoMap v.3.0. Käytimme päivitetty foorumi OncoMap (v.4.4) sisältäen enemmän geenistä ja määrityksiä ja tutki mutaation profiilin vain Korean naiset; kuitenkin usein somaattinen mutaatio EOC ei ole erottamiskykyinen verrataan edelliseen OncoMap tutkimuksessa (Fig. 2). Lukuisat tutkimukset ovat arvioineet yhdistyksen välillä

TP53

mutaatiot munasarjasyövän ja ennustetta. Tuloksemme eivät osoittaneet eroja DFS tai OS suhteen

TP53

mutaatiostatus. Vaikka on ollut monia raportteja, että läsnäolo

TP53

mutaatioita liittyy ennusteeseen munasarjasyöpä, ei yhdistyksen välillä

TP53

mutaatio ja etenemisestä vapaan tai OS löytyi kattava kartoitus

TP53

mutaation nykyisessä tutkimuksessa [14]. On mahdollista, että pieni määrä potilaita, joilla

TP53

mutaatiot voivat olla riittämätön havaita eroja ennusteeseen.

Tämä OncoMap v.4.4 tutkimuksessa Korean naisten paljasti samanlainen taajuus

TP53

somaattinen mutaatio (20,7% vs. 22,7%) ja erottuva tulos

MLH1

mutaatio (8,7% vs. 0%) verrataan edelliseen OncoMap v.3.0 tutkimus suoritettiin Dana-Farber Cancer Institute.

tässä tutkimuksessa toiseksi eniten mutatoitunut geeni EOC oli

MLH1

(8,7%), jota ei todettu mutatoitunut julkaistusta OncoMap tiedot korkealaatuisesta serous munasarjasyöpä. Ituradan mutaatioita epäsuhta korjaavien geenien, kuten

MLH1

,

MSH2

, ja

MSH6

, on tunnistettu munasarjasyöpää sairastavilla potilailla, joilla on perinnöllinen ei-polypoosin peräsuolen syöpä (HNPCC) [15]. Tutkimus, joka sisälsi 1893 naisten EOC ehdotti, että alle 1% naisista munasarjasyövän satama ituradan mutaatio HNPCC geenejä, ja patogeenisten mutaation kantajia oli aikaisemmin keski-ikä diagnoosin munasarjasyöpä, jolla on suurempi todennäköisyys ei -serous histologia, ja suurempi määrä sukulaisten kanssa HNPCC liittyviä syöpiä [15]. Meta-analyysi, somaattiset mutaatiot

MLH1

ja

MSH2

geenejä havaittiin olevan vallalla peräsuolen syövän lisäksi muita yleisemmin somaattisten mutaatioiden

MLH1

geeni suhteessa

MSH2

geeni havaittiin Euroopan ryhmässä [16]. On kuitenkin olemassa mitään raportteja

MLH1

somaattisia mutaatioita EOC. Tämä on ensimmäinen raportti havaita somaattisia mutaatioita

MLH1

satunnaisissa EOC; Siksi ei ole riippumatonta validointi tietoja. On tarpeen kuulustella onko

MLH1

somaattiset mutaatiot ovat ominaisia ​​erityisille munasarjasyöpä tyyppejä.

KRAS

mutaatioita (6,5%) ja

CDKN2A

mutaatiot (2,2%) havaittiin myös tässä tutkimuksessa. Mutaatiot

KRAS

geeni ovat yksi yleisimmistä geneettisiä poikkeavuuksia munasarjasyöpä, ja ovat useammin läsnä syöpä alemman asteen ja International Federation of Gynecology and Obstetrics (FIGO) vaihe, ja vauriot mucinous histotype [17].

KRAS

mutaatio liittyy mucinous erilaistumiseen, koska nämä mutaatiot myös kerääntyä mucinous karsinoomat muiden elinten [18], [19]. Kolme potilasta oli

KRAS

mutaatioita, ja että kaksi niistä oli mucinous syöpäsairauksia. Lisäksi on äskettäin osoitettu, että pre-invasiivinen munasarjojen mucinous kasvaimia on tunnusomaista sykliiniriippuvainen kinaasi-inhibiittori 2A (CDKN2A) ja Ras-reitin poikkeamia [20]. On huomattava, että yksi potilas, jolla on

CDKN2A

mutaatio tutkimuksessamme oli myös

KRAS

mutaatio. Tämä tutkimus on suurin ja tarkin analyysi mucinous hyvänlaatuisia ja rajatapauksia kasvaimet suorittaa tasalla ja antaa vahvan tukensa hypoteesia, että nämä vauriot ovat esiasteita primääri munasarjojen mucinous adenokarsinooma.

Tutkimme geenimutaatioita pariksi näytteet aluksi diagnosoidaan ja toistuva kasvaimia 46 munasarjasyöpä potilaille. Monet onkologit ovat olleet kiinnostuneita kasvaimensisäisenä heterogeenisyys sekä intertumoral heterogeenisyys välillä ensisijainen ja toistuva kasvain näytteet samasta potilaasta. Suuri Ennakoiva tutkimus rintasyövässä tunnistettu kytkintä reseptoristatus ER 10.2%: lla potilaista, PR vuonna 24,8%, ja HER2 2,9%; kytkintä reseptoristatus johtanut muutokseen seuraavassa hoitosuunnitelma 17,5% potilaista [21]. Kirjoittajat siis ehdotti, että johto uusiutuneen rintasyövän tulisi sisältää kudosta näytteenotto tunnistaa kytkimiä ER, PR tai HER2 tila paikallisesti uusiutunut tai metastasoitunut rintasyöpä, jotka saattavat vaikuttaa suunniteltuun hoitoon. Eräät raportit keuhkosyöpää ovat osoittaneet ristiriitaisia ​​mutaatio kuvioita välillä ensisijainen ja etäpesäkkeitä ja heterogeeninen jakautuminen kasvutekijän reseptorin (

EGFR

) mutaatioita yksittäisissä kasvaimissa [22] – [25]. Kuitenkin heterogeeninen mutaatiot

KRAS

ja

TP53

ovat niukat, koska nämä mutaatiot liittyvät varhaisen patogeneesin syövän [26]. Raportissa tarkastellaan kasvain näytteet Luettelon Somaattiset mutaatiot Cancer (COSMIC) tietokanta ja Aichin Cancer Center Kohortti, ei ristiriitainen mutaatio kuvioita havaittiin keskuudessa 77 pariksi ensisijainen ja metastaattinen sivuston näytteitä, tai joukossa 54 primääristen ja uusiutuvien kasvainten paria [27 ]. Tekijät päättelivät, että heterogeeninen jakautuminen

EGFR

mutaatioita on harvinaista, mutta koska mutantti

EGFR

alleelit valikoivasti monistettu kasvaimiin, näytteet analysoidaan vähemmän herkkiä havaitsemismenetelmät voivat virheellisesti näyttävät olevan heterogeeninen varten

EGFR

mutaatioita.

munasarjasyöpä, jotkut tutkimukset ovat osoittaneet ristiriitainen geenien ilmentymistä, tai proteiinin biologisten merkkiaineiden pariksi ensisijainen ja uusiutunut munasarjasyöpä kudosnäytteet, mitattuna immunohistokemiallisella analyysit [28] – [30 ]. Viime aikoina on kuitenkin päinvastainen tiedot on raportoitu, että mitään uusia mutaatioita nousi diagnoosista uusiutumisen jälkeen kemoterapian exome sekvensoimalla täsmäsi näytteitä yhden potilaan, mikä viittaa siihen, että mutaatiot jo läsnä primaarikasvaimen osaltaan etäpesäkkeiden ja kemoterapian resistenssin [31]. Tutkimuksessamme lähes 100% konkordanssin korko havaittiin pariksi ensisijainen ja toistuvia näytteitä. Vaikka yksi potilas osoitti ristiriita,

TP53

mutaatio havaittiin perusnäytteeseen, mutta ei toistuvien näytteessä. Tuloksemme viittaavat siihen, että nämä geenit (

TP53

,

MLH1

,

KRAS,

ja

CDKN2A

) osallistuvat kasvaimen varhaiseen kehitykseen, kuten edellä mainittiin .

Tämä OncoMap analyysi paljasti, että somaattiset mutaatiot olivat harvinaisia ​​EOC.

TP53

mutaatiot olivat yleisimpiä, noudattavat julkaistuja OncoMap ja TCGA tiedot, ja somaattiset mutaatiot

CDKN2A

,

KRAS

, ja

MLH1

olivat myös havaitaan, vaikkakin huomattavasti lievemmin. Koska ei ollut ristiriita välillä ensisijainen ja toistuvien näytteiden, emme löytäneet erityisiä somaattinen mutaatio liittyy kasvaimen uusiutumisen ja kaukainen etäpesäkkeiden EOC, joukossa tunnettuja onkogeenien ja tuumorisuppressorigeeneille. Ymmärtää biologia kasvaimen uusiutumisen EOC, lisää tutkimuksia myös epigeneettiset muutokset tai lisälaitteet mutaatiot muissa geeneissä ovat tarpeen. Lisäksi tulevissa tutkimuksissa on tarpeen korreloida läsnä

TP53

mutaatiot biologista aktiivisuutta ja kliinistä ennusteen syöpä. Lisäksi ei-serous tyyppisiä EOC olisi analysoitava, koska molekyyli tapahtumia ne syövät voivat tarjota mahdollisuuden hoitoja kohdentamista tiettyihin mutaatioita ja reittejä. Parempi toiminnallinen genetiikan ja taudin kerrostumista munasarjasyövän tekevät uusia, kohdennettuja hoitotavoitteet ja yksilöllisiä hoitoja mahdollista.

tukeminen Information

Taulukko S1.

OncoMap_4.4C koostuu 439 määrityksissä 32 erillisissä reaktioissa suunniteltu seulomaan 471 mutaatioita 41critical geenejä.

doi: 10,1371 /journal.pone.0099451.s001

(DOC) B