PLoS ONE: HIF-1α 1772 C /T ja 1790 G /A polymorfismit liittyvät merkittävästi Korkeampi syöpäriski: Päivitetty meta-analyysi 34 tapausverrokkitutkimukset
tiivistelmä
Background
HIF-1 aktivoi eri geenien syövän etenemisen ja etäpesäkkeiden. HIF-1α 1772 C /T ja 1790 G /A polymorfismit kuulemma liittyy syövän riski; Kuitenkin tulokset ovat vakuuttavia.
Menetelmät /Principal Havainnot
Meta-analyysi 34 tutkimuksia, jotka liittyvät 7522 tapauksissa ja 9847 säätimet 1772 C /T ja 24 tutkimuksia, jotka liittyvät 4884 tapauksissa ja 8154 säätimet 1790 G /A tehtiin tunnistamaan yhdistys C /T ja G /A polymorfismien syöpäriskiä. Kerroinsuhde (OR) ja 95%: n luottamusväli (95% CI) arviointiin käytettiin vahvuus -alueella.
HIF-1α 1772 C /T ja 1790 G /A polymorfismien liittyi suurempi syöpäriskin homozygoottisia vertailu (1772C /T: TT vs. CC: OR = 2,45, 95% CI: 1,52, 3,96;
P
heterogeenisyys = 0,028; 1790G /A: AA vs. GG: OR = 4,74 , 95% CI: 1,78, 12,6;
P
heterogeenisyys 0,01), hallitseva malli (1772C /T: TT /CT vs. CC: OR = 1,27, 95% CI: 1,04, 1,55
P
heterogeenisyys 0,01, 1790G /A: AA /GA vs. GG: OR = 1,65, 95% CI: 1,05, 2,60;
P
heterogeenisyys 0,01), T-alleelin vs. C-alleelin (T vs. C: OR = 1,42, 95% CI: 1,18, 1,70;
P
heterogeenisyys 0,01), ja A alleeli versus G-alleelin (A vs. G: OR = 1,83, 95% CI: 1,13, 2,96;
P
heterogeenisyys 0,01). Osaryhmälle analyysi, 1772 C /T-polymorfismi merkittävästi sidoksissa korkea riski rintasyöpä, keuhkosyöpä, eturauhassyöpä, ja kohdunkaulan syöpä, kun taas 1790-G /A-polymorfismi oli merkittävästi sidoksissa suurempia riskejä keuhkosyövän ja eturauhassyövän . Merkittävästi lisääntynyt syöpäriskiä löydettiin sekä aasialaiset ja valkoihoiset varten 1772C /T-polymorfismi, kun taas huomattavasti syöpäriskiä löydettiin valkoihoiset heterozygoottiset vertailua ja väistyvä malli 1790G /A polymorfismin.
Johtopäätökset
HIF-1α 1772 C /T ja 1790 G /A polymorfismit liittyvät merkittävästi suurempi syöpäriski.
Citation: Yang X, Zhu HC, Zhang C, Qin Q, Liu J, Xu LP , et ai. (2013) HIF-1α 1772 C /T ja 1790 G /A polymorfismit liittyvät merkittävästi Korkeampi syöpäriski: Päivitetty meta-analyysi 34 Case-Control Studies. PLoS ONE 8 (11): e80396. doi: 10,1371 /journal.pone.0080396
Editor: Qing-Yi Wei, Duke Cancer Institute, Yhdysvallat
vastaanotettu: Kesäkuu 27, 2013 Hyväksytty: 2. lokakuuta 2013. Julkaistu: 18 marraskuu 2013
Copyright: © 2013 Yang et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.
Rahoitus: Tämä työ tukivat Natural Science Foundation of China (numero 81272504), Innovation Team (numero LJ201123 (EH11)), ja Jiangsun maakunnan tieteen ja teknologian projektit (BK2011854 (DA11)), ja ”333” Project Jiangsun maakunnassa (BRA2012210 ( RS12)), ja tutkimusapurahat kiinalaisilta Society of Clinical Oncology (T-H2010-033 (KA10)). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.
Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.
ESITTELY
Syöpä, joka johtuu monimutkainen geneettisten ja ympäristötekijöiden, on tullut haastava terveysongelma. Yhä useammat ole tehty viime vuosina välisen suhteen arvioimiseksi geneettinen vaihtelu ja syövän riskiä [1].
Happi (O
2) pitoisuus tuumorikudoksissa on huomattavasti pienempi kuin ympäröivän normaaleissa kudoksissa. Useat tutkimukset ovat keskittyneet happivajaus, koska sen toiminta ylläpitämisessä kasvaimen mikroympäristöihin [2]. Hypoksinen kasvain microenvironment käynnistää useita soluvasteita, kuten leviämisen ja angiogeneesin, liipaisu kehittymistä ja etenemistä syövän. Yleensä hypoksia saattaa säädellä tuumorisolujen fenotyypit muuttamalla geenejä, jotka ovat herkkiä O
2 paine [3]. Tutkimukset ovat osoittaneet, että HIF-1 on tärkeä tehtävä kehittymistä ja etenemistä syövän aktivoimalla eri geenejä, jotka liittyvät angiogeneesiin, soluadheesiota, erytropoieesin ja glukoosin kuljetusta [4]. HIF-1 on heterodimeeri koostuu happea herkkä alayksikön HIF-1α ja konstitutiivisesti alayksikön HIF-1β; se hajoaa nopeasti läpi von Hippel-Lindaun välittämää Ubikitiini-proteasomireitillä alle normoksia olosuhteissa [5]. Viimeaikaiset tutkimukset ovat osoittaneet, että HIF-1α yli-ilmennetään monissa ihmisen syövissä kehittyneitä kasvaimen, mikä viittaa siihen, että HIF-1α toimii riippumaton tekijä syövän ennusteeseen [6].
Ihmisen HIF-1α-geeni, joka sijaitsee kromosomissa 14q21-24, koostuu 15 eksonien. Se koodaa 3919 bp: n ja tuottaa 826 aminohapon proteiinia. Yhden nukleotidin polymorfismit (SNP: t) koodausalueilla voi välittää aminohappo- muutokset ja vaikuttavat rakenteen ja biologisen aktiivisuuden käännetty proteiini [7]. Laajimmin tutkittu HIF-1α polymorfismien ovat 1772 C /T (Pro582Ser, rs11549465) ja 1790 G /A (Ala588Thr, G1790A, rs11549467), jotka indusoivat proliini-to-seriini ja alaniini-to-treoniini aminohapposubstituutioita, vastaavasti. Molemmat polymorfisia variantteja voi merkittävästi nostaa transkriptionaalinen aktiivisuus kuin villityypin molemmissa hypoksisissa ja normoxic olosuhteet in vitro -tutkimuksissa [8]. Lisäksi molemmat polymorfismit liittyy lisääntynyt kasvain mikroverisuonitiheys siten edistää kehittymistä ja etenemistä syövän [9].
HIF-1α 1772 C /T ja 1790 G /A geneettisten polymorfismien aiemmin ehdotettu olevan vastaava riski eri syöpien riskiä. Kuitenkin epidemiologisten tutkimusten tuloksiin ovat epäjohdonmukaisia [10-12]. Näin ollen suhde HIF-1α polymorfismien ja syöpien vaatii lisätutkimuksia. Niinpä teimme meta-analyysi hyväksyttävistä tapausverrokkitutkimukset tuottaa tehokkaampia arvio yhdistyksen HIF-1α 1772 C /T ja 1790 G /A polymorfismien syöpäriskiä.
Methods
tunnistaminen ja kelpoisuuden asiaankuuluvien tutkimusten
Kaikki tutkimukset julkaistiin ennen 26. päivää kesäkuuta 2013 mennessä, että tutki yhdistys HIF-1α 1772 C /T ja 1790 G /A polymorfismien syöpäriskiä pidettiin tässä meta -analyysiohjelman. Systemaattinen etsintä kirjallisuuden suoritettiin käyttäen PubMed ja EMBASE. Avainsanoja käytetään haussa olivat ”hypoksia-indusoituva factor-1” tai ”HIF-1” ketjutetaan ”SNP”, ”polymorfismi”, ”mutaatio” tai ”variantti” ja ”kasvain”, ”syöpä”, ”karsinooma ”tai” maligniteetti. ”Vain tutkimukset täydelliset tiedot vertailua HIF-1α 1772 C /T tai 1790 G /A polymorfismien välillä syöpäpotilaiden ja ohjaimet valittiin. Tapausselostukset eläinkokeissa, tarkastelun artikkeleita, pääkirjoitukset, tiivistelmiä, raportteja puutteellisia tietoja, ja tutkimukset perustuvat sukupuu tietoja ulkopuolelle.
Data louhinta
Kaksi tutkijat (Yang ja Zhu) itsenäisesti uudelleen artikkelit jättää merkityksetön ja päällekkäisiä tutkimuksia. Tuloksia verrattiin, ja erimielisyydet ratkaistiin keskustelun ja konsensuksen. Olemme mukana vain julkaisun raportoineen laajin tietoja, kun päällekkäisiä artikkelia ei löytynyt. Seuraavat tiedot poimittiin tutkimusta varten: ensimmäinen kirjoittaja, julkaisuvuosi, maan, rodun, ohjaus lähde, syöpä tyyppi, Hardy-Weinberg tasapaino, ja tapausten määrä ja säädöt kaikille genotyypin.
Tilastollinen analyysi
STATA (versio 11.0, StataCorp, College Station, Texas, USA) käytettiin meta-analyysi. Kaikki genotyyppi malleja kaksi HIF-1α polymorfismien arvioitiin. Olemme myös suoritettu alaryhmäanalyyseissa syöpätyypin, etnisyys, ja lähde ohjaus. Syövän tyyppi alaryhmiä, me mukana alaryhmä, joka sisälsi yli kolme tutkimusta.
olemassaolo heterogeenisuus tutkimusten välillä varmistettiin Q-tilastoa. Yhdistetty kerroinsuhde (OR) arvioitiin kanssa malleja, jotka perustuvat kiinteiden vaikutusten tai random-vaikutuksia oletuksiin. Satunnainen vaikutusten mallia käytettiin, kun merkittävät Q tilastollinen (
P
0,1) osoitti, että läsnä heterogeenisyys tutkimuksissa. Muussa tapauksessa kiinteiden vaikutusten malli valittiin. 95%: n luottamusväli (CI) OR laskettiin myös. Jakautuminen genotyyppien kontrolleissa tarkistettiin Hardy-Weinberg tasapaino. Tutkimukset valvonta ole Hardy-Weinberg tasapaino tehtiin herkkyysanalyysi.
Julkaisussa bias joukossa tutkimuksissa määritettiin. Suppilo tontit HIF-1α 1772 C /T polymorfismin T-alleelin vs. C alleeli ja HIF-1α 1790 G /A polymorfismin A-alleelin versus G-alleelin rakennettiin etsimään todisteita julkaisu puolueellisuudesta. Epäsymmetrinen suppilo juoni ilmaisee julkaisu bias, kun taas symmetrinen suppilo juoni tarkoittaa, ettei ole julkaisun puolueellisuudesta. Egger testi, arvioitu MIX 1.7 ohjelmisto (Kitasato Clinical Research Center, Kitasato University, Japani), suoritettiin mittaamiseksi suppiloon juoni epäsymmetriaa.
Tulokset
Ominaisuudet voivat tutkimusten
vuokaavio havainnollistaa tärkeimmistä syistä tutkimuksen ulkopuolelle (kuva 1). Valitut Tutkimuksen ominaisuudet esitetään yhteenveto taulukoissa 1 ja 2. Kolmekymmentäneljä asiaan tapausverrokkitutkimukset koskevat 1772 C /T ja 1790 G /A polymorfismien ja syövän riskiä otettiin mukaan meta-analyysi. Niistä 34 tutkimuksissa 5 keskittyi eturauhassyöpään [13-17], 5 rintasyövästä [18-22], 4 peräsuolen syöpä [23-26], 3 suusyövästä [27-29], 3 keuhkosyöpään [30-32], 2 haimasyöpä [33,34], 2 munuaissolukarsinooma [35,36], 2 kohdunkaulan syövän [37,38], 1 munasarjasyöpä, kohdun limakalvon syöpä, ja kohdunkaulan syöpä [39 ], ja 7 keskittyi erikseen ruokatorven okasolusyöpä [40], kohdun limakalvon syöpä [9], maksasyöpä [41], mahasyöpä [42], gliooma [43], virtsarakon syöpä [44], ja pään ja kaulan levyepiteelisyöpä kohdunkaulan [8]. Niistä voivat tutkimuksissa 34 esitetään tietoja 1772 C /T polymorfismin ja 24 esitetään tietoja 1790 G /A-polymorfismi. Sillä 1772 C /T-polymorfismi, jakautumista genotyyppien kontrolliryhmien 5 tutkimuksessa ei ollut Hardy-Weinberg tasapaino [9,13,28,35,36]. Sillä 1790 G /A-polymorfismi, jakautumista genotyyppien kontrolliryhmien yhdessä tutkimuksessa ei ollut Hardy-Weinberg tasapaino [36]. Niistä tukikelpoisia tutkimuksissa 1 tutkimus edellyttäen tietoja kolmesta syöpiin (kohdun limakalvon syöpä, munasarjasyöpä, ja kohdunkaulan syöpä) sekä polymorfismien [39].
Ensimmäinen Tekijä (viite) B Year
Maa
Alkuperä
Ohjaus Lähde
Cancer Type
Cases
Controls
HWE
CC
CT
TT
CC
CT
TT
Tanimoto2003JapanAsianPBHead ja kaulan levyepiteelisyöpä carcinoma45100981200.545Kuwai2004JapanAsianPBColorectal cancer10000891100.561Ling2005ChinaAsianPBEsophogeal sqaumous solun carcinoma84110931100.569Kim2008KoreaAsianHBBreast cancer818193900.641Lee2008KoreaAsianPBBreast cancer12071196124512310.25Nadaoka2008JapanAsianPBTransitional cell carcinoma of bladder19722419420.35Chen2009ChinaAsianPBOral cancer1631013341300.722Li2009ChinaAsianPBGastric cancer8340931300.501Naidu2009MalaysiaAsianPBBreast cancer294100162225030.922Chai2010ChinaAsianHBCervical cancer65257942120.52Hsiao2010ChinaAsianHBHepatocellular carcinoma94803341300.722Kang2011KoreaAsianPBColorectal cancer3812464Kim2011KoreaAsianHBCervical cancer1772201872700.325Putra2011JapanAsianHBLung cancer7490981200.545Wang2011ChinaAsianHBPancreatic cancer209 (198) 5402422900.352Xu2011ChinaAsianHBGlioma1212721351410.354Li2012ChinaAsianHBProstate cancer6124826595700.267Clifford2001UKCaucasianPBRenal solun carcinoma30501102760.018Ollerenshaw2004UKCaucasianPBRenal solun carcinoma16549019071 0,001, Fransen2006SwedenCaucasianPBColorectal cancer1672832134320.916Konac2007TurkeyCaucasianHBEndometrial, munasarja-, ja kohdunkaulan cancer484014683720.229Orr-Urtreger2007IsraelCaucasianPBProstate cancer28799162178030.137Horre’e2008NetherlandsCaucasianPBEndometrial cancer505346384120.001Apaydin2008TurkeyCaucasianPBBreast cancer79212682950.415Foley2009IrelandCaucasianPBProstate cancer653001751300.623Muñoz-Guerra2009SpainCaucasianPBOral cancer57,671132780.001Konac2009TurkeyCaucasianHBLung cancer110,3101114320.335Knechtel2010AustrilaCaucasianHBColorectal cancer291771773383 0.05Ruiz-Tovar2012SpianCaucasianPBPancreatic cancer471111162880.002Kuo2012ChinaCaucasianHBLung cancer153943821673110.132Alves2012BrazilCaucasianPBOral cancer01390853 0.001Zagouri2012GreeceCaucasianHBBreast cancer981501071700.413Chau2005USAMixedPBProstate cancer161296179143 0.001Li2007USAMixedPBProstate cancer818209141751300.623Table 1. ominaisuudet voivat tutkimusten välistä assosiaatiota 1772 C /T-polymorfismi ja syövän riskiä.
CSV Lataa CSV First Tekijä (viite) B Year
Maa
Alkuperä
Ohjaus Lähde
Cancer Type
Cases
Controls
HWE
GG
GA
AA
GG
GA
AA
Tanimoto2003JapanAsianPBHead ja kaulan okasolu- carcinoma5140101900.655Kim2008KoreaAsianHBBreast cancer873094710.06Nadaoka2008JapanAsianPBTransitional cell carcinoma of bladder20415421400.25Chen2009ChinaAsianPBOral cancer3331401532010.697Li2009ChinaAsianPBGastric cancer7413010060 0.764Naidu2009MalaysiaAsianPBBreast cancer3327262324120.898Hsiao2010ChinaAsianHBHepatocellular carcinoma2780200700.805Kim2011KoreaAsianHBCervical cancer1871202001310.136Putra2011JapanAsianHBLung cancer7292101900.655Wang2011ChinaAsianHBPancreatic cancer1986412492200.486Li2012ChinaAsianHBProstate cancer6144716853100.554Clifford2001UKCaucasianPBRenal solun carcinoma3500140400.866Ollerenshaw2004UKCaucasianPBRenal solun carcinoma6567142393910 0.001Fransen2006SwedenCaucasianPBColorectal cancer189890247900 .775Konac2007TurkeyCaucasianHBEndometrial, munasarjojen ja kohdunkaulan cancer10020107001Orr-Urtreger2007IsraelCaucasianPBProstate cancer19820298200.954Apaydin2008TurkeyCaucasianPBBreast cancer1020094400.837Muñoz-Guerra2009SpainCaucasianPBOral cancer40213130900.693Konac2009TurkeyCaucasianHBLung cancer14010152 200.936Knechtel2010AustrilaCaucasianHBColorectal cancer35611208076 0.05Ruiz-Tovar2012SpianCaucasianPBPancreatic cancer542314210 00.675Kuo2012ChinaCaucasianHBLung cancer15014121574110.154Alves2012BrazilCaucasianPBOral cancer213781700.698Li2007USAMixedPBProstate cancer105313012471700.81Table 2. ominaisuudet voivat tutkimuksia varten assosiaatio 1790 A /G-polymorfismi ja syöpäriskiä.
CSV Lataa CSV
Yhteenvetotilasto
meta-analyysi HIF-1α 1772 C /T-polymorfismi sisältyvät 7522 tapauksia ja 9847 tarkastuksia. Yleisyys CC-genotyyppi oli korkein, alleeli C oli yleisin, ja esiintyvyys TT genotyyppi oli alhaisin sekä tapauksessa ja kontrolliryhmiin.
Meta-analyysi HIF-1α 1790 G /A sisältyvä polymorfia 4884 syöpätapausta ja 8154 tarkastuksia. Yleisyys GG genotyypin oli korkein, alleeli G oli yleisin, ja esiintyvyys AA genotyyppi oli alhaisin sekä tapauksessa ja kontrolliryhmiin.
Kokonaisanalyysi
Kun yhdistäminen kaikkien tukikelpoisten tutkimuksissa havaitsimme, että molemmat 1772 C /T ja 1790 G /A polymorfiat liittyi merkittävästi syöpäriskiä homozygoottisia verrattuna (1772C /T: TT vs. CC: OR = 2,45, 95% CI: 1,52, 3,96;
P
heterogeenisyys = 0,028; 1790G /A: AA vs. GG: OR = 4,74, 95% CI: 1,78, 12,6;
P
heterogeenisyys 0,01) , hallitseva malli (1772C /T: TT /CT vs. CC: OR = 1,27, 95% CI: 1,04, 1,55;
P
heterogeenisyys 0,01, 1790G /A: AA /GA vs . GG: OR = 1,65, 95% CI: 1,05, 2,60;
P
heterogeenisyys 0,01) (kuviot 2 ja 3), resessiivinen malli (1772C /T: TT vs. CC /CT : OR = 3,18, 95% CI: 1,92, 5,29;
P
heterogeenisyys 0,01, 1790G /A: AA vs. GG /GA: OR = 4,39, 95% CI: 1.61,11.9
P
heterogeenisyys 0,01), T-alleelin vs. C-alleelin (T vs. C: OR = 1,42, 95% CI: 1,18, 1,70;
P
heterogeenisyys 0.01), ja A alleeli versus G-alleelin (A vs. G: OR = 1,83, 95% CI: 1.13,2.96;
P
heterogeenisyys 0,01) (kuvat 4 ja 5). Yhdistyksen vahvuus välillä HIF-1α polymorfismi ja syöpäriskiä on esitetty taulukossa 3. Mitään merkittävää yhteyttä todettiin heterotsygoottinen verrattuna (1772C /T: CT vs. CC: OR = 1,15, 95% CI: 0,92, 1,45;
P
heterogeenisyys 0,01, 1790G /A: GA vs. GG: OR = 1,35, 95% CI: 0,82, 2,21;
P
heterogeenisyys 0,01). Kuitenkin 1772C /T-polymorfismi merkitsevästi yhteydessä syövän heterozygoottiset mallissa (CT vs. CC: OR = 1,29, 95% CI: 1,04, 1,62; p
heterogeenisyys 0,01), kun tutkimuksia ole Hardy- Weinberg tasapaino suljettiin pois.
1772 C /T polymorfismit (rs11549465) B TT verrattuna CC
CT VS CC
TT /TT VS CC
TT VS CT /CC
T-alleelin VS C alleeli
N
Otoskoko
OR
P
b
TAI
P
b
OR
P
b
TAI
P
b
OR
P
b
Total3475222 .45 (1.52-3.96) 0.0281.15 (0.92-1.45) 0.0011.27 (1,05-1,55) 0.0013.18 (1,92-5,29) 0.0011.42 (1,18-1,70) 0.001Total vuonna HWE2565753.65 (2,47-5,40) 0.3181.29 (1,04-1,62) 0.0011.35 (1,10-1,65) 0.0013.38 (2.29-5.00) 0.4761.40 (1.15-1.71) 0.001Cancer typesBreast cancer520472 .30 (1.08-4.91) 0.0841.07 (0.88-1.29) 0.1881.12 (0.92-1.35) 0.7112.27 (1.06-4.87) 0.1201.09 (0.76-1.55) 0.022Lung cancer35091.41 (0,07-30,4) 0,0441 .13 (0.59-2.19) 0.0181.50 (1.15-1.96) 0.6883.27 (1.73-6.17) 0.0651.19 (0.50-2.86) 0.001Oral cancer32842.01 (0,75-5,41) 0.4630.85 (0,24-2,97 ) 0.0471.04 (0.61-1.78) 0.82322.8 (0.28-1888) 0.0013.93 (0,61-25,4) 0.001Colorectal cancer46271.91 (0,32-11,6) 0,24 (0,01-5,51) 0.0271.10 (0,87 -1,38) 0.7441.97 (0,33-11,9) 1,36 (0,68-2,70) 0.002Prostate cancer523963.68 (1,58-8,55) 0.8712.02 (1,01-4,07) 0.0012.10 (1.08-4.09) 0.0283.52 (1,52 -8,16) 0.8472.06 (1,15-3,68) 0.001Cervical cancer332810.1 (3.12-32.6) 0.1531.37 (0.92-2.02) 0.0991.63 (1.12-2.37) 0.1588.26 (2.64-25.9) 0.2361.89 (0,84-4,26) 0.002Others1313311.68 (0,42-6,80) 0.0010.97 (0,56-1,68) 0.0011.20 (0.98-1.47) 0.5121.99 (1.40-2.84) 0.1001.37 (0.96-1.97) 0.001EthnicitiesCaucasian1521511.70 (0.81-3.55) 0.0010.86 (0.57-1.31) 0.0011.05 (0,76-1,46) 0.0012.97 (1,44-6,14) 0.0011.32 (0,99-1,75) 0.001Asian1741344.42 (2.07-9.43) 0.9971.25 (0.98-1.60) 0.0101.33 (1.06-1.68) 0.0064.12 (1.93-8.77) 0.9551.40 (1.11-1.78) 0.002Mixed212373.13 (0,90-10,8 ) 0.5002.98 (1.92-4.63) 0.3723.05 (2.00-4.66) 0.2692.77 (0.80-9.54) 0.6462.91 (1.96-4.32) 0.208Source of controlPB2149441.92 (1.05-3.50) 0.0370.99 (0.69- 1.41) 0.0011.17 (0,87-1,57) 0.0013.14 (1,60-6,16) 0.0011.40 (1,06-1,84) 0.001HB1325784.38 (2.64-7.47) 0.4861.32 (1.13-1.57 ) 0.0231.39 (1.09-1.77) 0.0023.88 (2.32-6.51) 0.5691.46 (1.16-1.85) 0,0011790 G /A polymorfismit (rs11549465) AA VS GGGA VS GGAA /GA VS GGAA VS GA /GGA alleeli VS G alleleNSample sizeOR
P
Bor
P
Bor
P
Bor
P
Bor
P
bTotal2451364.74 (1,78-12,6) 0.0021.35 (0,82-2,21) 0.0011.65 (1,05-2,60) 0.0014.39 (1.61-11.9) 0.0011.83 (1.13-2.96) 0.001Total in HWE2350904.68 (1,34-16,3) 0,0011 0,23 (0,77-1,98) 0.0011.53 (+0,99-+2,36) 0.0014.65 (1.35-16.0) 0.0011.83 (1.13-2.96) 0.001Cancer typesBreast cancer35211.44 (0,38-5,44) 0,3361. 03 (0.70-1.52) 0.1151.05 (0.72-1.53) 0.0771.41 (0.37-5.37) 0.3561.07 (0.75-1.52) 0.055Lung cancer33625.42 (2,75-10,7) 0.8660.26 (0,01-7,10) 0.0010.82 (0.56-1.19) 0.2267.11 (3.61-14.0) 0.9751.48 (1.09-2.00) 0.575Oral cancer337520.7 (0,10-4519) 0.0012.21 (0,18-26,9) 0.0017.81 ( 0,27-224) 0.00117.5 (0,10-3257) 0.0019.34 (0,23-388) 0.001Prostate cancer318653.35 (0,14-82,3) 1,41 (0,97-2,07) 0.3651.44 (0,98-2,10) 0.3403.25 (,13-+79,9) 1,45 (1,00-2,11) 0.330Others1415424.81 (2,34-9,87) 0.4601.70 (+0,99-+2,90) 0.0011.80 (0,99-3,26) 0.0013.01 (1,47-6,21 ) 0.3671.91 (1,01-3,58) 0.001EthnicitiesCaucasian12163517.4 (4.01-75.3) 0.0011.09 (0.33-3.58) 0.0012.19 (+0,90-+5,34) 0.00115.8 (3,42-72,9) 0.0012.27 (0,92-5,58) 0.001Asian1124351.44 (0.60-3.46) 0.5221.45 (0.85-2.46) 0.0011.36 (0,83-2,24) 0.0011.41 (0,58-3,39) 0.5081.42 (0,84-2,40) 0.001Source of controlPB1430139.69 (1,41-66,7) 0.0011.40 (0,71-2,74) 0.0011.80 (,89-+3,64) 0.0018.08 (1,12-58,1) 0.0012.10 (0,95-4,68) 0.001HB1021234.08 (2.26-7.37) 0.4011.23 (0.53-2.86) 0.0011.47 (0,85-2,55) 0.0015.02 (2,79-9,02) 0.2781.50 (0,86-2,62) 0.001Table 3. Tärkeimmät tulokset meta-analyysi yhdistyksen HF1A geenin 1772 C /T ja 1790 G /A polymorfismien syöpäriskiä.
Random-vaikutusten malli oli käytetään, kun
P
arvo heterogeenisyys testi oli 0,05; muuten, kiinteiden vaikutusten mallia käytettiin.
b
P
arvo Q-Test varten heterogeenisuus TestN: tutkimusten lukumäärä mukana; TAI: riskisuhde; PB: väestöpohjainen; HB: sairaala-pohjainen; HWE = Hardy-Weinberg equilibrium.One tutkimus sisälsi yksityiskohtaisia tietoja munasarjasyöpä, kohdun limakalvon syöpä, ja kohdunkaulan syöpä. Käytimme yhdistetyt tiedot yleisanalyysi ja erilliset tiedot alaryhmäanalyysi syöpätyypin. CSV Lataa CSV
alaryhmäanalyyseissa
Alaryhmä analyysit suoritettiin vaikutuksen tutkimiseksi syövän tyypin, etnisyys, ja lähde ohjaus. Syövän tyypistä, 1772C /T-polymorfismi osoittivat lisääntynyt riski rintasyövän, keuhkosyövän, eturauhassyövän, kohdunkaulan syöpä, ja muiden syöpien eri malleja. Kun alaryhmien analyyseissä ”suun syöpä” ja ”peräsuolen syövän,” emme löytäneet Merkitsevä yhteys 1772C /T-polymorfismi ja syöpäriskiä. 1790G /A-polymorfismi näytteillä lisääntynyt syöpäriski keuhkosyöpä homozygoottisia ja väistyvä mallit (AA vs. GG: OR = 5,42, 95% CI: 2,75, 10,7;
P
heterogeenisyys = 0,866 ; AA vs. GG /GA: OR = 7,11, 95% CI: 3,61, 14,0;
P
heterogeenisyys = 0,975: A vs. G: OR = 1,48, 95% CI: 1,09, 2,00
P
heterogeenisyys = 0,575) ja eturauhassyövän (A vs. G: OR = 1,45, 95% CI: 1,00, 2,11;
P
heterogeenisyys = 0,330 ). Löysimme Merkitsevä yhteys 1772C /T ja 1790G /A polymorfismien ja syövän riskiä sekä väestöpohjainen ja sairaala perustuvat tutkimukset.
Kuitenkin etnisen vaikutti merkittävästi syöpäalttiutta. Sillä 1772C /T-polymorfismi, joka on merkittävästi lisääntynyt syöpäriskiä löydettiin sekä aasialaiset ja valkoihoiset. Sillä 1790G /A-polymorfismi, joka on merkittävästi lisääntynyt syöpäriskiä löydettiin valkoihoiset heterozygoottiset verrattuna (AA vs. GG: OR = 17,4, 95% CI: 4,01, 75,3;
P
heterogeenisyys
P
heterogeenisyys 0,01). Kuitenkaan mitään merkittävää yhteyttä näiden polymorfismien ja syövän riskiä löytyi aasialaiset. Nämä tulokset paljastivat, että vaikutus HIF-1α polymorfismien syövän liittyi etnisyys.
Herkkyystarkastelu
Herkkyysanalyysi suoritettiin tutkimaan vaikutuksen yksittäisen tutkimuksen yhdistetyissä tuloksissa poistamalla yksi tutkimus aina yhdistetystä analyysistä. Tulokset osoittivat, että mikään yksittäinen tutkimus vaikuttaa merkittävästi yhdistetyssä TAI koska mitään huomattavia muutoksia havaittiin (kuva ei näy).
Julkaisu bias
Julkaisu bias arvioitiin Begg n suppilo juoni ja Egger testi. Begg n suppilo tontin 1772 C /T polymorfismin on esitetty kuviossa 6 (
P
= 0.589 T-alleelin vs. C-alleelin). Egger testi suoritettiin tilastollinen analyysi, eikä julkaisu bias havaittu (
P
= 0,481 T alleelin vs. C-alleelin). Tulokset Begg ja Egger n testit 1790 G /A-polymorfismi oli
P
= 0,785 ja
P
= 0,870, vastaavasti, A alleelin versus G-alleelin (kuvio 7). Kaiken kaikkiaan ole julkaistu bias havaittu data.
Keskustelu
HIF-1 on tärkeä tehtävä syövän etenemisen ja etäpesäkkeiden aktivoimalla eri geenejä, jotka liittyvät angiogeneesin säätelyyn, solujen selviytymisen, ja energia-aineenvaihdunta [3]. Läsnäolo T ja variantti alleelien HIF-1α 1772, nimittäin C /T ja 1790 G /A polymorfismien, liittyy korkea transkription kykyjä ja proteiinisynteesiä in vitro [8]. In vivo -tutkimukset, jotka liittyvät näiden geneettisten muutosten monia aggressiivinen kliinisiä piirteitä syövän, kuten haavainen kasvun malli ja peräsuolen kasvaimia, mikä viittaa siihen, että HIF-1α polymorfismi liittyy syöpään [45]. Kuitenkin tutkimukset yhdistys HIF-1α 1772 C /T ja 1790 G /A polymorfismien syöpään ovat ristiriitaisia. Vuonna 2009 Zhao [10] teki meta-analyysin avulla 16 tapausverrokkitutkimukset ja totesi, että 1772 C /T liittyy merkittävästi suurempi syöpäriski ja 1790 G /A on vain huomattavasti liittyy rintasyöpään. Liu [12] toteuttanut vastaavan Meta-analyysi 22 tapausverrokkitutkimukset, mukaan lukien 5552 tapaukset ja 8044 säätimet 1772 C /T ja 3381 tapauksissa ja 5830 säätimet 1790 G /A, ja yhdessä tutkimuksessa arvioitiin syövän ennuste by polymorfismi [45 ]. Tämä edellinen Tutkimuksessa todettiin, että 1790 G /A-polymorfismi eikä 1772 C /T-polymorfismi liittyy merkittävästi syöpäriskiä. Tässä tutkimuksessa, teimme päivitetty meta-analyysi 34 tapausverrokkitutkimukset että mukana 7522 tapauksissa ja 9847 säätimet 1772 C /T polymorfismin ja 4884 tapauksissa ja 8154 säätimet 1790 G /A-polymorfismi.
Tässä meta-analyysissä, tutkimme yhdistys HIF-1α 1772 C /T ja 1790 G /A polymorfismien syöpäriskiä. Alaryhmäanalyyseissa syöpätyypin ja etnisen suoritettiin myös. Meidän analyysit osoittivat, että molemmat 1772C /T ja 1790G /A polymorfiat liittyi merkittävästi syöpäriskiä. Alaryhmässä tutkimuksessa, erilaisia syöpiä, kuten rinta- syöpä, keuhkosyöpä, eturauhassyöpä, ja kohdunkaulan syöpä, liittyi 1772C /T, kun taas vain keuhkosyöpä oli yhdistetty 1790G /A. Kuitenkin kertoimet suhde arvoja joissakin alaryhmäanalyyseissa olivat suuria ja puuttui tilastollinen voima, koska merkittävä heterogeenisyys. Etninen voi myös merkittävästi vaikuttaa syöpäalttiutta. Sillä 1790G /A-polymorfismi, emme löytäneet mitään assosiaatiota 1790G /A polymorfismin ja syöpäriskin aasialaiset. Tämä havainto voidaan selittää ero geneettinen tausta, ympäristötekijät, ja riskitekijät liittyvät elämäntapaan Aasian ja Kaukasian väestölle.
Joitakin rajoituksia tämän meta-analyysissä olisi käsiteltävä. Ensinnäkin puute yksityiskohtaisia tietoja ympäristöstä syövän riskitekijöitä riski mukana tutkimuksissa rajoittaneet lisäarviointia mahdollisten geenien geeni ja geeni-ympäristön vuorovaikutukset. Toiseksi
P
arvo Hardy-Weinberg tasapaino kolmen mukana tutkimuksissa oli alle 0,05, mikä viittaa siihen, että tutkimuspopulaatiossa eivät olleet edustava laajempaa kohderyhmä. Näistä rajoituksista huolimatta meidän meta-analyysi oli joitakin vahvoja etuja. Tämä meta-analyysi valottaa yhdistyksen välillä HIF-1α polymorfismien ja lisääntynyt riski erilaisiin syöpiin. Lisäksi laatu mukana tutkimuksissa oli tyydyttävä ja tapasimme kriteerinä. Lisäksi huomattava määrä tapauksia ja valvonta yhdistettiin eri tutkimuksista, joka lisäsi merkittävästi tilastollinen voima analyysin. Julkaisua ei bias todettiin myös, että kerätyt tiedot.
Yhteenvetona tämä meta-analyysi tarjotaan oivalluksia yhdistys HIF-1α 1772 C /T ja 1790 G /A geenipolymorfismien syöpäriskiä, tukemalla hypoteesi, että HIF-1α polymorfismit ovat alttiutta markkeri syövän. Kuitenkin suuri näyte tutkimuksia perusteltua vahvistaa havaintomme, erityisesti joissakin syöpien, kuten rintasyövän ja kohdunkaulan syövän. Lisää tutkimuksia geeni-geeni ja geeni-ympäristön vuorovaikutukset olisi myös harkittava tulevaisuudessa saada kattavampi käsitys yhdistyksen välillä HIF-1α polymorfismien ja syöpäriskiä.
tukeminen Information
tarkistuslista S1.
PRISMA tarkistuslista.
doi: 10,1371 /journal.pone.0080396.s001
(DOC) B