Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Genetic muunnelmia nikotiiniasetyylikoliini reseptorin ja alkoholin aineenvaihduntaan geenit on liittynyt taipumus polttaa tupakkaa ja alkoholia, vastaavasti, ja myös sekaantunut geneettinen alttius pään ja kaulan alueen syöpä. Lisäksi tupakointi ja alkoholin, tupakan pureskelu on tärkeä suullinen syövän riskitekijä Intiassa. Ei tiedetä, jos nämä geneettiset variantit vaikuttavat taipumus tai suullinen syöpäalttiutta yhteydessä näillä erillisillä verestä.

Methods

Tutkimme 639 suun ja nielun syöpätapausta ja 791 valvontaa kahdesta tapaus- ohjaus tutkimukset Intiassa. Olemme tutkineet kuusi variantteja tiedetään vaikuttavan nikotiiniriippuvuus tai alkoholin metaboliaa, kuten rs16969968 (

CHRNA5) B, rs578776 (

CHRNA3) B, rs1229984 (

ADH1B

), rs698 (

ADH1C

), rs1573496 (

ADH7

), ja rs4767364 (

ALDH2

).

tulokset

CHRN

variantteja liittyy määrä pureskelun tapahtumia päivässä, mukaan lukien ne, jotka pureskella tupakkaa mutta koskaan tupakoinut (P = 0,003, P = 0,01 rs16969968 ja rs578776 vastaavasti). Variantin läsnäollessa alleelin myötävaikuttanut noin 13%: n ero pureskelu taajuuden verrattuna ei-kantajia. Vaikka ei havaittu yhteyttä välillä rs16969968 ja suun syöpäriski (OR = 1,01, 95% CI = 0.83- 1.22), rs578776 oli vaatimattomasti liittyi 16% pienentynyt riski suusyövän (OR = 0,84, 95% CI = 0.72- 0.98 ). Oli vähän näyttöä yhteydestä polymorfismien geeneissä, jotka koodaavat alkoholin aineenvaihduntaan ja suusyövän tässä ryhmässä.

Johtopäätös

välinen yhteys rs16969968 ja lukumäärän pureskelua tapahtumia merkitsee, että vaikutus tupakoinnin taipumus siirrettävä tämän geenin muunnos ulottuu käytön savuton tupakka.

Citation: Anantharaman D, Chabrier A, Gaborieau V, Franceschi S, Herrero R, Rajkumar T, et al. (2014) geneettisiä variantteja nikotiinin väärinkäytön ja alkoholi Metabolism Geenit, Oral syöpäriski ja Taipumus Savu ja alkoholia A Replication Study Intiassa. PLoS ONE 9 (2): e88240. doi: 10,1371 /journal.pone.0088240

Editor: Qing-Yi Wei, Duke Cancer Institute, Yhdysvallat

vastaanotettu: 07 lokakuu 2013; Hyväksytty: 8. tammikuuta 2014; Julkaistu: 05 helmikuu 2014

Copyright: © 2014 Anantharaman et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: International suusyöpä tutkimuksen rahoitti International Agency for Research Cancer. Mumbain Tutkimus tukee Department of Biotechnology, Intian hallitus (BT /PR 2277/09/333/2000). National Institute of Dental ja kallon ja kasvojen tutkimus apurahan rahoitti laboratorioanalyysejä tätä tutkimusta varten (R03 DE020116). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista tämän käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Syövät suuontelon ja nielun edistää lähes 400000 uutta tapausta vuosittain maailmanlaajuisesti yli puolet joita esiintyy Intiassa. Joka vuosi yli 200000 kuolee sairauden, ja yli kolmannes näistä kuolemista tapahtuu Intiassa [1]. Tupakoinnin ja alkoholin kulutus ovat keskeisiä vahvistettu riskitekijät suusyöpää, jossa käytetään savuton tupakka on erityisen tärkeää Intian väestöstä [2]. Altistuminen ihmisen papilloomaviruksen on yhä tärkeämpää syöpiin suunielun [3], [4].

Genome-laajuinen yhdistys tutkimukset (GWAS) tunnistivat tautiherkkyyteen loci erilaisia ​​monimutkaisia ​​sairauksia [5]. Keuhkosyöpä GWAS ja nikotiiniriippuvuuden tutkimukset ovat tunnistaneet 15q25-lokuksen kätkeminen nikotiiniasetyylikoliini reseptorin (

CHRN) B-geeni klusterin [6] – [8]. Nämä geenit koodi reseptoreihin ilmaistuna hermosolujen ja muiden epiteelisolujen, jotka sitoutuvat nikotiinin ja nikotiinia johdannaiset [9], [10]. Kaksi

CHRN

reseptorin alayksikköä variantteja, rs16969968 ja rs578776 on johdonmukaisesti liittynyt keuhkosyövän riskiä ja tupakointikäyttäytymistä useissa populaatioissa [11] – [15]. Homotsygoottinen harjoittajien rs1669968 harvinainen alleeli on raportoitu polttaa noin 1,2 savuketta enemmän päivässä [13]. Edelleen, tämä variantti on myös liitetty suurentunut riski Ylä Aero-ruoansulatuskanavan (UADT) syöpä. UADT syöpä GWAS ja kandidaattigeenifragmenttikloonien yhdistys tutkimuksissa on todettu geneettisiä variantteja on 4Q (rs1229984, rs698, rs1573496) ja 12q (rs4767364) loci sisältävien geenien alkoholin metaboliaa [16], [17]. Tasapaino alkoholidehydrogenaasi ja aldehydidehydrogenaasin toiminta on ehdotettu säätelemään veren asetaldehydiä pitoisuuksina, jotka määrittävät epämiellyttäviä oireita alkoholin kulutus, vaikuttaen kyky alkoholia ja mahdollisesti syövän riski [18], [19]. Alkoholi ja aldehydidehydrogenaasin geenit (

ADH ja ALDH,

vastaavasti) on yhdistetty pään ja kaulan syövän riskiä [16], [17], [20]. Vaikka alkoholi on tärkeä ja vakiintunut riskitekijä suusyöpää Intiassa [21] – [24], on niukasti tietoa yhdistyksen

ADH

ja

ALDH2

variantteja tässä väestöstä.

tässä tutkimuksessa pyrittiin (i) onko yhdistyksen välillä

CHRN

variantit ja alttiutta savun ulottuu savuton muotojen tupakoinnin (ii) tutkia, jos

CHRN

perimä vaikuttaa alttiuteen suusyövän riski Intiassa, (iii) selventää yhdistyksen potentiaalinen syy variantit 4q23 (

ADH) B ja 12q (

ALDH2) B lokuksen ja riski suusyövän Intiassa.

Materiaalit ja menetelmät

Ethics selvitys

Kirjallinen suostumus saatiin kaikilta osapuolilta. IARC monikeskustutkimus hyväksyttiin keskitetysti Cancer Institute eettisen lautakunnan Chennai, Intia ja yleinen tutkimus hyväksyi IARC eettisen arviointikomiteaan klo International Agency for Research Cancer (IARC), Lyon, Ranska. Mumbain hyväksyi tutkimuksen sairaalan eettisen komitean Tata Memorial Hospital Cancer Research Institute Mumbaissa, Intiassa.

Study kuvaus

Tästä selvityksestä hyödynnetään tapausten ja kontrollien kahdesta aikaisemmin tehdyissä tutkimuksissa Intia: International monikeskustutkimus suusyövän tutkimus (IARC tutkimus), ja Mumbai tutkimus. IARC Tutkimuksen koordinoi International Agency for Research Cancer (IARC) yhdeksässä maassa vuonna 1996 vuoteen 1999. Tutkimukseen otetuista tapausten ja kontrollien kolmesta eri puolilla Intiaa, kuten Bangalore, Chennai ja Trivandrum. Tapauksia histologisesti tai patologisesti vahvistettu primaarisyöpien suuontelon ja nielu. Hospital perustuvat tarkastukset, yksi kussakin tapauksessa taajuus sovitettu iän (5 vuoden aikana), sukupuoli ja keskus rekrytoitiin. Yleinen Tutkimuksen osallistumisprosentti oli 93%, yksityiskohdat on kuvattu muualla [25] – [27]. Mumbain Tutkimuksen suoritti Cancer Research Institute, Advanced Center for Treatment, tutkimus- ja koulutus Syöpä Tata Memorial Center, vuonna 2001 2004 Tapauksia histologisesti diagnosoitu suuontelon syöpien ja asianmukaista valvontaa, taajuus sovitettu iän ( 5 vuotta välein), sukupuoli ja tupakka tottumukset rekrytoitiin Tata Memorial sairaalan veripankkien ja lähellä hammasklinikoita [28]. Lifestyle ja demografiset tiedot kerättiin heti henkilökohtaisen haastattelun molemmissa tutkimuksissa.

Laboratoriomenetelmät

Genominen DNA uutettiin verinäytteistä käyttäen QIAamp 96 DNA Veri Kit (Qiagen, Hilden, Saksa), tai kanssa Puregene kemia (Gentra Systems, Minneapolis, MN, USA) koskevasta Autopure väline (Gentra Systems) on IARC tutkimuksessa. Mumbain tutkimuksessa DNA uutettiin seuraavat vakioyhteyskäytäntöä Sambrook et ai [29]. DNA mitattiin käyttämällä PicoGreen kaksijuosteisen DNA: n kvantifiointiin sarjat (Molecular Probes, Leiden, Alankomaat). Kaikki polymorfismit analysoitiin keskitetysti IARC käyttäen 5 ’eksonukleaasimääritys. PCR-alukkeita ja TaqMan-koettimet syntetisoitiin Applied Biosystems (Foster City, CA). Varmistaakseen laadunvalvonta, DNA-näytteet tapauksessa potilaiden ja verrokkien jaettiin satunnaisesti kustakin PCR levy, ja kaikki genotyypitys suoritettiin henkilökunnan sokaissut tapaus-verrokki tila. Kymmenen prosenttia koehenkilöistä (eli sekä asia potilaiden ja verrokkien), valittiin satunnaisesti uudelleen genotyypitys jokaisen polymorfismin tutkia luotettavuutta genotyypityksen määrityksissä kaikki määritykset oli yksimielisiksi 99%. Lopullinen analyysit sisältyvät näytteiden läpäissyt tiukat laatukriteerit (QC) kriteerit. Kohteet jätettiin pois, jos ne eivät ole kahden tai useamman kuuden genotyypin määritykset suoritettiin. Edelleen vain tapauksissa 95% genotyypityksen onnistumisprosentti oli mukana. Alkuperäinen IARC Tutkimukseen otetuista 582 tapausta ja 582 valvontaa Intiasta. Näistä 935 aiheita genotyypattiin, joista 872 läpäisi kuvattu QC kriteerit ja olivat mukana tässä analyysissä. Mumbain tutkimuksessa on 576 aiheista genotyyppi, 226 tapausta ja 332 valvontaa tyhjentänyt kuvatut QC ja otettiin mukaan tähän analyysiin. Kaikkiaan 639 tapausta ja 791 kontrollia sisällytettiin tähän analyysiin seuraavat poikkeukset on kuvattu edellä.

Tilastolliset menetelmät

Data alkoholin kulutusta, tupakointi, purukumit ja tupakointi kerättiin sekä osallistuvat tutkimuksiin . Määritelmä juomari, tupakoitsija ja chewer olivat yhdenmukaiset molemmissa tutkimuksissa ja mukana henkilöitä, jotka vastasivat vahvistaa koskaan käytä alkoholia, koskaan tupakointi tahansa tupakkatuotetta (savuke, sikari, putki, vesipiippu, savuke- ja /tai bidi), koskaan käytä mitään poltettavien tupakkatuotteen tai ilman betel puntaa. Useat muodot nuuskan kulutetaan Intiassa, kun taas

khaini, Mawa, mishri, zarda, gudakhu

ja

gutkha

ovat kaikki, jotka sisältävät tupakan eri makuainetta

s, pannulla masala

on areca mutteri tuotteen, joka ei sisällä tupakkaa, joihin tupakka voidaan lisätä ulkoisesti. Kesto ja tiheys altistumisen tupakan ja alkoholin laskettiin kussakin tutkimuksessa kuten aiemmin on kuvattu [25] – [28]. Lyhyesti, tupakointi kesto laskettiin erotus ikä testin alussa ja ikä lopettaa tupakoinnin, ottaen huomioon päällekkäiset kaudet erilaisten tupakoinnin (paitsi Mumbain tutkimuksessa, jossa vain savukkeen ja bidi käyttö nauhoitettiin, ja hyvin harvat päällekkäisiä vastuita havaittiin). Tupakointi taajuus laskettiin useita savuke ekvivalenttien savustettu päivässä, 1 sikari = 4 savukkeita, 1 putki = 5 savuketta ja 1 bidi = 0,5 savukkeita. Chewing mukana käyttö poltettavien tupakkatuotteiden, kuten betel mälli, areca mutteri /tai ilman tupakkaa ja

pannulla masala

vuonna IARC tutkimuksessa, ja tupakka kalkilla,

pannulla masala, khaini, Mawa, mishri, zarda, gudakhu, nuuska

ja

gutkha

Mumbain tutkimuksessa. Märehtiä taajuus laskettiin kumulatiivinen määrä pureskelun tapahtumia päivässä, ottaen huomioon päällekkäiset kaudet altistumisen. Laskentaa varten eliniän alkoholin kulutuksen prosenttiosuus etanolin arvioitiin 40% väkevien (viski, gini, rommi, brandy, arrakin ja maa viina), 3% oluen ja 5% toddy (paitsi Mumbai tutkimuksessa) . Tupakointi, pureskelu ja alkoholiin liittyviä suun syöpäriski laskettiin logistisen regression malleja oikaistu ikä, sukupuoli, koulutustaso ja keskustan. Vastaavat johtuu jakeet perusteella lasketaan kaavalla: p (ec) x (OR-1) /TAI; jossa p (ec) on osuus altistuneiden joukossa tapauksia [30], [31]. Chi-square suoritettiin vertaamaan alleelifrekvenssit havaittu tässä tutkimuksessa meidän aiemmin julkaistu tulokset [16], [17]. Liitot välinen perimä ja suusyövän arvioitiin logistisella regressiolla oikaistu iän, sukupuolen ja keskus ja tupakan käyttö tarvittaessa. Yhdistys välinen

CHRN

variantteja ja taipumus käyttää tupakan arvioitiin käyttäen lineaarista regressiomallien log muuttaneet useita savuke ekvivalenttien savustettu päivässä, tai lukumäärä pureskelun tapahtumia päivässä kuin tulosmuuttujana. Tulokset edustavat taitettavan määrän muutos poltettujen savukkeiden päivässä tai lukumäärää pureskelun tapahtumia päivässä jokaisen kopion harvinainen alleelin. Nämä analyysit oikaistiin iän, sukupuolen, keskusta ja tapaus-verrokki tila. Samanlaisia ​​analyysit suoritettiin tutkimaan yhdistyksen välillä ADH /ALDH2 variantteja ja taipumus juoda alkoholia, mitattuna määrä juomia etanolia kulutetaan päivässä. Kaikki tilastolliset analyysit suoritettiin käyttäen STATA versio 11 (STATA Corp, College Station, Tx) ja raportoitu p-arvot ovat kaksipuolisia.

Tulokset

Taulukko 1 kuvataan ominaisuudet tutkimuksen väestöstä. Niistä 639 tapausta ja 791 valvontaa mukana tässä analyysissä, IARC kansainvälinen tutkimus osaltaan suurin osuus, (61%). Suurin osa tapauksista oli miehiä (65%) ja oli suorittanut alhaisempi koulutustaso ja olivat syöpiä suuontelon (96%). Tupakoinnin ja pureskelu liittyi kohonnut suusyövän (OR = 5,23, 95% CI = 3.39- 8.07 ja OR = 8,30, 95% CI = 5.78- 11,93, vastaavasti), ja siinä on hyödynnetty sekä tupakoinnin ja poltettavien tupakkatuotteiden koitui 12-kertaiseksi kohonnut suusyövän (OR = 12,40, 95% CI = 7.80- 19.70). Koskaan käytä alkoholia liittyi 1,67-kertaisesti lisääntynyt riski suusyövästä (OR = 1,67, 95% CI = 1.25- 2.22).

Jakelu kaikki kuusi variantteja tarkastellaan tässä analyysissä vastasi odotuksia genotyypin jakaumat perustuu Hardy-Weinberg periaate. Alleelifrekvenssien olivat samanlaisia ​​koko osallistuvien tutkimuksissa (tietoja ei esitetä). Huomasimme, että variantit alkoholidehydrogenaasi genes- rs1229984 (

ADH1B) B, rs698 (

ADH1C) B ja rs1573496 (

ADH7) B ja nikotiiniriippuvuuden geenivariantin rs16969968 olivat harvinaisempaa intiaanien verrattuna aikaisempiin tutkimuksiin voimistuvan Länsi populaatioissa. Toisaalta, rs578776 oli yleisempää Indians (Ptaulukko 2).

tutkinut yhdistyksen välillä

CHRN

variantteja ja taipumus käyttää tupakka; tulokset on koottu taulukkoon 3. kantajia rs16969968 harvinainen alleelin (A) osoitti jonkin verran taipumusta polttaa enemmän, vaikka eivät olleet tilastollisesti merkitseviä. Havaitsimme myös kasvu taipumus pureskella tupakan kanssa rs16969968 variantti (p = 0,03). Läsnäolo jokaisen kopion A-alleelin vastasi kasvua 13% enemmän pureskelua tapahtumaa päivässä (fold-muutos = 1,13, 95% CI = 1.01- 1.25) verrattuna ei-kantajia. Yhdistys pureskelussa pysyi voimakkaana upon lisäsäätöjä tupakoinnin taajuuden (fold-muutos = 1,13, 95% CI = 1.01- 1.26) ja yhdistys olivat yhdenmukaisia ​​keskuudessa koskaan tupakoija pureskella tupakkaa (p = 0,003) (fold-muutos = 1,19, 95% CI = 1.06- 1.34). Havaitsimme samanlainen väheneminen taipumus pureskella joukossa kantajia rs578776 harvinainen variantti (fold-muutos = 0,91, 95% CI = 0.84- 0.99), yhdistys on vahvempi keskuudessa chewers joka ei koskaan savustettu.

Ei yhdistys ei havaittu rs16969968 ja suun syövän riskiä tässä tutkimuksessa yleistä (OR = 1,01, 95% CI = 0.83- 1.22), sukupuolen (p-heterogeenisuus = 0,33). Vaikka mitään vaikutusta muutokseen, tupakointi tai pureskella asema ei havaittu, joka on statiscally ei-merkitsevä oddds suhde 1,22 (95% CI = 0.69- 2.13) havaittiin chewers ja tupakoitsijat (kuvio 1). Huomaamme vähän näyttöä tilastollinen vuorovaikutuksen rs16969968 variantin ja tupakan käytön riskiä suusyövän (OR: 1,18, 95% CI: 0.68- 2.07). Toisaalta, rs578776 liittyi vähentynyt riski suusyövän tässä tutkimuksessa (OR = 0,84, 95% CI = 0.72- 0.98). Geeni-annoksen vaikutus havaittiin harjoittajien harvinainen alleelin (p-trendi = 0,02). Vaikka ei ole heterogeenisyyttä havaittu perustuu tupakan tottumukset, alentunut riski havaittiin myös muun tupakoimattomia ja koskaan chewers (OR = 0,64, 95% CI = 0,43-0,96) (kuva 1).

Paneeli A esittää assosiaatio rs16969968 ja suun syöpä; Paneeli B esittää yhdistyksen välillä rs578776 ja suun syöpä. Forest juoni edustaa kertoimet tunnusluvut on saatu tukista lisäaine monimuuttuja malli ikä-, sukupuoli, koulutustaso ja keskustan tarvittaessa.

Tutkimme variantit liittyvistä geeneistä alkoholin aineenvaihduntaan, koska ne olivat yhteydessä pään ja kaulan alueen syöpä aiemmissa tutkimuksissa. Yksikään neljästä variantteja (rs1229984, rs698, rs1573496, ja rs4767364) tutki, osoittivat mitään yhteyttä suullinen syöpäriski (taulukko 4). Olemme myös suorittaa rajoitettu analyysien joukossa koskaan juovat annettiin tärkeä vaikutus muutokseen, alkoholin kulutus. Vaikka puute yhdistyksen pysyi johdonmukaisesti, havaitut arvioiden seurannut suuntaan odotettavissa perustuvat odotuksiin aiemmista GWAS ja kandidaattigeenifragmenttikloonien tutkimuksia. Kerrostunut analyysit sukupuolen perusteella ei ilmennä heterogeenisuus havaitun puutteen yhdistysten (taulukko 4). Edelleen, yksikään perimä alkoholin aineenvaihduntaan geenit näyttivät vaikuttavan alkoholin kulutuksen (taulukko S1).

Keskustelu

CHRN

variantteja, rs16969968 ja rs578776, on liittynyt nikotiiniriippuvuutta ja keuhkosyövän riskiä ja näiden järjestöjen näyttävät olevan riippumattomia [15], [32]. Tässä osoitamme, että yhdistyksen välillä

CHRN

vaihtoehdot ulottuu myös taipumus pureskella tupakkaa, asiaa suusyövästä riskitekijä Intian väestöstä.

Useita formulaatioiden poltettavien tupakkatuotteiden on kaupallisesti saatavilla ja käytetään yleisesti Intiassa; nämä ryhmiteltiin yhdessä tässä tutkimuksessa. Määrä pureskelun tapahtumia päivässä kirjattiin molemmissa tutkimuksissa sisällytetty tähän analyysiin; On kuitenkin tärkeää huomata, että tämä ei vastaa tuotteen määrä pureskella joka kerta ja siten muodostaa mahdollinen lähde Luokitteluvirheillä altistumisen. Koska vietämme mitattavissa yhdessä tällaisen karkean arvion merkitsee, että todellinen vaikutus

CHRN

variantteja ja purevien riippuvuus saattaa olla potentiaalisesti suurempi kuin on havaittu tässä tutkimuksessa. Aiemmat tutkimukset ovat osoittaneet, että UADT syöpäriski liittyy rs16969968 on yleisempää naisilla ja syöpien suuontelon ja kurkunpään [13], [33]. Tässä tutkimuksessa lisääntynyt taipumus pureskella tupakka eivät johtaneet lisääntyneeseen riskiin suun syöpään rs16969968; vaikka rs578776 liittyi sekä alentaneet pureskelua taipumus ja vaatimaton väheneminen suun kautta syöpäriskiä. Mielenkiintoista, rs578776 liittyi myös laskenut suun syöpäriskin koskaan tupakan käyttäjille, vaikkakin perustuu pieniin numeroihin. Tämä yhdistys voi vaikuttaa Luokitteluvirheillä altistumisen tai mahdollisesti kautta tupakan itsenäinen vaikutus. Suuremmat keskittynyt tutkimuksia tarvitaan käsittelemään tätä kysymystä.

ADH

geenejä, korreloi seurauksena kytkentäepätasapainossa, sijaitsevat 4q23 lokuksessa. Kolme alleelit, rs1229984, rs698 ja rs1573496 sisällä

ADH

lokus on liitetty UADT syöpäriskin eurooppalaisten ja muiden Aasian populaatiot [17], [34] – [36]. Vaikka on jonkin verran näyttöä siitä,

ADH

variantit voivat vaikuttaa suun ja kaulan syövän riskiä Intiassa, erityisesti rs698 [37], havaitsimme ei yhdistyksen välillä rs1229984, rs698 ja suun syöpäriskiä. Samoin

ALDH2

variantti rs4767364, jotka oli äskettäin UADT GWAS [17], ei liittynyt suusyövän tässä tutkimuksessa. Osa alkoholinkäyttäjistä tässä tutkimuksessa oli verrattavissa muihin raportin tästä väestöstä, mutta on huomattavasti pienempi kuin raportoitu eurooppalaisten keskuudessa [38], [39]. Edelleen harvinaisuus riskin alleelien Intian väestöstä viittaa siihen, että osuus alkoholin ja alkoholiin liittyvien variantit suun syöpäalttiutta Intiassa on todennäköisesti rajallinen.

parhaan tietomme, raportoimme varten ensimmäistä kertaa, että yhdistyksen välillä 15q25-lokuksen ja taipumus polttaa ulottuu tupakka pureskelua. Tarjoamme myös viittaavia todisteita siitä, että 15q25 alueen sisältävä

CHRN

geeni klusterin voi edistää suusyövän herkkyys Intiassa. Tässä tutkimuksessa rs16969968 variantti liittyi lisääntynyt alttius pureskella tupakkaa, ja rs578776 liittyi vähentynyt purukumit taipumus ja suun syöpäriskiä. Suuremmat tutkimuksia tarvitaan täsmentämään riskin muutos välittyy taipumus käyttää tupakkaa. Tämä tutkimus osoittaa myös, että variantit alkoholiin metabolizing geenit näyttävät olevan vähemmän tärkeitä suusyövän herkkyys Intiassa. Nämä tiedot toistaa, että on tärkeää sairauden etiologiasta, suhteellinen osuus riskitekijöitä ja niiden vaikutuksia replikaatio GWAS tunnistetun riskin loci poikki populaatioissa.

tukeminen Information

Taulukko S1.

Vaihtoehdot alkoholin metaboloivien geenien ja alkoholin kulutusta. Fold-muutos olivat peräisin lineaarisesta regressiomalleja ikä-, sukupuoli, keskusta ja tapaus-verrokki tila. Log muuttaneet määrä alkoholijuomien päivässä käsiteltiin kuten tulosmuuttujana kunkin vastaavan geneettisen variantin kuin selittävät.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0088240.s001

(DOCX) B

Kiitokset

kirjoittajat kiittää kaikkia osallistujia, jotka osallistuivat tähän tutkimukseen.