Geenitestit elintärkeää hepatiitti puhkeaminen
Jennifer Bails
TRIBUNE-KATSAUS
torstai 29 syyskuu 2005
Terveysviranomaiset vastasi nopeammin hepatiitti A-epidemia Beaver County kaksi vuotta sitten, koska geneettiset testit aikana käytetyt puhkeaminen tuottanut tulosta muutamassa päivässä, mukaan uusi valtion ja liittovaltion raportti.
tekniikkaa kutsutaan virus sekvensointi mahdollisti Yhdysvaltain Food and Drug Administration välittömästi käynnistää tutkimuksen nähdä, jos kevätsipulia tuotu Meksiko aiheutti epidemian, joka sairastui 660 ihmistä ja tappoi neljä, mukaan analyysiin, joka julkaistaan vuonna 15 lokakuu kysymys The Journal of Infectious Diseases, mutta nyt saatavilla verkossa.
Ilman tätä molekyyli todisteita, FDA voinut t ovat alkaneet jäljitetään lähde kunnes lääkäri etsivää valmis haastattelemalla hepatiitti A potilaille niiden oireita ja mitä ruokia he söivät ja missä, sanoi tohtori Anthony Fiore, lääketieteellinen epidemiologi Yhdysvaltain Centers for Disease Control and Prevention Atlantassa.
”tässä tapauksessa, pystyimme tekemään oletettu yhteys vihreää sipulia viljelijöiltä Pohjois-Meksikossa muutaman päivän alusta puhkeaminen juuri perustuu viruksen sekvensointi yksin” Fiore sanoi. ”Tämän seurauksena FDA voisi saada paluuseurannan tutkinta alkoi aikaisemmin, mikä johti heidät laittaa merenkulun kielto tuottaa kasvanut neljä tiloilla.”
Tämä menestys voi johtaa laajaan käyttöön virus- sekvensoinnin seurata taudin puhkeamisen , Fiore sanoi. Samanlaisia menetelmiä jo käytetään rutiininomaisesti geneettisen vertailun bakteerien liittyy E. coli ja salmonellamyrkytykseen.
Viral sekvensointi määrittää tarkkaa järjestystä kemian yksiköt, jotka muodostavat geneettisen koodin virus. Hepatiitti A-, geneettisen koodin koostuu yksiköistä, joita kutsutaan RNA, joka on rakenteeltaan samankaltainen kuin DNA. Jotkut osat RNA-sekvenssin vaihtelevat hieman kannasta toiseen. Tutkijat verrata vaihtelut kertomaan, kuinka tiiviisti yhteen viruskantaa liittyy toiseen.
Teknologia on tullut vasta viimeisen vuosikymmenen aikana sekvensoida RNA tarpeeksi nopeasti käytettäväksi aikana hepatiitti A puhkeamisen sijaan jälkeenpäin, Fiore sanoi.
viimeisten viiden vuoden aikana tutkijat oppivat myös poimia virus näytteiden sopiva sekvensointi verestä seerumista, hän sanoi. Aiemmin ulostenäytteitä tarvitaan, joka oli hitaampaa.
”Tekniikka on kehittynyt tarpeeksi, että nyt voimme saada tuloksia virus sekvensointi vähemmän kuin kaksi päivää,” Fiore sanoi.
Syyskuussa 2003, Tennessee, North Carolina ja Georgia raportoitu 422 tapausta elintarvikeperäisten hepatiitti A virusta Centers for Disease Control and Prevention. Kautta potilashaastattelut ja virusten sekvensointi, CDC virkamiehet määritellään ne tapaukset liittyvät kulutusta saastuneen kevätsipulia, mahdollisesti tuotu Meksiko.
Niitä käärimistä tutkimuksen lokakuun alussa kuin suojelijoita Chi-Chi ravintolassa Beaver County Mall tietämättään söi saastunut kevätsipuli.
Vaikka epidemiologit alkoi haastattelemalla potilaita Beaver County alue, CDC tutkijat alkoivat sekvensoimalla viruskantoja eristetty veressään.
Vaikka haastattelut olivat käynnissä, tutkijat löysivät RNA-sekvenssi hepatiitti kanta Pennsylvaniassa potilailla erosivat vain yhden kemiallisen yksikkö viruksen Georgiassa ja Pohjois-Carolinassa puhkeamisen. Ja se poikkesi yhden yksikön päässä Tennessee virus.
”Se ei yksinään todistaa sen täytyi johtua samasta lähteestä, mutta se oli hyvä alustava näyttö siitä, että hyppy-koko prosessi alkoi nopeammin” Fiore sanoi.
Jennifer Bails tavoittaa [email protected] tai (412) 320-7991.