Krooninen sairaus

tiivistelmä

Tausta ja tavoitteet

Tuumorinekroositekijä-alfa (TNF-a) liittyi tulehdus ja mukana kehittämisessä paksusuolen syövän. Polymorfismit sijaitsee

TNF-a

promoottorialueen, kuten 308G /A ja 238g /A, voi vaikuttaa riskiä eri syöpien säätelemällä TNF-tuotannon. Tässä tutkimuksessa, meta-analyysi suoritettiin tutkimaan yhdistyksen välillä yhteisen polymorfismia

TNF-a

promoottorialueen ja peräsuolen syövän alttiuden.

Methods

etsiminen useista tietokannat tehtiin kaikille julkaisuja yhdistyksen välillä

TNF-a

polymorfismien ja peräsuolen syöpä. Yhteenveto kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmillä alueilla) kanssa 95%: n luottamusväli (95% CI) laskettiin käyttäen random-vaikutus malleja. Kerrostunut analyysit perustuvat etnisyyteen ja valvontaa väestön lähde tehtiin myös.

Tulokset

Kaiken

TNF-a

308A polymorfismi osoitti merkittävää yhteyttä kohonnut kolorektaalisyövän globaali väestö alle homozygoottisia vertailu [AA vs. GG, OR (95% CI) = 1,46 (1,07-1,97)] muu kuin heterotsygoottianalyysin vertailu [AG vs. GG, OR (95% CI) = 1,05 (0,93-1,19)].

TNF-a

238A ei liittynyt peräsuolen syöpäriski alle homozygoottisia tai heterotsygoottianalyysin vertailuja. Vuonna kerrostunut analyysissä merkittävää yhteyttä havaittiin vain Länsi populaatiot [AA vs. GG, OR (95% CI) = 1,39 (1,01-1,91)] muuta kuin Itä populaatioiden alle homotsygoottisia verrattuna. Mitään merkittävää eroa ei havaittu väestöpohjainen alaryhmä ja sairaala-pohjainen alaryhmä.

Johtopäätökset

TNF-a

308A kohtalaisesti liittyy suurentunut riski paksusuolen syövän Länsi populaatiot, ja

TNF-a

238A polymorfismi ei merkittävästi liittynyt peräsuolen syövän riskiä.

Citation: Min L, Chen D, Qu L, Shou C (2014) tuumorinekroositekijä polymorfismit ja peräsuolen syövän Risk: meta-analyysi. PLoS ONE 9 (1): e85187. doi: 10,1371 /journal.pone.0085187

Editor: Giuseppe Novelli, Tor Vergata University of Rome, Italy

vastaanotettu: 05 elokuu 2013; Hyväksytty: 02 joulukuu 2013; Julkaistu: 03 tammikuu 2014

Copyright: © 2014 Min et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat tohtorikoulutuskeskukselle of Higher Education of China (20110001110050) ja National 973 Program of China (2009CB521805). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

peräsuolen syöpä on kolmanneksi yleisin diagnosoitu syöpä ja neljänneksi yleisin syy syövän liittyvän kuoleman maailmanlaajuisesti [1]. Yli 1 miljoonaa uutta tapausta ja peräsuolen syöpä todettiin maailmanlaajuisesti vuosittain [2], ja yli 715000 kuolemantapausta johtui peräsuolen syövän 2010, lähes kaksi kertaa ja 490000 vuonna 1990 [3]. Peräsuolen syöpä on tulossa tärkeä kansanterveydellinen ongelma, erityisesti kehittyneissä maissa. Yhdysvallat, sekä ilmaantuvuus ja kuolleisuus paksusuolisyövän listalla kolmanneksi suurin kaikista syöpätapauksista sekä miehillä että naisilla, ja elinikäinen riski sairastua peräsuolen syöpä on noin 1 20 (5%) [4].

Viime aikoina useita riskitekijöitä ja peräsuolen syöpään havaittiin [5]. Niistä systeemisen tulehduksen markkerien, liikalihavuus ja diabetes todettiin liittyvän kolorektaalisyövän riski prospektiivisissa epidemiologisissa tutkimuksissa [6].

Bio- ja epidemiologiset tutkimukset osoittivat selvän yhdistyksen välillä krooninen tulehdus ja peräsuolen syöpä [ ,,,0],6] – [8]. Potilaat, joilla on tulehduksellinen suolistosairaus (IBD), kuten Crohnin tauti (CD) ja haavainen paksusuolen tulehdus (UC), on lisääntynyt riski paksusuolen syövän [7]. Epidemiologiset tutkimukset viittaavat voimakkaasti osallistumista geneettisten tekijöiden IBD kehittämiseen, erityisesti sellaisten, jotka liittyvät tulehdukseen [9], [10].

Tuumorinekroositekijä-alfa (TNF-a) on tärkein tulehdusta edistäviä osallistuva sytokiini solukasvun, erilaistumista ja apoptoosia [11], [12], joka on myös raportoitu olevan keskeinen rooli syövän synnyn [12]. Tämän mukaisesti suuri määrä tutkimukset osoittivat, että krooninen tulehdus ja pro-inflammatoristen välittäjien, kuten TNF-a voi lisätä riskiä maligniteetin [9], [13] – [15]. Koska transkriptio

TNF-a

säätelee promoottorialueen

TNF-a

geenin, monet tutkimukset ovat osoittaneet, että polymorfismit sijaitsee

TNF-a

promoottorialueen [ ,,,0],kuten 238 (rs361525), 308 (rs1800629), 857 (rs1799724), ja 1031 (rs1799964)] voitaisiin säädellä TNF-tuotannon, mikä vaikuttaa riski syöpiä [16] – [18].

äskettäin

TNF-a

308 polymorfismi vahvistettiin riskitekijänä erilaisia ​​syöpiä meta-analyysissä, kuten maha-, rinta- ja maksan syöpien [19] – [21]. Kuitenkin molemmat kahden edellisen meta-analyysit keskittyvät

TNF-a

308 polymorfismi väitti, että se ei merkittävästi liittynyt paksusuolisyövän riskin [22], [23], joka näkyy ristiriidassa tuloksiin muiden syöpien [19] – [21]. Ottaen huomioon pieni otoskoko sekä kaksi meta-analyysit (1708 ja 1742, vastaavasti), onko

TNF-a

308 polymorfismi liittyy peräsuolen syöpä on edelleen epäselvä. Siksi toinen hyvin hoidettu, riippumaton selvitys tästä asiasta ei tarvitse saada lopullista johtopäätöstä.

yhdistyksen välillä peräsuolen syövän riskiä ja muita SNP kuten 238, 857, 863 ja 1031, eikä integroitu analyysi on ollut tehty. Kun otetaan huomioon heterogeenisyys kunkin julkaistussa tutkimuksessa yksikään työ voisi saavuttaa luotettavasti ja johtopäätös.

Tässä artikkelissa, keräsimme tietoa kaikista aiemmista tutkimuksista

TNF-α

polymorfismit ja peräsuolen syövän, ja meta-analyysi, joka sisälsi 3372 tapauksissa ja 4523 tarkastuksia tehtiin tutkia

TNF-α

308,

TNF-α

238 promoottori polymorfismien liittyivät riskiin paksusuolen syöpä.

Materiaalit ja menetelmät

Data Sources

Tämä meta-analyysi suoritettiin PRISMA ohje (Tukevaa tietoa: Taulukko S1). Kattava etsiminen kaikki artikkelit, jotka oli julkaistu yhdistyksen välillä

TNF-a

polymorfismien ja paksusuolen syövän riskiä suoritettiin käyttäen seuraavia termejä MEDLINE, PubMed, EMBASE: ( ’tuumorinekroositekijä -alfa [MeSH] TAI ”Tuumorinekroositekijä” tai TNF) JA ( ”polymorfismi, Genetic” [MeSH] TAI polymorfismi tai polymorfismit tai riskin) JA (peräsuolen syöpä). Kaikki artikkelit päivitettiin loka 25, 2013. Viitteet kaikista tutkimukseen ja katsaukset tarkistettiin ylimääräisiä viittauksia. Haetaan suoritti kaksi riippumatonta tutkijaa varmistaa, ettei julkaistuja jäivät.

ja poissulkukriteereitä

Mukana tutkimukset täyttivät seuraavat kriteerit: (i) tapausverrokkitutkimukset assosiaatiosta välillä

TNF-a

polymorfismien ja peräsuolen syöpä; (Ii) voidaan käyttää genotyypin taajuuksia tapausten ja kontrollien säädetty; ja (iii) raportointi tuloksista ja riskien arvioiden ja /tai esittämiseen tarvittavien tietojen laskemiseen syrjäisimpien alueiden 95% CI. Me ulkopuolelle tutkimukset päällekkäisiä muun tutkimuksia tai päällekkäisyyksiä tietoja samojen tekijöiden.

Data Extraction

Kaksi tutkijaa uutettu tiedot itsenäisesti. Eriä tekijän sukunimi, julkaisuvuosi, alkuperämaan, lähde tutkimusväestöstä, genotyypit ja numerot tapausten ja kontrollien purettu. Numerot tutkimuksia yhdistyksen välillä

TNF-a

308,

TNF-a

238 polymorfismien ja paksusuolen syövän riskiä oli 14, 4, tässä järjestyksessä. Useimmat tutkimuksista käytetty taajuus verrokit tapauksiin iän ja sukupuolen mukaan.

Tilastollinen analyysi

Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) testattiin verrata havaittua genotyypin taajuuksia odotettavissa genotyyppi taajuuksilla tarkastusten tulokset kaikissa tutkimuksissa. Syrjäisimmillä alueilla ja 95% CI laskettiin arvioida vahvuus yhdistyksen välillä

TNF-a

polymorfismien ja paksusuolisyövän riskin alle homozygoottisia vertailu ja heterotsygoottianalyysin vertailua. Random-tehosteet malleja käytettiin laskettaessa yleinen yhteenveto syrjäisimpien alueiden ja 95% CI. Tutkimus populaatiot luokiteltiin Länsi (Euroopassa ja Amerikassa) tai Itä (Kiina, Korea, Intia ja Iran).

merkitys yhteenveto syrjäisimpien alueiden määritettiin Z-testi, jossa kaksipuolinen

p

0,05 pidettiin tilastollisesti merkitsevä. Q-tilastoa laskettiin tutkia tulokseen heterogeenisuus tutkimuksia, ja

p

0,1 katsottiin merkitseväksi.

I

2

-statistic laskettiin myös tehokkaasti testata heterogeenisuus [24], jossa

I

2

25%, 25-75% ja 75 % katsotaan edustavan alhainen, kohtalainen ja korkea epäjohdonmukaisuutta, vastaavasti. Begg n suppilo juoni piirrettiin tutkia taustalla julkaisu bias [25]. Herkkyysanalyysi, suhteellisesti pienempiä tutkimuksia ulkopuolelle ja yhteenveto syrjäisimmät alueet (95% CI) laskettiin uudelleen. Kaikki analyysit tehtiin käyttäen STATA 12,0 (STATA Corporation, College Station, TX, USA).

Tulokset

Ominaisuudet Studies

Tässä artikkelissa, 15 tutkimuksia tunnistettu arvioida suhdetta

TNF-a

polymorfismien ja paksusuolisyövän riskin, ja kokonaismäärä 3372 tapausten ja 4523 kontrollia sisällytettiin. Yksityiskohtaisen tarkastelun prosessi esitetään kuviossa 1. Yleisimmin tutkittu polymorfismit olivat

TNF-a

308 ja

TNF-a

238, jotka raportoitiin 14 ja 4 tutkimuksia, vastaavasti [2] , [26] – [39]. Muita SNP, kuten

TNF-a

857,

TNF-a

863 ja

TNF-a

1031 tutkittiin myös tässä kattavaa etsimistä, mutta vastaava näyte koot olivat liian pieniä suorittamaan määrällisiä tietoja synteesi. Genotyyppi ja alleeli jakaumien

TNF-a

308 ja

TNF-a

238 on esitetty taulukossa 1. Mediaani taajuudet

TNF-a

308A alleeli oli 15,0% vuonna Länsi populaatiot ja 7,1% Itä populaatioissa. Vastaavat taajuudet

TNF-a

238A alleeli oli 3,5% ja 7,1%, vastaavasti.

Quantitative Data Synthesis

TNF

308G /A-polymorfismi, 14 tutkimuksessa yhteensä useita 2837 tapauksissa ja 3601 kontrollia sisällytettiin tähän analyysiin. Kuva 2A osoitti satunnainen tehosteiden yleistä OR (95% CI) on

TNF-a

308 polymorfismi alle homozygoottisia vertailu [AA vs. GG, OR (95% CI) = 1,46 (1,07-1,97)]. Kuva 2B osoitti satunnainen tehosteiden yleistä OR (95% CI) on

TNF-a

308 polymorfismi alle heterotsygoottianalyysiin vertailu [AG vs. GG, OR (95% CI) = 1,05 (0,93-1,19)].

V: AA vs. GG, Forest juoni; B: AG vs. GG, Forest juoni; Syrjäisimmillä alueilla, kertoimet suhdeluvut.

Kun ositettu etnisyys, Länsi väestön Merkitsevä yhteys

TNF-a

308 ja peräsuolen syövän riski havaittiin alle homozygoottisia vertailu [AA vs. GG, OR (95% CI) = 1,39 (1,01-1,91)], mutta ei heterotsygoottinen vertailu [AG vs. GG, OR (95% CI) = 1,04 (0,94-1,15)]. Itä populaatiot, mitään merkittävää yhdistys löytyy homozygoottisia tai heterotsygoottianalyysin vertailua. Alaryhmät ominaista vertailupopulaatiossa lähteen (sairaala-pohjainen, HB tai väestöpohjainen, PB), ja kasvaimen sijainti (paksusuolen tai peräsuolen) analysoitiin myös samalla menetelmällä kuin edellä (taulukko 2). Sekä homozygoottisia ja heterotsygoottianalyysiin vertailut näkyy merkittävä eri paksusuolisyövän riskin HB alaryhmään [AA vs. GG, OR (95% CI) = 2,16 (1,17-4,00)], mutta ei PB alaryhmään [AA vs. GG, OR (95% CI) = 1,28 (0,90-1,82)].

TNF-a

238 G /A-polymorfismi, me mukana 4 tutkimuksessa yhteensä määrä 535 tapausten ja 922 valvontaa . Kaiken kaikkiaan ei ole merkittävää assosioitunut

TNF-a

238g /polymorfismi ja paksusuolen syövän riskiä alle homozygoottisia vertailu [AA vs. GG, OR (95% CI) = 1,23 (0,24-6,23); Kuvio 3A] tai heterotsygootti vertailu [AG vs. GG, OR (95% CI) = 0,74 (0,47-1,17), kuvio 3B]. Koska on olemassa vain 4 Tutkimuksiin otettiin tässä tutkimuksessa ei ositettu analyysia havainnollistettiin muodossa lukuja. Nämä tulokset on esitetty taulukossa näkyvät yhdessä tulosten

TNF-a

308 sijasta (taulukko 2).

V: AA vs. GG, Forest juoni; B: AG vs. GG, Forest juoni; Syrjäisimmillä alueilla, kertoimet suhdeluvut.

Testaus heterogeenisuus

yleistä meta-analyysissä, Q-tilasto oli merkittävä ja

I

2

osoittivat kohtalainen vaihtelu

TNF-a

308 (AA vs. GG,

I

2

= 40,9%,

p

= 0,07; AG vs. GG,

I

2

= 60,3%,

p

= 0,01), eikä vaihtelua

TNF-a

238 (AA vs. GG,

I

2

= 0,0%,

p

= 0,46; AG vs. GG,

I

2

= 0,0%,

p

= 0,58) .

kerrostunut analyysit

TNF-a

308,

I

2

esti kohtalaisesti vaihtelut sekä Itä (AA vs. GG,

I

2

= 51,7%,

p

= 0,13) ja Länsi-populaatiot (AA vs. GG,

I

2

= 43,8%,

p

= 0,08). PB ja HB alaryhmiä,

I

2

osoittanut mitään vaihtelua (AA vs. GG,

I

2

= 0,0%,

p

= 0,884 ) ja voimakas vaihtelu (AA vs. GG,

I

2

= 86,9%,

p

0,001), vastaavasti, mikä osoitti, että sairaalan perustuvat tutkimukset saattavat olla tärkeitä lähde heterogeenisyys. Lisäksi vaihtelu esiintymistiheyttä

TNF-a

308 polymorfismi joukossa väestön tai jonkin tunnistamattoman tekijät voivat myös olla peräisin heterogeenisyys.

Herkkyysanalyysi ja julkaiseminen Bias

edelleen vahvistaa päätelmät, herkkyys analyysi. Yksi suhteellisen pieni tutkimus mukana meta-analyysissä suljettiin pois joka kerta. Sillä

TNF-a

308, vastaavien yhdistettyjen syrjäisimpien ei merkittävästi muuttunut (syrjäisimpien vaihteli 1,20-1,54 alle homotsygootti vertailu, 1,00-1,12 alle heterotsygoottianalyysiin vertailu, yksityiskohtaisia ​​tietoja ei ole esitetty), mikä osoittaa, että tulokset olivat tilastollisesti varmana. Herkkyysanalyysi ei suoriteta

TNF-a

238, koska siellä oli vain 4 tutkimuksessa mukana.

julkaisu bias tutkimuksen, Begg n suppilo juoni ja Egger painotettu regressio tehtiin yhdistyksen välillä

TNF-a

polymorfismien ja peräsuolen syöpä. Merkkejä bias havaittiin

TNF-a

308 polymorfismi alle homozygoottisia vertailu (kuvio 4A. Begg testi p = 0,325, Egger testi p = 0,180). Kuitenkin todisteita julkaisu puolueellisuudesta löytyi heterozygoottiset verrattuna (kuva 4B. Begg testi p = 0,024, Egger testi p = 0,063). Julkaisu bias tutkimusta ei ole suoritettu

TNF-a

238, koska siellä oli vain 4 tutkimuksessa mukana.

V: AA vs. GG, Begg n suppilo tontteja; B: AG vs. GG, Begg n suppilo tontteja.

Keskustelu

Tulehdus on yksi keskeinen tekijöitä syövän synnyn, ja ihmiset, joilla on tulehduksellinen suolistosairaus on suuri riski paksusuolen syövän [7]. Siksi polymorfismit tulehduksen liittyviä geenejä on pidettävä mahdollisina lähteinä syöpäriskin biomarkkereiden [5]. TNF-a, laajimmin tutkittu inflammatorinen tekijä syövän, on osoittautunut vaikuttavan peräsuolen kasvaimien syntyyn läpi eri reittejä [11], [12]. Aiemmat tutkimukset osoittivat, että TNF-a-liittyvä solutoiminnoille vaikutti suuresti polymorfismien promoottorialueen

TNF-a

geenin [16] – [18].

308G /A on yleisimmin tutkittu SNP sivusto

TNF-a

promoottorialueen. Erilaisia ​​meta-analyysit osoittivat, että

TNF-a

308A polymorfismi liittyi kohonnut mahalaukun syövän riski [19], rintasyövän [20], kohdunkaulan syöpä [40] ja keuhkosyövän [41]. Kuitenkin paksusuolisyövän, kahden edellisen meta-analyysit kertoi, että

TNF-a

308 polymorfismi ei liittynyt peräsuolen syöpäriski [22], [23], ja toinen näistä kahdesta meta-analyysit osoittivat myös, että

TNF-a

308A polymorfismi nähtiin lisääntynyt paksusuolisyövän riskin Länsi väestöstä [22]. Lisäksi toinen systemaattinen tarkastelu keskittyi alalla tiivistelmä geneettinen yhdistys myös meta-analyysi raportointi

TNF-a

308 polymorfismi ei liittynyt peräsuolen syöpäriski [42]. Nämä tulokset olivat erillään lähes kaikkien muiden syöpien, ja ne tuskin selittää mekanismin TNF-a. Tutkimuksessamme 2725 tapauksissa ja 3369 tarkastuksia 14 riippumattomat tutkimukset olivat mukana, ja edellinen päätelmää ei tue tutkimuksemme. Tutkimuksemme mukaan,

TNF-a

308A polymorfismi liittyi kohonnut paksusuolisyövän riskin alle homotsygoottisia verrattuna. Tämä tulos oli mukaisesti meta-analyysi muiden syöpien, ja myös voitaisiin selittää edellisen mekanistinen tutkimus TNF-a [43], joka ilmoitti, että ihmisillä, kun läsnä on promoottorin polymorfismi on

TNF

308A liittyy lisääntynyt plasman TNF-keskittymä, joka voi johtaa lisääntynyt riski syöpiä.

kuitenkin, yhdistyksen välillä

TNF-a

308 polymorfismi ja peräsuolen syöpä riski väheni merkittävästi alle heterotsygoottianalyysin vertailua. Verrattuna AA genotyyppi, ettei yhdistyksen välillä

TNF-a

308 AG-genotyyppi ja lisääntynyt paksusuolisyövän riskin voi selittyä haploinsufficiency vaikutus, eli plasman TNF-a pitoisuus johtui yhdestä

TNF-a

308 alleelin ehkä ole tarpeeksi korkea voimakkaasti vaikuttaa syöpäriskiä. Herkkyys analyysi osoitti, että kun jättää kunkin tutkimuksen mukana meta-analyysissä, syrjäisimpien alueiden alle heterotsygoottinen vertailu jäi yli 1,00, mikä viittaa siihen, että jos enemmän tutkimuksia sisällytetään tulevaan analyysissä, yhdistyksen välillä

TNF-a

308 AG-genotyyppi ja lisääntynyt paksusuolisyövän riskin voi myös tulla tilastollisesti merkitsevä.

Vertailukelpoinen syrjäisimpien havaittiin, kun analyysit olivat kerrostunut Itä- ja Länsi-populaatiot, mikä osoittaa, ettei selvää rotu-erityinen vaikutus tässä suhteessa. Koska otoskoko Itä väestön on suhteellisen pieni, yhdistyksen välillä

TNF-a

308A ja paksusuolisyövän riskin ei ollut merkittävä. Tarkkaan, voimme vain todeta, että

TNF-a

308A kohtalaisesti liittyy lisääntynyt paksusuolisyövän riskin Länsi populaatioissa.

Kuten on esitetty taulukossa 2, AA vs. GG vertailu tulokset olivat merkittäviä HB alaryhmä muttei PB alaryhmään, joiden mukaan ohjauslaite saattavat vaikuttaa yhdistyksen välillä

TNF-a

308 polymorfismi ja peräsuolen riski sairaala-Based tutkimus. Yhdessä me päätellä, että

TNF-a

308A polymorfismi oli yleinen riskitekijä paksusuolisyövän.

TNF-a

238g /A on toinen yleisesti tutkittu SNP site seuraavat 308 kaikkien polymorfismit sijaitsevat promoottorialueen

TNF-a

geenin. Kuitenkin viime aikoina ei integroitu analyysi on tehty saada lopullista päätelmää siitä

TNF-a

238g /A liittyy peräsuolen syöpään. Tähän asti kaikkien julkaisut, 4 tutkimuksissa selvitettiin yhdistyksen välillä

TNF-a

238 polymorfismi ja paksusuolisyövän riskin, mutta saatu ristiriitaisia ​​tuloksia. Meidän meta-analyysi, 535 tapausta ja 922 valvonta otettiin mukaan tutkimukseen ja huomasimme, että

TNF-a

238 polymorfismi ei merkittävästi liittynyt peräsuolen syöpäriski Aiemmin meta-analyysi mukaan lukien 34 tutkimusten 34679 tapauksia ja 41186 valvonta raportoi, että mitään merkittävää yhdistyksen välillä havaittiin

TNF-a

238 polymorfia ja yleistä syöpäriskiä [44], joka on yhdenmukainen nykyisen tuloksia. Kuitenkin eräitä nykyisiä tutkimuksia

TNF-a

238 polymorfismi ja paksusuolisyövän riskin on suhteellisen pieni, mikä tutkimuksista, jotka liittyvät enemmän tapauksia tarvitaan tulevaisuudessa.

genominlaajuisten Association Study (GWAS) on myös voimakas menetelmät geneettisissä tutkimuksissa. Mitä GWAS tutkimuksia kolorektaalisyövän [45] – [48], ei ole mitään näyttöä yhdessä

TNF-a

alue. Verrattuna GWAS tutkimusten meta-analyysit ovat helposti vaikuttaa näytteen heterogeenisyys ja epätarkkuuksia yhdessä tutkimuksessa. Kuitenkin GWAS tutkimukset myös haittansa. Voit hallita kustannuksia, ensimmäisessä vaiheessa GWAS tutkimuksissa tutkijat aina seuloa merkittäviä SNP koko genomin lukien yli 500000 SNP pieni väestö, ja se voi olla tarpeeksi voimaa tunnistaa kaikki SNP liittyvät tautiin. Esimerkiksi yksi GWAS tutkimuksessa todettiin vain kuusi mahdollista riskiä alleeleja paksusuolisyövän [45], joka vaikuttaa liian harvat niin monimutkainen sairaus. Joten mitään näyttöä yhdessä

TNF-a

alue on peräisin GWAS ei välttämättä tarkoita, että kaikki SNP tällä alueella ei ole yhteydessä paksusuolisyövän riskin. Me arveltu, että samanlainen Barton et al. kertoi Nivelreuma [49], laajentaa näytön kriteerit ensimmäisessä vaiheessa GWAS voivat parantaa testauksen teho ja tuottaa enemmän SNP liittyy peräsuolen syöpä, ja

TNF-a

308 polymorfismi voi olla joukossa. Kuitenkin alkuperäisen GWAS tietoja ei julkaista, emme pystyneet vahvistamaan tällaista spekulaatiota. Toisaalta, hyvin suoritettu meta-analyysi on yhtä suuri kuin monikeskuksisen, satunnaistetussa ja kontrolloidussa tutkimuksessa, joka voisi myös luoda uskottava johtopäätös. Jopa GWAS aikakauden, jossa yhdistyvät käytettävissä olevat tiedot tuottaa integroitu tulos on edelleen kohtuullinen ja voi säästää huomattavan määrän resursseja.

Useat rajoitukset Tämän tutkimuksen olisi puututtava. Ensinnäkin, otoskoko oli suhteellisen pieni kerrostunut analyysit, jotka heikensivät päätelmät, etenkin alle homotsygootti vertailua. Siksi enemmän tutkimuksia tarvitaan olla mukana jotta saadaan luotettavampi tulos. Toiseksi, yksityiskohtaiset tiedot yksilötasolla puuttui tässä analyysissä, jolle useat kerrostunut analyysit eivät voineet tehdä. Jos yksittäisten raaka oli saatavilla, aiheutuvaa iän, sukupuolen, huumeiden käyttö ja muut ympäristötekijät voivat myös tutkittava. Kolmanneksi, sytokiinit, kuten interleukiinit, muuttaa kasvutekijä, tuumorinekroositekijä, joilla saattaa olla vuorovaikutuksessa toimintoja keskenään, joten SNP muiden sytokiinien olisi myös otettava huomioon tehdä todellinen vaikutus, jos mahdollista. Neljänneksi tulokset GWAS tutkimuksia ei ole otettu mukaan, koska raakadataa ei ollut julkaistu. Lisäksi geeni-geeni, geeni-fenotyyppi, ja geeni-ympäristön vuorovaikutukset tulisi harkita.

Yhteenvetona tämä meta-analyysi oli yhdistetty kaikki saatavilla olevat tiedot, jotka liittyvät

TNF-a

polymorfismit ja peräsuolen syöpä, ja totesi, että

TNF-a 308

kohtalaisesti liittyy lisääntynyt paksusuolisyövän riskin Länsi populaatioissa.

TNF-a

238 polymorfismi ei merkittävästi liittynyt peräsuolen syövän riskiä. Lisäksi suuri hyvin suunniteltu kohorttitutkimuksiin vaatisivat vahvistaa tämän päätelmän, ja ymmärtää täysin molekyylimekanismin paksusuolen syöpä. Edelleen mahdollisille tutkimukset yhdistettynä analyyseissä muiden sytokiinien ja ympäristötekijät ovat myös tarpeen.

tukeminen Information

Taulukko S1.

PRISMA Tarkistuslista kohdat, kun raportointi järjestelmällinen katsaus tai meta-analyysi.

doi: 10,1371 /journal.pone.0085187.s001

(DOC) B

Kiitokset

Olemme syvästi arvostaa Dr. Zhi-Rong Yang (Peking University Center for Evidence-Based Medicine ja Clinical Research) ja Dr. Qi-Yan Wang (osastot Genetics, Pekingin yliopiston Cancer Hospital Institute) tarjoamiseksi tarkistamiseksi ehdotuksia.