Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Aikaisemmat tutkimukset tutkivat yhdistyksen välillä TGF -β1 polymorfismit ja säteily keuhkokuume (RP) riski ovat antaneet ristiriitaisia ​​tuloksia. Tutkimuksen tarkoituksena oli arvioida yhdistyksen välinen TGF-β1 geenien C509T, G915C ja T869C polymorfismit ja riski RP keuhkosyöpäpotilaiden hoidetuilla potilailla lopullisen sädehoitoa.

Methods

Kaksi tutkijat itsenäisesti etsinyt Medline, EMBASE, CNKI, ja Kiinan biolääketieteen tietokannat julkaistut tutkimukset ennen syyskuuta 2013. Yhteenveto kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja 95%: n luottamusvälit (CI) TGF-β1 polymorfismien ja RP oli laskettu kiinteiden vaikutusten mallia tai satunnainen vaikutusten malli tarvittaessa.

tulokset

Viime kädessä kukin 7 tutkimuksia todettiin olevan oikeutettuja meta-analyysejä C509T, G915C ja T869C, vastaavasti. Analyysimme ehdotti, että variantti genotyypin T869C liittyi merkitsevästi lisääntynyt RP riskiä hallitseva malli (OR = 0,59, 95% CI = 0,45-0,79) ja CT vs. TT malli (OR = 0,47, 95% CI = 0.32- 0,69). Vuonna alaryhmäanalyyseissa etnisyys /maa, joka on merkittävästi lisääntynyt riski havaittiin valkoihoisilla. Sillä C509T ja G915C polymorfismi, mitään selvää yhdistysten havaittiin kaikki geneettiset malleissa.

Johtopäätös

Tämä meta-analyysin mukaan T869C polymorfismi TGF-β1 saattaa liittyä RP riski vain valkoihoisilla , ja ei ehkä ole yhdistyksen välillä C509T ja G915C polymorfismi ja RP riskiä.

Citation: Hän J, Deng L, Na F, Xue J, Gao H, Lu Y (2014) Association välillä TGF-β1 polymorfismit ja säteily Keuhkokuume keuhkosyöpä hoidetuilla potilailla Definitive Sädehoito: Meta-analyysi. PLoS ONE 9 (3): e91100. doi: 10,1371 /journal.pone.0091100

Toimittaja: Graham R. Wallace, University of Birmingham, Iso-Britannia

vastaanotettu: 17 marraskuu 2013; Hyväksytty: 07 helmikuu 2014; Julkaistu 18 maaliskuuta 2014

Copyright: © 2014 He et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat National Major Project of China (2011ZX09302-001-01) ja National Natural Science Fund of China (81101698). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

säteily Pneumonia (HE) on keuhkotulehdus takia sädehoitoa. Tämä sivuvaikutus sädehoitoa tapahtuu 5-15% ihmisistä, jotka menevät läpi sädehoitoa keuhkosyövän. Säteily keuhkokuume (HE) on annosta rajoittava tekijä sädehoidon ja on suuri vaikutus potilaan, s ennustetta ja elää laatu. Koska nykyiset parametrit ennustamiseen RP ovat hyvin rajalliset, on kysyntää mahdollisuudesta kehittää uusia parametreja. Vaikka monet tekijät voivat vaikuttaa reaktion vaikeusasteen sädehoitoon, suuri osa esiintyä variaatiota määrite yksilölliset erot radioherkkyyttä, joka oletettiin määräytyy geenimuunnelmat potilailla [1]. Viime aikoina tutkimukset ovat keskittyneet yhdistyksen yhteisten Monimuotoinen vaihtelut kandidaattigeenit ja yksilölliset erot radioherkkyyttä [2].

Transforming kasvutekijä beeta 1 (TGF-β1) geenin valvonnan lisääntymistä, solujen erilaistumista ja muita toimintoja useimmissa soluissa. TGF-β1 signalointireitin on mukana monissa solun prosessit sekä aikuisen organismin ja kehittyvän alkion, mukaan lukien solujen kasvua, solujen erilaistumista, apoptoosia, solujen homeostaasin ja muita solun toimintoja. TGF-β1 on yksi laajimmin tutkituista sytokiinien kehittämisessä kudosfibroosi vastauksena säteilytys ja TGFp 1 signalointi on tärkeä modulaattori tulehdusreaktion. Useat viimeaikaiset tutkimukset ovat tutkineet plasmapitoisuudet TGFp 1 ennustajana RT aiheuttaman keuhkovaurion. Eläinten ja ihmisten tutkimukset ovat osoittaneet, että TGF-β1 on tärkeä säätelijä säteilyn aiheuttaman keuhkovaurion [3] – [7]. Antaminen anti-TGF-β1 vasta-aineet voivat vähentää tulehdusvastetta ja vähentävät TGF-β1 aktivointi useita viikkoja sädehoidon jälkeen, edelleen viittaa siihen, että kohdistaminen TGFp reitti voi olla käyttökelpoinen strategia estää RT aiheuttaman keuhkovaurion [8]. Vähentää plasman TGF-β1 pitoisuus kuin vähemmän kuin esikäsittely- arvo sädehoidon aikana potilailla, joilla ei keuhkokomplikaatioihin kannattaa käyttää TGF-β1 koska ennakoiva biomarkkereiden [5]. Kuitenkin vääränlaisesta käsittelystä verinäytteiden tai riittämätön sentrifugointiolosuhteiden voi virheellisesti nostaa verenkierrossa TGF-β1, mikä rajoittaa vakavasti tämä lähestymistapa riskien ennustamiseen.

Radiogenomics kanssa Genotyyppausanalyysiin of SNP TGFp 1 ja TGFp 1-reitin geenit voivat antavat mahdollisuuden selvittää genotyyppien altis RP. Aikaisemmat tutkimukset ovat osoittaneet, että TGFp 1 alleelit ovat pääasiassa ryhmitelty kolmeen fylogeneettiseen ryhmään perustuen yhteiset toiminnalliset SNP C509T, G915C ja T869C, mikä viittaa kolmeen fenotyyppinen ryhmää [9]. C509T, G915C ja T869C polymorfismit TGF-β1 johtaa aminohapposubstituutioihin TGF-β1, joka voi muuttaa TGF-β1-toiminto. Tämä muutos proteiinin biokemian johtaa oletukseen, että variantti alleelit voivat heikentää korjaus kinetiikka vaikuttaa näin alttius haitallisia terveysvaikutuksia [10]. Koska toiminnot TGF-β1 C509T, G915C ja T869C geenit tekevät niistä ehdokkaita yhdessä RP, useita tapausverrokkitutkimukset tehtiin tutkimaan assosiaatiota TGF-β1 C509T, G915C ja T869C polymorfismit ja riski RP tai muut normaalin kudoksen komplikaatioita [11] – [19]. Mutta nämä tutkimukset raportoitu ristiriitaisia ​​tuloksia. Erilaisia ​​menetelmiä on käytetty, mutta erityisesti joissakin tutkimuksissa käytetty otoskoko on pieni ja sen vuoksi ei ole yllättävää, että on ollut puutetta replikaation eri tutkimuksissa. Käyttämällä kaikkia käytettävissä julkaistut tiedot lisätä tilastollinen voima, oletettiin, että meta-analyysi voisi mahdollistaa uskottava ehdokas geenien ulkopuolelle ja niitä aiheuttavat geenit voidaan tunnistaa luotettavasti. Siksi olemme ottaneet meta-analyysi, jossa kaikki julkaistut tapausverrokkitutkimukset prosessoidaan vahvistaa, onko C509T, G915C ja T869C polymorfismi TGF-β1 geenin promoottori lisäsi riskiä RP.

Materiaalit ja menetelmät

kirjallisuus hakustrategia

PubMed, EMBASE, valtava Navigator (https://www.hugenavigator.net) ja China National Knowledge Infrastructure (CNKI) tutkimistamme hakea kaikki paperit saatavilla lähtien ja 05 marraskuu 2013, käyttäen sekä vapaa sanoja ja asiasanoina kunkin hakualustan (mesh PubMed ja Emtree in EMBASE). Haku strategiat perustuivat yhdistelmiä avainsanoja ( ”TGF-β1” tai ”TGF-beetaa) ja (” polymorfismi ”tai” genotyyppi ”tai” geneettinen ”) ja (” Radiation keuhkokuume ”tai” Sädepneumoniittia ”tai” Radiation aiheuttaman keuhkotulehduksen myrkyllisyys). Viittaukset tutkimuksissa tarkistettiin tunnistaa lisätutkimuksia, joita ei indeksoitu PubMed, EMBASE, valtava Navigator, ja CNKI. Kaikki julkaisua Englanti kielellä ja kiinan kielen kanssa saatavilla koko tekstin vastaavat voivat kriteerit haettiin. Lisäksi olemme myös tarkistanut viittaukset asiaan arvioita ja voivat artikkeleita, että hakua noudetaan. Jos useampi kuin yksi artikkeli julkaistiin saman tekijän käyttäen samaa tapauksessa sarja, valitsimme tutkimukseen, jossa useimmat ihmiset tutkittiin.

valintakriteerit ja tutkimusten määrittäminen

liittämisestä tähän meta-analyysi, tunnistaa esineet oli annettava tietoja seuraavista: (i) Tutkitaan TGF-β1 C509T, G915C tai T869C polymorfismit ja riski RP, (ii) käyttäen tapaus-verrokki suunnittelu; (Iii) riittävät tiedot jätetyn kerroinsuhde (OR), jossa 95%: n luottamusväli (CI); (Iv) viimeisimmän ja /tai suurimman tutkimuksessa uuttuvia tietojen pitäisi kuulua koskevat tutkimukset päällekkäisiä potilaiden ja valvontaa. Suurimmat syyt sulkeminen tutkimuksista olivat seuraavat: (i) kaksoiskappale tiedot, (ii) abstrakti, kommentoida, lue ja toimituksellisen ja (iii) ei riittävästi tietoa raportoitu.

Data louhinta

mukaan ja poissulkukriteereitä, uuttamalla kukin tutkimus toteutettiin itsenäisesti kaksi tekijää (JH ja FN) ja yksimielisyys saavutettiin kaikkien tietoja. Seuraavat tiedot uutettiin: ensimmäisen tekijän nimi, julkaisuvuosi, maa, etnisyys, numerot tapauksia /potilaiden ja verrokkien, ja jakelu genotyyppien tapauksessa ja kontrolliryhmiin. Käyttävissä tutkimuksissa puutteelliset tiedot, laatijat näistä tutkimuksista otettiin yhteyttä lisätietoja sähköpostitse, jos mahdollista.

Tilastollinen

Meta-analyysi suoritettiin ja raportoitu edellä kuvatulla tavalla. Raaka syrjäisimpien 95% Cl laskettiin arvioida vahvuus korrelaatio TGF-β1 polymorfismien ja alttius RP. Yhdistetty syrjäisimmillä alueilla tehtiin hallitseva malli (aa + Aa vs. AA) ja väistyvä malli (aa vs. Aa + AA). Lisäksi yhdistetyt arviot laskettiin myös, että pareittain vertailuissa (alleeli Aa vs. AA, ja alleeli aa vs. AA). Edellä mainittu A ja A edustaa suuria ja pieniä alleelien, vastaavasti. Ottaen huomioon mahdolliset Tutkimusten välisten heterogeenisuus, tilastollinen testi heterogeenisuus suoritettiin x

2 testiä tai Fisherin tarkkaa testiä tarvittaessa. P 0,10 tai I

2 50% ilmoitti ilmeinen on Tutkimusten välisten heterogeenisyys, ja OR (95% CI) laskettiin random-vaikutusten mallia käyttäen Dersimonian ja Laird menetelmä; muuten kiinteiden vaikutusten mallia käytti Mantel-Haenszel menetelmällä. Alaryhmä analyysit suoritettu pääasiassa kansallisuus (aasialainen, valkoihoinen), joita käytettiin tutkimaan ja selittämään heterogeenisyys eri tutkimuksissa. Herkkyys analyysit suoritettiin tulosten pysyvyyden, eli yksi tapauskontrollitutkimuksessa jätetty pois jokaisen aikaa pohtia vaikutuksesta yksittäisten tietojen asetettu yhdistettyjen OR. Epäsymmetria suppilo tontin osoitti mahdollista julkaisemista bias. Kaikki analyysit suoritettiin käyttäen RevMan 5,2 ohjelma (Cochrane Library, UK) tai STATA paketin version 13.0 ohjelma (Stata Corporation, College Station, Texas, USA). Kaikki P-arvot olivat kaksipuolisia. Varmistaakseen tietojen luotettavuus, kaksi arvioijat (JH ja FN) itsenäisesti suoritti tietojen analysoinnin tilastotiedot ohjelmat samat tulokset.

Tulokset

Kirjallisuus etsintä ja tutkimus valinta

217 tutkimuksissa tunnistettiin aluksi haku. Seulomalla otsikko ja lukemalla tiivistelmä ja koko artikkeli, 8 voivat artikkeleita (6 Englanti ja 2 kiinaksi) sisällytettiin perustuu hakuehtoja, RP alttius liittyy TGF-β1 C509T, G915C tai T869C polymorfismit. Kirjallisuudesta ja tutkimus valintamenettelyt on esitetty kuvassa 1. Tutki ominaisuudet olivat yhteenveto taulukossa 1. Tutkimukset tehtiin Kiinassa, Belgiassa, Argentiina, USA ja Saudi-Arabia. Kontrollit olivat keuhkosyöpää sairastavien potilaiden verrattavissa kliinisiä piirteitä, jotka eivät kehittäneet RP.

Quantitative synteesi

Association välillä TGF-β1 T869C polymorfismi ja riski RP.

7 tapausverrokkitutkimukset kanssa 341 tapausta ja 712 kontrollia sisällytettiin assosiaatiota välillä TGF-β1 T869C polymorfismi ja RP riski. Arvioinneissa yhdistyksen TGF-β1 T869C polymorfismi RP riski on esitetty taulukossa 2. Tulokset Yhdistetyn analyysit osoittivat, että TGF-β1 T869C polymorfismi oli heikompi RP riski hallitseva malli (OR = 0,59, 95% CI = 0,45-0,79) ja CT vs. TT malli (OR = 0,47, 95% CI = 0,32-0,69). Kuitenkin TGF-β1 T869C polymorfismi ei liittynyt RP riskiä väistyvä malli (OR = 0,85, 95% CI = 0,57-1,27) ja CC vs. TT malli (OR = 0,70, 95% CI = 0,45-1,11) (taulukko 2). Vuonna alaryhmäanalyyseissa etnisyys /maa, merkittävä yhdistys TGF-β1 T869C pienemmillä RP riski havaittiin keskuudessa valkoihoinen (hallitseva malli: OR = 0,48, 95% CI = 0,29-0,78). Kuitenkin joukossa Aasian, ei merkittävästi lisääntynyt riski havaittiin (hallitseva malli: OR = 0,80, 95% CI = 0,32-1,25). Heterogeenisyys oli merkittävä hallitseva malli Asian alaryhmä (I

2 = 57%, P = 0,10) ja random-vaikutusten malli suoritettiin. Kuitenkin, ei ollut merkittävää heterogeenisyyttä vertailua muiden geneettisten mallien (P 0,1) ja kiinteiden vaikutusten menetelmää suoritettiin tutkimuksessamme. Ei selvää julkaisu bias havaittiin mukaisesti suppiloon käyriä T869C polymorfismi kaikissa geneettinen mallit (kuva 2, 3).

(A) Meta-analyysi korjaus vaikutuksia malli hallitseva malli. (B) Meta-analyysi korjaus vaikutuksia mallin väistyvä malli. (C) Meta-analyysi korjaus vaikutuksia mallin CT vs. CC. (D) Meta-analyysi korjaus vaikutuksia mallin CC vs. TT.

(A) Meta-analyysi korjaus vaikutuksia malli hallitseva malli. (B) Meta-analyysi korjaus vaikutuksia mallin väistyvä malli. (C) Meta-analyysi korjaus vaikutuksia mallin CT vs. CC. (D) Meta-analyysi korjaus vaikutuksia mallin CC vs. TT. Jokainen piste edustaa yksittäisen tutkimuksen osoitetun -alueella.

Association välillä TGF-β1 C509T polymorfismi ja riski RP.

Mitä C509T polymorfismi, 7 tutkimukset kanssa 337 tapausta ja 817 kontrollia sisällytettiin lopulta. Ei havaittu yhteyttä välillä polymorfismin ja alttius RP kaikissa geneettinen mallit (taulukko 3, hallitseva malli: OR = 0,82, 95% CI = 0,62-1,08; väistyvä malli: OR = 0,74, 95% CI = 0,47-1,18 ; CT vs. CC: OR = 0,84, 95% CI = 0,58-1,22; TT vs. CC: OR = 0,63, 95% CI = +0,36-+1,08). Alaryhmä analyysi C509T polymorfismien etnisen ryhmän paljasti, että ei havaittu yhteyttä välillä C677T polymorfismin ja riski RP joko Aasian tai valkoihoinen väestö kaikissa geneettinen mallit (taulukko 3). Heterogeenisuus eivät olleet merkittäviä kaikissa geneettinen mallit (P 0,05) ja kiinteiden vaikutusten mallia käytettiin meta-analyysi. Ei selvää julkaisu bias havaittiin mukaisesti suppiloon käyriä C509T polymorfismin kaikissa geneettisen malleissa.

Association välillä TGF-β1 G915C polymorfismi ja riski RP.

varten G915C polymorfismi, 7 tutkimukset 453 tapausta ja 710 kontrollia sisällytettiin lopulta. Ei havaittu yhteyttä välillä polymorfismin ja riski RP kaikissa geneettinen mallit (taulukko 4, hallitseva malli: OR = 0,91, 95% CI = 0,57-1,46; väistyvä malli: OR = 1,60, 95% CI = 0,67-3,80 GC vs. GG: OR = 1,07, 95% CI = 0,31-3,68; CC vs. GG: OR = 1,00, 95% CI = 0,39-2,56). Alaryhmä analyysi G915C polymorfismien etnisen ryhmän paljasti, että ei havaittu yhteyttä välillä G915C polymorfismin ja riski RP joko Aasian tai valkoihoinen väestön hallitseva malleissa (taulukko 4). Heterogeenisyys oli merkittävä GC vs. GG malli (I

2 = 67%, P = 0,03) ja random-vaikutusten malli suoritettiin. Kuitenkin, ei ollut merkittävää heterogeenisyyttä vertailua muiden geneettisten mallien (P 0,1) ja kiinteiden vaikutusten menetelmää suoritettiin tutkimuksessamme. Ei selvää julkaisu bias havaittiin mukaisesti suppiloon käyriä G915C polymorfismin kaikissa geneettisen malleissa.

Keskustelu

Viime vuosina useat molekyylien epidemiologisia tutkimuksia on tehty arvioida roolia polymorfismien TGF-β1 RP alttius keuhkosyöpäpotilaita; kuitenkin, tulokset ovat kuitenkin ristiriitaisia ​​sijaan ratkaisevia. Kolme polymorfismit TGF-β1 C509T, G915C ja T869C on usein tarkasteltu tutkimuksissa RP alttiuteen. Parhaan tietomme mukaan tämä on ensimmäinen systemaattinen tarkastelu, joka on tutkinut yhdistyksen TGF-β1 polymorfismien ja RP alttius. Tässä meta-analyysissä, huomasimme, että TGF-β1 T869C polymorfismi voi liittyä RP alttius vain valkoihoinen, ja siellä voi olla yhdistyksen välillä C509T ja G915C polymorfismi ja RP alttius.

Koska alleelifrekvenssien polymorfismit ja niiden vaikutukset RP alttius olivat monipuolisia eri etnisten ryhmien, suoritimme alaryhmäanalyysi etnisyys. Tulokset yhdistettiin analyysien ehdotti, että T869C polymorfismi liittyy lisääntynyt RP alttiutta, kun taas TGF-β1 C509T ja G915C ei liittynyt RP herkkyyden, kun kaikki tutkimukset yhdistettiin. On todettu, että on olemassa laaja vaihtelu TGF-β1 T869C C-alleelin frekvenssi eri etnisten ryhmien, jotka vaihtelevat 46,9% ja Aasian väestöstä 36,9% on valkoihoinen väestö [14]. Kun ositella etnisyys, huomattavasti kohonneeseen riskiin havaittiin joukossa valkoihoinen varten T869C. Ei kuitenkaan yhdistyksen välillä T869C polymorfismi ja RP riskin todettiin Aasian. Tutkimukset yhdistys TGF-β1 polymorfismien RP oli pääasiassa toteutettiin Aasian maissa; vain 3 tehtiin länsimaissa. Täten mahdollinen etninen erot yhdistys TGF-β1 polymorfismien RP olisi tutkittava tarkemmin ja vahvistettiin lisää tulevaisuudessa tutkimukset suoritetaan valkoihoisilla. Nämä tulokset merkitsee, että geneettiset tekijät saattoivat esittää suurempaa roolia vaikuttamassa yksittäisen potilaan herkkyydestä, mikä viittaa mahdollisuuteen käyttää näitä biomarkkerit kuten ennakoivaa tekijöitä. Ylimääräisiä, tulevaisuuden ymmärtämistä yhdistetty vaikutus näiden polymorfismien potilaan vaste sädehoito saattaa valottaa ennustearvo näistä geneettisistä tekijöistä.

Jossain määrin useita rajoituksia tämän meta-analyysissä olisi käsiteltävä . Emme suorita alaryhmäanalyysi patologisen keuhkosyöpään Vähäisen tieto ensisijaiseen tutkimuksissa. Koska eri patologisten tyyppejä, Alaryhmäanalyysissa tulisi suorittaa. Kuitenkin jotkut tutkimus tässä meta-analyysissä ei raportoinut erillisiä genotyypin taajuus kullekin patologinen keuhkosyövän, joka esti meitä suorittamaan tämän alaryhmäanalyysi. Toinen rajoitus Tämän tutkimuksen tarkoituksena oli, että otoskoko mukana ei ole tarpeeksi suuri. Tutkimusten lukumäärä ja useita kohteita tutkimuksissa mukana meta-analyysissä olivat pieniä. Muita meta-analyysejä, joissa on suuri määrä paperit ovat tarpeen vahvistaa yhdistyksen tulevaisuudessa. Sitä paitsi osa altistumisen tietoja puuttuu edelleen käytettävissä olevat tutkimukset, esimerkiksi tupakoinnin asemasta tai ravitsemustilaa. Siksi vaikutukset ympäristöön altistuminen tai elämäntapa assosiaatio TGF-β1 variantteja ja alttius säteilyn keuhkokuume ei määräytyy tämän meta-analyysissä.

Yhteenvetona esillä oleva tutkimus antaa todisteita siitä, että TGF-β1 T869C polymorfismia voi liittyä RP riski vain valkoihoinen, ja siellä voi olla yhdistyksen välillä TGF- β1 C509T ja G915C polymorfismi ja RP riski. Yhdistys välinen TGF-β1 T869C polymorfismien ja herkkyydestä säteilyn keuhkokuume tulee vielä tutkia.

tukeminen Information

tarkistuslista S1.

PRISMA tarkistuslista.

doi: 10,1371 /journal.pone.0091100.s001

(DOC) B