PLoS ONE: MspI ja Ile462Val polymorfismit CYP1A1 ja Overall syöpäriski: Meta-Analysis
tiivistelmä
Background
Sytokromi P450 1A1 (CYP1A1) on jäsen CYP1 perhe, joka on keskeinen entsyymi metaboliaan monien endogeenisen alustoissa ja eksogeenisen karsinogeenejä. Tähän mennessä monet tutkimukset ovat tarkastelleet yhdistyksen välillä CYP1A1 MspI ja Ile462Val polymorfismien ja syövän riskiä eri populaatioissa, mutta niiden tulokset ovat ristiriitaisia sijaan johdonmukainen.
Methods
arvioitava tätä suhdetta enemmän tarkasti, meta-analyysi, joka perustuu 198 julkaisuihin suoritettiin. Kertoimet suhde (OR) ja vastaavat 95% luottamusvälit (CI) käytettiin arvioimaan -alueella. Tilastollinen heterogeenisuus tutkimuksissa tutkittiin chi-neliö-pohjainen Q-testi.
Tulokset
Kaiken merkittävän kohonnut syöpäriski liittyi CYP1A1 MspI ja Ile462Val polymorfismien kaikille geneettistä malleja tutkittu. Edelleen kerrostunut analyysi syöpätyyppeihin kävi ilmi, että MspI polymorfismi voi lisätä riskiä sairastua keuhkosyöpään ja kohdunkaulan syöpä taas Ile462Val polymorfismi voi osaltaan suurempaan keuhkosyövän riskiä, leukemia, ruokatorven syöpä, ja eturauhasen syöpä. Vuonna alaryhmäanalyysi etnisyys, selvää yhdistysten löytyivät Aasian väestön varten MspI polymorfismi taas lisääntynyt riski syövän havaittiin aasialaiset ja valkoihoiset varten Ile462Val polymorfismin.
Johtopäätökset
tulokset meta-analyysi viittaavat siihen, että CYP1A1 MspI ja Ile462Val polymorfismien osaltaan edistää syöpäalttiutta keskuudessa aasialaiset. Muita kattava järjestelmä analyysejä tarvitaan vahvistamaan tätä yhdistystä ja muiden siihen liittyvien polymorfismien.
Citation: Wu B, Liu K, Huang H, Yuan J, Yuan W, Wang S, et al. (2013) MspI ja Ile462Val polymorfismit CYP1A1 ja Overall syöpäriski: meta-analyysi. PLoS ONE 8 (12): e85166. doi: 10,1371 /journal.pone.0085166
Editor: Michael Scheurer, Baylor College of Medicine, Yhdysvallat
vastaanotettu: toukokuu 30, 2013; Hyväksytty: 22 marraskuu 2013; Julkaistu: 31 joulukuu 2013
Copyright: © 2013 Wu et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.
Rahoitus: Kirjoittajat ei ole rahoitusta tai tukea raportti.
Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.
Johdanto
Sytokromit P450 (CYP450s) ovat Hemi sisältäviä entsyymejä tärkeää vaiheittain I-riippuvainen metabolia huumeet ja muut vierasperäiset aineet [1]. Tutkimukset osoittavat, että CYP-entsyymien osallistuvat solun toimintoja, kuten aineenvaihdunta eikosanoidien, kolesterolin biosynteesiin ja sappihappoja, synteesiä ja metaboliaa steroidien ja D3-vitamiini, synteesi ja hajoaminen biogeenisten amiinien ja hydroksylaatio retinoiinihapon ja oletettavasti muiden morfogeeneille . Kuitenkin tehtäviä useita CYP-entsyymien ei vielä tunneta [2,3]. Tähän mennessä monet tärkeät yhden emäksen monimuotoisuus (SNP: t) on havaittu CYP geenejä, ja tällaiset polymorfismit näissä geenit voivat olla tärkeä rooli päätettäessä yksilön herkkyys moniin syöpiin. Niistä CYP mukana procarcinogen aktivointi, Sytokromi P450 1A1 (CYP1A1) on laajimmin tutkittu [4,5].
CYP1A1 ilmentyy pääasiassa extrahepatically etenkin epiteelikudoksissa, ja se on ratkaiseva aineenvaihdunnan monet endogeeniset substraatit ja eksogeenisen karsinogeenejä. Koska CYP450 1A1 kykyä katalysoida ensimmäistä vaihetta aineenvaihdunnassa polysyklisiä aromaattisia hiilivetyjä (PAH, läsnä myös tupakansavu), CYP1A1 voivat edistää muodostumista erittäin reaktiivisia välituotteita [6,7], jotka voivat muodostaa DNA addukteja, jotka, jos korjaamatta, voi aloittaa tai nopeuttaa syövän synnyn [8].
Useat polymorfismit CYP1A1 on kuvattu ja ajankohtaista tietoa löytyy ihmisen CYP-alleelin nimikkeistön verkkosivuilla (https://www.cypalleles.ki.se) [9]. Kertyvät todisteet viittaavat siihen, että geneettiset polymorfismit liittyvät yksilöllinen vaihtelu syöpäalttiutta [10,11]. Alttius syövän määräytyy aktivoituminen osallistuvien entsyymien karsinogeeni aktivoinnin tai deaktivoinnin. Tällaiset vaihtelut geeneissä, jotka koodaavat näitä entsyymejä voisi muuttaa niiden ilmentymistä ja toimintaa, mahdollisesti vaikuttanut tasapainon metabolinen aktivaatio ja vieroitus myrkkyjen, joka johtaa yksittäisen alttius syöpään [12]. Kaksi funktionaalista nonsynonymous polymorfismien on hiljattain tutkittu. Tarkemmin sanottuna T-to-C mutaatio ei-koodaavan 3′-reunustava alue on raportoitu aiheuttavan luomista uuteen MspI restriktiokohdan (MspI polymorfismi m1, T6235C, rs4646903). Toinen CYP1A1: polymorfismi on G-to-A siirtyminen (A4889G) eksonissa 7, jolloin korvaaminen isoleusiini (Ile) valiinilla (Val), joka on hemi-sitoutumiskohtaan (Ile462Val polymorfismi m2, A4889G, rs1048943) [ ,,,0],13].
Tähän mennessä useat meta-analyysit on suoritettu tutkimaan assosiaatio MspI ja Ile462Val polymorfismit CYP1A1 ja erilaiset syövät kuten eturauhas-, munasarja-, rinta-, keuhko-, ja peräsuolen syöpä ja leukemia , muutamia, jotka esiintyvät eri etnisten populaatioissa [5,7,14-18]. Kuitenkin meta-analyysi tutkimaan suhdetta CYP1A1 MspI ja Ile462Val polymorfismien ja yleistä syöpäriskiä ei ole tehty. Viimeisten kahdenkymmenen vuoden aikana monet molekyyli epidemiologiset tutkimukset on tehty selvittämään yhdistyksen välillä CYP1A1 polymorfismien ja syöpäriskin ihmisillä. Kuitenkin yksittäiset tutkimuksen rajoitukset vaikuttivat vaihtelevien päätelmät joukossa. Siksi teimme meta-analyysi kaikista voivat tutkimusten johtamiseksi tarkemman arvion suhde MspI ja Ile462Val polymorfismit CYP1A1 ja yleistä syöpäriskiä.
Materiaalit ja menetelmät
tunnistaminen ja kelpoisuus Asiaa Studies
Kaikki paperit koskevat yhdistyksen välillä CYP1A1 polymorfismien ja syöpäriski julkaistu jopa 31 joulukuu 2012 tunnistettiin kattavalla hakuja PubMed tietokantaan seuraavin ehdoin ja hakusanat: ” P450 1A1 ”,” ’CYP1A1’ ’ja’ ’polymorfismi’ ’,’ ’vaihtelu’ ’,’ ’mutaatio’ ’ja nämä ehdot olivat myös pariksi ”” syöpää ”’, ” kasvain ” ja ” karsinooma ” . Haku rajattiin ihmisen tutkimuksia ja Englanti kielen paperit.
Sisällyttämiskriteerit
osallisuutta tutkimuksissa tulee täyttää seuraavat kriteerit: (a) jolla on tietoa arvioinnin CYP1A1 polymorfismin ja syövän riskiä, (b) käyttäen tapaus-verrokki suunnittelu, ja (c), joka sisältää täydelliset tiedot kaikista genotyypin taajuuksilla. Hylkäämisperusteet mukana (a) tutkimukset, jotka eivät keskittyneet syöpää tai CYP1A1 tutkimusta, (b) arvioita, (c) raportoi ilman käyttökelpoista tietoa, ja (d) kahtena julkaisuja.
Data Extraction
Information oli huolellisesti uutetaan kaikki päteviä julkaisuista itsenäisesti kaksi tutkijaa (K Liu ja SQ Wang), joka perustuu pääsyn kriteerit yllä. Erimielisyydet ratkaistiin läpi keskustelun välillä kaksi tutkijaa. Seuraavat tiedot kerättiin kustakin mukana tutkimuksessa standardoituun tiedonkeruun protokolla (tarkistuslista S1): ensimmäisen tekijän nimi, julkaisuvuosi, etnisyyden, alkuperämaa, syövän tyypistä, genotyypitysmenetelmää, lähde ohjaus ryhmien (väestöpohjainen tai sairaalan perustuvat tarkastukset) ja täydellisiä tilastotietoja kaikista genotyyppien. Eri etnisten laskujen luokiteltiin Afrikkalainen, Aasian, valkoihoinen tai Mixed (koostuu eri etnisten ryhmien). Samaan aikaan eri asia-ohjattu ryhmiä yhdessä tutkimuksessa pidettiin riippumattomat tutkimukset.
tilastolliset menetelmät
OR (kertoimella suhteet) ja niiden 95% CI (luottamusvälit) käytettiin määrittämään vahvuus välisen assosiaation CYP1A1 MspI ja Ile462Val polymorfismien ja syöpäriskiä. Prosenttiosuus paino määräytyy tarkkuus sen arvio vaikutusta, ja tilastollinen ohjelmisto STATA, on yhtä suuri kuin käänteinen varianssin. Riskit (syrjäisimmillä alueilla) syöpään liittyvän CYP1A1 MspI ja Ile462Val polymorfismien arvioitiin kullekin tutkimusta. Tilastollinen merkitys yhteenveto OR määritettiin Z-testi. Meidän meta-analyysi, selvitimme yhdistyksen välillä alleeli C MspI polymorfismin ja syöpäriski verrattuna alleelin T. Myös lisäaineena (CC vs. TT ja CC vs. CT), resessiivinen (CC vs. CT + TT), ja hallitseva (CC + CT vs. TT) geneettistä mallia tutkittiin. Samaa menetelmää sovellettiin Ile462Val polymorfismin. Kerrostunut analyysit suoritettiin myös suhteessa syövän tyyppi (jos syöpä tyyppi sisälsi alle kaksi yksittäisten tutkimusten, se oli luokiteltu ”muu syöpä”), etnisyys, lähde valvonnan ja otoskoko (aiheet yli 500 yksilöä sekä tapauksessa ja ohjaus ryhmiä tai ei). Heterogeenisuus analyysi vahvisti Chi-square-pohjainen Q-testi. P-arvo on suurempi kuin 0,10 Q-testi osoitti puute heterogeenisuus tutkimuksista, ja sitten kiinteiden vaikutusten malli (Mantel-Haenszelin menetelmää) käytettiin laskemiseen yhteenveto OR arvio kunkin tutkimuksen. Muussa tapauksessa sattumanvaraiset vaikutukset malli (Dersimonian ja Laird menetelmää) käytettiin. HWE kontrolliryhmässä arvioitiin Fisherin testiä ja P-arvo 0,05 pidettiin merkittävänä. Arvio mahdollisten julkaisun harhaa suoritettiin suppilon avulla juoni, jossa keskivirhe log (OR) kukin tutkimus piirrettiin sen log (OR). Epäsymmetrinen juoni ehdottaa mahdollista julkaisu bias. Suppilo juoni epäsymmetria arvioitiin menetelmällä Egger n lineaarisen regression testi, lineaarinen regressio lähestymistapa mitata suppilo juoni epäsymmetria luonnon logaritminen mittakaava OR. Kaikki tilastolliset analyysit suoritettiin Stata ohjelmiston (versio 12.1, StataCorp LP, College Station, TX), käyttäen kaksipuolista P-arvoja.
Tulokset
Ominaisuudet Studies
Seitsemän yhdeksänkymmentä mahdollisesti merkitystä sitaattia tarkistetaan, ja 198 julkaisut (139 julkaisuja 148 tapauksessa kontrolloituja tutkimuksia varten MspI ja 126 julkaisuja 134 tapauksessa kontrolloituja tutkimuksia varten Ile462Val) täytti kriteereillä ja valittiin meidän meta-analyysi . Tutkimus hakuprosessi on kuvattu kuviossa 1. Yksityiskohtaiset tiedot 198 julkaisuista on lueteltu File S1.
Mitä tulee MspI polymorfismi, 37783 tapauksia ja 50536 säätimet 148 tapauksessa kontrolloiduissa tutkimuksissa oli käytettävissä. Tutkimus ominaisuudet on esitetty yhteenvetona taulukossa S3. Niistä 148 tapausverrokkitutkimukset oli 55 tutkimuksia Valkoihoisilla, 59 tutkimukset aasialaiset, 7 tutkimuksia afrikkalaisista ja 27 tutkimukset sekalaisen jälkeläisiä. Oli 32 keuhkosyöpä tutkimuksia, 29 rintasyöpätutkimuksissa, 15 leukemia tutkimuksia, 10 eturauhassyöpä tutkimuksia, 10 pään ja kaulan alueen syöpä tutkimukset, 9 peräsuolen syöpä tutkimukset, 7 kohdun limakalvon syöpä tutkimukset, 6 kohdunkaulan syövän tutkimuksiin, 5 munasarjasyövän tutkimuksissa, 4 mahalaukun syöpä tutkimukset, 4 ruokatorven syöpä tutkimukset, 3 hepatosellulaarinen syöpä tutkimukset, 3 lymfooma tutkimukset ja muut syövät luokiteltiin osaksi ”muut” -ryhmään. Koskee lähde valvonta, 74 olivat sairaaloiden, 70 oli väestöpohjainen ja 4 sekoitettiin. Lisäksi 46 tutkimusta tehtiin kanssa subjects≥500 sekä tapauksessa ja kontrolliryhmiin.
Mitä tulee Ile462Val polymorfismi, 134 tapauksessa kontrolloituja tutkimuksia olivat oikeutettuja (34466 tapausta ja 44371 valvonta), joka käsittää 67 tutkimusta Aasian populaatiot, 45 tutkimuksissa valkoihoinen väestö, 3 tutkimukset Afrikkalainen väestö ja 19 tutkimuksissa sekapopulaatioissa. 52 tutkimukset tehtiin yleisiä populaatiot, 52 olivat sairaaloiden ja 3 sekoitettiin. Oli 26 keuhkosyöpä tutkimuksia, 25 rintasyöpätutkimuksissa, 8 leukemia tutkimukset, 9 eturauhassyöpä tutkimuksia, 12 pään ja kaulan alueen syöpä tutkimukset, 8 peräsuolen syöpä tutkimukset, 6 kohdun limakalvon syöpä tutkimukset, 3 kohdunkaulan syövän tutkimuksiin, 4 munasarjasyövän tutkimuksissa, 4 mahalaukun syöpä tutkimukset, 10 ruokatorven syöpä tutkimukset, 3 hepatosellulaarinen syöpä tutkimuksissa 6 suullinen syöpä tutkimukset ja muut syövät luokiteltiin osaksi ”muut” -ryhmään. Niistä 134 tapausverrokkitutkimukset, 42 tutkimuksissa oli mukana otoksen size≥500. Yksityiskohtaisen tutkimuksen ominaisuudet on esitetty taulukossa S4.
Mitä genotyypin menetelmiä, PCR-RFLP, TaqMan ja alleeli-spesifinen PCR-menetelmiä käytetään yleisesti. Useimpien tutkimusten, syövät vahvistettiin histologisesti tai patologisesti ja kaikki kontrollit pääasiassa sovitettu sukupuolen ja iän mukaan. Lisäksi jakelu genotyyppien valvonnan kaikista hyväksyttävistä tutkimuksissa oli yhdenmukainen Hardy-Weinberg tasapaino (HWE).
Quantitative Synthesis
suhde MspI polymorfismin ja riski eri syöpätyyppien on esitetty taulukossa S1. Kaiken kaikkiaan merkittävästi kohonnut syöpäriski oli mukana CYP1A1 C /C polymorfismin varten alleelin kontrastin (C vs. T: OR = 1,15 CI = 1,09-1,22), lisäaine geneettinen malli (C /C vs. T /T : OR = 1,33 CI = 1,17-1,51; C /C vs. C /T: OR = 1,14 CI = 1,03-1,27), resessiivinen geneettinen malli (C /C vs. C /T + T /T: OR = 1,24 CI = 1,11-1,39) ja hallitseva geneettinen malli (C /C + C /T vs. T /T: OR = 1,17 CI = 1,10-1,24). Vuonna alaryhmäanalyysi etnisyys, tulokset osoittivat, että yksilöiden C /C-genotyyppi oli merkitsevästi suurempi syöpäriski aasialaiset (C /C vs. T /T: OR = 1,45, CI = 1,24-1,69; C /C vs. C /T: OR = 1,17, CI = 1,04-1,32; väistyvä malli: OR = 1.30, CI = 1,14-1,49, hallitseva malli: OR = 1,26, CI = 1,13-1,39). Kun rajoitetaan analyysin lähde valvonnan merkitseviä havaittiin sekaryhmää (C /C vs. T /T: OR = 1,95, CI = 1,32-2,87; C /C vs. C /T: OR = 1,41, CI = 1,00-1,97, hallitseva malli: OR = 1,43, CI = 1,19-1,71; väistyvä malli: OR = 1.67, CI = 1,13-2,46). Vuonna kerrostunut analyysi syöpätyyppejä, merkitseviä havaittiin keuhkosyöpä (C /C vs. T /T: OR = 1,43, CI = 1,16-1,78, hallitseva malli: OR = 1,21, CI = 1,10-1,32; väistyvä malli : OR = 1,32, CI = 1,07-1,62), kohdunkaulan syöpä (C /C vs. T /T: OR = 3,12, CI = 1,39-6,99; C /C vs. C /T: OR = 1.79, CI = 1,11 -2,88; väistyvä malli: OR = 2,48, CI = 1,41-4,36). Vuonna ositettu analyysi otoskoko (molemmissa tapauksissa ja valvonta), merkitseviä havaittiin 500 (C /C vs. T /T: OR = 1,44, CI = 1,21-1,72; C /C vs. C /T : OR = 1,22, CI = 1,05-1,41, hallitseva malli: OR = 1,23, CI = 1,12-1,36; väistyvä malli: OR = 1,33, CI = 1,14-1,56).
Mitä Ile462Val polymorfismi tiedot: yhdistettyjen syrjäisimmillä alueilla, sekä niiden 95% CI, on esitetty yksityiskohtaisesti taulukossa S2. Kaiken kaikkiaan huomattavasti lisääntynyt syöpäriski oli mukana CYP1A1 G /G-polymorfismi, että alleelin kontrastin (G vs. V: OR = 1,18 CI = 1,12-1,25), lisäaine geneettinen malli (G /G vs. A /A : OR = 1,52 CI = 1,34-1,72; G /G vs. G /A: OR = 1,28 CI = 1,17-1,39), resessiivinen geneettinen malli (G /G vs. G /A + A /A: OR = 1,42 CI = 1,27-1,60) ja hallitseva geneettinen malli (G /G + G /A vs. A /A: OR = 1,18 CI = 1,11-1,26). Toinen analyysi tehtiin tietoihin ositettu etnisyys ja lisääntynyt alttius löytyi yksilöiden G /G genotyyppi valkoihoisilla (G /G vs. A /A: OR = 1,90 CI = 1,45-2,51; G /G vs. G /A: OR = 1,53 CI = 1,19-1,99, hallitseva malli: OR = 1,17 CI = 1,03-1,33; väistyvä malli: OR = 1,74 CI = 1,34-2,26). Samanlaisia tuloksia havaittiin myös keskuudessa aasialaiset (G /G vs. A /A: OR = 1,46 CI = 1,26-1,68; G /G vs. G /A: OR = 1,24 CI = 1,12-1,36, hallitseva malli: OR = 1.19 CI = 1,10-1,28; väistyvä malli: OR = 1,38 CI = 1,21-1,57). Vuonna kerrostunut analyysin lähde valvonnan merkitseviä havaittiin kaikissa geneettisissä malleissa HB (G /G vs. A /A: OR = 1,50 CI = 1,31-1,71; G /G vs. G /A: OR = 1,35 CI = 1,21-1,51, hallitseva malli: OR = 1,15 CI = 1,07-1,25; väistyvä malli: OR = 1,43 CI = 1,27-1,61) ja PB (G /G vs. A /A: OR = 1,63 CI = 1,25-2,12 ; G /G vs. G /A: OR = 1,18 CI = 1,02-1,36, hallitseva malli: OR = 1,22 CI = 1,08-1,38; väistyvä malli: OR = 1,48 CI = 1,17-1,88). Kun rajoitetaan analyysin syöpätyyppejä, merkittäviä riskejä havaittiin keuhkosyöpä, leukemia, ruokatorven syöpä ja eturauhassyöpä kaikissa geneettisten mallien. Lisäksi kun kerrostunut analyysin mukaan otoskoko, yhdistys oli merkityksetön, kun meta-analyysi rajoitettiin suurempia tutkimuksia. Per-alleelin OR G variantin yli 500 koehenkilöillä oli 1,05 (95% CI: 0,99-1,10), jossa vastaaviin tuloksiin alla hallitseva ja väistyvä geneettisiä malleja 1,04 (95% CI: 0,98-1,11) ja 1,15 (95 % CI: 1,00-1,32), tässä järjestyksessä.
Testi heterogeenisuus
Ota CYP1A1 Ile462Val genotyyppi esimerkiksi oli merkittävää heterogeenisyyttä alleelin kontrastin (G vs. V: P 0,001 ), lisäaine geneettinen malli vertailu (G /G vs. G /A: P 0,001 ja G /G vs. A /A: P 0,001), hallitseva malli vertailu (G /G + G /A vs . A /A: P 0,001), ja väistyvä mallin vertailun (G /G vs. G /A + A /A: P 0,001). Käyttämällä meta-regressioanalyysi tutkia lähde heterogeenisyys varten hallitseva mallivertailujen (G /G + G /A vs. A /A) etnisyys, syöpätyyppejä, lähde valvonta, ja otoskoko, havaitsimme, että otoskoko ( t = -3.3, P = 0,001) vaikutti merkittävästi muutettu heterogeenisyys, mikä voisi selittää 100%: n heterogeenisyys lähteen. Samalla huomasimme, että syöpätyyppeihin (t = 0,58, P = 0,563), kansallisuus (t = 0,62, P = 0,534), tai lähde valvonta (t = -0,42, p = 0,677) ei vaikuttanut lähde heterogeenisyys .
herkkyysanalyysi
herkkyysanalyysi suoritettiin hylkäämällä tietyt tutkimukset, kuten tutkimus, joka ei vastannut HWE The HWE kontrolliryhmässä arvioitiin Fisherin testiä. Tutkimukset ennen ja jälkeen prosessi yksittäisten tutkimuksen laiminlyönnistä oli P-arvo 0,05 määritettiin eivät täytä HWE. Sen jälkeen yksittäisiä tutkimus laiminlyönti, vastaavien yhdistettyjen OR ei muuttunut merkittävästi. Herkkyysanalyysi vahvisti siten, että meta-analyysitulokset olivat tilastollisesti luotettavia ja että tulokset olivat luotettava ja vakaa.
Julkaisu Bias
Begg n suppilo juoni ja Egger testi tehtiin arvioimiseksi kirjallisuuden julkaisu bias . Mitä CYP1A1 MspI polymorfismi (kuva 2), suppilo juoni muoto vertailuja C ja T-alleelin CYP1A1 MspI polymorfismi ilmestyi symmetrinen kaikissa verrattuna malleihin. Sitten Egger testi tehtiin tarjoamaan tilastollista näyttöä suppilo juoni symmetria. Tiedot eivät viittaa näyttöä julkaisun bias (P = 0,232 SK vs. TT). Sillä Ile462Val genotyyppi (kuva 3), muodot suppilon tonttien näytti epäsymmetriset hallitseva geneettinen malli. Kuitenkin hallitseva malli (G /G + G /A vs. A /A) oli merkittävä julkaisu bias (t = 3,20 ja P = 0,002). Säädä tätä harhaa, trim-ja täyttö kehittämä menetelmä Duval ja Tweedie [19] käytettiin sekä tunnistaa ja korjata suppilon tontin epäsymmetrian johtuvat julkaisu bias. Me täytetään epäsymmetrinen syrjäisillä osa suppilo jälkeen arvioimalla kuinka monet tutkimukset olivat epäsymmetrinen komponentti avulla Stata ohjelmistoa. Data osoitti, että 17 tutkimuksissa on täytettävä jälkeen toistojen. Sitten arvioidaan todellista keskellä suppilo, todellinen keskiarvo, ja 95%: n luottamusväli, joka perustuu täytetty suppilon juoni. OR arvioita ja 95%: n luottamusväli Kiinteän efektimalli ennen ja jälkeen trim-ja täyttö olivat 1,071 (1,034-1,110) ja 1,084 (1,006-1,167). Myös satunnainen vaikutus malli, tulokset olivat 1.119, (1,079-1,160) ja 1,181 (1,106-1,261). Meta-analyysin kanssa tai ilman trim-ja-täyttö menetelmä ei tarjonnut erilaisia johtopäätöksiä, mikä osoittaa, että tulokset olivat tilastollisesti varmana.
(A) C-alleelin vs. T-alleelin. Jokainen piste edustaa erillistä tutkimusta osoitettuun -alueella. Log (OR), luonnollisen logaritmin OR. Vaakasuora viiva = keskimääräinen vaikutus koko.
(A) G /G + G /A vs. G /A. (B) trim-ja täytön G /G + G /A vs. G /A. Jokainen piste edustaa erillistä tutkimusta osoitettuun -alueella. Log (OR), luonnollisen logaritmin OR. Vaakasuora viiva = keskimääräinen vaikutus koko.
Keskustelu
CYP geenejä, jotka koostuvat suuria perheitä endoplasmic ja sytosolientsyymien, osansa huume, steroidi hormoni, ja procarcinogen aineenvaihduntaa. Ihmisillä CYPP450s kompleksi (metalloproteiinien) sisältää yli 15 erilaista entsyymit [20]. Jotkut CYP Hemi-tiolaat- entsyymit osallistuvat vieroitus ja reaktiivisten välituotteiden tuhansia kemikaaleja, jotka voivat vahingoittaa DNA, lipidit ja proteiinit. CYP ilmentyminen voi myös vaikuttaa molekyylien tuotantoa, jotka ovat peräisin arakidonihapon ja muuttaa eri alavirran signaalin transduktion reittejä. Tällaiset muutokset voivat olla esiasteita maligniteetin [21]. CYP1A1 on kriittinen CYPP450 ja tutkimukset viittaavat siihen, että CYP1A1 polymorfismi voi olla riskitekijä useiden pahanlaatuisten kasvainten vaikka edessä on sen rooli vieroitus ympäristön karsinogeenien ja metabolisen aktivaation ravinnon yhdisteitä, jotka suojaavat syöpä. Siksi osuus CYP1A1 syövän etenemiseen tai ehkäisyyn voi riippua tasapainoon procarcinogen aktivointi /vieroitus ja ravinnon ekstrahepaattisen aineenvaihdunta [9].
Aiemmat tutkimuksia CYP1A1 polymorfismien ja syöpäriskin ovat olleet tuloksettomia. Selventää yhteenliittymää, teimme meta-analyysi 198 julkaisuista. Parhaan tietomme mukaan tämä on ensimmäinen meta-analyysi arvioida suhdetta CYP1A1 polymorfismien ja yleistä syöpäriskiä. Tutkimuksemme tarjoaa myös alaryhmäanalyysissä ositettu etnisyys, lähde ohjaus, syöpätyypin ja otoskoko. Tuloksemme osoittivat, että MspI polymorfismi C /C genotyyppi liittyy suurentunut riski syöpiä, erityisesti keuhko- ja kohdunkaulan syöpä aasialaiset ja sekapopulaatioissa, kun taas Ile462Val polymorfismi G /G genotyyppi liittyy suurentunut riski sairastua keuhkosyöpään, leukemia, ruokatorven syöpä, ja eturauhassyövän valkoihoisilla ja aasialaiset.
Koska kasvain alkuperää voisi vaikuttaa tuloksiin meta-analyysit, suoritimme alaryhmäanalyyseissa syöpätyypin. Huomasimme, että CYP1A1 MspI ja Ile462Val polymorfismien korreloivat lisääntynyt keuhkosyöpä alttius. Myös MspI polymorfismi C /C genotyyppi liittyy lisääntynyt riski kohdunkaulan syövän. Mielenkiintoista, Gutman ja työtoverit [22] ilmoitetaan, että CYP1A1 MspI C /C polymorfismi tuskin on merkittävä riskitekijä kohdunkaulan syöpä, joka on vastoin meidän tietoja meta-analyysi. Samoin merkitty ja huomionarvoista ristiriita syntyy välillä meta-analyysin tiedot ja tuoreet tiedot Wideroff n [23] ja Li: n laboratoriossa [24]. Molemmat tutkijat raportoivat, että Ile462Val G /G-polymorfismi ei liity lisääntynyt riski ruokatorven syöpä ja eturauhassyöpä mutta tiedot osoittavat, että tämä G /G-polymorfismi voi vaikuttaa alttiuteen näitä erittäin syöpätyypit. Useita poikkeamia, kuten nämä havaittiin, vaikka syy on epäselvä. Ehkä eri syöpiä eri karsinogeenisia mekanismien ja ympäristöaltisteiden oli erilaisia vastauksia CYP1A1 genotyyppejä. Myös joidenkin syövän alatyyppejä, vain muutamia tutkimuksia olemassa, ja nämä olivat rajalliset otoskokoja. Niinpä joissakin tutkimuksissa on voitu alitehoinen havaita pieniä, mutta mielekästä, yhdistyksiä. Näin ollen laajamittainen, yksityiskohtaisia ja mekanistinen tutkimuksia tarvitaan vahvistamaan näitä suhteita.
alaryhmäanalyysi etnisyys, The MspI C /C polymorfismi havaittiin antaa lisääntynyt syöpäriski aasialaiset ja sekapopulaationa mutta ei valkoihoiset tai afrikkalaisia. Sillä Ile462Val G /G-polymorfismi, tilastollisesti merkittävästi kohonnut syöpäriski havaittiin aasialaiset ja valkoihoiset muttei afrikkalaisia tai seka jälkeläinen populaatioissa. Tarkkaa mekanismia etnisten ero on epävarma, mutta erot taustalla geneettinen tausta ja sosiaalisia tekijöitä eri populaatioissa tutkittu voivat olla tärkeitä. Monietnisessä kohteet voivat olla ainutlaatuisia kulttuureja ja elämäntapojen joka voi edistää eri geneettisiä ominaisuuksia ja alttius tiettyjen syöpien. Myös tässä meta-analyysissä, otoskoko ja lukumäärät tutkimusten Afrikkalainen ryhmät ja sekaryhminä eivät riittäneet arvioimaan yhteenliittymää. Lopulta valinta bias, eri matching kriteerit ja luokitusvirheitä tautinsa ja genotyypityksen saattanut vaikuttaa ristiriita. Kaiken tietomme antavat aiheen olettaa, geneettisen monimuotoisuuden eri etnisten.
Muut rajoitukset Tämän tutkimuksen mukana heterogeenisyys, joka voi häiritä tulkintaan meta-analyysin tiedot. Vaikka me minimoitu tämän todennäköisyyden suorittamalla huolellinen etsimään julkaistujen tutkimusten avulla selkeät kriteerit tutkimuksen sisällyttäminen ja suorittamalla tiukat tiedon louhinta ja analysointi, merkittävät Interstudy heterogeenisyys kuitenkin ollut lähes jokaisessa vertailussa. Meidän meta-analyysissä, otoskoko tutkimusten joukossa afrikkalaisten ja useiden syöpätyyppien on pieni ja rajoitettu. Tämän seurauksena, näytteen koko oli eniten heterogeenisyys lähteen. Emme kuitenkaan sulkea pois mahdollisuutta, että etninen tai kasvaimen tyyppi erot voivat myötävaikuttaa suhteellisen suuri heterogeenisyys. Samanaikaisesti heterogeenisyys voi syntyä eroja valikoima säätimiä sekä aihe ikäjakauma ja elämäntapaan liittyvien tekijöiden. Lisäksi puute alkuperäiset tiedot perustuvat tutkimukset rajoitettu arviomme mahdollisten yhteisvaikutusten koska vuorovaikutukset geeni-to-geeni, geeni-to-ympäristöön, ja jopa eri polymorfisten lokusten saman geenin, joka voi moduloida syöpäriskejä. Lopuksi määrä julkaistujen tutkimusten oli riittämätön kattava analyysi, erityisesti yhden syöpien ja afrikkalaisia. Parempi analyysi sisältää yksityiskohtaiset yksittäisiä tietoja, kuten ikä ja sukupuoli. Siksi enemmän tutkimuksia riittävän näytteen koot ja yksityiskohtaiset tiedot ovat perusteltuja. Myös tutkimukset indeksoitu valittujen tietokantojen olivat mukana meta-analyysissä, ja joitakin olennaisia julkaistuja tutkimuksia tai julkaisemattomista tutkimuksista null tulokset saattavat jäädä huomaamatta mikä bias tuloksemme.
Vaikka siis merkittävä heterogeenisyys alkaen sisältyi tutkimuksia olemassa, meidän meta-analyysi esittänyt todisteita tukemaan yhdistyksen välillä CYP1A1 MspI ja Ile462Val polymorfismien ja lisääntynyt syöpäriskiä. Vaikutukset kahden genotyyppien kunkin CYP1A1 polymorfismin ovat monimuotoisia mukaan alaryhmäanalyysissä ositettu etnisyys, syöpätyypin, ja lähde ohjaus. Tulevaisuudessa tarkka valikointi potilaita, hyvin verrokeilla, standardoituja ja puolueetonta menetelmät ja suurempia otokset ovat välttämättömiä. Gene-geeni ja geeni-ympäristön vuorovaikutukset olisi myös harkittava sekä etnisiä-erityisiä tutkimuksia tutkia roolia kaksi toiminnallista polymorfismien afrikkalaisia ja tiettyjä syöpätyyppejä.
tukeminen Information
tarkistuslista S1.
PRISMA 2009 tarkistuslista.
doi: 10,1371 /journal.pone.0085166.s001
(DOC)
Tiedosto S1.
Kaikki kelvolliset artikkelit mukana tässä meta-analyysi.
doi: 10,1371 /journal.pone.0085166.s002
(DOC) B Taulukko S1.
kerrostuneisuus analyysit P-arvon ja 95%: n luottamusväli MspI polymorfismi.
doi: 10,1371 /journal.pone.0085166.s003
(DOC) B Taulukko S2.
kerrostuneisuus analyysit P-arvon ja 95%: n luottamusväli Ile462Val polymorfismi.
doi: 10,1371 /journal.pone.0085166.s004
(DOC) B Taulukko S3.
Ominaisuudet sisältämien tutkimusten meta-analyysi MspI polymorfismi. Yleistynyt jakelu MspI genotyypin taajuudet kullekin mukana tutkimuksessa on listattu.
Doi: 10,1371 /journal.pone.0085166.s005
(DOC) B Taulukko S4.
Ominaisuudet sisältämien tutkimusten meta-analyysi Ile462Val polymorfismi. Yleistynyt jakelu Ile462Val genotyypin taajuudet kullekin mukana tutkimuksissa on listattu.
Doi: 10,1371 /journal.pone.0085166.s006
(DOC) B