Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

peräsuolen syöpä (CRC) on kolmas yleisin syöpä ja neljänneksi suurin syy syövän kuolemaan maailmanlaajuisesti. Yksittäinen nukleotidin polymorfismi (SNP), rs961253 sijaitsee 20p12, oli ensiksi kuvattu liittyvän suurentunut CRC genomin laajuinen yhdistys tutkimuksessa; kuitenkin uudempi replikointi tutkimukset tuotti kiistelty tuloksia.

Menetelmät /Principal Havainnot

Sairaala-pohjainen tapauskontrollitutkimuksessa kiinalaisessa väestöstä ensiksi suoritettu, ja sitten meta-analyysi yhdistämällä nykyinen ja aiemmin julkaistu tutkimukset suoritettiin tutkimaan todelliset vaikutukset rs961253 CRC alttius. Kiinan väestö mukaan lukien 641 tapausta ja 1037 tarkastukset, per-A-alleelin siirrettävä OR = 1,60 (95% CI = 1,26-2,02) alle lisäaine malli. Meta-analyysi mukaan lukien 29859 tapaukset ja 29696 valvonta, per-A-alleelin on OR 1,13 (95% CI = 1,09-1,18) alle satunnaista vaikutuksia mallin takia heterogeenisuus (

P

= 0,019 ). Kuitenkin heterogeenisyys voi täysin selittää etnisyys, jossa

tau

2

alennetaan 0 jälkeen myös etnisyyteen meta-regressiomallia. In kerrostunut analyysi etnisyys, per-A-alleelin oli syrjäisimmät alueet 1,34 (95% CI = 1,20-1,50) ja 1,11 (95% CI = 1,08-1,14) Aasian ja Euroopan, vastaavasti, ilman heterogeenisyys. Vaatimaton vaikutus jokaisen tutkimuksen havaittiin kokonaisarvioinnilla herkillä analyysiin, ja ilmeinen taipumus merkittävää yhteyttä nähtiin kumulatiivinen analyysi ajan, yhdessä osoittaa vahvaa vakautta nykyiset tulokset.

Johtopäätökset /merkitys

tulokset Tutkimuksemme ja meta-analyysi edellyttäen varmoja todisteita siitä, että rs961253 merkittävästi vaikuttaneet CRC riski sekä Aasian ja Euroopan väestöstä.

Citation: Zheng X, Wang L, Zhu Y, Guan Q, Li H, Xiong Z, et al. (2012) SNP rs961253 in 20p12.3 liittyy peräsuolen syöpäriski A tapauskontrollitutkimuksessa ja meta-analyysi julkaistun kirjallisuuden. PLoS ONE 7 (4): e34625. doi: 10,1371 /journal.pone.0034625

Editor: Hirofumi Arakawa, National Cancer Center Research Institute, Japani

vastaanotettu: 24 joulukuu 2011; Hyväksytty: 02 maaliskuu 2012; Julkaistu: 11 huhtikuu 2012

Copyright: © 2012 Zheng et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat National Natural Science Foundation of China [NSFC-81001275 ja 81171878 XM] ja Fok Ying Tung Foundation for Young Opettajat Korkeakoulujen of China (131038) XM Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

peräsuolen syöpä (CRC) on kolmas yhteinen maligniteetti ja neljänneksi suurin syy syövän kuolleisuus maailmassa, jossa on yli 1,2 miljoonaa ilmaantuvuutta maailmanlaajuisesti vuosittain ja noin 630.000 kuolemaa CRC vuosittain [1]. CRC on monimutkainen piirre vaikuttavat ympäristö- ja geneettiset tekijät ja niiden vuorovaikutus. Analyysi fenotyypin yhteneväinen kaksoset heijastuu vahva geneettinen komponentti kehittämiseen CRC [2], joka on vastuussa ~35% kaikista CRC. Kuitenkin korkean riskin ituradan mutaatioita muutamia geenejä, kuten

APC

, yhteensopimattomuuden korjausjärjestelmän (

MMR

) geenejä,

Smad4

, ja

BMPR1A

, selitti 5% kaikista CRC [3]. Kasvava todisteita epidemiologisten tutkimusten on vedonnut yhteisen alleelin-yleinen sairaus paradigma CRC. Viimeaikaiset genominlaajuisten yhdistys (GWA) tutkimukset ovat validoitu tämän hypoteesin ja sekaantunut useita yhteisiä yhden emäksen monimuotoisuus (SNP: t) vaikuttavat CRC alttiuteen [4] – [12]. Näistä SNP: t, rs961253 (20p12.3), sijaitse geenin luun morfogeneettinen proteiini 2 (

BMP2

), on ensin tunnistaa Houlston et al. voidaan merkittävästi liittyvän CRC riski meta-analyysi kahden GWAS käsittää 6780 tapauksia ja 6843 tarkastukset [5]. BMP2, kuten keskeinen jäsen transformoiva kasvutekijä-beeta (TGF-β) superperheen, on osoitettu estävän paksusuolen epiteelisolujen kasvua ja edistää apoptoosia ja siten kriittisesti mukana kehittämiseen CRC [13]. Kuitenkin enemmän replikointi tutkimuksissa tulokset ovat olleet epäjohdonmukaisia ​​[14], [15]. Osittain vaikeus replikointi tapahtuu mahdollisesti johtuen vaatimaton vaikutus tämän SNP, jossa kerroinsuhde (OR) 1,12 raportoitu vähäisiä alleelin; siten, pieni geneettinen yhdistys tutkimukset on liian vähän tehoa ja saattavat epäonnistua jäljitellä tätä yhdistystä. Lisäksi johtuen ilmiöiden ”voittajan kirous” että OR taudin variantti on yleensä yliarvioidaan alkuperäiseen positiivinen tutkimus, tarvittava otoskoko lisääntymään tutkimus olisi aliarvioida, jos perusta on aluksi raportoitu OR, niin replikointi olisi alimitoitettu ja mahdollisesti hylätty [16]. Kuitenkin, meta-analyysi, tilastollinen työkalu kampaus datan eri tutkimuksissa, on voimakas selventää epäjohdonmukaisia ​​havaintoja geneettinen yhdistyksen tutkimuksia, koska sen räjähdysmäisen kasvun otoksen koko [17]. Siksi tässä tutkimuksessa, teimme meta-analyysi, jossa yhdistyvät tulokset julkaistusta kirjallisuudesta ja meidän tapauskontrollitutkimuksessa tässä suoritetaan Kiinan väestön, antamaan tarkempi arvio yhdistyksen välillä rs961253 ja CRC riskiä.

Materiaalit ja menetelmät

Tutkimuskanta

yhteensä 641 tapauksesta tapauksia CRC ja 1037 tarkastukset otettiin vuosien 2009 ja 2011 välillä Tongji sairaalan Huazhong tiede ja teknologia (HUST), Wuhan, Kiina. Kaikki asiat eivät liittyneet etnisten Han kiinalaisia ​​Wuhan alueella. Tapaukset ovat olleet histologisia vahvisti ensisijainen CRC ja ei ollut saanut hoitoa ennen verinäytteiden keräämistä. Kontrollit olivat syöpää vapaa henkilöt valitaan satunnaisesti terveystarkastus-up-ohjelma samaan sairaalassa saman ajan kuin tapaukset otettiin. Kontrollit taajuus-sovitetaan tapauksissa iän (± 5 vuotta) ja sukupuoli. Tällä rekrytointi, 5 ml ääreisverinäytteestä kerättiin kustakin aiheesta jälkeen kirjallinen lupa saatiin. Tutkimus hyväksyi Institutional Review laudat Tongji sairaalan HUST.

genotyypin

Perimän DNA uutettiin 5-ml ääreisverinäytteestä käyttäen Relax Gene Veren DNA System DP319-02 (Tiangen, Peking, Kiina) mukaan valmistajan ohjeiden. Genotyyppejä rs961253 SNP määritettiin TaqMan SNP-genotyypin määritys (Applied Biosystems, Foster City, CA) käyttäen 7900HT Fast Real-Time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, CA). Laadunvalvontaan, 5% monistaa näytteet valittiin satunnaisesti uusittavuuden arvioimiseen, joiden konkordanssin oli 100%.

Tilastollinen analyysi

χ

2

testi, Fisherin eksakti testi, ja

t

testiä sovellettiin arvioitiin eroja jakeluun demografisten ominaisuuksien ja genotyyppien tapausten ja kontrollien välillä tarvittaessa. Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) arvioitiin hyvyyttä-of-fit χ

2test varten genotyyppejä kontrolliryhmässä. Under monimuuttuja logistinen regressiomalli, genotyyppitietojen OR ja sen 95%: n luottamusväli laskettiin säätämisen jälkeen ikä ja sukupuoli, jossa viitataan yhteisen homotsygootti. Välttämiseksi oletukset geneettisten mallien, lisäaine ja hallitseva malli rs961253 in liittyvän CRC analysoitiin myös. Kaikki edellä tilastollinen analyysi suoritettiin SPSS-V12.0.

Meta-analyysi rs961253 yhdessä CRC riski

Vahvista osallistumista rs961253 CRC alttius, meta-analyysi Yhdistämällä julkaistut tutkimukset ja meidän tapauskontrollitutkimuksessa tehtiin. Haimme kaikki julkaisut päivitetään lokakuun 2011 PubMed, EMBASE, ja ISI Web of Science tietokantoihin ilman kielirajoituksia, käyttämällä hakua strategiaa, joka perustuu termit ”rs961253, BMP2 tai 20p12.3” yhdessä ”peräsuolen neoplasmor peräsuolen syöpä ”. Viitteet on lueteltu haettuja artikkeleita tarkistettiin myös puuttuvat tiedot. Sisällyttäminen olivat: (1) tapaus-verrokki tai sisäkkäisiä tapauskontrollitutkimuksessa arvioidaan yhdistyksen välillä rs961253and CRC riski; (2) saadaan tietoa laskemiseksi genotyyppisten kerroinsuhde (syrjäisimmät alueet), jossa vastaava 95%: n luottamusväli (95% CI); (3) genotyyppien valvonnan ollessa Hardy-Weinberg tasapaino (

P

0,01). Eläinkokeissa, selostuksia, yksinkertaisesti kommentteja ja tapausselostuksia jätettiin pois. Tutkimus päällekkäisiä muun tutkimuksia olisi poistettava, ja yksi suurempi näytekoko valittiin. Jos useampi kuin yksi maantieteellinen tai etninen väestö sisällytettiin yhteen raportissa, kunkin populaation tarkasteltiin erikseen.

Seuraavat tiedot poimittiin kustakin tutkimus: ensin tekijän nimi, julkaisuvuosi, tutkimuksen suunnittelu, maantieteellisestä sijainnista tai etnisen opiskelua väestöstä, ohjaus lähde, otoskoko, genotyypitysmenetelmää, mies /nainen korko, keski-ikä, taajuudet genotyyppien tapauksissa ja valvontaa. Hardy-Weinberg tasapainon valvonta arvioitiin jälleen meta-analyysin mukaan hyvyys fit χ

2 testi (

P

0,01). Yhdistettiin taajuus alleelin eri etnisten populaatioiden arvioitiin käyttämällä käänteistä varianssi menetelmää aikaisemmin kuvanneet Thakkinstian et al. [18] .ORs ja 95% CI, sillä mittareita vaikutus koko valittiin uudelleen laskettiin genotyyppien AA vs. CC ja CA versus CC. Dominoiva geneettinen malli oletettiin varten rs961253, ja lisäaineen ”per-alleeli” malli pidettiin myös. Per-alleelin tai A- alleelin arvioitiin määrittämällä tulokset 0, 1, ja 2 genotyypit CC, CA, ja AA, vastaavasti, ja laskemalla syrjäisimpien kohden yksikköä maalitiliään logistinen regressiomalli. Tutkimusten välisten heterogeenisuus kaikki voivat vertailut arvioitiin Cochran n

Q

tilastotieto ja

I

2

metristä. Heterogeenisuus pidettiin merkitsevä

P

0,10 Q tilaston [19]. Sillä

I

2

metrinen, seuraavat katkaisupisteet käytettiin:

I

2

= 0-25%, ei heterogeenisyys;

I

2

= 25-50%, kohtalainen heterogeenisyys;

I

2

= 50-75%, suuri heterogeenisyys;

I

2

= 75-100%, äärimmäinen heterogeenisyys [20]. Kiinteä-vaikutukset mukaan käyttämällä Mantel-Haenszelin menetelmää [21], levitettiin allas tutkimuksia koskevat tiedot, kun heterogeenisuus oli vähäinen perustuu

P

Q tilastollinen yli 0,1; muuten, satunnainen vaikutusten mallia käyttäen Dersimonian ja Laird menetelmä [22], on sovellettu. Tutkitaan lähteitä heterogeenisuus tutkimusten meta-regressiomallia käytettiin [23]. Ennalta määritetyt ominaisuudet arvioimiseksi heterogeenisyyden lähteet olivat: etnisyys väestön (Aasian ja Euroopan), lähde ohjaus (väestö ja sairaaloiden perustuvat tarkastukset), tutkimus tyyppi (replikointi ja GWA tutkimukset), otoskoko (≤2000 ja 2000 aiheet) ja genotyypitysmenetelmää (high-throughput ja matalan tekirjastoja). Kerrostunut analyysi suoritettiin sitten mukaan mahdollisia lähteitä heterogeenisyys raportoitu meta-regressioanalyysi. Herkkyysanalyysi suoritettiin arvioimaan vaikutuksen kunkin tutkimuksen kokonaisarvioinnilla [24]. Kumulatiivinen analyysi suoritettiin valikoima julkaisun kertoja [25]. Julkaisu bias arvioitiin suppilo juoni [26], Egger testi [27], ja leikata ja täytä menetelmä [28], joka arvioi määrän ja tuloksia mahdollisesti puuttuu tutkimusten tuloksena julkaisemisesta bias. Kaikki tilastolliset analyysit suoritettiin STATA v11.0, ja kaikki

P

arvot kaksisuuntaisia, joilla on merkittävä tasolla 0.05.

Tulokset

tapauskontrollitutkimuksessa tulokset

Väestön ominaispiirteet.

yhteensä 641 tapauksesta tapauksista paksusuolisyövän ja 1037 taajuus verrokit otettiin tässä tutkimuksessa. Kuten taulukosta 1, miehillä oli 59,9% joukossa tapauksia verrattuna 59,1% kontrollien joukossa. Keski-ikä oli 56,31 vuotta (± 12,59) tapauksista ja 57,24 vuotta (± 10,86) valvontaa. Ei ollut merkitsevää eroa jakautuminen sukupuolen (

P

= 0,748) ja ikä (

P

= 0,119) välillä tapaus ja kontrolliryhmässä.

Association analyysi .

Taulukko 2 näyttää jakautuminen rs961253 genotyyppien tapauksissa ja valvontaa. Genotyyppien kontrollit olivat yhtä mieltä Hardy-Weinberg tasapaino (

P

= 0,277). Merkittävä ero havaittiin jakautuminen genotyyppien tapausten ja kontrollien välillä (

χ

2

= 16,33,

P

0,001). Monimuuttuja regressiomallia, kantajia CA genotyypin osoitti merkittävästi lisätä CRC riski kuin niitä kuljettavat CC genotyyppi (OR = 1,56, 95% CI = 1,21-2,01). Alhaisen taajuuden AA genotyyppi tässä tutkimuksessa väestön määräävä malli oli tehdä, yhdistämällä AA CA osaksi Kantoaallon (AA plus CA) ryhmä, lisätä tilastollinen voima arvioimiseksi CRC riskin. Todettiin, että A-kantoaalloilla OR 1,61 verrattuna kantajia CC-genotyyppi (95% CI = 1,25-2,06). Lisäksi merkittävästi lisääntynyt riski CRC löydettiin myös lisäaineena mallissa, jossa per-A-alleelin OR 1,60 (95% CI = 1,26-2,02).

Meta-analyysin tulokset

tutkimus ominaisuudet.

Kuten kuviossa S1, 8 raportit arvioitiin alustavasti sopivat kriteerit. Sen jälkeen yksityiskohtainen arviointi, 2 raportit puutteelliset tiedot poistettiin senjälkeen kun tekijöiden kanssa sähköpostitse [29], [30]. 3 raportit jakoivat saman näytteen [5], [31], [32], joista Tomlinson et al. [32] valittiin johtuen suurin näyte, vaikka Houlston et al. oli ensimmäinen ehdottaa yhdistyksen rs961253 [5]. Lopuksi 4 raportit plus meidän tapauskontrollitutkimuksessa käsittää 17 tutkimuksia 29859 tapauksia ja 29696 kontrollia sisällytettiin tähän meta-analyysi [14], [15], [32], [33]. Näistä 14 tutkimusta tehtiin Euroopan ja 3 Aasian (taulukko S1). Genotyyppien rs961253 verrokeilla sopeutui Hardy-Weinberg tasapaino kaikkien mukana tutkimuksissa (

P

0,01).

Frequency riskien alleeli vertailupopulaatiossa.

Oli merkittävä heterogeenisyys Euroopan ryhmässä (

P

heterogeenisyyden 0,001,

I

2

= 71,1%). Yhdistetty taajuus A-alleelin oli 35,4% (95% CI = 34,6% -36,2%) eurooppalaisessa suorittamaa valvontaa random-vaikutukset malli, joka oli huomattavasti korkeampi kuin 8,1% Aasian valvonnan ilman heterogeenisuus (95% CI = 7,5 % -8,6%,

P

heterogeenisyyden = 0,449; Kuva S2).

Kaiken meta-analyysi rs961253 in liittyvän CRC.

genotyypin mallissa merkittävästi lisätä riski CRC havaittiin CA verrattuna CC (OR = 1,14, 95% CI = 1,10-1,18, taulukko 3) alle kiinteiden vaikutusten malli (

P

heterogeenisyyden = 0,167). Marginaalinen heterogeenisuus havaittiin AA verrattuna CC (

P

heterogeenisyyden = 0,102) sekä hallitseva malli (

P

heterogeenisyyden = 0,099), kun taas merkittävä heterogeenisyys löytyi lisäaineena malli (

P

heterogeenisyyden = 0,019). Siksi random-vaikutukset mallia sovellettiin AA genotyypin, hallitseva ja lisäaine malleja, ja kaikki nämä geneettiset mallien siirrettävä huomattava kohonnut CRC, jossa syrjäisimpien alueiden 1,25 (95% CI = 1,16-1,34), 1,17 (95% CI = 1,12-1,22), ja 1,13 (95% CI = 1,09-1,18), tässä järjestyksessä.

Meta-regressioanalyysiä ja ositettu analyysi.

Tutkiakseen potentiaalisia between- tutkimuksessa heterogeenisyys alle lisäaine malli, meta-regressioanalyysi suoritettiin. Tyhjän regressio oli ensiksi juosta arvioida perustason arvo

tau

2

(

tau

2

= 0,0019), ja sitten joukko muuttujan mallia suoritettiin lisäämällä yksi covariates lukien etnisen väestön, lähde ohjaus, tutkimus tyyppi, otoskoko, ja genotyypitysmenetelmää. Vuonna univariate analyysissä mallin mukaan luettuna etnisyyden vähensi

tau

2

arvoksi 0, ja säätää

R

2

arvo oli 100% (

P

= 0,004), mikä viittaa siihen, kansallisuus voi täysin selittää heterogeenisyys eri tutkimuksissa lisäaineliuoksessa mallissa. Kerrostunut analyysin etnisyyden edelleen suoritettiin. Eurooppalaisessa väestö, kaikki geneettiset mallit osoittaneet todisteita heterogeenisuus (

P

heterogeenisyyden 0,1,

I

2

= 0), ja aiheuttavat huomattavasti lisääntynyt riski CRC, jossa syrjäisimpien alueiden 1,12 (95% CI = 1,08-1,16), 1,23 (95% CI = 1,17-1,30), 1,14 (95% CI = 1,10-1,18), ja 1,11 (95% CI = 1,08-1,14) ja genotyypin CA versus CC, AA vs. CC, ja hallitseva ja lisäaine malleja, vastaavasti. Aasian väestöstä vain genotyypin malli AA vs. CC osoitti merkittävää heterogeenisyyttä (

P

heterogeenisyyden = 0,012,

I

2

= 77,2%). Kaikki geneettinen malleja esitellään merkittävä kohonnut CRC lukuun ottamatta AA vs. CC (taulukko 3). Lisäksi suurempi vaikutus variantti nähtiin Aasian kuin Euroopan.

Herkkyystarkastelu.

Koska merkittävä heterogeenisuus tutkimuksissa havaittiin lisäaineen mallia, teimme herkkyysanalyysi vaikutuksen arvioimiseksi kunkin tutkimuksen yhdistetystä arvioon alle satunnaista vaikutus malli. Kuten taulukosta 4, sarja yhdistettiin OR 95%: n luottamusväli tuotetaan toistuvasti poistamisen jälkeen kunkin yksittäisen tutkimuksen ylittää jatkuvasti 1,0, ja yhdistettiin OR oli samanlainen ennen ja jälkeen poistetaan kunkin tutkimuksen. Samoin tulokset nähtiin muiden geneettisten mallien, että yksikään tutkimus mielekkäästi vaihtaa yhdistettiin syrjäisimpien alueiden, osoittaa vahvaa vakautta nykyiset tulokset.

Kumulatiivinen meta-analyysi.

Kumulatiivinen analyysi yhdistys rs961253 CRC tehtiin kautta valikoima opintojen julkaisemiseen. Kuten kuviossa 1, taipumusta merkittävää yhteyttä näkyivät ajan kaikissa geneettisten mallien. Lisäksi 95% CI tuli yhä kapeampi keskenään kertyminen enemmän tietoja, mikä viittaa tarkkuus arvioiden oli vähitellen kasvatti jatkuvasti lisäämällä näyte.

(A) CA versus CC; (B) AA vs. CC; (C) hallitseva mallia; (D) lisäaineen malli.

Julkaisu bias.

Kuten heijastuu suppilo juoni ja Egger testi, ei julkaistu puolueellisuudesta genotyypin malleja CA versus CC ja AA vs. CC ja hallitseva malli (

P

varten Egger testi = 0,269, 0,198 ja 0,187, tässä järjestyksessä), kun taas niukasti merkittävä julkaisu bias nähtiin lisäainetta mallissa (

P

varten Egger testi = 0,047). Sitten leikata-ja-täyttö menetelmä toteutettiin alle random-vaikutus malli. Tästä huolimatta ei leikkaus suoritettiin ja yhdistettiin arvio pysyi muuttumattomana, mikä osoittaa meidän tulos oli tilastollisesti varmana.

Keskustelu

Tässä tutkimuksessa, löysimme Merkitsevä yhteys rs961253 ja peräsuolen syövän Kiinan väestön . Myös seuraavia meta-analyysi yhdistämistä tietoja nykyisestä ja 16 aiemmin julkaistu tutkimukset osoittivat merkittävää yhdistys rs961253 CRC alle genotyypin, hallitseva ja lisäaine malleja. Kumulatiivinen analyysi vahvistaa vielä merkittävät yhdistys, joka osoittaa vaikutus -versio progressiivisesti merkittävä jokaisen kertymistä enemmän dataa ajan. Parhaiten Tietääksemme tämä meta-analyysi ensinnäkin yhteenlaskettu julkaistu GWA tutkimuksia ja replikointi tutkimuksia heijastamaan tarkkuus vaikutus rs961253 CRC riskiä.

rs961253 sijaitsee 20p12.3, alueella vailla geenien tai ennustettu proteiini-koodaus selostukset. Kuitenkin, BMP2 kartat 342 kb telomeerisesti tässä lokuksessa [5], joka on yksi initiaattoreita BMP signaloinnin sitoutumalla sen vastaavan reseptoreihin. BMP signalointi voi estää Wnt polku tasapuolisesti valvonta suoliston kantasolun itseuudistumisen [34]. Kuten näkyy aikaisemmista tutkimuksista, mutaatiot BMP koulutusjakson on kuvattu Nuorilla polypoosin [35], perinnöllinen oireyhtymä, joka altistaa CRC. Äskettäin tuumorisuppressiogeeneksi rooli BMP signalointi on perustettu, ja BMP polku on inaktivoitu jopa 70% satunnaista CRC [36]. Tarkastelee kaikkia näitä tietoja, vaikka mitään toimintoa raportti koskee sen rs961253, se on arveltu, että tämä lokus saattaa muuttaa BMP signalointi transduktio vaikutus BMP2 ja siten vaikuttaa CRC esiintyvyys [37]. Kuitenkin kun ensimmäinen GWA koskeneessa tutkimuksessa rs961253, seurannasta toistot ovat tuottaneet ristiriitaisia ​​tuloksia.

Tässä tutkimuksessa tietomme Kiinan väestö osoitti, että lisääntynyt riski oli merkitsevästi yhteydessä CA genotyypin verrattuna CC genotyyppi, ja vastaavat merkittävää suhdetta säilytetään hallitseva ja lisäaine malleja. AA-genotyyppi, johtuen alhaisesta tiheydestä väestö, emme onnistuneet arvioimaan sen tarkkaa vaikutusta. Seuraavat meta-analyysi, mukaan lukien 29859 tapaukset ja 29696 valvonta, tarjosi 100% teholla arvioimiseksi yhdistyksen välillä rs961253 ja CRC. Tulokset osoittivat, että kaikki geneettiset mallit siirrettävä huomattava kohonnut CRC. Kuitenkin, vaikka oli selvää näyttöä Tutkimusten välisten heterogeenisuus lisäaineen malleja, heterogeenisyys oli täysin selitettävissä etnistä tutkimusväestöstä tuloksen mukaan meta-regressioanalyysi. Sitten kerrostunut analyysin etnisyys tehtiin. Eurooppalaisessa väestön heterogeenisuus poistettiin, ja kaikki geneettiset mallit variantti alleeli oli vielä merkitsevästi liittyy suurentunut riski, kun taas kaikki geneettiset mallit Aasian myös siirrettävä lisääntynyt riski ilman näyttöä heterogeenisyys lukuun ottamatta AA genotyypin mallia. Sen jälkeen kun vertaa mies /nainen suhde, keski-ikä ja MAF riskin alleelin, ei ollut merkittäviä havainto Aasian ja Euroopan välinen paitsi MAF riskin alleelin. Siksi varianssi AA genotyypin vaikutus Euroopan ja Aasian voivat jakaa eri etnisen taustan ominaista alleelin taajuusero, jossa yhdistettiin alleelin taajuuksilla 35,4% Euroopan ja 8,1% Aasian. Lisäksi syrjäisimpien alueiden geneettisten mallien Aasian olivat kaikki suuremmat kuin Euroopan. Kun otetaan huomioon käänteinen suhde alleelin taajuus ja vaikutus koko perustuu puhdistava valinta [38], ehdotimme, että rs961253 variantti saattaa olla suurempi vaikutus Aasian kuin Euroopan.

Alkuperä heijastui myös tärkein alkuperä heterogeenisyys herkkyysanalyysissä osoittamalla, että heterogeenisuuden aste aleni, jolle ei Yhdessä tutkimuksessa Aasian. Lisäksi yksikään tutkimus vaikuttanut yleinen syrjäisimpien alueiden laadullisesti kaikkien geneettisten mallien, mikä viittaa erittäin vakautta nykyiset tulokset. Kumulatiivinen analyysi tarjotaan lisätukea nykyiseen tuloksia, mikä osoittaa, että koska kertyminen enemmän tietojen ajallinen tarkkuus arvioiden jatkuvasti parannettu ja taipumuksen merkittävää yhteyttä oli yhä ilmeinen. Julkaisu bias myös kattavasti arvioitu tässä nykyisessä tutkimuksessa. Ei ole todisteita julkaisun bias löydettiin kaikista geneettisen malleissa lukuunottamatta lisäaineen mallia heijastuu suppilo juoni ja Egger testi. Olemme edelleen sovellettu trim-ja täyttö menetelmä säätää julkaistavaksi bias. Kuitenkin tulos osoitti, että meta-analyysin kanssa tai ilman trim-ja-täyttö menetelmä ei vetänyt erilainen vaikutus arvio. Yhdessä tulokset tämän meta-analyysi ovat ääntä ja luotettavia.

Huolimatta selkeä vahvuus nykyisen tutkimus saadaan riittävästi virtaa, joitakin rajoituksia olisi käsiteltävä. CRC on monimutkainen piirre aiheuttama Sekä geneettiset ja ympäristötekijät; kuitenkin puuttuu ympäristön tietojen rajoittanut lisäarviointia geenien ympäristön vuorovaikutus. Vaikka assosiaatio rs961253 ja CRC on vahvistettu tässä tutkimuksessa, onko tämä SNP on syy edelleen epäselvä.

Yhteenvetona tulokset Tutkimuksemme Kiinan väestön ja meta-analyysi yhdistämällä eri etnisyys tarjosi enemmän tarkka kuvaus roolista rs961253 CRC alttius, mikä viittaa siihen, että variantti rs961253 liittyi suurentunut CRC, ja muunnelma voi tuotti suuremman vaikutuksen aasialaiset kuin eurooppalaiset. Kuitenkin hieno-kartoitus 20p12.3 alueen tai funktioanalyysivalikko olisi asetettava tunnistaa syy-variantti.

tukeminen Information

Kuva S1.

Vuokaavio tutkimuksen valintaan.

doi: 10,1371 /journal.pone.0034625.s001

(TIF) B Kuva S2.

yhdistetyt taajuus alleelin Euroopan ja Aasian valvontaa.

doi: 10,1371 /journal.pone.0034625.s002

(TIF) B Taulukko S1.

ominaisuudet sisältyvät tutkimukset meta-analyysi yhdistys rs961253 CRC.

doi: 10,1371 /journal.pone.0034625.s003

(DOC)

tarkistuslista S1.

PRISMA tarkistuslista.

doi: 10,1371 /journal.pone.0034625.s004

(DOC) B