PLoS ONE: BRAF, PIK3CA, ja HER2 onkogeeninen Muutokset mukaan KRAS mutaatiostatusta Advanced kolorektaalisyövissä kaukaisiin Metastasis
tiivistelmä
Background
Anti-EGFR-vasta-pohjainen hoito on tärkeä terapeuttinen edistyneeseen peräsuolen syöpä (CRC); tästä huolimatta, useita mutaatioita, mukaan lukien
KRAS
,
BRAF
, ja
PIK3CA
mutaatioita, ja
HER2
vahvistus-jotka liittyvät mekanismeista resistenssin kehittyminen anti-EGFR hoitoa. Tutkimuksen tarkoituksena oli selvittää taajuudet ja kliininen merkitys näiden geneettisten muutosten kehittynyt CRC.
Methods
KRAS
,
BRAF
, ja
PIK3CA
mutaatioita määritettiin Cobas reaaliaikainen polymeraasiketjureaktio (PCR) in 191 kehittyneitä CRC potilaalla on kaukainen etäpesäke. Mikrosatelliitti epävakaus (MSI) asema määritettiin hajanaisuus määrityksen ja
HER2
vahvistusta arvioitiin hopea in situ -hybridisaatio. Lisäksi
KRAS
mutaatioita tutkittiin Sangerin sekvensoinnin menetelmä 97 191 CRC tapauksista.
Tulokset
Mutaatiot
KRAS
,
BRAF
, ja
PIK3CA
havaittiin 104 (54,5%), 6 (3,1%), ja 25 (13,1%) tapauksessa kehittyneen CRC, vastaavasti. MSI-korkea asema ja
HER2
vahvistus havaittiin 3 (1,6%) ja 16 (8,4%) tapauksista, vastaavasti.
PIK3CA
mutaatioita useammin löytyy
KRAS
mutantin tyyppi (18,3%) kuin
KRAS
villityypin (6,9%) (
P
= 0,020 ). Sen sijaan
HER2
monistukset ja
BRAF
mutaatioita liittyivät
KRAS
villityypin rajatilaisesta merkitystä (
P
= 0,052 ja 0,094, tässä järjestyksessä) . Yhdistetyssä analyysit
KRAS
,
BRAF
ja
HER2
tila,
BRAF
mutaatioita tai
HER2
tiomonistukset liittyvä pahin ennusteen villityyppisen
KRAS
ryhmä (
P
= 0,004). Verrattaessa tehoa havaitsemismenetelmät, tulokset reaaliajassa PCR-analyysi paljasti 56 97 (57,7%), CRC tapauksissa
KRAS
mutaatioita, kun taas Sanger sekvensointi paljasti 49 tapauksessa (50,5%).
Johtopäätökset
KRAS
mutaatioita löydettiin 54,5% kehittyneiden CRC potilaista. Tuloksemme tuki subgrouping käyttämällä
PIK3CA
ja
BRAF
mutaation tai
HER2
vahvistus tila, lisäksi
KRAS
mutaatiostatus, on hyödyllistä hallintaan kehittynyt CRC potilaista.
Citation: Nam SK, Yun S, Koh J, Kwak Y, Seo AN, Park KU, et al. (2016)
BRAF
,
PIK3CA
, ja
HER2
onkogeeninen muutostyöt mukaan
KRAS
mutaatiostatusta Advanced kolorektaalisyövissä kanssa etäpesäkkeiden. PLoS ONE 11 (3): e0151865. doi: 10,1371 /journal.pone.0151865
Editor: Wayne A. Phillips, Peter MacCallum Cancer Centre, AUSTRALIASSA
vastaanotettu: 3. joulukuuta 2015 Hyväksytty: 04 maaliskuu 2016; Julkaistu 18 maaliskuuta 2016
Copyright: © 2016 Nam et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.
Data Saatavuus: Kaikki asiaankuuluvat tietoa sisällä olevat tiedot tiedostoja.
Rahoitus: Tämä tutkimus tukivat myöntämisestä Korea Health Technology R Welfare, Korean tasavalta (lupanumeroon: HI14C1813, https://www.khidi.or.kr/eps). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.
Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.
Johdanto
peräsuolen syöpä (CRC) on kolmanneksi yleisin syöpä ja esiintyvyys CRC kasvaa edelleen maailmanlaajuisesti vuosittain. Huolimatta varhaisen havaitsemisen ja terapeuttinen kehittyessä alueellisia tai kaukaisia etäpesäkkeitä osuus on lähes 50% vasta diagnosoitu CRC potilaille ja yleinen eloonjäämislukuja kehittyneiden CRC potilaista edelleen epätyydyttävä. Viimeaikainen tunnistaminen molekyyligenetiikan on mahdollistanut huomattavia edistysaskeleita potilaiden hoitoon kehittyneitä CRC. Kehittäminen kohdennettujen hoitomuotojen suunnattu spesifisiä mutaatioita, kuten
kasvutekijän reseptorin (EGFR) B tyrosiinikinaasigeeniä on parantunut hoidon tehokkuutta ja kliinistä tulosta kehittyneiden CRC potilailla [1-4]. Kuitenkin CRC ovat molekyylirakennetta heterogeenisiä kasvaimia että satama eri geenin muutoksia mukaan lukien mutaatiot
KRAS
,
BRAF
, ja
PIK3CA
sekä
HER2
vahvistusta; Monilla potilailla nämä mutaatiot siis kokemaan vastustuskykyä EGFR huumeiden ja on huono ennuste [2,3,5,6]. Sen vuoksi on tärkeää tutkia molekyylimekanismi taustalla vaste ja kestävyys EGFR-hoidon pitkälle CRC.
KRAS
mutaatioita, joita yleisesti havaitaan noin 40% CRC tapauksista , arvellaan liittyvän vastustuskyvyn EGFR hoidon CRC. Arviointi
KRAS
mutaatioita on siten välttämätöntä ennen käyttöä EGFR huumeiden valita potilaille, jotka saattavat hyötyä anti-EGFR hoitojen [7,8]. Lisäksi viimeaikaiset tutkimukset osoittavat, että ylimääräinen geenimutaatioita kuten
BRAF
mutaatioita,
PIK3CA
mutaatioita, ja
HER2
vahvistus on sekaantunut vastustuskykyä EGFR-kohdennettuja lääkkeitä CRC potilaille villin tyypin
KRAS
[5,9].
BRAF
, joka on jäsenenä RAF perhe, on tärkeä rooli MAP kinaasi /ERK-signalointireitistä [10]. Monet aikaisemmat tutkimukset ovat osoittaneet, että mutaatiot
BRAF
ovat biomarkkeri huonon ennusteen kehittynyt CRC. Lisäksi
BRAF
mutantti kasvaimia osoittavat huono vaste anti-EGFR hoito, etenkin CRC potilailla, joilla on villin tyypin
KRAS
[5,11].
PIK3CA
on mutatoitunut eri ihmisen syövissä; CRC, se on mutatoitunut noin 20%: ssa tapauksista. Nykyisin potilaat kätkeminen
PIK3CA
mutaatiot eksonissa 20 eikä mutaatiot
KRAS
voivat näyttää vastustuskykyä EGFR hoitoa. Lisäksi
PIK3CA
mutaatiot eksonin 9 ja KRAS mutaatioita yleensä löydy yhdessä [3,12]. Lopuksi
HER2
monistukset esiintyy pieni määrä CRC, ja muutamat tutkimukset ovat raportoineet yhdistyksen välillä
HER2
vahvistusta ja huono vaste anti-EGFR lääkkeet [13].
näistä edellinen havaintojen tieto taajuuksista ja kliininen merkitys näiden geneettisten muutosten Korean potilailla on edelleen rajallista. Esillä olevassa tutkimuksessa arvioimme esiintyvyys näiden geneettisiä muutoksia potilailla, joiden CRC, ja arvioi suhde näiden geneettisten muutosten kanssa kliinis tekijät ja potilaiden tulosta. Lisäksi vertasimme tehoa käyttäen Cobas reaaliaikainen polymeraasiketjureaktio (PCR) testit, jotka käyttää Sangerin sekvensointia testejä havaitsemismenetelmiä varten
KRAS
mutaatioita.
Materiaalit ja menetelmät
potilaiden ja kudosnäytteiden
yhteensä 191 kehittyneitä CRC potilaalla on synkronoitu tai metachronous kaukaisia etäpesäkkeitä, joille tehtiin kirurginen hoito Seoul National University Bundang Hospital vuosien 2003 ja 2009 otettiin tässä tutkimuksessa. Kaikkia potilaita hoidettiin resektioleikkaukselle ensisijaisen CRC on alustavan diagnoosin ja etäpesäkkeiden resekoituun havaittaessa. Kukaan potilaista hoidettiin ennen leikkausta kemo- tai sädehoitoa. Ennusteeseen viittaavia tietoja ja seurata tietoja saatiin potilasasiakirjamerkinnöistä ja patologian raportteja. Kokonaiselinaika (OS) laskettiin sen päivämäärän leikkauksen ja kuolinpäivä.
histopatologia ja luokittelu kasvaimia määritettiin mukaan WHO: n luokituksen. Käyttö potilaskertomuksen tietojen ja kudosnäytteiden Tutkimuksen hyväksyi Institutional Review Board of Seoul National University Bundang Hospital (viite: B-1210 /174-301). Kaikki näytteet ja potilaskertomuksen tietoja anonymisoidaan ennen käyttöä tässä tutkimuksessa ja osallistujat eivät antaneet kirjallisen tietoon perustuvan suostumuksen. Institutionaalinen Review Board luopua tarvetta kirjallinen suostumus olosuhteessa nimettömäksi ja ilman ylimääräisiä intervention osallistujille.
KRAS
,
BRAF
, ja
PIK3CA
mutaatio analyyseistä reaaliaikainen PCR-testi
Kasvaimen kerättiin kirurginen resektio yksilöitä ensisijaisen CRC. Hematoksyliini- Eosiini (HE) värjätään liukuu tarkisti patologi (H.S.L). Kasvaimen alueet identifioitiin ja mikroskooppisesti leikeltiin enemmän kuin 1 x 1 cm: n alueelle, joka koostui yli 60% tuumorisoluja. Yksi tai kaksi 8-pm paksu formaliinilla kiinnitetyt, parafiiniin upotettuja (FFPE) kasvainkudossektioista poistettiin parafiini ksyleenillä, 5 minuuttia huoneenlämmössä (RT), kuivattu absoluuttista alkoholia 5 min RT: ssä, ja niiden annettiin kuivua ilmassa täydellisesti 10 min. DNA eristettiin käyttäen Cobas DNA Sample Preparation Kit (Roche, Branchburg, NJ, USA) ja sama valmiste protokollaa kaikille Cobas mutaation sarjat käytettiin tässä tutkimuksessa. Pitoisuus eristetty DNA mitattiin käyttäen NanoDrop UV-spektrofotometrillä (Thermo Fisher Scientific, Wilmington, DE, USA) ja DNA laimennettiin DNA-näytelaimentimella päässä Cobas 4800 Mutation Test Kit (Roche) ja optimaalinen pitoisuus kullekin geenille (
KRAS
4 ng /ul,
BRAF
5 ng /ul, ja
PIK3CA
2 ng /ul). Vahvistusta ja tunnistus suoritettiin Automated Cobas X480 analysaattorin väline. Reaaliaikaisen PCR-testi voisi havaita kodonissa 12, 13, ja 61
KRAS
mutaatio, V600E
BRAF
mutaatio, ja eksoni 1, 4, 7, 9, ja 20
PIK3CA
mutaatio.
KRAS
mutaation analyysi käyttäen Sangerin sekvensointia menetelmä
Kasvaimen kerättiin sama ensisijainen CRC yksilöitä, jotka olivat käytetään reaa- PCR testejä. Kaikki näytteet microdissected käsin ja 60% näytteestä alueen osoitettiin sisältävän kasvainsolujen arvioituna H suhde laskettiin uudelleen näiden tulosten perusteella.
mikrosatelliittien epävakaus (MSI) analyysi
Osiot valmistettiin FFPE kudosnäytteistä ja hematoksyliinillä ja eosiinilla värjättyjen objektilasit arvioitiin tunnistamaan edustava kasvaimen alueelle ja normaali alue kussakin osassa. Nämä valitut alueet microdissected. MSI-analyysi suoritettiin, kuten aiemmin on kuvattu [16,17]. Lyhyesti, MSI tila määritettiin analysoimalla viisi microsatellite loci (BAT-26, BAT-25, D5S346, D17S250, ja S2S123) käyttämällä DNA automaattista sekvensseri (ABI 3731 geneettinen analysaattorin, Applied Biosystems, Foster City, CA). Mukaan Bethesda ohjeen MSI, kasvaimet luokiteltiin MSI-H, kun ainakin kaksi viidestä merkkiaineiden näkyvissä uusia bändejä, MSI-L, jolloin ylimääräinen alleelit havaittiin yksi viidestä markkereita, ja MSS kun kaikki mikrosatelliittimarkkerin tutkitut näkyvissä identtisiä malleja sekä kasvaimen ja normaaleissa kudoksissa.
tilastollinen
Tilastolliset analyysit tehtiin SPSS Statistics 18 ohjelmistopaketti (Chicago, IL, USA). Assosiaatio ennusteeseen viittaavia parametreja ja geneettisiä muutoksia analysoitiin käyttämällä Chi-square test tai Fisherin testiä. Chi-neliö testi suoritettiin vain, jos vähintään 80% soluista on odotettu taajuus on 5 tai suurempi, eikä solu on odotettu taajuus pienempi kuin 1,0. Jos ei, Fisherin testiä käytettiin. Ikä käsiteltiin jatkuvana muuttujana ja verrattiin käyttämällä riippumattomien T testi takia p 0,05 Shapiro-Wilk normaaliuden testi. Kaplan-Meier selviytymisen käyrät piirrettiin, ja tilastollisesti merkitseviä eroja eloonjäämiskäyrien analysoitiin käyttäen log-rank-testi. Monimuuttuja selviytyminen analyysi käyttäen Coxin suhteellisten riskien mallia toteutettiin mutaatiostatuksesta, iästä, ja vaihe alkudiagnoosin. Riskisuhde (HR) ja sen 95%: n luottamusväli (CI) arvioitiin. Kaikissa tapauksissa,
P
-arvot olivat alle 0,05 pidettiin tilastollisesti merkittävänä.
Tulokset
Patient ominaisuudet
viittaavia tekijöitä potilaista on esitetty yhteenvetona S1 Taulukko. Potilaat koostui 103 miestä (53,9%) ja 88 naista (46,1%), ja iän mediaani 60 vuotta (vaihteluväli: 28-93 vuotta). Niistä 191 tapauksessa 49 (25,7%) kasvaimia sijaitsee oikealla paksusuolessa, 71 (37,2%) kasvaimia vasemmassa paksusuolessa, ja 71 (37,2%) kasvaimia peräsuolessa. Mitä histologiset erilaistumista luokalla, 165 (86,4%) kasvaimet olivat huono laatu, ja 26 (13,6%) kasvaimet olivat korkealaatuista. Mitä hoitoja, 176 (92,1%) potilasta sai 5-fluorourasiilin (5-FU) -pohjaisen adjuvanttihoitoa tai ilman anti-EGFR hoito (setuksimabista) jälkeen poistettu kirurgisella; 150 (85,2%) potilasta sai 5-FU kemoterapian vain; ja 26 (14,8%) potilasta sai 5-FU anti-EGFR huumeita.
geneettiset muutokset liittyvät EGFR signalointireitin kehittyneissä CRC
Kaikki perustiedot on esitetty S2 taulukossa. Kasvaimen tutkituissa tapauksissa, 87 (45,5%) oli villityypin
KRAS
ja 104 (54,5%) oli
KRAS
mutaatioita. Niistä kasvainten
KRAS
mutaatioita, mutaatiot kodonissa 12 tai 13 havaittiin 97 (93,3%), kun taas mutaatiot kodonissa 61 havaittiin 7 (6,7%) potilaista.
BRAF
(V600E) mutaatioita havaittiin 6 (3,1%) kasvaimissa.
PIK3CA
mutaatioita tunnistettiin 25 (13,1%) kasvaimissa. Kaksi yleisintä
PIK3CA
mutaatioita sijaitsivat eksonissa 9 (17 tapausta, 68,0%) ja eksonin 20 (5 tapausta, 20,0%). Muita harvinaisia mutaatioita sijaitsivat eksonit 1 ja 4 (2 tapausta, 8,0%). Yksi tapaus kanna
PIK3CA
eksonin 4 mutaatio sekä
PIK3CA
eksoni 9 mutaatio. SISH analyysi osoitti
HER2
geenivahvistus 16 (8,4%) kasvaimia. Kolme tapausta Kohortin olivat MSI-H (1,6%), ja loput 188 (98,4%) tapauksista luokiteltiin MSS /MSI-L.
Out of 104
KRAS
mutantti tyyppi CRC tapauksissa, 23 (22,1%) oli
PIK3CA
mutaatioita,
HER2
monistuksia, tai
BRAF
mutaatiota (taulukko 1). Kahdeksantoista tapaukset osoittivat
PIK3CA
mutaatio, 4 tapausta osoitti
HER2
vahvistus, yhdessä tapauksessa oli kummankin
BRAF
ja
PIK3CA
mutaatioita, ja yhdessä tapauksessa oli kummankin
PIK3CA
mutaatio ja
HER2
vahvistusta. Out of 87
KRAS
villityypin CRC,
BRAF
mutaatioita,
PIK3CA
mutaatioita, ja
HER2
tiomonistukset löydettiin 5 (5,7%), 6 (6,9%), ja 11 (12,6%) tapauksista, vastaavasti; Kaiken 21 87
KRAS
villityypin tapauksessa (24,1%) oli
BRAF
mutaatioita,
PIK3CA
mutaatioita tai
HER2
monistuksissa.
Mielenkiintoista, läsnäolo
PIK3CA
mutaatioita oli merkitsevästi yhteydessä läsnäolo
KRAS
mutaatioita (
P
= 0,020; taulukko 2). Mutaatiot
KRAS
ja
BRAF
olivat lähes toisensa poissulkevia; kuitenkin yhdessä tapauksessa kanna samanaikaisesti
KRAS
ja
BRAF
mutaatioita.
HER2
monistukset ja
BRAF
mutaatioita oli taipumus useammin havaittavissa
KRAS
villityypin kasvaimia kuin
KRAS
mutantti tyyppi kasvainten rajatilaisesta tilastollista merkittävyyttä (
P
= 0,052 ja
P
= 0,094, tässä järjestyksessä). MSI tila ei osoittanut mitään yhteyttä näihin geneettisiin muutoksiin tässä kohortissa.
Association geneettisiä muutoksia kanssa viittaavia tekijöitä
Taulukko 3 osoittaa suhdetta geneettiset muutokset ja ennusteeseen viittaavia ominaisuuksia.
KRAS
mutantti kasvaimet olivat todennäköisesti sijoitetaan oikeaan paksusuolessa (
P
= 0,021). Nämä kasvaimet olivat liittyy myös huonolaatuisen histologia (
P
= 0,029).
BRAF
mutantti kasvainten liittyivät merkittävästi T4 syvyys invaasio (
P
= 0,033). Vaikka se ei saavuttanut tilastollista merkittävyyttä,
BRAF
mutantti kasvaimet sijaitsivat yleensä oikeassa paksusuolessa (
P
= 0,127) ja saada imusuonten invaasiota (
P
= 0,097) verrattuna samaan ominaisuudet
BRAF
villityypin kasvaimia. Kasvaimista
HER2
tiomonistukset korreloi merkitsevästi distaalinen sijainti (
P
= 0,006).
HER2
monistuksissa osoitti myös yhdessä nuorempi, mutta tämä ero ei ollut tilastollisesti merkitsevä (
P
= 0,081). Ei ollut muita merkittäviä assosiaatioita
PIK3CA
mutaatioiden tai MSI asema ennusteeseen viittaavia tekijöitä.
Prognostic merkitystä geneettisiä muutoksia
määrittämiseksi ennustetekijöiden merkitystä näiden geneettisten muutokset, selviytyminen analyysit suoritettiin käyttäen Kaplan-Meierin menetelmän OS (kuvio 1). Seuranta dataa kaikista 191 CRC potilasta osallistui selviytymisen analyysiin. Oli 84 CRC liittyviä kuolemantapauksia, ja mediaani seuranta aika oli 37,9 kuukautta (alue, +0,8-104,6kuukausi). Potilaat, joilla on
BRAF
mutaatioita osoitti taipumusta epäsuotuisa lopputulos OS, mutta tämä tulos ei ollut tilastollisesti merkitsevä (
P
= 0,081).
KRAS
mutaatioita,
PIK3CA
mutaatioita,
HER2
monistuksia, ja MSI tila ei osoittanut mitään yhteyttä potilaiden OS (
P
= 0,993
P
= 0,538,
P
= 0,368, ja
P
= 0,538, tässä järjestyksessä). Mutaatio
KRAS
kodonin 61 oli taipumus liittyä lyhyempi kokonaiselinaika, mutta se ei ollut tilastollisesti merkitsevä (
P
= 0,554).
Kaplan-Meier selviytymisen arvio kuvaajat kokonaiselinaika (OS) in 191 kehittyneet CRC potilaat mukaan
KRAS
mutaatioita asema (a), sijainnit
KRAS
mutaatioita kehittynyt CRC potilaalla (b),
BRAF
mutaatiot (c),
PIK3CA
mutaatioita (d),
HER2
monistukset (e), ja MSI tila (f).
Mielenkiintoista on, että
KRAS
villityypin alaryhmän kanssa
BRAF
mutaatioita tai
HER2
monistuksissa osoitti pahin ennusteen yhdistettyjen analyysien avulla (
P
= 0,004; Kuva 2A). Käyttämällä Coxin suhteellisten riskien mallia, tämä alaryhmä oli huono ennustetekijä (HR, 2,055, CI, 1,093-3,861;
P
= 0,025) riippumatta ikä ja vaihe alkudiagnoosin (S3 taulukko). Niistä 191 kehittynyt CRC, 165 potilasta ei hoidettu anti-EGFR lääkkeet potilaita, joille
KRAS
villityypin alaryhmän kanssa
BRAF
tai
HER2
muutoksia myös osoitti huonoin prognoosi (
P
= 0,012; Kuva 2B). Käyttämällä Coxin suhteellisten riskien mallia, tämä alaryhmä oli huono ennustetekijä rajatilaisesta tilastollista merkittävyyttä (HR, 1,984, CI, 0,963-4,085;
P
= 0,063; tuloksia ei ole esitetty). Kuitenkin 26 hoidetuilla potilailla 5-FU anti-EGFR lääkkeet,
KRAS
villityypin alaryhmän kanssa
BRAF
tai
HER2
muutoksiin ei liittynyt huonoon ennusteeseen (
P
= 0,305, tuloksia ei ole esitetty), joka voi olla, koska pieni määrä tapauksia.
KRAS
villityypin alaryhmä,
BRAF
tai
HER2
muutoksiin liittyi korkealaatuista histologisia erilaistuminen, pitkälle, imusuonten invaasio ja hermoa invaasio, mutta raja tilastollinen merkitys (S4 taulukko).
tulokset yhdistetään analyysin pitkälle CRC potilailla, joilla on
KRAS
villityypin alaryhmän mukaan
BRAF
mutaatio ja
HER2
vahvistus riippumatta anti-EGFR hoidon tila (n = 191) (a), johon ei ole käsitelty anti-EGFR-lääkkeet (n = 165) (b).
vertailu Cobas real- PCR ja Sanger sekvensointi menetelmiä
KRAS
mutaatioita
191 CRC näytteistä, kudoksiin 97 potilasta oli käytettävissä analyysia verrata havaitsemiseksi
KRAS
mutaatioita kanssa Sanger sekvensointi testi ja Cobas reaaliaikaisen PCR-testissä. Niistä 97 kasvainten mukana,
KRAS
mutaatioita havaittiin 49 tapauksessa (50,5%) Sangerin sekvensoinnilla testi. Mutaatiot
KRAS
kodonissa 12 tai 13 ja
KRAS
kodonissa 61 havaittiin 47 (48,5%) ja 2 (2,1%) tapauksista, vastaavasti. Toisaalta, 56 tapauksessa (57,7%) on
KRAS
mutaatioita havaittiin reaaliaikaisen PCR-testi; Testin sijaitsevat 52 (53,6%) mutaatioita kodonissa 12 tai 13 ja 4 (4,1%) mutaatioita kodonissa 61. reaaliaikainen PCR-testi osoitti suurempi herkkyys kuin Sangerin sekvensoinnin testi.
Keskustelu
KRAS
on tunnettu kuljettaja onkogeenin CRC ja läsnäolo
KRAS
mutaatio ennustaa huono vastaus EGFR täsmähoitoihin metastasoitunutta CRC potilailla. Olemme arvioineet taajuudet ja clincopathologic merkitys mutaatioiden
KRAS
,
BRAF
, ja
PIK3CA
, ja
HER2
vahvistus, sekä suhdetta näiden geneettisten muutosten kehittynyt CRC potilailla, jotka olivat ehdolla EGFR hoitoa päivittäin käytännössä. Mutaatiot
KRAS
,
BRAF
, ja
PIK3CA
havaittiin 104 (54,5%), 6 (3,1%), ja 25 (13,1%) tapauksista kehittyneiden CRC, vastaavasti. Lisäksi MSI-H fenotyyppi ja
HER2
vahvistus havaittiin 3 (1,6%) ja 16 (8,4%) tapauksista, vastaavasti.
kehitys kohdennettujen hoitomuotojen määrätyiltä molekyyli muutoksia on osaltaan hallintaan kehittyneitä CRC potilaiden, ja anti-EGFR huumeita käytetään näillä potilailla. Vaikka läsnäolo
KRAS
mutaatio on hyödyllinen jättää potilaille, jotka eivät hyödy EGFR hoitoa, monet potilaat villin tyypin
KRAS
CRC osoittavat negatiivisia vastauksia tähän hoitoon. Toistaiseksi katsotaan, että
BRAF
mutaatioita,
PIK3CA
mutaatioita, ja
HER2
monistusta liittyvät mekanismit näiden köyhien vastauksista [4,5]. Meidän kohortti, 16 87
KRAS
villityypin tapauksessa (18,4%) oli
BRAF
mutaatioita tai
HER2
monistuksissa; Lisäksi yhdistetty analyysi osoitti, että
KRAS
villityypin potilaalla on
BRAF
mutaatioita tai
HER2
monistuksissa oli pahin ennuste. Koska kohdennetut hoitomuotoja
BRAF
mutaatioita ja
HER2
monistuksissa merkittäviä eloonjäämishyötyä erilaisissa ihmisen syövissä [10,18,19], hoito anti-BRAF ja anti-HER2 aineet voivat olla hyvä terapeuttinen strategia parantaa hengissä CRC potilailla, joilla on villin tyypin
KRAS
kätkeminen
BRAF
mutaatioita tai
HER2
monistukset ja joilla on myös ensisijaisen tai toissijaisen vastustuskykyä EGFR käsittely.
Vaikka pieni määrä kasvainten
PIK3CA
mutaatioita meidän kohortin huomasimme, että
PIK3CA
mutaatioita pitkälti päällekkäin
KRAS
mutaatioita, joka oli yhdenmukainen aiempien tutkimusten Euroopan [20] ja japani [21] CRC sairastavilla potilailla etäpesäkkeitä. Tällä hetkellä useat estäjät kohdistaminen
PIK3CA
signalointireitin on kehitetty, ja nämä aineet testataan prekliinisissä ja kliinisissä kokeissa potilailla, joilla on CRC [22-24]. Ottaen huomioon tuloksemme ja aikaisemmat tutkimukset [20,21], että
KRAS
mutaatiot usein rinnakkain kanssa
PIK3CA
mutaatioita, estämällä
PIK3CA
signalointireitin saattaisi olla käyttökelpoinen terapeuttinen strategia hoitoon CRC potilaalla on
KRAS
mutaatioita.
Kaiken kaikkiaan 24 191 tapausta (12,6%) oli kaksi tai useampia onkogeenisten muutoksia tässä tutkimuksessa. Se voidaan tulkita niin, että nämä geneettiset muutokset esiintyvät samanaikaisesti samassa kasvain, mutta se voi johtua kasvaimen heterogeenisuus. Aikana syövän etenemiseen, onkogeeninen muutoksia kehittyä jatkoklooni, jotka edistävät syövän etäpesäkkeiden ja lääkeresistenssin. Käytimme herkempi havaitsemismenetelmiä, mikä mutaatioiden vähäiset tuumorisolupopulaatioon voitu havaita. Hallinnassa CRC potilailla, herkkä molekyyli diagnoosi on hyödyllistä havaita pieniä kasvaimia synnyttävän muutoksia, jotka voivat olla seuraava kohde kehittyneiden CRC potilailla, joilla on ensisijainen tai toissijainen vastustuskykyä ensilinjan kohdennettua hoitoa. Meidän kohortti, yhdessä tapauksessa kanna samanaikaisesti
KRAS
ja
BRAF
mutaatioita. On tunnettua, että
BRAF
mutaatiot ovat yleensä havaitaan
KRAS
villityypin kasvaimia, ja että ne ovat lähes sulkevat toisensa pois
KRAS
mutaatioita CRC. Useissa tutkimuksissa on raportoitu, että harvinaisissa tapauksissa Harbor yhdistetty
KRAS
ja
BRAF
mutaatioita, joita esiintyy alle 0,02% [25,26]. Vaikka tuumoribiologiassa ja ennusteen potilaita, joilla samanaikaisesti
KRAS
ja
BRAF
mutaatiot ovat olleet vielä epävarma, edellinen tutkimus viittaa siihen, että nämä samanaikainen mutaatiot liittyvät syövän etenemiseen kuten imusolmuke etäpesäke ja korkeampi T vaiheessa [25,27]. Edelleen laajoja tutkimuksia tarvitaan selvittämään ilmaantuvuutta ja biologinen toiminta samanaikaisen
KRAS
ja
BRAF
mutaatioita.
Aikaisemmat tutkimukset kehittyneitä CRC potilailla, joilla on etäpesäkkeitä raportoitu, että noin 34 ~ 45%: lla potilaista oli
KRAS
mutaatioita [20,21,28]. Tässä tutkimuksessa Korean CRC potilailla osoitti, että tiheys
KRAS
mutaatioita oli 54,5%, ja että nämä mutaatiot nähtiin lähinnä kodoneissa 12 tai 13 (93,3%). Taajuus
KRAS
mutaatiot tässä kohortissa oli hieman korkeampi kuin aiemmin julkaistu raporteissa metastaattisen CRC potilaista [20,21,28]. On olemassa useita mahdollisia selityksiä siihen. Ensin otettiin vain edistynyt CRC potilasta tässä kohortissa, mikä voi selittää korkeamman taajuuden
KRAS
mutaatioita. Toiseksi, oli joitakin eroja mutaation analyysimenetelmiä. Analysoimme mutaatio aseman käyttäen Cobas real-time PCR, jota pidetään osoittaa suuremman herkkyyden kuin muiden analyysimenetelmiä.
On raportoitu, että useimmat
KRAS
mutaatioita CRC potilailla esiintyy kodonissa 12 ja 13. Tämä tutkimus osoitti myös, että
KRAS
mutaatioita nähtiin lähinnä kodoneissa 12 tai 13 (93,3%). Meidän
KRAS
mutaatio Alaryhmäanalyysissa mutaatio
KRAS
kodonin 61 oli taipumus liittyä lyhyempi kokonaiselinaika, mutta se ei ollut tilastollisesti merkitsevä. Prognostisia vaikutus
KRAS
kodonin 61 mutaatiota on raportoitu useissa aiemmissa tutkimuksissa, joskin kiistelty tuloksia [29]. Koska esiintyvyys
KRAS
kodonissa 61 mutaatioiden on harvinainen, edelleen laajoja tutkimuksia voi auttaa selventämään suhde näiden mutaatioiden ja kliiniseen tulokseen.
mutaatiot
BRAF
ja
PIK3CA
havaittiin 3,1% ja 13,1%: ssa tapauksista, vastaavasti. Vaikka taajuuksien näiden mutaatioiden pidetään pienenä, ne olivat samanlaisia kuin aiempien tutkimusten kehittyneissä CRC [20,21,28]. Suostumuksella Edellisessä tutkimuksessa [30],
BRAF
mutaatiot liittyvät aggressiivinen CRC histologia, kuten korkeampi T vaiheessa ja esiintyminen imusuonten hyökkäystä. Vaikka tulokset eivät tilastollisesti merkitsevä, potilaat kätkeminen
BRAF
mutaatioita osoitti myös lyhyempiä OS.
arvioitiin kaksi havaitsemismenetelmät
KRAS
mutaatioita CRC näytteet: Cobas real -Aika PCR ja Sanger sekvensoinnilla. Siellä oli hyvä korrelaatio
KRAS
mutaation havaitsemista reaaliaikaisella PCR ja Sanger sekvensointi, ja reaaliaikainen PCR osoitti suurempi herkkyys kuin Sangerin sekvensoinnin. Meidän kohortti, 7 tapausta
KRAS
mutaatioita havaittiin reaaliaikaisen testiä, joita ei havaittu Sangerin sekvensoinnilla testi, nimenomaan 5 tapauksissa kodonissa 12 tai 13 ja 2 tapausta varten kodonissa 61. Sanger sekvensointi menetelmä, kehitettiin vuonna 1975, pidettiin yhtenä perus- mutaation havaitsemismenetelmät; kuitenkin, tämä menetelmä näyttää olevan rajoitetusti herkkyyttä alhainen mutanttialleelin voidaan havaita tällä menetelmällä [31]. Toisaalta, reaaliaikainen PCR-testi, kuten erilaisia kaupallisia pakkauksia pidetään erittäin herkkä menetelmä, joka osoittaa etuja havaitsemiseksi
KRAS
mutaatioita [32]. Tähän mennessä huomattava kasvaimeen heterogeenisyys molekyylitason muutoksia ja niiden kliinistä vaikutusta täsmähoitoihin on kuvattu erilaisissa kasvaimissa. CRC, useissa tutkimuksissa on raportoitu kliininen merkitys
KRAS
heterogeenisyys EGFR hoito [5,33,34]. Normanno et ai. ehdotti, että alhainen pitoisuus
KRAS
Mutanttialleelit oli riittävä tuottamaan resistenssin EGFR monoklonaalisia vasta-aineita, ja kynnys niiden tutkimuksessa oli 3 ~ 10% mutantin
KRAS
alleelin frekvenssi, joka oli epätodennäköistä voidaan havaita käyttämällä Sangerin sekvensointia [33]. Vaikka lisätutkimuksia tarvitaan vahvistaa nämä tulokset ja selkeyttää roolia molekyyli muutokset vastustuskykyä EGFR hoitoa, tarkka havaitseminen Näiden mutaatioiden on suuri kliininen merkitys.
Yhteenvetona huomasimme, että esiintyvyys
KRAS
mutaatioita oli 54,5% Korean kehittynyt CRC potilaita, mikä oli yleisempi kuin mitä on raportoitu muissa populaatioissa.
BRAF
mutaatioiden tai
HER2
monistukset todettiin 16,1%
KRAS
villityypin potilailla, ja lisäksi yhdistetty analyysi osoitti, että
KRAS
villityypin potilaalla on
BRAF
tai
HER2
monistuksissa oli pahin ennuste.
PIK3CA
mutaatiot useammin havaittiin
KRAS
mutantin tyyppi kuin villityypin
KRAS
CRC potilaille.