PLoS ONE: Association between PTEN Gene IVS4 polymorfismi ja syöpäriskin: Meta-analyysi

tiivistelmä

Background

fosfataasi ja tensin homologin (

PTEN

) on vakiintunut tuumorisuppressorigeeniä. Viime aikoina yhä tutkimuksissa selvitettiin yhdistyksen välillä

PTEN

IVS4 polymorfismi (rs3830675) ja riskien eri syöpien riskiä. Kuitenkin tulokset yksittäisistä tutkimuksista olivat kiistanalaisia. Tavoitteena meta-analyysi oli valottaa onko

PTEN

IVS4 polymorfismi oli yhteydessä syöpäriskiä.

Methods

Tietokannat kuten PubMed, Web tiedon ja Kiinan kansallisen Knowledge Infrastructure (CNKI) on systemaattisesti etsitään tunnistaa mahdollisesti oikeutettuja kirjallisuudessa. Kertoimet suhde (OR) ja niiden 95%: n luottamusväli (CI) arviointiin käytettiin vahvuus yhdistyksen välillä

PTEN

IVS4 polymorfismi ja syöpäriskiä.

Tulokset

yhteensä seitsemän tapausverrokkitutkimukset lopulta sisällytetty tähän meta-analyysiin. Yhdistetty analyysi viittasi siihen, että yksilöiden

PTEN

IVS4 (- /-) genotyyppi liittyi merkittävästi lisääntynyt riski syövän (OR = 1,45, 95% CI = 1,19-1,76, P 0,001) ja alaryhmä ruoansulatuskanavan suolikanavan syöpä (OR = 1,67, 95% CI = 1,28-2,18, P 0,001) verrattuna (+ /+) genotyyppi. Alleeli analyysi paljasti, että (-) alleeli oli merkitsevästi yhteydessä lisääntyneeseen syöpäriskiin (OR = 1,30, 95% CI = 1,12-1,50, p = 0,001) ja alaryhmä ruoansulatuskanavan syöpään (OR = 1,42, 95% CI = 1,16 -1,74, p = 0,001) verrattuna (+) alleeli. Ei merkittävää yhteyttä ei havaittu

PTEN

IVS4 (+/-) genotyypin ja syöpäriskiä.

Johtopäätös

PTEN

IVS4 (- /- ) genotyyppi oli merkittävästi liittyy lisääntynyt syöpäriskiä erityisesti ruoansulatuskanavan syöpään verrattuna (+ /+) genotyyppi. The (-) alleelin

PTEN

IVS4 (rs3830675) polymorfismi oli merkitsevästi liittyy lisääntynyt syöpäriskiä erityisesti ruoansulatuskanavan syöpään verrattuna (+) alleeli. Resessiivinen efektimalli ja hallitseva vaikutus malli osoitti myös merkitsevästi yhteydessä

PTEN

IVS4 (rs3830675) polymorfismi ja lisääntynyt syöpäriski erityisesti ruoansulatuskanavan syöpään. Edelleen laajamittainen ja hyvin suunniteltu tutkimuksia koskien eri etnisten ryhmien tarvitaan vielä tulosten varmistamiseksi meidän meta-analyysi.

Citation: Sun L, Liu J, Yuan Q, Xing C, Yuan Y (2014) Association välillä

PTEN

Gene IVS4 polymorfismi ja syöpäriskin: meta-analyysi. PLoS ONE 9 (6): e98851. doi: 10,1371 /journal.pone.0098851

Editor: Aamir Ahmad, Wayne State University School of Medicine, Yhdysvallat

vastaanotettu: 1. tammikuuta, 2014; Hyväksytty: 7. 2014; Julkaistu: 05 kesäkuu 2014

Copyright: © 2014 Sun et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus tukevat avustuksia National Basic Research Program of China (973 Program viitenro 2010CB529304), apurahat ja tieteen ja teknologian projekti Liaoningin maakunnassa (Ref No.2011225002) ja avustukset on Science and Technology Project Liaoningin maakunnassa ( viitenro 2012225016). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

maailmanlaajuinen syövän aiheuttamaa rasitetta kasvaa edelleen pitkälti noin 12,7 miljoonaa syöpätapausta ja 7,6 miljoonaa syöpään kuolee vuosittain maailmanlaajuisesti [1]. Karsinogeneesi on monivaiheinen ja monimutkainen prosessi vaikuttavat eri ympäristö- ja geneettiset tekijät. Kehittyvät todistusaineisto on osoittanut, että geenin polymorfismi on tärkeä rooli ero yksittäisten alttiuden syövän [2]. Tunnistaminen geenin polymorfismi, joka liittyy sen syöpäriskiä hyödyttäisi huomattavasti varhaisen ehkäisyn ja hoitoa syöpään.

fosfataasi ja tensin homologin (

PTEN

), vakiintunut tuumorisuppressorigeeniä, on kartoitettiin kromosomiin 10q23.3.

PTEN

geeni ulottuu 105 kb lukien yhdeksän eksonia ja kahdeksan intronit. 403 aminohapon PTEN-proteiinin on kaksi fosfataasi, joka toimii sekä seriini-treoniini ja tyrosiini sivustoja [3]. PTEN-proteiini sisältää kolme osaa: N-terminaalinen fosfataasin katalyyttisen domeenin, joka on C-terminaalinen C2-domeenin ja 50 aminohapon C-terminaalinen häntä, joka käsittää PDZ sitova motiivi ja CK2 fosforylaatiokohdat [4]. PTEN on mukana solukasvun säätelyssä, lisääntymistä, ja apoptoosin signaalitransduktioreitteihin ja osallistuu solusyklin [5], [6]. Koska ensimmäinen klooni 1997, somaattisten

PTEN

mutaatioita on laajasti raportoitu erityyppisiä syöpiä, mukaan lukien eturauhassyöpä, rintasyöpä, kohdun limakalvon syöpä ja niin edelleen [7] – [9]. Viime vuosina paljon huomiota on kiinnitettävä ituradan polymorfismi

PTEN

geeni.

PTEN

polymorfismien on raportoitu olevan mukana useita syöpiä, kuten rintasyövän [10], [11], mahasyöpä [12] ja paksusuolen syöpä [13].

PTEN

IVS4 polymorfismi (rs3830675) kanssa ATCTT insertio 109 emäsparia alavirtaan eksonin 4 intronissa 4 oli yksi yhteinen

PTEN

polymorfismit. Viimeksi lisääminen tutkimuksessa annettiin yhdistyksen välillä

PTEN

IVS4 polymorfismi (rs3830675) ja riskien eri syöpiin kuten rintasyövän [11], [14], peräsuolen syöpä [13], mahasyöpä [12] [15], ruokatorven syöpä [16] ja eturauhassyövän [17]. Kuitenkin tulokset yksittäisten tutkimukset olivat tuloksettomia. Esimerkiksi Canbay et ai. ehdotti, että

PTEN

IVS4 (- /-) genotyyppi liittyy lisääntynyt paksusuolen syövän riskiä [13]; mutta George et al. raportoi, että mitään merkittävää yhdistyksen välillä havaittiin

PTEN

IVS4 polymorfismin ja alttiutta eturauhassyövän [17].

Tähän asti ei meta-analyysi on suoritettu tutkimaan yhdistys

PTEN

IVS4 polymorfismi (rs3830675) ja alttius syövälle. Tutkitaan, onko

PTEN

IVS4 polymorfismi (rs3830675) liittyi riskejä syövän ja erityisten syövän alatyyppejä, suoritimme meta-analyysin yhteydestä

PTEN

IVS4 polymorfismi (rs3830675) ja syöpä vaara tässä tutkimuksessa.

Materiaalit ja menetelmät

tunnistaminen ja kelpoisuus Asiaa Studies

Sähköiset tietokannat Web of Science, PubMed ja Kiinan kansallisen Knowledge Infrastructure (CNKI) olivat systemaattisesti etsitään käyttäen erilaisia ​​yhdistelmiä hakusanojen mukaan lukien ”fosfataasi ja tensin homologin /PTEN”, ”polymorfismi /mutaatio /variantti” ja ”syöpä /kasvain /maligniteetti”. Vastaava Kiinan hakutermejä käytettiin etsittäessä Chinese tietokannasta. Siteeratut viitteet kussakin mukana kirjallisuudessa olivat edelleen etsitään manuaalisesti tunnistamaan mahdolliset käytettävissä oleviin tutkimuksiin. Jos tiedot annetaan kirjallisuudessa ollut riittävän selvä, kirjoittaja ottivat yhteyttä ylimääräisiä raakadataa. Kun päällekkäisiä tietoja on olemassa, vain tutkimuksessa täydellisempiä tietoja hyväksyttiin. Viimeinen haku päivämäärä oli 12 marraskuu 2013.

ja poissulkukriteereitä

Kaikki mukana tutkimuksissa on täytettävä seuraavat kriteerit: tapauskontrollitutkimuksessa; tutkimukset välistä assosiaatiota koskevaa

PTEN

geeni IVS4 polymorfismi (rs3830675) ja syöpäriskiä; julkaistuissa tutkimuksissa Englanti tai Kiinan; tutkimuksia riittävän raakadataa arviointiin kertoimet suhdeluvut (OR) ja niiden 95%: n luottamusväli (CI). Tärkeimmät syyt syrjäytymisen olivat: päällekkäiset tiedot; arvostelut; ei ole merkitystä syövän tai erityisiä polymorfismi; eläinkokeita; ei tapaus-verrokki suunniteltu; ei raakadataa jälkeenkin yhteyttä kirjailija.

Data Extraction

Kaksi tekijää (Liping Sun ja Jingwei Liu) itsenäisesti uutetaan tietoja mukana tutkimuksissa. Seuraavat tiedot on poimittu kunkin yksittäisen tutkimus: ensimmäinen kirjoittaja, julkaisuvuosi, etnisyys tutkituista väestöstä, syöpä tyyppi, määrä kunkin genotyypin tapauksissa ja valvontaa, genotyypitysmenetelmiä varten

PTEN

geeni IVS4 polymorfismi, lähde valvontaa. Ristiriita ratkaistiin jälkeen keskustelun ja konsensuksen lopulta päästiin kaikista poimitun datan.

Tilastollinen analyysi

Kaikki tilastollinen analyysi suoritettiin Stata ohjelmisto (versio 11,0; StataCorp, College Station, TX). Syrjäisimmillä alueilla ja niiden 95%: n luottamusväli arviointiin käytettiin vahvuus yhdistyksen välillä

PTEN

geenin polymorfismin ja syöpäriskiä. P-arvo 0,05 pidettiin tilastollisesti merkitsevä. Heterogeenisyys arvioitiin I-potenssiin (I

2) arvo ja käyttämällä Q tilastotieto (P 0,10 ehdottaa merkittävää heterogeenisyyttä tutkimusten välillä) [18]. Kun heterogeenisyys välillä tutkimuksissa ei ollut merkittävä, eli kiinteiden vaikutusten malli käyttäen Mantel-Haenszel menetelmä [19] käytettiin laskemiseen yhdistettiin syrjäisimmille alueille. Muuten, satunnainen vaikutusten mallia käyttäen Dersimonian ja Laird menetelmä [20] tehtiin. Herkkyysanalyysi suoritettiin tutkimaan heterogeenisuus kun merkittävä heterogeenisyys oli ilmoitettu. Alaryhmä analyysit suoritettiin tutkimaan vaikutuksia etnisyyden, syövän tyyppi ja lähde valvontaa. Lisäksi julkaisu bias arvioitiin laadullisesti suorittamalla suppilo tonttien ja arvioida kvantitatiivisesti Begg testillä [21] ja Egger testi [22], tässä järjestyksessä. P-arvo 0,1 varten Begg ja Egger testit ehdottaa merkittäviä julkaisu puolueellisuudesta.

Tulokset

Tutkimus Ominaisuudet

Tämä meta-analyysi järjestettiin perustuu PRISMA lausuma (PRISMA tarkistuslista). Kaikkiaan 492 kirjallisuus saatiin sähköisistä tietokannoista jälkeen kaksoiskappaleet poisto. Tutkittuaan otsikoita ja tiivistelmiä, 468 artikkelia ei otettu lähinnä ole merkitystä, selostuksia, eläinkokeissa tai ei syövästä. Tämän jälkeen vasen 24 julkaisua arvioitiin edelleen tukikelpoisuuden. Seitsemäntoista kirjallisuuden poistettiin, koska ei Englanti tai Kiinan, ei raakadataa, ei tapaus-verrokki suunniteltu tai joka ei koske IVS4 polymorfismi. Lopuksi seitsemän koko teksti artikkeleita kelpoisuus sisällytettiin olevassa meta-analyysi. Yksityiskohtainen vuokaavio Tutkimuksen valikointi esitetty kuviossa 1.

perustason ominaisuudet tutkimukset sisälly tähän meta-analyysissä oli yhteenvetona taulukossa 1. Kaikki mukana tapausverrokkitutkimukset julkaistiin Englanti tai Kiinan 2001-2013, yhteensä koostuu 1831 tapauksia ja 2767 tarkastuksia. Etnisten ryhmien tutkituissa populaatioissa katettu Turkki, Kiina ja amerikkalainen.

PTEN

IVS4 polymorfismi Kussakin tutkimuksessa kaikki oli havaittu polymeraasiketjureaktiolla-restriktiofragmenttipituuspolymorfismin (PCR-RFLP) -menetelmää. Tutkitut syöpätyyppien julkaisuista koostui rintasyöpä, paksusuolen ja peräsuolen syöpä, mahalaukun syöpä, ruokatorven syöpä ja eturauhassyöpä. Syöpätyyppejä mukaan lukien ruokatorven, mahasyövän ja peräsuolen syöpä integroitiin ruoansulatuskanavan syöpään suoritettaessa alaryhmäanalyysi perustuu syöpätyypin.

Quantitative Data Synthesis

tulokset määrällisten synteesi tietojen tiivistetysti taulukossa 2. yksilöiden

PTEN

IVS4 (- /-) genotyyppi liittyi merkittävästi lisääntynyt riski syövän (OR = 1,45, 95% CI = 1,19-1,76, P 0,001, Kuva 2) verrattuna (+ /+) genotyyppi. Sillä alaryhmäanalyysissä mukaan syöpätyypin,

PTEN

IVS4 (- /-) genotyypin havaittiin liittyvän lisääntynyt riski ruuansulatuskanavan syövän (OR = 1,67, 95% CI = 1,28-2,18, P 0,001 ), mutta ei merkittävää yhteyttä todettiin rintasyöpä (OR = 1,27, 95% CI = +0,79-+2,04, P = 0,318) tai eturauhassyövän (OR = 1,20, 95% CI = 0,83-1,73, p = 0,342). Koska eri etnisten ryhmien, kantajia

PTEN

IVS4 (- /-) genotyyppi liittyi merkittävästi lisääntynyt riski syövän Turkin ja Kiinan, mutta ei Amerikan väestöstä. Vuonna alaryhmäanalyysissä perustuu lähde ohjaus, lisääntynyt syöpäriskiä havaittiin väestöpohjaisen alaryhmä sijaan sairaala-pohjainen alaryhmä.

Yksilöiden

PTEN

IVS4 ( +/-) genotyypin eivät merkitsevästi liittynyt syöpäriskiä (OR = 1,10, 95% CI = 0,84-1,43, p = 0,484, kuva 3) verrattuna (+ /+) genotyyppi. Kuitenkin Alaryhmäanalyysissa perustuvat eri syöpätyypin osoitti, että

PTEN

IVS4 (+/-) genotyyppi oli merkittävästi liittyy lisääntynyt riski ruuansulatuskanavan syövän (OR = 1,33, 95% CI = 1,05-1,68, p = 0,016); kun taas mitään tällaista yhdistys havaittu alaryhmissä rintasyövän tai eturauhassyövän. Lisäksi mitään merkitsevää yhteyttä ei havaittu eri alaryhmään perustuu etniseltä. Oli syytä huomata, että alaryhmäanalyysi väestön-pohjainen (PB) ja sairaala-pohjainen (HB) osoittivat kiistanalaisia ​​tuloksia (PB: OR = 1,31, 95% CI = 1,07-1,59, p = 0,007; HB: OR = 0,63, 95 % CI = 0,41-0,96, p = 0,033), mikä ehdotti, että valinta valvonnan saattaa vaikuttaa tuloksena suhde

PTEN

IVS4 (+/-) genotyypin ja syövän riskiä.

resessiivinen efektimalli ja hallitseva vaikutus malli osoitti myös merkitsevästi yhteydessä

PTEN

IVS4 (rs3830675) polymorfismi ja lisääntynyt syöpäriskiä (- /- vs. (- /+ ja + /+): OR = 1,56, 95% CI = 1,19-2,05, p = 0,001, kuvio S2, (- /+ ja – /-) verrattuna (+ /+): OR = 1,26, 95% CI = 1,06-1,49, p = 0,008, kuvio S3) erityisesti ruoansulatuskanavan syöpään (- /- vs. (- /+ ja + /+): OR = 1,70, 95% CI = 1,16-2,49, p = 0,007, (- /+ ja – /- ) vs. (+ /+): OR = 1,45, 95% CI = 1,16-1,81, p = 0,001).

alleeli-analyysi osoitti, että (-) alleelin

PTEN

IVS4 (rs3830675) polymorfismi merkitsevästi liittyy lisääntynyt syöpäriski (OR = 1,30, 95% CI = 1,12-1,50, p = 0,001, kuva 4) ja ruuansulatuskanavan syövän (OR = 1,42, 95% CI = 1,16-1,74, P = 0,001) verrattuna (+) alleeli. Mitään tällaista merkittävää yhteyttä löytyi alaryhmissä rintasyövän tai eturauhassyövän. Vuonna kerrostunut analyysin mukaan eri etnisten ryhmien, jatkuvasti lisääntynyt syöpäriskin

PTEN

IVS4 (-) alleeli havaittiin Turkin ja Kiinan väestön, mutta ei ole merkittävää yhteyttä löytyi amerikkalainen.

heterogeenisuus Test, Herkkyysanalyysi ja julkaisu Bias

vertailussa

PTEN

IVS4 (- /-) genotyypin kanssa (+ /+) genotyyppi, mitään merkittävää heterogeenisyyttä havaittiin yleistä analyysi ja kaikki alaryhmäanalyyseissa. Siksi fix-efektimalli hyväksyttiin. Useissa vertailuissa

PTEN

IVS4 (+/-) genotyypin kanssa (+ /+) genotyypin ja alleeli analyysi, random-vaikutus mallia käytettiin johtuen merkittävistä heterogeenisuudesta (taulukko 2). Herkkyysanalyysi myöhemmin suoritettiin havaita vaikutusta yksittäisten tutkimus yhdistettiin arvioon jättämällä pois yksi tutkimus on saatu yhdistämällä analyysin kerta. Poissulkeminen kunkin yksittäisen tutkimus ei muuttanut merkittävästi yhdistetty OR (kuva ei esitetty), mikä viittaa siihen, että tulokset meta-analyysissä oli vankka.

Begg testi ja Egger testi tehtiin arvioimiseksi julkaisun bias opintojen kvantitatiivisesti. Yksityiskohtaiset tiedot julkaistavaksi bias testi esitetään taulukossa 3. Merkittävät julkaisu bias havaittiin alleelin analyysiin ja väistyvä efektimalli analyysi

PTEN

geeni IVS4 (rs3830675) polymorfismi. Sitä paitsi, suppilo juoni että laadullisesti arvioinut julkaisu bias välisen assosiaation

PTEN

IVS4 (- /-) genotyypin ja syövän riski oli esitetty kuvassa S1.

Keskustelu

tulokset aiempien tutkimusten koskee suhdetta

PTEN

geeni IVS4 (rs3830675) polymorfismi syöpäriskiä osoittautua kiistanalainen [11] – [17]. Parhaan tietomme, tämä oli ensimmäinen meta-analyysi tutkii rooli

PTEN

IVS4 polymorfismin karsinogeneesissä. Suorittamalla nykyinen meta-analyysi, ehdotimme, että

PTEN

IVS4 (- /-) genotyypin ja (-) alleeli merkittävästi liittyy lisääntynyt syöpäriskiä erityisesti ruoansulatuskanavan syöpään, vastaavasti. Kuitenkaan mitään merkittävää yhteyttä ei havaittu

PTEN

IVS4 (+/-) genotyypin ja syöpäriskiä.

Kun ensimmäisen tunnistamista kasvainsuppressorigeenin vuonna 1997, rooli

PTEN

geeni karsinogeneesis- on herättänyt erityistä kiinnostusta. Somaattisista mutaatioista on havaittu eri syöpä mukaan lukien rinta-, eturauhas-, melanooma ja kohdun limakalvon [23], joten se on yksi useimmin mutatoitunut tuumorisuppressoreilla. Lisäksi ituradan mutaatioista

PTEN

altistaa harjoittajien kehittää Cowden tauti ja Bannayan-Zonana oireyhtymä [24], [25]. Äskettäin yhdistyksen välillä polymorfismit

PTEN

geenin ja syöpäriskiä on tutkittu erityyppisiä syöpiä. Yksi yleisimmin tutkittu polymorfismi oli

PTEN

geeni IVS4 (rs3830675) polymorfismi intronin 4. yksittäiset tutkimukset osoittivat ristiriitaisia ​​tuloksia, suoritimme esillä meta-analyysi valottaa tarkkaa roolia

PTEN

geeni IVS4 (rs3830675) polymorfismi karsinogeneesissä.

suorittamalla nykyinen meta-analyysi, huomasimme, että

PTEN

IVS4 (- /-) genotyyppi merkitsevästi yhteydessä lisääntynyt syöpäriski (OR = 1,45) ja alaryhmä ruoansulatuskanavan syöpään (OR = 1,67) verrattuna (+ /+) genotyypin; ei merkittävää yhteyttä ei havaittu (- /-) genotyypin ja riskejä rintasyövän tai eturauhassyövän. Resessiivinen efektimalli ja hallitseva vaikutus malli osoitti myös merkitsevästi yhteydessä

PTEN

IVS4 (rs3830675) polymorfismi ja lisääntynyt syöpäriskiä (- /- vs. (- /+ ja + /+): OR = 1,56; ( – /+ ja – /-) verrattuna (+ /+): OR = 1,26) erityisesti ruoansulatuskanavan syöpään. Vastaavasti (-) alleelin

PTEN

IVS4 (rs3830675) polymorfismi oli myös merkitsevästi yhteydessä lisääntyneeseen syöpäriskiin (OR = 1,30) ja ruoansulatuskanavan syöpään (OR = 1,42) verrattuna (+) alleeli; tällaista merkittävää yhteyttä löytyi alaryhmissä rintasyövän tai eturauhassyövän. Eri syöpä on sen eri mekanismeja aloittamisesta ja etenemiseen, ilmeinen erilaiseen lopputulokseen erilaisia ​​syövän alatyyppejä tässä meta-analyysi osoitti, että

PTEN

IVS4 (rs3830675) polymorfismi voi siirtää muuttunut riskejä erityyppisiä syöpiä. Johdonmukainen yhteys välillä

PTEN

IVS4 (rs3830675) polymorfismi ja riski ruuansulatuskanavan syövän eri geneettisiä malleja ehdotti, että

PTEN

saattaa olla erityinen tehtävä karsinogeneesi ruoansulatuskanavan syöpä, joka vaatii vielä tutkimuksia tutkia. Koska eri etnisten ryhmien,

PTEN

IVS4 (- /-) genotyypin ja (-) alleeli liittyvän kohonneeseen syöpäriskiä sekä Turkin ja Kiinan muttei amerikkalaisissa. Vaikka eri yhdistysten havaittiin Aasian ja valkoihoinen, johtopäätös perustuu eri etnisten ryhmien tulisi tehdä huolellisesti vähäisyyden vuoksi tutkimuksen numero valkoihoisilla. Lisäksi, heterotsygoottinen (+/-) genotyyppi ole merkittävästi yhteydessä muuttunut syöpäriski mukaan yhdistetään arvion tämän meta-analyysissä.

rooli

PTEN

tuumorisuppressorina on on vakiintunut. PTEN antagonisoi phosphoinositol-3-kinaasi /AKT signalointireitin ja tukahduttaa solujen selviytymistä sekä solujen lisääntymistä, mikä turvaa tärkeät solu- koneistoja vastaan ​​kasvaimen kehittymisen [26]. Sitä paitsi, PTEN ohjaa erilaisia ​​biologisia prosesseja myös solujen jakautumista, kasvua, muuttoliike ja kuoleman [27]. Aiemmat tutkimukset koskien

PTEN

polymorfismien lähinnä eksoni alueella

PTEN

geeni. Aivan äskettäin, introni polymorfismi on

PTEN

kiinnitti yhä enemmän huomiota. Vaikka intronit alun perin uskotaan olevan funktionaalinen, koska ne eivät koodaa proteiineja, on ehdotettu, että jotkut näistä sekvensseistä hallussaan tärkeisiin toimintoihin [28]. Jotkut intronit voivat säädellä ilmentymistä geenin [29], kun taas muut niistä voidaan käsitellä edelleen saumauksen jälkeen tuottaa ei-koodaavaa RNA-molekyylejä, [30]. Tärkeää introni sivustoja polymorfismi voisi häiritä liitos prosessin aikana transkription.

PTEN

IVS4 (rs3830675) polymorfismi voi johtaa liittämiseen virhe tai voi tapahtua kytkentäepätasapaino- toisen lokuksen vaikuttaa ilmaisun ja toiminta

PTEN

. Vuorottelu

PTEN

ilmaisua väistämättä vaihtaa roolia

PTEN

ylläpitämisessä genomin vakautta, ja lakkaa toimimasta tämän tuumorisuppressorin saattaa siis johtaa syövän synnyn. Vaikka edellä mainittu mahdollinen mekanismi saattaa osittain selittää havaitun assosiaation

PTEN

IVS4 (rs3830675) polymorfismi ja syövän alttiuden, harvinainen toiminnallinen tutkimus on tehty ja tarkka mekanismi ovat edelleen suurelta osin hämäräksi. Tulevaisuuden toiminnallinen tutkimuksia tarvitaan edelleen selventämään tarkkaa roolia

PTEN

IVS4 (rs3830675) polymorfismi karsinogeneesissä.

Useita rajoituksia olisi tunnustettava tämä meta-analyysi tuloksia tulkittaessa . Ensinnäkin otoksen koko on meta-analyysi ei ollut riittävän suuri erityisesti alaryhmäanalyyseissa. Toiseksi, vain julkaistut tutkimukset Englanti tai Kiinan kuuluivat tähän meta-analyysi, joka saattaa aiheuttaa julkaisu puolueellisuudesta. Kolmanneksi etnisten ryhmien useimpien tutkimukset olivat aasialaisilla on vain yksi tutkimus toteutettiin valkoihoinen, joka ansaitsee edelleen vahvistusten muissa etnisissä ryhmissä. Lopuksi, koska muita tärkeitä tietoja, kuten sukupuoli, ikä, suvussa ja ympäristö riskitekijöitä ei ollut saatavilla, emme voineet saatu tuloksia säädöt muiden co-muuttujia.

Johtopäätös

Jotta päätteli, tämä meta-analyysi osoitti, että

PTEN

IVS4 (- /-) genotyyppi oli merkitsevästi yhteydessä lisääntyneeseen syöpäriskiä erityisesti ruoansulatuskanavan syöpään verrattuna (+ /+) genotyyppi. The (-) alleelin

PTEN

IVS4 (rs3830675) polymorfismi oli merkitsevästi liittyy lisääntynyt syöpäriskiä erityisesti ruoansulatuskanavan syöpään verrattuna (+) alleeli. Resessiivinen efektimalli ja hallitseva vaikutus malli osoitti myös merkitsevästi yhteydessä

PTEN

IVS4 (rs3830675) polymorfismi ja lisääntynyt syöpäriski erityisesti ruoansulatuskanavan syöpään. Edelleen laajamittainen ja hyvin suunniteltu tutkimuksia koskien eri etnisten ryhmien tarvitaan vielä tulosten varmistamiseksi meidän meta-analyysi.

tukeminen Information

Kuva S1.

Funnel tontti tutkimuksiin yhdistyksen välillä

PTEN

IVS4 (rs3830675) polymorfismi ja syövän riskiä (- /- vs. + /+).

doi: 10,1371 /journal.pone.0098851.s001

(TIF) B Kuva S2.

Funnel tontti tutkimuksiin yhdistyksen välillä

PTEN

IVS4 (rs3830675) polymorfismi ja syövän riskiä (- /- vs. [- /+ ja + /+]).

doi: 10,1371 /journal .pone.0098851.s002

(TIF) B Kuva S3.

Funnel tontti tutkimuksiin yhdistyksen välillä

PTEN

IVS4 (rs3830675) polymorfismi ja syövän riskiä ([- /- ja – /+] vs. + /+).

doi: 10,1371 /journal .pone.0098851.s003

(TIF)

tarkistuslista S1.

PRISMA tarkistuslista.

doi: 10,1371 /journal.pone.0098851.s004

(DOC) B

Vastaa