Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Kertyvät tutkimusten mukaan äidit vastaan ​​dekapentaplegisen homologi 7 (Smad7) rs12953717 polymorfia saattaa liittyä syöpäriskiä. Kuitenkin epidemiologiset havainnot ovat olleet ristiriitaisia. Siksi suorittaa meta-analyysi selventää assosiaatiota Smad7 rs12953717 polymorfismi ja syöpäriskiä.

Methods

Kattava haku suoritettiin tunnistamaan kaikki oikeutettuja tutkimuksia Smad7 rs12953717 polymorfismin ja syöpäriskiä . Käytimme kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmät alueet) arvioimaan vahvuus yhdistyksen, ja 95% luottamusväli (CI), jolloin tunteen tarkkuuden arvio. Heterogeenisyys, julkaisu bias, ja herkkyysanalyysi myös tutkittu.

Tulokset

yhteensä 14 tapausverrokkitutkimukset, mukaan lukien 16928 tapaukset ja 14781 valvonta, sisältyivät esillä meta-analyysi. Kokonaistulokset osoittivat, että variantti genotyypit liittyi merkitsevästi suurentunut riski kaikkien syöpätyyppien (homotsygootti vertailun, OR = 1,23, 95% CI = 1,10-1,38, P 0,01; heterotsygoottianalyysiin vertailu, OR = 1,12, 95% CI = 1,02-1,22, p = 0,02; väistyvä malli, OR = 1,17, 95% CI = 1,07-1,29, P 0,01, hallitseva malli, OR = 1,15, 95% CI = 1,06-1,25, P 0,01, alleeliset malli, OR = 1,12, 95% CI = 1,06-1,18, P 0,01). Edelleen herkkyys analyysi vahvisti merkittävää yhteyttä. Vuonna alaryhmäanalyysi etnisyys, Smad7 rs12953717 polymorfismi merkitsevästi yhteydessä syöpäriskiä niin valkoihoisilla ja aasialaiset. Vuonna alaryhmäanalyysi syöpätyyppejä, Smad7 rs12953717 polymorfismi merkitsevästi yhteydessä peräsuolen syöpään.

Johtopäätökset

tutkimukset osoittavat, että rs12953717 polymorfismi liittyy alttiuteen syövän. Laajamittainen ja hyvin suunniteltu tapausverrokkitutkimukset ovat tarpeen vahvistaa tunnistetun riskin olevassa meta-analyysi.

Citation: Zhang H, Ma H, Xu Y, Li L (2013) yhdistys Smad7 rs12953717 Polymorfismi Cancer: meta-analyysi. PLoS ONE 8 (3): e58170. doi: 10,1371 /journal.pone.0058170

Editor: Rui Medeiros, IPO, Inst Port Oncology, Portugali

vastaanotettu: 21 lokakuu 2012; Hyväksytty: 31 tammikuu 2013; Julkaistu 5 maaliskuuta 2013

Copyright: © 2013 Zhang et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat Tianjin maakunnassa Natural Science Foundation (09JCYBJC10000) ja korkean teknologian ja Basic tutkimusohjelma Tianjin Medical university (2009GSI18). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksessa, suunnittelussa, tietojen keruun ja analysoinnin, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Syöpä on loppuun monimutkainen sairaus, joka johtuu monimutkainen vuorovaikutus, mukaan lukien monitekijäinen, multi-geneettinen ja monivaiheinen prosesseja [1]. Se on tullut maailmanlaajuinen kansanterveyden taakan [2], [3]. Monimutkainen etiologiaa tätä tautia ei ole vielä täysin selvitetty [4]. Viime aikoina on käynyt selväksi, että geneettinen vaihtelu myötävaikuttaa kehittymistä ja etenemistä syövän [4], [5]. Kuitenkin eri syistä, mukaan lukien huomattava heterogeenisuus syöpä, tunnistaminen alttiusgeenit on vaikeaa ja useimmat yhdistykset eivät ole toistettu. Yhden emäksen monimuotoisuus (SNP: t) ovat herättäneet runsaasti huomiota viime vuosina mahdollisina markkereita ennustamaan sairauden herkkyys ja ohjaamiseen yksilöllisiä hoito-. On hyvin tunnettua, että transformoiva kasvutekijä-β (TGF-β) signalointireitin on merkittäviä rooleja kasvaimen aloittamista, invaasio ja metastaasi [6]. Geneettisten polymorfismien ja geenejä, jotka osallistuvat TGF-β signalointireittien, kuten äidit vastaan ​​dekapentaplegisen homologi 7 (Smad7) geeni, saattaa vaikuttaa syöpäalttiuteen.

Smad7: ää estävää Smad ja negatiivinen säätelijä TGF-β signalointireitin, joka edistää anti-inflammatorisia vaikutuksia TGF-β signalointia sitoutumisen kautta Välilehti2 ja tab3 ja inhiboimaan TAK1 [7]. On tunnettua, että väheneminen TGF-β signaloinnin lisää syöpäriskiä. Variantti on osa tätä reitti voi edustaa sopiva merkkiaine tunnistamiseen joilla on suuri riski sairastua syöpään [8]. Inaktivoivat mutaatiot on Smad proteiineja on löydetty ihmisen syövissä [9]. Vaikka Smad7-proteiinin yli-ilmentyminen on osoitettu antagonisoida TGF-β-välitteinen fibroosia, karsinogeneesin ja tulehduksen, taustalla olevaa mekanismia ei ole täysin selvitetty [10]. Koska Smad7 on estävää Smad joka toimii negatiivisena säätelijänä TGF-β signalointireitin, on loogista, että geneettisten polymorfismien Smad7 saattaa vaikuttaa syöpäalttiuteen. Useita geneettisiä variantteja sisällä Smad7, joka sijaitsee 18q21, on viime aikoina tutkittu [11] – [22]. Rs12953717 polymorfismin introni 3 on tietoomme. Useita tapausverrokkitutkimukset on suoritettu tutkimaan yhdistys rs12953717 kanssa syöpäalttiutta [11] – [20]. Kuitenkin molekyyli epidemiologiset tutkimukset ovat tuottaneet ristiriitaisia ​​tuloksia, jotka koskevat mahdollista roolia Smad7 rs12953717 polymorfismin syöpään.

Tähän mennessä ei ole meta-analyysi on suoritettu tutkimaan yhdistys rs12953717 polymorfismi Smad7-geenin ja syöpäriskiä. Yksittäiset tutkimukset ovat saattaneet alitehoinen havaita yleisiä vaikutuksia. Jotkut tutkimukset ovat rajalliset niiden otoskoko ja sen jälkeen kärsivät liian alhainen voima havaita vaikutuksia, jotka voivat olla. Koska kertyneen tiedon, me piti tärkeänä tehdä kvantitatiivinen synteesi todisteita. Siksi, meta-analyysi perustuu yhteensä 14 riippumattomien tutkimusten tehtiin, jotka voivat tarjota todisteita yhdistys rs12953717 polymorfismin kanssa syöpäalttiutta.

Materiaalit ja menetelmät

Literature Etsi

Etsimme oleelliset julkaisut käyttävät termejä ”Smad7”, ”18q21”, ”geneettinen alttius”, ”SNP”, ”estävä Smad: ien”, ”polymorfismi” tai ”muunnelma”, ”rs12953717” ja ”syöpä” tai ”karsinooma” tai ”neoplasia” PubMed, Cochrane ja EMBASE elektronisia tietokantoja, ja kaikki voivat tutkimuksia julkaistiin jopa 23. syyskuuta 2012. Arvioimme kaikki noudetun julkaisuista hakea kaikkein tukikelpoisten kirjallisuudessa. Heidän viiteluetteloihin olivat käsin etsitään löytää muita asiaan julkaisuja. Tutkimuksista samoilla tai päällekkäisiä tietoja samalla tutkijat, valitsimme viimeisimpiin kanssa eniten aiheita. Edellytyksenä on, että vain ne julkaistaan ​​Englanti kielellä sisällytettiin. Tutkimukset tutkii useamman kuin yhden tyyppisen syövän päällekkäisiä tai vastaavia tarkastuksia pidettiin yksittäisiä aineistoja ainoastaan ​​alaryhmäanalyyseissa syöpätyypin.

ja poissulkukriteereitä

Seuraavat kriteereillä olisi täytettävä : (1) arvioidaan yhdistyksen välillä Smad7 rs12953717 polymorfismin ja syövän riskiä, ​​(2) käyttäen tapaus-verrokki suunnittelu, (3) riittävien laskennan kerroinsuhde (OR), jossa 95%: n luottamusväli (CI), ja (4 ) julkaistiin Englanti kielellä. Lisäksi seuraavat poissulkukriteereitä käytettiin myös: (1) tieto ei-tapausverrokkitutkimukset; (2) ilman käytettävissä tietoja ilmoiteta; (3) Tutkimuksessa mukana vain tapauskohtaisesti väestön (4) eläinkokeissa; (5) puhdas solututkimuksia; (6) ei koske syöpäriskiä; ja (7) kahdennettu julkaisut.

Data Extraction

Kaksi tekijää (Zahng H ja Ma H) itsenäisesti arvioi artikkeleita noudattamista kriteerit. Erimielisyydet seurasi keskustelu kunnes päästiin. Jos nämä kaksi tekijää ei päästä yksimielisyyteen, niin kolmas kirjailija (Xu Y) kuultiin riidan ratkaisemiseksi. Seuraavat tiedot poimittiin: nimi ensimmäisen tekijän, julkaisu vuosi, ja Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) joukossa valvonta, alkuperämaa, syövän tyyppi, tutkimus tyyppi, tupakointi, liikalihavuus tila, lähde hallintalaitteiden, infektio tila, juominen tila, genotyypitysmenetelmiä, etnisyys väestöstä, ja genotyyppi jakeluun syöpätapauksia ja valvontaa. Eri etnisten ryhmien luokiteltiin valkoihoinen, Aasian ja Mixed, johon sisältyi enemmän kuin yksi rotu. Sillä tapausverrokkitutkimukset, tiedot poimittiin erikseen kunkin ryhmän aina kun mahdollista.

Tilastollinen analyysi

Vahvuus assosiaatiota Smad7 rs12953717 polymorfismin ja syöpäriskin mitattiin syrjäisimpien alueiden, kun taas tunne tarkkuuden arvio antoivat 95% CI. Tutkimme Smad7 rs12953717 genotyyppien käyttäen homozygoottisia vertailu (TT vs CC), heterotsygoottinen vertailu (TC vs CC), resessiivinen (TT vs TC + CC), hallitseva (TT + TC vs CC), ja alleelinen (T vs C) malleja. Heterogeenisuus olettamus tarkastettiin Q-testi. Merkittävä Q-tilastoa (P 0,10) osoitti heterogeenisuus tutkimuksia, ja sitten tulos satunnainen efektimalli valittiin [23]. Muutoin tuloksena kiinteän vaikutus malli valittiin [24]. Tutkimaan syitä heterogeenisuuden, alaryhmäanalyyseissa suoritettiin etnisyys, tutkimus tyyppi, ja syöpätyypin.

merkitys Yhdistettyjen OR määritettiin Z-testi ja P 0,05 pidettiin tilastollisesti merkitsevä. Yksisuuntainen herkkyysanalyysit tehtiin arvioimaan vakautta tuloksia, nimittäin Yhdessä tutkimuksessa meta-analyysi poistetaan joka kerta pohtia vaikutuksesta yksittäisten tietojen asetettu yhdistettiin OR. Arvio mahdollisesta julkaisun harhaa toteutettiin suppilo juoni. Epäsymmetrinen juoni ehdotti mahdollista julkaisemista bias. Suppilo juoni epäsymmetria arvioitiin Egger testi. Merkitys siepata määritettiin t-testin ehdotti Egger. P 0,05 katsottiin edustavan tilastollisesti merkitsevä julkaisun bias. Olemme arvioineet poikkeamat HWE kontrolliryhmän jokaisessa tutkimuksessa käyttämällä online HWE laskin (https://ihg.gsf.de/cgi-bin/hw/hwa1.pl). Kaikki tilastolliset testit suoritettiin tietokoneohjelmia Review Manage 5,0 ja Stata 11,0 käyttäen kaksipuolista P-arvoja.

Tulokset

Ominaisuudet Studies

valintaprosessiin tutkimukset sisällytettäväksi meta-analyysi on esitetty yhteenvetona kuviossa S1. Tietokanta etsintä tunnistettu 56 mahdollisesti merkitystä lainaukset, joista 43 katsottiin olevan mahdollisesti kiinnostaa perusteella otsikko. Perusteella abstraktin, 27 tutkimukset käytiin läpi kokonaisuudessaan. Louhittaessa, datan, 17 artikkelia jätettiin, koska ne eivät riittävästi tarvittavia tietoja tai laskenta, ei syöpätutkimukseen, olivat katsaukset tai niiden sisältö liittyy syövän ennusteeseen ja hoidon, jättäen 10 voivat artikkeleita lukien 14 tutkimusta [ ,,,0],11] – [20]. Tutkimuksissa selvittää eri syöpiä, eri etnisen tai erityyppisiä tutkimuksia erotettiin useisiin opintoja alaryhmäanalyysissä. Kaksi hyväksyttävistä tutkimusten samojen tekijöiden käytetty päällekkäisiä tarkastuksia, vaan suunnattu eri syöpiin, joten yhdistimme peräsuolen syöpä (Broderick et al.-B) ja kroonisen lymfaattisen leukemian (Broderick et al.-2008) yhdeksi tutkimuksen yleisanalyysi ja in alaryhmäanalyysissä Valkoihoisilla [19], [20]. Tutkimukset tutkii useamman kuin yhden tyyppisen syövän kanssa saman tai päällekkäisiä tarkastuksia pidettiin yksittäisiä tietomääriä alaryhmäanalyyseissa syöpätyypin [13,19.20]. Nämä 14 tutkimuksiin osallistui 2 rintasyöpätutkimuksissa [11], [17], 1 munuaissyövän tutkimus [16], 1 peräsuolen syöpä, mahasyöpä, ja keuhkosyöpä tutkimus [13], 1 krooninen lymfaattinen leukemia tutkimuksen [19], ja 11 kolorektaalisyöpä tutkimuksissa [12], [14], [15], [17], [18], [20]. Näistä oli 3 tutkimuksia aasialaiset [12], [13], [16], 9 tutkimukset Valkoihoisilla [14], [17] – [20], ja 2 tutkimukset sekoitettu etnisyys [11], [15] . Genotyyppi jakaumat kontrolleissa kaikkien tutkimusten olivat yhtä mieltä HWE lukuun ottamatta 2 tutkimuksissa [12], [15]. Lisäksi 13 tutkimukset [11] – [20] oli replikointi-pohjainen ja 1 tutkimus [20] oli GAWS-pohjainen. Tärkeimmät ominaisuudet kaikissa hyväksytyissä tutkimuksissa, on lueteltu taulukossa 1.

Meta-analyysi

yksityiskohtaiset tulokset tämän meta-analyysissä, julkaisussa bias testi, ja heterogeenisyys testi oli taulukoissa 2. ensin analysoidaan yhdistyksen koko väestöstä. Sitten saadakseen tarkan seuraus suhdetta Smad7 rs12953717 polymorfismin ja syöpäalttiutta, kerrostunut analyysit etnisyys, tutkimus tyyppi, ja syöpätyypin tehtiin. Kun Q-testi heterogeenisyys ei ollut merkittävä, teimme analyysit käyttäen kiinteän vaikutuksen mallia. Satunnaisen vaikutus malleja tehtiin, kun havaitaan merkittäviä Tutkimusten välisten heterogeenisuus.

Kaiken vaikutuksia meta-analyysissä.

välinen yhteys Smad7 rs12953717 ja syövän riskiä tutkittiin 14 tutkimuksissa joissa on yhteensä 16928 tapausta ja 14781 valvontaa. Merkittävät Tutkimusten välisten heterogeenisuus havaittiin kaikissa geneettisten mallien. Vuonna yleisanalyysi, havaitsimme merkittävää yhdistyksen välillä Smad7 rs12953717 polymorfismin ja syöpäalttiutta alle homozygoottisia vertailu (OR = 1,23, 95% CI = 1,10-1,38, P 0,01; kuva S2), heterotsygoottinen vertailu (OR = 1,12, 95% CI = 1,02-1,22, p = 0,02; kuva S3), resessiivinen malli (OR = 1,17, 95% CI = 1,07-1,29, P 0,01; kuva S4), hallitseva malli (OR = 1,15, 95% CI = 1.06- 1,25, P 0,01; kuva S5), ja alleelinen malli (OR = 1,12, 95% CI = 1,06-1,18, P 0,01; kuva S6).

Alaryhmäanalyysissä varten tutkimusasetelma.

kokonaistulokset osoittivat, että variantti genotyypit liittyi merkitsevästi lisääntynyt riski. Sen jälkeen kun 1 GAWS perustuva tutkimus jätettiin, tilastollista merkitystä tulosten ei muuttunut lisääntymään tutkimuksissa. (Homotsygootti vertailu, OR = 1,19, 95% CI = 1,08-1,32, P 0,01; heterotsygoottianalyysiin vertailu, R = 1,10, 95% CI = 1,00-1,21, p = 0,04; väistyvä malli, OR = 1,15, 95% CI = 1,04-1,26, P 0,01, hallitseva malli, OR = 1,13, 95% CI = 1,04-1,22, P 0,01, alleeliset malli, OR = 1,10, 95% CI = 1,05-1,15, P 0,01).

Alaryhmäanalyysissä varten kansallisuus.

Alaryhmäanalyysissä stratifioitiin etnisyys. Meta-analyysiin sisältyi 3 tutkimuksesta (1332 tapausta ja 1080 tarkastukset) Aasian väestön 2 tutkimukset (2726 tapausta ja 2969 tarkastukset) in sekapopulaatioon, ja 9 tutkimukset (12870 tapausta ja 10732 valvonta) valkoihoisilla väestöstä. Vuonna valkoihoinen väestö, Q-testi heterogeenisuus oli merkityksetön, ja teimme analyysit käyttämällä kiinteää vaikutus malleja kaikki geneettiset malleissa. Tilastollisesti merkitsevä yhteys perustettiin Smad7 rs12953717 polymorfismi valkoihoisilla kaikissa geneettinen mallit (homotsygootti vertailun, OR = 1,28, 95% CI = 1,19-1,38, P 0,01; heterotsygoottianalyysiin vertailu, R = 1,12, 95% CI = 1,06-1,19 P 0,01; väistyvä malli, OR = 1,19, 95% CI = 1,12-1,27, P 0,01, hallitseva malli, OR = 1,17, 95% CI = 1,10-1,23, P 0,01, alleeliset malli, OR = 1,13, 95% CI = 1,09-1,17, P 0,01). Aasialaiset, heterogeenisyys oli merkittävä ja teimme analyysejä käyttämällä satunnaisia ​​vaikutuksia mallien paitsi kontrasti T vs. C tiedot osoittivat, että rs12953717 liittyi syöpäriskiin alla hallitseva malli (OR = 1,48, 95% CI = 1,08-2,03, P = 0,01) ja alleelinen malli (OR = 1,25, 95% CI = 1,10-1,42, P 0,01) Aasian väestöstä. Kun se tulee sekapopulaatioon, emme löytäneet yhdistyksen välillä Smad7 rs12953717 polymorfismin ja syöpäalttiutta kaikissa geneettinen mallien sekapopulaatioon.

Alaryhmäanalyysissä varten syöpätyyppeihin.

Alaryhmäanalyysissä oli myös stratifioitu syöpätyyppeihin. Meta-analyysiin sisältyi 11 tutkimukset (12058 tapausta ja 11444 valvonta), joka perustuu peräsuolen syövän, 2 tutkimukset (3415 tapausta ja 3137 tarkastukset), joka perustuu rintasyöpä, ja 3 tutkimuksissa (1455 tapausta ja 4229 tarkastukset), joka perustuu muihin syöpiin. Kolorektaalisyövässä alaryhmässä oli merkittävä heterogeenisyys hallitseva malli. Ei ollut merkittävää heterogeenisyyttä alaryhmäanalyysissä rintasyöpään. Kun se tulee muiden syöpien, merkittävä heterogeenisyys löydettiin kaikista geneettisten mallien paitsi homotsygoottisia verrattuna. Eri syöpätyyppien, Smad7 rs12953717 polymorfismi oli merkitsevästi liittyy lisääntynyt paksusuolisyövän riskin kaikissa geneettinen malleissa (homotsygootti vertailun, OR = 1,34, 95% CI = 1,24-1,44, P 0,01; heterotsygoottianalyysiin vertailu, R = 1,11, 95% CI = 1,02-1,22, p = 0,02; väistyvä malli, OR = 1,25, 95% CI = 1,17-1,33, P 0,00001, hallitseva malli, OR = 1,17, 95% CI = 1,07-1,28, P 0,01; alleeliset malli, OR = 1,15, 95% CI = 1,11-1,20, P 0,01). Ei ole todisteita yhdistyksen löydetty geneettistä mallia välillä Smad7 rs12953717 polymorfismin ja rintasyövän riskiä tai muita syöpiä.

Herkkyysanalyysi

Jotta vertailla eroa ja arvioida herkkyys meta-analyysit, teimme yksisuuntainen herkkyyden analyysi stabiilisuuden arvioimiseksi meta-analyysi. Tilastollinen merkitsevyys ei muuttunut, kun mikään yksittäinen tutkimus jätettiin pois, vahvistaa vakautta tuloksia. Vaikka genotyyppi jakaumia valvonnan ryhmien 2 tutkimukset eivät noudata HWE, vastaavien yhdistettyjen OR ei muuta merkittävästi syrjäytymistä 2 tutkimuksiin. Näin ollen tulokset herkkyysanalyysin viittaavat siihen, että tiedot tässä meta-analyysi on suhteellisen vakaa ja uskottava. Yksityiskohtaiset tiedot olivat läsnä taulukossa S1.

Julkaisu Bias

Begg n suppilo juoni ja Egger testi tehtiin arvioimiseksi julkaisun bias. Muoto suppilo tontteja ei ilmennyt näyttöä ilmeinen epäsymmetrian kaikissa vertailuissa koko väestöstä, ja Egger n testiä käytettiin sellaisten tilastotietojen näyttöä suppilo juoni. Tulokset eivät osoittaneet mitään todisteita julkaisun bias kaikissa vertailuissa. Yksityiskohtaiset tiedot on esitetty taulukossa 2.

Keskustelu

Useita linjoja todisteet tukevat merkittävä rooli genetiikan määritetään riski syövän, ja yhdistys tutkimukset ovat asianmukaisia ​​etsimiseen altistavia geenejä osallisina syövän [25]. Viime vuosina kiinnostus geneettinen alttius syöpien on johtanut kasvavaan huomiota tutkimuksen polymorfismien liittyvien geenien tuumorigeneesiä. Koska tunnistaminen Smad7 rs12953717 polymorfismin [20], yhä useammat tutkimukset ehdotti, että Smad7 rs12953717 polymorfismi voi olla tärkeä rooli syövän kehittymisessä [11], [20]. Epidemiologiset tutkimukset Smad7 rs12953717 polymorfismi, jos suuria ja puolueeton, voi auttaa selvittämään

in vivo

suhde geenin ja syöpäriskiä. Kuitenkin tutkimukset keskittyvät assosiaatiosta Smad7 rs12953717 polymorfismi kanssa syöpäalttiutta oli kiistanalainen johtopäätöksiä. Jotkut perustuvat tutkimukset ovat rajalliset niiden otoskoko ja sen jälkeen kärsivät liian alhainen voima havaita vaikutuksia, jotka voivat olla. Mutta allas syrjäisimmille alueille syntyy paljon suurempi väestö voi lisätä tilastollinen voima. Meta-analyysi on tehokas työkalu yhteenveto tuloksista eri tutkimuksista tuottamalla yksi arvio suurta vaikutusta tiiviimmän tarkasti. Se voi voittaa ongelma pienen otoksen koosta ja riittämätön tilastollisen tehon geneettiset tutkimukset monimutkaisten ominaisuuksien, ja saadaan luotettavampia tuloksia kuin yhden tapauskontrollitutkimuksessa [26]. Yhdistämällä tietoja useista tutkimuksista etuna on vähentää satunnaisvirheen [27].

Jotta kattava ja luotettava johtopäätös, suoritimme esillä meta-analyysi 14 riippumaton tapaus-verrokki tutkimuksissa. Olemme tutkineet yhdistyksen välillä Smad7 rs12953717 polymorfismi ja syöpäriskiä. Alaryhmäanalyyseissa ositettu syöpätyyppejä, etnisyys, ja tutkimus tyyppi suoritettiin myös. Tietääksemme tämä tutkimus oli ensimmäinen meta-analyysi tutkii yhdistyksen välillä Smad7 rs12953717 polymorfismin ja syöpäriskiä. Tulokset osoittivat, että Smad7 rs12953717 oli merkitsevästi yhteydessä syöpäriskin yleisen analyysin. Nämä yhteydet olivat hyvin vahva, joka ei vaihtele, kun herkkyys analyysit suoritettiin. Vuonna kerrostunut analyysi syöpätyyppejä, tulokset osoittivat, että Smad7 rs12953717 polymorfismi oli merkitsevästi liittyy lisääntynyt peräsuolen riski. Kuitenkin rintasyövän ja muiden syöpien, ei yhdistysten löytyivät geneettistä mallia. Tulokset eri syöpätyyppejä olivat epäjohdonmukaisia, mikä saattaa johtua erilaisista mikroympäristöjen ja mekanismit eri syöpätyyppejä. Tutkimustulokset osoittivat, että alempi mediaani Smad7-mRNA liittyy peräsuolen syövän riskiä alleelin rs12953717 [20]. Smad7 toimii solunsisäinen antagonisti TGF-beetaa signalointi sitoutumaan stabiilisti reseptoriin monimutkainen ja estää aktivoinnin alavirran signalointia tapahtumat [28]. Häiriön Smad7-ekspression on aiemmin dokumentoitu vaikuttaa peräsuolen syövän etenemiseen [29], ja menetys kromosomissa 18q21 käsittää Smad7 on yleinen kolorektaalisyövässä [30]. Smad7 rs12953717 tunnistettiin GWAS sekä adenoomien ja syöpien [20]. Kuten määrä kopioita Smad7 kasvaa, paksusuolen syövän riskiä kasvaa harjoittajien ja ennusteen on pahentunut potilaille, joilla on peräsuolen syöpä [31]. Smad7-ekspression on pienempi syöpien kuin adenoomien riippumatta 18q kopioluvun tila tekee sivustakatsojavaikutus epätodennäköinen ja ehdottaa suora rooli Smad7 karsinogeneesis- [32]. Näin ollen alleelin ekspressio Smad7 on todennäköisesti biologisen perustan paksusuolisyövän alttius liittyy 18q21 vaihtelu [32]. Vuonna kerrostunut analyysi etnisyys, huomasimme, että Smad7 rs12953717 polymorfismi oli yhteydessä lisääntyneeseen syöpäriskiin sekä valkoihoisilla ja aasialaiset.

heterogeenisyys välillä tutkimuksissa on hyvin yleinen meta-analyysi geneettiset assosiaatiotutkimuksilla. Tutkimusten välisten heterogeenisuus havaittiin myös meidän meta-analyysi. Tilastollisesti merkitsevä Tutkimusten välisten heterogeenisyys genotyypin vaikutus todettiin kaikissa geneettisten mallien, kun kaikki voivat tutkimukset yhdistettiin osaksi meta-analyysi. Sen jälkeen alaryhmäanalyyseissa etnisyys ja syöpätyyppejä, heterogeenisyys on tosiasiallisesti poistettu tai vähentynyt. Siksi voidaan olettaa, että suhteellisen heterogeenisyys johtuu pääasiassa eroista alkuperään ja eri syöpätyyppeihin. Tiedetään, että genotyyppi jakaumat vaihdella eri populaatioiden ja genotyyppi-fenotyyppi yhdistykset voi riippua myös väestön kerrostumista. Lisäksi on olemassa joitakin tekijöitä, jotka olisivat voineet osaltaan kohti heterogeenisyys. Määritelmä kontrolliryhmän on erilainen eri tutkimuksissa, määritelmä erot valvonnan voinut myötävaikuttaa heterogeenisuus havaittiin meidän meta-analyysi. Yritimme selvittää, onko heterogeenisuus saattavat selittyä joitakin muuttujia kuten tupakointi asema, juominen tilan ja ympäristötekijöiden sisältyvät eri tutkimuksissa, mutta eivät pysty antamaan luotettavaa vastausta tähän kysymykseen, koska meillä ei ole pääsyä yksilötasolla tietoja näistä muuttujista. Kaikki edellä mainitut tekijät olisivat voineet osaltaan Tutkimusten välisten heterogeenisuus havaittiin meidän meta-analyysi ja erot tuloksissa tutkimuksista.

Nykyinen meta-analyysi on useita rajoituksia, jotka olisi huomattava. Ensiksi meidän haku rajoittui julkaistut tutkimukset indeksoitu lehdissä. Tämä voisi bias tuloksista tarkastelun kuten viivettä bias ja julkaisu bias. In viive bias [33], tutkimukset ”negatiiviset” tulokset kestää kauemmin julkaista, kun taas innostunut tulokset julkaistaan ​​paljon nopeammin. Julkaisussa bias [34], [35], pieniä tutkimuksia, joissa ”negatiiviset” tulokset eivät ole koskaan julkaistu, kun taas yhtä pieniä tutkimuksia, joilla on samanlaiset laatua, mutta ”positiivisia” tulokset näyttäisivät kirjallisuudessa. Toiseksi, ohjaus ei ole yhtenäinen. Non-ero Luokitteluvirheillä bias oli mahdollista, koska nämä tutkimukset ovat sisällyttäneet tarkastuksia, jotka todennäköisesti kehittyä syöpä seuraavina vuosina, vaikka heillä ei ollut kliinisiä oireita aikaan tutkimuksen. Kolmanneksi tulokset perustuivat oikaisemattomaan syrjäisimmillä alueilla, kun taas tarkempi arvio olisi otettava huomioon vaikutus useiden sekoittavien tekijöiden kuten iästä, tupakoinnista, juominen tila ja ympäristötekijät yhdistyksen. Tiedon puute tietojen analysointia voi aiheuttaa vakavia sekoittavia bias. Forthly, analyysimme rajattiin Aasian, Kaukasian ja sekoitetaan etnisten ryhmien, joten on epävarmaa, ovatko nämä tulokset ovat yleistettävissä muut populaatiot. Aasialaiset ja sekapopulaatioon määrä mukana tutkimuksissa oli rajallinen ja niiden otoskoot olivat pieniä. Sitä voidaan alitehoinen tutkia todellisia -alueella. Siten tutkimustuloksia on tulkittava varoen. Lisäksi meidän analyysi ei harkita mahdollisuutta geeni-geeni tai SNP-SNP vuorovaikutuksen tai mahdollisuutta kytkentäepätasapaino- välillä polymorfismien. Lisätutkimukset n haplotypic vaikutus geenin ja tutkimuksen useiden polymorfismien eri geeniä tarvitaan.

Johtopäätökset

Johtopäätöksenä meidän meta-analyysi paljasti, että rs12953717 polymorfismi Smad7 osallistuvien TGF-βsignaling polku oli merkitsevästi yhteydessä syöpäalttiutta. Rajoitusten vuoksi osoitti edellä tässä analyysissä, on tärkeää, että suurempi ja hyvin suunniteltu tutkimuksia tarvitaan vahvistamaan tuloksemme.

tukeminen Information

Kuva S1.

vuokaavio arviointiprosessia ja tulosten osallisuutta ja syrjäytymistä.

doi: 10,1371 /journal.pone.0058170.s001

(DOC) B Kuva S2.

Forest juoni syrjäisimpien alueiden 95% luottamusväli Smad7 rs12953717 polymorfismin ja yleistä syöpäriskiä (TT vs. CC).

doi: 10,1371 /journal.pone.0058170.s002

(PNG) B Kuva S3.

Forest juoni syrjäisimpien alueiden 95% luottamusväli Smad7 rs12953717 polymorfismin ja yleistä syöpäriskiä (TC vs. CC).

doi: 10,1371 /journal.pone.0058170.s003

(PNG) B Kuva S4.

Forest juoni syrjäisimpien alueiden 95% luottamusväli Smad7 rs12953717 polymorfismin ja yleistä syöpäriskiä (TT vs. TC + CC).

doi: 10,1371 /journal.pone.0058170.s004

(PNG) B Kuva S5.

Forest juoni syrjäisimpien alueiden 95% luottamusväli Smad7 rs12953717 polymorfismin ja yleistä syöpäriskiä (TT + TC vs. CC).

doi: 10,1371 /journal.pone.0058170.s005

(PNG) B Kuva S6.

Forest juoni syrjäisimpien alueiden 95% luottamusväli Smad7 rs12953717 polymorfismin ja yleistä syöpäriskiä (T vs. C).

doi: 10,1371 /journal.pone.0058170.s006

(PNG) B Taulukko S1.

syrjäisimmät alueet (95% CI) herkkyysanalyyseja Smad7 rs12953717.

doi: 10,1371 /journal.pone.0058170.s007

(DOC) B