PLoS ONE: kliinis ominaisuudet Potilaat, joilla on ei-pienisoluinen keuhkosyöpä Kuka Harbor EML4-ALK Fusion Gene: Meta-Analysis
tiivistelmä
Background
A novel fuusio geenin piikkinahkaisten mikrotubuluksiin liittyvä proteiini-like 4 (
EML4
) ja anaplastinen lymfooma kinaasia (
ALK
) on hiljattain tunnistettu ei-pienisoluinen keuhkosyövässä (NSCLCs). Potilaat, joilla on
EML4-ALK
-fuusiogeenin osoittaa ainutlaatuinen kliinis ja fysiologiset ominaisuudet. Tässä esittelemme meta-analyysi suuren mittakaavan tutkimuksia arvioimaan kliinis ominaisuudet NSCLC potilaiden kätkeminen
EML4-ALK
fuusio geeni.
Methods
Sekä Englanti ja Kiinan tietokantoja käytetään järjestelmällisesti etsimään materiaalit kliinis ominaisuuksien potilaiden NSCLC kätkeminen
EML4-ALK
fuusio geeni. Yhdistettiin suhteellinen riski (RR) arviot ja 95%: n luottamusväli (95% CI) laskettiin kiinteän tai satunnainen vaikutus malli. Julkaisu bias ja chi-neliö testi laskettiin myös.
Tulokset
27 takautuva tutkimuksia mukana meidän meta-analyysi. Näihin tutkimuksiin osallistui yhteensä 6950 potilasta. Esiintyvyys on
EML4-ALK
fuusio NSCLC potilaiden havaittiin olevan 6,8% (472/6950). Korrelaatio on
EML4-ALK
fuusio geenin ja kliinis ominaisuudet NSCLC potilailla osoitti merkittävää eroa tupakointistatus, histologiset tyypit, vaihe, ja etnisiä piirteitä. Positiivinen nopeus
EML4-ALK
fuusio geenin ilmentyminen naisilla oli hieman suurempi kuin miehillä, mutta ei merkittävästi (
P
= 0,52). Lisäksi
EML4-ALK
fuusio geeni toisensa poissulkevia, että
EGFR
ja
KRAS
mutaatio geenien (
P
= 0,00).
Johtopäätös
yhdistettiin analyysi paljasti, että
EML4-ALK
fuusio geeni havaittiin etupäässä adenokarsinoomaa, savuton ja NSCLC potilaat, etenkin diagnosoitu pitkälle kliinisessä vaiheessa NSCLC. Lisäksi
EML4-ALK
fuusio geeni ilman
EGFR
ja
KRAS
mutaatio geeneihin. Me otaksua, että IHC määritys on arvokas väline prescreening potilaalla on
ALK
-fuusiogeenin kliinisessä käytännössä, ja FISH määritys voidaan suorittaa kuin vahvistus menetelmällä. Nämä näkemykset voivat olla hyödyllisiä ohjaamisessa sopiva molekyylikohteena hoito NSCLC.
Citation: Zhao F, Xu M, Lei H, Zhou Z, Wang L, Li P, et al. (2015) kliinis ominaisuudet Potilaat, joilla on ei-pienisoluinen keuhkosyöpä Kuka Harbor
EML4-ALK
Fusion Gene: meta-analyysi. PLoS ONE 10 (2): e0117333. doi: 10,1371 /journal.pone.0117333
Academic Editor: Ramon Andrade de Mello, Algarven yliopisto, PORTUGALI
vastaanotettu: 6. kesäkuuta, 2014; Hyväksytty: 20 joulukuu 2014; Julkaistu: 23 helmikuu 2015
Copyright: © 2015 Zhao et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään
Data Saatavuus: kaikki asiaankuuluvat tiedot kuuluvat paperin ja sen tukeminen Information tiedostoja.
Rahoitus: Tämä tutkimus tukivat National Natural Science Foundation of China (81273814). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.
Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.
Johdanto
Keuhkosyöpä on yleisin syöpä ja johtava syy syöpään liittyvien kuolemien maailmanlaajuisesti [1]. Huolimatta parannuksista terapeuttisia menetelmiä, mukaan lukien kirurgia, kemoterapiaa ja sädehoitoa, keskimääräinen ennuste keuhkosyöpä on edelleen epätyydyttävä ja viiden vuoden pysyvyys on vain 15% [2]. Niistä keuhkosyöpäpotilaita, ei-pienisoluinen keuhkosyöpä (NSCLC) osuus on noin 80% -85% keuhkosyöpää tapauksissa [3]. Perinteisesti kliininen patologinen vaiheessa on tärkeää järjestelmän ennustamaan eloonjäämisaste potilaiden [4]; uusi keksintö uusien molekyylien signaalin muutoksia voi myös olla mukana määritellään terapiassa, joka voi osoittautua tehokkaammaksi ja vähemmän sivuvaikutuksia kuin tavanomainen hoito.
Lisääntynyt huomiota on kerännyt kehittämisessä ja soveltamisessa lääkkeitä, jotka kohdistuvat tiettyihin molekyylejä, jotka ilmentyvät NSCLC soluissa ja suuri menestys on raportoitu NSCLC potilaiden opintoryhmiin [5,6]. Näitä menetelmiä ovat signalointi transduktion ja angiogeneesin inhibiittorit, kuten epidermaalisen kasvutekijän reseptorin (
EGFR
) kohdennettuja lääkkeitä [7]. Siksi avaimen tunnistus ontogeny syövän oli ratkaiseva askel kehitettäessä molekyylitason kohdentamisaineita.
Vuonna 2007 fuusio piikkinahkaisten mikrotubuluksiin liittyvä proteiini-like 4 (
EML4
) geenejä anaplastinen lymfooma kinaasin (
ALK
) todettiin keuhkosyöpä [8]. Fuusio N-terminaalinen puoli on
EML4
ja solunsisäinen kinaasidomeenia
ALK
sisällä kromosomin 2p johtaa ekspressio kimeeristen tyrosiinikinaasi [9].
EML4-ALK
-fuusiogeenin hallussaan voimakas kriittistä biologista aktiivisuutta in vitro ja in vivo, kuten solujen lisääntymisen, apoptoosin ja etäpesäkkeiden [10], joka on tehokkaasti estänyt
ALK
kinaasi estäjä (Crizotinib) [11], joka soveltuu sivuosassa varten
EML4-ALK
-fuusiogeenin keuhkojen kasvaimien syntyyn. Tunnistamaan potilaat hyötyvät todennäköisesti Crizotinib, on tarpeen kehittää ja tehokasta diagnostinen algoritmi tunnistaa
EML4-ALK
-fuusiogeenin kun seulonta potilaiden hoidon Crizotinib. Tällä hetkellä seuraavat kolme menetelmiä käytetään havaitsemaan
EML4-AL
K fuusiogeenin, joka sisältää: fluoresenssi in situ -hybridisaatio (FISH), käänteistranskriptaasi-polymeraasiketjureaktiolla (RT-PCR) ja immunohistokemiallinen (IHC ). Kuitenkin paras algoritmi seulomiseksi
EML4-ALK
-fuusiogeenin kliinisissä keuhkosyöpä populaatioiden Vielä on selvitettävä, koska kolme menetelmiä edellä kuvattujen on erilaiset edut ja haitat. Parantaa havaitsemisen tehokkuutta kolmen menetelmiä, tutkimme jos yhdistetään kliinis ominaisuudet NSCLC kanssa
EML4-ALK
-fuusiogeenin antaisi hyödyllistä tietoa tehokkaan Esilajittelun potilaiden kanssa
EML4 alk
-fuusiogeenin kliinisessä käytössä.
Vaikka lukuisia tutkimuksia potilaista kätkeminen
EML4-ALK
-fuusiogeenin osoitetaan yksilöllinen kliininen fysiologisia ja patologisia ominaispiirteitä [12], yksityiskohtainen kliinis profiilit ovat edelleen epäselviä koska pieni määrä tapauksia tunnistettu. Korreloida
EML4-ALK
fuusio geenin kanssa NSCLC profiilin (mukaan lukien tupakointi, sukupuoli, kasvaimen tyyppiä, vaihe ja etnisiä piirteitä) ja selvittämään suhde
EML4-ALK
kanssa
EGFR
ja
KRAS
mutaatioita, suoritimme esillä meta-analyysi 6950 potilasta 27 tutkimuksista.
Methods
Haku strategia
sähköisten hakujen tehtiin vasta huhtikuussa 2014 ja mukana eri lähteistä, kuten MEDLINE, EMBASE tietokannat, Elsevier Science Direct, ISI Web of Science, China National Knowledge Internet, Kiina Biology Medical Literature tietokanta, ja tietokanta Kiinan tieteellisen ja teknisen Lehdet. Ei kieli rajoituksia sovellettiin. Avainsanat olivat seuraavat: ”ei-pienisoluinen keuhkosyöpä tai NSCLC”, ”piikkinahkaiset mikrotubuluksiin liittyvä proteiini-kaltainen 4 tai
EML4
”, ”anaplastinen lymfooma kinaasia tai
ALK
”, ”fuusio geeni”, ”fysiologiset ja patologiset ominaisuudet”. Haimme viiteluettelot asiaan arvosteluja, pääkirjoitukset, tutkimukset, kokous- tiivistelmiä ja kirjaimia. Käytimme Sciences Citation Index ylittämään viittaus jatkotutkimuksiin että täytti kelpoisuusvaatimukset.
Tutkimus valinta
Tutkimuksissa sisälly tähän meta-analyysin mukaan meidän ennalta määrättyjen kriteerien ovat seuraavat: ( 1) kokeet, jotka sisältävät koko tekstin julkaistussa vertaistarkistetuissa Englanti ja kiina lehtiä tai raportteja esittelysarjoilla tärkeissä onkologian kokouksissa; (2) arviointi assosiaatioita
EML4-ALK
fuusio geenin ja kliinis ominaisuuksia pienisoluista keuhkosyöpää; (3) samankaltaisuutta patients’baseline ominaisuudet.
Data louhinta ja laadun arviointiin
Kaksi arvioijat (Zhao ja Lei) itsenäisesti kerätyt tiedot standardin protokollaa. Seuraavia kriteereitä asetettiin seulomaan artikkeleita, jotka olivat hyväksyttäviä tutkimuksemme: (1) ilmaus
EML4-ALK
fuusio geeni arvioitiin ensisijainen keuhkosyövän kudosta verrattuna metastaattisen kudokseen; (2), jota käytetään laitteen
EML4-ALK
fuusio geenien ilmentyminen, mukaan lukien IHC, kalaa tai RT-PCR; (3) histologinen tyyppi kasvainten oli ei-pienisoluisen keuhkosyövän; (4) vertaaminen riskisuhde (RR) ja sen luottamusväli (CI) potilailla, jotka satama
EML4-ALK
fuusio geenin yli ilmentyminen ja vastineet kuvattiin tai tilastollisesti uutettavissa tiedot artikkelissa ; (5), kun useita artikkelia samojen tekijöiden tai ryhmiä, kaikkein informatiivinen tai uusin single artikkeli on valittu. Tutkimukset arvioitiin kanssa Downs ja musta laadun arviointimenetelmä [13]; (6) mahdolliset erimielisyydet ratkaistiin keskustelun ja konsensuksen ylimmän tutkija (Xu).
Tilastollinen ja Herkkyysanalyysi
Tämä meta-analyysi suoritettiin RevMan 5.2 ohjelmisto. Tilastolliset laskelmat käytettiin SPSS (versio 17.0 SPSS Inc., IL, USA). Suhteellinen riski (RR) ja keskimääräinen ero 95%: n luottamusväli (95% CI) laskettiin jatkuvasti tuloksia ja dikotominen tuloksia, vastaavasti. P 0,05 pidettiin merkittävä ero arvon kahden ryhmän välillä. I
2 tilastoa käytettiin tutkimaan heterogeenisuus tutkimuksissa. Heterogeenisuus oli selvittävät I
2 ja χ
2, I
2 50% ilmoitti pieni epäjohdonmukaisuus ja I
2 50% osoitti suurta epäjohdonmukaisuutta. Kun oli tilastollista eroa kannalta heterogeenisuus (I
2 50%), random-vaikutus mallia käytettiin koota tietoja; Muuten kiinteän efektimalli valittiin.
Julkaisu bias
julkaisu bias ennustamisesta voimme visuaalisesti seurata merkittäviä tilastollisesti symmetrinen eroja, mukaan suppiloon juoni.
tulokset
kuvaus Studies
27 takautuva kohorttitutkimusten samaan aikaan meidän kriteerit ja sisältyvät tähän meta-analyysiin. Kaikkiaan 6950 potilasta sisällytettiin 27 tutkimuksissa, joista 24 (5130 tapausta) arvioi yhdistyksen fuusio
EML4-ALK
geenin NSCLC kanssa tupakointianamneesista; kun taas 17 tutkimukset korosti yhdistys
EML4-ALK
uudelleenjärjestely kudosten tyypit (3360 tapausta); 13 paperit heijasti suhdetta
EML4-ALK
-fuusiogeenin kliinisen vaiheen (2876 tapausta) ja 26 tutkimukset osoittivat yhdistyksen tämän fuusio geenin ja sukupuolten potilaiden (5797 tapausta). Voit etsiä algoritmi, tulokset valintaperusteet ja hakustrategioita on esitetty kuvassa. 1, ja ominaisuudet potilaiden ja havaittujen menetelmien
EML4-ALK
fuusiogeenin on esitetty taulukossa 1.
Direct meta-analyysi ja yhdistettiin tulokset
Meta-analyysi kirjallisuuden paljasti 27 julkaisut, johon kuului 6950 pienisoluista keuhkosyöpää; 472 näistä potilaista (6,8%) kanna
EML4-ALK
fuusiogeenin. 24 tehdystä tutkimuksesta 27 dokumentoituja korrelaatio tupakoinnin historiaa ja
EML4-ALK
fuusio geeni. Emme ole havainneet merkittävää harhaa kahden ryhmän välillä (P = 0,16 I
2 = 23%), kun kiinteiden vaikutusten mallia käytettiin. Yhdistetyt Tulos on esitetty kuviossa. 2A. Verrattuna tupakointia tapauksissa tupakoimattomien NSCLC on tilastollisesti merkitsevä suurempi riski läsnäollessa
EML4-ALK
fuusio geeni (12,6% vs. 3,4%, RR = 3,41, 95% CI, 2,72-4,27
P
0,01). 17 Tutkimuksissa arvioitiin
EML4-ALK
fuusio geenin adenokarsinoomaa ja ei-adenokarsinooma ryhmiä, ja heterogeenisuus oli tunnistettavissa kautta 16 raportit (
P
= 0,26 I
2 = 17%) . Sitten tiedot analysoitiin käyttämällä kiinteiden vaikutusten malli. Tulokset osoittivat, että
EML4-ALK
fuusio taajuus on suurempi adenokarsinooma ryhmässä kuin ei-adenokarsinooma ryhmä (11,2% vs. 3,3%, RR = 2,30, 95% CI, 1,60-3,31,
P
0,01) kuvassa. 2B. 13 tutkimukset ilmaisivat yhdistyksen välillä kasvaimen vaiheen ja
EML4-ALK
fuusio geeni. Ei ole mitään merkittävää harhaa välillä vaiheen I-II ja III-IV (
P
= 0,57 I
2 = 0%); siksi, tiedot analysoitiin käyttämällä kiinteiden vaikutusten malli. Tuloksemme viittaavat siihen, että oli tilastollisesti merkittävää kasvua taajuus
EML4-ALK
mutaatiot III-IV kuin vaiheen I-II (8,2% vs. 4,0%, RR = 0,52, 95% CI, ,38-+0,72,
P
0,01) kuvassa. 2C. Lisäksi 26 Näistä 27 tutkimukset dokumentoitu
EML4-ALK
fuusio naisten ja miesten ryhmissä. Emme ole havainneet merkittävää harhaa kahden ryhmän välillä (
P
= 0,08
I
2
= 30%) ja analysoi dataa kiinteiden vaikutusten malli. Tuloksemme viittaavat siihen, että ei ollut merkitsevää eroa miesten ja naisten ryhmiä. (7,6% vs. 6,3%, RR = 1,06, 95% CI, 0,89-1,27, p = 0,52) kuvassa. 2D.
(A tupakoitsijat vs. no-tupakoitsijoita; B adenokarsinooman vs ei-adenokarsinooman; C vaiheissa I-II vs. vaiheiden III-IV; D mies vs nainen). Forest juoni Suhteellinen riski (RR) on kliinis ominaisuuksien kanssa
EML4-ALK
fuusio geenin potilaille. RR arvio kunkin yksittäisen oikeudenkäynnin vastaa keskelle neliöt ja vaakasuora viiva antaa 95%: n luottamusväli. Jokaisella rivillä, numerot tapahtumia edustettuina jakeet kokonaismäärästä; satunnainen valintoja näkyvät molemmissa hoitoryhmissä. Kunkin alaryhmä, summa tilastojen yhteenvedon kanssa RR edustaa keskellä umpinaiset. Testi heterogeenisuuden välisten kokeiden osamuodostelmassa on annettu alla esitetään tilastotiedot.
Myös laajentaneet tutkimuksen suorittamiseen kolmea menetelmää (FISH, RT-PCR ja IHC) suoraa vertailua herkkyys ja spesifisyys. Niistä 3813 potilaista FISH tutkimuksessa 336 potilasta (8,8%,) todettiin
EML4-ALK
uudelleenjärjestelyn. Niistä 5236 potilasta, 280 (5,3%) oli merkittävästi positiivisia havaitseminen RT-PCR: llä. Kaikkiaan 2688 potilasta oli menestyksekäs IHC värjäystä havaitseminen
EML4-ALK
fuusio ilmaisun ja 191 potilasta kanna
EML4-ALK
fuusio geenin (7,1%) taulukossa 2.
tässä analyysissä, 27 tutkimukset arvioitiin
EML4-ALK
fuusio geenin eri etnisyys ryhmissä. Ero fuusio hinnat Aasian ja ei-Aasian väestöstä oli huomattava; oli 6950 potilasta valitaan 27 satunnaistettua tutkimusta, 4906 Aasian ja 2044 ei-aasialaisilla. Potilaat ei-Aasian etnisyys ryhmillä oli korkeampi mutaatiovauhdin kuin Aasian etnisyys ryhmissä (8,5% vs. 6,1% χ
2 = 12,80 P = 0,00) taulukossa 3.
Oli 694 potilasta, joilla
EGFR
mutaatioita ja 107 potilasta, joilla
KRAS
mutaatioita. Lisäksi oli 214 potilasta, joilla
EML4-ALK
fuusio geenin, jotka esitetään taulukossa 4. 199 potilaalla satama
EML4-ALK
-fuusiogeenin oli villin tyypin
EGFR
ja
KRAS
. Tilastollinen analyysi osoitti merkittävän yhdistys
EML4-ALK
fuusio geenin villityypin
EGFR
(
P
= 0.00 McNemar testi) ja
KRAS
(
P
= 0.00 McNemar testi). Siitä huolimatta, tunnistimme 15
EML4-ALK
fuusio pienisoluista keuhkosyöpää tutkimuksessamme joka osoitti rinnakkain olemassa mutaatioita
EGFR
taulukossa 4.
Julkaisu Bias
Julkaisu bias voi olla olemassa, kun ei-merkittäviä havaintoja jäisivät julkaisematta. Begg n suppilo juoni tehtiin arvioimaan mahdollisten julkaisu harha kaikissa kirjallisuudessa. Kuten on esitetty kuviossa. 3, symmetrinen muoto suppilon tontteja ei paljasta mitään todisteita julkaisun puolueellisuudesta.
(tupakoitsijat vs. tupakoimattomien; B adenokarsinooman vs ei-adenokarsinooman; C vaiheissa I-II vs. vaiheiden III-IV; D mies vs nainen).
keskustelu
mukaan kasvain ominaiset biologiset ominaisuudet, molekyylirakennetta suunnattu hoitoja osoittivat äskettäin uuden strategian, joka osoitti, että on tärkeää pienten alaryhmä potilaista.
EML4-ALK
fuusio geeni edustaa uutta alaryhmä NSCLC potilaat reagoivat myönteisesti ALK estäjien [11].
Tällä hetkellä kattavin meta-analyysi koskien kliinistä ominaisuudet
EML4-ALK
fuusio geeni tehtiin tutkimuksessamme. Olemme täysin analysoitu 6950 tapauksia 27 artikkeleita. Meidän havainnot osoittivat esiintyvyys on alhainen (6,8%) ja
EML4-ALK
translokaatio joukossa valitsematta pienisoluista keuhkosyöpää; tämä osoittautui yhdenmukaisia aiempien raporttien (1,4% ~ 11,6%) [16,17,20]. Koska esiintyvyys
EML4-ALK
on alhainen pienisoluista keuhkosyöpää, on välttämätöntä selvittää kliinis ominaisuudet
EML4-ALK
fuusiogeenin-positiivisia keuhkosyöpä parantaa seulonta tehokkuutta. Tuloksemme osoittivat, että
EML4-ALK
fuusio geeni esiintyi pääasiassa savuton, adenokarsinooma potilaat, vaikka tilastollista eroa löytynyt mies- ja naispotilaiden. Todennäköinen tulkinta tästä ilmiöstä on, että adenokarsinooma osuus on merkittävä osa naispotilaiden jotka harvoin tupakoi. Edellä esitetty osoitti, että
EML4-ALK
fuusio geenin liittyvän syövän synnyn saattaa olla erilainen kuin kroonisen tulehduksen aiheuttama tupakoinnin tai tuberkuloosi [41]. Siksi uskomme, että kliinisiä piirteitä, kuten tupakointi, ja adenokarsinooma, tulisi käyttää valitsemaan potilaiden
EML4-ALK
fuusio geenin seulonta.
Samalla huomasimme, että esiintyvyys EML4-ALK fuusio III-IV potilaista oli hieman korkeampi kuin vaiheen I-II potilailla. Ehdotamme, että NSCLC potilaita on valmis
EML4-ALK
fuusio havaitseminen ennen ALK molekyyli- estäjä hoitoa. Lisäksi tämä epätasapainoinen vaiheessa jakelu voinut johtuen saatavuudesta tuore kudosten RT-PCR, joka on todennäköisempää toiminnallisessa potilailla (vaihe I ja III), mutta vaikea vaihe II ja IV potilaat. Kuitenkin ilmaantuvuus
EML4-ALK
uudelleenjärjestelyihin vaiheen III potilaat olivat korkeammat kuin muissa vaiheissa [25,42,43]. Vuonna Takamochi tutkimuksessa, osuus imusolmuke osallistuminen
EML4-ALK
fuusio geeni-positiivinen adenokarsinooma oli huomattavasti yleisempää kuin negatiivinen vastine [34]. Mukaan Paik raportin,
EML4-ALK
fuusio geeni-positiivinen adenokarsinooman voi etäispesäkkeitä imusolmukkeisiin [44], ja Vincent kertoi, että
EML4-ALK
fuusio geeni-positiivisia kasvaimia yleensä imusolmukkeiden solmu ja aivometastaaseja [45]. Kaikki havainnot edellä olivat mahdollisesti mukana päättämässä miksi fuusio geeni useammin nähty kehittyneen NSCLC.
Tällä hetkellä useat menetelmiä käytetään havaitsemiseksi
EML4-ALK
fuusio, kuten FISH, RT-PCR ja IHC. Meidän meta-analyysissä, positiivinen nopeus FISH, RT-PCR ja IHC oli 8,8%, 5,3% ja 7,1% tässä järjestyksessä. Tarkka ja luotettava menetelmä havaitsemiseksi
EML4-ALK
fuusio on ratkaiseva valittaessa NSCLC potilaille, jotka ovat ehdolla hoidon
ALK
estäjiä. Vaikka FISH määritystä on käytetty tunnistaa potilaat, joilla
EML4-ALK
-fuusiogeenin kliinisissä tutkimuksissa, kultakantaan menetelmä määrittämiseen
EML4-ALK
fuusio geeni ei ole vahvistettu. Meidän tutkimus osoitti, että suosittu, jota käytetään laitteen
EML4-ALK
fuusio geeni ovat FISH ja RT-PCR. Teoriassa RT-PCR ja FISH kaksi lähestymistapaa havaitsemiseksi geenien fuusio; kuitenkin, molemmat ovat merkittäviä rajoituksia kliinisessä työssä. RT-PCR tarvitaan tuoretta kudosnäytteiden RNA ja luotettava FISH määritys vaaditaan hyvä fluoresenssi laajuus ja teknistä asiantuntemusta. IHC testaamiseen
EML4-ALK
fuusio on vakiintunut menetelmä, varsinkin kun kustannukset IHC on paljon pienempi kuin FISH. Joten IHC voisi olla paljon helpompaa ja kustannustehokkaampaa seulontamenetelmä
EML4-ALK
fuusio geenin pienisoluista keuhkosyöpää [41]. Koska RT-PCR-menetelmää ei saa tunnistaa uusia uudelleenjärjestelyjä, joihin aiemmin tuntemattomia EML4-ALK versioiden tai tuntematon fuusiokumppanit ja sen prosessi voidaan helposti saastuneita, sen herkkyys ja spesifisyys ovat vielä validoitu [35]. IHC on vahvuuksia ovat laajasti saatavilla, suhteellisen helppo tehdä ja säilyttää morfologinen tieto, joka mahdollistaa varmoja arvioida poikkeavan geenien kasvainsoluissa. Useita ALK vasta, raportoitu viimeaikaiset tutkimukset osoittavat, että IHC on korkea yhteensopivuutta FISH. Täten nämä tulokset viittaavat siihen, että rutiini käytännössä IHC määritys on väline arvon prescreening sairastavien potilaiden ALK -fuusiogeenin kliinisessä käytännössä, ja FISH määritys voidaan suorittaa kuin vahvistus menetelmällä. Tämä on yhdenmukaista aikaisempien raporttien [34,35,46].
On huomattava, että ensimmäistä kertaa tutkimuksissamme olemme todenneet, että
EML4-ALK
-fuusiogeenin esiintyi enemmän usein ei-Aasian potilaille, toisin kuin niiden aasialainen vastine; tämä tarkoittaa, että esiintyvyys
EML4-ALK
fuusio ei-Aasian väestöstä on korkeampi kuin muissa etnisissä ryhmissä. Tämä tulos osoittaa, että
EML4-ALK
fuusio voi liittyä ei-Aasian etnisyys, toisin kuin
EGFR
mutaatioita, jotka liittyvät aasialaiset. Wu raportoi äskettäin, että joukossa NSCLC potilaalla, joiden päiväys etnisyyteen ja varianttitaudista tiedot
EML4-ALK
fuusio geenin variantti 3 (52,3%) oli yleisin Kiinan väestöstä, kun taas variantti 1 ( 75,7%) oli yleisintä Kaukasian väestöstä [47]. Nämä tulokset osoittivat lisäksi, että esiintyvyys
EML4-ALK
fuusio geeni voi vaihdella kesken eri etnisten ryhmien välillä.
Vaikka
EML4-ALK
fuusio ja
EGFR
mutaatiot aiemmin raportoitu olevan toisensa poissulkevia, useat tutkimukset ovat osoittaneet, että
EML4-ALK
uudelleenjärjestelyjä voi esiintyä samanaikaisesti
EGFR
mutaatioita [48,49]; kuitenkin, nämä voivat olla harvinaisia tapahtumia. Tuloksemme osoittivat, että on olemassa 15 (15/6950) potilaista, jotka kanna samanaikaista
EML4-ALK
fuusio ja
EGFR
mutaatioita. Lisäksi vertailussa
EML4-ALK
järjestelynä
KRAS
mutaatiot samassa NSCLC näytteistä paljastui, että
EML4-ALK
fuusio geeni toisensa poissulkevia, että
KRAS
mutaatioita. Siksi porrastetusti valita -geenimutaatiotesti NSCLC ehdotetaan: ensin
KRAS
, sekunti
EGFR
,
EML4-ALK
translokaatio, ja sitten samanaikaisesti
EML4-ALK
fuusio ja
EGFR
mutaatioita. Jos potilas on positiivinen
KRAS
mutaatio, enää molekyyli- testausta tarvita. Hoito lähestymistapa keskittyy kemoterapiaa, kuten kasvaimissa, joissa somaattiset mutaatiot
KRAS
, joka koodaa GTPaasina myötävirtaan
EGFR
, näyttelytila suuremman vastuksen kohdennettuja lääkkeitä. Jos potilas on negatiivinen
KRAS
mutaatiot, on välttämätöntä seuloa
EGFR
mutaatioita ja
EML4-ALK
fuusiogeenin. Positiivinen tulos joko osoittaa molekyyli- hoitoon käytetään
EGFR
tyrosiinikinaasin estäjät (TKI) tai
ALK
estäjä. Kun potilaat satama samanaikainen
EML4-ALK
fuusio ja
EGFR
mutaatioita, hoitostrategioita voi olla apua, koska tämä alaryhmä on tietty genotyyppi dual terapeuttisen tavoitteita. Kuten Yang raportissa [40], testaus suhteellinen fosforylaation tasoja
EML4-ALK
ja
EGFR
voisi auttaa ohjaamaan valintaan
ALK
estäjän tai
EGFR
-TKIs kliinisessä käytössä.
Johtopäätös
analyysi osoitti, että
EML4-ALK
positiivisten NSCLC käsitti ainutlaatuinen alaryhmä adenokarsinoomien erottuva kliinis ominaisuuksia. Olemme myös, että
EML4-ALK
fuusio oli toisensa poissulkevia EGFR-mutaatio
KRAS
mutaatioita. Verrattuna ei-
EML4-ALK
-positiivinen NSCLC, tämä ryhmä on merkittävästi rikastettu savuttomia potilaalla on adenokarsinooma. Positiivinen nopeus
EML4-ALK
fuusio geenin ilmentyminen naisilla oli hiukan suurempi kuin miehillä, mutta ei merkittävästi. Nämä potilaat tyypillisesti läsnä loppuvaiheissa, josta ei voida nostaa kirurgiseen resektio. Siksi molekyylikohteena hoito että tavoite
EML4-ALK
fuusioproteiini olisi tehokas, uusia terapeuttisia menetelmä. Tutkimuksemme ovat
EML4-ALK
fuusio perustuu ainutlaatuiseen kliinis ominaisuuksia. Lisäksi HC määritys on väline arvon prescreening sairastavien potilaiden ALK -fuusiogeenin kliinisessä käytännössä, ja FISH määritys voidaan suorittaa vahvistus menetelmällä.
tukeminen Information
S1 PRISMA tarkistuslista.
doi: 10,1371 /journal.pone.0117333.s001
(DOC) B