Krooninen sairaus

tiivistelmä

Johdanto

MikroRNA (miRNA) ovat tärkeä sääntelytehtävistä soluprosesseissa ja ovat osoittaneet lupaavia potentiaali ennustetekijöitä markkereina taudin lopputuloksen syöpäpotilailla. Tavoitteena tässä tutkimuksessa oli löytää miRNA ekspressioprofiileja kokoveressä jotka olivat ennustetekijöitä yleisen (OS) metastasoituneen kolorektaalisyövän (metastasoitunutta kolorektaalisyöpää) Setuksimabihoitoa saaneilla ja irinotekaanin.

Methods

Vuodesta 138 potilasta metastasoituneen kolorektaalisyövän 3

rd hoitona setuksimabin ja irinotekaanin prospektiivisessa faasi II tutkimus, 738 esikäsittely miRNA eristettiin ja profiloitu kokoverestä käyttäen TaqMan MicroRNA Array v2.0. Mutaatio asema

KRAS, BRAF, ja PI3KCA

tunnettiin.

Tulokset

Kun Bonferroni säätö, 6 miRNA: (miR-345, miR-143, miR-34a *, miR-628-5p, miR-886-3p ja miR-324-3p), havaittiin liittyy lyhyeksi OS. miR-345 oli vahvin ennustetekijöiden miRNA, merkittävä koko kohortin ja ei-

KRAS

mutanttipopulaation. miR-345, jatkuvana muuttujana koko kohortin johti riskisuhde (HR) 2,38 per IQR (CI 95%: 1,8-3,1,

P

-arvo = 2.86e-07, Bonferronin oikaistu, univariable analyysi) ja HR = 1,75 IQR (CI 95%: 1,24-2,48,

P

-Wald = 1.45e-03) on monimuuttuja analyysiin oikaistu sukupuolen, iän, KRAS, PI3KCA ja suorituskyky tila. miR-345 oli ennustetekijöiden in ilman taudin etenemistä (PFS), jossa HR = 1,63 per IQR (CI 95%: 1,25-2,114,

P

-Wald = 2.92e-4) on monimuuttuja analyysiin. Lisäksi korkea miR-345 ilmentyminen liittyi puute vaste setuksimabihoidon ja irinotekaanin.

Johtopäätös

tunnistettu miR-345 kokoveressä mahdollisena biomarkkeri kliinisistä tuloksista. MiR-345 oli yksi ennustetekijöitä biomarkkereiden sekä käyttöjärjestelmän ja PFS kaikilla potilailla ja myös ei-

KRAS

mutanttipopulaation.

Citation: Schou JV, Rossi S, Jensen BV, Nielsen DL, Pfeiffer P, Høgdall E, et ai. (2014) miR-345 in metastasoitunut kolorektaalisyöpä: noninvasiivinen biomarkkeri kliinistä tulosta Non-KRAS Mutant hoidetuista potilaista 3

rd Line Setuksimabia ja irinotekaanin. PLoS ONE 9 (6): e99886. doi: 10,1371 /journal.pone.0099886

Editor: Pierre Busson, Gustave Roussy, Ranska

vastaanotettu: 03 helmikuu 2014; Hyväksytty: 20 toukokuu 2014; Julkaistu: 18 kesäkuu 2014

Copyright: © 2014 Schou et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat avustuksia Toimikunta at Herlev Hospital, Tanskan sisäasiainministeriö ja terveysministeriön, Merck-Serono Tanska /Ruotsi, ja Euroopan unionin seitsemännen puiteohjelman [FP7 /2007-2013] avustussopimuksen no 222916 (annettu MK). ST on vanhempi kliininen tutkija on tieteellisen tutkimuksen rahasto Flanders ja tukee Belgian National Cancer Plan. ST ja SR tukee myös Säätiön Fournier-Majoie, FFMI, Belgia. MD tukee osittain Sveitsin National Science Foundation (SNF, https://www.snf.ch/E/; Grant nro 320030_135421); Krebsforschung Schweiz (KFS, https://www.krebsforschung.ch/; Grant nro 02697-08-2010); ja jonka Fondation Medic. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: MK työskentelee AROS Applied Biotechnology. Yhtiöllä ei ole mitään taloudellisia etuja ja patentteja mukana tässä julkaisussa. Tämä ei muuta tekijöiden noudattaminen PLoS One politiikkaa jakaa tietoja ja materiaaleja.

Johdanto

peräsuolen syöpä (CRC) on 3

rd yleisin syöpä maailmassa. Kaksikymmentä prosenttia potilaista diagnosoidaan CRC on etäpesäkkeitä ja lisäksi 30-35% kehittyy etäpesäkkeitä myöhemmin aikana heidän sairautensa [1], [2].

Setuksimabia, IgG1 monoklonaalinen vasta-aine kohdistuu epidermaalisen kasvutekijän (EGFR), on osoittanut tehoa kemoterapiaan yhdistettynä metastasoituneen kolorektaalisyövän (metastasoitunutta kolorektaalisyöpää), vaikka ei potilailla, joilla

KRAS

mutaatioita, [3], [4], joka nähdään noin 40% potilaista, joilla CRC. Kuitenkin vain potilasryhmässä, jossa

KRAS

villityypin (wt) hyötyvät setuksimabi. Näin ollen on olemassa suuri tarve tunnistaa uusia biomarkkereita hoitovaste setuksimabista alaryhmässä potilaiden metastasoituneen kolorektaalisyövän ja

KRAS

.

Viime vuosina on ollut nopeasti kasvava kiinnostus MikroRNA (miRNA) mahdollisina uusia biomarkkereita syöpäpotilailla. MiRNA ovat pieniä endogeenisten ei-koodaavat RNA: t, joissa 19-22 nukleotidin geenin ilmentymisen säätelemiseksi tällä posttranskriptionaalisella tasolla. Tähän mennessä yli 2000 ihmisen miRNA sekvenssit on tunnistettu, ja määrä kasvaa [5]. MiRNA on tärkeitä sääntelytehtävistään perus- solun prosesseihin ja toimivat oncogenes ja kasvaimen synnyssä [6]. MiRNA ovat osallisina syövän alttiuden, kehittymisen ja etenemisen kautta geenin vapauttamisen ja /tai yhden emäksen monimuotoisuus. MiRNA on syöpä asetus voidaan luokitella sen perusteella, niiden päätehtävää: oncomir, metastamir, apoptomir, hypoxamir ja angiomir.

Kiertävä miRNA voidaan helposti kerätä ja

näyttää erittäin vakaa ankarissa olosuhteissa, pitkä säilytysaika ja toistuvassa jäädytys-sulatus syklien.

[7]

,

[8]

lisäksi

verinäytteestä on helpompaa ja vähemmän invasiivisia potilailla kuin koepala.

lisäksi ottaa diagnostista potentiaalia, [9], [10], [11], tiettyjen miRNA on osoitettu olevan prognostinen. Seerumin miR-141 ehdotettiin ennustetyövälineenä biomarkkeri potilaalla on CRC [12] ja seerumin miR-21 kuin ja ennustavia biomarkkereiden CRC. [13]

tavoitteena esillä mahdollisille biomarkkereiden oli arvioida, onko profiilien

miRNA kokoveressä olivat ennustetekijöitä yleisen eloonjäämisen ja potilaan kliinisen potilailla metastasoituneen kolorektaalisyövän ennen 3

rd linja setuksimabihoidon ja irinotekaanin.

Methods

potilaat ja hoito

Prospektiivisessa faasi II tutkimus suunniteltu arvioimaan tehoa setuksimabin ja irinotekaanin kuin 3

rd hoitona potilailla, joilla on metastasoitunutta kolorektaalisyöpää, esikäsittelyyn kokoverta miRNA ilmaisuja mitattiin 143 potilasta. Kaikki potilaat olivat resistenttejä 5-FU, oksaliplatiinia ja irinotekaania ja käsiteltiin irinotekaania (180 mg /m

2) ja setuksimabi (500 mg /m

2) joka toinen viikko [14]. Potilaat olivat mukana kolmesta Tanskan sairaalat lokakuusta 2006 lokakuussa 2008 ja hoitoa taudin etenemiseen asti ja seurannut, kunnes kuolema tai 1. syyskuuta 2012.

Ethics lausunto

Kaikkia potilaita kunhan kirjallinen lupa, ja tutkimuksen hyväksyi alueellisen eettisen komitean Tanskan kansallinen komitea Health Research Ethics (VEK viite. KA-20060094, www.cvk.sum.dk).

KRAS

,

BRAF

ja

PI3KCA

mutaatiostatus

Vuodesta kaikilla potilailla, formaliinilla parafiiniin (FFPE) kudosblokeista edustavat kasvain valittiin. FFPE kudokset leikattiin 3-4 mikrometriä osiin ja värjättiin hematoksyliinillä ja eosiinilla (H Hochberg menetelmä (FDR 5%) suoritettiin määrittämään ilmentyvät eri miRNA luokkien välillä näytteitä (

KRAS, BRAF, PI3KCA

, kaksinkertainen paino, kliininen hyöty, suorituskyky tila).

Univariable ja monimuuttuja selviytyminen analyysit suoritettiin käyttäen suhteellista vaarat Coxin regressio (paketti ”survival” R). Me raportoitu yhden testi ja Bonferronin korjattu

P

-arvot perustuvat lukumäärän miRNA testattiin univariable kokonaiselinaika (OS) ja elinaika ilman taudin etenemistä (PFS) regressiomalleja. Bootstrap menettely (150 kenkiin kuin oletuksena tämän menettelyn) päässä regressiomallinnus strategiaa tehtiin validoimiseksi asennettu miRNA perustuvat Cox eloonjäämisen malleihin (R kirjasto rms), concordance todennäköisyydet laskettiin laadintaan keskivirheet (muun muassa käytettävissä tilastot) välillä uudelleen näytteet sovitetun mallin ja alkuperäinen malli jokaisessa bootstrap vaiheessa. Konkordanssi toimenpide edustaa todennäköisyyttä, se mittaa kuinka hyvin malli syrjii erilaisia ​​vastauksia, jossa C = 0,5 hiljaista ei ennustavaa kykyä. Meidän tapauksessamme, C 0,5 tarkoittaa, että kyseisestä miRNA on hyvä ennustaja.

Monimuuttujalähettimet eloonjääminen analyysi suoritettiin seuraavat muuttujat: miRNA (kuten jatkuvia muuttujia), sukupuoli,

KRAS

,

PI3KCA

ja ikä (kahtia by mediaani = 63 vuotta).

BRAF

jätettiin monimuuttuja analyysiä vähäisen määrän mutatoitunut potilaita tapahtumia (n = 2). Ilmaisut Jatkuvan miRNA oli kaksijakoinen osaksi High and Low riskiä mediaani lausekkeen arvojen visualisointi on Kaplan-Meier tontteja. Kaplan-Meier luvut raportoitu jokaista varustettu selviytymisen malli on vähintään yksi tilastollisesti merkittävä miRNA. Kaplan-Meier luvut osoittavat myös hazard ratio (HR), luottamusväli (CI) ja oikaisematon Wald

P

-arvot Cox regressiomalleja erityisiä pairwise vertailuja kohteisiin. Hazard suhde jatkuvien muuttujien esitetään kvartiiliväli (IQR) yksikköä.

Target ja Pathway Analysis

Tunnistaa molekyylitason reitit mahdollisesti muuttaa ilmaus yhden tai useita miRNA, käytimme Diana -mirPath ohjelmisto, [23], web-pohjainen laskennallisen työkalu. Ohjelmisto suorittaa rikastamiseen analyysin kohdegeenien useita miRNA vertaamalla niitä kaikkia Kegg polkuja.

käytetyt tietokannat olivat TarBase (www.microrna.gr/tarbase) tai microT-CDS (www.microrna. gr /microT-CDS).

tulokset

Kliiniset ominaispiirteet ja mutaatio asema potilaat

jälkeen laadun arviointiin, näytteet viidestä potilaasta heitettiin pois. Baseline kliiniset ominaisuudet ja jakelu

KRAS, BRAF,

ja

PI3KCA

mutaatiostatus jäljellä 138 potilasta metastasoituneen kolorektaalisyövän sisällyttää esillä biomarkkereiden tutkimuksessa esitetään taulukossa 1. Kaikkia potilaita hoidettiin ilman tietoa niiden mutaatiostatuksesta riippumatta.

miR-345 oli Prognostiset varten Kokonaiselossaoloaika

sata ja kolmekymmentäkaksi (95%) potilaista oli kuollut aika seurannan (syyskuussa 2012). Mediaani kokonaiselossaoloaika potilaista oli 10,6 kk (95% CI: +2,1-+38,2kuukausi). Mitään eroa OS välinen 3 keskusten havaittiin.

Kun säätö tehdään Bonferronin menetelmällä, löysimme kuusi ennustetekijöiden miRNA: korkea ilmentyminen miR-345, miR-143, miR-34a *, miR-628- 5p, miR-886-3p ja alhainen ilmentyminen miR-324-3p liittyi lyhyt OS (taulukko 2). Kaplan-Meier -käyrät kuuden ennustetekijöiden miRNA on esitetty kuvassa 1.

Potilaat kahtia keskimääräisenä lauseke arvo miR-345. Matala miRNA lauseke (punainen) ja korkea miRNA lauseke (sininen).

P

-arvon viittaa Wald testi.

Täydellinen luettelo miRNA ennustetekijöitä OS ennen Bonferroni korjausta esitetään taulukossa S1 tiedosto S1 – yhteensä 64 miRNA ulos 372 oli prognoosi-, 50 suuremmilla ilme liittyy huonompi ennuste ja 14 pienemmillä ilme liittyy huonompi ennuste, yksikään valvonnan (U6, RNU24, RNU43, RNU44, RNU48 ja RNU6B) olivat ennustetekijöiden. Tulivuori juoni, joka osoittaa Z pisteet laskettuna Coxin regressioanalyysin ja tasoittamattomina p-arvo, on esitetty kuvassa S5 tiedostoon S1.

Monimuuttujalähettimet eloonjääminen analyysi suoritettiin seuraavat muuttujat: miR-345, asennuspalveli- 143, miR-34a *, miR-628-5p, miR-886-3p, miR-324-3p, sukupuoli,

KRAS, PI3KCA

ja ikä (kahtia by mediaani = 63 vuotta). Tulokset on esitetty taulukossa 3.

OS, miR-345 ja miR-324-3p olivat ainoat kaksi miRNA, jotka olivat tilastollisesti merkitseviä sekä monimuuttuja-analyysiä ja univariable analyysi. Suorituskyky tila ja

KRAS

olivat myös merkittäviä tekijöitä monimuuttuja analyysiin, vaikka

KRAS

oli rajatapaus merkittävä kuin muuttujan kerroin (HR = 1,36, CI 95%: 0,94-1,97).

miR-345 yhtenä miRNA Marker for Clinical Lopputulos

miR-345 oli myös ennustavan PFS, HR jonka IQR = 1,7, (CI 95%: 1,31-2,2 oikaistuna Bonferronin

P

-arvo = 0,021). Sen lisäksi, että merkittävä OS koko kohortin miR-345 oli tilastollisesti merkitsevä kaikissa selviytymisen malleja potilailla, joiden paino on

KRAS

,

BRAF

,

PI3KCA

ja kaksinkertainen wt yhdistelmille,

KRAS

+

BRAF

ja

KRAS

+

PI3KCA,

katso taulukot S2-6 tiedoston S1. miR-345 oli ennustetekijöiden OS

BRAF

+

PI3KCA

paino- ryhmässä ja kolminkertainen paino- ryhmä (

BRAF

wt +

KRAS

p- +

PI3KCA

paino), mutta ei in PFS analyysit. Vertasimme saatavilla mutaatiostatuksesta riippumatta yhdessä miR-345 ilmaisun osalta OS (kuva 2) ja PFS (kuva 3).

(A) Potilaat kahtia by

KRAS

mutaatio tila ja miR-345. (B) Potilaat kahtia by

BRAF

p- mutaatioiden aseman ja miR-345. (C) Potilaat kahtia by

PI3KCA

mutaatiostatus ja miR-345. (D) Potilaat kahtia tupla p- mutaatiostatus ja miR-345.

P

-arvon viittaa Wald testi.

Potilaat kahtia alhainen miR-345 lauseke (punainen) ja korkea miR-345 lauseke (sininen). (A) Potilaita kahtia keskimääräisenä lauseke arvo miR-345. (B) Potilaat kahtia by

KRAS

mutaatioita tila ja miR-345. (C) Potilaat kahtia by

BRAF

WT mutaatioiden aseman ja miR-345. (D) Potilaat kahtia by

PI3KCA

mutaatioiden aseman ja miR-345. (E) Potilaat kahtia tupla p- mutaatiostatus ja miR-345.

P

-arvon viittaa Wald testi.

asennettu Cox malleja todensi resampling menettelyä. Malli asentaa miR-345 ja OS osoitti hyvää vastaavuutta, korkeampi kuin joka toinen analysoitu miRNA OS (kuva S6 tiedostossa S1).

on myös tarkistanut miR-345 ilmentyminen liittyi hoitovastetta ja kliinistä hyötyä. Näimme, että korkeampi ilmentyminen liittyi puute vastaus (kuva 4). Analysoida edelleen, me rajoitti joukko potilaita, joilla on osittainen vaste (n = 24) ja etenevä sairaus (n = 37) in paras kokonaisvaste. Sitten verrataan potilaiden määrä alemman ja korkeamman miR-345 lauseke mukaan mediaani ilmentymisen miR-345 ja saadaan merkittävää suhdetta miR-345 ilmaisun ja vastetta kertoimet suhde 5,37 (

P

-arvo = 0,004; 95% CI: 1,56-20,94).

Jos me rajoitamme joukko potilaita, joilla on osittainen vaste (n = 24) ja etenevä sairaus (n = 37), joka on merkitsevää suhdetta miR-345 ilmaisun ja hoitovaste saatiin kanssa riskisuhde 5,37, (

P

-arvo = 0,004 ja 95% CI: 1,56-20,94).

Pathway ja Target Analysis

tunnistaa molekyyli polkuja liittyy ilmaus kuudesta miRNA ennustetekijöiden OS (miR-345, miR-143, miR-34a *, miR-628-5p, miR-886- 3p, miR-324-3p), testasimme Kegg reittejä. Niistä tilastollisesti merkittävien, peräsuolen syöpä (Kegg koulutusjakson hsa05210) oli läsnä johtuen ennustettu vuorovaikutus näiden miRNA ja seuraavat kohdegeeneissä: TCF4, APC, Smad4, MAPK8, PIK3CG, PIK3CD, DCC, PIK3CG, PIK3CA ja MAPK1.

keskustelu

ensimmäinen ja myöhemmin riviä potilaiden hoitoon metastasoitunutta kolorektaalisyöpää lisäämällä setuksimabin kemoterapiaan voi olla hyötyä potilaille, joilla ei mutaatiot

KRAS

ja

BRAF

[24], [25], [26]. Kuitenkin viimeaikaiset tutkimukset tutkivat setuksimabia ensimmäisen rivin metastasoituneen kolorektaalisyövän, ei voinut vahvistaa etuuden PFS ja OS

KRAS

paino- potilaille. [27], [28]. Tarvitaan tarkemmalle biomarkkerit tai paneeleihin biomarkkereita. Esillä mahdollisille biomarkkereiden tutkimus tehtiin tunnistamiseksi ennustetekijöiden miRNA kokoveressä potilaiden metastasoituneen kolorektaalisyövän käsiteltiin 3

rd linja setuksimabin ja irinotekaanin.

Tutkimuksemme osoittaa mahdollisen roolin kiertävän miRNA palvelemaan biomarkkereita kliinistä tulosta potilaille metastasoituneen kolorektaalisyövän. Huomasimme, että miR-345 oli ennustetekijöiden OS kaikissa potilaille metastasoituneen kolorektaalisyövän ja

KRAS

paino potilailla, joilla on korkea ilme liittyy lyhyempi selviytymistä. Monimuuttujalähettimet analyysi osoitti, että miR-345 oli vahva tekijä, joka lisätään ennustetekijöiden tieto muille käytettävissä ennusteeseen viittaavia ja mutaatio muuttujia. Kasvain taakka on yhdistelmä kasvaimen koon ja metastaasien lukumäärän. Tiedot koskevat kasvaimen kokoa ei ollut käytettävissämme, ja siksi kasvaintaakkaa ei sisällytetä monimuuttuja analyysiin. Teimme kuitenkin sisältää edustava luettelo covariates joita pidetään ennustavat tekijät potilaille metastasoituneen kolorektaalisyövän Setuksimabihoitoa saaneilla.

miR-345 oli tilastollisesti merkitsevä kaikkien paino- alaryhmiä analysoitiin. Koska kaikki potilaat saivat setuksimabia, emme voi päätellä, onko miR-345 oli ennustetyövälineenä biomarkkereiden (riippumatta hoidon potilaista sai) tai biomarkkereiden ennustamiseen herkkyys setuksimabihoidon ja irinotekaanin, mutta huomasimme, että sen suurempi ekspressio liittyi puute of hoitovaste. Kun yksittäinen ryhmä reagoivien vs. ei-vastetta, korkean miR-345 ilmentyminen oli merkitsevästi yhteydessä 5 kertaa riski etenevä sairaus kuin paras kokonaisvaste. Nämä tulokset ovat uusia havaintoja ja viittaavat siihen, että tämä miRNA on prognoosi- ja voi olla mahdollinen biomarkkeri vaste potilailla metastasoituneen kolorektaalisyövän Setuksimabihoitoa saaneilla ja irinotekaanin.

kiertävän miR-345 on tietojemme mukaan ole aikaisemmin kuvattu yhteydessä CRC, mutta Tang ja kollegat ilmoitti, että alhainen miR-345 CRC kudos liittyy imusolmukemetastaaseja, pahempi histologinen tyyppi ja on säädelty kolorektaalisyövässä solulinjoissa hoidon jälkeen 5-atsa-dc [29 ]. Lisäksi DNA-metylaatio tasot promoottorialue miR-345 ovat suurempia CRC kudoksessa verrattuna normaaliin paksusuolen kudos- ja vastaavat ei-syöpäkudoksen, mikä viittaa siihen, että tämä miRNA on metylaatioherkän tuumorisuppressori [29].

kudosnäytteitä, miR-345 on ennustetekijöiden potilailla, joilla on rintasyöpä [30]. Vaikka validointi ulkoisten ikäluokat ei ollut tilastollisesti merkitsevä, miR-345 oli ainoa miRNA pysyä ennustetekijöiden vuonna monimuuttujaisen malli, jonka osuus keskeisten kliinisten parametrien [30].

Ei tiedetä, miksi on olemassa ristiriita miRNA ilmentymistä kudoksessa ja veressä potilaiden kanssa CRC. Harvat tutkimukset verranneet miRNA ilmentymistä vastaava kudos- ja verinäytteitä. Vähän päällekkäisyyttä nähdään välillä miRNA erottaa keuhkosyöpä näytteitä normaalista keuhkokudoksesta näytteitä ja plasma miRNA eriyttämällä potilaalla on aggressiivinen vs. muu aggressiivinen keuhkosyöpää. [31] miR-345 havaittiin vähentynyt CRC kudoksen suhteellisen pieni tutkimus 26 CRC kudosnäytteet jossa vain 5 potilaalla oli etäpesäkkeitä. [29] Pienen miR-345-pitoisuus on pääasiassa lokalisoitu CRC kudos välttämättä ole verrattavissa korkea pitoisuus verenkierrossa miR-345 metastasoitunutta CRC. Sama miRNA voi olla kasvaimeen liittyvää eri tavoin riippuen, jos se löytyy kasvain tai kiertävä miRNA.

miR-143 on alaspäin säännellään CRC kasvain näytteissä verrattuna normaaliin kudokseen . [32], [33], [34]

KRAS

voi olla kohde miR-143 [35] ja tasot miR-143 ilmentymistä CRC kasvain näytteet ennustetyövälineenä biomarkkereiden in

KRAS

paino- potilailla, mutta ei ennustavaa markkerin anti-EGFR-hoidon. [36] Verenkierrossa miR-143 on testattu diagnostisena markkerina CRC potilailla, mutta ei ole merkittävästi vapautettu verrattuna normaaleihin kontrolleihin. [37] miR-324- 3p ei ole kuvattu CRC, mutta on eri ilmaistu plasmassa rintasyöpäpotilailla terveisiin kontrolleihin verrattuna. [38].

vahvuus tutkimus oli suhteellisen suuri otoskoko, bootstrap menettely (rs validointi Coxin regressiomallin), ja tiukan tilastollisen lähestymistapaa käyttäen vain miRNA mukaisesti korotettua Bonferronin korjauksen. Seuraava askel on vahvistaa nämä merkittävät miRNA kokoverestä toiselta kohortin potilaista metastasoituneen kolorektaalisyövän Setuksimabihoitoa saaneilla ja irinotekaanin. Tällä hetkellä ei ole tällaisia ​​näytteitä ovat saatavilla suorittanut vaiheen III tutkimuksissa.

Tutkimuksia ei tutki, miRNA ilmaisuja kokoveressä on potentiaali prognostinen tai ennakoivaa biomarkkereita potilailla metastasoituneen kolorektaalisyövän Setuksimabihoitoa saaneilla ja irinotekaanin. Useimmat tutkimukset tutkivat verenkierrossa miRNA on käytetty plasman tai seerumin. [39], [40] miRNA ilmentymisen profiilit koottu kokoveri PAXgene RNA putket on kuvattu potilailla, joilla on hematologisia sairauksia, haima- ja keuhkosyöpä [41], [42] ja on etuja verrattuna miRNA seerumin /plasman johtui tuotto [43] ja miRNA ja vähemmän menetelmiin ongelmia [44]. MiRNA löytyy perifeerisen kokoveressä voivat olla peräisin syöpäsolujen lisäksi myös muista kuin syöpäsolu, kuten leukosyytit, trombosyytit ja monosyytit. Ne voivat olla veressä sitoutunut proteiineihin kuten AGO [45] ja HDL [46] tai pakattu eksosomeiksi. [47] ennustetekijöiden miRNA, löytyy meidän potilaiden ryhmässä, voi johtua syövän etenemiseen, tulehdusreaktio tai vastauksena elinten vajaatoiminta.

Äskettäin Shen ja työtovereiden raportoitu, että EGFR oli mukana tukahduttaminen erityisten miRNA kypsymisen vastauksena hypoksinen stressiin. [48] ehdotettu mekanismi oli EGFR kautta fosforylaation AGO2, aiheutti vähentäminen Dicer /AGO2 sitova [48] täten estämällä kypsymistä valmiiksi miRNA pitkän loop kokoonpano. EGFR saattaa myös aiheuttaa solunsisäisten miRNA sääntelyä ja kuljettavat joitakin muuttuneen miRNA verenkiertoon, se toimii näin ollen kiertävä vastauksena EGFR toimiin.

Johtopäätös

tunnistettu kuusi kiertävä miRNA vuonna kokoverta kuten ennustetekijöitä merkkiaineita OS. miR-345 oli yksi biomarkkeri OS kaikilla potilailla ja potilailla, joiden

KRAS

paino- ja

KRAS + BRAF

kaksinkertainen paino. Lisäksi miR-345 oli merkitsevästi yhteydessä PFS ja paras yleinen vastaus ja voi olla mahdollinen biomarkkeri kliinistä tulosta potilaan kanssa metastasoitunutta kolorektaalisyöpää käsiteltiin 3

rd linja setuksimabin ja irinotekaanin.

tukeminen Information

Tiedoston S1.

Sisältää seuraavat tiedostot: Kuva S1, kuva S2, kuva S3, kuva S4, taulukko S1, taulukko S2, taulukko S3, Table S4, Table S5, taulukko S6, kuva S5, kuva S6.

doi: 10,1371 /journal.pone.0099886.s001

(DOCX) B

Kiitokset

kiitos Nina Dahl Kjersgaard ja Beata Gregersen, Herlev Hospital for erinomaisen teknistä tukea. Birgitte Christiansen, Trine S. Rasmussen ja sairaanhoitajien ja teknikoiden on Clinical Research Unit ja yksikkö kokeellinen hoito on Herlev Hospital, Odensen sairaala ja Aalborg sairaala ovat kiitti erinomaista apua. Tanskan Cancer Biopankkiverkosto at Herlev sairaalan kiitti käsittelyyn kudosnäytteitä.