PLoS ONE: Kytkin FOXA1 Status Associatesin endometriumsyöpään Progression
tiivistelmä
Background
transkriptiotekijä Forkhead laatikko A1 (FOXA1) on ehdotettu olevan tärkeä hormoni riippuvaisten syöpien, vaikkakin vähän tietoja kohdun limakalvon syöpään. Tutkimme ekspressiotasot FOXA1 perus- ja metastaattisen kohdun limakalvon syöpä suhteessa kliinisiin fenotyyppiin, ja transkription muutokset liittyvät FOXA1 asemaan.
Methods
Proteiinin ilmentymistä FOXA1 tutkittiin immunohistokemiallisesti 529 ensisijainen ja 199 metastaattinen kohtukarsinooma vaurioita. mRNA-tasot vastaavista 158 tuore ensisijainen ja 42 etäpesäkeleesioita analysoitiin Agilent mikrosirut (44k) rinnakkain.
Tulokset
Low FOXA1 proteiinin ilmentymisen primaarikasvainten korreloi merkitsevästi alhainen FOXA1 mRNA, korkea ikä, ei-endomet- histologia, korkea laatu, menetys ERa ja PR ja huono eloonjäämisen (kaikki p-arvot 0,05). Kautta Connectivity Kartalta, HDAC-inhibiittorit ehdotettiin mahdollisiksi hoito potilailla, joilla on alhainen FOXA1 ilme. Nostamalla FOXA1 ilmentyminen havaittiin peruskoulusta etäpesäkeleesioita ja se korreloi CDKN2A ilmaisun etäpesäkkeitä.
Johtopäätös
Low FOXA1 liittyy huono selviytymisen ja ehdottaa mahdollisia HDAC-inhibiittorit endometriumin karsinooma. Kytkin sisään FOXA1 ilmaisun perusopetuksesta etäpesäkeleesioita havaitaan ja geenien ilmentyminen osoittaa yhteyden FOXA1 ja CDKN2A in etäpesäkeleesioita.
Citation: Tangen IL, Kråkstad C, Halle MK, Werner HMJ, Øyan AM, Kusonmano K, et al. (2014) kytkin FOXA1 Status Associatesin endometriumsyöpään Progression. PLoS ONE 9 (5): e98069. doi: 10,1371 /journal.pone.0098069
Editor: Natasha Kyprianou, University of Kentucky College of Medicine, Yhdysvallat
vastaanotettu: 28 tammikuu 2014; Hyväksytty: 18 huhtikuu 2014; Julkaistu: toukokuu 21, 2014
Copyright: © 2014 Tangen et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.
Rahoitus: Tämä tutkimus tukivat Helse Vest, yliopisto Bergenin Norja Cancer Society ja Norjan tutkimusneuvoston. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.
Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.
Johdanto
länsimaissa kohdun limakalvon syöpä on yleisin gynekologinen maligniteetti, ja esiintyvyys on kasvussa [1]. Kohdun limakalvon syöpien luokitellaan yleisesti kahteen ryhmään. Tyypin I kohdun limakalvon syöpä on yleisin ja on ominaista suotuisa kehitys, endomet- histologia, matala vaiheessa ja laatu sekä usein ehjä ilmaus hormonireseptorit. Tyypin II kohdun limakalvon syöpä liittyy huono tulos, ei-endomet- histologia, korkea vaiheessa ja arvosana, ja se on yleensä menetetty ilmaus hormonin reseptorien [2]. Potilaat standardly kirurgisesti käsitelty kohdunpoisto kahdenvälisillä salpingoophorectomy tai ilman imusolmukkeiden poiston. Vaikutus adjuvantti systeemistä hoitoa vähemmän tutkittu endometriumin verrattuna munasarjasyöpä, vaikka samanlaisia platinajohdoksia solunsalpaajahoitojen yhdessä paklitakselin usein käytetään adjuvanttia ja systeeminen sairaus ympäristössä.
estrogeeniriippuvaisen kohdun limakalvon syöpiä arvellaan syntyä pitkäaikainen yksimielisesti altistuminen estrogeenit. Estrogeeniriippuvainen aktivointi estrogeenireseptorin α (ERa) on raportoitu johtavan proliferaation säätelyä kasvutekijät, kuten epidermaalinen kasvutekijä (EGF) [3], sen reseptori EGFR [4], insuliinin kaltainen kasvutekijä (IGF-1) [5] ja kasvua edistäviä proto-onkogeenien, kuten c-myc [6]. Sääntely ERa aktiivisuuden tiedetään myös mukana useita kofaktoreita lukien sekä koaktivaattoreiden ja korepressoreiden. Lisäksi edelläkävijä tekijä Forkhead laatikko A1 (FOXA1) on osoitettu olevan tärkeä säätelijä ERa toimintaa helpottamalla sitoutuminen ERa [7].
FOXA1 on jäsenenä Forkhead Box transkriptiotekijä perhe, entinen tunnetaan Maksasolukasvute- Nuclear Factor (HNF) perhe. FOXA1 proteiinit sitovat DNA: ta ja aiheuttaa nukleosomaalisten uudelleenjärjestely, joka johtaa usein avoimessa kromatiinirakenteeseen [8], [9]. Tämä helpottaa sitoutumista muita transkriptiotekijöitä, mukaan lukien ERa [7]. FOXA1 on havaittu rekrytoidaan lähes puolet kaikista ER sitoutumisalueiden [7].
välinen yhteys hormonireseptorit ja tunnettuja prognostiset muuttujia kuten FIGO vaiheessa histologinen ja selviytyminen on hyvin dokumentoitu kohtukarsinooma [10] – [12]. Enemmän tietämyksen molekyylitason mekanismeja estrogeenin signalointi ja estrogeeni liittyviä kofaktoreita liittyvä hormoni syöpien tarvitaan kehittää uusia hoitostrategioita. Useat tutkimukset ovat osoittaneet rooli FOXA1 eri hormoni riippuvaisia syöpiä [13]. Korkea FOXA1 ilmentyminen korreloi hyvän ennusteen ER rintasyövän mutta eturauhassyövän FOXA1 taso on liittynyt joko hyvä tai huono prognoosi riippuen potilaan ryhmä, ja on ehdotettu tilanneriippuvaista markkeri hengissä hormoni riippuvaisia syöpiä [ ,,,0],14] – [17].
Lisäksi yhdistyksen välillä FOXA1 ja ER rintasyövän ja FOXA1 ja androgeenireseptorin (AR) eturauhassyövässä viittaa siihen, että ekspressiotasot FOXA1 saattaa vaikuttaa vastata antihormonaaliseen hoidon hormoni riippuvaisia syövät. Tällä perusteella olemme tutkineet ekspressiotason FOXA1 endometriumin syövän suhteen fenotyyppiin ja vakiintunut biomarkkerit kuten hormonin reseptori asema; ja tämän jälkeen tutkia transkription muutoksiin liittyvät FOXA1 proteiinin tasot primaarinen ja metastaattinen kohtukarsinooma vaurioita.
Materiaalit ja menetelmät
Ethics selvitys
Kaikki osat Tutkimuksen on hyväksytty mukaan ja Norja lainsäädäntöä. Tutkimuksen hyväksyi Norja tietosuojaviranomainen, Norja yhteiskuntatieteiden Data Services ja alueneuvoston Medical Research Ethics, REC West (NSD15501; REK 052,01). Kaikki osallistujat antoivat kirjallisen tietoisen suostumuksensa.
Potilaan sarjan
väestöpohjainen potilaan sarja, myös 529 potilaalla diagnosoitiin endometriumsyöpään Hordaland County (Norja) kaudella 2001-2011, tutkittiin . Tissue primaarikasvaimista sisältyi takautuvasti suostunut potilaista kirurgisesti järjestetään mukaan International Federation of Naistenklinikka ja synnytysten (FIGO) 2009 kriteerit. Kliinis muuttujia, ikä diagnoosin, FIGO vaiheessa histologiset alatyypin ja laatu, hoito ja seuranta kerättiin tarkastelu potilastiedot kuten aiemmin ilmoitettua [18]. 91 joilla on pitkälle edennyt tai uusiutuva sairaus, koepalat oli saatavilla metastaattinen kudoksesta (yhteensä 199 FFPE vaurioita). Tuore kudos (158 ensisijainen ja 42 etäpesäkeleesioita) kerättiin ja valmistettiin rinnakkain formaliinikiinnitetyt parafiiniin upotetut kudokset (FFPE tiedot).
kudossiruina
kudossiruina (TMA) valmistettiin FFPE kudoksesta primaarikasvaimista ja etäpesäkkeitä. Alueella korkeimman kasvaimen tunnistettiin hematoksyliinillä ja eosiini värjätään dioja. Kolme kudossylintereitä primaarikasvaimista, ja yksi kudossylinteri päässä etäpesäkkeitä (0,6 mm) irrotettiin valituilta alueilta, ja asennettu vastaanottajan parafiiniblokkiin käyttäen mittatilaustyönä tarkkuusinstrumentti (Beecher välineitä, Silver Spring, MD, USA). Tämä menetelmä TMA on aiemmin kuvattu ja validoitu [19].
immunohistokemia
Viisi um TMA kohdat poistettiin vaha ksyleenillä ja niihin lisätään arvostellaan etanolia sarjassa. Sillä FOXA1 havaitsemiseksi, antigeeni haku suoritettiin mikroaalloilla keitetään 20 minuuttia sitraattipuskurissa (pH 6). Endogeeninen peroksidaasi ja epäspesifisen sitoutumisen ensisijaisen vasta-aineen blokattiin peroksidaasin lohkon (S2023, Dako, Tanska) ja seerumin vapaan proteiinin lohkon (X0909, Dako, Tanska). Laseja inkuboitiin anti-FOXA1 primäärinen vasta-aine (ab23738, Abcam, UK), laimennettu 1:800, 30 minuutin ajan huoneenlämpötilassa. Sekundaarinen vasta-aine, yhdistetty anti-hiiri-anti-kani (K5007, Dako, Tanska), levitettiin 30 minuutin ajan, minkä jälkeen 8 minuuttia Diaminobenzidine (DAB +, K4007, Dako, Tanska), ennen kuin counterstaining hematoksyliinillä. Immunohistokemiallinen värjäys ja ERa on aiemmin kuvattu 477 primaareja kasvaimia ja 78 etäpesäkkeitä. Muihin 92 primaaristen kasvainten värjättiin menetelmän mukaisesti raportoitu aiemmin [12].
arviointi värjäämällä
IHC värjäytyminen arvioitiin käyttäen puoli- kvantitatiivista järjestelmä, jossa sekä Värjäytymisen intensiteetti, ja alueen kasvaimen -positiivisiksi värjäytyneet solut pidettiin. Värjäys intensiteettiä arvostellaan asteikolla 0 (ei värjäys) 3 (voimakas värjäytyminen). Osa värjätään kasvainsolujen luokiteltiin 0, 1 ( 10%), 2 (10%: sta 50%) ja 3 ( 50%). Värjäys indeksi laskettiin tuote intensiteetti ja värjäyksen alue. Vuonna tilastollisen analyysin, värjäys hakemistot FOXA1 luokiteltiin vuonna kolmannekseen harkitsee frekvenssijakautuman varten merkki, koko alaryhmien ja tapahtumien lukumäärä kussakin luokassa. Kaksi alempaa kolmannekseen, joka osoittaa samanlaisia eloonjäämisennusteet, sittemmin yhdistettiin. Cut-off-arvo ERa sovellettiin aikaisemmin määritelty [12]. Arvioidaan toistettavuus, kaksi riippumatonta tarkkailijaa (ILT ja CK) sai satunnaisen TMA dioja, jolloin κ-arvo 0,80 FOXA1 ja 0,82 varten ERa [12]. Kun arvioidaan heterogeenisen useita etäpesäkeleesioita muodostavat samasta potilaasta, FOXA1 määriteltiin alhainen, jos jokin etäpesäkeleesioita osoitti heikkoa ilmentymistä.
mikrosiruanalyysi
Tuoreena jäädytettyjä kudoksia 158 ensisijainen kasvaimia ja 42 etäpesäkkeitä kerättiin rinnakkain FFPE kudoksiin. RNA: n tehtiin käyttämällä RNeasy Mini Kit (Qiagen, Hilden, Saksa). RNA hybridisoitiin Agilent kaikkiaan Human Genome mikrosirut 44k (Cat. No. G4112F) mukaan valmistajan ohjeiden ja taulukot skannattiin käyttäen Agilent Microarray Scanner Bundle. J-Express-ohjelmisto (Molmine, Bergen, Norja) käytettiin analysointiin. Mediaani spot signaalia käytettiin intensiteetti toimenpide ja ilmaisun tiedot normalisoitiin käyttämällä quantile normalisointi. Microarray tiedot on talletettu ArrayExpress Arkistotietokanta, https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/hakunumerolla E-MTAB-2532. Geenit ilmentyvät eri ryhmien välillä tunnistettiin SAM (merkitys analysointi Microarray) analyysi ja pidettiin merkittävinä, jos False Discovery Rate (FDR) 0,01. Jos näytteiden määrä ei mahdollista käyttää SAM, FSS (Feature Subset Selection) analyysiä käytettiin ja P 0,01 katsottiin merkitseväksi.
Yhteydet Kartta
korrelaatio geenien ilmentymistä ja mahdollisten terapeuttiset tutkittiin käyttämällä huumeita allekirjoitus tietokanta Connectivity Map [20]. Lääke allekirjoitukset tietokantaan syntyy geenit ilmentyvät differentiaalisesti solulinjoissa hoitaa lääkkeillä verrattuna hoitamattomiin solulinjoihin, ja heijastavat geenejä oletetaan muuttaa lääkkeen. Geenit differentiaalisesti ilmaisi mukaan FOXA1 tilan sisällä koko potilasryhmää sisällä ERa negatiivinen ryhmä oli pohjana analyysin Connectivity Map.
Tilastollinen
ohjelmistopaketti SPSS 19,0 (SPSS Inc, Chicago, IL) käytettiin tilastollisiin analyyseihin. Tilastollinen merkittävyys määritettiin todennäköisyys 0,05. Association ryhmien välillä arvioitiin käyttämällä Pearsonin χ
2 testi kategorisen muuttujia. Univariate eloonjääminen analyysi suoritettiin käyttäen Kaplan-Meier (tuote-raja) menetelmä, jossa päiväys ensiarvoisen kirurgian merkintä päivämäärä ja aika kuolemaan johtuen kohtukarsinooma kuin päätepiste (tautikohtaisia selviytyminen). Potilaat, jotka kuolivat muista syistä sensuroitiin klo kuolinpäivä. Log-rank testi (Mantel-Cox) käytettiin vertaamaan selviytymisen ryhmien välillä. Coxin suhteellinen vaara regressiomallin käytettiin arvioimaan ennustetekijöiden vaikutusta FOXA1 oikaistu muiden ennustetekijöitä merkkiaineiden kohdun limakalvon syöpään. Johtuen vuorovaikutusta levinneisyysaste ja histologinen tyyppi, Cox analyysi suoritettiin endomet- alatyyppi.
Tulokset
Low FOXA1 ilmentyminen liittyy huonon ennusteen endometriumsyöpään
FOXA1 on aiemmin osoitettu olevan edelläkävijä tekijä ER rintasyövässä (kuva S1). Tutkimme laaja ja ainutlaatuinen kokoelma kohdun limakalvon syöpä näytteiden selvittämään mahdollisen samanlainen rooli FOXA1 näissä sairauksissa. Proteiinin ilmentyminen FOXA1 ensisijaisesti ydin-. Proteiini ilmentyminen nähtiin sekä strooman ja rauhas kudoksissa, mutta ainoastaan värjäytymistä ytimet rauhaskudoksen pisteytettiin. Verrattaessa FOXA1 asema saatavilla kliinis muuttujia, alhainen FOXA1 lauseke (pisteet indeksi 0-4) korreloi merkitsevästi korkea ikä (P = 0,04), ei-endomet- histologia (P = 0,002), korkea histologinen (P = 0,003) menetys PR (P = 0,02) ja ERa: n (P = 0,003) (taulukko 1). Alhainen FOXA1 proteiinin ilmentyminen oli merkitsevästi yhteydessä heikentyneeseen tautikohtaisten selviytyminen (P = 0,004) (kuvio 1A) ja matalan FOXA1 mRNA: n ilmentymisen (P = 0,001) (kuvio 1 B). Jos potilaalla on ERa kasvaimia, löysimme ei vaikutusta FOXA1 (kuvio 2A) Toisin kuin ERa negatiivinen ryhmä, jossa alhainen FOXA1 ilmentyminen liittyi merkitsevästi huonompi tulos (kuvio 2B). Monimuuttuja-analyysissä, että endomet- alaryhmä, Coxin suhteellista riskin malliin iän, FIGO vaiheessa histologinen, FOXA1 ja ERa ilmaisun muuttujina, FOXA1 ilmentyminen havaittiin ennustetekijöiden vaikutus samanlainen laatu ja ERa asema, vaikka ilman itsenäinen ennustetekijöitä vaikutus (taulukko S1).
(A) Kaplan-Meier käyrä tautikohtaisten selviytymisen mukaan FOXA1 proteiinia tasolle. Alhainen FOXA1 ilmentyminen korreloi merkitsevästi alentunut potilaiden elinaikaa kohtukarsinooma. Vasen ja oikea insertti osoittaa matalan ja korkean ydinvoiman ilmaus FOXA1 vastaavasti. (B) Low proteiini ilmentymä FOXA1 merkittävästi korreloi alhaisen FOXA1 mRNA: n ilmentymisen.
(A) Matala FOXA1 ilmaus keskuudessa ERa positiiviset potilaat eivät merkittävästi vaikuta selviytymistä. (B) keskuudessa ERa negatiivisilla potilailla FOXA1 ilmaisu merkittävästi vaikuttanut selviytymisen huonoin prognoosi potilaille, joilla on alhainen FOXA1.
Geenien ilmentyminen liittyvät FOXA1 ja ERa ilmaisua ei mene päällekkäin
kuten rintasyövän, ERa menetys on jatkuvasti yhteydessä huonoon säilymiseen potilailla, joilla on kohdun limakalvon syöpä [2], [11], [12]. Kuten FOXA1 on osoitettu olevan tärkeä ERa-chromatin vuorovaikutusta rintasyövässä, me tutki tarkemmin sitä FOXA1 liittyvien geenien ilmentymistä muistuttaa ERa säänneltyjen geeniekspression kohdun limakalvon syöpään. SAM analyysi tunnistettu 468 geenit ilmentyvät differentiaalisesti kasvaimissa ehjät ERa ilme verrattuna menetys, kun taas 506-geenit ilmentyvät differentiaalisesti kasvaimissa on korkea FOXA1 ilme verrattuna alhainen. Vain kolme päällekkäistä geenit tunnistettiin ERa: n ja FOXA1 liittyvä geeni luetteloita (taulukko S2 ja S3).
HDAC-inhibiittorit ehdotetaan mahdollisiksi hoitoon tarkoitetut lääkkeet kohdun limakalvon syöpiä, joilla on alhainen FOXA1
Genes differentiaalisesti ilmaisi liittyvät FOXA1 tila käytettiin kyselyn Connectivity Map yhdisteille mahdollisten palata geenin allekirjoitus potilaalla on matala FOXA1 tila. Kaksi HDAC-inhibiittorit tuli viiden parhaan joukkoon sijoittunut yhdisteitä (taulukko 2). Nämä kaksi HDAC-inhibiittorit olivat myös kaksi korkeimmilla sijoilla anticorrelated yhdisteiden alhaisen FOXA1 ilmaisun sisällä ERa negatiivinen potilaan alaryhmässä (taulukko 2) (taulukko S4).
Metastasoitunut leviäminen liittyy muutos FOXA1 ilmaisun
etäpesäkeleesioita 91 potilasta värjättiin FOXA1 ilmaisun tutkia FOXA1 tilaansa etäpesäkeleesioita. Määriteltäessä FOXA1 alhaiset, jos jokin etäpesäkeleesioita osoitti heikkoa ilmentymistä, ei merkittävää muutosta ilmentyminen nähtiin välillä koko väestö primaarikasvaimia ja etäpesäkeleesioita (kuvio 3A). Yllättäen kun verrataan FOXA1 tasot primaarikasvainten potilaista, joilla on systeeminen sairaus, jossa metastasoituneeseen vaurio kollegansa, ilmaus FOXA1 havaittiin olevan huomattavasti korkeampi etäpesäkeleesioita verrattuna vastaaviin primäärivamma. Tämä oli myös totta, kun kaikki etäpesäkeleesioita, riippumaton määrä etäpesäkkeiden potilasta kohden, tutkittiin (kuvio 3B). Olemme aikaisemmin havainneet, että on olemassa merkittävä menetys ilmentymisen ERa peruskoulusta etäpesäkeleesioita [12]. Verrattaessa FOXA1 ja ERa ilmaisun metastaattisessa vaurio ei korrelaatiota ekspressiotasot havaittiin (r
2 = 0,012) (kuvio 3C). Sama havaittiin verrattaessa FOXA1 tasoilla etäpesäkkeiden vain ERa positiivinen ensisijainen kohdun kasvainten (r
2 = 0,11) (kuvio 3D).
(A) FOXA1 ilmentyminen säilyy perusopetuksesta kasvainten etäpesäkkeitä, kun taas ekspressio on merkittävästi lisääntynyt pariksi primaaristen kasvainten niiden vastaavat etäpesäkkeitä. FOXA1 määritellään alhainen, jos jokin etäpesäkeleesioita yksittäisistä tapauksista tutkitaan (n = 78) osoitti heikkoa ilmentymistä. (B) Tarkasteltaessa kaikkia etäpesäkkeitä (n = 199) on kasvanut merkittävästi ilmaisun perusasteelta etäpesäkeleesioita. Numerot osoittavat tutkittujen tapausten määrä, joissa tapausten määrä on korkea ilme suluissa. (C) ei ole korrelaatiota FOXA1 ja ERa ilmaisun etäpesäkkeitä ja korrelaatio FOXA1 ja ERa ilmaisun etäpesäkkeitä ainoastaan ERa positiivinen ensisijainen kasvaimia on alhainen (D).
FOXA1 ja CDKN2A tasot ovat linkitetty etäpesäkeleesioita
tutkia eroja transkription vaikutukset liittyvät FOXA1 tasoilla ensisijainen ja etäpesäkeleesioita me tutkia tarkemmin geenit ilmentyvät differentiaalisesti mukaan FOXA1 tilaansa primaarikasvainten verrattuna etäpesäkkeitä (taulukko S3 ja S5). Päällekkäisyys välinen geenien ilmennetty eri oli pieni (vain 26 geenejä). Kiinnostavaa, yksi alkuun sijoittui geenit ilmentyvät differentiaalisesti mukaan FOXA1 proteiinin ilmentymistä etäpesäkeleesioita oli CDKN2A. FOXA1 äskettäin osoitettu ohjaamaan CDKN2A ilmentymistä [21]. Sen tutkimiseksi, onko tämä yhdistys rajoittui Metastasoituneessa tutkimme välistä mahdollista yhteyttä FOXA1 ja CDKN2A myös primaarikasvainten (kuva 4). Merkittävä assosiaatio FOXA1 ja CDKN2A havaittiin ainoastaan etäpesäkeleesioita.
Proteiinin ilmentymistä FOXA1 liittyy merkittävästi CDKN2A mRNA ilmaisun etäpesäkkeitä, mutta ei ensisijainen kasvaimia.
Keskustelu
FOXA1 on tunnustettu tärkeäksi transkriptiotekijä, joka moduloi toiminnot steroidireseptorit kuten estrogeenireseptori rintasyövän ja AR eturauhassyövässä. FOXA1 ennustetyövälineenä markkeri rintasyövässä on tutkittu laajasti [14], [22] ja korkea ilmentyminen FOXA1 korreloi paremmin tautikohtaisten selviytyminen, ERa positiivisuus ja luminaaliselle alatyyppi A. eturauhassyöpä korkea ilmentymä FOXA1 ennustaa kehno ennuste, ja korreloi AR positiivisuus [15]. Myös hiljattain julkaiseman Cancer Genome Atlas (TCGA) Research Network oli pieni ER /FOXA1 signalointi liittyvän huono selviytyminen kohdun limakalvon syöpä [23]. Havaintomme, että matalan FOXA1 ilmentyminen liittyy merkittävästi merkkiaineita huonompaan lopputulokseen sekä huono selviytymisen näyttävät olevan sopusoinnussa TCGA tiedot ja havainnot rintasyövässä, mutta toisin kuin eturauhasen syöpä ja yksi aikaisempi pieni, ja mahdollisesti alimitoitettu tutkiminen 109 kohdun limakalvon karsinooma tapauksissa ei ilmene merkittävää prognostisia vaikutuksia FOXA1 ilmaisun [24].
rintasyöpäsolujen FOXA1 on osoitettu olevan tarpeen estrogeenimäärityksellä [7]. Samanlaisia rintasyöpä, kohdun limakalvon syöpä on estrogeeniriippuvainen syöpä ja tyypin 1 kohdun limakalvon syöpä liittyy ilmaus ERa. ERa positiivinen potilailla on huomattavasti parempi eloonjäämisen kuin potilailla, joilla on ERa menetys ja ERa on vahva prognostinen markkeri endometriumsyöpään [2]. Tutkimukset rintasyövän ovat osoittaneet, että ERa positiivisilla potilailla, joilla on korkea ilmaus FOXA1 on huomattavasti parempi eloonjäämisen verrattuna potilaisiin, joilla on alhainen ilmentyminen FOXA1 [14], [25]. Emme löytäneet samanlaista vahva selviytymisen vaikutus FOXA1 sisällä ERa positiivinen ryhmä, mutta vain sisällä ERa negatiivinen potilasryhmässä. Jos alennettu eloonjäämistä havaittiin FOXA1 negatiivisten ryhmään vain johtui menettämisen ERa Merkitsevä yhteys FOXA1 ja selviytymisen sisällä ERa negatiivinen ryhmä ei olisi ollut odotettavissa. Tämä voi osoittaa, että FOXA1 endometriumin syöpä voi olla toiminto, joka ei liity ERa, ja vaikutus FOXA1 voisi olla elinspesifisiin. FOXA1 on aiemmin osoitettu säätelevän erillisiä transkription ohjelmia soluissa eri linages [26], ja kliininen kokemus lisääntynyt kohdun limakalvon syövän riski naisten kanssa ERa positiivinen rintasyöpiä käsitelty tamoksifeenin tukee elinspesifisiin eroja hormoni asetuksessa. Edelleen tukee tätä, geenien ilmentyminen liittyvät FOXA1 tasolle täydensi ilmentämiskuviota liittyviä ERa. Jos FOXA1 on tärkeää säännellä ERa toimintaa kohdun limakalvon syöpä, kuten nähdään rintasyöpä, välinen päällekkäisyys differentiaalisesti ilmentyvien geenien olisi odotettavissa. Lisäksi meidän tiedot viittaavat HDAC-inhibiittorit mahdollisina hoito potilailla, joilla on alhainen FOXA1 ilme, sekä sisällä koko potilasryhmää sisällä ERa: n negatiivinen ryhmä. Tämä on mielenkiintoista, koska PI3K ja mTOR inhibiittorit viime aikoina on ehdotettu lupaavia lääkkeitä potilaille, joilla ERa syöpäkasvain erityisesti [11]. Esillä havainto viittaa siihen FOXA1 osallistuminen ERa sääntely saattaa olla erilainen endometriumsyöpään verrattuna siihen, mitä on todettu rintasyöpä. Tämä näyttää olevan sopusoinnussa endometriumin tasyöpäsolulinja tutkimus osoittaa, että käyttöönotto FOXA1 tukahduttaa sekä lisääntymistä ja muuttoliike [24] toisin kuin ERa joka johtaa lisääntymistä. Rooli FOXA1 edelläkävijä tekijä ERa on myös havaittu eroa eri syöpäsolutyyppien. Rekrytointia kromatiinin osoitettiin olevan riippuvainen FOXA1 rintasyöpäsoluissa kuitenkin käytettäessä osteoblastien kuten solulinja (U2OS-ERa) FOXA1 ei ilmenny ja ERa sitoutuminen riipu FOXA1 [27]. Endometriumin syöpä, FOXA1 on tärkeää esto solun proliferaatio ja migraatio [24], ja eturauhassyövän solulinjoissa FOXA1 äskettäin osoitettu estävän solun liikkuvuus ja epiteelin ja mesenkymaalitransitioon (EMT) säätelemällä transkriptiotekijän SLUG [17] . Tiedetään vähän suhteen bindingpartners varten FOXA1 endometriumin syöpää, ja lisää työtä tarvitaan selventää tätä.
havainneet, että FOXA1 proteiinin ilmentyminen suureni ensisijainen kasvaimia etäpesäkkeitä, saattaa esiintyä myös ristiriidassa meidän havainto, että korkea FOXA1 osakkuusyrityksissä hyvä tulos, jos potilaalla on kohdun limakalvon syöpä. ERa ilmaus tappio on raportoitu lisäävän perusopetuksesta metastaattinen kohtukarsinooma vaurioiden [12]. Alhainen korrelaatio ERa ja FOXA1 ilmaisun etäpesäkeleesioita, viittaa siihen, että FOXA1 on vähemmän kriittinen ERa toiminnon endometriumsyöpään verrattuna siihen, mitä on havaittu rintasyövän [28]. Sekä eturauhasen ja rintasyöpiä korkea ilmentyminen FOXA1 vuonna etäpesäkeleesioita todettiin, kuitenkin säilytti ilmaus AR ja ERa vastaavasti [28], [29]. Yhdessä tämä viittaa siihen, että rooli edelläkävijä tekijöiden sääntelyn ydin- reseptorien hormoni riippuvaisten syöpien kudosta liittyviä. Rintasyövässä FOXA1 tuntuu tärkeää ER välittämän transkription, ja vaimentaminen FOXA1 johtaa inhibitioon ER sitoutumisen ja transkription toimintaa [30]. Eturauhasen syöpä FOXA1 on todettu olevan edelläkävijä tekijä AR joitakin sitovia tapahtumia, mutta myös repressori. Muutos FOXA1 ilmentyminen eturauhassyövässä näyttää siis johtavan uudelleenohjelmointi AR sitova tapahtumia [15].
Mitä korkeampi ilmentyminen FOXA1 vuonna etäpesäkkeitä verrattuna niiden primaarikasvaimen kollegansa, ja yhdistyksen välillä proteiinin ilmentymistä FOXA1 ja CDKN2A mRNA vain etäpesäkeleesioita, voi osoittaa muutoksen roolissa FOXA1 aikana kohdun limakalvon syövän etenemisessä. Etäpesäkkeet, joilla on korkea ilmentymisen FOXA1 on myös korkea ilmentymisen CDKN2A. CDKN2A tiedetään koodata useita erillisiä proteiineja, mukaan lukien p16
INK4a, p15
INK4B ja p14
ARF. Mielenkiintoista FOXA1 äskettäin osoitettu ohjaamaan p16
INK4a ilmaisun aikana solujen vanhenemista [21]. Joka koodaama proteiini CDKN2A joka on ilmaistu etäpesäkkeitä on kuitenkin tuntematon ja sitä tutkitaan edelleen.
FOXA1 näyttää kudosspesifinen roolit voivat myös muuttua kohdun limakalvon syövän etenemisessä. Lisäksi on todennäköistä, että muita tuntemattomia tekijöitä kuin FOXA1 tarvitaan säätelyyn ERa toiminnon kohdun limakalvon syöpä. Tunnistaminen useampi näistä parantaa ymmärrystämme kudosspesifisiä hormonin reseptorin signalointi ja on merkitystä kehitettäessä kohdennettuja terapeuttisia ERa liittyvien pahanlaatuinen sairaus, kuten kohdun limakalvon syöpä. Siten FOXA1 voi lisätä kliinisesti merkityksellistä tietoa biomarkkerina endometriumin syövät ja viittaa rooli HDAC estäjät hoitoon.
tukeminen Information
Kuva S1.
Kaaviokuva tekijöitä säätelyyn ER välitteisen transkription (E2: estradioli).
doi: 10,1371 /journal.pone.0098069.s001
(TIF) B Taulukko S1.
Cox analyysi ennustavat kohdun limakalvon syöpä erityisiä selviytymisen: vaikutukset FIGO vaiheessa, ikä, histologinen, FOXA1 ja ERa ilme sisällä endomet- alaryhmä.
doi: 10,1371 /journal.pone.0098069.s002
( DOCX) B Taulukko S2.
SAM analyysi ER positiivinen verrattuna ER-negatiivisen tapauksissa (FDR 0,01).
doi: 10,1371 /journal.pone.0098069.s003
(XLSX) B Taulukko S3.
SAM analyysi FOXA1 huipulla FOXA1 matala tapauksissa (FDR 0,01).
doi: 10,1371 /journal.pone.0098069.s004
(XLSX) B Taulukko S4.
FSS analyysi FOXA1 huipulla FOXA1 alhainen tapauksissa ER negatiivista näytettä (p-arvo 0,01).
doi: 10,1371 /journal.pone.0098069.s005
(XLSX) B Taulukko S5.
FSS analyysi FOXA1 huipulla FOXA1 alhainen tapauksia etäpesäkkeitä (p-value 0.01).
doi:10.1371/journal.pone.0098069.s006
(XLSX)
Acknowledgments
We kiitos Ellen Valen, Britt Edvardsen, Kadri Madissoo, Tormund S Njølstad, Gerd Lillian Hallseth Bendik Nordanger ja Hua My Hoang tekniseen tukeen.