PLoS ONE: Yhden Gene Prognostiset biomarkkerit munasarjasyövässä: Meta-analyysi
tiivistelmä
Tarkoitus
Voit löytää uusia ennustetekijöiden biomarkkereita munasarjojen vakavasta karsinoomia.
Methods
meta-analyysi kaikkien yksittäisten geenien koettimia TCGA ja HAS munasarjojen kohortteja suoritettiin tunnistaa mahdollisia biomarkkereita käyttäen Coxin regressiota jatkuvana muuttujana kokonaiselossaolo. Geenit paremmuusjärjestykseen p-arvoon käyttäen Stouffer menetelmää ja valittiin tilastollisesti merkitsevä väärä löytö määrä (FDR) 0,05 käyttäen Benjamini-Hochberg menetelmällä.
Tulokset
kaksitoista geenien korkea mRNA ilmentyminen oli ennustetekijöiden huonon lopputuloksen kanssa FDR 0,05 (AXL, APC, RAB11FIP5, C19orf2, CYBRD1, PINK1, LRRN3, AQP1, DES, XRCC4, BCHE, ja ASAP3). Kaksikymmentä geenejä, joilla on alhainen mRNA ilmentyminen oli ennustetekijöiden Huonon lopputuloksen kanssa FDR 0,05 (LRIG1, SLC33A1, NUCB2, POLD3, ESR2, GOLPH3, XBP1, PAXIP1, CYB561, POLA2, CDH1, GMNN, SLC37A4, FAM174B, AGR2, SDR39U1 , MAGT1, GJB1, SDF2L1, ja C9orf82).
Johtopäätös
meta-analyysi kaikkien yksittäisten geenien tunnistettu kolmekymmentäkaksi ehdokas biomarkkereita niiden mahdollinen rooli munasarjojen vakavasta syöpä. Nämä geenit voivat tarjota käsityksen kuljettajia tai sääntelyviranomaisten munasarjasyöpä ja olisi arvioitava myöhemmissä tutkimuksissa. Geenit, joilla on korkea ilme osoittaa huono tulos ovat mahdollisia terapeuttisia kohteita tunnettujen antagonisteja tai inhibiittoreita. Lisäksi geenit voitaisiin yhdistää ennustetyövälineenä usean geenin allekirjoitus ja testattiin tulevaisuuden munasarjojen ikäluokat.
Citation: Willis S, Villalobos VM, Gevaert O, Abramovitz M, Williams C, Sikic BI, et al. (2016) Single Gene Prognostiset biomarkkerit munasarjasyövässä: meta-analyysi. PLoS ONE 11 (2): e0149183. doi: 10,1371 /journal.pone.0149183
Editor: William B. Coleman, University of North Carolina School of Medicine, Yhdysvallat