Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

karsinooma sappirakon (GBC) on aggressiivinen maligniteetti. Korkeampi esiintyvyys sappirakon syöpä naisilla on osittain johtuvan hormonaaliset tekijät. Siksi esillä oleva tutkimus suunniteltiin tutkimaan roolia perimä estrogeenin (

ESR1, ESR2

) ja progesteroni (

PGR

) reseptoreihin annetaan riskiä sappirakon syöpä.

Materiaalit ja menetelmät

Tässä tapauskontrollitutkimuksessa palvelukseen yhteensä 860 aiheita, myös 410 GBC potilasta, 230 sappikivien potilaita ja 220 valvontaa. Tutkimme yhdistysten 6 valittujen polymorfismien kolme geeniä:

ESR1

(rs2234693, rs9340799, rs1801132),

ESR2

(rs1271572, rs1256049) ja

PGR

(rs1042838) GBC riski. Genotyping kaikille polymorfismien tehtiin käyttäen PCR-RFLP. Usea dimensionality vähentäminen ja luokittelu ja regressio puu lähestymistapoja yhdistettiin logistisen regression löytää korkean kertaluvun geeni-geeni vuorovaikutukset hormonivalmisteiden kautta.

Tulokset

Verrattaessa genotyypin taajuus jakelu sappikivien ja GBC potilaalla on terveillä koehenkilöillä homotsygoottinen variantti genotyypin

ESR1

-397TT (rs2234693) polymorfismi osoitti merkittävää riskiä kehittää sappikivien [riskisuhde: OR = 2,9] ja GBC [OR = 1,8] vastaavasti. Yksityiskohtainen haplotypes analyysi viittasi siihen, että

ESR1

T

rs2234693G

rs9340799C

rs1801132 on merkitsevä yhteys annetaan riskiä sekä sappikivet [OR = 2,2] ja GBC [OR = 3.0]. Kuitenkin muunnos sisältävä genotyyppien (DI + II) on

PGR

(rs1042838) osoitti pienen riskin sekä GBC [OR = 0,4] ja sappikivien potilailla [OR = 0,4] heidänkin osuutensa suorittamiseksi MDR analyysi,

ESR1

IVS1-397C T,

ESR1

IVS1-351A G, ja

ESR2

-789 A C tuotti korkeimman testaus tarkkuus 0,634. Nämä tulokset tukevat lisäksi CART analyysi, joka osoitti, että yksilöiden yhteenlaskettu genotyypit

ESR1

-397 CT tai TT,

ESR1

-351 AG tai GG ja

ESR2

-789 AA oli korkein riski GBC [OR = 3.9].

Johtopäätös

Käyttämällä multi-analyyttisiä lähestymistapoja, meidän tutkimus osoitti tärkeä rooli

ESR1

IVS1- 397C T,

ESR1

IVS1-351A G, ja

ESR2

-789 A C variantit GBC alttius ja riski näyttää välittävän kautta sappikivien riippuvaisen reitin.

Citation: Srivastava A, Sharma KL, Srivastava N, Misra S, Mittal B (2012) Merkittävä rooli estrogeenin ja progesteronin Reseptori sekvenssivariantit sisään sappirakon syöpä Taipumus: Multi-Analyyttinen strategia. PLoS ONE 7 (7): e40162. doi: 10,1371 /journal.pone.0040162

Editor: Amanda Ewart Toland, Ohio State University Medical Center, Yhdysvallat

vastaanotettu: 1 maaliskuu 2012; Hyväksytty: 2 kesäkuu 2012; Julkaistu: 10. heinäkuuta 2012

Copyright: © 2012 Srivastava et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tutkimus tukivat tutkimus- ja keskinäisessä avustukset Intian neuvoston Medical Research (ICMR) ja Department of Biotechnology (DBT) Govt. Intiassa. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

karsinooma sappirakon on erittäin tappava sairaus, jossa myöhäinen diagnosointi, rajoitettu hoitovaihtoehdot ja riistää ennusteen [1]. Se on yleisin pahanlaatuinen vaurion sappiteiden ja kuudes yleisimpiä pahanlaatuisia kasvaimia ruoansulatuskanavan [1], [2], [3]. Tutkimus Utah syöpärekisteritietojen (UCR) ja ruotsalainen perhe-syöpä tietokanta raportoitu familiaalinen klusterointi GBC [4]. Kiistatonta näyttöä on olemassa myös roolia suvussa sappikivet sappirakon syöpä etiologiassa [5], [6]. Lisäksi esiintyvyys kuvaaja sappirakon syöpä vaihtelee sukupuolen ja etnisen alkuperän ja ylin taajuudet raportoitu naisilla kuuluvien intiaanien, Etelä-Amerikassa, ja Pohjois-Intiassa [7].

Monipuolinen vuorovaikutus hormoneja, metabolinen muutokset , infektiot, ja jopa anatomiset poikkeavuudet on selvitetty etiologiassa sappirakon syöpä [1]. Lisäksi lukuisia epidemiologiset tutkimukset ovat osoittaneet vahvaa yhdistys GBC kolesterolia sappikivien tauti [8] ja monet sen riskitekijöitä, kuten liikalihavuus, korkea hiilihydraattien saantia, ja naispuoliseen [9]. Jälkeisessä vaihdevuodet ohittaneilla naisilla, hormonikorvaushoito lisää merkittävästi riskiä sappirakon sairauksiin [10], [11] mikä viittaa huomionarvoista rooli sukupuolihormonien etiologiassa GBC [12], [13], [14], [15], [16] .Myös naiset kaksi-kuusi kertaa enemmän vaikutusta kuin miehet. Kaikkiaan nämä todisteet ovat esiin mahdollisuuden Sukupuolisteroidit (estrogeeni ja progesteroni) voi olla keskeinen patofysiologista rooli kehitettäessä sappirakon syöpä. Estrogeeni ja progesteroni hormonit toimivat kohdekudoksissa sitoutumalla niiden reseptoreihin. Estrogeenireseptoreihin (

ESR1, ESR2

) ja progesteroni reseptorin (

PGR) B geenit sijaitsevat kromosomissa 6q25.1, 14q21-22 ja 11q22 vastaavasti ja niiden ilmaisun on havaittu ihmisen sappirakon normaalissa limakalvon [15] ja GBC [16] alleelivariantit estrogeenireseptorin geenejä on osoitettu liittyvän alttiuteen tai etenemisen eri häiriöitä, kuten sydäninfarkti [17], kolesterolia sappikivien ja sappiteiden sairaudet [18]. Lisäksi toiminnalliset analyysit viittaavat siihen, että

ESR1

IVS1-397C T polymorfismi vaikuttaa sitoutumiskohdan myb perheen transkriptiotekijöiden [19], [20], ja polymorfismi on tutkittu myös eri rintasyövän assosiaatiotutkimuksiin [17], [21], [22]. Päinvastoin, progesteroni on tärkeä rooli säätelyssä tasoa estrogeenin ja suojaavat useita syöpiä [23], [24].

Koska mahdollisia hormonaalisia rooli sappirakon sairauksiin, ja myös aiemmin tutkittu roolia

ESR /PGR

polymorfismien naisten liittyviä syöpiä, me arveltu, että geneettisiä variantteja

ESR1

,

ESR2

ja

PGR

geenit voivat olla merkittäviä vaikutus riskeistä sappirakon syöpä. Siksi tässä tutkimuksessa, selvitimme paneeli 6 hyvin tutkituissa polymorfismien

ESR1, ESR2

ja

PGR

geenien tapaus-verrokki muotoilu mukana 410 GBC potilasta, 230 sappikivien potilailla ja 220 syöpä /sappikivien-vapaa säätimet Pohjois-Intiassa. Lisäksi logistinen regressio (LR), kaksi ei-parametrinen lähestymistapoja, multifactor dimensionality vähennys (MDR) ja luokittelu ja regressio puu (CART) levitettiin tutkia korkean kertaluvun geeni-geeni vuorovaikutukset moduloinnissa riskiä sappirakon syöpä. Parhaan tietomme mukaan tämä on ensimmäinen raportti, joka on tutkinut roolin perimä hormonivalmisteiden reseptorin geenien käytetään usean analyyttisen lähestymistavan määritellä yksittäisiä riskiprofiilit sappirakon syöpä ja sappikivien sairaus.

Tulokset

väestön ominaispiirteet

väestörakenteen ominaisuudet GBC ja sappikivien potilailla suhteessa iän ja sukupuolen verrokeilla on esitetty taulukossa 1. keski-ikä kaikissa kolmessa ryhmässä olivat vertailukelpoisia ja osoittivat tilastollisesti merkitsevä eroja. Yli 90% GBC potilaista oli pitkälle edennyt syöpä (vaiheiden III ja IV) ja sappikivet todettiin olevan läsnä 50,5% ja GBC potilaista. Noin 31% GBC potilaat olivat yhteydessä tupakan käyttö jonkinlaista (tupakointi, pureskelu, tai molemmat). Havaittiin tiedonkeruun aikana, että suurin osa naispotilaiden olivat kotiäidit ja miespotilailla ei harjoita vaarallisissa ammateissa. Kaikki syöpä ja sappikivien potilasta oli tapaus tapauksissa eikä mitään tarkastuksia ollut suvussa syöpä.

Allelic jakelu Opiskellut polymorfismit Controls

genotyyppisen ja alleeliset jakelu

ESR1

IVS1-397C T (rs2234693), IVS1-351A G (rs9340799), Ex4-122C G (rs1801132),

ESR2

-789 A C (rs1271572), 1082 G A (rs1256049) ja

PGR

ins /del (rs1042838) esitetään taulukossa 2. havaittu genotyyppi taajuudet kaikkien tutkittu polymorfismien tarkastukset olivat mukaisesti Hardy-Weinberg tasapaino (p 0,05). Taajuudet variantin alleelien tutkimuksessamme olivat edellisiin julkaistut raportit [25].

Association of

ESR1

,

ESR2

ja

PGR

polymorfismit GBC ja sappikivet

taulukossa 3 esitetään riskiä sappirakon syöpä ja kiviä suhteessa kunkin SNP

ESR1, ESR2

ja

PGR.

verrattaessa genotyyppi frekvenssijakautuman Tutkimuksemme ryhmien eli GBC ja sappikivien potilaiden kanssa, valvonta, homotsygoottinen variantti genotyypin

ESR1

IVS1-397C T (rs2234693) polymorfismi osoitti tilastollisesti merkitsevä lisääntynyt riski saada GBC ( p = 0,02; [OR], 1,8) ja sappikivien (p = 0,001; [OR], 2.9). Lisäksi sappikivien potilailla

ESR1

IVS1-351A G siirrettävä suurempi riski (p = 0,002; [OR], 2.6). Päinvastoin, ei havaittu merkittäviä eroja jakelu

ESR1

IVS1-351A G, Ex4-122C G, (rs1801132) ja

ESR2

-789 A C (rs1271572 ), EX6 1082 G A (rs1256049) polymorfismit tahansa ryhmistä, sekä geno- ja alleeliset tasolla. Variantti sisältävä genotyyppien (DI + II) on

PGR

ins /del (rs1042838) osoitti pienen riskin sekä GBC ja sappikivien potilailla oli myös merkitsevä (p = 0,004; [OR], 0,4; p = 0,009; [OR], 0,4 taulukko 2) verrattuna homotsygoottista villityypin DD genotyypin.

Tutkimushenkilöt stratifioitiin miehillä ja naisilla. Mies- GBC potilailla, variantti genotyyppi TT on

ESR1

IVS1-397C T (rs2234693) polymorfismi osoitti merkitsevästi lisääntynyt riski GBC (p = 0,009; [OR], 4,8), kun taas IVS1-351A G ( rs9340799) polymorfismi siirrettävä lisääntyneen riskin GBC naisilla (p = 0,026; [OR], 2.4). Nämä ristiriitaiset tulokset saattavat osittain johtua riittämättömästä määrä miehillä, naisten GBC potilaille. Yksikään geneettistä vaihtelua on

ESR2

ja

PGR

ins /del myönnetty sukupuoleen liittyviä riskejä GBC sekä genotyyppisen ja alleeliset tasolla. Samanlaisia ​​tuloksia saatiin, kun vertasimme sappikivien miehillä ja naisilla vastaavien sukupuoli erillisillä valvontaa. (Tuloksia ei esitetty.).

ESR1

ja

PGR

polymorfismit ja modulaatio Risk läsnäolossa sappikivet

Koska sappikivet ovat läsnä enemmän yli 50% GBC potilaista, syöpä tapaukset jaotella kahteen ryhmään sen perusteella, läsnäolo tai puuttuminen mukana sappikivet ja verrattiin itsenäisesti kontrolleihin (taulukko 3). GBC potilaalla on mukana sappikiviä havaittiin suurempi riski sairastua tautiin, jossa

ESR1

IVS1-397 CT + TT (rs2234693) genotyyppejä (p = 0,002; [OR], 1.6 taulukko 3). Sen sijaan

ESR1

Ex4-122C G (rs1801132) ei todettu merkittävästi liittyvän molemmissa alaryhmissä. Siinä tapauksessa, että

PGR

ins /del (rs1042838), suojaava vaikutus havaittiin GBC potilailla riippumatta niiden sappikivien tila (taulukko 3). Kuitenkin vertaamalla GBC potilailla, joilla sappikivien kanssa sappikivien potilailla (ei syöpä), tulokset osoittivat ole yhteyttä kaikissa tutkituissa polymorfismia

ESR1, ESR2

ja

PGR,

sekä genotyypin ja alleeliset tasoilla. (Tuloksia ei esitetty.).

kytkentäepätasapaino- ja Haplotyypit analyysi

ESR1

asiassa ja kontrolliryhmissä

LD analyysi,

ESR1

rs2234693 ja rs9340799 todettiin olevan kytkentäepätasapainossa (D ’= 0,575). Haplotypes rakennettiin kolmelle polymorfismien

ESR1

geeni lukien IVS1-397C T (rs2234693); IVS1-351A G (rs9340799) ja Ex4-122C G (rs1801132). Haplotyypit käsittää homotsygoottinen villi alleelit otettiin referenssinä ja ero taajuuksia haplotyyppien välillä potilaiden ja verrokkien testattiin Khin neliö testi.

haplotypes analyysi tutkittu kolmen polymorfismit

ESR1

paljasti, että jakelu T

rs2234693G

rs9340799C

rs1801132 haplotyyppi oli huomattavasti korkeampi sekä GBC (27,5% v /s 13,7%) ja sappikivien potilailla (25,1% v /s 13,7) verrattuna kontrolleihin ja sen annetaan suuri riski GBC (p = 0,0001; [OR], 3,0 taulukko 4) ja sappikivien tauti (p = 0,0012; [OR], 2,2 taulukko 4). Global haplotypes analyysi osoitti tilastollisesti merkitsevää eroa GBC tapausten ja kontrollien perusteella jakaantumiskuvio

ESR1

haplotyyppien (p = 0,001). Kuitenkaan yksikään

ESR2

haplotypes havaittiin liittyvän GBC ja sappikivien riski.

Gene-geeni Vuorovaikutus

voi olla merkittäviä vuorovaikutuksia

PGR, ESR1

ja

ESR2

, yleinen geeneihin geeni vuorovaikutuksen analyysi. Tulokset on esitetty taulukossa 5 paljasti merkittävän vuorovaikutuksen erityisiä muunnelmia kolmen geenin kanssa yleistä vuorovaikutusta p-arvo 0,0001.

Association of High-tilauksen Vuorovaikutus GBC Risk by MDR Analysis

aiemmin tulokset ovat osoittaneet osallistumista korkea, jotta geeni-geeni vuorovaikutusta DNA: n korjaukseen ja tulehduksellinen reittejä GBC herkkyys [26]. Siksi etsimme tällaista vuorovaikutusta perimä hormonaalisten reseptorin geenien käyttäen MDR ja CART analyysi.

Taulukossa 6 parhaan vuorovaikutuksen mallia MDR analyysi. Paras-tekijä mallin ennustamiseen GBC riski oli

ESR1

IVS1-397C T SNP (testaus tarkkuus = 0,519, CVC = 10/10, permutaatio p = 0,025). Paras kahden tekijän malli

ESR1

IVS1 351A G ja

ESR2

-789 A C oli parannettu testaus tarkkuus 0,564 (permutaatio p = 0,001), kuitenkin CVC pienenivät (6/10). Paras vuorovaikutuksen oli kolmen tekijän sisältävä malli

ESR1

IVS1-397C T

ESR1

IVS1 351A G ja

ESR2

-789 A C SNP, joka tuotti korkeimman testaus tarkkuus 0,634 ja maksimaalinen CVC: n 10/10 (permutaatio p = 0,001). Neljän tekijä malli koostuu

ESR1

IVS1-397C T, IVS1 351A G, Ex4-122C G ja

ESR2

-789 A C myös parantuneet testaus tarkkuutta verrattuna yhden tekijän malli (CVC = 10/10 permutaatio p = 0,001). Kolmen SNP tunnistettu paras vuorovaikutusmallia,

ESR1

IVS1-397C T, IVS1 351A G ja

ESR2

-789 A C yhdistettiin ja kahtia mukaan MDR ohjelmisto . Yksilöt kantavat yhdistetyn riskin stratum oli 4,0 kertainen lisääntynyt riski GBC (p = 0,001). Lisäksi yhteinen vaikutus

ESR1

IVS1-397C T, IVS1 -351A G ja

ESR2

-789 A C arvioitiin regressioanalyysimme (taulukko 7) kanssa

ESR1

IVS1-397TT, IVS1-351GG ja

ESR2

-789 AA riskiä genotyypit. Koehenkilöille luokiteltu neljään ryhmään määrän perusteella riskin genotyyppien he kantoivat ja ilman vaaraa genotyyppi nimettiin vertailuryhmään. Huomasimme, että p-arvojen henkilöille, joilla on yksi ja kaksi riskiä genotyyppien oli 0,46 ja 0,015 vastaavasti, kuitenkin p-arvo ja syrjäisimpien alueiden kolmen riski genotyyppien ei voida määritellä, koska ei ole variantin yhdistelmän kontrolleissa (taulukko 7). Nämä tulokset viittaavat huomattaviin geeniannoksen vaikutus

ESR1

IVS1-397C T, IVS1 -351A G ja

ESR2

-789 A C.

Association of High-tilauksen vuorovaikutus GBC Risk rattailla Analysis

lopullinen tuloksena puu tuotettiin CART analyysi (taulukko 8). Yhdenmukainen MDR paras-tekijä mallin, alkuperäisen split juuren solmun päätös puu oli

ESR1

IVS1-397C T, mikä viittaa siihen, että tämä SNP on vahvin riskitekijä GBC joukossa polymorfismit tutkitaan . Edelleen tarkastus puurakenteen paljasti erillisiä vuorovaikutuksen tavoista yksilöiden välillä kuljettavat

ESR1

IVS1-397 CT tai TT ja ne, joilla on

ESR2

-789 AC tai CC genotyyppejä. Yksilöt kuljettavat

ESR1

IVS1-397CC,

ESR1

-122CC ja

ESR2

-789 AC tai AA genotyyppien oli pienin kulmanopeuden 33,3%, ja otetaan viitteenä. Käyttämällä napaliitäntä käsittää

ESR1

Ex4-122 CC genotyyppi kantajia ohjearvon, yksilöiden kuljettaa sekä

ESR1

-397 CT tai TT,

ESR1

-351 AG tai GG ja

ESR2

-789 AC genotyypit näytteillä huomattavasti suurempi riski GBC (oikaistu OR 3,6; 95% CI, 1,7-9,1), kun taas yksilöiden yhdistetyn genotyypit

ESR1

– 397 CT tai TT,

ESR1

-351AG tai GG,

ESR2

-789 AA oli korkein riski GBC (oikaistu OR 3,9; 95% CI, 2,0-9,8) (taulukko 8) . Siten yhdistämällä yhden lokuksen analyysin OSTOSKORIIN ja MDR huomasimme, että yksittäinen geneettisiä variantteja joko

ESR1

tai

ESR2

välttämättä ole vastuussa annetaan suuri riski taudin vaan korkeammat geeni -geenin vuorovaikutukset ovat todennäköisesti mukana geneettinen alttius GBC.

in silico analyysi perimä Gene Activity

Koska SNP sijaitsevat ei-koodaavat sekvenssit, se oli todennäköistä, että SNP: t voivat vaikuttaa geenin transkriptiota. In silico analyysi käyttäen FAST-SNP ja F-SNP osoitti muutos transkription säätelyyn ja vaihtoehtoisen silmukoinnin useimpien valittujen SNP (taulukko 8). In-Silco analyysi PROGINS, Polyphen ”Tulos osoitti muutokseen Hyvänlaatuinen taas SEULOA ehdotti” siedetty ”muutos (taulukko 9).

Keskustelu

Genetic eroja sukupuolihormonien geenien voi olla vaikutusta niiden toimintaan, mikä aiheuttaa yksilöiden välisiä eroja taipumus GBC. Myös vahva naispuolinen ilmaantuvuus on nostanut todennäköisyyttä, että estrogeenit voivat olla keskeinen patofysiologista rooli etenemistä sappirakon syöpä [27]. Lisäksi ilmaisun ja toiminnalliset tutkimukset ovat osoittaneet suoraa vuorovaikutukset ESR ja PGR reseptori verkkotunnuksia [28], [29]. On näyttöä siitä, että vaara, että GBC peräisin sappikivitautia potilailla, joilla ei suvussa sappikivet oli 21-kertainen riski, kun taas ne, joilla on sekä sappikivet ja positiivinen suvussa oli 57 kertaa suurempi riski [6].

Tässä tutkimuksessa olemme soveltaneet usean analyyttisen strategia yhdistyvät LR, MDR ja CART lähestymistapoja systemaattisesti tutkia assosiaatiot GBC riskin ja paneelin geneettisten polymorfismien mukana hormonaalista kautta.

yksin- locus analyysi,

ESR1

IVS1-397C T (rs2234693) polymorfismi osoittivat merkittävää yhteyttä GBC riski. Tuloksemme LR, MDR ja CART analyysit myös johdonmukaisesti ehdottanut, että

ESR1

IVS1-397C T polymorfismi on tärkein yksittäinen alttius tekijä GBC kehittämiseen. Lisäksi geeni – geeni vuorovaikutuksen analyysi osoitti merkittäviä yhteisvaikutuksia näiden hormonaalisten variantteja. Lisäksi genethe multi-analyyttinen strategioiden paljasti myös korkeamman asteen geeni-geeni vuorovaikutus

ESR1

IVS1-397C T, IVS1 -351A G ja

ESR2

-789 A C polymorfismit GBC riski.

suorittamalla yksityiskohtainen analyysi haplotyyppien, huomasimme, että sappirakon syöpä ja sappikivet henkilöillä, jotka kantavat

ESR1

haplotypes IVS1-397T, IVS1-351G, Ex4-122C siirrettävä lisääntynyt riski sekä GBC ja sappikivet osoittaa, että

ESR1

haplotyypin riskitekijänä. Siten kantajia

ESR1

haplotypes oli 3,04 kertaa suurempi riski sappirakon syöpä verrattuna ei-kantajia, kun taas saman haplotyyppien Siirretään 2,2 kertaa suurempi riski saada sappikivien sairauksiin. Sen sijaan

Alu

lisääminen polymorfismi progesteronireseptorit (

PGR

) Siirretään pienempi riski GBC ja sappikivien potilailla.

Äskettäin tutkimus Park et al. Kiinan väestö on arvioitu vaihtelut hormonireseptorit (

ESR1, ESR2

) suhteessa sappiteiden syövät (35) ja esitetty yhdistyksen kanssa

ESR1

(rs1801132) ja

ESR2

(rs1255953) variantit, GBC riski, mutta emme noudata mitään merkittävää yhteyttä näihin eksoni polymorfismit. Sen sijaan löysimme yhdessä introni (

ESR1

) ja promoottori (

ESR2

) polymorfismit. Syy tähän ristiriita voisi olla väestöstä vaihtelua. Alleelifrekvenssien on

ESR1

ja

ESR2

polymorfismien eivät olleet vertailukelpoisia kahden tutkimuksessa. Myös kokonaismäärä GBC tapausten ilmoittautunut Park et ai oli suhteellisesti pienempi verrattuna esillä olevassa tutkimuksessa, joka nostaa mahdollisuudet tyypin II β virhe tutkimuksessaan. On myös mahdollista, että SNP on

ESR1

ja

ESR2

saa suoran vaikutuksia GBC alttiuteen ja niiden vaikutukset saattavat välittyä läpi ne liittyvät joitakin keskeisiä toiminnallisia polymorfismit.

välinen yhteys

ESR1

polymorfismit ja riski GBC /sappikivet ovat biologisesti uskottavia. Eläinten tutkimukset ovat osoittaneet, että olennaiset turvallisuusvaatimukset ovat läsnä maksa- haiman-sappipuuston [30], [31], [32] kuten sappitiehyen epiteelisolujen ja sappirakon, mikä viittaa siihen, että estrogeenit voivat olla rooli sappirakon sairauksiin. Lisäksi immunohistokemiallinen ja kvantitatiivinen RT-PCR tutkimukset ovat myös paljastaneet, että ilmaisu taso

ESR1

geeni on noin 50 kertaa suurempi kuin

ESR2

[33] Eläinmalleissa, 17- beeta estradioli edistetään sappikivien muodostuminen liittyy ylössäätely maksan ilmentymisen ERalpha mutta ei ERbeta, ja sappikivien estrogeenin voidaan estää kokonaan antiestrogeeniset aineet ICI 182780 [34]. Nämä tutkimukset osoittavat, että ESR-1 on avainasemassa ja löydökset voivat tarjota uuden lähestymistavan hoitaa sappikivet ja sappirakon syöpä estämällä maksan ER toimintaa maksa-erityinen, ERalpha-selektiivisiä antagonisteja. Jotkut tutkimukset ovat korostaneet merkittävä rooli

ESR-2

rs1271572 että munasarjasyövän riskiä [35], [36]. Lisäksi tutkimus Marie-Genica Consortium ehdotti, että suurempi riski havaittiin koehenkilöillä, joilla yhdistetään genotyypit sekä

ESR1

ja

ESR2

geenien modifioitu riskejä estrogeenimonoterapia käytetään rintasyövän [37 ]. Samoin Tutkimuksessamme soveltaen geeni-geeni vuorovaikutusta ja multianalytical lähestymistapoja paljasti, että GBC riski oli suurempi, kun muunnos genotyypin

ESR1

ja villi

ESR2

-789 A C olivat läsnä yhdistelminä .

Se voi myös mainita, että geneettistä vaihtelua useissa muissa geeneissä estrogeenin biosynteesin, liikenne ja aineenvaihdunta ovat osoittaneet merkittävää yhteyttä sekä sappikivien tauti ja sappiteiden syöpä mahdollisesti muuntamalla aineenvaihduntaan [18]. IVS1-397C T ja IVS1-351A G polymorfismien ovat olleet tärkeä tutkimusalue sairauksien kuten osteoporoosin [22], [38], [39] sydän- ja verisuonisairauksien [40] ja syöpä [41]. Useita hypoteeseja toiminnallista merkitystä näiden polymorfismien on raportoitu kirjallisuudessa. Ottaen huomioon niiden sijainnin, 397 ja 351 emäsparia ylävirtaan alusta eksonin 2, on mahdollista toimintamekanismit ovat muuttuneet ESR1 ilmentymisen ero sitovat transkriptiotekijöitä ja vaikuttaa vaihtoehtoisen silmukoinnin. Meidän in-silico tutkimuksissa lisätukea vaikutuksen perimä estrogeenin reseptorin geenin transkription ja silmukoinnin mekanismit. Siten estrogeeni voi parantaa kolesteroli cholelithogenesis kasvattamalla toimintoja estrogeenin reseptorien maksassa ja sappirakko [42]. Merkitykseen hormonaalista reseptoreihin sappirakon toiminto, oletettua variantit voivat johtaa kolesterolin sappikivet seurasi krooninen tulehdus ja edelleen voimakas metaplasiasta lopulta jatkuen GBC jotka puolestaan ​​voidaan luokitella sappikiven riippuvaisen reitin estrogeenireseptoreihin.

progesteroni reseptorin polymorfismi, hyvin vähän tiedetään toiminnalliset seuraukset joka

Alu

lisäämästä progesteronireseptorille henkilöiden suojelemiseksi sappirakon syöpä ja sappikivet. PROGINS alleeli koodit PGR, joka koostuu 306 emäsparin Alu lisäämästä G introni.

PGR

ins /del on täydellisessä kytkentäepätasapainossa (D ’= 1,0) kanssa V660L polymorfismi (rs1042838) [43] (ts Insertti kantava alleeli (PGR I) osoittaa suurempi mRNA vakautta ja transkriptoidaan joka vakaampi ja transkriptionaalisesti aktiivinen proteiini [44]. PROGINS lisäys alleeli on raportoitu korreloi käänteisesti rintasyövän riskiä [45], [46], [47] ja endometrioosin [48] joissakin populaatioissa [49], [50 ], [51]. uskotaan, että kasvanut PGR voi estää mitogeeninen insuliinin kaltaiset kasvutekijät (IGF: t), mahdollisesti säätelemällä Insulin-like growth factor-sitova proteiini 1 (IBP-1) ja siten vaikuttaa syöpää riski [52], [53], [54].

tutkimus rajoitukset

Vaikka otoskoko tässä tutkimuksessa on riittävä saanto 80% teholla, mutta se on rajoitettu alaryhmäanalyysissä. siksi tutkimus saattaa vaatia vahvistusta suuremmissa ikäryhmät. Koska tämä on yhdistys tutkimus, emme voi sulkea pois niissä mahdollisesti kytkentäepätasapainossa muiden naapurivaltioiden geenejä, jotka saattavat selittää merkittävää yhteyttä sappirakon syöpä fenotyyppejä tai haitallisia ennusteeseen.

Lopuksi meidän tutkimus osoitti, että

ESR1

IVS1-397C T (rs2234693),

ESR1

IVS1-351A G (rs9340799),

ESR2

-789 A C (rs1271572) polymorfismit ja niiden korkeamman asteen vuorovaikutukset voivat antaa lisääntynyt riski sappirakko syöpä, luultavasti kautta sappikivien välittämän reitin.

Methods

Ethics lausunto

tutkimusprotokolla hyväksyi institutionaalisten eettisen komitean Sanjay Gandhin Post Graduate Institute of Medical Sciences (SGPGIMS), ja kirjoittajat seurasi normit maailman Association Helsingin julistuksen. Kaikki osallistujat olivat varustettu kirjallinen lupa tutkimukseen.

Tutkimus Väestö

Nyt esillä oleva asia verrokkitutkimuksen palvelukseen yhteensä 860 aiheita, myös 410 GBC potilaat johon kuului 230 edellinen GBC tapauksissa [ ,,,0],26], 230 sappikivien potilasta (GS) ja 220 terveillä koehenkilöillä. Kaikki etuyhteydettömille aiheet olivat Pohjois-Intian etnisyys. Potilaat peräkkäin diagnosoitu välillä kesäkuussa 2006 ja syyskuuta 2011 Dept. of Gastro-leikkaus, Sanjay Gandhi Post Graduate Institute of Medical Sciences ja Dept. of Surgical Oncology, CSMMU Lucknow, Intia. GBC määriteltiin kasvaimen johtuvat sisimpään (limakalvon) kerroksen ja leviää sisäelinten vatsakalvon (kudos, joka peittää sappirakon) ja /tai maksan ja /tai yhteen lähellä elimen (kuten mahan, ohutsuolen, paksusuolen, haima, tai sappiteiden maksan ulkopuolella), ja läheisiin imusolmukkeisiin. Syöpädiagnoosin kaikissa tapauksissa vahvistettiin Fine Needle Aspiroitu Cell sytologia (FNAC) ja histopatologia, jolloin saatiin vastausprosentti oli 94%. Lavastus syöpä oli dokumentoitu mukaan AJCC /UICC lavastus [55]. Vuonna sappikivien tauti, oireenmukainen sappikivet havaittiin transabdominaalinen ultraäänitutkimus. Terveillä verrokeilla rekrytoitiin sukulaisyksilöistä vailla maligniteetin peräisin väestössä. Yksilöiden hiljainen sappikiviä havaita ultraäänitutkimuksella jätettiin valvontaa. Kontrollit olivat taajuus sovitetaan potilaiden iän (± 5 vuotta) ja sukupuoli. Tällä rekrytointi, suostumus saatiin kultakin kohteelta ja tietoja demografisia ominaisuuksia, kuten sukupuoli, ikä ja tupakointi tapana, kerättiin kyselylomakkeella.

DNA Näytteet ja genotyypin

perusteella Edellisen toiminnalliset ja epidemiologisissa tutkimuksissa [17], valitsimme yhteensä 6 kirjallisuuden määriteltyjä toiminnallisia polymorfismien kolme tärkeää geenien kuuluvat estrogeenin ja progesteronin reseptoreihin. Ehdokas yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) valittiin perustuvat seuraaviin: (a) alleelin tiheys yli viisi prosenttia julkaistusta kirjallisuudesta tai tietokannoista [56] (b) validoitu alleeliset vaihdot, ja /tai (c) toiminnalliset muutokset liittyvät alleelinen korvaaminen raportoitu kirjallisuudessa. Näihin sisältyy kolme yhden nukleotidin polymorfismien (SNP) in estrogeenireseptorin 1 (

ESR1

: IVS1-397C T rs2234693, IVS1-351A G rs9340799), ja Ex4-122C G (rs1801132) geeni, kaksi SNP in estrogeenireseptori 2 (

ESR2

: -789 A Crs1271572, 1082 G rs1256049) geeni ja yksi SNP progesteroni reseptorin (

PGR

: ins /del rs1042838). Genomi-DNA uutettiin 5 ml ääreisverivalkosolut standardin ulossuolaus menetelmän [57]. Verinäyte ja kliiniset tiedot kerättiin jokaisen osallistujan rekrytointivaiheessa. Polymorfismien genotyypitettiin käyttäen PCR tai PCR-restriktiofragmenttipituuspolymorfismin menetelmällä, kuten on kuvattu aikaisemmin Lai

et ai

[58] ja Rowe

et ai

. [59]. Pilkottu PCR-fragmentit erotettiin polyakryyliamidigeelillä, värjättiin etidiumbromidilla ja sitä tarkkailtiin ultravioletti kuvantamisjärjestelmä (Bio-Rad Model). Tehtiin genotyypin tietämättä tapauksessa tai valvonta-asema. 10% naamioitu, satunnaisotos tapausten ja kontrollien testattiin kahdesti eri laboratorion henkilökunta ja toistettavuus oli 100%.

Tilastollinen analyysi

Tarkempi tilastoista esitettiin keskiarvon ja keskihajonnan [SD ] jatkuvia toimia samalla itseisarvo ja prosentit käytettiin kategorinen toimenpiteisiin. Chi-neliö hyvyyttä testiä käytettiin poikkeamiseen Hardy Weinberg Equilibrium kontrolleissa. Erot genotyyppi ja alleelifrekvenssit välillä opintoryhmistä arvioitiin chi-neliö testi. Ehdoton monimuuttuja LR käytettiin arvioitaessa kertoimet suhdeluvut [syrjäisimpien] ja niiden 95%: n luottamusväli [CI] korjattuna iän ja sukupuolen. Syrjäisimmillä alueilla oikaistiin sekoittavat tekijät, kuten ikä ja sukupuoli. Kahden tailed p-arvo on vähemmän kuin 0,05 katsottiin tilastollisesti merkittävä tulos. Kaikki tilastolliset analyysit suoritettiin käyttäen SPSS ohjelmistoversio 16.0 (SPSS, Chicago, IL, USA). Haplotyyppianalyysissä suoritettiin käyttäen SNPstatwww.snpstats.in [60].

Multifactor dimensionality vähennys (MDR) menetelmä on ei-parametrinen, geneettinen malli-vapaa menetelmä ratkaista joitakin rajoituksia logistinen regressio (ts näytekoko rajoituksia) havaitsemiseksi ja karakterisointi geeni-geeni vuorovaikutusta [61].