Krooninen sairaus

tiivistelmä

tavoite

transkriptiotekijä 7 kaltainen 2 (

TCF7L2

) geeni on ehdotettu olevan tärkeä rooli patogeneesissä syöpä. Kuitenkin tulokset ovat olleet ristiriitaisia. Tässä tutkimuksessa, suoritimme meta-analyysi selventää assosiaatioita

TCF7L2

polymorfismi ja syöpäriskiä.

Methods

julkaistuja PubMed ja EMBASE haettiin. Yhdistettiin kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmät alueet), jossa 95%: n luottamusväli (CI) laskettiin käyttäen kiinteä- tai random-vaikutusten mallia.

Tulokset

yhteensä 19 tutkimukset (14814 tapausta ja 33856 valvonta) tunnistettiin analysoinnissa yhdistyksen välillä

TCF7L2

polymorfismi ja syöpäriskiä. Tulokset osoittivat, että

TCF7L2

polymorfismi liittyi rintasyöpään (Homogeeniset malli: OR = 1,17, 95% CI = 1,02-1,35,

I

2 = 21,8%,

p

heterogeenisyyden = 0,276; heterogeeninen malli: OR = 1,11, 95% CI = 1,03-1,20,

I

2 = 0,0%,

p

heterogeenisyyden = 0,543), eturauhassyöpä (Homogeeniset malli: OR = 0,89, 95% CI = ,84-,96,

I

2 = 0,0%,

p

heterogeenisyyden = 0,640; heterogeeninen malli : OR = 0,89, 95% CI = +0,84-,95,

I

2 = 0,0%,

p

heterogeenisyyden = 0,871), ja paksusuolen syöpä (heterogeeninen malli: OR = 1,15, 95% CI = 1,01-1,31,

I

2 = 0,0%,

p

heterogeenisyyden = 0,658), mutta ei peräsuolen syöpä, keuhkosyöpä ja munasarjasyövän .

Johtopäätökset

Tämä meta-analyysi osoitti, että oli merkitsevästi assosiaatioita

TCF7L2

rs7903146 ​​polymorfismi ja rintasyövän, eturauhas- ja paksusuolen syöpiä, pikemmin kuin peräsuolen syöpä , keuhkosyöpä ja munasarjasyövän.

Citation: Chen J, Yuan T, Liu M, Chen P (2013) välisestä assosiaatiosta TCF7L2 Gene polymorfismi ja syöpäriski: meta-analyysi. PLoS ONE 8 (8): e71730. doi: 10,1371 /journal.pone.0071730

Editor: Swati Palit Deb, Virginia Commonwealth University, Yhdysvallat

vastaanotettu: 21 helmikuu 2013; Hyväksytty: 09 heinäkuu 2013; Julkaistu: 09 elokuu 2013

Copyright: © 2013 Chen et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Kirjoittajat ei ole tukea tai rahoitusta raportoida.

kilpailevat edut: kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

transkriptiotekijä 7 kaltainen 2 (

TCF7L2

) geenin, aikaisemmin raportoitu

TCF-4

, on havaittu liittyvän tyypin 2 diabetes. Rs7903146 ​​muunnelma

TCF7L2

geeni ensin määritelty yhdeksi alttius merkki tyypin 2 diabetes genomin laajuinen yhdistys tutkimuksessa [1]. Seuraavat tutkimukset vahvistivat lisäksi yhdistyksen välillä

TCF7L2

rs7903146 ​​variantti ja tyypin 2 diabetes [2]. Lisäksi henkilöt kuljettaa T alleelin

TCF7L2

rs7903146 ​​muunnos osoitti suuri riski insuliiniresistenssiä [3]. Vaihtoehtoisesti

TCF7L2

voi vaikuttaa syövän riippumatta diabeteksen, kuten

TCF7L2

geenituote osallistuu Wnt /β-kateniinin signalointireitin. TCF7L2 muodostaa aktiivinen ydinvoimalassa kanssa β-kateniinin, joka sitoo ja indusoi kohdegeenien mukana soluproliferaatioon kiertäminen apoptoosin, ja kudosten ja metastaasit.

Tähän mennessä monet tutkimukset on julkaistu tutkii assosiaatio

TCF7L2

rs7903146 ​​tai rs12255372 (se on korkea kytkentäepätasapainossa rs7903146) ja useiden syöpätyyppien, kuten rintasyöpä [4] – [8], eturauhassyöpä [5], [9] – [ ,,,0],12], paksusuolen ja peräsuolen syövän [5], [13] – [15], paksusuolen syöpä [5], [16], keuhkosyöpä [5] ja munasarjasyöpä [6]. Kuitenkin johtopäätökset ovat olleet ristiriitaisia. Siksi teimme meta-analyysi selventää yhdistyksen välillä

TCF7L2

rs7903146 ​​variantti ja syöpäriskiä.

Materiaalit ja menetelmät

Kirjallisuus ja haku strategia

Haimme PubMed ja EMBASE kirjallisuuden tietokantoja. Hakustrategia tunnistamaan kaikki mahdolliset tutkimukseen osallistui käyttöön seuraavat keskeiset sanat: (

TCF7L2

tai transkriptiotekijä 7-like 2 tai

TCF-4

) ja (muunnos tai muunnelma tai polymorfismi tai genotyypin) ja (syöpä tai syöpä tai kasvain). Kaikki liittyvät tutkimukset julkaistaan ​​Englanti kieli sisällytettiin. Viiteluetteloihin irrotetun artikkelit käsin etsitään. Jos useampi kuin yksi artikkeli julkaistiin käyttäen samaa tapauksessa sarja, vain tutkimuksessa uusimmat tiedot oli mukana. Kirjallisuudesta päivitettiin 18. helmikuuta 2013.

Sisällyttämiskriteerit ja Data Extraction

sisällytettyjen tutkimusten meta-analyysissä on täytettävä kaikki seuraavat kriteereillä: (1) arvioidaan yhdistysten on

TCF7L2

polymorfismi syöpäriskiä; (2) käyttää tapaus-verrokki tai kohortti suunnittelu; ja (3) antaa riittävästi laskennan kerroinsuhde (OR), jossa 95%: n luottamusväli (CI). Seuraavat tiedot kustakin uutettiin tutkimus: (1) nimen ensimmäinen tekijän; (2) ilmestymisvuosi; (3) alkuperämaa; (4) kansallisuus; (5) syöpä tyyppi; (6) otoskoko tapausten ja valvontaa; (7) covariates ’säädetty tai 95%: n luottamusväli yhteispäätösmenettelyssä hallitseva mallia; (8) pienet alleelin esiintymistiheys tapauksissa ja valvontaa; (9)

p

Hardy Weinberg tasapaino testi kontrolleissa; ja (10) tutkivat polymorfismi. Kaksi kirjoittajat itsenäisesti arvioi artikkeleita noudattamisen sisällyttäminen /poissulkemisperusteet, ratkaistaan ​​erimielisyydet ja saavutti johdonmukainen päätös.

Tilastollinen analyysi

yhdistys

TCF7L2

polymorfismi kanssa syöpäriski arvioitiin laskemalla yhdistetyssä syrjäisimpien alueiden ja 95% CI alle yhteistyössä hallitseva malli. Merkitys yhdistettyä OR määritettiin Z testi (P ​​ 0,05 pidettiin tilastollisesti merkitsevä). Q Testi suoritettiin arvioimiseksi Tutkimusten välisten heterogeenisuus. Satunnaisvaikutusmalliin (Dersimonian-Laird menetelmä [17] tai määräaikaisia ​​(Mantel-Haenszel menetelmä) [18] vaikutusten mallia käytettiin laskemiseen yhdistettiin OR läsnäollessa (

P

≤0.10) tai puuttumisen (

P

0,10) heterogeenisuuden, vastaavasti. alaryhmäanalyysi syöpätyypin tehtiin käsitellä Tutkimusten välisten heterogeenisuus. Julkaisu bias arvioitiin Begg testillä [19] ja Egger testi [20] (

P

0,05 pidettiin tilastollisesti merkitsevä). Tietojen analysointi suoritettiin käyttäen STATA versio 11 (StataCorp LP, College Station, TX, USA).

tulokset

Ominaisuudet Studies

tässä tutkimuksessa me seurasimme PRISMA Statement (tarkistuslista S1). vuokaavio, joka kuvaa prosessia sisällyttäminen /poissulkeminen tutkimus on esitetty kuvassa. 1. kirjallisuudesta tunnistettiin yhteensä 128 mahdollisesti merkitystä papereita. heistä 112 paperit jätettiin vuoksi ilmeinen merkityksettömyyden lukemalla otsikot ja tiivistelmät. lisäksi kaksi paperit ulkopuolelle, koska ne olivat arvioita. Sitten 14 paperit täyttänyt ensisijaisen kriteerit. Kuitenkin yksi paperi jätettiin pois, koska se ei ollut riittäviä tietoja laskemiseen tai 95% CI [21]. Koska useampi kuin yksi tutkimus sisältyi kaksi artikkeleita Folsom et ai [5] ja Goode et ai [6], niitä pidettiin erillisinä tutkimusten meta-analyysi. Lisäksi koska rs7903146 ​​oli korkea LD kanssa rs12255372, yhdistimme kaikki mukana tutkimuksissa yhdessä. Vihdoin, 19 tutkimuksia yhdistyksen välillä

TCF7L2

polymorfismi ja syövän riskiä sisällytettiin lopulliseen meta-analyysi. Heistä viisi oli rintasyöpää, viisi olivat eturauhassyöpä, neljä olivat peräsuolen syöpä, kaksi olivat paksusuolensyöpä, kaksi olivat keuhkosyöpää, ja yksi oli munasarjasyöpä. Ominaisuudet mukana tutkimuksissa, on lueteltu taulukossa 1. On huomattava, että koska useimmat tutkimukset edellyttäen covariates ”säätää tai 95%: n luottamusväli alle yhteistyössä hallitseva malli, laskimme yhdistetyistä arvio tämän mallin vain.

Meta-analyysin tulokset

yhteensä 14814 tapausta ja 33856 kontrolliraskauksiin analysoinnissa yhdistyksen välillä

TCF7L2

polymorfismi syöpäriskiä. Tulokset osoittivat, että

TCF7L2

polymorfia ei ehkä liittyy syövän riski yhteispäätösmenettelyllä hallitseva malli (Homogeeniset malli: OR = 1,07, 95% CI = 0,95-1,21,

I

2 = 61,4%,

p

heterogeenisyyden 0,001, kuva 2, heterogeeninen malli: OR = 1,04, 95% CI = 0,97-1,12,

I

2 = 58,1%,

p

heterogeenisyyden = 0,001, kuva 3). Kuitenkin edelleen alaryhmäanalyysi syövän tyypin ehdotti, että vaikutus koko oli merkittävä rintasyövän (Homogeeniset malli: OR = 1,17, 95% CI = 1,02-1,35,

I

2 = 21,8%,

p

heterogeenisyyden = 0,276; heterogeeninen malli: OR = 1,11, 95% CI = 1,03-1,20,

I

2 = 0,0%,

p

heterogeenisyyden = 0,543), eturauhassyöpä (Homogeeniset malli: OR = 0,89, 95% CI = 0,84-0,96,

I

2 = 0,0%,

p

heterogeenisyyden = 0,640; heterogeeninen malli: OR = 0,89, 95% CI = 0,84-0,95,

I

2 = 0,0%,

p

heterogeenisyyden = 0,871), ja paksusuolen syöpä (heterogeeninen malli: OR = 1,15, 95% CI = 1,01-1,31,

I

2 = 0,0%,

p

heterogeenisyyden = 0,658), mutta ei peräsuolen syöpä, keuhkosyöpä, ja munasarjojen syöpä (kaikki

p

0,05, taulukko 2).

Mahdolliset Julkaisu bias

Ei julkaistu bias voitiin havaita homogeenisissa co-hallitseva malli (

p

= 0,780 varten Begg testi ja

p

= 0,123 varten Egger testi) ja heterogeeninen yhteistyö hallitseva malli (

p

= 0,889 varten Begg testi ja

p

= 0,274 varten Egger testi).

keskustelu

parhaan tietomme mukaan meidän meta-analyysi on ensimmäinen yksi tutkivat yhdistyksen välillä

TCF7L2

rs7903146 ​​polymorfismi ja syöpäriskiä. Tulokset viittasivat siihen, että

TCF7L2

rs7903146 ​​polymorfia ei ehkä liittyy syövän riskiä. Kuitenkin edelleen ositettu analyysi osoitti merkittävää yhteyttä rintasyöpä, eturauhassyöpä ja paksusuolen syöpä, eikä niinkään peräsuolen syöpä, keuhkosyöpä, ja munasarjasyöpä.

Mielenkiintoista on, että T-alleelin rs7903146 ​​polymorfismin, joka on liitetty lisääntynyt riski tyypin 2 diabetes, osoitti käänteinen yhdessä eturauhassyövän pohjautuvat meta-analyysi. Havainto oli yhdenmukaiset yksittäisistä tutkimuksista Folsom et al. [5] ja Machiela et ai [12]. Kuitenkin muut kolme mukana tutkimuksessa ei viitannut järjestön [9] – [11]. Lisäksi löysimme välistä positiivista rs7903146 ​​polymorfismin ja rintasyövän riskiä. Äskettäin Michailidou K et al. [22] ovat löytäneet rs7904519 intronissa 4

TCF7L2

(r

2 = 0,37 kanssa rs7904519 /rs12255372) liittyvän rintasyöpään. Lisätutkimukset ovat tarpeen tutkia mahdollisia eri mekanismit

TCF7L2

polymorfismi erilaisissa syövissä.

heterogeenisyys välillä tutkimuksissa on yleinen meta-analyysi geneettiset assosiaatiotutkimuksilla. Vaikka heterogeenisuus voidaan ottaa huomioon suorittamalla random-vaikutuksia mallissa, se lisäisi kertoimella tyypin I virhe [23]. Löysimme merkittäviä Tutkimusten välisten heterogeenisuus yhdistys

TCF7L2

rs7903146 ​​polymorfismi syöpäriskiä. Siksi alaryhmäanalyysi syöpätyyppeihin avulla selvitettiin lähde heterogeenisyys. Tulokset osoittivat, että Tutkimusten välisten heterogeenisuus katosi useita alaryhmiä, mutta jäi muiden alaryhmien ehdottaa muita covariates saattavat häpeään -alueella.

Nykyinen meta-analyysi on useita vahvuuksia. Ensinnäkin, OR (95% CI) jälkeen covariates säätö yksittäisten tutkimus käytettiin laskettaessa yhdistettiin arvio, mikä lisäsi tarkkuutta vaikutuksen arvio. Toiseksi, tilastollinen teho oli parantunut yhdistyksen tutkimus

TCF7L2

rs7903146 ​​polymorfismi yhdistetyssä analyysissa. Kuitenkin, useita rajoituksia myös syytä huomata. Ensinnäkin tapaus – verrokkitutkimus rakenne ei salli, että päättely välisen syy geenin polymorfismin ja lopputuloksen. Toiseksi vaikutus geenin – geenin /gene – ympäristön vuorovaikutuksesta ei ole käsitelty tässä meta-analyysi. Kolmanneksi, vaikka etnisen tärkeä rooli yhdistys

TCF7L2

rs7903146 ​​polymorfismi syöpäriskiä, ​​emme tee vielä alaryhmäanalyysi etnisyyden takia rajallinen tutkimukset kullekin syöpätyypin.

Lopuksi, tulokset osoittivat, että oli merkitsevästi yhdistyksen välillä

TCF7L2

rs7903146 ​​polymorfismi ja rintasyövän riskiä, ​​eturauhasen syöpä ja paksusuolen syöpä, eikä niinkään peräsuolen syöpä, keuhkosyöpä, ja munasarjasyöpä. Edelleen hyvin suunniteltu laajoja tutkimuksia tarkasteltaessa geeni-geeni ja geeni-ympäristön vuorovaikutukset olisi tehtävä tutkia yhdistyksen tulevaisuudessa.

tukeminen Information

tarkistuslista S1.

PRISMA tarkistuslista.

doi: 10,1371 /journal.pone.0071730.s001

(DOC) B