Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Aikaisemmat tutkimukset tutkivat yhdistyksen välillä röntgen korjaus rajat komplementaatioryhmä 1 (XRCC1) polymorfismit ja kohdunkaulan syöpä (CC) riski on antanut ristiriitaisia ​​tuloksia. Tutkimuksen tarkoituksena oli arvioida yhdistyksen välinen XRCC1 geeni Arg399Gln, Arg194Trp, Arg280His polymorfismit ja riski CC.

Methods

Kaksi tutkijat itsenäisesti etsinyt Medline, EMBASE, CNKI, ja Kiinan biolääketieteen tietokannat tutkimuksia julkaistaan ​​ennen maaliskuun 2011.Summary kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja 95%: n luottamusvälit (CI) varten XRCC1 polymorfismien ja CC oli laskettu kiinteiden vaikutusten mallia tai satunnaista vaikutuksia malli tarvittaessa.

tulokset

Lopulta 9, 5 ja 2 tutkimuksia todettiin olevan oikeutettuja meta-analyysejä Arg399Gln, Arg194Trp ja Arg280His, vastaavasti. Analyysimme ehdotti, että variantti genotyypin Arg194Trp liittyi merkitsevästi lisääntynyt CC riski (Trp /Trp vs Arg /Arg, OR = 2,21, 95% CI = 1,60-3,06; Arg /Trp vs Arg /Arg, OR = 1,23, 95% CI = 1,02-1,49, hallitseva malli, OR = 1,36, 95% CI = 1,14-1,63; väistyvä malli, OR = 2,06, 95% CI = 1,51-2,82). Sillä Arg280His polymorfismi, mitään selvää yhdistysten havaittiin kaikki geneettiset malleissa. Sillä Arg399Gln polymorfismi, myös mitään selvää yhdistysten havaittiin kaikki geneettiset malleissa. Vuonna alaryhmäanalyyseissa etnisyys /maa, joka on merkittävästi lisääntynyt riski havaittiin keskuudessa Aasian, etenkin Kiinan. Saada tarkempaa todisteita, säädettävä syrjäisimmät alueet (95% CI) mahdolliset sekoittavien tekijöiden (kuten ikä, kansallisuus tai tupakointia, jne) laskettiin myös XRCC1 Arg399Gln ja Arg194Trp kuitenkin arvioitu yhdistettiin säädetty tai vieläkään ei muuttunut lainkaan.

Johtopäätös

Tämä meta-analyysi viittaa siihen, että Arg194Trp polymorfismia voi liittyä CC riski, Arg399Gln polymorfismi voi olla matalan penetrent riskitekijä SK: ta vain aasialaiset, ja siellä voi olla yhdistys välillä Arg280His polymorfismin ja CC riskiä.

Citation: Li Y, Liu F, Tan SQ, Wang Y, Li SW (2012) X-Ray Repair Cross-täydennykseksi Ryhmä 1 (XRCC1) geneettisten polymorfismien ja kohdunkaulan syövän riski : valtava Systematic Review and Meta-analyysi. PLoS ONE 7 (9): e44441. doi: 10,1371 /journal.pone.0044441

Toimittaja: JoEllen M. Schildkraut, Duke University Medical Center, Yhdysvallat

vastaanotettu: 14 maaliskuu 2012; Hyväksytty: 03 elokuu 2012; Julkaistu: 12 syyskuu 2012

Copyright: © Li et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Kirjoittajat ei ole tukea tai rahoitusta raportoida.

kilpailevat edut: kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

X-ray korjaus rajat täydentävät ryhmä 1 (XRCC1) proteiini, joka koodaa XRCC1 geeni, on tärkeä osa pohjan Leikkauskorjauksessa (BER) kautta. SNP 1 alttiita geenissä ovat yhä korostettu sillä perusteella, että XRCC1 pidetään tärkeä tukirakenne proteiini tiiviisti pohjan Leikkauskorjauksessa polku [1], [2], joka on ajateltu olevan hallitseva DNA-vaurioita korjaus koulutusjakson käsittelyn pienten pohjan vaurioita peräisin hapettumista ja alkylointi vahinkoa [3]. XRCC1 geeni sijaitsee kromosomissa 19q13.2-13.3 [4], ulottuu geneettinen etäisyys 33 kb, sisältää 17 eksonia ja koodaa 70 kDa: n proteiinia, joka koostuu 633 aminohaposta [5]. Vaikka on olemassa enemmän kuin 300 validoitu yhden nukleotidin polymorfismit (SNP: t) on XRCC1 geenin raportoitu dbSNP tietokantaan (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP), kolme XRCC1 on eniten tutkittu [6], [7] ja lukemiin aminohapposubstituutioihin XRCC1 kodonissa 194 (asemassa 26304 on eksonin 6, pohja C T, aminohappo Arg: stä Trp, dbSNP ei. rs1799782), kodonissa 280 (asemassa 27466 on eksonin 9, pohja G: stä A, aminohappoon Arg His, dbSNP ei. rs25489) ja kodonissa 399 (asemassa 28152 on eksonin 10, pohja G: stä A, aminohappoon Arg Gin, dbSNP no.rs25487), nämä ei-konservatiivisia aminohappo- muutoksia voi muuttaa XRCC1 toiminto. Tämä muutos proteiinin biokemian johtaa oletukseen, että variantti alleelit voivat heikentää korjaus kinetiikka vaikuttaa näin alttius haitallisia terveysvaikutuksia, kuten syöpää.

Altistuminen eri sisäsyntyinen ja eksogeeniset mutageenien ja karsinogeenien voi johtaa erilaisten DNA vahingoista. Nämä muutokset, jos ei korjata, voi aiheuttaa geneettinen epävakaus, mutageneesiä ja syövän. Tärkeää on, torjumaan haitallisia seurauksia DNA: ta vaurioittavien aineiden, evoluutio on muovattu useita DNA-korjaus- että koko huolehtivat useimmat loukkauksia aiheutettu solun elintärkeiden geneettistä informaatiota. Korjaukseen erityyppisten DNA vahinkoja on tärkeää turvata genomisen koskemattomuuden [8]. Tärkeimpiä DNA huolto mekanismit toimivat ihmisillä, BER on ensisijainen puolustuslinja vaurioita syntyy ionisoivaa säteilyä ja vahva alkyloivat aineet sekä vaurioita muodostuu endogeenisen DNA: ta vaurioittavien aineiden, kuten viruksia [9].

Kohdunkaulan syöpä (CC) on toiseksi yleisin maligniteetti naisten kaikkialla maailmassa, ja on edelleen johtava syy syövän naisten yleisin kuolinsyy. Kehitysmaissa, joissa laaja seulonta on edelleen käytettävissä, kohdunkaulan syöpä vastaa suhteettoman osuus kuolleisuutta [10], [11]. Suurin esiintymistiheys työllisyysasteet ovat Saharan eteläpuolisessa Afrikassa, Melanesia, Karibia, Etelä-Keski-ja Kaakkois-Aasiassa ja Latinalaisessa Amerikassa [12]. Erilaisia ​​todisteita osoitti vahvan yhteyden kehittäminen kohdunkaulan syövän ja korkean riskin ihmisen papilloomaviruksen (HR-HPV) infektio [13], kuten HPV 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56 , 58, 59, 68, ja muut. Kuitenkin suurin osa HPV-infektiot ovat ohimeneviä ja vain pieni osa tartunnan saaneiden naisten HPV kehittyy CC [14]. Tämä osoittaa, että HPV-infektio on välttämätön tapahtuma, mutta ei riitä CC. Siksi muut tekijät, kuten ympäristötekijöiden ja isäntä geneettinen tausta, voi olla ratkaiseva rooli kehittämisessä CC [15]. Tunnistaminen geneettisiä variantteja liittyvä kohdunkaulan syövän edistävät ymmärtämistä taustalla mekanismeista sen kehityksen ja mahdollisesti tarjota terapeuttisia tavoitteita.

Viimeisten kahden vuosikymmenen aikana, useat tapausverrokkitutkimukset [16] – [25 ] tehtiin tutkimaan yhdistyksen välillä XRCC1 Arg194Trp, Arg280His, Arg399Gln polymorfismit ja riski CC naisilla. Mutta nämä tutkimukset raportoitu ristiriitaisia ​​tuloksia. Erilaisia ​​menetelmiä on käytetty, mutta erityisesti joissakin tutkimuksissa käytetty otoskoko on pieni ja sen vuoksi ei ole yllättävää, että on ollut puutetta replikaation eri tutkimuksissa. Käyttämällä kaikkia käytettävissä julkaistut tiedot lisätä tilastollinen voima, oletettiin, että meta-analyysi voisi mahdollistaa uskottava ehdokas geenien ulkopuolelle ja niitä aiheuttavat geenit voidaan tunnistaa luotettavasti. Siksi olemme ottaneet meta-analyysi, jossa kaikki julkaistut tapausverrokkitutkimukset prosessoidaan vahvistaa, onko Arg194Trp, Arg280His, Arg399Gln polymorfismi XRCC1 geenin promoottori lisäsi riskiä CC.

Materiaalit ja menetelmät

hakustrategia

PubMed, EMBASE, CNKI (China National Knowledge Infrastructure) ja Kiinan biolääketieteen tietokantojen (edellinen haku päivitettiin maaliskuu 2011) käytettiin samanaikaisesti yhdistelmän Englanti ja /tai Kiinan keskeisiä termejä: ”X-ray korjaus cross -complementing ryhmä 1” tai ”XRCC1”, tai ”BER”, ”polymorfismi” tai ”genotyyppi” tai ”alleeli”, ja ”kohdunkaulan syöpä” tai ”syöpä kohdunkaula” tai ”kohdunkaulan karsinooma’. Kaikki julkaisua Englanti kielellä ja kiinan kielen kanssa saatavilla koko tekstin vastaavat voivat kriteerit haettiin. Lisäksi olemme myös tarkistanut viittaukset asiaan arvioita ja voivat artikkeleita, että hakua noudetaan. Jos useampi kuin yksi artikkeli on julkaistu saman tekijän käyttäen samaa tapauksessa sarja, valitsimme tutkimukseen, jossa useimmat ihmiset tutkittiin.

valintakriteerit ja tunnistaminen Studies

liittämisestä tähän meta-analyysi, tunnistaa esineet oli annettava tietoja seuraavista: (i) XRCC1 Arg194Trp, Arg280His tai Arg399Gln polymorfismien ja CC riski (Riippumatta okasolusyöpä tai adenokarsinooma), (ii) käyttäen tapaus-verrokki tai kohortti suunnittelu; (Iii) riittävät tiedot jätetyn kerroinsuhde (OR), jossa 95%: n luottamusväli (CI); (Iv) viimeisimmän ja /tai suurimman tutkimuksessa uuttuvia tietojen pitäisi kuulua koskevat tutkimukset päällekkäisiä potilaiden ja valvontaa. Suurimmat syyt sulkeminen tutkimuksista olivat seuraavat: (i) kaksoiskappale tiedot, (ii) abstrakti, kommentoida, lue ja toimituksellisen ja (iii) ei riittävästi tietoa raportoitu.

Data Extraction

Kaksi tutkijat (Ya Li ja Fei Liu) uuttaa tietoa kaikista hyväksyttävistä julkaisuista itsenäisesti mukaan pääsyn kriteerit yllä. Erimielisyydet ratkaistiin keskustelua väliin kaksi tutkijaa. Jos kaksi kirjoittajat eivät päässeet yksimielisyyteen, sitten kolmas tutkija (Shang-Wei Li) kuultiin riidan ratkaisemiseksi ja lopullisen päätöksen tehnyt enemmistö. Seuraavat ominaisuudet kerättiin kunkin tutkimuksen: ensimmäinen kirjoittaja, julkaisuvuosi, maan /alueen ensimmäisen tai vastaava tekijä, etnisyys, tapausten määrä ja valvonnan, genotyypitysmenetelmiä, vähäinen alleelin taajuus (MAF) kontrolleissa, ja todisteet Hardy -Weinberg tasapaino (HWE). Eri etnisten ryhmien luokiteltiin Aasialainen, Kaukaasialainen. Jos alkuperäinen genotyypin frekvenssi tiedot olivat saatavilla asiaa artikkeleita, pyyntö lähetettiin vastaava kirjailija lisätietoja.

Tilastollinen analyysi

Ensin arvioitiin HWE kontrolleissa tutkimusta varten käyttäen goodness- of-fit testi (

chi-neliö

tai

Fisherin

testi) ja

P

0,05 pidettiin merkittävänä epätasapainoon. Vahvuus yhdistyksen välillä CC ja XRCC1 Arg194Trp, Arg280His ja Arg399Gln polymorfismien arvioitiin käyttämällä syrjäisimmillä alueilla, joilla vastaava 95% CI. Merkitys yhdistettyä syrjäisimpien alueiden testattiin Z testi (

P

0,05 katsottiin merkitseväksi). Sillä XRCC1 Arg194Trp polymorfismi, ensin tarkasteltiin riski variantin genotyyppien Trp /Trp tai Arg /Trp CC verrattuna villityypin Arg /Arg homotsygootti. Sitten riski (Trp /Trp + Arg /Trp) vs. Arg /Arg ja Trp /Trp vs (Arg /Trp + Arg /Arg) varten CC arvioitiin hallitseva ja väistyvä malleja. Sillä XRCC1 Arg280His ja Arg399Gln polymorfismien, me myös suorittaa neljästä geneettistä mallia. Jos mahdollista, me myös suorittaa kerrostunut analyysit etnisyys, maa, julkaisemiseen, tutkimus otoskoko.

Sekä Cochranin Q tilastollinen [26] testata heterogeenisuus ja

I

2 tilastotieto määrällisesti osuus koko vaihtelu johtuu heterogeenisuudesta [27] laskettiin.

P

arvo on yli nimellistasoa 0,10 Q tilaston osoitti puute heterogeenisuus tutkimuksissa mahdollistaa käytön kiinteiden vaikutusten malli (Mantel-Haenszel menetelmä) [28]; muuten, random-vaikutusten malli (jäljempänä Dersimonian ja Laird menetelmää) käytettiin [29]. Tutkitaan lähteitä heterogeenisuus tutkimuksissa teimme logistinen meta-Regressioanalyysistä. Tutkimme Seuraava tutkimus ominaisuudet: etnisyys, maa, HWE kontrolleissa (kyllä ​​/ei), genotyypitysmenetelmiä ja tutkimuksen otoskoko (≤400 ja 400 potilasta). Herkkyysanalyysi suoritettiin arvioimaan vakautta tuloksia. Kumulatiivinen meta-analyysit yhdistysten kullekin SNP tehtiin myös läpi lajitelma tutkimuksissa julkaisemiseen.

Useita menetelmiä käytettiin arvioida mahdolliset julkaisun harhaa. Silmämääräinen tarkastus suppilo juoni epäsymmetrian tehtiin. Begg sijoitus korrelaatio menetelmä [30] ja Egger painotettu regressiomenetelmä [31] käytettiin tilastollisesti arvioida julkaisun bias (

P

0,05 pidettiin tilastollisesti merkitsevä). Kaikki tilastolliset analyysit suoritettiin Stata ohjelmiston (versio 11.0, STATA Corp., College Station, TX, USA) käyttäen kaksipuolista

P

-arvot.

Tulokset

Literature Etsi ja Study Selection

56 paperit olivat merkityksellisiä hakusanojen. Seulomalla otsikko ja lukemalla tiivistelmä ja koko artikkeli, 10 voivat artikkeleita [16] – [25] (kuusi [16] – [21] Englanti ja neljä [22] – [25] kiinaksi) sisällytettiin perustuvat hakuehtoja, joista yksi oli väitöskirjoista jatko-opiskelijoiden [24], CC alttius liittyy XRCC1 geeni Arg194Trp, Arg280His ja Arg399Gln polymorfismit. Kirjallisuudesta ja tutkimus valintamenettelyt esitetään kuvassa 1.

Tutkimus ominaisuudet olivat yhteenveto taulukossa 1. Oli seitsemän tutkimusta aiheista Aasian syntyperää, kaksi tutkimusta aiheista Kaukasian syntyperää ja yksi alistaa Latinalaisen Amerikan laskeutuminen. Näistä tutkimuksista, 5 on tutkittu vain XRCC1 Arg399Gln polymorfismi, 3 tutkimuksissa mukana XRCC1 Arg194Trp ja Arg399Gln polymorfismien, kun taas 1 tutkimukset mukana XRCC1 Arg194Trp, Arg280His ja Arg399Gln polymorfismien, ja 1 tutkimuksessa oli mukana XRCC1 Arg194Trp ja Arg280His polymorfismit. Siksi oli 9 tapausverrokkitutkimukset kanssa 1761 tapauksia ja 2552 säätimet Arg399Gln polymorfismi, 5 tapausverrokkitutkimukset kanssa 893 tapausta ja 1237 säätimet Arg194Trp polymorfismin ja 2 tapausverrokkitutkimukset kanssa 662 tapausta ja 975 säätimet Arg280His polymorfismi. Tutkimukset oli tehty Kiinassa, Japanissa, Slovakiassa, Puolassa, Thaimaassa ja Argentiinassa. Kontrollit olivat pääosin terve väestö tai verenluovuttajien. 9/10 tutkimukset uutettu DNA ääreisverenkierron ja klassinen PCR-RFLP määritys käytettiin 8 10 tutkimuksia. Vain 5/10 (50%) kuvatut tutkimukset käytön positiivisten kontrollien ja eri genotyypitysmääritys vahvistaen. Genotyyppi jakaumat keskuudessa valvontaa kaikkien tutkimusten seurasi HWE paitsi kaksi tutkimusta [19], [20] varten Arg194Trp polymorfismin ja yhdessä tutkimuksessa [22] varten Arg280His polymorfismin.

XRCC1 Arg194Trp ja Arg280His polymorfismi

Five tapausverrokkitutkimukset [17] – [20], [22] kanssa 893 tapausta ja 1237 säätimet XRCC1 Arg194Trp sisällytettiin lopulta. Oli suuri vaihtelu XRCC1 Arg194Trp Trp alleelin frekvenssi eri etnisten ryhmien, jotka vaihtelevat 9% Latinalaisen Amerikan väestöstä [20] 29% ja Aasian väestöstä [17]. Sillä XRCC1 Arg194Trp polymorfismi, joka on merkittävästi lisääntynyt CC riski havaittiin, kun kaikki tutkimukset yhdistettiin osaksi meta-analyysi (TrpTrp vs. ArgArg: OR = 2,21, 95% CI = 1,60-3,60,

P

heterogeenisyys = 0,53; ArgTrp vs. ArgArg: OR = 1,23, 95% CI = 1,02-1,49,

P

heterogeenisyys = 0,39; hallitseva malli: OR = 1,36, 95% CI = 1,14-1,63

P

heterogeenisyys = 0,71, ja väistyvä malli: OR = 2,06, 95% CI = 1,51-2,82,

P

heterogeenisyys = 0,54) (kuvio 2A). Kun ositella etnisyys, huomattavasti kohonneeseen riskiin havaittiin joukossa Aasian (TrpTrp vs. ArgArg: OR = 2,29, 95% CI = 1,63-3,20,

P

heterogeenisyys = 0,46; hallitseva malli: OR = 1,34, 95% CI = 1,11-1,62,

P

heterogeenisyys = 0,61). Lisäksi kun alaryhmäanalyyseissa tutkimuksiin genotyypin jakelun valvonnan HWE tai ulos HWE, joka on merkittävästi kohonnut riski todettiin niiden joukossa tutkimuksia genotyypin jakelun valvonnan HWE (TrpTrp vs. ArgArg, OR = 2,16, 95% CI = 1.53- 3.05,

P

heterogeenisyys = 0,61; hallitseva malli: OR = 1,33, 95% CI = 1,09-1,62,

P

heterogeenisyys = 0,52).

keskusta jokaisen neliön edustaa OR, alueen neliö on määrä otokseen ja painoa käytetään meta-analyysi, ja vaakasuora viiva osoittaa 95%: n luottamusväli. (A) Arg194Trp, Trp /Trp + Trp /Arg vs. Arg /Arg. (B) Arg399Gln, Gin /Gln + Gin /Arg vs. Arg /Arg.

oli vain kaksi tapausverrokkitutkimukset [17], [22], joka oli tehty tutkimaan XRCC1 Arg280His polymorfismit ja CC riski. Tulokset Yhdistetyn analyysit osoittivat, että XRCC1 Arg280His polymorfismi ei liittynyt CC riski (taulukko 2).

XRCC1 Arg399Gln polymorfismi

Yhdeksän tapausverrokkitutkimukset [16] – [ ,,,0],21], [23] – [25] kanssa 1761 tapausta ja 2552 kontrollia sisällytettiin varten yhteydestä XRCC1 Arg399Gln polymorfismin ja CC riski. Oli suuri vaihtelu XRCC1 Arg399Gln Gin alleelin frekvenssi eri etnisten ryhmien, jotka vaihtelevat 19% ja Aasian väestöstä [17] on 42% Latinalaisen Amerikan väestöstä [20] kantavassa genotyyppi jakaumat keskuudessa valvontaa kaikkien tutkimukset olivat sopusoinnussa HWE varten XRCC1 Arg399Gln polymorfismin.

arvioinneissa yhdistyksen XRCC1 Arg399Gln polymorfismi sertin riski on esitetty taulukossa 3. tulokset yhdistetyn analyysit osoittivat, että XRCC1 Arg399Gln ei liittynyt CC riski kaikki geneettiset mallit (GlnGln vs. ArgArg: OR = 1,20, 95% CI = 0,78-1,84,

P

heterogeenisyys = 0,003; ArgGln vs. ArgArg: OR = 1,07, 95% CI = 0.82- 1,41,

P

heterogeenisyys = 0,001; hallitseva malli: OR = 1,08, 95% CI = ,82-+1,41,

P

heterogeenisyys 0,001 ja väistyvä malli: OR = 1,19, 95% CI = 0,86-1,66,

P

heterogeenisyys = 0,06) (kuvio 2B). Vuonna alaryhmäanalyyseissa etnisyys /maa, joka on merkittävästi lisääntynyt riski havaittiin joukossa Aasian (ArgGln vs. ArgArg: OR = 1,24, 95% CI = 1,07-1,43,

P

heterogeenisyys = 0,16), etenkin kiina (ArgGln vs. ArgArg: OR = 1,27, 95% CI = 1,08-1,49,

P

heterogeenisyys = 0,07). Kun ositella tutkimalla otoskoko, huomattavasti lisääntynyt CC riski havaittiin keskuudessa suuren otoksen tutkimukset ( 400 potilasta) (Arg /Gin vs. ArgArg: OR = 1,36, 95% CI = 1,17-1,59, hallitseva malli: OR = 1,38 , 95% luottamusväli = 1,06-1,81), mutta ei pienten näyte tutkimukset (≤400 aiheita). Mielenkiintoista, kun kerrostamiselintä julkaisemalla aikaan merkittävästi kohonnut riski todettiin niiden joukossa julkaistuissa tutkimuksissa ennen tai sen aikana 2009 (ArgGln vs. ArgArg: OR = 1,32, 95% CI = 1,13-1,55,

P

heterogeenisyys = 0,26), mutta ei joukossa julkaistuissa tutkimuksissa vuoden 2009 jälkeen

heterogeenisuus Analysis

oli heterogeenisuus tutkimuksia yleistä vertailuja ja myös alaryhmäanalyyseissa varten XRCC1 Arg399Gln polymorfismi. Tutkitaan lähteitä heterogeenisuus tutkimuksissa arvioimme kaikki vertailun mallien etnisyys (Aasia /valkoihoinen), maa (Kiina /muut), julkaisemiseen (ennen tai sen aikana 2009/2009 jälkeen), genotyypitysmenetelmiä (PCR-RFLP /muut ), tai tutkimuksen otoskoko ( 400 aiheita /≤400 saaneista) tarvittaessa. Tämän seurauksena tutkimus otoskoko (hallitseva malli:

P

= 0,04), mutta ei etnisen, maa, genotyypitysmenetelmiä tai julkaisemiseen, todettiin osaltaan merkittäviä heterogeenisuus. Lisäksi meta-regressioanalyyseissä osoittivat, että tutkimuksen otoskoko selittäisi 55,25%: n

τ

2.

Herkkyysanalyysi

herkkyysanalyysissä, vaikutus kunkin tutkimuksen yhdistettyihin OR tutkittiin toistamalla meta-analyysissä, kun jätetään pois kunkin tutkimuksen, yksi kerrallaan. Mitä assosiointi Arg399Gln SNP sertin riski, tutkimus, joka oli suurin vaikutus yleiseen yhdistetystä arvioiden (kuva 3) näytti olevan yksi suoritti Huang

et al

. [18]; kuitenkin, herkkyys analyysi osoitti, että syrjäisimmät alueet olivat 1,08 (95% CI: 0,82, 1,41) ja 1,00 (95% CI: 0,77, 1,31) ennen ja poistamisen jälkeen, että tutkimus, vastaavasti, mikä osoittaa erittäin vakaa tuloksista. Oli kaksi tutkimusta, jotka poikkesivat HWE varten XRCC1 Arg194Trp polymorfismi, kun ilman tutkimuksia, jotka eivät olleet HWE arvioitu yhdistettiin OR vieläkään ei muuttunut lainkaan (taulukko 2).

Tulokset laskettiin jättämällä kussakin tutkimuksessa (vasen sarake) puolestaan. Bars, 95%: n luottamusväli.

OR ja 95%: n luottamusväli oikaistaan ​​mahdollisten sekoittavien tekijöiden (kuten ikä, kansallisuus tai tupakointia, jne) joissakin tutkimuksissa, kun taas OR ja 95%: n luottamusväli on ei oikaistu näiden mahdollisten sekoittavien tekijöiden muissa tutkimuksissa. Liitot näistä riskitekijöistä kohdunkaulan syöpä ovat suuruudet vähintään samaa luokkaa kuin SNP raportoitu. Kun ilman tutkimuksia, joita ei ole oikaistu näitä mahdollisia sekoittavien tekijöiden, arvioitu yhdistetyssä säädetty tai vieläkään ei muuttunut lainkaan (taulukko 4). Tämä menettely osoitti, että tuloksemme ovat luotettava ja kestävä.

Kumulatiivinen Meta-analyysi

Kumulatiivinen meta-analyysit 3 yhdistysten suoritettiin myös kautta valikoima opintojen julkaisemiseen. Kuvio 4 esittää tulokset kumulatiivinen meta-analyysi assosiointi Arg399Gln SNP kanssa yleisen kohdunkaulasyövän aikajärjestyksessä. Taipumusta null merkitseviä näkyivät keskenään kertyminen enemmän dataa huomattavasti ajan myötä yhdistysten olivat aluksi vahva. Tulokset muut 2 SNP: t ovat samat (tuloksia ei ole esitetty).

piireissä ja vaakasuorat viivat osoittavat kertyminen arvioihin tulokset kunkin tutkimuksen lisättiin, sen sijaan, että arvio kunkin tutkimuksen. Tutkimukset lajiteltu julkaisemiseen; Bars, 95%: n luottamusväli.

Julkaisu Bias

Begg n suppilo juoni ja Egger testi tehtiin arvioimaan julkaisemisen bias käsittelevästä kirjallisuudesta CC. Kuva 5. näytetään suppiloon juoni tutkinut XRCC1 Arg399Gln polymorfismi ja yleinen CC riski mukana meta-analyysissä. Muoto suppilo juoni ei ilmennyt näyttöä suppilo juoni epäsymmetria. Tilastolliset tulokset eivät vieläkään näytä julkaisu bias (varten XRCC1 Arg194Trp ja Arg280His polymorfismi oli taulukossa 2, ja XRCC1 Arg399Gln polymorfismin: Gln /Gln vs. Arg /Arg: Begg testi

P

= 0,54, Egger testi

P

= 0,32; Arg /Gin vs. Arg /Arg: Begg testi

P

= 0,06, Egger testi

P

= 0,10; hallitseva malli: Begg testi

P

= 0,35, Egger testi

P

= 0,14; väistyvä malli: Begg testi

P

= 0,39, Egger testi

P

= 0,40).

(Gin /Gln vs. Arg /Arg). Jokainen piste edustaa erillistä tutkimusta osoitettuun -alueella. LogOR, luonnollisen logaritmin OR. Vaakasuora viiva, keskimääräinen vaikutus koko.

Keskustelu

Various DNA muutokset voivat johtua altistumisesta ympäristön ja endogeenisen karsinogeenejä. Useimmat näistä muutoksista, jos ei korjata, voi aiheuttaa geneettinen epävakaus, mutageneesi ja solukuolemaa. DNA korjausmekanismit ovat tärkeää säilyttää genomin eheyttä ja estää syövän syntymistä. XRCC1 proteiini on tärkeä osa ryhmäpoikkeusasetuksen reitin, joka korjaa pohja vaurioita ja yksittäisen DNA-säikeen katkoksia ionisoivan säteilyn aiheuttamaa ja alkyloivat aineet. Mutaatiot XRCC1 voi lisätä riskiä syöpiä huonontamalla vuorovaikutus XRCC1 muiden entsymaattisten proteiinien ja siten muuttamalla DNA korjausaktiivisuus [32], [33]. Viime vuosina suuri määrä molekyylien epidemiologisia tutkimuksia on tehty arvioida roolia polymorfismien DNA korjaava geeni XRCC1 CC riski; kuitenkin, tulokset ovat kuitenkin ristiriitaisia ​​sijasta vakuuttavia.

kolme polymorfismien XRCC1 (Arg194Trp, Arg280His ja Arg399Gln) on usein tarkasteltu tutkimuksissa syöpäalttiutta. Parhaan tietomme mukaan tämä on ensimmäinen systemaattinen tarkastelu, joka on tutkinut yhdistyksen XRCC1 polymorfismien ja CC riski. Tässä meta-analyysissä, huomasimme, että XRCC1 Arg194Trp polymorfismia voi liittyä CC riski, kun taas XRCC1 Arg399Gln polymorfismi voisi olla matalan penetrent riskitekijä SK: ta vain aasialaisia ​​naisia, ja ei ehkä ole yhdistyksen välillä Arg280His polymorfismin ja CC riski . Selitystä tuloksia voi olla, että toiminnallinen variantit XRCC1 geeni voi olla ratkaiseva rooli helpotettaessa ihmisen syövän kehityksen takia muuttamisen ryhmäpoikkeusasetuksen toimintojen [34]. Kuten toiminnallinen merkitys XRCC1 Arg194Trp johtuu pääasiassa sen sijainti evoluutiossa säilyneitä Kytkijäalue [35], ja XRCC1 Arg399Gln SNP voi muuttaa tehokkuutta korjaus prosessi, koska sen sijainti poly (ADP-riboosi) poly-merase sitovan domeenin [34], [36], [37]. Null assosiaatio XRCC1 Arg280His SNP ja CC riski saattaa johtua siitä oli vain kaksi tutkimukset rajoitettu väestö SNP analyysissä. Lisäksi kumulatiivinen meta-analyysi stratifioitu julkaisupäivämäärä, taipumusta vastaaviin yhdistysten 3 SNP voitaisiin laikullinen keskenään kertyminen enemmän dataa ajan.

Koska alleelifrekvenssien polymorfismien ja niiden vaikutukset syöpäriskiä olivat monipuolisia eri etnisten ryhmien, suoritimme alaryhmäanalyysi etnisyys varten Arg194Trp ja Arg399Gln SNP. Tulokset yhdistettiin analyysien ehdotti, että Arg194Trp polymorfismi liittyy suurentunut CC riski, kun taas XRCC1 Arg399Gln ei liittynyt CC riski, kun kaikki tutkimukset yhdistettiin. Kuitenkin, kun kerrostamiselintä etnisyys, huomattavasti kohonneeseen riskiin havaittiin joukossa Aasian varten 2 SNP. Tutkimukset yhdistys XRCC1 polymorfismien sertin oli pääasiassa toteutettiin Aasian maissa; vain kaksi tehtiin länsimaissa. Täten mahdollinen etninen erot yhdistys XRCC1 polymorfismien sertin olisi tutkittava tarkemmin ja vahvistettiin lisää tutkimuksia tehdään länsimaissa.

kerrostuneisuus analyysin tutkimuksen mukaan otoksen koon Arg399Gln SNP tilastollisesti merkittävä havainto oli nähtävissä suuri otos ryhmä ( 400 potilasta), mutta ei pienten näyte tutkimukset (≤400 aiheita), mikä osoittaa, että suuren otoksen tutkimukset voivat tarjota aivan erilaisiin tuloksiin kuin pieni näyte tutkimuksissa. Tämä johtuu todennäköisesti siitä tutkimusten pieni otoskoko voi olla riittämätön tilastollinen voima havaita lievä vaikutus tai ehkä tuottaneet vaihdelleet riskiarvio [38]. Siten käyttö asianmukaisesti ja suuri otoskoko tutkimus on erittäin tärkeää vähentää harhat niin genotyypin assosiaatiotutkimuksiin. Suosittelemme, että tutkijat suunnitella geneettistä vaihtelua assosiaatiotutkimuksiin suurempien tutkimus otoskoko tulevaisuudessa.

Tässä meta-analyysissä etsittiin niin paljon julkaisuja kuin pystyimme. Useimmat kirjallisuuden kokotekstistä etsimme ovat Englanti ja Kiina, ja uskomme, että suurin osa kirjallisuutta on saatu ja seulotaan tutkimuksessamme. Lisäksi yksi suurimpia huolenaiheita hyvässä meta-analyysi on heterogeenisuuden aste, joka vallitsee komponentin tutkimukset; toteutimme Q-testi ja

I

2

tilastojen testata merkitystä heterogeenisyys. Ilmeinen heterogeenisyys välillä tutkimuksissa havaittiin yleistä vertailuja ja myös joitakin alaryhmäanalyyseissa joissakin malleissa, ja sitten meta-regressioanalyysiä käytettiin tutkimaan lähteitä heterogeenisyys. Huomasimme, että tutkimuksen otoskoko ei osaltaan mahdollisia heterogeenisuus. Toinen tärkeä kysymys mistään meta-analyysi on julkaisu bias koska valikoiva raporttien julkaisu. Nykyisessä tutkimuksessa, suppilo juoni, Begg ja Egger n suoritettiin arvioimaan tätä ongelmaa. Sekä muoto suppilon tonttien ja tilastolliset tulokset eivät osoittaneet julkaisu puolueellisuudesta.

Vaikka olemme ottaneet paljon vaivaa ja resursseja testaus Mahdollinen yhteys XRCC1 geenipolymorfismien ja CC riski, on vielä joitakin rajoituksia tässä meta -analyysiohjelman. Ensinnäkin, emme suorita alaryhmäanalyysi patologiset tyypit CC rajallisuuden vuoksi tieto ensisijaiseen tutkimuksissa. Suurin osa CC oli levyepiteelikarsinooma tässä tutkimuksessa kuitenkin muutama CC sekoitettiin levyepiteelisyöpä ja adenokarsinooma. Koska eri patologisten tyyppejä, Alaryhmäanalyysissa tulisi suorittaa. Kuitenkin vain yhdessä tutkimuksessa [16] Tässä meta-analyysissä raportoitu erillisen genotyypin frekvenssi okasolusyöpään ja adenokarsinooma, vaikka useat tutkimukset sekoitettiin levyepiteelisyöpä ja adenokarsinooma [16], [17], [21], joka esti meitä tehdä tätä alaryhmäanalyysi. Toiseksi geeni-geeni, ja geeni-ympäristön yhteisvaikutuksia ei ole käsitelty meta-analyysi, koska puutteellisten tietojen takia. On mahdollista, erityisten ympäristö- ja elämäntapaan liittyvien tekijöiden muuttaa näiden yhdistysten välillä geenipolymorfismien ja syöpäriskiä. Esimerkiksi Lao

et al

. [39] todetaan, että Gln /Gln genotyyppi Arg399Gln liittyi alentuneeseen virtsarakon syöpä koskaan tupakoitsijat kun Arg399Gln polymorfismi ei liittynyt virtsarakon syöpäriskiä koko väestöstä. Kolmanneksi oli merkittävä Tutkimusten välisten heterogeenisuus kokeista yleistä vertailuja ja myös alaryhmäanalyyseissa, ja genotyyppijakauman kontrolliryhmässä osoitti myös poikkeama HWE joissakin tutkimuksissa. Viimeisenä mutta ei vähäisimpänä, useita tutkimuksia ja useita kohteita tutkimuksissa mukana meta-analyysissä olivat pieniä, erityisesti valkoisilla väestölle ja Arg280His. Koska harvat papereita mukana meidän meta-analyysin tuloksena epävakaa yhdistyksen arvioiden tuloksemme suhteessa näihin polymorfismien tulisi aina kohdella alustavia, ja lisäksi meta-analyysit, jossa on suuri joukko paperit ovat tarpeen vahvistaa yhdistystä tulevaisuus. Huolimatta näistä, meidän meta-analyysi oli myös joitakin etuja. Ensinnäkin, emme havaitse mitään julkaisu bias osoittaa, että koko yhdistettyä tuloksen pitäisi olla puolueeton. Mikä parasta, geneettinen meta-analyysi suoritetaan aina ilman säätö, johtuen vähäisestä tieto ensisijaiseen tutkimuksissa. Tässä meta-analyysissä, paitsi määrällinen analysoi kaikkien SNP ilman säätö, säädettävä analysoi mahdolliset sekoittavien tekijöiden (kuten ikä, kansallisuus tai tupakointia, jne) suoritettiin myös XRCC1 Arg399Gln ja Arg194Trp polymorfismit. Tulokset mukautetaan analyysien olivat pysyviä, mikä puolestaan ​​vahvisti luotettavuutta meta-analyysi.

Yhteenvetona tutkimuksessa suhde XRCC1 polymorfismien ja CC on hyvin suosittu, mutta ristiriitaisia ​​tällä hetkellä.