PLoS ONE: Association välinen XRCC1 Arg399Gln polymorfismi ja syöpäriski: Evidence from 297 Case-Control Studies
tiivistelmä
Background
Arg399Gln polymorfismi X-ray rajat täydentävät ryhmä 1 (XRCC1) oli osallisena syöpäalttiutta. Aiempi julkaistua tietoa yhdistyksen välillä XRCC1 Arg399Gln polymorfismin ja syöpäriskiä pysynyt kiistanalainen.
Menetelmät /Principal Havainnot
johtamiseksi tarkempi arvio yhdistyksen välisen XRCC1 Arg399Gln polymorfismi ja yleinen syöpä riski, suoritimme meta-analyysi 297 tapausverrokkitutkimukset, joissa on yhteensä 93941 tapausta ja 121480 kontrollia sisällytettiin. Kaiken kaikkiaan huomattavasti syöpäriskiä havaittu geneettistä mallia (hallitseva malli: kertoimet annos [OR] = 1,04, 95% luottamusväli [CI] = 1,01-1,07; väistyvä malli: OR = 1,08, 95% CI = 1,03-1,13 ; lisäaine malli: OR = 1,09, 95% CI = 1,04-1,14), kun kaikki voivat tutkimukset yhdistettiin osaksi meta-analyysi. Muissa ositettu ja herkkyysanalyysien merkittävästi kohonnut hepatosellulaarinen ja rintasyöpiä riski havaittiin aasialaisilla (määräävässä malli: OR = 1,39, 95% CI = 1,06-1,84) ja intialaiset (määräävässä malli: OR = 1,64, 95% CI = 1,31 -2,04; väistyvä malli: OR = 1,94, 95% CI = 1,09-3,47; lisäaine malli: OR = 2,06, 95% CI = 1,50-2,84), tässä järjestyksessä.
Johtopäätökset /merkitys
Tämä meta-analyysi viittaa siihen osallistumisen XRCC1 Arg399Gln on geneettinen alttius maksasolusyövän aasialaisilla ja rintasyövän Indians. Lisäksi työmme huomauttaa myös, että on tärkeää uusia tutkimuksia varten Arg399Gln yhdistys joidenkin syöpätyyppien, kuten gliooma, mahasyövän, ja suun syöpä, jossa ainakin jotkut covariates vastaavan heterogeenisuus voitaisiin ohjata, jotta saadaan enemmän ratkaisevia ymmärrystä siitä funktio XRCC1 Arg399Gln polymorfismi syövän kehittymisessä.
Citation: Yi L, Xiao Feng H, Yun-tao L, Hao L, Ye S, Song-tao Q (2013) välisestä assosiaatiosta XRCC1 Arg399Gln polymorfismi ja syöpäriski: Evidence from 297 Case-Control Studies. PLoS ONE 8 (10): e78071. doi: 10,1371 /journal.pone.0078071
Editor: Balraj Mittal, Sanjay Gandhi Medical Institute, Intia
vastaanotettu: 3. heinäkuuta 2013. Hyväksytty: 17 syyskuu 2013; Julkaistu: 29 lokakuu 2013
Copyright: © 2013 Yi et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.
Rahoitus: Kirjoittajat ei ole tukea tai rahoitusta raportoida.
kilpailevat edut: kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.
Johdanto
DNA korjaus- kriittisiä rooleja suojaavat mutaatioita ja ovat olennaisia ylläpitämiseksi genomin eheyttä. Tiettyjä yhteisiä geneettisten polymorfismien sisällä geenien DNA-vaurioita vasteet voivat edistää syövän kehittymistä ja liittyä suurentunut riski sairastua. Koska alennettu DNA korjaus kapasiteetti voi johtaa geneettinen epävakaus ja Karsinogeneesin geenit osallistuvat DNA: n korjaukseen oli ehdotettu ehdokas syövän alttiusgeenit [1]. Tähän asti yli sata proteiinit osallisena DNA: n korjaukseen on löydetty ihmisen soluissa. Nämä proteiinit osallisena neljä suurta DNA korjaukseen polkuja, mukaan lukien nukleotidin Leikkauskorjauksessa (NER), pohja Leikkauskorjauksessa (BER), double-lohkon murtuma korjaus (DSBR) ja mismatch korjaus (MMR) [1], [2].
XRCC (X-Ray rajat täydentämisen) geenit alun perin löydettiin kautta rooli DNA-vaurioita vastauksena ionisoivan säteilyn aiheuttamaa. Ne ovat tärkeä osa erilaisten DNA korjaukseen väyliä edistää DNA-vaurioita käsittely ja geneettinen pysyvyys [3]. DNA korjaus entsyymit XRCC1 keskeisessä asemassa BER koulutusjakson [4], [5]. XRCC1 sijaitsee kromosomissa no. 19q13.2-13.3, ja sen geenituote on osallisena yhden lohkon murtuma korjaus- ja pohjan leikkaaminen korjausmekanismit [6]. Vaikka on olemassa enemmän kuin 300 validoitu yhden nukleotidin polymorfismit (SNP: t) on XRCC1 geenin raportoitu dbSNP tietokannasta (http: //www.ncbi. Nlm.nih.gov/SNP), joista kolme on yhteisiä [7] ja lyijyä aminohapposubstituutioihin in XRCC1 kodonissa 194 (eksoni 6, emästä C T, aminohappoon Arg: stä Trp, dbSNP ei. rs1799782), kodonissa 280 (eksoni 9, pohja G: stä A, aminohappoon Arg His, dbSNP ei. rs25489) ja kodonissa 399 (eksoni 10, pohja G: stä A, aminohappoon Arg Gin, dbSNP no.rs25487), nämä ei-konservatiivisia aminohappo- muutokset saattavat muuttaa XRCC1 toiminto. Tämä muutos proteiinin biokemian johtaa oletukseen, että variantti alleelit voivat heikentää korjaus kinetiikka vaikuttaa näin alttius haitallisia terveysvaikutuksia, kuten syöpää.
Viimeisen vuosikymmenen aikana useita molekyyli- epidemiologiset tutkimukset on tehty arvioida yhdistyksen välinen XRCC1 Arg399Gln polymorfismin ja eri syöpien riskiä eri väestöryhmien. Kuitenkin tulokset olivat epäjohdonmukaisia tai jopa ristiriitaisia. Osittain siitä syystä, että pieni vaikutus polymorfismin syöpäriskiin ja suhteellisen pieni otoskoko kussakin julkaistuissa tutkimuksissa. Lisäksi, viime aikoina meta-analyysit analysoitiin kuten yhdistyksen vain yhden syövän, kuten keuhkosyövän, mahasyövän, kohdunkaulan syöpä, rintasyöpä, eturauhassyöpä, ja niin edelleen [8] – [12]. Siksi teimme kattavan meta-analyysin mukaan lukien viimeisimmät ja asiaa artikkeleita tunnistamaan tilastollista näyttöä yhdistyksen välillä XRCC1 Arg399Gln polymorfismin ja riskien kaikista syövistä, joita on tutkittu. Meta-analyysi on tehokas työkalu yhteenveto eri tutkimuksissa. Se ei voi vain voittaa ongelma pienen koon ja riittämätön tilastollisen tehon geneettiset tutkimukset monimutkaisten ominaisuuksien, mutta voi myös tarjota entistä luotettavampia tuloksia kuin yhden tapauskontrollitutkimuksessa.
Materiaalit ja menetelmät
tunnistaminen ja kelpoisuus asiaa Studies
kattava kirjallisuus haku suoritettiin käyttäen PubMed, ISI, ja EMBASE tietokanta asiaan julkaistut artikkelit (edellinen haku päivitys 15 tammikuu 2013) seuraavin avainsanat ” XRCC1, ”” polymorfismi ”ja” syöpä ”tai” syöpä ”. haku ei rajoitu kielen. Lisätutkimukset tunnistettiin käsin tutkiva viittaukset artikkelia ja katsaus artikkeleita. Tekijät otettiin yhteyttä suoraan koskien keskeisiä tietoja ei ilmoiteta alkuperäisessä artikkeleita. Lisäksi tutkimukset tunnistettiin manuaalisesti etsimään viiteluetteloihin katsauksissa ja noudetaan tutkimuksia. Me sisältyvät kaikki tapausverrokkitutkimukset ja kohorttitutkimusten että tutkinut yhdistyksen välillä XRCC1 Arg399Gln polymorfismin ja syöpäriskiä kanssa Genotyyppaustulokset. Kaikki kelvolliset tutkimukset haettiin, ja niiden kirjallisuusluettelot tarkastettiin muiden asiaan julkaisuihin. Kun samasta näytteestä käytettiin useissa julkaisuissa, vain kaikkein täydelliset tiedot oli sisällytetty seuraaviin tutkittava huolellisesti.
Sisällyttämiskriteerit
sisältyi tarvittavien tutkimusten ovat täyttäneet seuraavat kriteerit: (1) ainoastaan Asiakirja-ohjaus tutkimuksiin tai kohorttitutkimuksiin katsottiin, (2) arvioi XRCC1 Arg399Gln polymorfismi ja syöpäriskiä, ja (3) genotyyppijakauman polymorfismien tapauksissa ja valvonta on kuvattu yksityiskohtaisesti ja tulokset ilmaistiin kertoimet (OR) ja vastaavat 95%: n luottamusväli (95% CI). Merkittävä syy syrjäytymiseen tutkimusten olivat seuraavat: (1) ei syöpätutkimukseen, (2) vain tapauspopulaatio, ja (3) kaksoiskappale Edellisen julkaisun.
Data Extraction
Tietoja saatiin huolellisesti uutettu kaikki voivat tutkimuksista itsenäisesti kaksi tutkijaa mukaan pääsyn kriteerit yllä. Seuraavat tiedot kerättiin kunkin tutkimuksen: ensimmäinen tekijän nimi, julkaisuvuosi, alkuperämaan, etnisyyden, lähde hallintalaitteiden, otoskoko ja lukumäärät tapauksissa ja valvonnan XRCC1 Arg399Gln genotyyppien aina kun mahdollista. Etnisyys luokiteltiin ”valkoihoinen,” ”Afrikkalainen” (mukaan lukien Afrikkalainen amerikkalaiset) ja ”Aasian.” Mietimme näytteitä tutkimuksia Intiasta ja Pakistanista vuodesta ”Indian” etnisyys, ja näytteet Lähi-idän maissa kuin ”Lähi-idän” etnisyys. Kun yksi tutkimus ei todeta, mitä etnisten ryhmien sisältyi tai jos se oli mahdotonta erottaa osallistujien mukaan fenotyyppiin, näyte kutsutaan nimellä ”sekapopulaatioon.” Samaan aikaan, tutkimukset tutkivat enemmän kuin yhdenlaisen syövän laskettiin yksittäisinä data asettaa vain in alaryhmäanalyyseissa syöpätyypin. Emme määritellä mitään vähimmäismäärää potilaita sisällyttää tähän meta-analyysiin. Artikkeleita, jotka on raportoitu eri etnisten ryhmien ja eri maiden tai paikkoihin, me piti niitä eri tutkimuksessa näytteitä kullekin em.
Tilastollinen analyysi
Raakaöljy kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmät alueet) ja niiden vastaavat 95% CI arviointiin käytettiin voimakkuuden välisen assosiaation XRCC1 Arg399Gln polymorfismi ja syöpäriskiä. Seuraavat julkaistut suositukset laadun arvioinnin meta-analyysit geneettisen yhdistysten, tutkimme: valinta geneettisten mallien (hyväksyimme kolme geneettistä mallia, vältetään olettaen vain yksi ”väärä” geneettinen malli). Yhdistetty syrjäisimmillä alueilla tehtiin hallitseva malli (Arg /Gin + Gln /Gin
versus
Arg /Arg); väistyvä malli (Gin /Gin
versus
Arg /Gin + Arg /Arg); lisäaine malli (Gin /Gin
versus
Arg /Arg), tässä järjestyksessä. Tutkimusten välisten heterogeenisuus arvioitiin laskemalla
Q
-statistic (heterogeenisuus pidettiin tilastollisesti merkitsevä, jos
P
0,10) [13] ja mittaamaan
I
2 arvo, arvo, joka kuvaa prosenttiosuutta vaihtelua tutkimuksia, jotka johtuvat heterogeenisuus sijaan mahdollisuus, jossa
I
2 = 0% tarkoittaa, ei havaittu heterogeenisyys, jossa 25% pitää alhainen , 50% maltillisena, ja 75% niinkin korkea [14]. Jos tulokset eivät olleet heterogeenisiä, yhdistettyjen syrjäisimpien alueiden laskettiin kiinteän vaikutuksen mallia (käytimme
Q
-statistic, joka edustaa suuruus heterogeenisyys välillä-tutkimukset) [15]. Muussa tapauksessa random-vaikutus mallia käytettiin (kun heterogeenisyys välillä-tutkimukset olivat merkittäviä) [16]. Lisäksi vertailun kaikilla koehenkilöillä, me myös suorittaa ositus analyysejä syövän tyyppi (jos syöpä tyyppi sisälsi vähemmän kuin kolme yksittäisten tutkimusten, se yhdistettiin osaksi ”muita syöpiä” ryhmä), lähde ohjaus, ja etnisyys. Lisäksi missä määrin yhdistetyn riskin arvioon saattaa vaikuttaa yksittäisten tutkimusten arvioitiin peräkkäin jättämällä jokaisen tutkimuksen meta-analyysi (jätä-yksi-out herkkyysanalyysi). Tämä lähestymistapa myös kaapata vaikutus vanhimman tai ensimmäinen positiivinen tutkimus (ensimmäinen tutkimus vaikutus). Lisäksi olemme myös sijoittui tutkimuksia mukaan otoskoko, ja sitten toistetaan tämä meta-analyysi. Näytteen koko oli luokiteltu vähintään 200 osallistujaa ja ne, joilla on vähemmän kuin 200 osallistujaa. Cité kriteerit aiemmin kuvattu [17]. Viime, herkkyys analyysi suoritettiin myös ilman tutkimuksia joiden alleelifrekvenssit kontrolleissa näytteillä poiketaan merkittävästi Hardy-Weinberg tasapaino (HWE), koska poikkeama voi merkitä harhaa. Poikkeama HWE saattaa heijastaa menetelmiin liittyviä ongelmia, kuten genotyypityksen virheitä, väestö kerrostuminen tai valinnan bias. HWE laskettiin käyttäen hyvyys kunnossa testi, ja poikkeama pidettiin kun
P
0,01. Begg n suppilo tonttien [18] ja Egger n lineaarisen regression testi [19] arviointiin käytettiin julkaisun bias. Meta-regressioanalyysi suoritettiin tunnistamaan tärkeimmät lähteet välillä-tutkimusten vaihtelua tuloksiin, lokin avulla syrjäisimpien alueiden kustakin tutkimuksessa riippuvat muuttujat, ja syöpä tyyppi, etnisyys, otoskoko, ja lähde valvontaa kuin mahdolliset lähteet heterogeenisyys. Kaikki laskelmat tehtiin käyttämällä STATA versio 10.0 (STATA Corporation, College Station, TX).
Tulokset
hyväksyttävät tutkimukset ja meta-analyysi tietokannat
Kuva. 1 kuvaa graafisesti kokeen vuokaavion. Kaikkiaan 895 artikkeleita koskevat XRCC1 polymorfismien suhteen syövän tunnistettiin. Seulonnan otsikot ja abstraktit, 610 artikkelia ulkopuolelle, koska ne olivat tarkastelun artikkeleita, tapausselostukset muut polymorfismia XRCC1 tai epäolennaisia tässä tutkimuksessa. Lisäksi, näiden julkaistujen artikkeleiden, 18 julkaisut (16, 23, 70, 90, 102, 106, 118, 144, 174, 190, 195, 196, 217, 224, 245, 256, 261, 263 Viitteet S1) jätettiin koska niiden väestön päällekkäin toisen 18 sisältyi tutkimuksia (15, 17, 18, 45, 63, 101, 125, 131, 145, 149, 150, 156, 191, 200, 199, 203, 226, 242 Viitteet S1). Jotka esitetään taulukossa S1, 267 julkaisuja 297 tapausverrokkitutkimukset valittiin joukosta meta-analyysi, mukaan lukien 93941 tapaukset ja 121480 valvontaa. Näistä tutkimuksista, yksi tutkimus kuului väistyvä malli ja yhdeksässä tutkimuksessa oli mukana hallitseva mallissa vain siksi, että tarjotaan genotyyppejä Arg /Gln + Arg /Arg
versus
Gin /Gin ja Arg /Gin + Gln /Gln
versus
Arg /Arg koko, vastaavasti. Lisäksi oli 20 virtsarakon syövän tutkimuksiin, 54 rintasyöpätutkimuksissa, kuusi kohdunkaulan syövän tutkimuksessa, 27 peräsuolen syöpä tutkimukset, 14 ruokatorven syöpä tutkimukset, 15 mahasyöpä tutkimuksissa seitsemän gliooma tutkimukset, yhdeksän hepatosellulaarinen syöpä tutkimukset, 39 pään ja kaulan alueen syöpä tutkimukset , 15 leukemia tutkimuksia, 41 keuhkosyöpä tutkimuksia, neljä lymfooma tutkimuksissa kuusi haimasyöpä tutkimuksia, 18 eturauhassyöpä tutkimuksia, 13 ihosyöpä tutkimuksia, ja yhdeksän tutkimuksia kanssa ”muita syöpiä”. Kaikki tapaukset olivat patologisesti vahvistettiin.
Quantitative Synthesis
arvioinneissa yhdistyksen XRCC1 Arg399Gln polymorfismi syöpäriskiä on esitetty taulukossa 1. Kaiken kaikkiaan huomattavasti syövän riski oli havaittu geneettistä mallia (hallitseva malli: OR = 1,04, 95% CI = 1,01-1,07,
P
arvo heterogeenisyys testi [
P
h] 0,001,
I
2 = 52,6%; väistyvä malli: OR = 1,08, 95% CI = 1,03-1,13,
P
h 0,001,
I
2 = 48,8%; lisäainetta malli: OR = 1,09, 95% CI = 1,04-1,14,
P
h 0,001,
I
2 = 49,4 %). Oli kuitenkin merkittävä heterogeenisyys tutkimusten välillä. Siksi me sitten suoritti alaryhmäanalyysi syöpätyypin. Huomasimme, että yksilöiden alaikäisen variantti genotyyppien oli suurempi rintasyöpäriski (väistyvä malli: OR = 1,09, 95% CI = 1,00-1,18,
P
h 0,001,
I
2 = 50,6%; lisäainetta malli: OR = 1,10, 95% CI = 1,01-1,20,
P
h 0,001,
I
2 = 49,1%), kohdunkaulan syöpä (väistyvä malli: OR = 1,37, 95% CI = 1,03-1,81,
P
h = 0,765,
I
2 = 0,0%, lisäainetta malli: OR = 1,37, 95% CI = 1,02-1,84,
P
h = 0,134,
I
2 = 43,1%), peräsuolen syöpä (resessiivinen malli: OR = 1,18, 95% CI = 1,00-1,39,
P
h = 0,001,
I
2 = 54,2%; lisäainetta malli: OR = 1,18, 95% CI = 1,00-1,42,
P
h 0,001,
I
2 = 57,4%), ja leukemian (hallitseva malli: OR = 1,24, 95% CI = 1,00-1,53,
P
h 0,001,
I
2 = 66,8%), kuten on esitetty taulukossa 1. merkittävästi vähentynyt virtsarakon syövän riski oli todettu liittyvän vähäinen muunnos genotyyppien väistyvä malli (OR = 0,87, 95% CI = 0,78-0,97,
P
h = 0.430,
I
2 = 2,1%). Sillä rintasyöpätutkimuksissa, myös suoritti alaryhmäanalyysi vaihdevuosien asema, mitään merkittävää yhdistys havaittu premenopausaalisissa ja postmenopausaalisilla naisilla (tuloksia ei ole esitetty). Olemme myös suoritti alaryhmäanalyysi tupakoitsija tottumukset varten keuhkosyövän tutkimuksissa ei merkitsevää yhteyttä löytynyt tupakoitsijoiden ja tupakoimattomien (tuloksia ei ole esitetty).
Alkuperä ja syöpäriski Luetaan ansioksi XRCC1 Arg399Gln polymorfismi
perehtyi assosiaatiosta XRCC1 Arg399Gln polymorfismia syöpäriskin mukaan syöpätyypin ja etnisyys (taulukko 2), koska ei ollut merkittävää heterogeenisyyttä tutkimusten välillä. Näytteille Valkoihoisilla, mitään merkittävää yhdistys havaittu geneettistä mallia. Sillä näytteitä aasialaiset, huomasimme, että yksilöiden alaikäisen variantti genotyyppien oli suurempi rintasyöpäriski (väistyvä malli: OR = 1,20, 95% CI = 1,04-1,39,
P
h = 0,339,
I
2 = 11,5%; lisäainetta malli: OR = 1,18, 95% CI = 1,02-1,37,
P
h = 0,269,
I
2 = 19,5%), hepatosellulaarinen syöpä (hallitseva malli: OR = 1,39, 95% CI = 1,06-1,84,
P
h = 0,040,
I
2 = 60,0%), ja eturauhasen syöpä (väistyvä malli: OR = 1,43, 95% CI = 1,02-2,00,
P
h = 0,383,
I
2 = 1,9%; lisäainetta malli: OR = 1,55, 95% CI = 1,02-2,33,
P
h = 0,388,
I
2 = 0,8 %). Näytteille afrikkalaisista, merkittävää yhteyttä havaittu ainoastaan keskuudessa rintasyöpä (hallitseva malli: OR = 1,28, 95% CI = 1,07-1,54,
P
h = 0,348,
I
2 = 9,1%; lisäainetta malli: OR = 1,81, 95% CI = 1,08-3,02,
P
h = 0,988,
I
2 = 0,0%). Näytteille intiaaneja, merkittävää yhteyttä havaittiin myös keskuudessa rintasyöpä (hallitseva malli: OR = 1,39, 95% CI = 1,06-1,84,
P
h = 0,040,
I
2 = 60,0%; väistyvä malli: OR = 1,43, 95% CI = 1,02-2,00,
P
h = 0,383,
I
2 = 1,9%, lisäainetta malli: OR = 1,55, 95% CI = 1,02-2,33,
P
h = 0,388,
I
2 = 0,8%) ja eturauhassyövän (hallitseva malli: OR = 1,26, 95% CI = 1,00-1,58,
P
h = 0,207,
I
2 = 36,5%).
lähde Controls ja syöpäriski Luetaan ansioksi XRCC1 Arg399Gln polymorfismi
tarkasteltiin myös assosiaatiosta XRCC1 Arg399Gln polymorfismi ja syöpäriskin mukaan syöpätyypin ja lähde valvonta (taulukko 3). Sillä väestöpohjainen tutkimuksissa XRCC1 Arg399Gln polymorfismi oli yhteydessä rintasyöpään ja virtsarakon syövän riskiä. Sairaalan perustuvat tutkimukset, merkittävää yhteyttä välillä havaittiin virtsarakon syöpä, rintasyöpä, kohdunkaulan syöpä, peräsuolen syöpä, leukemia, ja eturauhasen syöpä.
anatominen Site, histologinen tyyppi, ja liitto XRCC1 Arg399Gln Polymorfismi kanssa syöpäriski
ensi valmiiksi alaryhmäanalyysi kasvaimen kohdalle ja histologinen tyyppi tai anatominen sijainti (taulukko 4). Kaiken kaikkiaan ei ollut yhdistyksen välillä XRCC1 Arg399Gln polymorfismi ja riski nenänielun syöpä, suun syöpä, kurkunpään syöpä, kilpirauhassyöpä, ja muut pään ja kaulan alueen syöpä sivustoja. Sillä keuhko- ja mahasyöpä, mitään merkittävää yhdistyksen välillä havaittiin keuhkojen adenokarsinooma, keuhkojen okasolusyöpä, pienisoluinen keuhkosyöpä, ja cardia mahasyövän.
Test heterogeenisuus ja herkkyys
ei ollut merkittävää heterogeenisuus näitä tutkimuksia varten hallitseva mallin vertailun (
P
h 0,001), resessiivinen malli vertailu (
P
h 0,001), ja lisäaine malli vertailu (
P
h 0,001). Sitten arvioimme lähde heterogeenisyys etnisyys, syöpä tyyppi, lähde valvonta, ja otoskoko. Tulokset meta-regressio osoitti, että lähde valvonta (määräävä malli: P = 0,241; väistyvä malli:
P
= 0,626; lisäaine malli:
P
= 0,504), kansallisuus (hallitseva malli : P = 0,739; väistyvä malli:
P
= 0,305; lisäaine malli:
P
= 0,334), syöpä tyyppi (hallitseva malli:
P
= 0,526; väistyvä malli :
P
= 0,507; lisäaine malli:
P
= 0,848), ja otoskoko (hallitseva malli:
P
= 0,366; väistyvä malli:
P
= 0,944; lisäaine malli:
P
= 0,665) ei vaikuttanut huomattavan heterogeenisuus meta-analyysi. Tutkitaan genotyyppi taajuudet kontrolleissa, merkittävä poikkeama HWE havaittiin kahdeksassa tutkimuksissa (7, 24, 69, 86, 93, 100, 169, 172 Viitteet S1). Kun nämä tutkimukset suljettiin pois, tuloksena XRCC1 Arg399Gln muuttui keskuudessa eturauhassyövän (väistyvä malli: OR = 1,18, 95% CI = 1,04-1,35,
P
h = 0,209,
I
2 = 21,5%), kuten on esitetty taulukossa 5. lisäksi, kun tämä meta-analyysi suoritettiin ilman tutkimuksissa pienestä otoksesta, tulokset XRCC1 Arg399Gln muutettiin kesken peräsuolen syöpä (väistyvä malli: OR = 1,18, 95% CI = 0,98-1,42,
P
h 0,001,
I
2 = 62,9%; lisäainetta malli: OR = 1,17, 95% CI = 0,97-1,43,
P
h 0,001,
I
2 = 63,7%), hepatosellulaarinen syöpä (hallitseva malli: OR = 1,35, 95% CI = 1,05 -1,75,
P
h = 0,035,
I
2 = 58,4%; lisäainetta malli: OR = 1,39, 95% CI = 1,03-1,86,
P
h = 0,954,
I
2 = 0,0%), ja leukemian (hallitseva malli: OR = 1,18, 95% CI = 0,97-1,42,
P
h = 0,012,
I
2 = 55,8%), kuten on esitetty taulukossa 6. lisäksi kun tutkimus Kelsey et al. (230 Viitteet S1) jätettiin, tulokset muuttuivat kesken virtsarakon syöpä (väistyvä malli: OR = 0,90, 95% CI = 0,80-1,01,
P
h = 0,605,
I
2 = 0,0%). Sen jälkeen, kun tutkimus Roszak et al. (22 Viitteet S1) jätettiin, tulokset olivat muuttuneet keskuudessa kohdunkaulan syöpä (väistyvä malli: OR = 1,21, 95% CI = +0,86-+1,70,
P
h = 0,942,
Olen
2 = 0,0%; lisäainetta malli: OR = 1,11, 95% CI = 0,78-1,58,
P
h = 0,517,
I
2 = 0,0%). Sillä näytteitä aasialaiset, kun tutkimus jätettiin pois, tulokset muuttuivat kesken virtsarakko-, rinta- ja eturauhasen syöpiä. Sillä näytteitä afrikkalaiset, kun tutkimus jätettiin pois, tulokset olivat muuttuneet keskuudessa rintasyöpä. Näytteille intiaaneja, kun tutkimus jätettiin pois, tulokset olivat muuttuneet keskuudessa eturauhassyöpää. Sairaalan perustuvat tutkimukset, kun tutkimus jätettiin pois, tulokset muuttuivat kesken virtsarakon syöpä, kohdunkaulan syöpä, peräsuolen syöpä, ja leukemia. Väestön perustuvat tutkimukset, kun tutkimus jätettiin pois, tulokset olivat muuttuneet keskuudessa virtsarakon syöpään.
Julkaisu Bias
Suoritimme Begg n suppilo juoni ja Egger testi arvioimaan julkaisemisen painottuvat kirjallisuutta. Begg n suppilo tontteja ja Egger testi ehdotti, että siellä saattaa olla julkaisu puolueellisuudesta väistyvä malli (
P
= 0,032) ja lisäaine malli (
P
= 0,015) kokonaispituudeltaan syöpä. Sitten tutkimme onko olemassa näyttöä julkaisemisesta bias tutkimuksiin kussakin syövän tyypin ryhmässä (taulukko 1). Ei ollut epäsymmetria suppiloon tontteja (tuloksia ei ole esitetty) ja ei ole tilastollista merkitystä Egger n testeissä useimmille syöpä sivustoja, lukuun ottamatta rintasyövän (väistyvä malli:
P
= 0,008; lisäaine malli:
P
= 0,005). Niiden suppilo tontteja osoitti, että epäsymmetria johtui lähinnä muutamia tutkimuksia pienemmillä näytteen koot ja suuri vaikutus kokoja, tosiasia selvempää rintasyövän ryhmä. Tarvittiin mahdollista julkaisemista bias käyttäen Duval ja Tweedie nonparametric ”leikata ja täytä” menetelmä rintasyövän, tuloksia ei ole muutettu välillä Arg399Gln polymorfismin kanssa rintasyövän riskiä. Kuvio 2 lueteltu Duval ja Tweedie nonparametric ”leikata ja täytä” menetelmiä suppilo tontin väistyvä malli ja lisäaine malli.
Keskustelu
Syöpä on tulosta sarjan DNA vaihtelussa yhden solun tai klooni, joka solu, joka johtaa menetykseen normaalia toimintaa, poikkeava tai kontrolloimaton solukasvu ja usein etäpesäkkeitä. BER aloitetaan tunnustamista ja leikkaamalla vaurioituneiden jalustasta erityisten DNA glykosylaasin. X-ray korjaus rajat täydentävät ryhmien 1 (proteiini on rakennusteline proteiini liittyy suoraan polymeraasin beta, DNA-ligaasi III ja poly (ADP-riboosi) -polymeraasia monimutkainen helpottaa pohjan leikkaaminen korjaus (BER) ja yhden lohkon murtuma korjaus (SSBR) prosessit [6], [20], [21]. Tuoreessa raportissa edellyttäen tietoja, jotka osoittavat, että E2F1 transkriptiotekijän säätelee XRCC1 ja edistää DNA korjaukseen [22]. XRCC1 deleetiomutaation null homotsygoottisia hiirillä on alkion tappava [ ,,,0],23]. XRCC1 on kaksi BRCA1 karboksipään (BRCT) domeenit (BRCT1 ja BRCT2), joka sijaitsee keskitetysti ja C-terminaalisesta päästä, vastaavasti. BRCT2 on vastuussa sitoutumisesta ja vakauttaa DNA-ligaasi-III, jota tarvitaan yhden säikeen katkoksia ja aukkoja korjaus (SSBR), erityisesti aikana G0 /G1 vaiheiden solusyklin [24]. keskustassa BRCT1 domain sitoutuu ja alas-säätelee yhden säikeen katkoksia ja aukkoja tunnustamista proteiinia PARP1 jota tarvitaan tehokkaaseen SSBR aikana sekä G1 ja S /G2 vaiheiden solusyklin. Polymorfiaetsintä Arg399Gln sijaitsee lähellä BRCT1 n C-terminaalin rajan. Mutaatio tällä alalla muuttuu XRCC1 rakennetta ja saattaa olla häiritä yhdistelmä BRCT1 ja PARP1. Useat tutkimukset ovat raportoineet yhdistyksen XRCC1 Arg399Gln polymorfismi kanssa syöpäriskiä, mutta tulokset pysyivät kiistanalainen, vaikka alkuperäiset tutkimukset mieltä, että Arg399Gln polymorfismi liittyi syöpäriskiä, toisilla oli erilaisia mielipiteitä. Voidakseen ratkaista ristiriita, meta-analyysi 297 voivat tutkimusten mukaan lukien 93941 tapauksissa ja 121480 tarkastukset suoritettiin johtamiseksi tarkemman arvion yhdistyksen välillä XRCC1 Arg399Gln polymorfismin ja riskien eri syöpien riskiä.
kaiken kaikkiaan tuloksemme osoittavat, että XRCC1 Arg399Gln polymorfismi liittyy lisääntynyt syöpäriskiä, jolloin kaikki voivat tutkimukset yhdistettiin osaksi meta-analyysi. Muissa ositettu ja herkkyysanalyysien merkittävästi kohonnut hepatosellulaarinen ja rintasyövän riskiä havaittiin aasialaisilla (määräävässä malli: OR = 1,39, 95% CI = 1,06-1,84) ja intialaiset (määräävässä malli: OR = 1,64, 95% CI = 1,31 -2,04; väistyvä malli: OR = 1,94, 95% CI = 1,09-3,47; lisäaine malli: OR = 2,06, 95% CI = 1,50-2,84), tässä järjestyksessä. On otettava huomioon, että näennäinen epäjohdonmukaisuus Näiden tulokset voivat taustalla eroja etnisyys, elämäntapojen ja taudin esiintyvyys sekä mahdolliset rajoitukset suhteellisen pieni otoskoko. Nykyinen tietämys syövän osoittaa monitekijäinen ja monivaiheinen prosessi, johon eri geneettiset muutokset ja useita biologisia reittejä. Näin ollen on epätodennäköistä, että riskitekijät syövän työn erillään toisistaan. Ja sama polymorfismit voivat pelata erilaisia rooleja syövän alttiuden, koska syöpä on monimutkainen multi-geneettinen sairaus, ja erilaiset geneettiset taustat saattaa edistää ristiriita. Ja mikä vielä tärkeämpää, alhaisen penetraation geneettisiä vaikutuksia yhden polymorfismin voivat suurelta osin riippua vuorovaikutuksesta muiden polymorfismien ja /tai tietyn ympäristön altistuminen. Havaitsimme laaja vaihtelu Gln alleelifrekvenssien valvontaresurssit aasialaisilla (0,27), intialaiset (0,35), valkoihoiset (0,35) ja afrikkalaiset (0,17), ja tämä erilainen alleelin taajuus voisi selittää assosiaatiota XRCC1 Arg399Gln polymorfismia syöpäalttiutta eri etnisyys.
Perustuu biokemialliset ominaisuudet kuvattiin XRCC1 polymorfismi, voimme odottaa, että Gin alleeli liittyisi suurempi alttius kaikkien syöpien riskiä. Kuitenkin meidän tulokset osoittivat, että tällainen yhdistys havaittiin vain rinta- ja maksan syöpä, mikä viittaa siihen, että muut tekijät voivat olla moduloimalla XRCC1 polymorfismi toiminnallisuutta. Kuitenkin tarkka mekanismi yhdistyksen eri tuumorikohdat ja XRCC1 Arg399Gln polymorfismi ei ollut selvää, karsinogeenisia mekanismi saattaa vaihdella eri kasvain sivustoja ja XRCC1 perimä voi käyttää erilaisia vaikutuksia eri syöpiä. Useat aikaisemmat meta-analyysit arvioi yhdistyksen XRCC1 Arg399Gln polymorfismi kanssa rintasyövän, keuhkosyövän ja maksan syöpä, ja niin edelleen. Huang et al. [25] ehdotti, että Arg399Gln polymorfismi liittyi suurentunut rintasyövän riski keskuudessa aasialaiset ja afrikkalaiset ja sen sijaan vain hieman lisääntynyt rintasyövän riski valkoihoisilla. Saadat et ai. [26] ehdotti, että Arg399Gln polymorfismi oli yhteydessä lisääntyneeseen rintasyövän riskiä aasialaisilla. Li et ai. [27] ehdotetaan, että
XRCC1
Arg399Gln polymorfismi voi muuttaa rintasyövän riskiä valkoihoisista ja aasialaiset. Wu et ai. [11] todettiin, että
XRCC1
Arg399Gln on riskitekijä kehittämiseksi rintasyövän, etenkin aasialaiset ja afrikkalaiset. Kiyohara et ai. [28] ehdotetaan, että
XRCC1
Arg399Gln polymorfismi liittyy suurentunut riski sairastua keuhkosyöpään keskuudessa aasialaiset mutta ei valkoihoisilla. Wang et ai. [29] havaittu suojaava vaikutus XRCC1 399 Gln /Gin ja Arg /Gin tai Gin /Gin polymorfismien keuhkosyövän perusteella väestönkasvun hillitseminen (OR = 0,73, 95% CI: +0,58-+0,92; OR = 0,86, 95 % CI: 0,77-0,97, vastaavasti). Dai et ai. [9] mukaan
XRCC1
Arg399Gln polymorfismi voi olla yhteydessä keuhkosyövän riskiä. Liu et ai. [30], Zhang et al. [31], ja Xie et al. [32] ehdotti, että XRCC1 Arg399Gln polymorfismi ei liittynyt riskiä hepatosellulaarinen syöpä. Li et ai. [33] osoitti, että Arg399Gln polymorfismit XRCC1 voi olla geneettinen alttius HCC idässä aasialaiset. Duan et al. [34] osoitti, että XRCC1 Arg399Gln geeni polymorfismi liittyy suurentunut maksasyövän riskiä Kiinalaisessa Han väestö. Meidän meta-analyysissä pitäisi olla tiukempia ja kattava. Ensinnäkin, paremmin ajan tasalla tutkimusten rekrytoitiin antamaan tilastollisesti merkittäviä tuloksia. Toiseksi yhdistys Arg399Gln, jossa syöpäriskiä oli tutkittu yksityiskohtaisesti. Present meta-analyysi viittaa siihen osallistumisen XRCC1 Arg399Gln on geneettinen alttius maksasolusyövän aasialaisilla, rintasyövästä Indians, ja ei liity keuhkosyövän riskiä.
Tässä meta-analyysissä, erittäin between- tutkimuksissa heterogeenisuus havaittiin sairaalassa perustuvia tarkastuksia joidenkin syöpätyyppien, kuten gliooma. Syynä voi olla se, että sairaalan perustuvat tutkimukset on joitakin harhojen koska tällaista valvontaa voivat sisältää tiettyjen hyvänlaatuinen sairauksia, jotka ovat alttiita kehittämään pahanlaatuisen ja ehkä ole kovin edustava väestön. Siten käyttö asianmukaisen ja edustava syöpää vapaa verrokeilla on erittäin tärkeää vähentää harhat niin genotyypin assosiaatiotutkimuksiin. Mahdollisia lähteitä heterogeenisyys, kuten valvonnan lähteenä, syöpätyypin ja etnisyys ei osoittanut todettu merkittäviä vaihtelua meta-regressio. On mahdollista, että muut rajoitukset palvelukseen tutkimukset voivat osittain myötävaikuttaa havaittu heterogeenisyys. Ja tämä tarkoittaa, että se voi olla tarkoituksenmukaista käyttää yleistä arvio suhteesta XRCC1 Arg399Gln polymorfismin ja syöpäriskiä.
Nykyinen meta-analyysi on joitakin lujuus verrattuna yksittäisten tutkimusten ja aiempien meta-analyysit.