PLoS ONE: polymorfismit liittyvät Serum 25-hydroksi-D-taso ja sydäninfarktin, diabetes, syöpä ja kuolleisuus. Tromssan Study
tiivistelmä
tavoite
Matala seerumin 25 (OH) D arvot liittyvät kardiovaskulaarisia riskitekijöitä, ja myös ennustaa tulevaa sydäninfarkti (MI), tyypin 2 diabetes (tyypin 2 diabetekseen), syöpä ja kaikki kuolleisuusriskiä. Viime aikoina useat yhden emäksen monimuotoisuus (SNP: t), johon liittyy seerumin 25-OH-D (25 (OH) D) taso on tunnistettu. Jos nämä suhteet ovat syy voisi odottaa samanlainen yhdistys näiden SNP ja terveys.
Methods
DNA valmistettiin potilailla, jotka osallistuivat neljänteen kartoitus Tromssan Study 1994-1995 ja joka rekisteröitiin päätepisteissä MI, tyypin 2 diabetekseen, syöpään tai kuolema sekä satunnaisesti valitun kontrolliryhmään. Päätepisteen rekistereitä täydellisiä jopa 2007-2010. Tehtiin genotyypin 17 SNP liittyvät seerumin 25 (OH) D tasolla.
Tulokset
Yhteensä 9528 aiheista valittiin geneettisiä analyysejä, jotka suoritettiin onnistuneesti ainakin yhden SNP 9471 aiheista. Näistä 2025 rekisteröitiin MI, 1092 tyypin 2 diabetekseen, 2924 syöpään ja 3828 olivat kuolleet. Keskimääräinen erot seerumin 25 (OH) D: n välillä SNP genotyyppien alin ja ylin seerumin 25 (OH) D-pitoisuudet vaihtelivat 0,1-7,8 nmol /l. Genotyypin pistemäärä perustuu painotettuun riski alleeleja koskevat alhainen seerumin 25 (OH) D-pitoisuudet määritettiin. Ei ollut johdonmukainen yhteys välillä genotyypin pisteet tai henkilöille SNP ja MI, tyypin 2 diabetekseen, syöpään, kuolleisuutta tai riskitekijöitä sairaus. Kuitenkin rs6013897 genotyyppien (sijaitsee 24-hydroksylaasin geenin (
CYP24A1
)) oli merkittävää yhteyttä rintasyövän (P 0,05).
Johtopäätös
Tuloksemme eivät tue eivätkä sulje pois kausaalista suhdetta seerumin 25 (OH) D tasoja ja MI, tyypin 2 diabetekseen, syöpään tai kuolleisuus, ja havaintomme rintasyöpää tarpeisiin vahvistuksen. Lisäksi geneettiset tutkimukset ovat aiheellisia, erityisesti väestön D-vitamiinin puutos.
Trial Rekisteröinti
ClinicalTrials.gov NCT01395303
Citation: Jorde R, Schirmer H, Wilsgaard T, Joakimsen RM, Mathiesen EB, Njølstad I, et ai. (2012) polymorfismit liittyvät Serum 25-hydroksi-D-taso ja sydäninfarktin, diabetes, syöpä ja kuolleisuus. Tromssan Study. PLoS ONE 7 (5): e37295. doi: 10,1371 /journal.pone.0037295
Editor: John R. B. Perry, Peninsula College of Medicine ja hammaslääketieteen, Yhdistynyt Kuningaskunta
vastaanotettu: 10 helmikuu 2012; Hyväksytty: 17 huhtikuu 2012; Julkaistu: 23 toukokuu 2012
Copyright: © 2012 Jorde et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.
Rahoitus: Tämä tutkimuksen tukivat avustuksia Pohjois-Norjan Regional Health Authority (htpp /: www.helse-nord.no), The Norja Diabetes Association (htpp /: www.diabetes.no), ja Tromssan yliopistossa (htpp /: www .uit.no). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.
Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.
Johdanto
D-vitamiini on ikivanha hormonin kiistämätön merkitys kalsiumin ja luun aineenvaihduntaan. D-vitamiini- reseptoriin (VDR) on tumareseptorin lokalisoitu soluissa useissa elimissä ilmaisee tärkeitä tehtäviä myös extra-luuston kudoksissa [1].
Niinpä aiemmissa raporteissa päässä Tromssan Study olemme löytäneet matalan seerumin 25-hydroksi-D (25 (OH) D) tason (joka on D-vitamiinin metaboliitin käytetään arvioimaan kohteen D-vitamiinin asema) olisi vahvasti liittyvän verenpainetaudin [2], lihavuus [3], kohonnut hemoglobiinia (HbA
1c) [4] ja epäsuotuisa seerumin rasva profile [5]. Tämän mukaisesti olemme havainneet alhainen seerumin 25 (OH) D tasojen liittyvän riski sairastua tyypin 2 diabetes (tyypin 2 diabetekseen) [6], sekä lisääntynyt kuolleisuusriskiä [7]. Samanlaisia havaintoja on raportoitu muissa tutkimuksissa [8], [9], ja seerumin 25 (OH) D tasot on myös liitetty syöpään [10]. Näin ollen seerumin 25 (OH) D taso näyttää olevan tärkeä riskitekijä taudin yleensä. Kuitenkin onko syy-yhteys, matala seerumin 25 (OH) D ja tauti on epävarmaa ja odottaa tuloksia puutteellisesti satunnaistetussa kliinisessä tutkimuksessa (RCT).
D-vitamiinin saanti ja auringonoton ovat tärkeimpiä tekijöitä seerumin 25 (OH) D tason, mutta ei voi täysin selittää erot seerumin 25 (OH) D yksilöiden välillä [11]. Perustuen perhe ja kahden tutkimuksissa on arvioitu, että yli 50% vaihtelu voidaan lukea geneettiset tekijät [12], ja viime aikoina useat yhden emäksen monimuotoisuus (SNP: t), jotka liittyvät seerumin 25 (OH) D on tunnistettu [13 ], [14]. Nämä SNP, jossa alaikäinen alleeli taajuudet vaihtelevat 16 ja 40%, näkyvät tärkeitä seerumin 25 (OH) D tasolla kuin vaikutus D-vitamiinin ja lähes yhtä tärkeitä kuin vaikutus kausi [13]. Näin ollen jos seerumin 25 (OH) D taso on syy-yhteydessä terveyteen, voisi olettaa, että potilailla, joilla polymorfismit liittyy alhainen seerumin 25 (OH) D tasot olisivat alttiimpia sairauksille kuin potilailla, joilla oli oletettavasti edullisemman polymorfismit.
Tromsø Study on pitkittäinen epidemiologinen väestön terveyden tutkimuksen toistuvia tutkimuksia suoritettiin 6-7 vuotta välein [15]. Neljännessä tutkimuksessa suoritetaan 1994-1995, verinäytteitä DNA: n valmistaminen kerättiin lähes 27 000 aiheita. Osallistujat kanssa seurataan rekisteröinti tapahtuman sydäninfarkti (MI), tyypin 2 diabetekseen, syöpään ja kuolemaa, ja siksi oli tilaisuus testata, jos SNP D-vitamiinin järjestelmä liittyy kovaa päätepisteitä sekä sydän- ja verisuonitautia (CVD) riskitekijät. Tutkimuksessa kuitenkin ei antanut johdonmukaista näyttöä näiden suhteiden.
Materiaalit ja menetelmät
Tromssan Tutkimuksessa
Tromssan Study, suoritti Tromssan yliopistossa yhteistyössä National Health Screening Service, on pitkittäinen population-based monikäyttöinen tutkimus keskittyy elämäntapaan liittyviä sairauksia. Neljäs tutkimus tehtiin vuosina 1994-1995, viides vuosina 2001-2002 ja kuudes vuosina 2007-2008; 27 158, 8130 ja 12984 aiheita osallistui, vastaavasti (taulukko 1) [15], [16].
Määritelmä Tyypin 2 diabeteksen päätepisteiden
Mahdollisia tapauksia Tyypin 2 diabeteksen tunnistettiin itse- raportoitu diabeteksen kyselylomakkeen neljännessä (1994-1995), viidennen (2001-2002) ja kuudennen (2007-2008) tutkimuksia Tromssan Study kautta kohonnut HbA
1 c ( 6,5%) yhdessä kaksi entinen terveystutkimuksiin, kytkemällä neljännen kyselyn osallistujalista yliopistollisen sairaalan of North Norja digitaalisen vastuuvapauden diagnoosi rekisterin (ICD-9-koodit 250, 357,2, 362,0, 583,8, 648,0, 648,8, 790,2, ICD-10 koodit E10.0- E14, O24 ja R73) kanssa samanaikaisesti CVD rekisteröintiä tai sidos kuolinsyistä rekisterin. Lisäksi teimme systemaattisen oppaat ja sähköisten hakujen kautta lääketieteellistä listoilla diabetes (ennen vuotta 2001 paperi, 2001 digitaalinen kirjaa) kaikille osallistujille rekisteröity seuraavia sydän- diagnosoida koodeja kansainvälisen tautiluokituksen version 9 ja 10: ICD-9-koodit 410-414 (iskeeminen sydänsairaus), 427 (sydämen rytmihäiriöt), 430-438 (aivoverenkierron sairaus), 798 (äkillinen kuolema) ja 799 (muut huonosti määritelty ja määrittelemätön kuolinsyitä), ja ICD-10-koodien I20-I25 (iskeeminen sydänsairaus), I47 (kohtauksittainen takykardia), I47 (eteisvärinä ja värinä), I60-I69 (aivoverisuonisairaus), R96 (muut äkkikuolema, aiheuttaa tuntematon) ja R98 (vartioimatta kuolema) ja R99 (muut huonosti määritelty ja määrittelemätön kuolinsyitä). Diabetestapauksia rekisteröity jollakin näistä menettelyistä varmistettiin potilaskertomuksen tiedot yliopistollisessa sairaalassa Pohjois Norjan ainoa paikallisen sairaalan palvelevat Tromsø väestöstä. Tapaukset tuntemattomien tyypin diabetes ei sisällytetty analyyseihin, ja vain tapauksissa todentaa Tyypin 2 diabeteksen käytettiin. Erottelu tyypin 1 ja tyypin 2 diabetes perustui kliiniseen arvioon ja mittauksiin C-peptidin ja /tai glutamiinihappodekarboksylaasi vasta-aine (anti-GAD). Tyypin 2 diabeteksen päätepisteet olivat mukana loppuun asti 2008 [17].
Määritelmä MI päätepisteiden
joutui sairaalaan tapauksissa tapahtuman MI tunnistettiin linkittämällä Tromssan Study osanottajaluettelosta vastuuvapauden diagnoosi rekisteröi yliopistollisessa sairaalassa Pohjois Norja. Yksilöidä kaikki mahdolliset ensimmäisiä MI tapauksissa meidän hakustrategia sisälsi seuraavat vianmäärityskoodit: 1980-98 ICD 9 koodit 410-414 ja 798-7998; ja sen jälkeen ICD 10 koodit I20-I25, ja R96 ja R98-99. Mitä diabetes, myös systemaattisesti etsinyt potilastietoja varten MI osallistujien rekisteröity ICD-9-koodit 427, 430-438, ja 798-799, ja ICD-10-koodien I47-48, I60-I69, R96 ja R98-99. Sairaala potilaskertomuksen sitten nosteta tapauksessa validointi. Vastuuvapaus kirjeitä sairaalahoitoa muissa sairaaloissa kerättiin myös tarvittaessa. Edelleen, Tromssan Study osanottajaluettelosta oli yhdistetty valtakunnallisen kuolinsyistä kirjaamon Tilastot Norjan ja kuolintodistukset haettiin niille, joilla taustalla tai edistää diagnosointia CVD tai äkillinen odottamaton kuolema. Asiaa koskevat tiedot kerättiin lisälähteitä kuten ruumiinavauskertomuksiin ja levyjä hoitokodeissa, sairaankuljetuspalvelut ja yleislääkärit. Tämä menettely tunnistettu kohtalokas tapaus tapauksia MI esiintyneiden out-of-sairaalan kuolemista, kuten kuolemista tapahtuu ulkopuolella Tromsø. Tapaukset täyttävät diagnostiset kriteerit tai todennäköinen kuolemaan johtava tai ei-kohtalokkaan aikojen ensimmäinen MI luokiteltiin MI. WHO MONICA /MORGAM kriteereitä käytettiin algoritmien ja mukana kliinisiä oireita ja merkkejä, löydökset EKG, arvojen sydämen biomarkkereita ja (tarvittaessa) ruumiinavauskertomuksiin [18]. Silent sydäninfarktien määrittelemien EKG vain ei sisällytetä tapauksissa, koska vaikeuksia määritellä tarkan päivämäärän tapahtuman. MI päätepisteet olivat mukana loppuun asti 2007
Määritelmä syövän ja kuolleisuuden päätepisteiden
Tietoa syövän esiintyvyys ja syövän sijainti oli noudetaan Syöpärekisterissä Norjan päivitetyn loppuun 2008 . tiedot kuolema saatiin kuolinsyitä rekisterin, ja tietoa liikkumisesta pois Tromssan alueen ja maastamuutto Norjasta saatiin Norja kirjaamon Vital Statistics päivitetään loppuun 2010
valinta tutkimuskohortissa ja tehon laskeminen
lisäksi MI, tyypin 2 diabetekseen, päätepisteen rekisteriä aivohalvaus, lonkan ja radial murtumia, ja aorttastenoosi on luotu osana Tromssan tutkimuksen. Kun aiheista tässä tutkimuksessa valittiin joulukuussa 2010, 1874 koehenkilöille rekisteröity MI, 1136 tyypin 2 diabetekseen, 1150 aivohalvaus, 754 kanssa lonkkamurtuman, 1177 radial murtuma, 569 aortan ahtauma, 2932 syöpään ja 3850 olivat kuolleet . Lisäksi 769 potilaalla on yhteensä kaulavaltimon plakin alueen yläkvartiili on kaulavaltimon ultraäänellä toisessa vierailu neljännen kyselyn sisällytettiin tapauksissa. Koska kaikki nämä päätetapahtumat olivat mahdollisia etua koskevista geneettisten polymorfismien, ja rajoitettu rahoitus ei sallinut DNA: n valmistus ja geneettisiä analyysejä koko Tromssan Study kohortissa, päätimme tapauskohtaisesti kohortti suunnittelu. Tämän lähestymistavan, sama ”ohjaus kohortti”, valitaan satunnaisesti koko kohortin jotka osallistuivat neljäs tutkimus vuosina 1994-1995, voidaan käyttää ”kontrolliryhmä” kaikille eri päätepisteet [19].
vuonna valta laskettaessa päättää koon ohjaus kohortin oletimme ero seerumin 25 (OH) D 20 nmol /l välillä, joilla suotuisin ja epäedullinen genotyyppi [13], että tämä ero johtaisi eron suhteellisen riskin noin 1,3 koskien MI [20], ja että 20%: n valvonnan oli altistunut polymorfismi. Näillä oletuksilla ja α = 0.05 lukien 3655 tarkastukset ja 1218 tapauksia antaisi voimaa 0,9 havaita eroa genotyyppien MI. Siksi päätti valvontaa kohortin 4000 aiheita, mutta mukana ylimääräisiä aiheita tapauksessa joitakin geneettisiä analyysejä tai DNA uuttoja epäonnistuivat. Rekisteröinti ja laadunvalvonta päätepisteiden jatkui vasta elokuussa 2011, ja lopullinen määrä koehenkilöiden päätetapahtuma oli siis erilainen kuin silloin aiheista DNA analyysejä valittiin.
Mittaukset
Tällä vuonna 1994 tehty tutkimus -1995, osallistujat täyttivät kyselylomakkeita lääketieteellisen historian ja elämäntapojen tekijät. Verenpaine, pituus ja paino, seerumin kokonaiskolesteroli ja triglyseridit analysoitiin aikaisemmin kuvatulla [15].
Sera toisesta käynti säilytettiin -70 ° C: ssa, ja sen jälkeen mediaani varastointiaika 13 vuotta, sulattaa maaliskuun 2008 analysoitiin 25 (OH) D käyttäen automatisoitua kliinisen kemian analysaattoriin (Modular E170, Roche Diagnostics®, Mannheim, Saksa) [21].
ensimmäinen vierailu kokoverta kerättiin valmisteluun veritulpan jotka myöhemmin varastoidaan HUNT /NTNU Biopankkiverkosto Levanger, Keski-Norjan missä DNA valmistettiin myös käyttäen manuaalista eristäminen perustuva menetelmä Clotted Lysate valmistelu pöytäkirjan 8 tai 16 näytettä on Autopure LS Instrument Gentra (Gentra Systems Inc. MN, USA) käyttäen reagensseja Qiagen (Qiagen NV, Venlo, Alankomaat).
viidennessä tutkimuksen Tromssan tutkimuksessa vuosina 2001-2002 seerumin (PTH) mitattiin vakuuttavasti kuten aiemmin kuvattu [22] ja mukana tässä tutkimuksessa vakiintuneena merkki vitamiinin D: n biologinen vaikutus [1].
saatavien tietojen kahdesta genomin laajuinen yhdistys tutkimukset [13], [14], ja yksi kattava yhdistys analyysi [23], 17 SNP sijaitsee tai lähellä seuraavia geenien merkitys D-vitamiinin aineenvaihduntaa ja raportoidaan olevan voimakkaimmin liittyy seerumin 25 (OH) D tasot, valittiin analyysiin esillä olevassa tutkimuksessa:
– tekstin D-vitamiinia sitovan proteiinin (DBP) geeni (
DBP: tä tai GC
): kuusi top SNP mukaan Wang et al. [13] (rs2282679, rs7041, rs1155563, rs3755967, rs17467825, rs2298850) ja lisäksi yksi lupaava SNP raportoitiin Bu et al. [23] (rs222020).
– 25-hydroksylaasin geenin (
CYP2R1
) mukana muuntaminen D-vitamiinin 25 (OH) D: kolme parasta SNP mukaan Wang et al. [13] (rs10741657, rs2060793, rs12794714 (rs1993116 luultavasti välityspalvelinta rs2060793 ja ei sisälly)), ja lisäksi yksi lupaava SNP raportoineet Bu et al. [23] (rs1562902).
– 7-dehydrokolesteroli reduktaasin /NAD syntetaasin 1-geeni (
NADSYN1
) vastaa saatavuudesta 7-dehydrokolesteroli ihossa: kaksi ylintä SNP mukaan Wang et ai. [13] (rs12785878, rs3794060) ja kaksi ylintä SNP mukaan Ahn et al. [14] (rs3829251, rs11234027).
– 24-hydroksylaasin geenin (
CYP24A1
) hajotukseen osallistuvia 25 (OH) D: rs6013897 [13]. Rs2762939 ei liity seerumin 25 (OH) D taso, mutta oli vielä mukana, koska mahdollisen suhteessa valtimoiden kalkkeutumista [24], jotka voivat olla merkitystä tässä tutkimuksessa.
Kaikki genotyypitys suoritettiin KBioscience (https://www.kbioscience.co.uk) käyttäen KASP (KBioScience Allele-Specific Polymorphism) SNP genotyypin järjestelmään. KASP on kilpailukykyinen alleeli-spesifinen PCR: llä, joissa on FRET (Fluorescence Resonance Energy Transfer) sammuttaja kasetti. KASP raportointijärjestelmä koostuu seuraavista osatekijän oligonukleotideja:
– Kaksi alleelin-spesifisiä alukkeita (yksi kutakin SNP-alleelin). Jokainen aluke sisältää ainutlaatuisen leimaamatonta häntäsekvenssi sen 5′-päässä.
– Yksi yleinen (peruutus) aluke.
– Kaksi 5 ’fluor-leimattujen oligonukleotidien, yksi leimattu FAM, yksi HEX. Nämä oligonukleotidisekvenssiä on suunniteltu toimimaan vuorovaikutuksessa sekvenssit hännät alleelin-alukkeita.
– Kaksi muuta oligonukleotidien sammuttajia sidottu niiden 3′-päihin. Nämä oligonukleotidin sekvenssit ovat komplementaarisia niille, ja fluoria leimattujen oligonukleotidien (ja siten myös täydentävät hännät alleelin alukkeita). Nämä sammutettiin oligonukleotidit sitoutuvat sen vuoksi niiden fluori-leimatun täydentää ja kaikki fluoresoiva signaali pysäytetään, kunnes niitä tarvitaan.
alkuvaiheessa PCR, sopiva alleeli-spesifinen aluke sitoutuu sen komplementaarisen alueen suoraan ylävirtaan SNP (jossa 3′-pään alukkeen sijoitettu SNP nukleotidi). Yhteisen reverse-aluke sitoutuu myös ja PCR etenee, jossa alleeli-spesifinen aluke tulossa sisällytetty malliin. Tämän vaiheen aikana, Fluor-leimattujen oligonukleotidien pysyvät sitoutuneina niiden sammuttajaa sidottu komplementaaristen oligonukleotidien, ja fluoresoivaa signaali.
PCR etenee, yksi fluoria leimattujen oligonukleotidien, jotka vastaavat monistettujen alleeli myös saa sisällyttää malliin ja ei siten ole enää sidottu sen sammuttajaleimattuja sidottu täydennys. Koska fluor ei enää sammutetaan, sopiva fluoresoiva signaali ja havaitsee tavallisin keinoin. Jos genotyyppi tietyllä SNP on homotsygoottinen, vain yksi tai muun mahdollisen fluoresoivat signaalit generoidaan. Jos yksilö on heterotsygoottinen, tulos on sekoitettu fluoresoiva signaali.
Kaikissa genotyypityksen levyjä ei-templaattikontrollien (NTC) sisältyvät sen osoittamiseksi, että vahvistus näytteessä kuoppiin johtuu yksinomaan läsnäolosta näyte-DNA. Kaksi erillistä manuaalinen laadunvalvonta tarkistuksia tehdään, ja tiedot myös tarkistetaan erityisen ohjelmiston päättää, että ei ole olemassa virheellisiä puhelua tehtäviä, ei näytteitä liian lähelle tai liian kaukana alkuperä, ei NTC monistettu, tai virheelliset puheluja.
Tilastolliset analyysit
suhde SNP genotyyppien ja päätepisteet MI, tyypin 2 diabetekseen, syöpään ja kuolleisuus arvioitiin Coxin regressioanalyysisarjoissa iän, sukupuolen, painoindeksi (BMI), ja vitamiini D /kalanmaksaöljy lisäravinteen kovariantteja. MI riskitekijät systolinen verenpaine ja seerumin kolesterolia sisällytettiin myös erillisessä analyysissä tutkia, jos suhteita voitaisiin selittää näiden riskitekijöitä. Kuolleisuuden, havaintoaikaväliä asetettiin 1994, että muita vasteita syntymästä. Tarkkailujakson katkesi loppuun mennessä 2007 MI, 2008 diabeteksen ja syövän, ja 2010 kuolleisuutta. Ennalta määrätty ohjaus kohortti käytettiin ohjauslaitteet aiheita tietyn päätepisteen (tapaukset). Koska tämä valvonta kohortti valitaan satunnaisesti koko kohortin, se myös huomattava määrä aiheita, joissa yhdelle tai useammalle ominaisuudelle. Kun analysoidaan tietyn päätepisteen, aiheita valvontaan kohortin kanssa kyseisen päätepiste siirrettiin tapauksessa ryhmään (joista vain mukana potilaalla on, että tietty päätepiste). Näin ollen, koko valvonnan kohortin vaihdella riippuen päätepisteen osalta. Koska koko valvonta-kohortti, emme tee säätö osittaiseen todennäköisyys Coxin Regressioanalyysistä [19].
Jakelu jatkuvia muuttujia seerumin 25 (OH) D, verenpaine, rasva- , BMI ja HbA
1c arvioitiin skewness ja curtosis ja silmämääräinen tarkastus histogrammien ja todettu normaalia paitsi triglyseridit, HbA
1 c ja PTH jotka normalisoitiin log muutosta ennen käyttöä riippuvien muuttujien. Trends poikki genotyypit arvioitiin lineaarisen regression iän, sukupuolen, BMI, kuukausi tutkimus (jossa käytetään osoitinmuuttujia) ja D-vitamiinin saanti täydentää tai kalanmaksaöljy kovariantteja. CVD riskitekijät arvioitiin sisällä koko kohortin.
genotyyppi taajuudet tutkittiin noudattamista Hardy-Weinberg tasapaino Chi-Square-analyysi [25]. Kytkentäepätasapaino- (LD) SNP: iden välillä arvioitiin r
2 ja Lewontin n D ’tilastojen [26], [27].
Perustuu β-kertoimet regressioanalyysisarjoissa kanssa seerumin 25 (OH) D riippuva muuttuja, riski alleelit (itse liittyä alhainen seerumin 25 (OH) D tasot) punnittiin ja genotyyppi pisteet rakennettu [13]. Tästä pisteet vain SNP merkittävästi liittyvät seerumin 25 (OH) D-tasot mukana, ja vain SNP jotka olivat korreloimattomia (r
2 0,40) [28]. Coxin regressio analysoi kohortti jaettiin genotyyppi pisteet kvartiileja alin kvartiili (se, jolla on korkein seerumin 25 (OH) D-taso) referenssinä. Lisäksi, yksittäisten SNP: tä arvioitiin myös Coxin suurten homotsygoottinen genotyyppi on käytetty vertailukohtana.
Tiedot esitetään keskiarvona ± SD. Kaikki testit tehdään kaksipuolisia, ja P-arvo 0,05 katsottiin tilastollisesti merkitsevä. Jossa yksittäisten SNP: analysoitiin, korjaukset useita testaus suoritettiin Bonferronin menetelmällä. Niinpä Coxin analysoi P-arvot kerrottuna kertoimella 32 (4 SNP ja 8 päätepisteet) ja suhde CVD riskitekijöiden ja SNP kertoimella 4.
Ethics
Tutkimus hyväksyttiin alueneuvoston Lääketieteen ja Health Research Ethics (REK nord) (viite 2010 /2913-4). Vain osallistujille voimassa kirjallinen suostumus sisällytettiin.
Tulokset
Yhteensä 9528 aiheista valittiin tutkimukseen osallistumiseen ja DNA onnistuneesti valmistetaan ja analysoidaan ainakin yhden SNP 9471 aiheista. Näistä 4175 sisällytettiin kontrollina kohortin 2025 koehenkilöille vihdoin rekisteröity päätepisteiden MI, 1092 tyypin 2 diabetekseen, 2924 syöpään ja 3828 olivat kuolleet (taulukko 1). Ikäjakauma, sukupuoli, tupakointi ja laboratorio tietojen 1994-1995 näissä aineissa on esitetty taulukossa 2. genotyyppien kaikkien SNP oli Hardy-Weinberg tasapainon kaikkien analyysien lukuunottamatta neljää SNP on
NADSYN1
geeni jossa khiin neliö testaus antoi P 0,05.
yksittäiset SNP analyysit onnistuivat 98,8-99,5%: lla koehenkilöistä. Seerumin 25 (OH) D-tasot liittyvät genotyyppi on esitetty taulukossa 3. Yleisesti keskimääräinen erot seerumin 25 (OH) D välillä suurten ja pienten homozygoottisia genotyyppien olivat SNP: liittyvät
GC
,
CYP2R1
,
NADSYN1
ja
CYP24A1
geenit 0,3-7,8 nmol /l, 0,6-2,4 nmol /l, 1,8-2,9 nmol /l, ja 2.3- 2,7 nmol /l, vastaavasti.
SNP: t, joilla on sama geenin sijainti, ja että lisäksi olivat merkitsevästi yhteydessä seerumin 25 (OH) D tasot, korreloivat voimakkaasti. Siten
GC
geeni, rs2298850, joka oli SNP korkein ero keskimääräisissä seerumin 25 (OH) D välillä suurten ja pienten homozygoottien, oli LD kanssa rs2282679, rs1155563, rs3755967, rs17467825 (r
2 = 0,90, 0,59, 0,92, 0,92, vastaavasti), mutta ei rs7041 (r
2 = 0,38). Vastaavasti
CYP2R1
geeni, rs10741657 oli LD kanssa rs2060793 ja rs12794714 (r
2 = 1,00 ja 0,49, vastaavasti), ja että
NADSYN1
geeni rs3794060 oli LD kanssa rs12785878 (r
2 = 1,00). Kuitenkaan yksikään SNP rs2298850, rs7041, rs10741657, rs3794060 ja rs6013897 oli LD toisiinsa, ja nämä viisi SNP käytettiin rakentamisessa genotyypin pisteet. Seerumin keskimääräiset 25 (OH) D tasoilla neljä kvartiileja tämän genotyypin pisteet olivat 62,5 ± 20,7, 59,1 ± 19,8, 57,3 ± 19,5 ja 54,7 ± 19,5 nmol /l.
Taulukoissa 4 ja 5 tulokset koskien päätepisteet suhteessa näihin genotyypin pisteet kvartiileja yhdessä neljän SNP valittu sillä perusteella merkittävä ja suurin ero seerumin 25 (OH) D välillä suurten ja pienten homozygoottien kussakin geenissä, esittelyyn.
genotyypin pisteet ei liittynyt seerumin PTH, mutta rs6013897 sijaitsee
CYP24A1
geeni havaittiin merkittävä suhteessa alhaisempi keskimääräinen seerumin PTH tasolla polymorfismi on korkein keskimääräinen seerumin 25 (OH) D taso (taulukko 6 ).
Major päätepisteet
Kumpikaan genotyyppi pisteet eikä neljästä valittujen SNP liittyi merkittävästi MI, tyypin 2 diabetekseen, syöpään ja kuolleisuus korjauksen jälkeen useiden testaus (taulukko 4) . MI sisällyttäminen riskitekijöiden systolinen verenpaine ja seerumin kolesteroli ei vaikuta näihin tuloksiin (tuloksia ei ole esitetty). Kun syöpä jaettiin sijainnin (rinta-, keuhko-, peräsuolen ja eturauhasen), rs6013897 klo
CYP24A1
geeni oli merkittävä yhteys rintasyöpään (P 0,05), jossa alaikäinen homotsygootti, joka oli yksi alin seerumin 25 (OH) D tason, oli 86% suurempi riski sairastua rintasyöpään kuin suuret ja viite homozygoottisia (kuvio 1). Tämä oli vain yksi neljästä valittu SNP: iden samoin kuin genotyyppi pisteet, jotka osoittivat merkittävästi suhteessa tiettyyn syöpään.
CVD riskitekijöitä
ei ollut merkitsevää suhde CVD riskitekijöiden ja genotyyppi pisteet tai neljä valittua SNP (taulukko 6). Ei ollut eroa tupakointitottumuksissa suhteessa tahansa SNP genotyyppien (tuloksia ei ole esitetty).
Keskustelu
Tietääksemme tämä on ensimmäinen suuri väestöpohjainen tutkimus, jossa SNP liittyvä seerumin 25 (OH) D-tasot on raportoitu suhteessa merkittävien sairauksien CVD, tyypin 2 diabetekseen, syöpään, kuolleisuus, ja riskitekijöitä sairaus. Odotetusti löysimme merkittävää suhdetta valittujen SNP ja seerumin 25 (OH) D tasot [13], [14], kun taas suhteita kovan päätepisteet ja CVD riskitekijät eivät olleet yhdenmukaisia.
SNP analysoitiin meille ovat kaikki mukana tärkeitä askeleita D-vitamiinin aineenvaihdunnan kuten saatavuus substraattia D-vitamiinin tuotantoa ihossa (
NADSYN1
geeni), hydroksylaatio 25 (OH) D (
CYP2R1
geeni), kuljetus 25 (OH) D verenkierrossa (
DBP
tai
GC
geeni) ja hajoaminen inaktiivisiksi metaboliiteiksi (
CYP24A1
geeni) [13]. SNP eivät vaikuta elämäntapaa, ja niiden vaikutukset ovat elinikäinen. Siten ne saattavat olla parempi markkereita aihe D-vitamiinin asema kuin yhden seerumin 25 (OH) D mittaus. Vaikka ei korvaa RCT, tunnistamiseksi näiden SNP on mahdollistanut välillisesti testata suhde seerumin 25 (OH) D ja sairaudet. Erityisesti voisi odottaa nähdä suhteessa kehittyviä sairauksia pitkän ajan kuluessa, kuten CVD, tyypin 2 diabetekseen, syöpään ja lopulta myös kuoleman.
Mitä kuolleisuutta, jossa pieni seerumin 25 (OH) D taso on ennustaja [7], [9], kaikki riskisuhteita oli lähellä 1.00 ilman suuntausta matalan genotyypin pisteet, eivätkä yksittäiset genotyypit, joihin liittyy korkea seerumin 25 (OH) D-pitoisuudet, on suojaava vaikutus. Vastaavasti, matala seerumin 25 (OH) D on ennustaja MI [29], mutta mikään genotyyppien SNP-kohtien tutkittiin ilmestyi liittyvät MI riskiä. Tämä ei ole muutettu sisällyttämällä riskitekijöistä systolinen verenpaine ja seerumin kolesterolin Coxin regressioanalyysillä. Vaikka ei ole tilastollisesti merkitsevä, se oli myös huomionarvoista, että rs2298850 (joka oli SNP korkein ero suurten ja pienten homozygoottien koskevat seerumin 25 (OH) D)) oli 17% pienempi riski MI varten genotyypin alin seerumin 25 (OH) D tasolla. Assosiaation SNP
CYP24A1
geeni ja MI olisi voitu odottaa, koska Sehn et al. [24] raportoitiin yhden tällaisen SNP (rs2762939) liittyvän sepelvaltimoiden kalkkeutumista, joka jälleen ennustaa CVD [30]. Kuitenkaan yksikään
CYP24A1
geenin SNP, (mukaan lukien rs2762939) ilmestyi liittyvät MI meidän kohortissa.
suhde D-vitamiinin ja syöpä on uskottava kuin VDR, joka on tumareseptorin , on havaittu soluissa useissa kudoksissa ja aktiivinen muoto D-vitamiinia, 1,25-dihydroksivitamiini D (1,25 (OH)
2D), näyttää olevan antiproliferatiivisia vaikutuksia [31]. Epidemiologiset tiedot osoittavat negatiivisen ennustetekijöitä rooli matalan seerumin 25 (OH) D tasojen suhteen syöpä [32], mutta toistaiseksi syy-seuraus-suhde ei ole vahvistettu. [33] Tämän mukaisesti, että genotyypin pisteet kvartiilit ja useimmat SNP analysoitiin meille riskisuhteita syövän olivat lähes 1,00 paitsi rs6013897. Tätä SNP genotyyppi liittyy pienin seerumin 25 (OH) D taso oli 20% suurempi riski syövän, mutta tämä ei ollut merkittävä oikaistu monivertailuja.
Kuten ryhmä koostui peräti 2924 tapauksissa syöpä, tutkimme myös rinta-, paksu- ja peräsuolen, keuhko- ja eturauhassyöpää erikseen. Keuhkosyövän hoidossa [34] sekä eturauhassyövän [35] on vain heikkoja viitteitä suhde D-vitamiinia, ja joita ei käytetä genotyypin pisteet kvartiileja eikä SNP analysoitiin meistä oli mitään merkitseviä. Rintasyövän, tilanne on samanlainen ole yksimielisyyttä siitä, onko seerumin 25 (OH) D on ennustavan tulevaisuutta taudin tai ei [36]. Kuitenkin SNP rs6013897 koehenkilöt alaikäisen homozygoottisia genotyyppi (joka oli yksi, jolla on pienin seerumin 25 (OH) D-taso), oli lähes kaksinkertainen riski sairastua rintasyöpään verrattuna koehenkilöihin suurten homotsygoottisia genotyyppi.
rs6013897 liittyy
CYP24A1
geenin, joka pidetään onkogeeni. Tämä geeni (24 hydroksylaasin entsyymi) muuntaa 25 (OH) D sekä 1,25 (OH)
2D niiden aktiivinen muotoja ja on läsnä myös perifeerisissä kudoksissa. Paikallisesti tuotetun 1,25 (OH)
2D oletetaan olevan syövän vaikutusta, ja lisääntynyt paikallinen ilmentyminen
CYP24A1
geenin (ja siten lisääntynyt hajoaminen 1,25 (OH)
2D) on yhteydessä huonoon säilymiseen [37]. Sen vuoksi on kohtuullista, että myös polymorfismeilla tämä geeni saattaa vaikuttaa syöpäriskiä. Kuitenkin, Anderson et al. [38], joka tutki 1560 henkilöillä, joilla on rintasyöpä ja 1633 tarkastuksia ei löytänyt suhdetta SNP
CYP24A1
geeni ja rintasyöpä, kun taas ne ilmoitetaan yhdistyksen rintasyövän ja rs7041 jota ei ole nähty tutkimuksessamme (data ei näytetty). Ja lisätä sekaannusta, tutkimuksessa Kiinasta lukien 2919 tapauksissa ja 2323 tarkastukset, ei rs7041 eikä rs2762932 (proxy rs6013897) katsottiin merkittävästi liittyvät rintasyövän [39].
peräsuolen syövän näyttäisi olla käänteinen suhteessa D-vitamiinin saanti sekä seerumin 25 (OH) D tasoilla [40]. Kuitenkin RCT todisteita on rajoitettu, eikä yksikään SNP tarkastamaltamme tai genotyyppi pisteet, havaittiin merkittävä yhdessä peräsuolen syöpä.