Krooninen sairaus

tiivistelmä

Tarkoitus

Xeroderma pigmentsum ryhmä F (XPF) on keskeinen tehtävä DNA nukleotidin Leikkauskorjauksessa ja on yhdistetty kehittää erilaisia ​​syöpiä. Tutkimuksen tavoitteena on arvioida yhdistyksen

XPF

geneettisiä variantteja kanssa herkkyys ruokatorven okasolusyöpä (ESCC) Kiinan väestöstä.

Methods

Tämä kaksivaiheinen tapaus -Säätimet tutkimus tehtiin kaikkiaan 1524 potilasta, joilla ESCC ja 1524 tarkastuksia. Genotyyppi

XPF

-673C T ja 11985A G variantteja määritettiin polymeraasiketjureaktiolla-pohjainen restriktiofragmenttipituuspolymorfismin (PCR-RFLP). Logistinen regressioanalyysi suoritettiin arvioida pariton suhde (syrjäisimmillä alueilla) ja 95%: n luottamusväli (95% CI).

Tulokset

tapauskontrollitutkimuksessa osoitti, että

XPF

-673TT genotyyppi liittyi alentuneeseen ESCC verrattuna CC-genotyyppi sekä tapaus-verrokki sarjaa (Tangshan set: OR = 0,58; 95% CI = ,34-+0,99,

P

= 0,040; Beijing sarja: OR = 0,66; 95% CI = 0,46-0,95,

P

= 0,027). Kerrostunut analyysit paljastivat, että monikertaisesti vuorovaikutus -673C T variantti ja iän, sukupuolen tai tupakoinnin asema oli ilmeinen (Gene-ikä: P

vuorovaikutus = 0,002; Gene sukupuolta: P

vuorovaikutus = 0,002; Gene tupakoinnin : P

vuorovaikutus = 0,002). Sillä

XPF

11985A G-polymorfismi, ei ollut merkittävää eroa genotyypin jakautuminen ESCC tapauksissa ja valvontaa.

Johtopäätös

Nämä havainnot osoittivat, että geneettisiä variantteja

XPF

saattaa edistää alttiutta ESCC.

Citation: Liu Y, Cao L, Chang J, Lin J, hän B, Rao J, et al. (2014)

XPF

-673C T polymorfismin Vaikutus Alttius ruokatorven syöpä Kiinan Population. PLoS ONE 9 (4): e94136. doi: 10,1371 /journal.pone.0094136

Editor: Xiaoping Miao, MOE Key laboratorio ympäristöä ja terveyttä, School of Public Health, Tongji Medical College, Huazhong tiede ja teknologia, Kiina

vastaanotettu: 07 tammikuu 2014; Hyväksytty: 12 maaliskuu 2014; Julkaistu 7 huhtikuuta 2014

Copyright: © 2014 Liu et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus tukivat National Natural Science Foundation of China (81272613 X. Zhang), Science Fund for Distinguished Young Scholars Hebein tieteellisen komitean (H2012401022 X. Zhang) ja Leader Talent viljelysuunnitelma Innovation Team Hebein maakunnassa (LJRC001 X . Zhang). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Ruokatorven levyepiteelisyöpä (ESCC), yksi yleisimmistä pahanlaatuisia kasvaimia, on vakava uhka ihmisten ja terveydelle. Lähes 50% ESCC tapauksista esiintyy China [1] kantavassa kehittäminen ESCC on monimutkainen prosessi, joka liittyy useita ympäristön tekijät, mukaan lukien ruokavalio [2], infektion [3], elämäntapa tekijät, erityisesti tupakoinnin ja alkoholin [4]. Kuitenkin niillä henkilöillä, jotka altistuvat samalla riskitekijät, oli erilaiset alttius ESCC, mitkä olennaiset roolia geneettinen tekijä kehitettäessä ESCC [5], [6], [7].

Nucleotide leikkaaminen korjaus (NER) oli yksi monipuolisimmista DNA korjaus-. Se poistaa monenlaisia ​​DNA vaurioita, kuten UV-mukana tymiinidimeeri, DNA cross-link ja oksidatiivisen vaurion säilyttää DNA vakautta [8], [9]. Puutteita DNA korjaus kapasiteetti on liitetty suurentunut riski useiden syöpien [10].

Xeroderma pigmentsum ryhmä F (XPF), yksi olennainen NER proteiinien [10], muodostuu tiivis kompleksi Leikkauskorjauksessa cross komplementaatio 1 (ERCC1) leikkaamaan vaurioitunut DNA [11], [12].

in vitro

tutkimus osoitti, että

XPF

-673C T variantti muuttanut transkriptionaalista aktiivisuutta geenin [13]. Epidemiologiset tutkimukset osoittivat myös, että

XPF

geneettisiä variantteja osaltaan alttiutta erilaisiin syöpiin, kuten virtsarakon, rinta-, keuhko- ja mahasyöpä [14], [15], [16], [17].

Kun otetaan huomioon keskeinen rooli

XPF

vuonna NER, meidän pitäisi että

XPF

polymorfismien osaltaan riskiä sairastua ESCC. Voit tarkistaa tämän hypoteesin, suoritimme tämä tapaus-verrokki kiinalaisessa väestöstä.

Materiaalit ja menetelmät

Study aihe ja etiikka selvitys

Tässä tutkimuksessa kaksi riippumatonta tapaus -Säätimet näytejoukoille käytettiin. (A) Tangshan tapaus-verrokki set: 500 potilasta, joilla ESCC rekrytoidaan Tangshan Gongren sairaalasta (Tangshan, Kiina) välillä maaliskuun 2008 joulukuuta 2012 500 syöpää vapaa valvontaa. (B) Peking tapaus-verrokki set: 1024 ESCC potilasta rekrytoitiin Cancer sairaalan Kiinan Academy of Medical Sciences (Peking, Kiina) välillä tammikuussa 2009 ja joulukuuta 2012 1024 tervettä verrokkia. Kaikki osallistujat olivat geneettisesti jotka eivät liity Han-kiinalaisia. Tukikelpoisia potilaat olivat ensisijainen histopatologisesti vahvistetaan ja aiemmin hoitamaton sädehoitoa ja kemoterapiaa. Ei ollut ikä, sukupuoli, vaihe, tai histologian rajoituksia. Potilaille, joilla on maligniteetti tai metastasized syövän muista elimistä suljettiin pois. Kontrollit valittiin satunnaisesti syöpää vapaa väestö yhteisöstä suoritettiin samalla alueella samana aikana, kun potilaat rekrytoitiin. Valintakriteerit tarkastukselle mukana ei ole aiempaa maligniteetin, ja verrokeilla oli taajuus-sovitetaan potilaan iän (± 5 vuotta) ja sukupuoli. Tällä rekrytointi, kirjallinen suostumus saatiin kuhunkin aiheeseen. Tutkimus hyväksyi Institutional Review Board of Hebei United yliopiston ja Kiinan Academy of Medical Sciences Cancer Institute.

XPF genotyypityksen

genotyyppiä

XPF

-673C T (rs3136038) ja 11985A G (rs254942) polymorfismit määritettiin polymeraasiketjureaktiolla perustuu restriktiofragmenttipituuspolymorfismin (PCR-RFLP).

XPF

PCR-fragmentit, jotka sisältävät -673 C T tai 11985A G sivuston monistettiin alukkeilla paria XPF-673F (5 ’- GGG AGG CAA ACA GAG GTC TGA ATT – 3′) /XPF-673R (5’-TGC GAT TAC TCC CCA TCC TTC TT 3 ’) tai

XPF

-11985F (5′-GGA GTC AAG AAA CAG CCA ACC TAG TA-3′) /

XPF

-11985R (5′-AGG AAG ACA GGA TGA CAG CCA G-3 ’). PCR suoritettiin 25 ul reaktioseosta, joka sisälsi 10 ng DNA: ta, 0,3 pmol kutakin aluketta ja 2,5 mM MgCI

2, 1,25 mM dNTP: itä, 1,5 U DNA-Taq-DNA-polymeraasia. Reaktio saatiin aikaan profiili, joka koostuu ensimmäisen sulamisen vaihe 2 min 95 ° C: ssa, jota seurasi 35 sykliä 30 s 94 ° C: ssa, 30 s 58 ° C: ssa, 45 s 72 ° C: ssa, ja lopullinen pidennysvaihe 72 ° C: ssa 10 minuutin ajan. Vahvistetut PCR-tuotteet olivat 137 bp ja 129 bp -673C T ja 11985A G, vastaavasti.

-673C T, PCR-tuotteet pilkottiin EcoRI

I

. Rajoitusta tuote tehtiin näkyväksi 3,5% agaroosigeelillä. -673C Alleeli syntyy 114 bp ja 23 emäsparin kaksi juovaa; -673T alleeli tuotti yhden 137 emäsparin kaistan. Sillä 11985A G variantti, PCR-tuotteet digestoitiin Rsa

I

ja sitten erotettiin 3,5% agaroosigeelillä. 11985G alleeli syntyy 104 bp ja 25 bp: n kaksi vyöhykettä ja 11985A alleeli tuotti yhden 129-bp: n juova.

genotyypit erottaa PCR-RFLP varmistettiin vielä suoralla sekvensoinnilla (kuvio 1). Tehtiin genotyypin tietämättä tapauksessa /valvonta-asema, tutkimuksen aiheista. 10% naamioitu satunnaisia ​​näytteitä testattiin eri henkilöt ja tulokset olivat yhdenmukaisia.

Kuva A ja C hetkellä sekvensointi kuvia genotyyppien

XPF

-673 C T ja 11985A G ; Kuvassa B esitetään tulokset PCR-RFLP-analyysi -673C T polymorfismin edustavien tapausten (M: DNA-markkeri, asiat 1, 3 ja 5: CC genotyypin Tapaus 2 ja 6: CT genotyypin asia 4 ja 7: TT-genotyyppi ); Kuva D esitetään tulokset PCR-RFLP-analyysi 11985A G polymorfismin edustavien tapausten (M: DNA Marker; Tapaus 1, 4 ja 6: GG genotyypin asia 5 ja 7: AG genotyypin Tapaus 2 ja 3: AA genotyyppi) .

tilastollinen

Kaikki tilastolliset analyysit suoritettiin käyttäen SPSS16.0 tilastollinen ohjelmistopaketti (versio 16.0, SPSS Inc., Chicago, IL). Χ

2 testiä käytettiin tutkimaan eroja demografiset muuttujat ja jakaumat genotyyppien tapausten ja kontrollien välillä. Kertoimet suhde (OR) ja 95% luottamusvälit (CI) käytettiin arvioimaan yhdistys

XPF

variantteja riskiä ESCC mukaan ehdoton logistinen regressiomalli säätää iän, sukupuolen ja tupakoinnista. Kaikki tilastolliset testit olivat kaksipuolisia testejä, ja

P

arvo 0,05 pidettiin merkittävänä.

Tulokset

Aihe ominaisuudet

genotyyppi jakaumat Valittujen osallistujien ominaispiirteet tässä tutkimuksessa on esitetty taulukossa 1. mitään tilastollisesti eroja tapauksissa ja säätimet Tangshan tapaus-verrokki set ja Peking tapaus-verrokki asetettu iän ja sukupuolen jakelu (kaikki

P

0,05), mikä osoittaa, että taajuus sovitus oli riittävä. Oli kuitenkin enemmän tupakoivien potilaiden verrattuna kontrolleihin sekä tapaus-verrokki sarjaa (Tangshan set: 61,2%

vs

29,2%,

P

0,001; Beijing sarja: 65,5%

vs

32,3%,

P

0,001).

XPF

variantteja ja riski ESCC

genotyyppi jakamiin

XPF

-673C T ja 11985A G polymorfismit tapauksissa ja kontrollit yhteenveto taulukossa 2. havaittu genotyyppi taajuudet

XPF

polymorfismi (-673C T ja 11985A G) sekä valvonta olivat yhdenmukaisia ​​Hardy-Weinberg tasapaino kummassakin (Tangshan set:

P

= 0,06 ja

P

= 0,50; Beijing set:

P

= 0,40 ja

P

= 0,97).

monimuuttuja regressioanalyysimme käytettiin laskettaessa yhdistys XPF -673C T tai 11985A G genotyyppien kanssa ESCC riski (taulukko 2) . Sillä -673 C T-polymorfismi, TT genotyyppi osoitettiin olevan suojaava genotyyppi. Verrattuna -673CC genotyyppi, -673TT genotyyppi liittyi laskuun riski ESCC Tangshan tapaus-verrokki set (OR = 0,58, 95% CI = 0,34-0,99,

P

= 0,04). Samankaltaisuus, logistinen regressio analyysit paljastivat, että yksilöiden -673TT genotyypin myös oli pienentynyt riski ESCC OR (95% CI) 0,66 (,46-+0,95) Pekingissä tapaus-verrokki set. Yhdistettyihin analyysit, olemme huomanneet, että -673TT genotyyppi kantajia oli 0,64-kertainen riski vähenee kehittää ESCC (95% CI = 0,47-0,86). For 11985 A G-polymorfismi, meidän tutkimus ei osoittanut mitään yhdistyksen genotyyppien 11985A G-polymorfismi kanssa riskiä ESCC.

Riski ESCC liittyvän -673C T polymorfismin edelleen arvioitiin ositettiin ikä, sukupuoli ja tupakointi käyttämällä yhdistettyä dataa kahden tapaus-verrokki sarjaa (taulukko 3). Vuonna kerrostunut analyysit iän, -673TT genotyyppi merkitsevästi yhteydessä alentuneeseen riskiin keskuudessa 60 vuotta tai nuorempi (OR = 0,54, 95% CI = +0,36-0,80,

P

= 0,002), mutta ei joukossa aiheita ikäinen yli 60-vuotiaiden (OR = 0,81, 95% CI = 0,51-1,28,

P

= 0,359). Siellä oli merkittävä geeni-ikä vuorovaikutus havaittiin

(P

vuorovaikutukselle = 0,002). Verrattuna -673CC genotyyppi, joka on merkittävästi vähentynyt riski ESCC liittyi TT genotyypit vain miehillä (OR = 0,67, 95% CI = ,48-0,93,

P

= 0,017), mutta ei naisten keskuudessa ( OR = 0,58, 95% CI = 0,28-1,21,

P

= 0,145). Oli merkittävä geeni sukupuolta vuorovaikutus (

P

vuorovaikutukselle = 0,002).

Koska tupakanpoltto altistava tekijä ESCC, me olivatko geeni-tupakointi vuorovaikutus olemassa välillä -673C T polymorfismin ja tupakointi (taulukko 3). Joukossa tupakoimattomien verrattuna -673CC harjoittajien yksilöiden TT genotyyppi oli 0,61-kertainen riski vähenee kehittää ESCC (95% CI = 0,39-0,96, p = 0,031). Tupakoitsijoiden oli marginaalisesti vähensi merkittävästi ESCC riski (OR = 0,66, 95% CI = 0,43-1,00, p = 0,050) ja yksilöiden TT genotyypin verrattuna AA genotyyppi. Kertova geeni-tupakointi vuorovaikutus havaittiin myös kanssa

P

vuorovaikutukselle vastaten 0,002.

Keskustelu

Tässä tutkimuksessa tutkimme yhdistysten

XPF

-673C T ja 11985A G geneettisiä variantteja riski ESCC Kiinan väestöstä. Olemme havainneet, että potilailla, joilla -673TT genotyyppi vähensi ESCC verrattuna -673CC genotyypin harjoittajille Kiinan väestön. Sillä 11985A G-polymorfismi, ei ollut merkitsevää eroa ESCC tapauksissa ja valvontaa.

etninen ero

XPF

polymorfismien saattaa olla merkittävää vaikutusta sairausfenotyyppi. Tutkijat löysivät merkittävän yhdistys

XPF

rs1799801 eksonissa 11, jossa on pienempi riski virtsarakon syöpään valkoihoinen väestö [18], mutta ei Kiinan väestöstä [15]. Tämä ristiriita voi heijastaa ero geneettisen taustan eri tutkimuspopulaatiossa. Vuonna Tässä tutkimuksessa genotyyppi taajuudet

XPF

-673C T kontrolleissa ovat 59,4% CC, 35,0% CT ja 5,6% TT, jotka ovat yhdenmukaisia ​​niille Yu tutkimuksessa (55,5% for CC, 36,7% CT, 7,8% TT) ja ne, Shao tutkimuksessa (57,3% CC, 37,4% CT, 5,2% TT) [13], [16]. Tietääksemme ei ilmoiteta tietoja 11985A G polymorfismien ovat käytettävissä.

XPF on olennainen proteiini NER reitin, joka vastaa poistamaan DNA additiotuotteiden aiheuttama platina yhdisteitä [19]. Koska rakenne spesifisen DNA-endonukleaasi, XPF on raportoitu sitoutuvan kaksijuosteiseen DNA: han [20] ja edelleen osallistunut useisiin DNA korjaukseen reittejä yhdistämällä ERCC1 [21], [22]. On ratkaiseva nopeutta rajoittava tekijä NER, alhainen ilmentyminen XPF toimi geneettinen alttius tekijä syöpien kehittymisessä ja ennuste riskitekijä kemoterapian jälkeen useita syöpiä, mukaan lukien ruokatorven syöpä [15], [23], [ ,,,0],24], [25]. Toiminnallinen analyysi

XPF

-673T C osoitti, että -673T alleeli oli huomattavasti korkeampi transkriptionaalinen aktiivisuus verrattuna -673C-alleeli. Epidemiologiaa osoittivat myös, että -673TT genotyyppi oli pienentynyt riski sairastua keuhkosyöpään verrattuna -673CC genotyyppi [13], [16]. Nämä tulokset edelleen tukevat tämänhetkisiin tuloksiin, joka osoitti harjoittajille -673TT genotyyppi oli merkittävästi vähentynyt riski ruokatorven syöpään.

Useita todisteita ovat osoittaneet tilastollisesti merkitsevä geeni-ympäristö vuorovaikutus erilaisten syöpien [26], [27 ], [28]. Useimmat ESCC esiintyi myös siitä välistä vuorovaikutusta ympäristön ja geneettisten tekijöiden [2], [4]. NER-reitti on ensisijainen mekanismi pari vieviä ja kierteisen vääristää DNA additiotuotteiden tuottaman savuke [29], [30]. Tupakansavu sisältää monia syöpää ja prokarsinogeenien, kuten bentso (a) pyreenin ja nitrosamiinia. Geneettinen variantti promoottori

XPF

voivat vaikuttaa aktivointi substraattien tupakansavun ja edistävät eri alttius syöpiä. Useat tutkimukset ovat arvioineet suhde

XPF

-673C T polymorfismin ja keuhkosyöpää alttius tupakoinnin tila. Tekemä tutkimus Shao osoittivat -673 TT tai CT-genotyyppi merkittävästi lisääntynyt riski sairastua keuhkosyöpään tupakoimattomien, mutta ei tupakoitsijoita [16]. Kuitenkin Yu ja hänen kollegansa eivät ole löytänyt mitään vuorovaikutusta -673C T polymorfismin ja tupakointi [13] .Tämä on ensimmäinen raportti osoittaa geeni-tupakointi vuorovaikutusta

XPF

genotyypit ja tupakointi asema ESCC riski. Tuloksemme ehdotti, että XPF -673TT genotyyppi liittyi alentunut ESCC riski keskuudessa tupakoimattomia, mutta ei tupakoitsijoiden. Keskeisenä DNA Vahinkosaneerauksessa proteiinia, alhainen ilmentyminen XPF voivat viivästyttää DNA korjaus, ja edelleen lisätä genomin epävakautta ja edistää kasvaimen kehittymisen. Kuitenkin suuri mount altistumisen tupakoinnin voi hukuttaa ero DNA korjaus kapasiteetti eri genotyypin.

Tutkimuksemme on sen rajoitus. Tämä tutkimus on sairaala-pohjainen tapauskontrollitutkimuksessa rajoitettu Kiinan Han väestö. Valinta bias voi syntyä, kun näytteenotto ei ole satunnaista sisällä alapopulaatioille ja syövän vapaa aiheista. Kontrollit tutkimuksessamme oli sovitettu tapauksiin iän ja sukupuolen mukaan, mikä saattaa vähentää aihetta valinta bias. Lisäksi oli useita

XPF

polymorfismien havaittiin ja on osoitettu liittyvän erilaisiin syöpiin. Lisää mahdollisia toiminnallisia XPF polymorfismien vielä validoitava suurempia tutkimuksia eri väestöryhmien.

Yhteenvetona

XPF

-673C T-polymorfismi liittyvät merkittävästi pienentynyt riski ESCC. Meidän havainto viittaa siihen, että

XPF

osansa etiologiassa ESCC.