Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Munasarjojen syöpä on toiseksi yleisin gynecologic syöpä naisilla. Se on kuitenkin ylivoimaisesti kaikkein vaarallisin. Tämä on yleensä johtuvan puuttuessa helposti havaittavissa spesifisten merkkiaineiden munasarjojen syöpiä, jotka voidaan käyttää varhaisen diagnoosin ja erityistä terapeuttista tavoitteita.

Menetelmät /Principal Havainnot

Käyttäen päätepistettä PCR olemme löytäneet että perheen retrogenes, luultu ilmaistaan ​​ainoastaan ​​miehen kiveksissä aikana spermatogeneesin mies, ilmaistaan ​​myös normaalissa munasarjakudoksen ja suuri osa munasarjojen syöpiä. Ihmisellä on ainakin yksitoista peittyvästi retrogenes, jotka ovat intronitonta kopioita geeneistä X-kromosomissa, välttämätön normaalille siittiöiden ja ilmaisi erityisesti ihmisen kiveksissä. Testasimme ilmentämistä varten viiden tunnetun retrogenes,

UTP14C

,

PGK2, RPL10L

,

RPL39L

ja

UBL4B

normaaleissa ihmisen munasarjan ja munasarjojen syöpien.

Johtopäätökset /merkitys

Ehdotamme, että aktivointi kivesspesifinen retrogenes munasarjassa ja munasarjan syövät on biologista merkitystä ihmisille. Koska nämä retrogenes nimenomaisesti ilmaistu munasarjassa ja munasarjan syövistä naisten ne voi osoittautua hyödylliseksi uusien diagnostisten ja /tai terapeuttisten tavoitteita munasarjasyöpä.

Citation: Rohozinski J, Anderson ML, Broaddus RE, Edwards CL, Bishop CE (2009) Spermantuotanto Associated Retrogenes ilmentyvät ihmisen munasarjan ja munasarjasyövät. PLoS ONE 4 (3): E5064. doi: 10,1371 /journal.pone.0005064

Editor: Anja-Katrin Bielinsky, University of Minnesota, Yhdysvallat

vastaanotettu: 19 elokuu 2008; Hyväksytty: 06 helmikuu 2009; Julkaistu: 31 maaliskuu 2009

Copyright: © 2009 Rohozinski et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Rahoitusta tässä työssä, jonka Saks Fifth Avenue ”avain Cure” Foundations, The Joann Rosenberg rahaston Munasarjojen Cancer Research ja Munasarjojen Cancer Research Program osaston Naistenklinikka, Baylor College of Medicine ja anonyymin lahjoitus kautta CLE. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Vaikka munasarjasyöpä on toiseksi yleisin gynekologinen syöpä naisilla, se on ylivoimaisesti kaikkein vaarallisin. Se on viides johtava syy syövän liittyvät kuolemat naisten Yhdysvalloissa, vaikka se on alle 4% koko syöpien diagnosoitu. Vuonna 2008 on arvioitu, että siellä on noin 21650 uutta tapausta munasarjasyövän diagnosoidaan Yhdysvalloissa ja siellä on 15520 syyksi kuolemista [1]. Noin 45% naisista diagnosoitu munasarjasyöpä kuolee 5 vuoden sisällä diagnoosista. Tämä on verrattavissa 14% näistä diagnosoitu rintasyöpä ja 30% kohdunkaulan ja kohdun [2]. Tämä korkea sairastuvuus arvellaan johtuvan kyvyttömyydestä tunnistaa läsnäolo varhaisessa vaiheessa munasarjasyövän kliinisessä puutteen syövän markkereita, jotka voisivat auttaa varhainen diagnoosi ja post operatiivinen seuranta tauti uusiutuu. Tämä tilanne käy selvästi ilmi se, että kun munasarjojen syöpiä diagnosoidaan vaiheen I ja II 82% uhreista hengissä viiden vuoden kuluttua diagnoosista taas diagnosoitu vaiheen III ja IV on viiden vuoden eloonjäämisaste 25%. Vain 32% tapauksista diagnosoidaan vaiheen I ja II, verrattuna 68% vaiheessa III ja IV [3]. Siksi on suuri tarve tunnistaa malleja geenin ilmentymisen, jotka ovat ominaisia ​​munasarjasyövän jotta uusia diagnostisia ja terapeuttisia strategioita voidaan kehittää.

Osana meneillään olevaa ohjelmaa tutkimuksiin, jotka koskevat geenien kriittinen spermatogeneesin, me aikaisemmin tunnistaneet retrogene,

UTP14C

, liittyy miehen hedelmällisyyteen ihmisellä ja hiirellä [4] – [6]. Retrogenes syntyy, kun täysin tai osittain käsitelty mRNA: t käänteistranskriboidaan kaksijuosteisen DNA: n, ja tämä DNA-kopion työnnetään genomisen DNA: n läsnä kromosomeja. Jos kopio ilmentyy lähetti-RNA: n ja käännetään proteiinia uusi geeni tunnetaan toiminnallinen retrogene. Geeni, josta retrogene peräisin kutsutaan kantaisä-geenin. Ihmisillä

UTP14C

sijaitsee kromosomissa 13 ja alkunsa käänteistranskriptoituneet kopion geenin sijaitsee X-kromosomissa,

UTP14A

. Äskettäin on osoitettu, että suhteettoman paljon toiminnallisia peittyvästi retrogenes ovat peräisin X-kromosomi ja hankkinut miespuolinen ituradan tietyn toiminnon [7] – [9]. Useita erilaisia ​​hypoteeseja on ehdotettu selittää evoluution ilmiötä [10], kuitenkin kaikkein pakottavia on, että korvausta transkription inaktivointi sukupuolikromosomeiksi joka tapahtuu nisäkkäillä, kun sukupuoli elimet muodostavat spermatogeneesin aikana [11]. Aikana gametogeneesiin miehillä sukupuolikromosomeiksi pari kautta lyhyen pseudoautosomal alueen alkupuolella profaasissa I ja tiivistyy muodostaen macrochromatin elin tunnetaan sukupuoleen tai XY, kehon [11]. Toisin kuin autosomaalisen kromosomeja, jotka muodostavat homologinen pareja kutsutaan synaptonemal kompleksit ja pysyvät kopiointia aktiivisia läpi Meioosin sukupuolikromosomeiksi ovat kopiointia vaiennetaan (meioottisiin sukupuolikromosomi inaktivaatio) alkaen, kun sukupuolen kehon muodostumista kunnes meioosi on kilpaillut ja haploid spermatids muodostavat [12]. X-kromosomi sisältää suuren määrän siivous geenien välttämätön normaalille solujen toimintaa ja selviytymistä. Näin hiljentäminen X-kromosomi aikana mies meioosi voi olla metabolinen haittaa myöhemmissä vaiheissa spermatogeneesin. Retrotranspositiossa X liittyvät taloudenhoito geenien autosomeiksi, jossa myöhemmin aloitetun kivesspesifinen ilmaisun, on yksi mekanismi, jolla tällaiset metabolinen haitta voidaan korjata spermatogeneesin aikana häiritsemättä normaalia toimintaa somaattisten kudosten [13]. Ihmisellä on ainakin yksitoista peittyvästi retrogenes jotka ovat retrotransposed pois X-kromosomissa ja on tärkeä rooli ylläpitää tehokasta spermatogeneesin [10].

Käyttämällä päätepiste RT-PCR seuloa cDNA valmistetaan kattavasta paneelista ihmisen kudoksissa havaittiin, että

UTP14C

ilmaistiin paitsi miehen kiveksissä, mutta myös naisen munasarjojen ja mitään muuta kudosta [6]. Odottamaton ilmaus

UTP14C

ihmisen munasarja sai meidät tutkimaan, onko

UTP14C

myös ilmaistu munasarjasyöpiä. Sen määrittämiseksi, onko ilmentymisen kivesspesifinen retrogenes normaalissa munasarjojen ja munasarjojen syöpien oli yleinen ilmiö ihmisillä testattiin myös ilmentämiseen neljän muun retrogenes (

PGK2

,

RPL10L

,

RPL39L

ja

UBL4B

), jotka on aiemmin ajateltiin ilmaistaan ​​yksinomaan aikana spermatogeneesin miehen.

Tässä esitämme tulokset meidän näytöllä ilmentämiseen kivesspesifinen retrogenes normaalissa munasarjakudoksen ja paneelin munasarjojen syöpien. Ehdotamme, että kuvio kiveksen kaltaisia ​​transkription säätelyyn, joka johtaa retrogene ilmaisun usein esiintyy munasarjojen syöpien ja voisi edistää patogeneesiin tämän taudin. Lisäksi ainutlaatuinen munasarjojen ja munasarjojen syövän erityinen ilmaisu retrogene koodatun tuotteet voivat tarjota uutta ymmärrystä geenien ilmentymisen naisen ja johtaa tunnistaakseen uusia diagnostisia ja /tai terapeuttisia tavoitteita munasarjasyövän hoitoon.

Materiaalit ja menetelmät

lähteet Kudosnäytteiden ja RNA

näytteitä esi- ja postmenopausaalisilla munasarjat otettiin takautuvasti kerättiin kliinisissä-merkitty leikkauksia suoritetaan Baylor College of Medicine sidoksissa sairaaloista gynekologinen kirurgit. Lisäksi näytteet pikapakastet- munasarjasyöpiä saatiin monitieteinen Naistentautien Kasvain Bank The University of Texas MD Anderson Cancer Center (MDACC, Houston, Texas), ihmisen koko kives ja munasarjojen RNA ostettiin Panomics (Fremont, Kalifornia, USA . Tuote # NA2007) ja ihmisen RNA paneeli ostettiin Clontec (Clontech Laboratories Inc., Mountain View Kaliforniassa Yhdysvalloissa. Master Panel II, tuote # 636643).

Kaikki keräys tehtiin alle hyväksynnän Institutional Review Board on Baylor College of Medicine (Protocol H-14372). Lupa käyttää ihmisen kudosten saatiin kunkin potilaan kirjallista suostumusta lomakkeella hyväksymässä Institutional Review Board for Baylor College of Medicine ja siihen liittyvät laitokset. Kirjallinen suostumus saatiin samalla tavalla potilaiden lahjoittamalla kudosnäytteitä Monitieteellisen naistentautien Kasvain Bank The University of Texas MD Anderson Cancer Center.

RNA ja ensimmäisen juosteen synteesiin

takautuvasti kerättyjen kudosnäytteiden sijoitettiin 10 ml: aan RNAlater (Ambion, Inc. Austin Texas, USA) ja niitä säilytettiin -20 ° C: ssa, kunnes RNA. RNA uutettiin paino kudosnäytteistä sulattamalla Trizol-reagenssissa (Invitrogen Corp. Carlsbad California USA), jota seurasi välitön homogenointi käyttäen Tissue-Tearor homogenisaattorilla (BioSpec Products, Inc. Bartlesville Oklahoma, USA). RNA kerättiin käyttäen TRIzol Reagent protokollaa. RNA suspendoitiin uudelleen nukleaasin vapaata vettä ja säilytettiin -80 ° C: ssa. CDNA: n tuottamiseksi 5 ug RNA: ta käsiteltiin DNaasi (Turbo DNA-free-sarja, Ambion Inc.), saostettiin ja suspendoitiin uudelleen pitoisuuteen 1 ug per ui. RETROscript Kit (Ambion, Inc.) käytettiin ensimmäisen juosteen cDNA-synteesi 2 ug RNA: ta, jossa on yhdistelmä oligo (dT)

18 ja random (dN)

15-alukkeita. Synteesin jälkeen 20 ui reaktioseokset laimennettiin 150 ul: ksi nukleaasilla vapaata vettä ja säilytettiin -20 °.

RT-PCR

Genes kiinnostavia havaittiin päätepiste PCR: llä käyttäen geenispesifistä alukkeet (taulukko 1). Reaktio tilavuutta 20 ui laimennettua AccuPrime Super Mix II (Invitrogen, Corp.), joka sisälsi 1 ui cDNA: ta ja retrogene spesifisiä alukkeita kuumennettiin 94 ° C: ssa 2 minuutin ajan, sitten kierrätettiin 35 kertaa läpi 94 ° C: ssa 20 sekunnin ajan, 58 ° C 20 sekuntia, 68 ° C: ssa 30 sekunnin ajan, ja pidettiin 15 ° C: ssa sen jälkeen, kun viimeinen sykli. PCR-tuotteet ajettiin ulos 1,75% agaroosigeeleillä, jotka sisältävät etidiumbromidia ja vanteet näkyviksi UV valaistus. Geelit valokuvattiin käyttäen Kodakin Gel Logic 200 Imaging System.

Tulokset ja keskustelu

Osana meneillään olevaa ohjelmaa tutkimuksiin, jotka koskevat geenien ratkaisevaa siittiöiden olemme aiemmin raportoitu tunnistaminen retrogene liittyy miehen hedelmällisyyteen ihmisellä ja hiirellä [4] – [6]. Ihmisillä tämä retrogene,

UTP14C

, sijaitsee kromosomissa 13 ja alkunsa intronitonta, käänteiskopioitiin kopio X-kromosomiin liittyvä geeni,

UTP14A

. Vaikka funktio

UTP14A

ja

C

ja niiden tuotteiden ei tiedetä, vastaavasti tuotteen hiivan geenistä,

Utp14

, viittaa siihen, että ihmisen peptidit, UTP14A ja C, osa Small-alayksikkö (SSU) processome joka vastaa tuottaa 18S rRNA sen edeltäjä, U3 snoRNA, että nucleolus [14], [15]. Käyttäen päätepiste RT-PCR seuloa cDNA: ita, jotka on valmistettu laajan Ihmiskudospaneelia löydettiin

UTP14C

ilmaistaan ​​paitsi miehen kiveksissä, mutta myös naisten munasarjoissa [6]. Tämä odottamaton ilmentyminen

UTP14C

ihmisen munasarja sai meidät nähdä, jos

UTP14C

myös ilmaistu munasarjasyöpiä toivoa tunnistaa kudosspesifisiä markkereita selektiivisesti ilmentyy normaaleissa munasarjat ja munasarjojen syöpien. Loppupiste RT-PCR: ää käytettiin havaitsemaan selostukset

UTP14A

ja

C

perusterveydenhuollossa munasarjasyöpiä ja perustettu munasarjasyövän solulinjoissa. Ilmentymisen määrittämiseksi on

UTP14C

RT-PCR mutkistaa se, että se sijaitsee aktiivisesti puhtaaksi isännän geenistä,

GT8

.

UTP14C

on seurausta retrotranspositioon tapahtuma, jossa intronitonta DNA kopio

UTP14A

koodaava sekvenssi lisätään välittömästi ylävirtaan koodausalueen läsnä terminaalin eksonissa

GT8

kromosomissa 13. Tämän jälkeen

UTP14C

on hankkinut promoottoriin, joka ohjaa sen ilme spermatogeneesin aikana. Koska selostukset

UTP14C

ja

GT8

päällekkäin mahdollisuutta yksittäisen transkriptin sisältävä avointa lukukehystä molemmista geeneistä syntyy. Erottaa päällekkäisten transkriptit, joita tuotetaan retrogene ja sen isäntä, alukeparia suunniteltiin nimenomaan monistamaan joko

UTP14C

tai

GT8

[6] ja havaita mahdolliset transkriptio jotka voivat sisältää sekä avointa lukukehystä. Kuva. 1 esittää ilmentymisen profiilit

UTP14A

,

UTP14C

ja

GT8

in edustava otos kuudesta eri papillaarisen vakavien munasarjasyöpiä, yleisin histologinen alatyyppi tämän maligniteetin kaksi selvää solu- ja kaksi endomet- näytettä.

UTP14A

, X-kromosomin liittyvät esisolujen geeni, joka

UTP14C

syntyi, ilmentyi kaikissa syövän näytteiden (kaista A). Vastaavasti

GT8

, isäntä geeni

UTP14C

, ilmentyi kaikissa näytteissä (kaista C). Spermatogeneesi liittyvä retrogene,

UTP14C

, ilmentyi kaikissa paitsi yhdessä syöpänäytteissä (kaista D). Testasimme myös näytteitä käyttäen yhdistelmä 5′-aluke ominaisia ​​

GT8

(joka on jopa virtana UTP14C transkription aloituspaikan) ja 3′-aluketta ominaisia ​​

UTP14C

( joka on ylävirtaan

GT8

transkriptio) [6]. Puuttuminen PCR-tuotteen käyttämällä tätä alukeparia vahvistaa, että luku-kautta mRNA, ulottuen sekä

GT8

ja

UTP14C

geenejä, ei tuotettu ja vahvistetaan riippumattomuutta kaksi päällekkäistä selostukset (kaista B). Samanlaisia ​​tuloksia saatiin kaikille alukeyhdistelmiä, kun paneeli on perustettu munasarjasyövän solulinjoissa testattiin identtisissä olosuhteissa (2774, ES-2, TOV112D, OV90, SKOV3, TOV21G, HEI ja OVCAR3; Fig. 2). On kuitenkin syytä huomata, että useat solun näytteitä osoitti myös läsnäolon RNA-transkriptien, joka kesti niin isännän geenistä (

GT8

) ja

UTP14C

viittaa poikkeava transkription säätelyyn joissakin munasarjasyöpä solulinjoissa. Emme ole koskaan havaittu transkription, joka kesti Molempien geenien ihmisen kudosnäytteitä.

Kaista A esittää tuotteen erityisiä

UTP14A

. Kaista B osoittaa reaktiotuote alukeparin spesifinen

GT8

(5′-pää) ja

UTP14C

(3′-pää), nämä kaksi geeniä ovat päällekkäisiä ihmisen kromosomissa 1 ja puuttuessa PCR-tuote osoittaa, että selostukset kahdesta geenistä ovat poissulkevia. Kaista C esittää

GT8

geenin tietyn tuotteen ja, kaista D, PCR-tuotetta

UTP14C

. Molekyylipainomarkkeria ajettiin kaistalla M.

Kaista A:

UTP14A

tietyn tuotteen. Kaista B: Tuote alukkeista yhteisiä sekä

UTP14C

ja

GT8

. Tämä aluke yhdistelmä ei anna PCR-tuote, munasarjan tai munasarjasyövän kudosnäytteistä. Kaista C:

GT8

erityisiä RT-PCR-tuotetta. Kaista D: Tuotteen erityinen

UTP14C

. Alukeyhdistelmiä on kuvattu tekstissä. Perustettu munasarjasyövän solulinjoissa käytettiin 1. 2774, 2. ES-2, 3 TOV112D, 4. OV90, 5. SKOV3, 6. TOV21G, 7. HEI, 8. OVCAR3, ja M, molekyylikoon markkeri.

korkea taajuus, jolla

UTP14C

ilmaistiin meidän peruskatsastuksesta johti meidät tutkimaan esiintyvyys sen ilmaisun suuressa paneelissa munasarjojen syöpien eri kliinisen histologian. Yhteenlaskettuna huomasimme, että selostukset

UTP14C

voidaan helposti havaita 41/51 (80%) papillaarisen vakavien syöpien, yleisin syöpä tutkittiin, ja useimmat muut syövän alatyyppeihin. Taajuus

UTP14C

ilmentymistä erilaisissa munasarjasyövän histologinen alatyyppi on esitetty taulukossa 2.

määrittää, onko aktivointi kivesspesifinen retrogenes munasarjat ja munasarjojen syöpien on yleinen ilmiö ilmaus neljä muuta retrogenes, aikaisemmin olevan kivesspesifinen, tutkittiin. Spermatogeneesi liittyvä retrogenes testataan koodataan eri solun tärkeitä toimintoja: metabolisia entsyymejä (

PGK2

) [13], ribosomaalinen proteiinit (

RPL10L

ja

RPL39L

) [16 ] ja translaation jälkeinen proteiinin muutos (

UBL4B

) [17]. Alukeparit nimenomaan retrogenes ja X liittyvät esisolujen käytettiin molekulaarinen geeni-ilmentymisen sama paneeli munasarjasyöpä kudosten aikaisemmin on kuvattu.

mies, fosfoglyseraattikinaasin koodaa kaksi geeniä,

PGK1-

ja

PGK2

. Fosfoglyseraattikinaasille muuntaa 1,3-difosfoglyseraatti osaksi 3-fosfo- glykolyysijärjestelmän kautta. Tämä johtaa tuotannon pyruvaattia glukoosi ja fruktoosi [18].

PGK1-

sijaitsee X-kromosomissa ja ilmentyy kaikkialla taas

PGK2

, joka on retrotransposed kopio

PGK1-

, sijaitsee kromosomissa 6 ja esittää kivesspesifinen ilmentymiskuvio [13]. Toinen retrotransposed kopio

PGK1-

on läsnä kromosomissa 19 mutta se näkyy katkaistun proteiinin ja on luultavasti aktiivinen kuin mitään EST (ilmenevän geenin osiksi) voisi löytyä ihmisen tietokantaan. Yli ilmentyminen PGK1-proteiinin on yhdistetty paklitakselin vastus [19] ja kasvaimen angiogeneesissä [20]. Lisäksi PGK1- proteiini tasot ovat kohonneet seerumin haimatiehyeeseen adenokarsinooma potilaille [20], [21]. Näin ollen näyttää siltä, ​​että

PGK1

yli ilmentyminen voi olla biologinen merkitys joidenkin syöpien. Havaitseminen

PGK1-

ja

PGK2

edustavassa paneelissa munasarjasyöpiä, kiveksissä ja ennen ja jälkeen vaihdevuosien munasarjat on esitetty kuvassa. 3. ilmentäminen

PGK2

todettiin kaikissa munasarjakasvain tyyppejä korkein taajuus papillaarisen vakavien (78%) ja sekoitetaan histologia (76%) kasvaimista (taulukko 2). Odotetusti taloudenhoito geeni,

PGK1-

ilmentyi kaikissa kasvain näytteissä. Kuitenkin johtuen pienestä näytteen koosta harvinainen munasarjasyöpä alatyyppien todellinen taajuus

PGK2

ilmentymistä näissä kasvaimissa ei voitu määrittää. On vielä ratkaistava, jos

PGK2

ilmentyminen liittyy kasvaimen biologiaan.

a. Retrogene ilmentyminen paneeli munasarjasyövistä havaittiin RT-PCR: llä. Näytteet ja syöpä histologia olivat: 1-6. Papillaarisen Seroosi, 7 8 Clear Cell, 9 10 endomet-, 11 premenopausaalinen munasarja, 12 postmenopausaalisen munasarja. Negatiivinen kontrolli C ja merkki M. b. Retrogene ilmentyminen normaalissa munasarjakudoksessa: 1-4. premenopausaalinen munasarjat, 5-8. post vaihdevuosien munasarjat, negatiivinen kontrolli C ja merkki M.

Nisäkkäiden ribosomien koostuvat vähintään 80 ribosomaalisen proteiinit [22], joista neljä on koodattu X-kromosomissa [23]. Kolme näistä,

RPL10

,

RPL36A

ja

RPL39

, on peittyvästi retrotransposed kopioita. Kaksi sijaitsevat kromosomissa 14 (

RPL10L

ja

RPL36AL

) ja kolmas kromosomissa 3 (

RPL39L

) [16].

RPL36AL

ilmentyy kaikkialla taas

RPL10L

ja

RPL39L

on aiemmin raportoitu ilmaistaan ​​yksinomaan kiveksissä [16].

RPL10

on myös tuumorisuppressorigeenin ja proteiini se koodaa tunnetaan tuumorisuppressiogeeneksi proteiinin QM [24]. Alennettu

RPL10

ilmentyminen liittyy yhä luokan eturauhasen adenokarsinooma [25]. Spesifisiä alukkeita ja

RPL10L

ja

RPL39L

käytettiin seulomaan ilmentämiseen näiden kivesspesifinen retrogenes paneelissa munasarjojen syöpien (taulukko 2; Fig. 3). Tekstinäytteitä molemmat retrogenes havaittiin papillien vakavien, kirkas solu ja endometroid näytteitä.

RPL10L

ilmaistiin 76% suuren munasarjakasvain paneeli 84% ilmaisun papillien vakavien syöpiä, 76% kasvaimissa sekavin histologia ja 44% vuonna endometroid kasvaimista (taulukko 2).

RPL39L

ilmentyi jopa korkeampi taajuus on 98% papillaarisen vakavien syöpiä, jotka sisältävät transkriptio (taulukko 2). Expression kasvaimissa muiden histologialtaan oli 88% vuonna AGCT (Adult follikkeliepiteelisolujen kasvain) ja 100% kaikissa muissa alatyyppeihin testattu.

Vaikka välitön rooli ribosomaalisen proteiinien syövän biologian on vielä laatimatta, se on huomattava, että

RPL39

ilmentyminen on lisääntynyt rintasyövän [26].

RPL39L

ilmentyminen on raportoitu kohdunkaulan syövän [27] sekä solulinjat, jotka ovat peräisin rinta-, keuhko-, eturauhas-, paksusuoli-, haima- ja munasarjasyövät [16], [20], mikä viittaa siihen, että retrogene

RPL39L

voi olla tärkeä rooli biologian laaja valikoima syöpiä. On kuitenkin syytä huomata, että näyttö

RPL39L

ilmentymistä ihmisen kudoksen RNA-paneeli johti tunnistaa tämän retrogene suuri määrä normaaleissa kudoksissa viittaa siihen, että vaikka

RPL39L

ilmaisu tapahtuu pääasiassa kiveksissä se voi olla kivesspesifinen (Fig. 4). Ilmentäminen retrogenes

RPL10L

ja

RPL39L

syövissä mahdollisesti parantaa ribosomien tuotanto- ja /tai translaation aktiivisuutta. Kivesten, nämä retrogenes ilmaistaan ​​spermatogeneesin aikana juuri ennen nopeaa proteiinien tuotantoa, joita tarvitaan siittiöiden erilaistumisen ja kypsymisen.

Expression X liittyvät kantaisä geenien

PGK1

,

RPL10

,

RPL39

ja

UBL4A

on kaikkialla, kuten voidaan odottaa, geenejä, jotka koodaavat olennaisia ​​solun toimintoja. Sitä vastoin ilmaus spermatogeneesin erityisten retrogenes,

PGK2

,

RPL10L

,

RPL39L

ja

UBL4B

, on pääasiallisesti rajoitettu kiveksissä. Tissue avain: AG, lisämunuaisen; BM, Bone Marrow; B, Brain; H, sydän; K, munuainen; L, maksan; Lu, Lung; O, Munasarja; Pl, Istukka; Pr, eturauhasen; SG, sylkirauhasten; SM, Luurankolihasvaikutukset; SC, selkäydin; T, Kives; Ty, Thyamus; Tr, Kilpirauhasen; Tch, henkitorvi; U, Kohtu. M on molekyylikoon merkki ja C, on pohjamaali hallita vain reaktio. Ilmaus malli

UTP14A

ja

UTP14C

on aiemmin julkaistu [5].

Ubiquitin kuten proteiineja (UBLs) ovat translaation jälkeen sidottu monipuolinen joukko muiden proteiinien lisäten siten toiminnallisen monimuotoisuuden koodatun proteomin. UBL modifioidut proteiinit tiedetään vaikuttavan aktiivisuuden monenlaisia ​​solun signalointireittien [28], [29].

UBL4A

ja

UBL4B

ovat äskettäin tunnistettu geenejä, jotka koodaavat pieniä ubikitiinipromoottori kuten proteiineja [17]. Hiiren, X-sidottu

Ubl4A

ilmentyy kaikissa kudostyypeissä, kun taas retrogene

Ubl4b

on raportoitu ilmaista vain kasvavaan spermatids loppuvaiheissa spermatogeneesin kiveksissä [17 ]. Alustava testaus

UBL4A

ja

UBL4B

ilmentymistä ihmisen RNA paneeli totesi, että

UBL4A

ilmentyi kaikissa kudostyypeissä testattu.

UBL4B

, sijaitsee kromosomissa 1, ilmentyi vain kiveksissä (Fig. 4), vaikka myöhemmin seulonta suurempi näyte ennen ja jälkeen vaihdevuosien munasarjat osoitti, että

UBL4B

ilmaistiin normaalissa munasarjakudoksessa matalilla taajuuksilla (taulukko 2). Tulokset ensimmäisen näytön

UBL4B

aktivaatio munasarjakasvain näytteissä esitetään kuviossa. 3. Taulukossa 2 esitetään taajuuden, jolla

UBL4A

ja

UBL4B

ekspressiota havaittiin laaja paneeli munasarjakasvain näytteitä. Kuten melkein kaikki solutoiminnoille vaikuttavat ubikinaa- ei ole yllättävää, että muutokset ubikitiinipromoottori ja UBL aktiivisuus ovat sekaantuneet synnyssä ihmisen erilaisten kasvainten tyyppiä [30]. UBL muutokseen, SUMO-1 (pieni ubikitiinistä liittyvä määrite, joka tunnetaan myös UBL1) on suoraan sidoksissa muuttaminen apoptoosireittiä munasarjakasvaimia [31] ja sen tiedetään olevan tärkeä rooli spermatogeneesin [32].

seulonta retrogene ilmentymistä normaalissa esi- ja postmenopausaalisilla munasarjat paljasti, että retrogenes eivät ilmenny kaikilla naisilla. X liittyvät kantaisä-geeni ilmentyy kaikissa tapauksissa (taulukko 2; Fig. 3), kuten voidaan odottaa, geenejä, jotka koodaavat välttämätön geeni toimintoja, jotka ovat läsnä kaikissa ihmisen kehon. Kuitenkin retrogene ilmentyminen terveissä munasarjakudoksen voi olla jopa 100% (

RPL10L

ja

RPL39L

) näytteistä testattujen tai niin alhainen kuin 44% (

UBL4B

). Tämä viittaa siihen, että ainakin joidenkin retrogenes, ilmentyminen munasarja rajoitu tiettyihin yksilöihin väestössä. Suurin osa työstä on siittiöiden erityisiä retrogenes on tehty hiiren mallia, jossa munasarjojen näiden geenien ilmentymistä on poissa. Expression näistä retrogenes ihmisen munasarja voi olla lajille ominainen ilmiö, voi heijastaa tärkeä biologinen ero ihmisen ja hiiren. Retrogene ja kantaisä X alukkeilla testattiin paneeli RNA: iden eri ihmisen kudoksista vahvistaa läsnä ilmentymisen X liittyvät kantasoluihin ja rajoitetun ilmentymisen retrogene (Fig. 4). Useimmissa tapauksissa retrogene ilmentyminen rajoittui sukurauhasten mies. Onko suhde ilmaus kivesspesifinen retrogenes ihmisen munasarja ja lisääntynyt todennäköisyys syövän kehityksen vielä perustettava.

Erityisestä huomata on havaintomme, että X liittyvät kantaisä geenejä ei aina ilmaistu kaikki munasarjasyöpä näytteitä. Kun näin oli talon retrogene on aina ilmaistu viittaa siihen, että retrogene on korvata menetys geenin aktiivisuuden X-kromosomissa samalla tavalla kuin sitä, joka tapahtuu, kun X-kromosomi transkriptionaalisesti vaimennettu aikana uros meioosin. Poisto segmentit X-kromosomi on munasarjasyöpäsoluja ja myöhemmin Heterotsygotian menetys on hyvin dokumentoitu [33]. Tällaiset poistot voivat johtaa menetykseen geenien, joilla on retrotransposed kopioita. Menetys kopion

PGK1-

vuoksi deleetioita X-kromosomi on aiemmin raportoitu eri munasarjasyövän histologinen alatyyppi [34]. Tällainen menetys voi olla biologisesti merkittävä, jos poistetaan kappale on aktiivisesta X-kromosomi tai jos molemmat kopiot geenistä ovat transkriptionaalisesti aktiivisia normaaleissa soluissa.

tiheä spermatogeneesin erityisiä retrogene aktivaatio munasarjasyöpiä raportoitu tässä paperi on tärkeä teoreettinen ja käytännön vaikutukset munasarjasyövän hoitoon ja biologia. Koska nämä retrogenes ilmaistaan ​​vain munasarjoissa ja /tai munasarjojen kasvaimia ja missään muualla naisvartalon potentiaalia kehittyä kasvain markkereita ja hoitoja esittelee itsensä. Ensisijaisia ​​tähän on perustettu ilmaus syövän /kives (CT) geenejä ja antigeenejä monenlaisiin ihmisen kasvaimia ja on ilmiö, joka on tunnustettu jo jonkin aikaa [35], [36]. Expression of CT antigeenien syövissä ensin raportoitu

MAGE-1

vuonna 1991, vaikka tuolloin sen katsottiin olevan geenin ilmaistu erityisesti ihmisen melanooman kasvaimissa [37] ja sen ilmentyminen kiveksissä oli ei tunnistettu. Myöhemmin raportit lisätään

MAGE-3

ja

BAGE

luetteloon CT antigeenejä, jotka ilmentyvät tuumoreissa muttei ilmentyy normaaleissa kudoksissa kuin kiveksissä [38], [39]. Tunnistaminen Muiden CT antigeenejä siirretään eteenpäin nopeasti soveltamista serologisen analyysin rekombinantilähteestä kirjastojen (Serex) tekniikka [40]. Tähän mennessä ainakin neljäkymmentäneljä erilaista CT antigeenejä on tunnistettu [41]. Syy, miksi geenit, jotka koodaavat proteiineja, jotka ovat välttämättömiä spermatogeneesin miehen tai on rakenteellinen rooli siittiöiden, ilmaistaan ​​syövissä ei ole selvä. Tilannetta vaikeuttaa se, että rooli monien CT-geenien spermatogeneesin ymmärretään huonosti [36]. Tämä ei kuitenkaan ole estänyt hyödyntäminen CT antigeenejä biomarkkereina kehittää uusia syövän diagnostiikassa [42] ja /tai tavoitteita hoitoja kuten immunoterapia [43]. Yksi rajoittava tekijä käytännön soveltamisessa CT antigeenejä on ollut alhainen taajuus, jolla syöpä /kives geenit ilmentyvät missä tahansa kasvaimen tyyppi. Tämä rajoitus ei ole läsnä, kun kyseessä on spermatogeneesin erityisiä retrogene ilmaisun munasarjasyöpiä koska nämä geenit ilmentyvät suhteellisen suuri prosenttiosuus kasvaimia.

Mielenkiintoinen piirre aikaisemmin kirjattu syöpä /kives geenejä ja antigeenejä on niiden kohtuutonta yhdessä X-kromosomissa [36]. X-kromosomi ja geenit se koodaa ilmeisesti keskeinen rooli kasvaimen synnyssä ja kehittämiseen [44]. Kuitenkin suhde tuumoribiologiassa ja spermatogeneesiin on epäselvempi. Ihmisen näyttää siltä, ​​että kivesspesifinen retrogenes on myös ilmaistu munasarjoissa. Kuitenkin spesifinen solutyyppejä, jossa ilmaisu tapahtuu vielä määritettävä. Expression näistä retrogenes voi olla selvä metabolinen etu munasarjojen kasvainten kehittymiseen, koska se voi täydentää geenituotteilla X-kromosomi, erityisesti tapauksissa, joissa kantaisä geeni toimintaa säädeltiin metylointi [45] tai kadota poistetaan [34]. Välinen yhteys metabolisen tapahtumia spermatogeneesin aikana ja syövän kehityksen voidaan päätellä viimeaikainen edistys ymmärtäminen syövän biologian. Erityisen huomattava on äskettäin tunnistettu roolia BRCA-1 kehittämisessä rinta- ja munasarjasyövän syöpiä [46]. BRCA-1-proteiinin on osoitettu olevan yhteydessä aktiivinen X-kromosomi naisten somaattisten solujen ja, spermatogeneesin aikana, on lokalisoitu aktiivinen X-kromosomi on pachytene spermatosyyteiksi aikana meioosi [47], [48]. Tämä viittaa jaetun sääntelyn kautta. Lisätyötä tarvitaan määrittämään toiminnallista roolia spermatogeneesin erityisten retrogene tuotteita sekä spermatogeneesin ja syöpä. Geenien ilmentymistä ja retrogenes vuonna spermatogeenisten soluissa ohjaavat TATA-riippumaton promoottorit. Polyadenylaatiokohtia ovat ylävirtaan niitä käytetään somaattisten solujen ja on vallitsevana vaihtoehtoisia pre-mRNA [49]. Ekspressio kiveksissä geenien ja retrogenes viittaa siihen, että syöpäsolut pystyvät hyödyntämään transkription ja RNA prosessointireaktiosarjat normaalisti aktiivinen ainoastaan ​​spermatogeneesin miehen kiveksissä. Mikä tahansa rakenteellinen identiteetti yhteinen mRNA: t syntyvät CT ja muut geenit ilmaistaan ​​sekä syöpien ja kives on määritettävä. Jos siittiöiden ja kasvaimen synnyssä osuus piirteitä geenien ilmentymisen, sääntely ja RNA käsittely voitaisiin otaksua, että pitkäikäisen nisäkkäillä syöpä on biologinen rangaistus on erilliset sukupuolten ja tarve spermatogeneesin erityisesti.