Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

DNA korjaus geeni X-ray korjaus cross täydentää ryhmä 1 (XRCC1) on tärkeä rooli ylläpidossa genomisen eheys ja suojaaminen solujen DNA-vaurioita. Sekvenssimuuntelun XRCC1 geeni voi muuttaa pään ja kaulan alueen syöpä (HNC) alttius. Nämä tulokset eivät ole ratkaisevia. Johtamiseksi tarkemman arvion suhdetta XRCC1 polymorfismin ja HNC riski, suoritimme meta-analyysissa 16344 aiheista.

Methods

etsimään kirjallisuuden PubMed, EMBASE, Web tiede ja China National Knowledge Infrastructure suoritettiin tunnistaa tutkimuksiin perustuen ennalta kriteerit. Kertoimet suhde (OR), jossa 95%: n luottamusväli (CI) yhdistettiin käytettäessä satunnaista vaikutuksia mallia tai kiinteiden vaikutusten malli.

Tulokset

Kaksikymmentäyhdeksän tutkimukset koostuvat 6719 tapauksia ja 9627 kontrolliraskauksiin ja analysoitiin. Kaiken kaikkiaan mitään todisteita merkittävää yhteyttä ei havaittu XRCC1 Arg194Trp, XRCC1 Arg280His, XRCC1 Arg399Gln genotyypit ja riski HNC tahansa geneettistä mallia. Alaryhmäanalyyseissa mukaan etnisyys, kasvain sivusto, julkaisuvuosi, genotyypitysmenetelmää myös havaittu mitään merkittävää yhdistyksen missään alaryhmä, paitsi että suusyövästä liittyi Arg194Trp muunnos väistyvä malli. Lisäksi ei ole merkittävää vaikutusta näiden polymorfismien vuorovaikutuksessa tupakoinnin HNC riski havaittiin mutta Arg194Trp homotsygoottinen variantti.

Johtopäätös

Kaiken kaikkiaan tämä meta-analyysin mukaan XRCC1 Arg194Trp, Arg280His ja Arg399Gln polymorfismi voi ei osalliseksi HNC alttius. Lisätutkimukset noin geeni-geeni ja geeni ympäristön vuorovaikutukset eri väestöissä tarvitaan.

Citation: Lou Y, Peng Wj, Cao Ds, Xie J, Li Hh, Jiang Zx (2013) DNA Repair Gene XRCC1 polymorfismit ja pään ja kaulan syöpäriski: Päivitetty meta-analyysi lukien 16344 aiheet. PLoS ONE 8 (9): e74059. doi: 10,1371 /journal.pone.0074059

Editor: Peiwen Fei, Havaijin yliopiston Cancer Center, Yhdysvallat

vastaanotettu: 13 huhtikuu 2013; Hyväksytty: 29 heinäkuu 2013; Julkaistu 23 syyskuuta 2013

Copyright: © 2013 Lou et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Kirjoittajat ei ole tukea tai rahoitusta raportoida.

kilpailevat edut: kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Pään ja kaulan alueen syöpä (HNC) on nyt viidenneksi yleisin syöpätyyppi maailmassa [1], jossa on noin 434000 uutta potilasta diagnosoidaan vuosittain maailmanlaajuisesti [2]. Useimmat tapaukset uusia potilaita tapahtuu taloudellisesti kehitysmaissa, kuten Intiassa, Brasiliassa ja Thaimaa [3,4]. HNC jaetaan yleensä kolmeen ryhmään: suuontelon, nielun, ja kurkunpää. Evolvement HNC on monitekijäinen prosessi liittyy erilaisia ​​riskitekijöitä. Kumulatiivinen todisteet osoittavat, että tupakoinnin, alkoholin ja märehtiä betel mälli kolme suurta riskitekijöitä HNC [5,6]. Nämä ympäristön karsinogeenien voi aiheuttaa viallisen DNA-vaurioita vastaus, joka voi johtaa apoptoosin tai voi aiheuttaa perimän epävakaisuuden ja un-säännelty (proliferatiivinen) solujen kasvuun [7-9].

DNA korjaus järjestelmä pyrkii ylläpitämään genomista eheys, ja jatkuvasti haastaa ympäristö- loukkauksia ja replikointi virheitä. Siksi muutos DNA korjaus geenit voivat lisätä riskiä kohdunkaulan pään ja kaulan [10]. Kolme tärkeää DNA korjaukseen polkuja, mukaan lukien nukleotidin Leikkauskorjauksessa (NER), pohja Leikkauskorjauksessa (BER), ja kaksinkertainen lohkon murtuma (DSB), ovat mukana tässä prosessissa. X-ray korjaus rajat täydentävät ryhmä 1 (XRCC1) osallistuu BER reitin uskotaan olevan keskeinen tehtävä suojella genomin useista riskitekijöistä. Kolme yhteinen yhden nukleotidin polymorfismien XRCC1 geenissä, kuten Arg194Trp (C T substituutio eksonissa 6 tuloksena Arg Trp aminohapon muutos), Arg280His (G vaihtamaan at eksonissa 9 tuloksena on Arg Hänen aminohapon muutos) ja Arg399Gln (G vaihtamaan at eksonissa 10 johtaa Arg Gln aminohapon muutos) ovat yleisimmin testattu monissa tutkimuksissa, jotka ovat tutkineet eri populaatioissa.

Useita tutkimukset ovat arvioineet yhdistys HNC riski polymorfismi DNA korjaavien geenien XRCC1 Arg194Trp, XRCC1 Arg280His, ja XRCC1 Arg399Gln. Nämä tulokset ovat ristiriidassa. Vaikka mikään yhdistyksen välillä XRCC1 polymorfismien ja HNC riski osoitettiin joissakin tutkimuksissa [11,12], mutta Ramachandran et al. [13] ja Olshan et ai. [14] havaittu suhde XRCC1 Arg194Trp ja Arg399Gln polymorfismien ja riski HNC. Olshan et ai. [14] suoritetaan ositettu analyysi arvioida vuorovaikutusta XRCC1 polymorfismien ja tupakointi, mikä viittaa siihen, että Arg194Trp ja Arg399Gln variantteja XRCC1 liittyi riski HNC niissä tapauksissa, mutta ei yhdistys löytyi Kumar tutkimus [15]. Vaikka Flores-Obando et ai. [16] suoritetaan meta-analyysi vuonna 2010 suhteesta XRCC1 polymorfismien ja riski HNC, alaryhmäanalyyseissa tupakoinnin ja genotyypitysmenetelmää ei ole tehty. Ottaen huomioon nämä ristiriitaiset tulokset, teimme päivitetty meta-analyysi päätellä kohtuullisen johtopäätös suhteesta XRCC1 polymorfismien ja HNC riski. Alaryhmäanalyyseissa koskevat etnisyys, tupakointi, sivusto HNC, julkaisuvuosi, ja genotyypitysmenetelmää tehtiin. Siksi nykyinen meta-analyysi on suurempi kyky valta johtaa tarkempi johtopäätökset kuin edellisen meta-analyysit.

Materiaalit ja menetelmät

Haku strategia

Systemaattinen ja sähköinen haku antoi PubMed, EMBASE, Web of Science, ja Kiinan kansallinen Knowledge Infrastructure (CNKI) tietokannat suoritettiin tunnistamiseksi tutkimukset yhdistelmillä seuraavista hakutermit: ”pää ja kaula”, ”suun”, ”nielu”, ”kurkunpää ”,” nenänielun ”,” syöpä ”,” kasvain ”,” karsinooma ”,” x-ray korjaus cross täydentää ryhmä 1 ”,” XRCC1 ”,” Arg194Trp ”,” Arg280His ”,” Arg399Gln ”,” polymorfismi ”, ja ”vaihtelu”. Kaikki tutkimukset julkaistiin varhaisimmistakin rajanylityspaikoilla maaliskuussa 2013.

Selection

Kaikissa tutkimuksissa täyttivät seuraavat kriteereillä: (1) julkaistiin Englanti; (2) tutkittiin tapausverrokkitutkimukset arvioitaessa suhdetta XRCC1 polymorfismin ja riski HNC; (3) kuvattu genotyypin taajuuksilla; (4) genotyypin jakautuminen valvonnan on oltava Hardy-Weinberg tasapaino (HWE); ja (5), kun monistetaan tutkimuksia julkaistiin saman tekijän saadaan samasta potilaan näytteestä, vain kaikkein täydellinen julkaisu tutkimus sisällytettiin tähän meta-analyysiin. Julkaisematon raportti ja abstrakteja ei pidetty.

Data louhinta

Tiedot kerättiin mukaan vakioprotokolla. Seuraavat tiedot kustakin uutettiin tutkimus: nimen ensimmäinen kirjoittaja, julkaisuvuosi, maa, genotyypitysmenetelmiä, etnisyys ja lähde tapausten ja kontrollien, näytteen ominaisuuksien väestöstä, ja genotyyppi numerot tapauksista ja valvontaa.

tilastollinen

ensimmäinen testattu poikkeamat Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) kontrolliryhmässä ryhmissä käyttäen hyvyys fit testi (Chi-square test tai Fisherin tarkka testi) . Kertoimet suhde (OR) ja vastaava 95%: n luottamusväli (CI) käytettiin tutkimaan yhdistyksen välillä XRCC1 polymorfismin ja HNC riski. Nykyinen meta-analyysissä käytetään seuraavia tilastollisia malleja, alleelinen geneettinen malli, codominant geneettinen malli (homotsygootti vertailun), ja väistyvä geneettinen malli. Heterogeenisuus tutkimuksissa arvioitiin käyttäen chi-neliö-pohjainen Q tilastoa (P 0,1 Q testi osoittaa merkittävää heterogeenisyyttä) [17]. Olemme myös määrällisesti vaikutus heterogeenisyys käyttäen I

2 tilastotieto [18]. Joko random-vaikutusten malli (Dersimonian-Laird menetelmällä [19]), tai kiinteiden vaikutusten malli (Mantel-Haenszelin menetelmää [20]) käytettiin laskettaessa yhdistetystä vaikutuksesta arvioiden läsnä ollessa tai poissa ollessa heterogeenisyys, vastaavasti. Lopuksi mahdollisia julkaisu bias arvioitiin kautta Begg testi ja Egger testi visuaalisesti analyysin suppilon juoni [21,22]. P 0,05 pidettiin tilastollisesti merkitsevä julkaisu puolueellisuudesta. Genotyyppi taajuudet kontrollipopulaatioissa mukaan rotuun laskettiin ja testit yhtäläisistä mittasuhteet suoritettiin Aasian ja Kaukasian kontrollipopulaatioissa voidakseen vertailla eroja genotyyppi taajuuksilla kahden ryhmän välillä. Kaikki tilastolliset analyysit suoritettiin STATA versio 10.0 ohjelmisto (Stata Corporation, College Station, TX).

Tulokset

Tutkimukset ominaisuudet

Kuten kuviossa 1, atk haku-strategiaa edellä mainittujen toimitti 38 julkaisuissa. Näistä kaksi paperit pois johtuen siitä, että ne eivät arvioi yhdistyksen välillä HNC riskin ja XRCC1 polymorfismien [23,24]. Myöhemmin viisi tutkimusta suljettiin pois, koska ei ole hyödyllistä genotyyppitietoja [25-29]. Muissa 31 tutkimuksissa kaksi asiakirjaa jätettiin päällekkäisyyden vuoksi tietojen [30,31]. Lopulta 29 tutkimuksissa havaittiin tukikelpoisia ja ne analysoitiin [11-15,32-55].

Yhteensä 29 raportteja, jotka koostuvat 6719 tapauksia ja 9627 tarkastukset, yhteensovitus mukaanottokriteereihin olivat sisältyvät esillä meta-analyysi. Ominaisuudet on esitetty taulukossa 1. Näistä 29 raportteja, 15 tutkimuksia tehtiin valkoihoisten, 10 tutkimukset suoritettiin aasialaisista, ja neljä tutkimukset suoritettiin sekapopulaatio. Vuonna 29 tutkimuksissa, 23 keskittyi suhdetta XRCC1 Arg194Trp polymorfismin ja HNC riski, 11 keskittyi Arg280His polymorfismia, ja 28 tutki yhdistyksen välillä Arg399Gln polymorfismin ja HNC riski. Vuonna 19 tutkimuksissa, tarkastukset olivat terveeltä väestö ja kahdeksassa tutkimuksissa tarkastukset olivat sairaalassa väestöstä.

Ensimmäisen tekijän (vuosi) B Maa

Alkuperä

Ohjaus lähde

kasvain sivustoja

genotyypitysmenetelmiä

Näytteen koko (tapaus /kontrolli) B Tutkimus ympäristötekijöiden

Sturgis ym. (1999) USACaucasianHospitalOral onkalo, kurkunpään, oro /hypo-pharynxPCR-RFLP203 /424NROlshan ym. (2002 ) USACaucasianHospitalOral ontelon, kurkunpään, pharynxPCR-RFLP98 /161SmokingVarzim et al. (2003) PortugalCaucasianHealthyLarynxPCR-RFLP88 /178NRCho et al. (2003) TaiwanAsianHealthyNasopharynxPCR-RFLP334 /282NRTae et al. (2004) KoreaAsianHospitalOral ontelon, kurkunpään, oro /hypo-pharynxSequence129 /157NRDemokan et al. (2005) TurkeyOtherHealthyNRPCR-RFLP95 /98Smoking, alcoholMatullo et al. (2005) EuropeCaucasianHealthyOral ontelon, kurkunpään, pharynxTaqman82 /1094SmokingRydzanicz et al. (2005) PolandCaucasianHealthyOral ontelon, kielen, kurkunpään ja pharynxPCR-RFLP182 /143SmokingGajecka et al. ( 2005) PolandCaucasianHealthyLarynxPCR-RFLP293 /319NRKietthubthew et al. (2006) ThailandAsianHealthyOral cavityPCR-RFLP106 /164SmokingRamachandran et al. (2006) IndiaAsianHospitalOral cavityPCR-RFLP110 /110Smoking, alkoholi, betel quid chewingCao et al. (2006) ChinaAsianHealthyNasopharynxPCR-RFLP425 /501SmokingLi et al. (2007) USACaucasianHealthyOral ontelon, kurkunpään, pharynxPCR-RFLP830 /854Smoking, alcoholMajumder et al. (2007) IndiaAsianHospitalOral cavityPCR-RFLP309 /385NRYang et al. (2007) ChinaAsianHealthyNasopharynxPCR-RFLP153 /168NRHo et al. (2007) USACaucasianHospitalOral cavityPCR-RFLP138 /503NRHarth et al. (2008) GermanyCaucasianHospitalOral ontelon, kurkunpään, pharynxPCR-RFLP310 /300SmokingYen et al. (2008 ) TaiwanAsianHospitalOral cavityPCR-RFLP103 /98NRCsejtei et al. (2009) HungaryCaucasianHealthyOral ontelon, kurkunpään, pharynxPCR-RFLP108 /102SmokingKowalski et al. (2009) PolandCaucasianHealthyOral ontelon, kurkunpään, pharynxPCR-RFLP92 /124SmokingApplebaum et al. (2009) USACaucasianHealthyOral ontelon, kurkunpään, oro /hypo-pharynxPCR-RFLP483 /547SmokingJelonek et al. (2010) PolandCaucasianHealthyNRPCR-RFLP104 /252NRGugatschka et al. (2011) AustriaCaucasianHealthyNRTaqman168 /463NRLaantri et al. (2011) MoroccoAfricanNRNasopharynxTaqman512 /477NRKumar et al. ( 2012) IndiaAsianHealthyOral ontelon, kielen, kurkunpään ja pharynxPCR-RFLP278 /278Smoking, alkoholin, tupakan chewingYuan et al. (2012) ChinaAsianHealthyOral ontelon, kurkunpään, oropharynxTaqman390 /886NRAl-Hadyan et ai. (2012) Saudi ArabiaOtherHealthyNasopharynxSequence156 /251NRDos Reis et al. (2012) BrazilOtherHealthyOral cavityPCR-RFLP150 /150NRKostrzewska-Poczekaj et al. (2012) PolandCaucasianNROral ontelon, larynxPCR-RFLP290 /158NRTable 1. Tärkeimmät ominaisuudet sisältämien tutkimusten meta-analyysi.

lyhenteet: NR = ei ilmoiteta; PCR-RFLP = PCR-pohjainen restriktiofragmenttipituuspolymorfismin CSV Lataa CSV

Jakelu XRCC1 Arg194Trp, XRCC1 Arg280His, ja XRCC1 Arg399Gln polymorfismi genotyyppi taajuuksien välillä HNC tapausten ja säätimiä 29 tutkimuksissa on esitetty taulukossa 2. Selvästi , genotyyppi jakelu ohjaimissa Arg194Trp polymorfismi tutkimuksessa Demokan et al. [36] ja Arg399Gln polymorfismi tutkimuksesta Dos Reis et al. [46] poikkea HWE, jotka eivät sisälly edellä alaryhmäanalyyseissa.

Gene polymorfismi

Ensimmäisen tekijän (vuosi) B kotelot (n)

Controls (n) B P-arvo HWE kontrolleissa

XRCC1-Arg194TrpArg /ArgArg /TrpTrp /TrpArg /ArgArg /TrpTrp /TrpSturgis et al. (1999) 1802213636100.279Olshan et al. (2002) 821601352600.537Varzim et al. (2003) 80801601800.777Tae et al. (2004) 595291013950.879Matullo et al. (2005) 784095114120.391Rydzanicz et al. (2005) 1651611291400.827Gajecka et al. (2005) 2622712913310.998Kietthubthew et al. (2006) 4050167767200.664Ramachandran et al. (2006) 66377901910.999Cao et al. (2006) 23216619235217430.776Majumder et al. (2007) 2485833176280.074Yang et al. (2007) 627912996540.204Ho et al. (2007) 1082904336910.592Harth et al. (2008) 2174012593920.924Yen et al. (2008) 484015543590.643Csejtei et al. (2009) 96111851520.425Kowalski et al. (2009) 712101022200.556Applebaum et al. (2009) 4275524856130.776Gugatschka et al. (2011) 1482003976330.959Laantri et al. (2011) 4925544704110.994Kumar et al. (2012) 14411123121131260.535Dos Reis et al. (2012) 1272301232430.396XRCC1-Arg280HisArg /ArgArg /HisHis /HisArg /ArgArg /HisHis /HisCho et al. (2003) 2755522156620.442Tae et al. (2004) 1132111392900.473Ramachandran et al. (2006) 77312832610.798Majumder et al. (2007) 2257932978730.461Yang et al. (2007) 1252711313520.981Ho et al. (2007) 1251304535000.503Harth et al. (2008) 2832812703000.660Applebaum et al. (2009) 4374614925240.150Gugatschka et al. (2011) 159904303210.885Laantri et al. (2011) 431114104059290.382Kumar et al. (2012) 12912326142116200.855XRCC1- Arg399GlnArg /ArgArg /GlnGln /GlnArg /ArgArg /GlnGln /GlnSturgis et al. (1999) 947732181197460.782Olshan et al. (2002) 455036282170.412Varzim et al. (2003) 3740118080180.954Cho et al. (2003) 17412832152109210.972Tae et al. (2004) 69519866470.517Demokan et al. (2005) 4241123946130.995Matullo et al. (2005) 3438104844821280.892Rydzanicz et al. (2005) 6398215963210.825Gajecka et al. (2005) 10615334124145500.783Kietthubthew et al. (2006) 554566774230.940Ramachandran et al. (2006) 464816733340.996Cao et al. (2006) 24115232270201300.651Li et al. (2007) 3353741213603851090.929Majumder et al. (2007) 13414332170179360.523Yang et al. (2007) 93546956760.370Ho et al. (2007) 616215220216670.486Harth et al. (2008) 11416630143121360.423Csejtei et al. (2009) 504711534180.999Kowalski et al. (2009) 3744114953220.521Applebaum et al. (2009) 19222962232246690.956Jelonek et al. (2010) 47507103124250.374Gugatschka et al. (2011) 707424204198610.503Laantri et al. (2011) 27419345279163350.268Kumar et al. (2012) 1281242698144360.323Yuan et al. (2012) 22114623481339660.842Al-Hadyan et ai. (2012) 96501013599170.980Kostrzewska-Poczekaj et ai. (2012) 110154265081270.837Arg194Trp vaikuttaa smokingArg /ArgArg /TrpTrp /TrpArg /ArgArg /TrpTrp /TrpOlshan et al. (2002) 74160811600.675Rydzanicz et al. (2005) 1651611291400.827Cao et al. (2006) 15410897862140.947Csejtei et al. (2009) 96111851520.425Kowalski et al. (2009) 4917044800.835Arg399Gln vaikuttaa smokingArg /ArgArg /GlnGln /GlnArg /ArgArg /GlnGln /GlnRydzanicz et al. (2005) 6398215963210.825Cao et al. (2006) 156102218560120.953Csejtei et al. (2009) 504711534180.999Kowalski et al. (2009) 193611361600.423Table 2. jakautuminen XRCC1 genotyyppien joukossa pään ja kaulan alueen syöpä tapausten ja kontrollien mukana meta-analyysissä.

Lyhenteet: HWE = Hardy-Weinberg tasapaino. CSV Lataa CSV

Meta-analyysin tulokset

Kokonaistulokset meta-analyysi XRCC1 polymorfismin ja riski HNC on esitetty taulukossa 3.

vertailu

määrä tutkimuksia

Näytteen koko (tapaus /kontrolli) B Test yhdistymis-

Test heterogeeninen

Julkaisu bias

TAI

95% CI

P-arvo

Model

Q

P-arvo

I

2

P-arvo (Begg n) B P-arvo (Egger n) B Arg194Trp

Arg194 alleeli vs. Trp194 allele

Total224,478/6,8730.910.77-1.080.279R66.780.00068.6%0.3670.449Caucasian122,190/4,3661.040.89-1.210.652F12.280.30410.4%0.0860.108Asian81,596/1,8450.760.55-1.050.095R50.480.00086.1%0.0190.001OC6915/1,4120.740.55-1.010.054R13.990.01664.3%0.4520.573Smoking5717/5481.190.94-1.520.155F4.830.30517.2%0.2210.219Publication year41147/14031.110.93-1.340.251F5.950.11449.6%1.0000.890PCR-RFLP183566/46590.920.77-1.090.332R49.240.00065.5%0.8200.176Taqman3801/20691.210.63-2.350.768R7.650.02273.9%0.2960.221

Arg/Arg vs. Trp/Trp

Total224,478/6,8730.800.50-1.280.349R33.770.01346.7%0.9440.245Caucasian122,190/4,3661.040.45-2.400.920F2.950.9370.0%0.1180.125Asian81,596/1,8450.700.37-1.350.294R27.710.00074.7%0.0350.046OC6915/1,4120.710.44-1.130.145F8.400.13640.4%1.0000.715Smoking5717/5482.531.16-5.530.020F1.380.5020.0%0.2960.346Publication year41147/14031.330.77-2.280.308F3.550.31415.5%0.3080.908PCR-RFLP183566/46590.900.54-1.500.684R27.700.01649.5%0.6210.334Taqman3801/20690.590.16-2.220.439F1.550.4610.0%1.0000.525

Arg/Arg vs.Arg /Trp + Trp/Trp

Total224,478/6,8730.900.75-1.080.225R61.790.00066.0%0.6930.450Caucasian122,190/4,3661.030.88-1.210.711F13.220.27916.8%0.0860.112Asian81,596/1,8450.720.50-1.060.094R45.550.00084.6%0.0190.003OC6915/1,4120.700.52-0.950.022R10.660.05953.1%1.0000.483Smoking6842/7051.570.68-3.640.289R44.810.00088.8%0.4520.948Publication year41147/14031.130.91-1.400.283F5.530.13745.7%0.7340.852PCR-RFLP183566/46590.900.75-1.100.305R44.930.00062.2%0.9400.156Taqman3801/20691.220.63-2.330.704R6.880.03270.9%0.2960.169Arg280His

Arg280 alleeli vs. His280 allele

Total112,972/3,7140.980.87-1.100.757F9.870.4520.0%0.2760.153Caucasian41,102/1,8041.120.86-1.450.411F0.420.9370.0%0.7340.508Asian61,315/1,3940.970.83-1.130.696F8.000.15637.5%0.4520.550OC3555/1,0000.860.67-1.100.241F0.590.7460.0%1.0000.749Publication year31001/12470.890.75-1.070.220F1.480.4770.0%0.2960.097PCR-RFLP82114/25770.990.87-1.140.922F8.480.29217.4%0.7110.413Taqman2723/9690.940.73-1.200.617F1.210.27217.2%1.000

Arg/Arg vs.His/His

Total112,972/3,7140.840.55-1.290.427F3.730.9280.0%0.7210.638Caucasian41,102/1,8041.560.38-6.410.536F1.420.4920.0%1.0000.276Asian61,315/1,3940.740.44-1.240.250F1.440.9200.0%0.7070.826OC3555/1,0000.650.17-2.440.521F0.110.7410.0%1.000Publication year31001/12470.780.47-1.300.342F0.360.8360.0%1.0000.559PCR-RFLP82114/25770.830.50-1.370.463F3.130.7920.0%1.0000.404Taqman2723/9690.970.40-2.320.943F0.010.9300.0%1.000

Arg/Arg vs. Arg /His + His/His

Total112,972/3,7140.990.87-1.130.872F9.950.4450.0%0.2760.205Caucasian41,102/1,8041.100.84-1.440.483F0.340.9520.0%0.3080.258Asian61,315/1,3940.990.83-1.180.913F8.260.14239.5%0.4520.680OC3555/1,0000.850.65-1.120.247F0.610.7360.0%1.0000.746Publication year31001/12470.880.72-1.090.252F1.380.5020.0%1.0000.200PCR-RFLP82114/25771.010.86-1.170.938F8.410.29816.8%0.5360.596Taqman2723/9690.920.70-1.210.565F1.160.28213.7%1.000Arg399Gln

Arg399 alleeli vs. Gln399 allele

Total276,466/9,3791.010.94-1.090.850R50.970.00249.0%0.5320.529Caucasian142,639/4,7681.000.93-1.080.965F14.090.3687.7%0.5110.324Asian92,234/2,9311.010.84-1.210.931R30.420.00073.7%0.4660.425OC4663/1,1620.910.59-1.400.674R22.410.00086.6%1.0000.685Smoking4635/4540.700.43-1.150.158R18.190.00083.5%0.0890.042Publication year71898/27651.120.96-1.290.149R14.080.02957.4%0.7640.276PCR-RFLP215029/60511.020.93-1.110.737R44.770.00155.3%0.5660.558Taqman41152/29200.960.85-1.080.478F3.730.29219.6%1.0000.762Sequence2285/4081.080.85-1.390.519F1.560.21235.8%1.000

Arg/Arg vs.Gln/Gln

Total276,466/9,3791.030.88-1.200.714R43.000.01939.5%0.2600.330Caucasian142,639/4,7681.080.92-1.280.348F16.570.21921.6%0.3240.157Asian92,234/2,9310.970.65-1.440.874R22.860.00465.0%0.4660.478OC4663/1,1620.910.38-2.200.838R15.870.00181.1%0.8060.692Smoking4635/4540.730.33-1.630.445R7.490.05860.0%0.0890.002Publication year71898/27651.280.93-1.750.129R11.320.07947.0%0.2300.314PCR-RFLP215029/60511.060.87-1.300.534R39.180.00649.0%0.1560.290Taqman41152/29200.950.73-1.240.709F2.580.4600.0%0.7340.974Sequence2285/4080.940.50-1.770.843F0.960.3280.0%1.000

Arg/Arg vs. Arg /Gin +Gln/Gln

Total276,466/9,3790.990.90-1.090.869R46.670.00844.3%0.6770.721Caucasian142,639/4,7680.940.85-1.040.233F14.540.33710.6%0.3810.380Asian92,234/2,9311.040.85-1.280.687R23.770.00366.3%0.9170.472OC4663/1,1620.880.55-1.420.612R15.800.00181.0%1.0000.657Smoking71,039/7460.730.45-1.190.206R35.560.00083.1%0.2300.038Publication year71898/27651.130.94-1.360.199R12.650.04952.6%0.7640.225PCR-RFLP215029/60510.990.89-1.120.928R40.730.00450.9%0.8330.795Taqman41152/29200.940.81-1.090.412F2.950.4000.0%0.7340.734Sequence2285/4081.170.86-1.590.308F1.370.24227.1%1.000Table 3. Tulokset meta-analyysi XRCC1 polymorfismin ja riski HNC.

Lyhenteet: CI, luottamusväli; OR, odds ratio; OC, suun syöpä; R: random-vaikutus mallia; F: kiinteiden vaikutusten mallia. CSV Lataa CSV

XRCC1 Arg194Trp polymorfismin vaikutus HNC riski koko väestöstä.

yhteensä 22 tutkimukset, mukaan lukien 4487 tapaukset ja 6873 tarkastukset, tutkimalla yhdistyksen välillä XRCC1 Arg194Trp polymorfismin ja HNC riski tarkistettiin. Siellä oli merkittävä ero taajuus XRCC1 Arg194Trp polymorfismin välillä valkoihoisten ja aasialaiset (34,42% vs. 12,27%, P 0,001). Yhdistetty Syrjäisimpien alueiden koko väestön osoittaneet todisteita Merkitsevä yhteys varianttia genotyyppejä XRCC1 Arg194Trp ja riski HNC tahansa geneettistä mallia. Merkittävää heterogeenisuus havaittiin kaikissa geneettisten mallien. Metsä juoni on esitetty kuviossa 2.

XRCC1 Arg194Trp polymorfismin vaikutus HNC riski tietyssä populaation.

ositettu analyysia etnisyys suoritettiin, jotta voidaan määrittää lähde heterogeenisuus tutkimuksissa. Mitään merkittäviä yhdistys HNC riskin XRCC1 Arg194Trp polymorfismi havaittiin aasialaiset ja valkoihoiset missään geneettinen malli (kuviot S1-S2). Merkittävät erot-tutkimuksessa erilaisuuteen löytyivät aasialaiset, mutta niitä ei löydy valkoihoisilla.

Suun syöpä (OC) on yleisin muoto HNC ja se on vastuussa yli 90% pään ja kaulan syöpien [56]. Näin ollen suoritimme kerrostunut analyysin tutkia suhdetta XRCC1 Arg194Trp polymorfismin ja OC alttius. Kuusi tutkimukset, mukaan lukien 915 tapausta ja 1412 tarkastuksia, arvioidaan yhdistyksen välillä OC riskin ja XRCC1 variantti genotyypit mukana (taulukko 1). Mitään merkittävää assosiaatiota XRCC1 Arg194Trp polymorfismi ja riski OC havaittiin alleeliset geneettinen malli ja homotsygootti Vertailun mutta merkittävä yhdistys oli löytynyt väistyvä malli (kuva S3). Tutkimusten välisten erilaisuuteen havaittiin alleeliset geneettinen malli ja väistyvä malli, mutta se ei todettu olevan merkittäviä homotsygoottisia verrattuna.

Useat tutkimukset ovat osoittaneet, että vuorovaikutus XRCC1 polymorfismin ja ympäristömyrkyt voivat vaikuttaa riskin HNC. Ottaen huomioon, että tupakointi on tärkeä näkökohta ympäristömyrkkyjä, suoritimme alaryhmäanalyysi kuusi osoittavien vaikutuksen, että vuorovaikutus tupakansavun kanssa XRCC1 polymorfia on päällä HNC riski. Oli merkittävä assosiaatio yhteisvaikutus tupakoinnin XRCC1 Arg194Trp polymorfia ja riski HNC alle homozygoottisia vertailu (kuva 3). Mitään merkittävää yhdistys havaittu alleeliset geneettinen malli ja väistyvä malli (kuva 3). Heterogeenisuus tutkimuksissa ei ollut merkittävää missään geneettistä mallia, paitsi väistyvä malli.

Flores-Obando et al. suoritettiin samanlainen meta-analyysi, joka sisältyi tutkimuksia on julkaistu ennen 2010. Koska ristiriitaisia ​​tuloksia kahden tutkimuksessa, päätimme tehdä kerrostunut analyysi mukaan lukien julkaistut tutkimukset vuoden 2010 jälkeen tulos ei ollut merkittävää yhdistyksen havaittu välillä Arg194Trp polymorfismin ja HNC riski tahansa geneettinen malli (kuva S4). Tutkimusten välisten heterogeenisyys ei ollut merkittävää tässä kerrostunut analyysissä.

Eri genotyypitysmenetelmiä käytetään kirjallisuudessa voi aiheuttaa erilaisia ​​-genotyypitystulosten. Siksi teimme alaryhmäanalyysi genotyypitysmenetelmiä tutkia suhdetta Arg194Trp ja HNC alttius. Kumpikaan PCR-RFLP alaryhmä eikä TaqMan alaryhmä havaittu mitään merkittävää yhdistyksen analyysit kaikki geneettiset mallit (kuviot S5-S6). Lisäksi heterogeenisuus tutkimuksissa havaittiin kaksi kerrostunut analyysit kaikissa geneettinen mallit, lukuun ottamatta homotsygootti vertailun TaqMan alaryhmä.

XRCC1 Arg280His polymorfismin vaikutus HNC riski koko väestöstä.

yksitoista tutkimukset, mukaan lukien 2972 ​​tapaukset ja 3714 tarkastukset, suhdetta tarkasteltaessa XRCC1 Arg280His polymorfismin ja HNC riski tarkistettiin. Siellä oli merkittävä ero taajuus XRCC1 Arg280His polymorfismin välillä valkoihoisten ja aasialaiset (25,75% vs. 9,04%, P 0,001). Ei ollut merkittävää yhdistyksen HNC riskiä variantti genotyypit XRCC1 Arg280His tahansa geneettistä mallia. Merkittävät Tutkimusten välisten heterogeenisuus oli poissa kaikissa geneettisten mallien. Metsä juoni on esitetty kuvassa 4.

XRCC1 Arg280His polymorfismin vaikutus HNC riski tietyissä populaatiossa.

Olemme suorittaneet alaryhmäanalyyseissa etnisyys, kasvainpaikkaa, julkaisuvuosi, ja genotyypitys menetelmä arvioida suhdetta XRCC1 Arg280His variantin genotyyppien ja riski NHC. Kuitenkaan mitään merkittävää yhteyttä ei havaittu missään alaryhmä eri geneettisiä malleja, ja ei ollut merkittävää heterogeenisuus tutkimuksissa millään ositettu analyysi (kuviot S7-S12). Vain yksi tutkimuksessa arvioitiin vaikutuksesta vuorovaikutuksen tupakoinnin ja Arg280His polymorfismin vaikutus HNC riski; kuitenkin, emme voi enää tehdä kerrostunut analyysi kyseisen tutkimuksen.

XRCC1 Arg399Gln polymorfismin vaikutus HNC riski koko väestöstä.

Oli 27 tutkimukset, mukaan lukien 6466 tapaukset ja 9379 tarkastuksia, jotka tutki yhdistyksen välillä HNC alttius ja XRCC1 Arg399Gln polymorfismi. Siellä oli merkittävä ero taajuus XRCC1 Arg399Gln polymorfismin välillä valkoihoisten ja aasialaiset (41.28% vs. 44,65%, P = 0,004). Kaiken yhdistyksen välillä variantin genotyypin XRCC1 Arg399Gln polymorfismin ja HNC alttius ollut merkittävä alla alleeliset geneettinen malli, homotsygootti vertailun, ja väistyvä malli. Tutkimusten välisten heterogeenisuus havaittiin kaikissa geneettisten mallien. Metsä juoni on esitetty kuviossa 5.

XRCC1 Arg399Gln polymorfismin vaikutus HNC riski tietyssä populaation.

alaryhmäanalyysi etnisyys, mitään merkittävää yhdistyksen välillä XRCC1 Arg399Gln polymorfismia HNC riski havaittiin aasialaisilla (kuva S13) ja valkoihoisten (kuva S14). Heterogeenisuus tutkimuksissa ei ollut merkittävää valkoihoisilla; kuitenkin merkittävä heterogeenisyys havaittiin aasialaisilla kaikissa geneettinen malleissa.

neljä tutkimukset, mukaan lukien 663 tapausta ja 1162 tarkastukset, tehtiin OC väestö, ja ei ollut merkittävää yhdistyksen välillä XRCC1 Arg399Gln polymorfismin ja HNC alttius (kuva S15). Tutkimusten välisten heterogeenisuus havaittiin kaikissa geneettinen malleissa.

kerrostunut analyysi tupakoinnin alleeliset geneettinen malli ja homotsygootti vertailun, neljä tutkimusta olivat mukana ja mitään merkittävää yhdistyksen havaittiin (kuva S16). Seitsemän tutkimukset yhdistettiin resessiivinen mallissa. Kuitenkin emme onnistuneet saa merkittävää yhdistyksen välillä HNC riskin ja Arg399Gln genotyyppi (kuva S16). Heterogeenisuus tutkimuksissa havaittiin kaikissa geneettinen malleissa.

kerrostunut analyysi julkaisuvuoden kirjallisuuden julkaistuja 2010-2012, merkittävä heterogeenisyys havaittiin kaikissa geneettisten mallien. Lisäksi olemme löytäneet yhdistyksen välillä Arg399Gln ja HNC riski missään geneettinen malli (kuva S17).

Alaryhmäanalyysissä genotyyppitestien menetelmän, PCR-RFLP, TaqMan, ja sekvenssianalyysillä käytettiin kirjallisuudessa genotyypin XRCC1 Arg399Gln polymorfismi. Tulokset osoittivat merkittävää yhdistyksen välillä Arg399Gln ja HNC riskiä missään kerrostunut analyysin eri geneettinen mallit (kuviot S18-S20).

Julkaisu bias

Sekä Begg testi ja Egger testi tehtiin arvioimiseksi julkaisemisen bias kirjallisuudessa. Visuaalinen analyysi suppilon tontteja ei ole ilmennyt näyttöä ilmeinen epäsymmetrian tahansa geneettistä mallia yleisessä meta-analyysit XRCC1 Arg194Trp, Arg280His, ja Arg399Gln (kuviot 6-8). Kuitenkin selvää näyttöä julkaisun bias paljastui XRCC1 Arg194Trp Aasian ryhmä kaikissa geneettinen malleissa. Vuonna XRCC1 Arg399Gln tupakointi kerrostunut analyysin potentiaali julkaisu bias ei paljastunut Begg testissä missään geneettistä mallia, mutta se esiteltiin Egger testi. Kumpikaan Begg testi eikä Egger testi havainnut selvää näyttöä julkaisu puolueellisuudesta muissa ositettu analyyseja kaikki geneettiset mallit (taulukko 3).

Keskustelu

DNA korjausmekanismit on ratkaiseva rooli suojelussa solujen DNA-vaurioita ja ylläpidossa genomisen koskemattomuuden. Proteiini, jota koodaa XRCC1 geeni on rakennustelineet proteiini, joka assosioituu DNA-ligaasi-I, DNA-ligaasi-III, polynukleotidikinaasia (PNK), DNA-polymeraasi β, ja poly-polymeraasia, jotka ovat osia DNA: n korjaukseen järjestelmään. Vuorovaikutus XRCC1 DNA-ligaasilla III voisi lisätä endosellulaariset vakautta ligaasia. Yhteinen vaikutukset XRCC1 ja PNK stimuloivat 5′-kinaasi ja 3′-phospatase toimintaa. Kaikki nämä olosuhteet edistävät korjaus DNA. Siksi sekvenssi vaihtelu XRCC1 geeni ehdotetaan muuttamaan syövän alttiudesta. Yleisin variantti genotyyppien XRCC1, kuten Arg194Trp, Arg399Gln, ja Arg280His geenejä, on kuvattu ja monet tutkimukset ovat tutkineet geneettinen vaikutus XRCC1 Arg194Trp, Arg280His, ja Arg399Gln polymorfismit on HNC herkkyyden kanssa ristiriitaisia ​​tuloksia. Tämä moninaisuus motivoi nykyistä päivitetty meta-analyysi, jotka voivat auttaa meitä tutkimaan vankempi arvio vaikutuksesta XRCC1 polymorfismin vaikutus riskin HNC. Esillä olevassa meta-analyysi 6719 tapauksia ja 9627 tarkastukset, ei saatu näyttöä Merkitsevä yhteys HNC alttius ja mitä tahansa XRCC1 variantin genotyypin havaittiin.

edellinen meta-analyysi, joka toteutettiin vuonna 2010 Flores- Obando et al., arvioi suhde XRCC1 polymorfismien ja riski HNC Yhteensä 15 julkaisuissa, kuten 2330 tapauksissa ja 3834 säätimet Arg194Trp, neljä julkaisua lukien 879 tapausta ja 926 säätimet Arg280His, ja 15 tutkimuksiin 3582 tapauksissa ja 5347 säätimet Arg399Gln polymorfismi. Päivitimme tämä meta-analyysi lisäämällä otoskoot. Kaikkiaan 22 tutkimuksista, mukaan lukien 4487 tapaukset ja 6873 tarkastuksia, arvioi assosiaatio XRCC1 Arg194Trp geenin ja HNC riski; 11 tutkimukset, mukaan lukien 2972 ​​tapaukset ja 3714 tarkastuksia, arvioi yhdistyksen välillä Arg280His ja HNC riski; ja 27 tutkimukset, mukaan lukien 6466 tapaukset ja 9379 tarkastuksia, arvioi yhdistyksen välillä Arg399Gln polymorfismin ja HNC riski. On joitakin eroja Flores-Obando et al. meta-analyysi ja meidän. Marginaalinen assosiaatio XRCC1 Arg399Gln polymorfismin ja HNC riski havaittiin alle resessiivinen geneettinen malli valkoihoiset meta-analyysin mukaan Flores-Obando et al., Mutta sitä ei löydy meidän. Nämä erilaiset tulokset voivat yleensä johtua eroista tutkimuksissa mukana meta-analyysissä. Nenänielun karsinooma (NPC) on yksi tyyppi HNC, joka on silmiinpistävä maantieteellinen ja etninen jakauma, erityisen korkea havaittu keskuudessa aasialaiset. Kirjallisuudessa on NPC ei sisälly Flores-Obando et al. tutkia, mutta se sisältyi meidän. Edellä mainittujen kerrostunut analyysitulos, seitsemän artikkelia jakoi Flores-Obando et al. tutkia ja Tutkimuksessamme ja tutkimuksemme mukana ylimääräisen seitsemän artikkeleita, kuten äskettäin julkaistun kirjallisuuden ja NPC kirjallisuutta. Tulokset näistä seitsemästä tutkimusten osuus on 54,94% paino (kuvio 9), mikä aiheutti ristiriita näiden kahden meta-analyysit. Arvioitaessa vaikutuksen XRCC1 Arg194Trp variantti genotyypit on HNC alttius, meta- tai suoritti Flores-Obando et al. löytyi merkittävä assosiaatio Arg194Trp variantin ja HNC riski homotsygootti vertailua koko väestöstä ja Aasian ryhmään, jota ei havaittu omassa meta-analyysi. Samoin Tutkimuksessamme ylimääräinen yhdeksässä tutkimuksessa ja neljässä tutkimuksessa koostuu äskettäin julkaissut tutkimuksen ja NPC tutkimusten mukaan yleiseen väestöryhmään ja Aasian ryhmä, vastaavasti. Tulokset näistä lisätutkimuksista osuus 53.46% ja 53.79% paino (kuviot 10-11), vastaavasti. Kontrollien tekemän tutkimuksen Demokan et al., Genotyyppi jakelu Arg194Trp poikkesi HWE, josta jätettiin pois meidän analyysi Arg194Trp polymorfismi; kuitenkin, se sisällytettiin Flores-Obando et al. artikla. Lisäksi sekä tutkimuksemme ja Flores-Obando et al. Tutkimuksessa oli mukana kaksi tutkimukset Majumder et al. Majumder ym. Viimeisin julkaisu oli mukana Tutkimuksessamme mutta Majumder ym.: N tutkimus julkaistiin vuonna 2005 sisältyi Flores-Obando et al. meta-analyysi. Nämä tekijät johtavat eri päätelmään. Monia muita suhteita ei kuvattu Flores-Obando et al. artikla. Lisäksi olemme suorittaa joitakin riippumattomia ja alkuperäinen alaryhmäanalyyseissa. Alaryhmäanalyysi tupakoinnin ei suoritettu vuonna Flores-Obando tutkimuksessa, mutta se sisällytettiin tähän meta-analyysiin. Olemme myös suoritettu kerrostunut analyysit genotyypitysmenetelmiä ja julkaisu vuosi, ja kaikki tulokset eivät paljastaneet yhdistyksen välillä XRCC1 polymorfismin ja syöpäriskiä. Siksi meidän meta-analyysi on voimakkaampi todisteita selventää yhdistyksille.

Suhde HNC alttius ja variantti genotyypin XRCC1 saattaa vaikuttaa tuumorikohdat. Niinpä me esiintyi myös kerrostunut analyysi suusyövän ryhmä.

PRISMA tarkistuslista.