Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

MikroRNA (miRNA) säädellä negatiivisesti geeniekspressiota ja toimivat tuumorisuppressoreita tai onkogeenien kasvaimen synnyssä. Yhdistyksen välillä yhden nukleotidin polymorfismin (SNP) in miR-196a2 rs11614913 ja herkkyydestä ruoansulatuskanavan syöpien oli epäjohdonmukainen aiemmissa tutkimuksissa.

Menetelmät /Principal Havainnot

Päivitetty meta-analyysi perustuu 15 itsenäistä tapausverrokkitutkimukset koostuu 4999 syöpäpotilaiden ja 7606 tarkastukset suoritettiin käsittelemään tätä -alueella. Todettiin, että miR-196a2 polymorfismi merkittävästi kohonnut riskejä ruoansulatuskanavan syöpien (CT vs. TT, OR = 1,25, 95% CI = 1,07-1,45; CC vs. TT, OR = 1,38, 95% CI = 1,13-1,67 ; CC /CT vs. TT, OR = 1,29, 95% CI = 1,10-1,50; CC vs. CT /TT, OR = 1,14, 95% CI = 1,01-1,30; C vs. T, OR = 1,15, 95% CI = 1,05-1,26). Olemme myös havainneet, että muunnos miR-196a2 lisäsi alttiutta peräsuolen syöpä (CRC) (CT vs. TT, OR = 1,23, 95% CI = 1,04-1,44; CC vs. TT, OR = 1,32, 95% CI = 1,08 -1,61; CC /CT vs. TT, OR = 1,25, 95% CI = 1,07-1,46; C vs. T, OR = 1,15, 95% CI = 1,05-1,28), kun taas yhdistys väistyvä malli (CC vs. CT /TT, OR = 1,16, 95% CI = 0,98-1,38) osoittivat marginaalinen merkitys. Lisäksi merkitsevästi yhteydessä miR-196a2 polymorfismi ja kohonnut hepatosellulaarinen syöpä (HCC) havaittiin. By ositella kasvaimia perusteella syntypaikalla, lähde hallintalaitteiden, etnisyyden ja alleelin taajuus valvonta, kohonnut syöpäriski havaittiin.

Päätelmä /merkitys

Tulosten perusteella näyttää merkittävä yhdistyksen välillä miR-196a2 polymorfismi ja lisääntynyt alttius ruoansulatuskanavan syöpien, erityisesti CRC, HCC ja aasialaiset. Lisäksi C-alleelin voivat osaltaan lisätä ruoansulatuskanavan syöpäriski.

Citation: Guo J, Jin M, Zhang M, Chen K (2012) geneettinen Variant in miR-196a2 Lisääntynyt Ruuansulatuskanavan syöpäriski: meta analyysi 15 Case-Control Studies. PLoS ONE 7 (1): e30585. doi: 10,1371 /journal.pone.0030585

Editor: Brock C. Christensen, Dartmouth College, Yhdysvallat

vastaanotettu: 19 lokakuu 2011; Hyväksytty: 22 joulukuu 2011; Julkaistu: 24 tammikuu 2012

Copyright: © 2012 Guo et ai. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus tukivat National Natural Science Foundation of China (nro 81072356). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

MikroRNA (miRNA) ovat endogeenisiä, pienet ei-koodaus ja pituus on 18-25 nukleotidin RNA: iden. miRNA olla vuorovaikutuksessa RNA: iden (mRNA: t) sitoutumalla 3 ’un-luetut alueet (UTR) ja johtaa hajoamisen tai translaation tukahduttamisesta mRNA: iden. Tutkimukset paljastivat, että miRNA olleet avainasemassa erilaisissa biologisissa prosesseissa kuten solun kasvun säätelyssä, erilaistuminen, apoptoosi ja kasvaimen kehittymisen [1], [2], [3]. miRNA säädellä noin 30% ihmisen geenien ja näytteille merkittävä panos karsinogeneesi [2], [4]. Poikkeava modulaatio erityisiä miRNA katsottiin olevan ratkaiseva tapahtuma erilaisia ​​sairauksia, mukaan lukien syöpiä, [5], vaikka yksityiskohtainen prosessi miRNA ilmaisun ja mutaatio on yhä epäselvä. Lisäksi joissakin tutkimuksissa havaittiin, että miRNA osallistui etiologiassa, etenemisen ja ennusteen syöpien, kuten ei-pienisoluinen keuhkosyöpä [6] ja maksasyövän [7]. Useita mahdollisia mekanismeja, kuten geneettiset ja epigeneettiset alternations, on ehdotettu. SNP miRNA on merkitty uusia geneettisiä variaatioita, jotka voivat muuttaa syövän alttiuden [8]. Geneettinen muunnos miR-196a2 oli osoitettu olevan yhteydessä joidenkin syöpäriski, mutta erilaiset tutkimukset osoittivat ristiriitaisia ​​yhdistyksiä. Meta-analyysi rintasyöpä, keuhkosyöpä ja muita syöpiä osoitti, että rs11614913 oli toimiva SNP ja piti kyvystä muuttaa syöpäriskien [9], [10], [11], [12], [13].

Kuten tiedämme, edellä viitattu meta-analyysiin sisältyi mahasyövän (GC), HCC ja muut ruoansulatuskanavan syöpien varten SNP miR-196a2. Kuitenkin rajoittamisesta riittämätön julkaisuja, he eivät laske yhdistettyä syrjäisimmille alueille ruoansulatuskanavan syöpien kattavasti. Tehostaa meta-analyysi ruoansulatus syöpien ja vähentää mahdollisia Tutkimusten välisten heterogeenisuus, joka voi johtua eri syöpiä erilaisissa järjestelmissä, keskityimme ruoansulatuskanavan syöpiin vain ja lisätään uudempaa julkaisut CRC [14], [15] , [16] ja HCC [17] tässä tutkimuksessa. Olemme myös yhteyttä kirjoittajat pyytääkseen genotyypin taajuuksilla noin suuontelon levyepiteelikarsinooma syöpä (OSCC) ja nielu levyepiteelin syöpä (PSCC) [18], [19], joita ei ole esitetty julkaistuja artikkeleita. Lisäksi julkaisemattomassa tapauskontrollitutkimuksessa CRC joka suoritettiin Mingwu Zhang et al Molecular Epidemiology Laboratory Zhejiangin yliopistossa School of Medicine kerättiin. Kaiken kaikkiaan 9 aineistoja 7 tutkimuksista (mukaan lukien 2875 tapauksissa ruoansulatuskanavan syöpiä ja 5556 tarkastukset), joita ei ole tutkittu edellisessä meta-analyysi oli lisäksi mukana tutkimuksessamme. Ja suoritimme tämä meta-analyysi keskittyy seuraaviin kysymyksiin: (a) Mikä on assosiaatio miR-196a2 polymorfismi ja alttius ruoansulatuskanavan syöpien, erityisesti kolorektaalisyövän? (B) Onko muutoksia tuumorikohdat, demografiset ominaisuudet ja muut tekijät muuttamaan tämän yhdistyksen merkittävästi?

Materiaalit ja menetelmät

tunnistetiedot voivat tutkimusten

järjestelmällinen haku PubMed oli suoritettiin käyttäen haettaessa kyselyä muotoilua ”(microRNA 196a2 OR rs11614913) polymorfismit syöpä” (viimeinen etsiä päivitetty 20 elokuu 2011). Olemme myös etsitään viittauksia julkaissut artikkeleita ja arvosteluja tästä aiheesta PubMed. Hyväksyttävät tutkimukset valittiin seuraavien yksiselitteiset valintakriteerit: (a) Tutkimus suunniteltiin käyttäen metodologiaa, joka tapauskontrollitutkimuksessa. (B) välinen yhteys miR-196a2 polymorfismi ja ruoansulatuskanavan syöpäriski tutkittiin. (C) oli riittävästi tietoja laskennan kertoimet suhteet ja vastaavat 95% luottamusväli (syrjäisimmille alueille, 95% CI). (D) tapaukset, joissa karsinoomia diagnosoitiin histopatologisesti. Lisäksi olemme myös yhteyttä jotkut tutkijat pyytää julkaisemattomassa tutkimuksessa tuloksista sekä yksityiskohtainen aineistot Yhdistettyjä laskenta (kuvio 1).

Data louhinta

Kaksi tutkijat (Guo ja Jin) seulotaan otsikot, tiivistelmiä ja kokoteksteihin itsenäisesti käyttäen standardoitua seulonta oppaan. Tiedon louhinta suoritettiin itsenäisesti jälkeen salaaminen tekijöiden, lehtiä, tukiorganisaatioiden ja varoja välttää tutkijoiden bias. Kun tietoja abstraktio, ristiriitaisuuksia ja eroja ratkaistaan ​​yhteisymmärryksessä ja keskustelua.

Ominaisuudet otetuista tutkimuksista oli osoitettu jäsennellysti (taulukko 1), mukaan lukien ensimmäisen tekijän nimi, julkaisemiseen, tutkimus maista peräisin etnisyys, syöpä tyyppi, lähde valvonta, genotyypitysmenetelmää, Hyväksytty kriteerit tapausten ja kontrollien välillä, otoskoko, C-alleelin taajuus valvonta (taulukko S1), genotyyppi toistojaon laatupisteet.

Methodological laadun arviointi

kolme arvioijat (Guo, Jin ja Zhang) arvioitu riippumattomasti laatua valittujen tutkimusten pisteytys mukaan ennalta määrättyjä kriteerejä (taulukko S2), joka uutettiin ja muutettu aiemmista tutkimuksista [20], [21], [ ,,,0],22]. Laatupisteet vaihteli 0-10 ja tutkimuksissa suurempi tulos esitettiin parempaa laatua. Erimielisyydet ratkaistiin keskustelemalla.

Tilastollinen

Raakaöljy syrjäisimpien ja vastaavat 95% CI laskettiin tutkia yhdistyksen vahvuus välillä miR-196a2 polymorfismi ja herkkyydestä ruoansulatuskanavan syöpiin. Yhdistettiin syrjäisimmät alueet saatiin yhdistelmä yhden tutkimukset heterotsygoottianalyysin verrattuna (CT vs. TT), homotsygoottinen vertailu (CC vs. TT), hallitseva ja väistyvä malleja (CC /CT vs. TT, CC vs. CT /TT), alleelinen vertailu (C vs. T) vastaavasti. Käytimme chi-neliö-pohjainen Q-testi [23] ja I

2 indeksi [24] ja tarkista, heterogeenisuus eri tutkimuksissa. Kun Q-testi osoitti, että huomattava heterogeenisuus (P-arvo on alle 0,10 ja /tai I

2-indeksi yli 50%,), käytimme random-vaikutusten malli (Dersimonian ja Laird menetelmä) [25]; muuten kiinteiden vaikutusten malli (Mantel ja Haenszel menetelmä) suoritettiin [26].

jaottelu tuumoripaikkaan, lähde hallintalaitteiden, etnisyyden ja alleelin taajuus tarkastuksia tehtiin. Kaikki syövät luokiteltiin kahteen ryhmään: ruoansulatuskanavan syöpään ja ruoansulatuskanavan rauhanen syöpä. Hyväksyttävät tutkimukset luokiteltiin väestöpohjainen ja sairaala-pohjainen mukaan ohjauslaite. Tutkittavat luokiteltiin etnisyys osaksi valkoihoinen ryhmä ja Aasian ryhmä. Olemme myös luokiteltu valittuun tutkimuksia C T (C-alleelin frekvenssi yli T-alleelin frekvenssi) ryhmä ja C≤T (C-alleelin frekvenssi on alle tai vastaava T-alleelin frekvenssi) ryhmän alleelifrekvensseiltään kontrolleissa.

Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) valvonta väestö tuomaroi chi-neliö testi. P-arvo alle 0,05 pidettiin tilassa epätasapainoa. Julkaisu bias oli diagnosoitu Egger n regressioanalyysin menetelmä [27], [28] ja suppilo juoni. P-arvo on alle 0,05 Egger n lineaarinen regressio osoitti, että läsnä mahdollisten julkaisun harhaa. Keskivirhe logaritmi OR piirrettiin sen OR sisään suppilo juoni. Begg n suppilo juoni oli myös piirretty havaita julkaisun bias ja vaikutus yksittäisten tutkimus yhdistettiin OR. Log OR oli piirrettävä keskivirhe Log OR kunkin mukana tutkimuksessa Begg n suppiloon juoni [29]. Ja epäsymmetrinen tai epätäydellinen suppilomainen tonttien osoitti julkaisu bias myös. Vuonna yksisuuntainen herkkyysanalyysi, me sulkea yhden tutkimuksen joka kerta, ja uudet yhdistettyä tulokset voivat heijastaa vaikutusta, että poistetut tutkimuksen yleistä tiivistelmän OR.

frekvenssijakaumat C-alleelin aasialaisilla ja valkoihoiset verrattiin käyttäen chi-neliö testi. Kaikki tilastollinen analyysi toteutettiin SAS 9.2 ohjelmisto (SAS Institute Inc., Cary, NC, USA), STATA 11,0 (STATA Corp, College Station, Texas) ja RevMan 5,1 (https://ims.cochrane.org/revman/download ). Kaikki P-arvot olivat kaksipuolisia.

Tulokset

Tutkimukset ominaisuudet

13 voivat tutkimusten mukaan lukien 12 julkaistuja tutkimuksia [14], [15], [16], [ ,,,0],17], [18], [19], [30], [31], [32], [33], [34], [35] ja 1 julkaisemattomia yksi kerättiin tässä meta-analyysin mukaan mukaanottokriteereihin . Ominaisuudet näistä tutkimuksista on esitetty taulukossa 1 ja genotyyppi frekvenssijakaumaa oli esitetty taulukossa S1.

joukossa tutkimuksia pään ja kaulan okasolusyöpä (HNSCC, johon kuului suullinen, nielun ja kurkunpään syöpiä) [18] , [19], kurkunpään syöpä hengityselimiä ei käytetty. Mietimme potilaiden suun kautta syöpä ja nielun syöpä erillisinä ryhmiä ja yhdistetään ne kvantitatiivisen analyysin itsenäisesti. Siksi tämä meta-analyysi tuotto 15 erillistä tapausverrokkitutkimukset, mukaan lukien 4999 tapaukset ja 7606 tarkastuksia, että polymorfismi miR-196a2.

12 tutkimuksia Hyväksytty iän, sukupuolen ja /tai asuinpaikka, tupakointi, alkoholin kulutus [14], [15], [16], [17], [18], [19], [32], [34], [35]; 9 tutkimuksissa kerätyt aasialaiset kuten aiheita ja toinen 6 tutkittu valkoihoiset; C-alleelin tarkastusten tiheys oli vähäinen alleelin taajuus (MAF) 7 tutkimuksissa ja T-alleelin frekvenssi oli MAF on 8 tutkimuksissa säilyi; valvontaa 10 tutkimukset sairaala-pohjainen ja valvonnan muut tutkimukset olivat väestöpohjainen; 11 tutkimuksissa on kuvattu ruoansulatuskanavan syöpien ja 4 tutkimuksia keskittyi kasvaimia ruoansulatus rauhaset. Laimentaa mahdollisia sekoittavia harhaa HBV-infektion tutkimuksessa Qi et al [33], pidimme HBV potilaat ilman HCC verrokkeina ja HBV potilaalla on HCC kuin tapauksissa.

genotyypit kaikissa tutkimuksissa havaittiin geneettisen DNA verinäytteestä 4 genotyypitysmenetelmiä kokonaan. 13 ulos 15 tutkimukset tarkastetaan genotyyppien laadunvalvontaan. Genotyyppi jakautuminen valvonnan kaikissa tutkimuksissa oli yhdenmukainen HWE, paitsi Mingwu Zhang tutkimuksen CRC.

Julkaisu bias

Emme löytäneet merkittäviä todisteita julkaisun bias (P-arvo 0,05) vertailu malliin käyttäen Egger n lineaarista regressio menetelmällä. Lisäksi muoto suppilon tontilta alleelin kontrastin (C vs. T) osoitti noin symmetrinen ja ylösalaisin suppilomainen (Kuva S1). Begge n suppilo juoni (C vs. T) ei paljastanut mitään merkittävää epäsymmetriaa jakelu hajallaan pistettä (kuva 2). Kaikista tutkimuksissa mukana, Wangin tutkimuksessa ESCC [35] ja Liun päälle PSCC [19] poikkesivat muista symmetrisesti tutkimuksissa. Kun nämä kaksi tutkimusta poistettiin, I

2 pieneni 63% (Ph = 0,0005) ja 42% (Ph = 0,05). Vaikka yhteenveto tai alleelin kontrastin (C vs. T) säilytetään edelleen merkittävä (OR = 1,15, 95% CI = 1,06-1,25), ja tämä tulos oli samankaltainen yhdistettyä tai ilman poistamista mitään tutkimusta (OR = 1,15, 95% CI = 1,05-1,26).

Log OR funktiona keskivirhe Log OR kunkin mukana tutkimuksessa. Jokainen ympyrä dot edustaa erillistä tutkimusta varten osoitettuun yhdistyksen alleelin sijaan (C yli T). Wangin tutkimuksessa ESCC (ylempi piste) ja Liun tutkimuksessa PSCC (alempi piste) paikantaa ulkopuolella pseudo 95% CI rajojen ilmeisesti.

Test heterogeeninen

Between-tutkimus heterogeenisyyksien ja vastaavien määrällisten astetta kaikissa vertailuissa ja alaryhmiä, jotka on esitetty taulukossa S3. Sen jälkeen kerrostuneisuuden erilaisuuteen väheni selvästi alaryhmissä CRC, GC, ruoansulatus rauhanen, HCC, sairaala perustuvat tarkastukset, ja C≤T ryhmä (Ph 0,10 ja I

2 50% useimmissa geneettinen vertailuissa).

Herkkyystarkastelu

Poistimme yhden tutkimuksen yleisestä Yhdistetyn analyysin aina tarkistaa vaikutuksen poistetun datajoukon yleistä syrjäisimmille alueille. Kaksi tutkimusta (Wang (ESCC) [35] ja Liu (PSCC) [19]) muutti Tutkimusten välisten erilaisuuteen olennaisilta osiltaan heterotsygoottianalyysiin verrattuna ja väistyvä malli vastaavasti. Kun poistetaan tahansa kahdessa tutkimuksessa mainittiin, heterogeenisyys katosi, kun yhdistys säilytetään edelleen merkittäviä (taulukko S4).

Meta-analyysin tulokset

Yhdistyksen vahvuus välillä miR-196a2 polymorfismi ja alttius ruoansulatuskanavan syöpien on esitetty taulukossa 2. Kaikkialla oli tilastollisesti suurentunut ruoansulatuskanavan syöpien jokaisessa geneettinen verrattuna (CT vs. TT, OR = 1,25, 95% CI = 1,07-1,45; CC vs. TT, OR = 1,38, 95% CI = 1,13-1,67; CC /CT vs. TT, OR = 1,29, 95% CI = 1,10-1,50; CC vs. CT /TT, OR = 1,14, 95% CI = 1.01- 1,30; C vs. T, OR = 1,15, 95% CI = 1,05-1,26).

Kasvain sivuston lähde hallintalaitteiden, etnisyyden ja alleelin taajuus valvonta otettiin huomioon alaryhmäanalyysi. Metsä tontit hallitseva malleja (CC /CT vs. TT) eri alaryhmää kuvassa S2. Verrattaessa genotyyppi TT, heterotsygoottinen CT (OR = 1,23, 95% CI = 1,03-1,48), homotsygoottinen CC (OR = 1,32, 95% CI = 1,05-1,65), yhdistelmä CT /CC (OR = 1,26, 95% CI = 1,04-1,51) pääasiallisesti esiintyvän useammin syövistä ruoansulatuskanavan. Ja me myös havaittu, että C-alleelin kantajia oli enemmän riskejä ruoansulatuskanavan syöpien (C vs. T, OR = 1,13, 95% CI = 1,02-1,25), mutta mitään merkittävää tulosta havaittu väistyvä malli (CC vs. CT /TT TAI = 1,12, 95% CI = 0,98-1,28).

merkitsevästi yhteydessä SNP rs11614913 ja lisääntyneiden riskien ruoansulatuskanavan rauhanen syöpiä todettiin kolmessa geneettinen mallia (CT vs. TT, OR = 1,30, 95% CI = 1,02-1,65; CC vs. TT, OR = 1,64, 95% CI = 1,24-2,17; CC /CT vs. TT, OR = 1,38, 95% CI = 1,10-1,74), paitsi väistyvä malli (CC vs . TT, OR = 1,24, 95% CI = ,85-+1,79) ja alleeli kontrasti (C vs. T, OR = 1,20, 95% CI = 0,96-1,51). Lisäksi osoitimme, että tämä lokus polymorfismi oli merkittävästi sidoksissa korkea riski CRC (CT vs. TT, OR = 1,23, 95% CI = 1,04-1,44; CC vs. TT, OR = 1,32, 95% CI = 1,08-1,61 ; CC /CT vs. TT, OR = 1,25, 95% CI = 1,07-1,46; C vs. T, OR = 1,15, 95% CI = 1,05-1,28), mutta marginaalinen merkitys löydettiin väistyvä malli (CC vs . CT /TT, OR = 1,16, 95% CI = 0,98-1,38). Havaitsimme myös lisääntynyt alttius HCC in homozygoottisia verrattuna (OR = 1,79, 95% CI = 1,31-2,43), hallitseva malli (OR = 1,41, 95% CI = 1,11-1,79), resessiivinen malli (OR = 1,49, 95% CI = 1,16-1,91) ja alleeli kontrasti (OR = 1,32, 95% CI = 1,14-1,54). Olemme juuri löytänyt marginaalinen merkitys homozygoottisia verrattuna (OR = 1,27, 95% CI = 0,99-1,64) HCC tutkimuksessa. Verrattuna CRC ja HCC, eikä merkittäviä yhdistysten havaittiin GC, OSCC ja PSCC.

käsittelyn valvonta lähde, tutkimukset sairaala perustuvan valvonnan osoittivat kohonneet riskit neljään geneettiseen vertailuissa (CT vs. TT, OR = 1,21, 95% CI = 1,08-1,36; CC vs. TT, OR = 1,37, 95% CI = 1,12-1,66; CC /CT vs. TT, OR = 1,24, 95% CI = 1,12-1,38; C vs. T, OR = 1,16, 95% CI = 1,05-1,28) ja reunan vaikutus saatiin väistyvä malli (OR = 1,18, 95% CI = 1,00-1,40). Kuitenkin tutkimukset väestön perustuvan valvonnan esitettäessä saa merkittävää yhteyttä.

Aasian ryhmä, joka geneettinen vertailu tuotti huomattavasti riskejä (CT vs. TT, OR = 1,26, 95% CI = 1,05-1,50; CC vs. TT, OR = 1,47, 95% CI = 1,18-1,82; CC /CT vs. TT, OR = 1,32, 95% CI = 1,10-1,57; CC vs. CT /TT, OR = 1,25, 95% CI = 1,11-1,40; C vs. T, OR = 1,20, 95% CI = 1,10-1,31), kun taas mitään merkittävää yhdistysten havaittu valkoihoinen ryhmässä.

alaryhmässä C T, huomattavan kohonnut syöpäriski oli löydetty homozygoottisia verrattuna (OR = 1,45, 95% CI = 1,01-2,07) ja hallitseva malli (OR = 1,39, 95% CI = 1,02-1,90). Vaikka emme löytäneet merkittäviä yhdistysten keskuudessa heterotsygoottianalyysiin vertailu (OR = 1,36, 95% CI = 1,00-1,85), resessiivinen malli (OR = 1,11, 95% CI = 0,91-1,36) ja alleeli kontrasti (OR = 1,15, 95% CI = 0,98-1,34). Samaan aikaan merkitsevästi yhteydessä miR-196a2 polymorfismi ja lisääntynyt riski ruoansulatuskanavan syöpä todettiin myös, että C≤T ryhmässä (CT vs. TT, OR = 1,18, 95% CI = 1,04-1,34; CC vs. TT, OR = 1,33, 95% CI = 1,14-1,55; CC /CT vs. TT, OR = 1,22, 95% CI = 1,08-1,37; CC vs. CT /TT, OR = 1,20, 95% CI = 1,05-1,37; C vs . T, OR = 1,15, 95% CI = 1,07-1,24).

Kun verrataan C-alleelin frekvenssi aasialaisilla kanssa valkoihoisista, Zhang tutkimuksen CRC suljettiin pois, koska sen HWE epätasapainoa valvontaa. C-alleelin taajuus miR-196a2 vaihteli +0,419-0,754 poikki Aasian ja Kaukasian valvontaa. Aasian valvonta, C-alleelin frekvenssi oli 45,60%, mikä oli merkittävästi pienempi kuin valkoihoisilla valvonta (59,90%, χ

2 = 222,32, P 0,0001). Entinen tutkimuksessa raportoitiin rinnakkainen havainto [9].

MOOSE muistilista meidän Tutkimus esitetään taulukkona S5.

Keskustelu

miRNA osallistua erilaisiin biologisiin prosesseihin ja on pidetään avaintekijänä oncogenesis. SNP miR-196a2 rs11614913 ajateltiin olevan osallisena muuttuneeseen ilmentymistä ja toimintaa kypsä miRNA, mikä osaltaan muutettu syöpäriski. Useat tutkimukset osoittivat muunnos rs11614913 oli merkitsevästi yhteydessä alttiutta eri syöpiä. Hong et ai. havaitsivat, että kantajia TC /CC genotyyppi miR-196a2 oli korkea riski ei-pienisoluinen keuhkosyöpä (NSCLC) vertaamalla TT harjoittajille [36]. Verrattaessa TT genotyyppi, Hu et al. Todettuja että CC tai CC /CT genotyyppien merkittävästi lisääntynyt rintasyövän riskejä [37]. Samanlaisia ​​tuloksia havaittiin myös gliooman [38], eturauhassyöpä [39] ja muiden syöpien.

Vielä enemmän, SNP miRNA voi joskus häiritä geenin tai proteiinin ilmentymisen ja johtaa patogeenisyyden [40]. Zhan ja hänen kollegansa kertoi, että ekspressiotasot miR-196a in CC ja CC /CT genotyyppien olivat korkeammat kuin TT genotyyppi CRC [15]. Li et ai. totesi myös, että CC ja CC /CT genotyyppien lisääntynyt ekspressiotaso miR-196a HCC potilailla, joilla on HBV-infektio vertaamalla TT genotyyppi [30]. Hu et ai. havaitsivat, että ilmentymistaso miR-196a CC-genotyyppi kantajia oli merkittävästi pienempi kuin CT tai TT kantajia NSCLC [6]. Lisäksi verrattuna CT /TT genotyyppi, CC genotyyppi miR-196a2 pääasiassa vähensi elinaika NSCLC potilaiden Hu tutkimuksessa [6]. Siten Hu ja hänen kollegansa ehdotti geneettinen muunnos tässä lokuksessa olevan ennustetyövälineenä biomarkkeri NSCLC.

tutkimus osoitti, että läsnäolo C-alleelin huomattavasti riskiä ruoansulatuskanavan syöpien kanssa verrattuna T-alleelin. Tämä havainto osoittaa, että geneettinen muunnos miR-196a2 voi ratkaisevasti muuttaa alttius ruoansulatuskanavan syöpiin. Edellinen meta-analyysi, joka on kuvattu syöpiä paikallistamiseen useita järjestelmiä organismin tukenut havainto [9], [13].

Huomasimme, että miR-196a2 polymorfismi, vuonna ositettu analyysi syöpämuodon, oli tilastollisesti liittyvät kohonneisiin syöpäriskejä ruuansulatuskanavan ryhmä ja ruoansulatuskanavan rauhanen ryhmä. Lisäksi merkittävästi lisääntyneitä riskejä havaittiin CRC ja HCC. Emme kuitenkaan ei havainnut merkittäviä assosiaatio geneettinen muunnos ja herkkyydestä GC, OSCC ja PSCC. On joitakin mahdollisuuksia tätä eroa keskuudessa kasvain sivustoja. Ensinnäkin kudosspesifisyyttä johtaa erilaisiin syövän alttiuden eri kudoksissa. Toiseksi suhteellisen pieni määrä hyväksyttyjä opintoja kerrostunut analyysi saattaa aiheuttaa merkittäviä /merkityksetön yhdistys sattumalta riittämättömän tilastollinen teho [41]. Kahdessa aiemmassa meta-analyysissä raportoitu merkityksetön assosiaatio miR-196a2 polymorfismi ja HCC riskeistä [9], [13], joka on ristiriidassa meidän havainto. Päättelemme, että vähemmän mukana tutkimukset ja laiminlyönti HBV-infektion verrokeilla saattaisi johtaa merkityksetön tuloksiin aikaisemmissa meta-analyysi.

alaryhmässä etnisyyden, löysimme merkittävä assosiaatio miR-196a2 polymorfismi ja lisääntyneiden riskien ruoansulatuskanavan syöpiä aasialaisilla muttei valkoihoisilla. Entinen meta-analyysissä raportoitu rinnakkaista havainto meille [9]. Keskenään ristiriidassa etnisten ryhmien voidaan selittää mahdollisuutta, että eri etnisten ryhmien elää useita elintapoja ja ympäristötekijät ja näin saadaan monipuolinen geeni ympäristön vuorovaikutukset [42]. Ja eri populaatioissa kuljettaa eri genotyyppi ja /tai alleeli taajuuksilla tämän lokuksen polymorfismia voi johtaa eriasteista syöpäalttiutta [43]. Suhteellinen pieni otoskoko valkoihoisilla saattaa aiheuttaa inconspicuousness myös.

Suurin osa (70%, 7/10) tutkimustulokset sairaalan perustuvan valvonnan palvelukseen aasialaiset kuin testattu aiheita ja löysimme huomattavasti riskejä tässä alaryhmässä. Vaikka useimmat (60%, 3/5) tutkimukset väestöön perustuvat tarkastukset tutkittiin valkoihoisilla ja emme löytäneet mitään merkittäviä tuloksia tässä alaryhmässä. Joten mainitut etninen tulkinnat ovat saatavilla epäjohdonmukaisuutta ohjauslähteen kerrostumista. Ja mahdollinen valinta bias kontrolleissa eri Hyväksytty kriteerien ja näytteen koko voi myös olla syy. Chu meta-analyysin tutkimuksessa raportoitiin myös merkittävästi lisääntynyt syöpäriski aasialaisilla muttei valkoihoisilla [9].

Erimielisyydet Ositusmenetelmässä alleelifrekvensseiltään verrokeilla saattavat määrittää edellä tulkintoja etnisten vaikutus jossain määrin.

Joitakin etuja voidaan korostaa tutkimuksessamme. Toisaalta tämä meta-analyysi valottaa yhdistyksen välillä miR-196a2 polymorfismi ja lisääntyneiden riskien ruoansulatuskanavan syöpien, CRC ja HCC kattavasti ja järjestelmällisesti. Toisaalta, sisällyttäminen julkaisemattoman tutkimuksen CRC ja keräämistä julkaisemattomia genotyypin taajuuden OSCC ja PSCC vahvistunut voima ja suostuttelun meidän päättely. Vielä enemmän, kaikki mukana tutkimuksissa oli hyväksyttävä laatu (sijoitettiin ainakin 6). Rajoitukset Tämän tutkimuksen tulisi huomioida samanaikaisesti. Ensinnäkin, geneettiset tekijät, kasvain biologiset ominaisuudet ja niiden vuorovaikutus ympäristöön tekijät tuottavat ilmeistä vaikutteita syövän alttiuden ja kasvaimen kehittymisen. Syöpätyypin on erilaiset riskitekijät ja monipuolinen herkkyydet niihin. Esimerkiksi Heliobacter pylori infektioiden ja tupakointi voi lisätä ilmaantuvuutta mahasyövän. Ja hepatiitti B, C virusinfektioiden ja altistumista aflatoksiini elintarvikkeiden ovat riski maksasyövän [44]. Tutkimukset sisälly tähän meta-analyysi sisälsi erilaisia ​​syöpiä, etninen väestö ja kansojen ja multifactor kuten sukupuoli, ikä, elämäntapa, kulttuuri esteet, terveydenhuollon ja altistuminen taudinaiheuttajia ja karsinogeeneja olivat erilaisia. Vaikka puuttuu yksittäisten tietojen esti meitä ohjaamasta mahdollisista sekoittavat tekijät, jotka saattavat johtua epäjohdonmukaisuuksia edellä. Emme myöskään voinut tehdä enemmän laskemaan tarkasti säädetty syrjäisimpien alueiden ja analysoida tarkemmin mahdollisten geenien ja ympäristön vuorovaikutus. Toiseksi mukana tutkii eivät kata kaikenlaisia ​​ruoansulatuskanavan syöpien, kuten haimasyövän. Ja kolmanneksi, kieli bias voi johtua seulotaan viitetiedot Englanti asiakirjoja vain.

Yhteenvetona tämä meta-analyysi osoitti, että miR-196a2 rs11614913 polymorfismi voi lisätä alttiutta ruoansulatuskanavan syöpien, erityisesti CRC ja HCC . SNP tässä lokuksessa voivat huomattavasti toimia ehdokkaana biomarkkeri syöpäseulonnan, diagnosoinnin ja hoidon tulevaisuudessa. Vahvista Tutkimuksemme edelleen hyvin suunniteltu tutkimuksissa on suuri otoskoko etninen väestö, useampaa ruoansulatuskanavan syövät yhdessä kudosspesifisiä biokemiallisia, toiminnallisia ja ilmaisulliset ominaisuuksia tarvitaan.

tukeminen Information

Kuva S1.

Funnel tontti julkaisu puolueellisuudesta. Keskivirhe log (OR) on funktiona tai tutkimusta varten. Jokainen neliö edustaa erillistä tutkimusta varten osoitettuun yhdistyksen alleelin sijaan (C vs. T). Katkoviiva sinisellä ilmaisee arvioidun OR.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0030585.s001

(TIF) B Kuva S2.

Forest kuvaajia hallitseva malli (CC /CT vs. TT) eri alaryhmiin. Neliöt ja vaakasuorat viivat vastaavat OR ja 95%: n luottamusväli erityinen tutkimus, ja alue neliöiden heijastaa tutkimuksen paino (käänteistä varianssi). Timantti edustaa yhdistettiin OR ja sen 95%: n luottamusväli.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0030585.s002

(TIF) B Taulukko S1.

genotyyppi frekvenssijakautuman sisältyvät tutkimukset.

doi: 10,1371 /journal.pone.0030585.s003

(DOC) B Taulukko S2.

Scale menetelmäsyistä laadun arviointiin.

doi: 10,1371 /journal.pone.0030585.s004

(DOC) B Taulukko S3.

heterogeenisuus testi.

doi: 10,1371 /journal.pone.0030585.s005

(DOC) B Taulukko S4.

syrjäisimmät alueet (95% CI) herkkyysanalyyseja.

doi: 10,1371 /journal.pone.0030585.s006

(DOC) B Taulukko S5.

MOOSE tarkistuslista.

doi: 10,1371 /journal.pone.0030585.s007

(DOC) B

Kiitokset

Kiitämme Qingyi Wei ja Zhensheng Liu päässä University of Texas MD Anderson Cancer Center, Karl T. Kelsey osastolta patologian ja laboratorio lääketieteen, Brown University, joka ystävällisesti tarjoamasta julkaisemattomia tietoja. Kiitämme myös Xiang Shu alkaen School of Public Health, University of Texas Health Science Center, sillä kritisoimalla ja muokata paperin.