PLoS ONE: monivaiheisessa High-Content Screening lähestymistapa tunnistaa uusia Toiminnallisesti Asiaa kohdegeenien Haimasyöpä
tiivistelmä
Jotta edistetään järjestelmällistä tunnistamista uusia geenejä, joissa merkittäviä toiminnallisia rooleja haimasyövän, olemme kehittäneet monivaiheisen seulontastrategia tarjoamaan rationaalinen pohja valinnassa erittäin tärkeitä uusia ehdokas geenit tulosten perusteella toiminnallisten korkea-pitoisuus analyyseissä. Työnkulun oli kolme peräkkäistä vaihetta: 1) sarja geeniekspressioprofilointi analyysit ensisijainen ihmisen haiman kudoksista sekä useita
in vivo
ja
in vitro
malleissa Kasvainten asiaankuuluvat ominaisuudet, jotta tunnistaa geenejä näkyvään ilmentymiskuviot; 2) käyttö ”käänteinen transfektion array” teknologia laajamittaiseen parallelized toiminnallisia analyysejä mahdollisten kandidaattigeenejä soluun perustuvissa määrityksissä; ja 3) valinta yksittäisten kandidaattigeenit syvällisempää tarkastelua niiden solujen rooleja. Kaikkiaan 14 geenejä, joiden joukossa 8 alk ”druggable” geeniperheisiin luokiteltiin etusija ehdokkaiden yksittäisten toiminnallisen kuvauksen. Esimerkkinä osoittamaan pätevyyttä lähestymistapa, kattava toiminnallinen tietoa kandidaattigeenifragmenttikloonien ADRBK1 /GRK2, jota ei ole aiemmin liitetty haimasyövän, on esitetty.
Citation: Buchholz M, Honstein T, Kirchhoff S , Kreider R, Schmidt H, Sipos B, et ai. (2015) monivaiheisessa Korkea Content Screening lähestymistapa tunnistaa uusia Toiminnallisesti Asiaa kohdegeenien Haimasyöpä. PLoS ONE 10 (4): e0122946. doi: 10,1371 /journal.pone.0122946
Academic Editor: Chunhong Yan, Georgia Regents University, Yhdysvallat