Krooninen sairaus

tiivistelmä

Vaikka munasarjasyöpä on kaikkein vaarallisin Gynekologiasairauksien maligniteettien suuri vaihtelu lopputulokseen seuraavissa tavanomaista hoitoa edelleen olemassa. Läsnäolo kasvain infiltroituneen säätelijä-T-solujen (Tregs) on rooli tulos tämän taudin, ja kasvava määrä tietoa tukee olemassa perinyt ennustavat tekijät. Kuitenkin rooli perinyt varianttien geeneissä, jotka koodaavat Treg liittyvien immuuni molekyylejä ei ole täysin selvitetty. Analysoimme ilme polygeeninen ominaisuus (eQTL) ja sekvenssi-pohjaisia ​​koodeja yhden emäksen monimuotoisuus (tagSNPs) 54 liittyviä geenejä Tregs vuonna 3662 invasiivisen munasarjasyövän tapauksissa. Korjattuna tunnettujen ennustetekijät viittaavia tuloksia havaittiin keskuudessa harvinaisempia histologisia alatyyppejä; köyhempi eloonjääminen liittyi vähäisiä alleeleissa SNP RGS1 (kirkas solu, rs10921202, p = 2,7 × 10

-5), LRRC32 ja TNFRSF18 /TNFRSF4 (mucinous, rs3781699, p = 4,5 × 10

-4, ja rs3753348, p = 9,0 × 10

-4, vastaavasti), ja CD80 (endomet-, rs13071247, p = 8,0 x 10

-4). Fo0r jälkimmäinen, kiinnekohta tiedot tukevat CD80 rs13071247 genotyypin yhdessä CD80 kasvaimen RNA lauseke (p = 0,006). Ylimääräinen eQTL SNP CD80 liittyi lyhyempi elinaika (rs7804190, p = 8,1 × 10

-4) kaikista tapauksista yhdistettynä. Koska tuotteet näiden geenien tiedetään vaikuttavan induktio, kaupan tai immunosuppressiivisten toiminta Tregs nämä tulokset viittaavat, että tarvitaan seurantaa fenotyyppisten tutkimuksia.

Citation: Goode EL, DERYCKE M, Kalli KR, Oberg aL, Cunningham JM, Maurer MJ, et ai. (2013) peritty vaihtoehdot in Regulatory T solugeenejä ja tulos munasarjasyöpä. PLoS ONE 8 (1): e53903. doi: 10,1371 /journal.pone.0053903

Editor: Michael Scheurer, Baylor College of Medicine, Yhdysvallat

vastaanotettu: 06 heinäkuu 2012; Hyväksytty: 04 joulukuu 2012; Julkaistu: 30 tammikuu 2013

Copyright: © 2013 Goode et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: tieteellinen kehittäminen ja rahoitus tämän hankkeen tuettiin osittain Mayo Clinic munasarjasyöpä SPORE (P50-CA136393) ja ELG, LCH, ja KLK, National Cancer Institute GAME-oN Post-GWAS Initiative (U19-CA148112), National Cancer Institute tutkimus hankeavustuksista (R01-CA086888, R01-CA122443, R01-CA106414, R01-CA76016, R01-CA114343), Cancer Research Iso-Britannia (A10119, A10124, A8339, A6187, A11306, A7058), Medical Research Council (G0801875- 89310), munasarjojen Cancer Research Fund, Mayo Foundation, Minnesota munasarjasyöpä Alliance, Mayo Foundation, Roswell Park Cancer Institute Alliance Foundation, ja Fred C. ja Katherine B. Andersen Foundation. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

munasarjasyöpä on viidenneksi suurin syy syövän kuolemaan naisten keskuudessa Yhdysvalloissa [1]. Viiden vuoden eloonjäämisaste on noin 45%, ja, vaikka moderni kirurgisten ja kemoterapeuttiset strategioita, useimmiten kehittyneitä taudin uusiutumisen ja periksi taudin [2], [3]. Harvinainen ituradan BRCA1 tai BRCA2 mutaatiot antavat parantuneen selviytymisen [4]. Yhteinen perinyt variantit voivat myös vaikuttaa lopputulokseen; genomin laajuinen yhdistys tutkimukset (GWAS) ovat käynnissä, mutta eivät vielä ole löytäneet selviytymisen liittyviä loci [5]. Huomioon uusia biologisia reittejä käyttäen perusteellinen analyysi vaihtelua kandidaattigeenejä lupaava tunnistamiseksi ennustetekijöiden geneettisten tekijöiden.

Useat tutkimukset osoittavat, että on tärkeää immuunijärjestelmän munasarjasyövän lopputulokseen. Esimerkiksi eräässä raportissa, tapauksia todisteet CD3 T-solujen kasvain tunkeutuminen (noin puolet tutkituista tapauksista) osoitti parannetun etenemisestä vapaan ja eloonjäämiseen [6]. Myöhemmät tutkimukset ovat puhdistettu ymmärrystämme kasvainta infiltroituneen T-soluja, joista yksi osoittaa, että CD8

+ T-lymfosyytit ovat ensisijainen osa-T-solujen populaation liittyy parempi eloonjääminen [7]. Yhdessä havainto, että vasta kasvaimen antigeeni-spesifisiä T-soluvasteita voidaan havaita tapauksissa, nämä tulokset viittaavat siihen, että anti-kasvain immuniteetin esiin munasarja- syöpiä ja vaikutuksia kliiniseen taudinkulku [8]. Tästä huolimatta sukupolven immuunivasteen, mutta anti-kasvain immuniteetin vastapainotrukki jota immunosuppressoivilla mikroympäristön [9]. Of immunosuppressoivilla mekanismeja, CD4

+ säätelijä-T-solujen (Tregs) ovat ensisijainen keino immuuni kiertämistä munasarjasyöpiä; nämä ovat CD4

+ T-sukuperää soluja, joiden ensisijainen tehtävä on immuuni asetus [10]. Yhteistyössä muiden kanssa, ensin ehdotti rooli kasvaimen infiltroituneen Tregs munasarjasyövän synnyssä, raportointi korkeampi CD4

+ Tregs mitattuna immunofluoresenssilla, joukossa tapauksia huonompi selviytyminen [11]. Myöhempi työ tukee merkitystä CD4

+ Tregs munasarjasyövän synnyssä ja tulos [7], [12]. Esimerkiksi, kun läsnä on CD4

+ Tregs näyttää vaikuttavan anti-kasvain aktiivisuuden kasvainta infiltroivien sytotoksisten CD8

+ T-solujen [7]. CD4

+ Tregs lohko sekä mukautuva ja synnynnäisen immuniteetin effektorit Solukontaktin mekanismeja sekä liukoinen välittäjinä [13], [14]. Liukoinen välittäjiä suppression liittyy yleisesti CD4

+ Tregs kuuluvat IL-10 ja TGF-β, jotka molemmat lohkon T-solujen lisääntymistä ja soluvälitteisen immuniteetin [15], [16], [17]. Muut solun pinnan molekyylejä osallisena tukahduttamaan immuunivaste ovat B7-H1 (CD274), GITR (TNFRSF18), LAG-3: n, CTLA-4, ja pinta-sitoutuneen TGF-β [18], [19], [20].

Koska tärkeydestä CD4

+ Tregs ja rooli perinnöllinen tekijöiden tulos, me arvioi yhteinen perinnöllinen vaihtelu liittyvät CD4

+ Treg liittyviä geenejä liittyi munasarjasyöpä lopputulokseen seuraavista standardihoitoa hoitoa. Erityisesti arvioimme 54 geenien avain induktio, kaupan tai immunosuppressiivisten toiminnot CD4

+ Tregs. Hyödyntämällä dataa uusi kandidaattigeeni tutkimuksessa yhdistetään olemassa olevien tietojen, tutkimme polymorfismit, joiden on osoitettu vaikuttavan ilmaus tai merkitä perinnöllinen vaihtelu näiden geenien. Liittyvät muunnelmat lopputulos useita tutkimuspopulaatiossa voisi valaista immunosuppressiiviseen mekanismeja munasarjasyöpä.

Materiaalit ja menetelmät

Ethics lausunto

pöytäkirjat hyväksyttiin asianmukaiset institutionaaliset tarkastuslautakunta (Mayo Clinic Institutional Review Board, Roswell Park Cancer Institute Institutional Review Boards, Duke University Institutional Review Boards, National Cancer Institute Institutional Review Boards, Moffitt Cancer Center Institutional Review Boards) tai etiikka paneeli (Royal Marsden Hospital etiikka paneeli, University of Cambridge eettisen paneelin , University College London etiikka paneeli). Kaikki osallistujat antoivat kirjallisen tietoisen suostumuksensa.

Candidate Gene SNP Array

Viisikymmentäneljä geenien avain merkitystä biologiaan Tregs (ACVR2B, AGTR1, CCL11, CCL17, CCL19, CCL2, CCL20, CCL22, CCL3, CCL4, CCL5, CCR4, CCR6, CCR7, CCR8, CD274, CD46, CD80, CD86, CXCL10, CXCL13, CXCR5, DUSP4, EGR2, GPR83, IDO1, IKZF2, IKZF4, IL10RB, IL15RA, IL2RB, IL6ST, IL9, INHBA, INHBB, IRF4, ITGAE, KLF10, LAG3, LRRC32, MDFIC, NRP1, PDCD1, PLAG1, PRNP, RGS1, RGS16, SH3BGRL2, SLC22A2, Smad3, SOCS2, TNFRSF18, TNFRSF4, ja TNFRSF9) valittiin tutkimuksen ( Taulukko S1). Merkityksellisyys Näiden geenien perustettiin peräisin PubMed [21] tietokantahaku joka osoitti julkaistut tiedot, jotka joko suoraan osoitti tai ehdotettu rooli vastaavien geenituotteiden induktio, immunosuppressoivilla toiminto, tai kaupan Tregs. Kahdeksaakymmentäviittä SNP: t (p 10

-6) ja lymfosyyttien mRNA: n ilmentymisen yhden tai useamman kandidaattigeenit (eQTL SNP: t) otettiin mukaan [22]. Lisäksi viiden kb kunkin geenin SNP koodaus muut SNP vähäisin alleelin taajuus (MAF) ≥0.05 r

2≥0.9 tunnistettiin 60 Euroopan-Amerikan osallistujien Low-kattavuus Pilot 1000 Genomes Project (53 geenien) [23] tai SeattleSNPs Variation Discovery Resource (for CCL2) [24], kumpi oli kaikkein informatiivinen. Valittu tagSNPs (N = 1451) optimoitiin sisällyttää SNP asianmukaisia ​​muotoilu tulokset varten Illumina GoldenGate BeadArray Pitoisuus, ennusti toiminnallisuus, ja sisällyttää useamman kuin yhden tagSNP suurille ryhmille vastaaviin SNP [25]. Muita SNP tieto on taulukossa S2.

Candidate Gene TET ja genotyypin

Kotelot genotyyppi on Treg mukautetun SNP array mukana naisten patologisesti-vahvistettu invasiivisen ensisijainen munasarjan epiteelin, vatsakalvon tai munanjohdin syöpä kirjoittautui Mayo Clinic ja Roswell Park Cancer Institute (RPCI). Mayo Clinic tapauksissa (N = 905) on todennut joulukuun 1999 marraskuu 2010 osaksi Mayo Clinic munasarjasyöpä tapauskontrollitutkimuksessa (MAY) tai Mayo Clinic Asia-Only munasarjasyöpä Study (MAC) sisältäen vuotiailla naisilla 20 vuotta tai yli kirjoilla kautta Mayo Clinic n Osastot Gynekologiasairauksien Surgery ja Medical Oncology. Kuusikymmentä kahdeksan prosenttia näistä tapauksista otettiin viikon kuluessa diagnoosin (mediaani diagnoosista rekrytointi oli nolla vuorokautta). RPCI tapauksissa (N = 167) olivat asukkaat Länsi-Pennsylvania, Itä-Ohio, tai Western New York, 25-vuotiaana tai yli ja varmistettu tammikuusta 2004 toukokuu 2009 kuuden kuukauden kuluessa diagnoosista kautta Roswell Park Cancer Instituten Sihteeri gynekologinen leikkaus ja Oncology . Nämä tapaukset otettiin mediaani diagnoosista rekrytointi 80 päivää. Molemmissa sivustoja, DNA uutettiin 10: stä 15 ml tuoretta ääreisverenkierron (käyttäen Gentra AutoPure LS Purgene suolaamalla metodologian Mayo Clinic ja FlexiGene DNA Kit metodologian RPCI), säilytetään -80 ° C: ssa, ja viivakoodilla varmistaa tarkat käsittely. Kaikkiaan 1072 osallistujaa genotyypattiin käyttämällä mukautettua Illumina GoldenGate BeadArray Pitoisuus yhdessä 24 kaksoiskappaleet ja 24 HapMap CEU näytteitä (8 trioista). Concordance joukossa tutkimus kaksoiskappaleet oli 99,998%, ei SNP ollut ratkaisematta toisinto tai Mendelin virheitä, ja keskimääräinen genotyyppi puhelu oli 99,88%. Näytteet, joissa genotyypitystä vajaatoiminta (N = 22) tai soita asti 97% (N = 11), ei oteta sekä näytteet todettiin virheellisesti pinnoitettu (N = 1) tai tapaukset tukikelvottomat johtuen ei-epiteelin sairaus (N = 5), rajatapaus kasvain käyttäytyminen (N = 34), tai ilmoittautuminen yli vuoden ennen diagnoosia (N = 5). SNP kanssa genotyypitystä vajaatoiminta (N = 162), soita asti 95% (N = 19), tai HWE 0,0001 ja huono klustereiden (N = 15) jätettiin pois. Niinpä analyysit perustuvat 994 tapausta ja 1340 SNP.

genominlaajuisten Association Study

analysoitiin myös tietoja seuranta munasarjasyövän Genetic Association ja vuorovaikutus Studies (pesäkkeitä) yhteistyö joka on osa National Cancer Institute GAME-oN Post-GWAS aloite ja on kuvattu muualla [26], [27]. Lyhyesti, osallistujat olivat 2,167 itse ilmoitettu valkoinen invasiivisen munasarjasyövän tapauksissa ilmoittautunut North Carolina munasarjasyöpä Study (NCO), NCI Munasarjojen Case-Control Study Puolassa (POL), Royal Marsden Cancer Study (RMH), Yhdistyneessä kuningaskunnassa tutkimukset of Epidemiology and Risk Factors in Cancer Heredity munasarjasyöpä Study (SEA), Tampa Bay munasarjasyöpä Study (TBO) ja Yhdistyneessä kuningaskunnassa Familial Munasarjojen Syöpärekisteri ja Britannian munasarjasyöpä populaatiotutkimuksessa (UKR + UKO). Genotyypin käytetään Illumina 317 k tai 610-Quad Infinium Array kanssa syyksi on HapMap v 26 käyttäen annostus-arvoja MACH ohjelmapaketti [28]. Tiedot 820 SNP olivat saatavilla kaikissa tapauksissa.

Tilastollinen analyysi

Käytimme Coxin suhteellista riskiregressioanalyysiä osuus vasemmalle katkaisu arvioida hazard ratio (t) ja 95%: n luottamusvälit (CI) varten yhdessä kokonaiselossaolo. Elinaika määriteltiin aika diagnoosista munasarjasyövän kunnes kuolema mistä tahansa syystä tai Viimeisimmässä seurannassa. Jokaisen SNP HRS 95% CI arvioitiin per-alleelin (eli 0, 1, tai 2 kopiota pieniä alleelin), analoginen Armitage testi suuntaus binary päätepisteitä. Log-lisäaine Coxin suhteellisen vaarat regressiomalleja oikaistiin tutkimuspaikan (MAY + MAC, RPCI, POL, NCO, RMH, SEA, TBO, UKO + UKR), ikä diagnoosin ( 50 vuoden 50-69 vuotta, 70 vuotta), kasvain vaiheessa (I tai II, III tai IV, tuntematon), kasvaimen (matala, korkea, tuntematon), ja rotu (valkoiset, ei-valkoinen, tuntematon), mallinnus suora genotyyppi vaatii MAY + MAC ja RPCI ja laskennalliset alleeli annosteluarvot tarvittaessa varten pesäkkeitä osallistujille. Heterogeenisyys HRS poikki tutkimuspaikan virallisesti tutkittiin käyttäen tutkimus-by-SNP vuorovaikutuksen kannalta ja suorittamalla todennäköisyyden osamäärätesti; ei korjausta useille testaus suoritettiin.

Kasvain Expression polygeeninen ominaisuus (eQTL) Analysis

54 genotyyppi Mayo Clinic tapauksissa (33 seroosinen yhdeksän kirkas solu, kahdeksan endomet-, neljä mucinous), ilmaisu analyysit suoritettiin myös. Kasvaimen RNA eristettiin Tuorenäytteissä, Qiagen RNeasy protokolla ja kvantitoitiin käyttäen Nanodrop spektrofotometrillä (Agilent Technologies, Santa Clara, CA). Kokonais-RNA (750 ng) korkealaatuisia (RNA integroitu määrä 8,0) leimattiin syaniini 5-CTP tai syaniini 3-CTP käyttäen Low RNA Input loisteputki Linear -monistustarvikesarjaa (Agilent Technologies), puhdistettiin RNeasy Mini sarakkeita ( Qiagen), ja hybridisoidaan Agilent koko ihmisen genomin 4 × 44 K ilmaisu pakat (käyttäen sekoitettua viittaus sisältävän 106 kasvainnäytteestä). Objektilasit skannattu käyttäen Agilent 2565BA Scanner, ja data normalisoitiin käyttämällä Agilent virhe mallin viemän Agilent Feature Extraction Software (versio 7.5.1). Data muodossa log suhde signaaleja yksittäisten kasvaimia signaaleja viittaus sekoitus käytettiin analyysiä varten. Geenejä kanssa SNP jotka liittyivät eloonjääminen p 0,001, yhdistyksen välillä genotyypin ja ilmaisun antureista arvioitiin käyttäen Wilcoxonin-summa testejä.

Tulokset

lähes 1000 invasiivisen munasarjasyövän tapauksissa genotyyppi joka Treg mukautetun SNP array ja noin 2600 tapauksia pesäkkeitä yhteistyössä osoitti odotetun jakaumat kuolleisuus, ikä ja kliiniset piirteet (taulukko 1). 1529 havaittu kuolemia aikana seuranta-ajan mediaani oli 5,4 vuotta. Yhdistetyssä analyysit kaikista tapauksista ja kyseessä määriteltyjen ryhmien histologia, kahdeksan SNP tuotti p 0,001 lukien kuusi riippumatonta r ​​

2 0,95 (taulukko 2). Tulokset olivat samanlaisia, kun rajoitettu 2518 tapauksia täydelliset tiedot lavalla, laatu, ja histologia. Jokaisessa SNP vähäisiä alleelit olivat yhteydessä heikompaan munasarjasyöpä selviytymistä. Kaikkein tilastollisesti merkitsevä yhteys oli välillä selviytymisen seuraavat selkeät cell munasarjasyöpä (N = 217) ja pienet alleeleissa harvinaista introni- SNP säädin G-proteiinin signalointi 1 (RGS1), mikä viittaa lähes kolme kertaa suurempi riski kuolla ( p = 2,7 × 10

-5).

Niistä 272 mucinous munasarjasyöpiä, pienet alleeleissa neljä SNP leusiini rikas toista, joka sisälsi 32 (LRRC32) liittyivät suurempaan kuin kaksi kertainen köyhempi selviytymistä. Kolme näistä SNP: iden (rs3781699, rs3197153, rs3781701) korreloivat voimakkaasti (r

2≥0.97), jolloin vain yksi näistä on esitetty taulukossa 2 (rs3781669 p = 4,5 x 10

-4). Neljäs SNP, LRRC32 SNP rs7944357, oli vain hieman korreloi tämän kolmen SNP klusteri (r

2≤0.26), mutta liittyi myös selviytymisen joukossa tapauksia mucinous munasarjasyöpä (p = 8,3 x 10

– 4). Eräs toinen SNP rs3753348 osoittivat yhteyden johonkin yli kolminkertaiseksi riskin selviytymisen mucinous munasarjasyöpä (taulukko 2); Tämä SNP asuu 5 kb välisellä alueella tuumorinekroositekijän reseptoreiden superperheen jäseniä 4 ja 18 (TNFRSF4 ja TNFRSF18) kromosomissa 1.

Niistä 570 endomet- munasarjasyöpä tapauksissa vähäinen alleeleissa introni- CD80 tagSNP rs13071247 liittyivät kanssa 73% lisääntynyt riski kuolla (p = 8,0 x 10

-4, taulukko 2). Lisäksi analyysi kaikista tapauksista riippumatta histologia ehdotti, että eQTL SNP varten CD80 (rs7804190) liittyi 14% lyhyempi elinaika (p = 8,0 x 10

-4). Rs7804190 eQTL, joka sijaitsee introni on MAD1 mitoottiseen pidätys puutteellisia-like 1 (hiiva) (MAD1L1), on kiinnostava, koska genotyypin on todettu korreloivan ilmentymisen CD80 (p = 6,0 x 10

-7), kuten sekä polymeraasi (DNA suunnattu), beeta (POLB), proliini-seriini-treoniini fosfataasin vuorovaikutuksessa proteiini 2 (PSTPIP2), ja KIAA1128 (p 10

-6) lymfoblastisolulinjoissa [22]. Huomattavaa on, että ei SNP liittyi eloonjäämisen seuraavien vakavien munasarjasyöpä (p 0,001), yleisin ja kaikkein vaarallisin histologinen alatyyppi. Testit vuorovaikutus paljastaneet mitään paikkasidonnainen heterogeenisyys yhdistyksen tahansa SNP taulukossa 2 (p 0,05 kullekin).

Tutkiakseen mahdollisia mekanismeja havaitut SNP liittyy munasarjasyövän säilymiseen, tutkimme kasvain RNA ilme tiedot 54 Mayo Clinic tapauksissa ja korreloi ilmaisutapoja genotyyppi on kaikkein suggestiivinen selviytymisen liittyvän SNP: edellä kuvattu. Tällä CD80 rs13071247, yhdistys havaittiin niin että heterotsygooteilla ja pienet alleeli homozygoottien (AC ja CC genotyyppien) oli hieman lisääntynyt kasvaimen lauseke (mediaani kertainen muutos = 1,04 on raaka mittakaavassa, 0,06 log

2 asteikko) kuin tapaukset, joissa AA-genotyyppi (p = 0,006, kuvio 1). Mikään muu assosiaatiot genotyypin ja kasvaimen RNA ilmaisun havaittiin p 0,05.

joukossa N = 54 MAY + MAC invasiivisen munasarjasyövän tapauksissa Agilent koko ihmisen genomin 4 × 44 K ilmaisun array koetin A_24_P155632; CD80 log

2 suhde kasvaimen verrattuna viite-RNA ilmaisu (y-akseli) versus genotyyppi (x-akseli); Viivat osoittavat mediaani; kukin symboli on ainutlaatuinen potilas; datapistettä jittered joten kaikki tiedot ovat näkyvissä.

Keskustelu

Aiemmat tutkimukset tukevat merkittävä rooli Tregs munasarjasyövän jotka näyttävät vaalittava immunosuppressivisia mikroympäristön. Täällä analysoimme munasarjasyövän selviytymisen suhteen perinyt Treg genotyyppien yhdistämällä räätälöityjä genotyypityksen ja integrointi olemassa olevien genotyyppien peräisin yhteistyötä GWAS. Vaikka mikään SNP tuotti viittaavia tuloksia keskuudessa yleisempää vakavien tapauksissa huonompi selviytyminen liittyi vähäisiä alleeleissa SNP RGS1 (kirkas cell), LRRC32 ja TNFRSF18 /TNFRSF4 (mucinous), ja CD80 (endomet-). Jälkimmäisessä lisätiedot tukevat CD80 genotyypin yhdessä CD80 kasvaimen RNA ilme. Yhdistetty analyysi useiden riippumattomien aineistojen tarjoaa suurempaa tilastotehoa kuin erilliset löytö ja replikointi analyysit [29]; Näin, käytimme tämän tutkimuksen suunnittelu ja tutkivat mahdollisuutta heterogeenisyys tuloksia eri tutkimuksissa. Koska tilastollisesti merkitsevä heterogeenisuus tutkimuksissa havaittiin, meidän päättely perustuu tämän yhdistetyn, tehokkain lähestymistapa. On syytä huomata, että tutkimme suhteellisen suuri määrä SNP poikki 54 Treg liittyvien geenien ja eri histologisia alatyyppejä, ja siksi tunnustettava, että useita testauksen ongelmia saattaa esiintyä; jotkut korostettiin tulosten voisi todellakin olla vääriä positiivisia yhdistysten. Se, että geenit tutkitaan valittiin perustuen a priori rooli munasarjasyövän ja että keskittynyt vain SNP assosiaatioita p-arvot alle 0,001 vähentää, mutta ei kokonaan poista, tämä mahdollisuus. Kuitenkin tämä työ korostaa erityisesti Treg liittyviä geenejä kohteisiin.

CD80 on tutkittu laajalti sen roolin immuunivasteiden, mutta ei rajattu analyysi SNP: iden ja munasarjasyövän tulos on raportoitu, että tietomme. Se toimii ligandina sekä CD28- ja CTLA4, mikä johtaa proliferaatioon ja anergian naiivi T-soluissa, vastaavasti [30], [31], [32]. CTLA4 on konstitutiivisesti Tregs, joissa on tärkeää tukahduttaa immuunivasteita monin ehdotettuja mekanismeja, mukaan lukien aktivoituminen indoleamine-2,3-dioksigenaasia väylän dendriittisolut (DC) ja inhibitio vuorovaikutukset aktivoitujen T-solujen ja DC: [33], [34], [35]. Havaitsimme, että introni- koodaus CD80 SNP liittyi huonompi selviytyminen endomet- tapauksissa ja lisääntynyt kasvaimen CD80 ilmaisun, ja kaikista tapauksista, havaitsimme, että eQTL SNP toisessa kromosomissa joka liittyy CD80 lymfosyyttien ilme liittyi myös huonompi selviytyminen . Kaiken kaikkiaan nämä tiedot viittaavat siihen, että CD80: n ilmentyminen olla osasyynä peritty tekijöitä ja voi johtaa lisääntyneeseen immuunijärjestelmän tukahduttaminen ja huonompi tulos.

Kiinnostaa tyhjentää solun munasarjasyöpä, geenituote RGS1, RGS1 tai BL34 , on jäsen RGS proteiinin perhe, jonka jäsenet osallistuvat säätelyyn G-proteiinin signalointi. Erityisesti ne ovat GTPaasia aktivoivia proteiineja, jotka rajoittavat kesto G-proteiinin signalointi [36], [37]. Lymfosyyttien liikkumista kemotaktinen signaalit välittyvät G-proteiini signaaleja ja aikaisemmat tutkimukset ovat osoittaneet, että Tregs eivät reagoi yhtä hyvin kemokiini signalointi niin naiiveja T-soluja [38]). Lisäksi RGS1 on korkeammin ilmaistaan ​​Tregs ja ilmaisun korreloi käänteisesti muuttoliike [38]. Mielenkiintoista on, RGS1 geenin ilmentyminen on lisääntynyt aktivoitu Tregs, ja tämä välittää sitoutumisen Treg transkriptiotekijän FOXP3 on RGS1 geenin [39]. Associations of RGS1 SNP: iden on myös havaittu useita T-soluvälitteinen autoimmuunisairauksien, mukaan lukien tyypin 1 diabetes, keliakia, ja multippeliskleroosi [40], [41], [42], [43]. Näiden pohjalta ennen tutkimuksiin, on houkuttelevaa spekuloida, että geneettisesti määritelty RGS1 tasot voivat säädellä Treg tunkeutumisen selvä soluun munasarjasyöpiä ja siten edistää lopputulokseen.

SNP mahdollisia merkitystä mucinous tauti on LRRC32 joka koodaa GARP, transmembraaninen proteiini, joka ilmentyy spesifisesti luonnollisesti esiintyvät aktivoitu Tregs, mutta ei lepovaiheessa Tregs [44], [45]. GARP on osoitettu olevan reseptori aktiivinen, latenssi liittyvä peptidi (LAP) sitoutunut TGF-β [46], [47]. GARP ei aiheuta aktivointia latentin TGF-β; se voi kuitenkin toimia tarttuvaa toleranssi, muuntaa FOXP3

– solujen käyttöön ehkäisevän FOXP3

+ solujen [46], [48]. Lisäksi, GARP on osa positiivista takaisinkytkentäsilmukka FOXP3 in Tregs, joiden tiedetään ylläpitää ehkäisevästä kasvaimen mikroympäris- ja estää tehokkaan immunologisen vasteen [45]. Meidän havainto köyhempien eloonjäämisennustetta mucinous tapauksissa tehty pieniä alleelien klo LRRC32 SNP viittaa siihen, että nämä tapaukset ovat saattaneet lisätä immunosuppressiota.

Raportoimme yhdistyksen välillä kuolemanriski vuoksi mucinous munasarjasyöpä ja SNP geenissä klusterin sisältäviä TNFRSF18 ja TNFRSF4. TNFRSF18 koodaa GITR, kostimulatorista molekyyliä esillä olevan konstitutiivisesti Treg-solujen ja säädelty naiiveja T-solujen stimulaation jälkeen. Raportit ovat ristiriitaisia, koska rooliin GITR, koska se on raportoitu sekä lisätä [49], [50] ja kumoamaan tukahduttava funktio Tregs [51], [52]. Vaikka erityinen mekanismi GITR toiminnan edelleen kiistanalainen, on selvää, että se moduloi Tregs. TNFRSF4 koodaa OX40 (CD134), ja signalointi kautta OX40 vähentää kykyä Tregs toimia suppressorisolut vähentämällä ilmentymä FOXP3 [53], [54]. Alennettu FOXP3 johtaa laski miR155 ja lisääntyminen myöhemmin SOCS1 (vaimennin sytokiinien signalointi 1). SOCS1 on komponentti negatiivinen kierre IL-2 signalointiryöpyn; lisääntynyt ilmentyminen SOCS1 johtaa tarpeeseen lisätä IL-2 tasot selviytymiselle Tregs [55]. Niinpä OX40 signalointi Tregs voi moduloida vaimennin toimii sekä vähentämällä heidän efektoritoiminto ja vaatimalla suurempia määriä IL-2 säilymisen ja aktivointi. Intergeenisessä SNP liittyvä yleinen hengissä tapauksissa mucinous munasarjasyöpä voi toimia kautta joko GITR tai OX40 mekanismi. Dissecting rooli ituradan variantit voivat auttaa tunnistamaan mekanismeja, jotka voisivat selittää, miksi immuunijärjestelmä ei pysty asentaa tehokas vastaus munasarjojen syöpiä.

Yhteenvetona analyysimme 3662 invasiivisen munasarjasyövän tapaukset viittaavat siihen, että perinnöllinen variantit liittyvät Tregs liittyvät munasarjasyövän tulos alatyyppi sopivalla tavalla, vaikka oikaistu tiedossa ennustetekijöiden ominaisuuksia. Meidän löydökset korostavat alatyypin-erityisiä analyyseja kliinisissä ja epidemiologisissa tutkimuksissa munasarjasyövän, kun otetaan huomioon vakiintunut sairaus heterogeenisyys, jossa kukin histologisen alatyypin ilmaista erilaisia ​​malleja geneettisen, epidemiologiset ja kliiniset ominaisuudet (tarkastelleet Karst ja Drapkin [56]). Tulevaisuuden työ tulisi tarkastella muun muassa Lisätutkimuksessa väestön immunologisiin tutkimuksiin, ja korrelaatio perityn variantteja muihin kasvain ominaisuuksia, kuten tasot Treg tunkeutumisen.

tukeminen Information

Taulukko S1.

Gene tiedot.

doi: 10,1371 /journal.pone.0053903.s001

(XLS) B Taulukko S2.

SNP tiedot.

doi: 10,1371 /journal.pone.0053903.s002

(XLSX) B

Kiitokset

Olemme kiitollisia perheen ja ystävien Kathryn Sladek Smith heidän anteliaasta tuesta munasarjasyövän Association Consortium kautta lahjoituksia Munasarjojen Cancer Research Fund.