PLoS ONE: HNF1B ja endometriumin syöpäriski: Tulokset PAGE tutkimus

tiivistelmä

tutkinut yhdistyksen välillä

HNF1B

variantteja tunnistettiin äskettäin genomin laajuinen yhdistys tutkimuksessa ja kohdun limakalvon syövän kaksi suurta tapausverrokkitutkimukset sisäkkäisiä mahdollisille ikäluokat: monietnisen Cohort Study (MEC) ja naisten Health Initiative (WHI) osana Population arkkitehtuurin avulla Genomics ja epidemiologia (PAGE) tutkimus. Kaikkiaan 1357 tapauksesta invasiivista kohdun limakalvon syövän ja 7609 kontrollia sisällytettiin analyysiin (MEC: 426 tapausta /3854 valvonta; WHI: 931cases /3755 tarkastukset). Suurin osa naisista WHI olivat amerikkalaisen, kun taas MEC mukana melkoinen määrä Afrikkalainen amerikkalaiset, japanilaiset ja latinot. Arvioimme kertoimet suhdeluvut (syrjäisimpien alueiden) per alleeli ja 95% luottamusväli (CI) kunkin SNP käyttäen ehdoton logistista regressiota säätämisen ikä, painoindeksi, ja neljä pääpiirteistä syntyperää informatiivisia merkkejä. Yhdistetyt syrjäisimmillä alueilla arvioitiin käyttämällä kiinteää vaikutus malleja. Rs4430796 ja rs7501939 liittyi endometriumin syöpäriskin MEC ja WHI ilman heterogeenisuus havaittiin kaikilla rotua /etnistä ryhmää (P≥0.21) tai tutkimusten välillä (P≥0.70). OR

kohden alleeli oli 0,82 (95% CI: 0,75, 0,89; p = 5,63 x 10

-6) ja rs4430796 (

G

alleeli) ja 0,79 (95% CI: 0,73, 0,87; p = 3,77 x 10

-7) ja rs7501939 (

alleeli). Yhdistykset kanssa riski tyypin I ja tyypin II kasvaimet olivat samanlaisia ​​(P≥0.19). Säätö ylimääräisiä endometriumsyöpään riskitekijöiden, kuten pariteetti, ehkäisytablettien käyttö, vaihdevuosien hormonien käyttö ja tupakointi oli vain vähän vaikutusta tuloksiin. Lopuksi

HNF1B

SNP liittyy riski kohdun limakalvon syöpä ja että niihin liittyvät suhteelliset riskit ovat samankaltaiset tyypin I ja tyypin II kasvaimia.

Citation: Setiawan VW, Haessler J, Schumacher F Cote ML, Deelman E, Fesinmeyer MD, et al. (2012)

HNF1B

ja endometriumin syöpäriski: Tulokset PAGE tutkimuksessa. PLoS ONE 7 (1): e30390. doi: 10,1371 /journal.pone.0030390

Editor: Paolo Peterlongo, Fondazione Istituto FIRC di Oncologia Molecolare (IFOM), Italia

vastaanotettu: 02 marraskuu 2011; Hyväksytty: 20 joulukuu 2011; Julkaistu: 27 tammikuu 2012

Copyright: © 2012 Setiawan et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Dr. Setiawan tukee osittain National Cancer Institute (NCI) urakehitys Award K07 CA116543. Väestötietojärjestelmä Arkkitehtuuri käyttäminen Genomics ja epidemiologia (PAGE) Ohjelman rahoittaa National Human Genome Research Institute (NHGRI), jota tukee U01HG004803 (calico), U01HG004798 (EAGLE), U01HG004802 (MEC), U01HG004790 (WHI), ja U01HG004801 (koordinointi Keskusta). Sisältö tämän paperin ovat yksin vastuussa kirjoittajien eivätkä välttämättä edusta näkemyksiä National Institutes of Health (NIH). Täydellinen luettelo PAGE jäsenistä löytyy osoitteesta https://www.pagestudy.org. Tiedot ja materiaalien mukana tässä raportissa seurausta yhteistyönä seuraavat tutkimukset: monietnisen kohorttitutkimus (MEC) karakterisointi epidemiologisten arkkitehtuuria rahoitetaan NHGRI PAGE-ohjelma (U01HG004802). MEC Tutkimus rahoitetaan National Cancer Institute (R37CA54281, R01CA63464, P01CA33619, U01CA136792, U01CA98758, ja R03CA128008). Kirjoittajat kiittää kohortti jäseniä osallistumisesta ja tohtori Monroe hänen merkittävästä maksuosuudet toteuttamista monietnisen kohorttitutkimuksessa. Rahoitus tuki ”Epidemiology Oletettujen Geneettiset Vaihtoehdot: The Women Health Initiative” tutkimuksesta toimitetaan kautta NHGRI PAGE-ohjelma (U01HG004790). WHI Ohjelma rahoittaa National Heart, Lung, and Blood Institute; NIH; ja US Department of Health and Human Services sopimusten kautta N01WH22110, 24152, 32100-2, 32105-6, 32108-9, 32111-13, 32115, 32118-32119, 32122, 42107-26, 42129-32, ja 44221. rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

kilpailevat edut: kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

kohdun limakalvon syöpä on yleisin gynekologinen syöpä kehittyneissä maissa. Tuore genomin laajuinen yhdistys tutkimuksessa (GWAS) tunnistettu yhteisiä yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) in

HNF1B

liittyy endometriumin syöpäriskiä naisilla eurooppalaisten tausta [1]. Sama SNP: t, rs4430796 ja rs7501939, liittyy myös eturauhassyövän [2] ja tyypin 2 diabetes [3], [4]. Tutkimme yhdistyksen näiden SNP ja kohdun limakalvon syövän kaksi suurta mahdollisille kohorttitutkimukset kattavaa -riskitekijöistä: monietnisen seurantatutkimus (MEC) ja naisten Health Initiative (WHI), osana Population arkkitehtuurin avulla Genomics ja epidemiologia (PAGE) tutkimus [5]. Tutkimme myös assosiaatiot

HNF1B

ja kohdun limakalvon syöpä poikki rotua /etnistä ryhmää ja kasvaimen histologisia tyyppejä, ja vaikutus muuttaminen tunnetuilla endometriumsyöpään riskitekijöitä.

Materiaalit ja menetelmät

PAGE on liitännäinen tutkimus sekä WHI ja MEC, ja on hyväksynyt WHI ja MEC ohjauskomiteoissa. PiS sivun tutkimusten kuluessa WHI ja MEC on edelleen viranomaisen analyysien puitteissa alkuperäisen sovelluksia.

Tutkimuskanta

PAGE tutkimus on kansallinen Human Genome Research Institute (NHGRI) – tuettu yhteistyössä pääpaino syvän luonnehdinta hyvin monistaa geneettinen riski variantit tunnistetaan GWAS ja niiden suhteita eri fenotyypit ja ominaisuuksia (esim lipidejä, diabetes, sydänsairaudet, syövät) erilaisissa epidemiologisissa tutkimuksissa. Mukana ominaispiirteiden analysoinnin on 1) kopio alkuperäisestä yhdistyksen populaatiossa samanlainen geeniperimästä kuin alkuperäinen GWAS, 2) yleistäminen yhdistyksen eri väestöryhmien kuten Afrikkalainen amerikkalaiset, aasialaiset, Espanjalainen /Meksikon amerikkalaisia, ja muut ryhmät, 3) tunnistaminen geenin ympäristön vuorovaikutukset, ja 4) tunnistaminen pleiotropia. Yksityiskohdat sivujen suunnittelu ja menetelmiä on esittänyt Matise et al [5]. PAGE Tutkimuksessa otettiin näytteet, joista neljästä suuri väestö perustuvat tutkimukset tai konsortiot [5]; Kuitenkin nykyinen analyysi mukaan vain naisia ​​MEC ja WHI. MEC on tulevaisuuteen kohorttitutkimuksessa koostuu 215251 aikuisten miesten ja naisten asuu Havaijilla ja Kaliforniassa pääasiassa viidestä populaatiot: amerikkalaisen, Afrikkalainen Amerikan, Native Hawaiian, japani, ja Latino (Espanjalainen /Mexican amerikkalaiset) [6]. Osajoukko kohortin osallistujat (~70,000) on saatavilla DNA-näytteitä. Tapaus tapauksissa endometriumsyöpätapausta tunnistettiin kohortti sidos väestöpohjaiset syöpä Surveillance, epidemiologia, ja Lopputulokset (SEER) rekisterit Kaliforniassa ja Havaijilla. Kontrollit valittiin nainen kohortin osallistujat ilman itse ilmoitettu kohdun lähtötilanteessa ja jotka olivat vapaita syövän at 31. joulukuuta 2008. kontrollit erikseen sovitettu tapauksiin perustuvat ikä kohortin merkintä, rodun /etnisyyden, ja tutkia alue (Hawaii tai Kalifornia). MEC endometriumsyöpään tapauskontrollitutkimuksessa mukana 426 invasiivista kohdun limakalvon syövän tapauksissa ja 3854 tarkastuksia. WHI koostuu havainnointitutkimuksessa ja neljässä kliinisessä tutkimuksessa, joka kattaa komponenttien ruokavaliota muuttamalla, hormonihoito, erikseen naisille ja ilman kohtu, ja täydentämistä kalsium /D-vitamiinin [7]. Tutkimus koostuu 161808 postmenopausaalisilla naisilla eri rotua /etnistä ryhmää. Tapaus tapauksissa endometriumsyöpätapausta kohortin tunnistettiin itsestään raportti, joka todettiin vähintään kerran vuodessa ja varmistettiin kliinikot tutkittuaan patologiaraporteista [8]. Kontrollit valittiin kohortin osallistujat ilman itse ilmoitettu kohdun lähtötilanteessa ja jotka olivat vapaita syövästä 1. syyskuuta 2009. kontrollit erikseen sovitettu tapauksiin iän lähtötilanteessa, jona ilmoittautuminen, rodun /etnisyyden, ja oikeudenkäynti aseita. WHI endometriumsyöpään tapauskontrollitutkimuksessa mukana 931 invasiivista kohdun limakalvon syövän tapauksissa ja 3755 tarkastuksia.

kasvainhistologiaa

Käytimme kansainvälistä luokitusta Taudit, Oncology (ICD-O-3) koodin luokitella kohdun limakalvon syövän tapauksissa tyypin I tai II [9] – [11]. Pelkän estrogeenin epäillään vaikuttavan tyypin I, mutta ei tyypin II kasvaimissa [12]. Tyyppi I sisältyvät endomet- (ICD-O-3-koodi: 8380, 8381, 8382, 8383), adenokarsinooma putkimainen (8210, 8211), papillaarinen adenokarsinooma (8260, 8262, 8263), adenokarsinooma kanssa levyepiteelikarsinooma metaplasiaa (8570), mucinous adenokarsinooma ( 8480, 8481), ja adenokarsinooma NOS (8140). Tyypin II sisältyy selkeä solu (8310), vakavien (8441), papillaarinen vakavien (8460, 8461), levyepiteelisyöpä (8050, 8070, 8071, 8072), adenosquamous (8560), pienisoluinen karsinooma (8041), ja sekoitetaan adenokarsinooman (8323). Tapaukset, joissa on sarkooma diagnoosi ei sisällytetty analyysiin.

SNP valinta ja genotyypityksen

Kaksi

HNF1B

SNP (rs4430796 ja rs7501939) olivat osa 167 (MEC) ja 183 (WHI) hyvin monistaa geneettinen riski variantteja tunnistaa GWAS genotyypitetty PAGE tutkimuksessa tutkia dalmatialaistäpläisiä useilla syövän sivustoja. Genotyypin suoritettiin käyttäen TaqMan Open Array genotyypin System (Life Technologies /Applied Biosystems) osana PAGE aloitteen. Keskimääräinen genotyyppi suorittaneita oli 98,0% vuonna MEC ja 99,9% vuonna WHI. Konkordanssi Sokkoutetun kaksoiskappaleet oli 99,7% vuonna MEC ja 99,5% vuonna WHI. Hardy-Weinberg Equilibrium (HWE) kunkin alleelin arvioitiin kussakin rotuun /etniseen ryhmään valvontaa; ei poikkeamaa HWE havaittiin (at P 0,01 taso) useampaan kuin yhteen rotuun /etninen ryhmä, mikä viittaa siihen, että tällaiset poikkeamat ovat todennäköisesti johtuu sattumasta eikä genotyypitys virhettä.

Tilastollinen analyysi

Tunnetut riskitekijät kohdun limakalvon syöpä (

eli

pariteetti, ehkäisytablettien käyttö, vaihdevuosien hormonien käyttö, tupakointi ja diabetes tila saatiin lähtötilanteen kyselyn tiedot. Per alleelin kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja 95% luottamusväli (CI) varten SNP-kohdun limakalvon syövän yhdistys laskettiin ehdoton logistinen regressio. mallit oikaistiin ikä (jatkuva), kehon painoindeksi (BMI) ( 25, 25- 30, ≥30 kg /m

2), ja neljä parasta syntyperä pääkomponenttien. Keskeiset komponentit on johdettu 100 syntyperä informatiivinen markkereita arvioitiin käyttämällä EIGENSTRAT menetelmää [13]. Parity, ehkäisytablettien käyttö, vaihdevuosien hormonien käyttö, tupakointi asema, ja diabetes tila katsottiin mahdollisina sekoittavien tekijöiden. testi vuorovaikutus rodun /etnisyyden ja mahdollisen vaikutuksen muutokseen, kohdun limakalvon syöpä riskitekijöitä arvioitiin käyttäen log-todennäköisyys testisuureen vertailemalla malleja ja ilman vuorovaikutusta termi (ristitulo välillä SNP ja rodun /etnisyyden tai riski kiinnostavaa tekijää). Yhdistetty syrjäisimmillä alueilla ja 95% CI arvioitiin kunkin tutkimuksen tai käyttämällä kiinteää vaikutusten malli ja Tutkimusten välisten heterogeenisuus tutkittiin käyttäen Q testisuureen. Käytimme polytomous logistisen regression laskemiseen syrjäisimmille alueille ja 95% CI tyypin I ja tyypin II kohdun limakalvon syöpä. Kaikki rotuun /etnistä ryhmää kuuluivat tähän alaryhmäanalyysissä. Kaikki P-arvot ovat kaksipuolisia.

Tulokset

ominaisuudet tapauksissa ja valvonnan MEC ja WHI on esitetty taulukossa 1. Keskimääräinen iät tapausten ja kontrollien olivat samanlaiset kullakin tutkimus. Suurin osa naisista WHI olivat amerikkalaisen (93,2% tapauksista ja 80,3% hallintalaitteiden); oli hyvin vähän Aasian /Tyynenmeren Islander (n = 8) ja Latino (n = 20) tapauksessa. MEC mukana melkoinen määrä naisia ​​muilta rotua /etnistä ryhmää: 20,5% Afrikkalainen Amerikkalainen, 30,3% Japani, ja 18,7% Latino. Verrokkeihin verrattuna, tapaukset olivat painavampia, todennäköisemmin vähemmän syntymät, ja olla diabeetikko. Tapaukset olivat vähemmän todennäköisesti käytetään ehkäisytabletteihin tai on koskaan tupakoinut.

Huomasimme, että rs4430796 ja rs7501939 liittyi kohdun limakalvon syövän eurooppalaisessa amerikkalaiset MEC ja WHI (taulukko 2). Yhdistetty OR

kohden alleeli oli 0,83 (95% CI: 0,75, 0,92; p = 4,00 x 10

-4) varten rs4430796 (

G

alleeli) ja 0,79 (95% CI: 0,71 , 0,88; p = 1,30 x 10

-5) ja rs7501939 (

alleeli). Ei heterogeenisyys välillä tutkimuksissa havaittiin (P≥0.59). Rs4430796 ja rs7501939 olivat vahvoja kytkentäepätasapainossa (LD) eurooppalaisessa-Amerikan valvonta (r

2 = 0,61 MEC; r

2 = 0,66 WHI).

vuonna MEC, johdonmukainen yhdistysten havaittiin Afrikkalainen amerikkalaiset, hawaiians, japani ja Latinot, eli pienentää riskejä

G

alleelin rs4430796 tai

alleelin rs7501939 (taulukko 2). Vain pienellä määrällä ei-eurooppalaista syntyperää naisten WHI, erityisesti Aasian /Tyynenmeren Islander ryhmä (8 tapausta ja 161 valvontaa). Vuonna Afrikkalainen amerikkalaiset ja latinot, havaitsimme yhdenmukaisia ​​järjestöjen samankaltaiset kuin eurooppalaisten amerikkalaisia. Mitään näyttöä ei havaittu heterogeenisyyden syrjäisimmillä alueilla rodun /etnisyyden (P≥0.21). Yhdistämällä MEC ja WHI tuloksia, OR

per alleeli vaihteli 0,74 ja 0,80 rs4430796 ja välillä 0,73 ja 0,80 rs7501939 vuonna Afrikkalainen amerikkalaiset, aasialaiset /Tyynenmeren saarten asukkaat, ja latinot. Kaksi SNP olivat korkeat LD aasialaisilla (r

2 = 0,80) ja Latinot (r

2 = 0,65) ja alemman LD Afrikkalainen amerikkalaiset (r

2 = 0,33).

analyysi kaikista rodun /etnisyyden yhdisti, OR

kohden alleeli rs4430796 oli 0,80 (95% CI: 0,69, 0,93; p = 0,0048) ja 0,83 (95% CI: 0,75, 0,92; P = 0,00059) on MEC ja WHI, vastaavasti (taulukko 2). Kaikki ryhmät ”TAI

kohden alleeli rs7501939 oli 0,80 (95% CI: 0,68, 0,94; p = 0,0068) ja 0,79 (95% CI: 0,71, 0,88; p = 1,87 x 10

-5) in MEC ja WHI, vastaavasti. Kun yhdistimme tulokset MEC ja WHI, OR

kohden alleeli oli 0,82 (95% CI: 0,75, 0,89; p = 5,63 x 10

-6) ja rs4430796 ja 0,79 (95% CI: 0,73, 0,87; p = 3,77 x 10

-7) varten rs7501939. Ei heterogeenisyys välillä tutkimuksissa havaittiin (P≥0.70). Lisäsäätöjä tasavertaisuudesta, ehkäisytablettien käyttö, vaihdevuosien hormonien käyttö, tupakointi, diabetes tila ja kliinisen tutkimuksen osallistuminen (ruokavalion muutos, hormonihoito tai havainnointitutkimuksen) varten WHI oli vain vähän vaikutusta tuloksiin.

yhteenliittymien

HNF1B

SNP tyypin I ja tyypin II kasvaimia on esitetty taulukossa 3. molemmissa tutkimuksissa rs4430796 ja rs7501939 liittyi merkittävästi tyypin I kasvaimia. Molemmat SNP olivat myös yhteydessä alentuneeseen riski tyypin II kasvaimia, mutta yhdistys oli ainoa merkittävä rs4430796 että MEC. Ei ole todisteita heterogeenisuus tutkimusten välillä havaittiin (P≥0.18). Yhdistetty OR

kohden alleeli rs4430796 oli 0,83 (95% CI: 0,76, 0,90; p = 2,79 x 10

-5) I-tyypin kasvaimet ja 0,78 (95% CI: 0,61, 0,99; p = 0,041 ) tyypin II kasvaimia. Yhdistetty OR

kohden alleeli rs7501939 oli 0,80 (95% CI: 0,73, 0,87; p = 1,00 x 10

-6) I-tyypin kasvaimet ja 0,75 (95% CI: 0,58, 0,95; p = 0,020 ) tyypin II kasvaimia. Kumpikaan Tutkimuksessa havaittiin merkittäviä eroja yhdistysten

HNF1B

SNP tyypin I ja tyypin II kasvaimet (P≥0.19 että MEC, P≥0.80 vuonna WHI).

onko yhdistysten

HNF1B

variantteja ja kohdun limakalvon syöpä vaikutti diabetes, selvitimme OR SNP-kohdun limakalvon syövän suhde diabeetikoilla ja ei-diabeetikoilla erikseen (taulukko 4). Merkitseviä havaittiin vain keskuudessa ei-diabeetikoilla molemmissa tutkimuksissa. WHI, testin vuorovaikutus oli tilastollisesti merkitsevä rs4430796 (P = 0,028) ja raja merkittävä rs7501939 (P = 0,054). Merkittäviä yhteisvaikutuksia ei havaittu MEC.

Lisäksi tutkittiin vaikutusta muuttaminen yhdistyksen välillä

HNF1B

SNP ja kohdun limakalvon syöpä BMI, pariteetti, OC käyttö, vaihdevuosien hormonien käyttö ja tupakoinnista (taulukko S1 ja S2) ja ei havaittu huomattavia vuorovaikutusta.

keskustelu

Osoitamme, että

HNF1B

SNP (rs4430796 ja rs7501939) tunnistettiin äskettäin kohdun limakalvon syöpä GWAS [1] liittyvät endometriumin syöpäriskin kaksi riippumatonta tutkimusta, ja että yhdistykset havaittiin useissa rotuun /etnistä ryhmää. Samalla osoitetaan, että vastaavia yhteyksiä nähdään sekä tyypin I ja tyypin II kasvaimet ja kaikkiin luokkiin BMI, pariteetti, OC käyttö, vaihdevuosien hormonien käyttö ja tupakointi.

riskiestimaattien havaittu eurooppalaisten amerikkalaiset tässä tutkimuksessa (OR

rs4430796 = 0,83; OR

rs7501939 = 0,79) olivat samanlaiset kuin alkuperäisellä GWAS (OR

rs4430796 = 0,84; OR

rs7501939 = 0,85) [1]; merkittävin SNP on GWAS (rs4430796) ei kuitenkaan ollut voimakkaimmin liittyvän SNP tässä tutkimuksessa, joka on taustalla se, että kumpikaan SNP on syy SNP.

HNF1B

(ent kuten

TCF2

) on transkriptiotekijä, joka koodaa kolme isoformeja: isoformeja A ja B, jotka toimivat transkription aktivaattoreita ja isoformi C, joka toimii transkription repressori [14]. Harvinaiset mutaatiot

HNF1B

on liittynyt kypsyyttä diabetes nuoren alatyypin 5 (MODY5), munuaisten kystat, haiman surkastumista, ja kohdun poikkeavuuksia, joita epätäydelliset MUllerin kanava fuusio ja MUllerin kanava aplasia [15], [16]. Differential ilmentyminen

HNF1B

on yhdistetty eturauhasen syövän uusiutumista [17] ja differentiaalisen ekspression

HNF1B

isoformien on havaittu normaalissa eturauhasessa ja eturauhassyöpäkudoksille [18]. Toiminnallinen merkitys kaksi

HNF1B

SNP tutkittu tässä ei tunneta, vaikkakin lymfosyytti johdetun geenin ilmentymisen analyysi osoitti merkitsevästi yhteydessä rs4430796 ja

HNF1B

ilmentymistä yksilöissä Euroopan syntyperä muttei yksilöt Afrikkalainen syntyperä [1].

G

alleelin rs4430796 johon liittyy pienentynyt riski kohdun limakalvon syöpä, on liittynyt alentunut eturauhassyövän riskiä, ​​mutta ei muita syöpiä kuten rinta-, keuhko-, paksusuolen ja peräsuolen tai haiman syöpä tai melanooma [2]. Sama SNP alleeli on myös liitetty suurentunut riski tyypin 2 diabeteksen [3], [4]. Diabetes on kääntäen liittyy eturauhassyöpään [19], mutta positiivisessa yhteydessä kohdun limakalvon syöpä [20]. Siksi voimme odottaa, että SNP usein vaikuttavat samaan suuntaan molemmissa tuloksiin. Päinvastainen vaikutus rs4430796 diabeteksesta ja kohdun limakalvon syöpä, mutta ei kuvasta välistä positiivista diabeteksen ja kohdun limakalvon syövän riskiä. Havaitsimme merkittäviä assosiaatioita

HNF1B

variantteja ja kohdun limakalvon syöpä vain keskuudessa ei-diabeetikoilla molemmissa tutkimuksissa. Puuttuminen tilastollisen merkityksen diabeetikoilla johtuu todennäköisesti pieni määrä diabeetikoille ja siten rajallinen valta ( 40%) havaitsemisessa vaatimaton vaikutukset, jotka liittyvät näiden SNP. Havaitsimme myös mahdollinen vuorovaikutus

HNF1B

SNP ja diabetes asema WHI, mutta ei MEC. On mahdollista, että tämä ero johtui siitä, että suuruuden yhdistyksen välillä diabeteksen ja kohdun limakalvon syöpä vaihteli WHI (OR = 1,34; 95% CI: 0,93, 1,91) ja MEC (OR = 0,93; 95% CI: 0,64 , 1,36). Meidän analyysi korjattuna diabetes tila oli vain vähän vaikutusta SNP-endometriumsyöpään suhteita. Olipa diabetes tila vaikuttaa yhdistyksen välillä

HNF1B

ja kohdun limakalvon syöpä on siis edelleen epäselvä; tutkitaan mahdollisia vuorovaikutuksen diabetes aseman ja

HNF1B

muissa endometriumsyöpään tutkimuksissa on perusteltua.

vahvuuksia Tutkimuksemme kuuluu suhteellisen suuri otoskoko ja saatavuutta kattavan riskitekijä tietojen sekoitin säätö, sekä syntyperäisesti monipuolinen väestö. Rajoitukset ovat ei-keskitetty patologian tarkastelun määritettäessä kohdun limakalvon syöpä histologiaa, joka voi johtaa Luokitteluvirheillä tyypin I ja tyypin II kasvaimet ja voi laimentaa ero syrjäisimmillä alueilla, mahdollisesti näiden kahden ryhmän välillä.

Yhteenvetona tarjoamme lisää todisteita siitä, että

HNF1B

osallistuu kohdun limakalvon syövän etiologiassa. Tulevaisuuden projekteja, jotka sisältävät hienoksi kartoitus /sekvensoimalla

HNF1B

alue ja toiminnalliset tutkimukset ovat perusteltuja paikantaa syy variantit ja biologiset mekanismit kohdun limakalvon syövän syntymistä.

tukeminen Information

Taulukko S1 .

Gene-ympäristön välistä vuorovaikutusta

HNF1B

ja kohdun limakalvon syöpä riskitekijöiden naisten Health Initiative (WHI) -tutkimuksessa.

doi: 10,1371 /journal.pone.0030390.s001

(DOCX) B Taulukko S2.

Gene-ympäristön välistä vuorovaikutusta

HNF1B

ja kohdun limakalvon syöpä riskitekijöiden monikansaisen seurantatutkimus (MEC).

doi: 10,1371 /journal.pone.0030390.s002

(DOCX) B

Kiitokset

Tiedot ja materiaalien mukana tässä raportissa seurausta yhteistyönä PAGE konsortion, monietnisen kohorttitutkimuksessa (MEC) ja naisten Health Initiative (WHI).

kirjoittajat kiittää MEC kohortti jäseniä osallistumisesta ja tohtori Kristine Monroe hänen merkittävästä maksuosuudet toteuttamista monietnisen kohorttitutkimuksessa. Kirjoittajat kiittää WHI tutkijat ja henkilökunta omistautumisesta, ja tutkimukseen osallistujat ohjelman tekoon mahdollista. Täydellinen luettelo WHI tutkijat löytyy osoitteesta: https://www.whiscience.org/publications/WHI_investigators_shortlist.pdf.

Vastaa