Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

ennustaminen ennuste eturauhassyövän sairauksia geeniekspressioanalyysissä kiinnitetään yhä enemmän kiinnostusta. Monissa tapauksissa tällaiset analyysit perustuvat formaliinilla kiinnitetyt, parafiiniin (FFPE) ydin neulabiopsiaan materiaalia, johon Gleason arvosana diagnoosi on tehty. Koska jokainen potilas on yleensä useita biopsianäytteissä, ja koska Gleason luokittelu on operaattorista riippuvainen menettely tunnetusti vaikeaa, vaikutus operaattorin valintaan koepala arvioitiin.

Methods

Useita biopsianäytteissä 43 potilasta arvioitiin käyttäen aikaisemmin raportoitu geeni allekirjoitus IGFBP3, F3 ja VGLL3 mahdollisten ennusteen arvioinnissa arvioitaessa eloonjäämisaste diagnoosin eturauhassyövän. Neljän multiplex yhden askeleen qRT-PCR testipakkauksen, suunniteltu ja optimoitu mittaamaan allekirjoitettavaksi FFPE ydin neula biopsianäytteissä käytettiin. Yksimielisiksi geeniekspressiotasot välillä ensisijainen ja toissijainen Gleason kasvain kuvioita, sekä hyvän- kudosnäytteet, analysoitiin.

Tulokset

geeniekspressiotasot IGFBP3 ja F3 eturauhassyövässä epiteelin solu- sisältävä kudos edustaa ensisijainen ja toissijainen Gleason kuviot olivat korkeat ja johdonmukaisia, ja alhainen ilmaisi VGLL3 osoittivat suurempaa vaihtelua sen ekspressiotasoja.

Johtopäätös

arviointi IGFBP3 ja F3-geenin ilmentymisen tasoa eturauhasen syöpä kudos on riippumaton Gleason kuvioita, mikä tarkoittaa, että vaikutus operaattorin valintaan biopsia on alhainen.

Citation: Peng Z, Andersson K, Lindholm J, Bodin I Pramana S, Pawitan Y, et al. (2014) Riippuvat valinta Eturauhassyöpä Biopsia on rajallinen vaikutus Gene allekirjoitus Analyysi Highly ilmaistuna Geenit IGFBP3 ja F3 Eturauhassyöpä epiteelisolujen. PLoS ONE 9 (10): e109610. doi: 10,1371 /journal.pone.0109610

Editor: Natasha Kyprianou, University of Kentucky College of Medicine, Yhdysvallat

vastaanotettu: 4. kesäkuuta, 2014; Hyväksytty: 1. syyskuuta 2014; Julkaistu: 08 lokakuu 2014

Copyright: © 2014 Peng et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Data Saatavuus: Tällä kirjoittajat vahvistavat, että kaikki tiedot taustalla olevat havainnot ovat täysin saatavilla rajoituksetta. Kaikki asiaankuuluvat tiedot ovat paperi- ja sen tukeminen Tietopaketti.

Rahoitus: Tämä työ oli rahoitettu Uppsala Bio (https://www.uppsalabio.com/), Ruotsin Cancer Society (http: //www.cancerfonden.se/sv/Information-in-English/), kuningas Kustaa V Jubilee Foundation (https://www.rahfo.se/Metamenyn/In-English/), sekä Tukholman maakäräjien (http: //www.sll.se/om-landstinget/Information-in-English1/). Rahoittajat tukivat muodossa palkkojen Zhuochun Peng, Karolinska Institutet, mutta ei ollut mitään ylimääräistä roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Dr. Chunde Li on yksi mukana perustamassa, osakas ja sijainen hallituksen Chundsell Medicals AB, start-up yritys, jonka tavoitteena on kehittää Prostatype ® qRT-PCR kit perustuu aikaisemmin raportoitu allekirjoitus tutkimus mainitut referenssit. Hän on myös yksi keksijöistä Ruotsin patentin (SE 536352), jonka omistaa Chundsell Medicals AB. Zhuochun Peng toimii tieteellisenä neuvonantajana ja tuotepäällikkönä Chundsell Medicals AB, sen lisäksi, että osakkeenomistaja. Hän on myös yksi keksijöistä ruotsalaisen patentin (SE 536352), jonka omistaa Chundsell Medicals AB. Karl Andersson toimii tilastoja konsulttina Chundsell Medicals AB. Hän on sidoksissa Ridgeview Instruments AB, joka on sopimukseen kehittäjä Chundsell Medicals AB. Edellä kuvattu kilpailevan edun ei muuta tekijöiden noudattaminen PLoS One politiikkaa jakaa tietoja ja materiaaleja.

Johdanto

ennustaminen ennuste syöpäsairaus käyttämällä geenien ilmentymisen analyysi on lähestymistapa raportoitu käytettäessä kasvava määrä tutkimuksia [1]. Monille syöpä diagnoosit, kätevä ja helposti näytteen tyyppi on formaliinilla parafiiniin upotetut (FFPE) materiaalia joko biopsialaitteet tai kirurgisesti poistettu kasvain kudosta. Eturauhasen syöpä (PCA), FFPE koepaloja ovat helposti saatavilla kliinistä rutiinia patologian laboratorioissa ja sopivia tällaisia ​​analyyseja. Kuitenkin monissa tapauksissa useita koepaloja ovat saatavilla kullekin potilaalle, ja geenien ilmentymisen analyysi suoritetaan normaalisti vain yksi näyte per potilas. Tämä tarkoittaa sitä, että patologi on valittava joka koepala analysoitavaksi.

Gleason Score (GS) luokitusjärjestelmä on hallitseva histopatologiset luokittelu menetelmä eturauhassyövän ympäri maailmaa, niin tutkimuksessa ja kliinisissä rutiinia. Gleason on summa Gleason laatujen yleisin ja toiseksi yleisin kasvain kuvioita. GS on yksi tärkeimmistä kliinisten parametrien ilmaisemiseksi ennustetta selviytymisen eturauhassyöpäpotilailla. On kuitenkin suuri harmaa alue GS 7 suhteen selviytymisen eroja: esimerkiksi potilaille, joilla on GS 3 + 4 on paljon parempi ennuste kuin potilailla, joilla on GS 4 + 3 [2]. Se on yleisesti huomannut, että Gleason luokittelua, vaikka arvioitu taitava patologia, on operaattori riippuvainen menetelmällä. Tämä johtaa riskejä raportointiin kuin yhtäpitäviä tuloksia samasta kasvain materiaalista, erityisesti kun erotteleva 3 + 4 4 + 3 [3]. Tämäntyyppinen operaattorin riippuvuus voi olla vaikutusta geeniekspressioanalyysissä.

Tuoreessa raportissa meidän laboratorio osoitti, että geenien ilmentyminen allekirjoitus IGFBP3, F3 ja VGLL3 voisi arvioida eturauhassyöpä potilaiden eloonjäämiseen aikaan diagnoosi [4]. Kolme geenit valittiin vaiheittain lähtöpaineesta joukko 641 kantasolujen geenin ennustajia. Näin ollen tämä allekirjoitus mahdollisesti kaappaa kantasolujen taipumus tai ”stemness” syöpäsolujen riippumaton histopatologista alatyypin [4]. Se arvioitiin Ruotsin kohortti 189 PCa potilaista diagnosoidaan vuosien 1986 ja 2001 lähes valmiiksi seurannan kokonaiselossaolo tiedot. Tässä kohortissa, 78% potilaista hoidettiin ensisijaisesti hormonihoito vain. Geeniekspressiota allekirjoitus osoitettiin riittää luokitella potilaita korkean riskin, väli-riskin ja matalan riskin alatyyppejä.

IGFBP3, F3 ja VGLL3 geeni allekirjoitus tunnistettiin käyttämällä Fine neula pyrkimys (FNA) sytologia näytteitä . Nykyinen kliininen käytäntö eturauhassyövän diagnoosia on käyttää FFPE ydin neulabiopsian näytteitä. Etuna FFPE näytteitä on, että ne voidaan helposti arkistoida ja että monet kohortteja ovat pitkään seurannan kliiniset tiedot, mikä helpottaa kliinisiä tutkimuksia. Vaikka uutettu RNA FFPE näytteet voivat olla suhteellisen heikkolaatuista, useita viimeaikaiset tutkimukset ovat osoittaneet lupaavia tuloksia, kun käytetään hajonnutta RNA: ta uutettiin arkistointiin FFPE näytteiden mittaamiseksi geeni-ilmentymisen tasoja optimoitu qRT-PCR-menetelmillä [5] – [7]. Yksi esimerkki on Prostatype qRT-PCR kit, joka on kehitetty ja optimoitu mittaamaan geenin ekspressiotasot geenin allekirjoitus IGFBP3, F3 ja VGLL3 erityisesti FFPE näytteissä.

analyysi RNA: n ekspressiotasot FFPE biopsianäytteissä, on olemassa lukuisia tekijöitä, jotka vaikuttavat tuloksiin. Jokaisessa koepala on eri osa kasvain materiaalin ja säilytysolosuhteet voineet vaikuttaa RNA laatua eri tavoin. Tätä on olemassa useita tekijöitä analyysimenetelmän mukaisesti, joka aiheuttaa vaihtelua, niin että RNA tehokkuus, pipetointi virheitä, säilyvyyteen ajan, epäpuhtaudet, saastumisen jne.

Kun otetaan huomioon vaihtelevuus ja operaattori riippuvuutta Gleason pisteet ranking, tutkimme ilmentymistason IGFBP3, F3 ja VGLL3 useita koepalat saman potilaan ja keskittyi liittyvä vaihtelu hyvin valintaan jotka koepala analysoitavaksi. Tämä teki mahdolliseksi arvioida operaattorin valintaan näytteen mitattuun geenin ilmentymisen taso.

Materiaalit ja menetelmät

Ethics selvitys

tutkimusprotokolla hyväksyi tutkimuseettiseltä komitean Karolinska University Hospital (hyväksynnän numero: 00-164) ja suoritettiin mukaisesti eettisten periaatteiden kuvattu 1964 Helsingin julistuksen.

tietoisen kirjallisen suostumuksensa yleistä bio-pankki materiaalin kerääminen saatiin kaikki osallistujat mukaan Ruotsin bio-pankki laki, ennen niiden sisällyttämistä tutkimukseen.

FFPE eturauhasen ydin neulabiopsiat

FFPE eturauhasen ydin neulabiopsiaan kerättiin klo aika Eturauhassyövän diagnoosia mukaan rutiinitoimenpide käytetään Aleris Diagnostik AB (Aleris Medilab) Tukholmassa. Kunkin potilaan 6-10 neulabiopsiat otettiin Gleason luokittelua [2]. Koepaloja 43 potilasta diagnosoitu PCa välillä 2004-2007, jossa käytetään tässä tutkimuksessa. Loppuun asti 2013, 22 näistä potilaista oli kuollut Eturauhassyövän, 10 kuoli muiden sairauksien ja 11 oli vielä elossa. Kaikki koepaloja oli tallennettu Aleris Medilab biopankissa laitokseen sopivat olosuhteet FFPE näytteitä vähintään 6 vuotta ennen käyttöä tässä analyysissä.

Näytteiden valmistelu ja RNA

Näytteen valmisteluprosessi ennen että RNA on kuvattu vaihe vaiheelta seuraavasti.

vaihe a: leikkausnopeudesta of FFPE näytteistä.

FFPE ydin neulabiopsiat leikattiin erillisiin lohkoihin ja oli kiinnitetty huurrelasi liukuu olennaisesti mukaan rutiinien histopatologisten protokollat ​​[8], paitsi että DNaasi /RNaasitonta käytettiin vettä ja vaihe, jossa sulaa parafiinin kuivauksen jälkeen osat on jätetty pois. Ensimmäinen pätevä osa 5 um paksuus oli H 0,37; 2,61 /0,71, ja VGLL3, he olivat 5,12; 0,36; 5.91 /3.76. Tämän perusteella tyypillinen vaihtelu delta Ct arvot run juosta takia määritys sellaisenaan arvioitiin kahden keskihajonnan eli 0,84 varten IGFBP3, 0,74 F3 ja 0,72 varten VGLL3.

Kuva 1D , E, F osoittaa histogrammit JM (delta Ct) kolmen allekirjoituksen geenien verrattaessa primaarikasvaimen kuvion hyvänlaatuinen kudosta. Tässä vertailussa IGFBP3 johdonmukaisesti edellyttäen arvot samanlainen Diff (delta Ct) sisällä ensisijainen ja toissijainen syöpä näytteet jokaisesta potilaan (kuvio 1 D). Itse asiassa, ensisijainen kuvio oli lähes yhtä samanlainen kuin hyvänlaatuinen kaavaa toissijaiseen kuvio. F3, ensisijainen-hyvänlaatuinen samankaltaisuus oli alle ensisijainen keskiasteen samankaltaisuus (kuvio 1 E). VGLL3 osoitti suuri erotus (delta Ct) eroja ensisijaisen Gleason kasvain kuvio ja hyvänlaatuinen näyte (kuvio 1 F).

Vaihtoehtoinen tapa havainnollistaa eroja geenien ilmentymisen välillä ensisijainen ja toissijainen kasvain kuvioita on tehdä scatterplots delta Ct-arvoja mitataan näistä syövän näytteistä (kuvio 2). Tämän näkemyksen mukaan on selvää, että vertailtavuus on hyvä, erityisesti matalan delta Ct-arvoja, lukuun ottamatta muutamia harha (punaiset ympyrät). Alempi aste vertailtavuus VGLL3 johtuu pääasiassa eroista suurilla delta Ct-arvoja tarkoittaa suhteellisen alhainen ekspressiotasot (katkoviiva neliö).

Jotta mitata kuinka samanlaisia ​​ensisijainen ja toissijainen syövän näytteet olivat kannalta geeniekspressiotasot, ja edelleen että harha analyysissa syntyy scatterplots geeni-ilmentymisen tasoja kahden mittauksen. Ilmentymistasojen kolmen allekirjoituksen geenit on esitetty delta-Ct-arvot käyttämällä samaa yhtälöä, kuten on kuvattu kuvatekstissä kuvion 1 ensimmäisen ja toisen syöpään näytteen mittaukset viittaavat kahden mittauksen, joka sisältää ensimmäisen ja toisen yleisin Gleason kuvioita. Kaksi syöpien näytteiden 43 potilasta verrattiin käyttäen scatterplots. Punaiset ympyrät osoittavat poikkeavuuksien joita tutkittiin tarkemmin koskien kudosta tulon määrä ja prosenttiosuudet syövän epiteelisolujen. Katkoviiva neliö osoittaa VGLL3 mittauksia että oli korkea delta Ct-arvoja ja huono toistettavuus.

harha on scatterplots kolmen geenien kuvassa 2 (punaiset ympyrät) tutkittiin tarkemmin tarkistamalla kudos tulo, prosenttiosuudet syöpäsoluja merkityillä alueilla tai erityisen histopatologinen kuviot valittu syöpä alueilla. Suurin osa harha saatiin näytteistä, jotka oli jokin seuraavista ominaisuuksista: 0,1 mm

3 kudosta panos, joka sisältää 30% stromasoluja tai edustavat infiltratiivinen /kohdunkaulan syöpä tyyppi, jossa syöpäsolut yleensä kapseloidaan stroomasolut. Tämä kudostyypin löydettiin 4 5 harha varten IGFBP3, F3 3 5 ja VGLL3 4 6. Yksi potilas tuotettu harha kaikissa kolmessa vertailussa ja toinen potilas tuotti harha sekä F3 ja VGLL3. Jäljellä harha ei voitu selittää.

Keskustelu

Tämä työ arvioi operaattorin vaikutus jonka valinta koepala käytettäväksi geenien ilmentymisen analyysi. Minimoimiseksi yleistä vaihtelu testitulosten geenin ilmentymisen määrityksissä, on tärkeää arvioida vaihtelua aiheuttama subjektiivinen ja siten se mahdollisuus vähentää vaihtelua parantamalla käytännön menettelyjä. Itse asiassa tässä tutkimuksessa on kolme geeniä ilmaus allekirjoitus eturauhassyövässä sisältyi suuri osuus (80%) potilaista, joilla pariton Gleason pisteet kuten 3 + 4/4 + 3 (eli 7) tai 4 + 5/5 + 4 ( eli 9), jossa pidämme riski operaattorin virheet on suurin.

IGFBP3 ja F3 geenit osoittivat rajoitettu eroja ilmaisun tasoilla syövän epiteelisolujen näytteitä, kun verrataan delta Ct-arvoja eri koepalat peräisin sama potilas. Sisällä syöpäkudoksessa mittaukset edustavat eri histopatologisesti määrittää Gleason kuvioita, tyypillinen vaihtelu oli 1-2 delta Ct-arvo yksikköä. Verrattaessa koepala on hyvänlaatuinen solujen kanssa, ensisijaisen Gleason kuvio, samanlainen muutos havaittiin IGFBP3 ja hieman suurempi vaihtelu F3. Koska positiivinen kontrolli vaihtelu oli 0,7-0,8 delta Ct-arvo yksikköä, valinta biopsia on virhelähde ja vaihtelua samaa luokkaa kuin kokeessa itse.

vertailu delta Ct-arvoja kudosnäytteistä, jotka ovat peräisin saman potilaan voidaan toteuttaa monin eri tavoin. Pääsy useita koepaloja vain 43 potilasta, määrä sopivia menetelmiä verrataan lähtö on valitettavasti rajallinen. Olemme päättäneet käyttää histogrammeja esittää eroja, koska tämä on selkeä esimerkki jakelun eroja. Esimerkiksi kuviossa 1A on selvää, että suurin osa delta Ct eroja verrattaessa ensisijainen ja toissijainen syöpä näyte on välillä 0 ja 2 delta Ct yksikköä, mukana muutama poikkeavia havaintoja. Kaikki yritykset arvioida vastaavuustaulukkoa käyttämällä tilastollisia menetelmiä olisi voimakkaasti vääristyneinä poikkeavuuksien joten valinta histogrammin esitys tuloksista, mukana scatterplots.

mittaukset VGLL3 ekspressiotasoja osoitti suurempaa vaihtelua koepaloja, joka lähinnä johtui alhainen ilmentymistaso syöpäsolujen verrattuna kahteen muuhun allekirjoitus geenejä. Keskimääräinen delta Ct VGLL3 positiivinen kontrolli määrityksissä osoitti koetin ja alukkeet VGLL3 ovat riittävän toiminnallisia, mikä tarkoittaa, että ekspressiotaso VGLL3 on todella pieni eturauhasen kudosta. Tarkka kvantifiointi niin alhainen ekspressiotasoja voidaan todennäköisesti parantaa lisäämällä panos syövän kudoksen siten parantaa signaalin. Muita tekijöitä, jotka voivat vaikuttaa vaihtelevuus VGLL3 mittausten vaihtelua stroomasolulinja sisällön eri biopsianäyttei- tai epäyhtenäinen mRNA: n hajoamisen, mikä tarkoittaa, että VGLL3 saattavat kärsiä enemmän laajaa hajoamista kuin muut testatut geenit tai saattaa olla eri jaetaan epiteelin ja eri stroomasolut.

Mittaukset geenin allekirjoituksen hyvänlaatuisen kudoksen paljasti, että IGFBP3 johdonmukaisesti aikaan samanlaiset arvot kuin kasvainkudoksen samasta potilaasta, F3 oli samanlainen mutta suurempi vaihtelu, ja VGLL3 oli erittäin vaihteleva. Koska syöpä kudoksiin mittauksessa käytetty sisälsi eritasoisia stroomasolujen tämäntyyppinen analyysi on tärkeää oppia ohjaamaan operaattori koepalan valinnassa. Geenien ilmentyminen mittauksia sekä IGFBP3 ja F3, ensisijainen ja toissijainen kasvaimen malleja edellyttäen tulokset olivat yhteneviä, ja näissä tapauksissa oli tiedossa, että vain pieni osa kasvain näytteet todellisuudessa sisälsivät strooman soluja. Koska F3 menetti osien ilmentymisen tason vertailukelpoisuuden kohti hyvänlaatuinen kudokseen vain, on tärkeää, että on suuri osa kasvainsolujen kudosnäytteessä käytetään geeniekspressioanalyysiä varten. Nykyinen paras arvio on, että noin 2/3 kudoksen tulisi sisältää syöpää epiteelisolujen F3 tuottaa vertailukelpoisia tuloksia. Sillä VGLL3, vertailtavuus on heikko, mutta ei tiedetä, johtuuko tämä tämä geeni on eri ilmaistaan ​​kasvaimen vasta hyvänlaatuinen kudokseen, vuonna epiteelisyöpäsolujen versus stromasoluja tai jos tämä on yksinkertaisesti vaikutus teknisiä ongelmia mitattaessa heikosti ilmaisun tasoilla.

tärkeä havainto on, että vaikutus operaattorin valintaan joka koepala on ensisijainen kannalta kasvaimen pattern (Gleason kuvio) ei ole määräävä virhelähdettä kahden geenin, jotka olivat erittäin ilmaistaan, eli IGFBP3 ja F3. Tämä tarkoittaa sitä, että geeni-ilmentymisen analyysi käyttäen IGFBP3 ja F3 on epäherkkä kohtalainen erot Gleason luokittelu. Lisäksi on IGFBP3 ja F3 menettely on herkkä osa stroomasolujen, niin kauan kuin noin 2/3 kudos materiaali on syöpäsoluja. Nämä kaksi seikkaa ovat tärkeitä tekijöitä, jotka edistävät aidosti tavoite geenin ilmentymisen arviointiin potilaan, joka yhdistettynä perinteiseen kliinisten parametrien kuten Gleason voivat edistää tarkempi ennustetekijöitä lausuntoja. Toinen tärkeä havainto on, että koska ilmaisu näytteiden analyysin edustavat ensisijainen ja toissijainen kuviot on samanlainen IGFBP3 ja F3, ei ole tarpeen pitää ne erillään, mutta kaikki kasvaimen materiaalia yhdestä koepalasta voidaan todennäköisesti kootaan yhden injektiopullon geeniekspressioanalyysiä varten. Sillä VGLL3, kaikkein havaitut suuret erot tapahtui alhaisilla ekspressiotasoja. Vasta kun analyysimenetelmän on muutettu käsittelemään tällaisia ​​pieniä määriä, suorituskyky profiilin VGLL3 monelta kasvain kuvioita voidaan tutkia.

Usein kun ennustetyövälineenä tai diagnostinen geenin ilmentymisen paneeli on kehitetty suurille ja tuoreet (tai tuore) kudoksen kirurgisista näytteistä haaste luo siirtämään määrityksessä käsitellä näytteitä, jotka ovat saatavilla kliinistä rutiinia, erityisesti käyttäen biopsianäytteissä sisältävät pieniä syövän alueilla. FFPE kudosnäytteiden ovat yleisiä rutiinia syövän diagnostiikassa, mutta sisältävät huonompilaatuista DNA /RNA takia ankara kudosvalmistuksen vaiheet ja pitkäaikaiseen varastointiin. Tämä raportti osoittaa, että kahden erittäin ilmaisi geenejä, jonka valinta kudosnäytteestä analysoidaan on pieni (mahdollisesti) vaikutusta analyysitulos, joka on rohkaisevaa yleiseen tapaukseen siirtää geenin ilmentymisen määrityksissä tuoreista kudokset FFPE materiaalia .

varten käyttäen IGFBP3, F3, VGLL3 geeniekspressioprofiili tarjota täydentäviä tietoja ennustetta yksittäisen potilaan eturauhassyövän tauti, voimassa koetulokset vaaditaan. Tässä raportissa todetaan, että operaattori riippuvuus ei ole määräävä virhelähdettä IGFBP3 ja F3 tässä geeniekspressioprofiili, mikä on ensiarvoisen tärkeää käytännön toteutuksesta geenin ilmentymisen määritys rutiinikäyttöön. Geeniekspression profiilin parhaillaan arvioidaan eturauhassyövän potilaan tiedot, jotta se kykenee auttamaan tekemään prognostisissa päätöksiä, ja kyseisen tutkimuksen tuloksia raportoidaan myöhemmin.

Jos havainto raportoitu tässä raportissa osoittautuu yleensä todiste taustalla ”stemness” hypoteesia aloittamista ja etenemisessä (eturauhasen) syöpä vahvistuisi. Koska geeni-ilmentymisen tasoja IGFBP3 ja F3 ovat riippumattomia histopatologisia luokittelu eturauhassyövän alueella, sama kuin hyvänlaatuinen alueella, geeni allekirjoitus saattaa kuvastaa taustalla patogeeniset mekanismit eturauhassyöpää. Perustuen tähän havaintoon, määritys siirrot olisi suuri menestys-rate kliinisessä käytössä.

Yhteenvetona raportoimme että operaattorin valintaan joka koepala suorittaa geenien ilmentymisen analyysi ei ole hallitseva vaikutus tulokset IGFBP3 ja F3-geenin ilmentymisen mittaukset syövän epiteelisolujen. Analyysi VGLL3 geeniekspressiotasot hyötyisivät optimoinnin vuoksi yleensä pieni ekspressiotasoja.

tukeminen Information

Taulukko S1.