Krooninen sairaus

tiivistelmä

Tavoite

Tutkimus suunniteltiin arvioimaan mahdollisuutta käyttää kiertävän miRNA (seerumi miRNA) diagnostisia biomarkkereita kolorektaalisyövän syöpä (CRC) ja tunnistaa niiden mahdollisuus ehdokkaiksi täsmähoitoihin.

Methods

Tutkimukseen osallistui kaksi näytesarjan: 1- koulutusta joukko, johon kuului 90 potilasta, joilla peräsuolen liittyvät sairaudet (30 CRC, 18 joilla on tulehduksellinen suolistosairaus (IBD), 18 koolonpolyyppien (CP) ja 24 eri paksusuolen oireita, mutta ilman colonoscopic poikkeavuus, jotka oli otettu kuin kontrolliryhmä) ja 2- validointi joukko, johon kuului 100 CRC potilasta. Seerumin miRNA poimittiin kaikki aiheet arvioimaan ekspressioprofiileja seuraaville miRNA (

miR-17

,

miR-18a

,

miR-19a

,

miR-19b

,

miR-20a

,

miR-21

,

miR-146a

,

miR-223

,

miR-24

,

miR-454

,

miR-183

,

miR-135a

,

asennuspalveli- 135b ja asennuspalveli- 92a

) muokatuilla miScript miRNA PCR-pohjainen sybergreen array. Viljelyala vastaanotin toimii ominaiskäyrä (AUC) käytettiin arvioimaan diagnostinen suorituskyky tutkittu miRNA paksusuolisyövän diagnoosia.

Tulokset

Data-analyysi miRNA koulutuksesta joukko osoitti, että ; vertailuryhmän ryhmään, vain

miR-19b

oli merkitsevästi säädelty potilailla, joilla on IBD ryhmä (fold muutos = 5,24, p = 0,016), kun taas potilailla, joilla on paksusuolen polyypit,

miR-18a

oli merkitsevästi sääteli (kertainen muutos = 3.49, p-arvo = 0,018). Toisaalta,

miR-17

,

miR-19a

,

miR-20a ja

miR-223

merkittävästi sääteli ( kertainen muutos = 2,35, 3,07, 2,38 ja 10,35, vastaavasti ja p-arvo = 0,02, 0,015, 0,017 ja 0,016, vastaavasti CRC potilailla. kuitenkin validointi asettaa osoittivat, että vain

miR-223

oli huomattavasti ylöspäin -regulated CRC potilailla (fold muutos = 4,06, p-arvo = 0,04).

Johtopäätös

Aberrant miRNA ilmaisuja erittäin osallistuvat lukuisiin peräsuolen syövän synnyn. Olemme havainneet, että (

miR-17

,

miR-19a

,

miR-20a ja miR-223

) voitaisiin käyttää diagnostisina biomarkkereita CRC. Toisaalta,

miR-19b

ja

miR-18a

voitaisiin käyttää diagnostisia biomarkkereita CP ja IBD vastaavasti.

Citation: Zekri A-RN, Youssef ASE-D, Lotfy MM, Gabr R, Ahmed OS, Nassar A, et al. (2016) Circulating Serum miRNA kuin Diagnostic tussit peräsuolen syövän. PLoS ONE 11 (5): e0154130. doi: 10,1371 /journal.pone.0154130

Editor: Shrikant Anant, University of Kansas School of Medicine, Yhdysvallat |

vastaanotettu: 08 marraskuu 2015; Hyväksytty: 10 huhtikuu 2016; Julkaistu: 02 toukokuu 2016

Copyright: © 2016 Zekri et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Data Saatavuus: Tiedot ovat saatavilla figshare seuraavasta linkistä: https://figshare.com/articles/Circulating_serum_miRNAs_as_diagnostic_markers_for_colorectal_cancer/3084625.

Funding: Nämä kirjoittajat eivät tuki ja rahoitus raportoida.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

peräsuolen syöpä (CRC) on yksi yleisimmät pahanlaatuiset kasvaimet maailmanlaajuisesti, on toiseksi naisilla ja kolmas miehillä 1,2 miljoonaa vuotuista uusia tapauksia maailmanlaajuisesti [1]. Huolimatta lisääntynyt tietoisuus sekä parantunut seulonta suosituksia ja tekniikoita, CRC edelleen toiseksi suurin syy syöpään liittyvät kuolemat miehillä ja naisilla [2] ja on vastuussa 10% syöpää liittyvää kuolleisuutta maailmanlaajuisesti [3].

aiemmin on osoitettu, että potilailla, joilla on tulehduksellinen suolistosairaus (IBD) on yleensä liittyy lisääntynyt riski etenemisen epiteeli- dysplasia ja CRC [4, 5].

miRNA edustavat mielenkiintoinen luokka pieniä (18-25 nukleotidia pitkä) ei-koodaavaa RNA: t, jotka toimivat posttranskriptionaalisella sääntelyviranomaisten geenien ilmentymisen kautta sitoutumalla 3`untranslated alueita (UTR) kohde mRNA: iden ja edistävät mRNA: n hajoamisen tai translaation tukahduttaminen [6]. Se seikka, että miRNA rooli syövän biologian tukivat todennut, että yli 50%: n miRNA-geenit sijaitsevat hauras sivustoja ja alueiden poistamista tai monistuksia, jotka ovat muuttuneet erilaisissa ihmisen syövän [7]. Kumulatiivinen näyttöä siitä, että jotkut miRNA voi käyttäytyä joko oncomirs tai tuumorisuppressorigeeneille kaskadissa on CRC.Therefore, niillä potentiaali voidaan käyttää diagnostisina, prognostista tai terapeuttista kasvainmerkkiaineet [8].

Eri tutkimukset ovat ilmoittaneet merkittävistä muutoksista miRNA ekspressiotasot CRC kudoksissa verrattuna normaaliin paksusuolen epiteelin, ja tunnistaa ryhmät miRNA jotka mahdollistavat ennustetekijöiden kerrostuneisuus CRC potilaista [9]. Tässä yhteydessä lisääntyneen ekspression monia miRNA, jotka välittävät solujen kasvua ja kasvaimen etenemisen, raportoitiin veressä ja /tai kudoksissa CRC tapauksissa käyttämällä miRNA microarray-määritystä, joka

sisältyvät miR-20

,

miR-21

,

miR-17-5p

,

miR-15b

,

miR-181B

,

miR-191 ja miR-200c

[10, 11]. Läsnäolo miRNA seerumissa, plasmassa ja muiden kehon nesteiden, kuten virtsan, syljen, ja lapsivesi kannusti miRNA tutkimusta, koska tämä helpottaa niiden havaitsemista ja tekee niistä ihanteellisia ehdokkaita kuin ei-invasiivisia biomarkkereita varhaisen havaitsemisen ja seurannan taudin etenemiseen [12].

tavoitteena nykyisen tutkimuksen tarkoituksena on arvioida rooli poikkeavien miRNA ilmaisujen kehittymistä ja etenemistä CRC tapauksista. Työ toteutettiin tutkimalla ekspressiotasot 14 miRNA eri vaiheissa peräsuolen syövän synnyn Cascade. Rationaalinen valintaan tutkittiin 14 miRNA perustui ennen viittauksia, jotka havainnollistetaan niiden roolia peräsuolen syövän synnyn (S1 taulukko).

Potilaat ja menetelmät

Tutkimusasetelma

Kaksi itsenäistä näytejoukoille olivat mukana tässä tutkimuksessa (harjoitussarjassa ja validointi asetettu). Harjoitussarjassa mukana 90 potilasta, jotka osallistuivat maha tähystykseen yksikkö trooppisen lääketieteen osasto, Kasr El-Aini School of Medicine, Kairon yliopisto; välisenä aikana tammikuussa 2011 maaliskuussa 2012. Perustuen colonoscopic tulosten ja histopatologinen tutkimus tutkituissa tapauksissa potilaat luokiteltiin neljään ryhmään; 30 potilaalla on CRC, 18 joilla on tulehduksellinen suolistosairaus (IBD), 18 koolonpolyyppien (CP) ja 24 eri paksusuolen oireita, mutta ilman colonoscopic poikkeavuus, joka toimi vertailuryhmällä. Validointi joukko mukana 100 CRC tapauksissa jotka diagnosoidaan ja hoidetaan National Cancer Institute, Kairon yliopisto aikana tammikuusta 2013 maaliskuu 2014 kirjallinen suostumus saatiin kunkin potilaan hyväksymisen jälkeen eettisen valiokuntien NCI ( National Cancer Institute), Kairon yliopisto. IRB jäsenet ovat professori Ahmed Morsi Mostafa, varadekaani korkeakoulu- ja tutkimusministeri; Prof.Wahid Yousry johtaja Surgical Oncology Dept .; Prof. Emad El-Gemaei, Head of Pathology Dept .; Prof. Rabab Gaafar, johtaja Medical Oncology Dept .; Prof. Mahmoud El Gebaly, johtaja Clincal Pathology Dept .; Prof. Mervat El Nagar, johtaja Sädehoito Dept .; Prof. Sabry Shaarawy, johtaja syöpäbiologian Dept .; Prof. Ikram Hamed, johtaja röntgendiagnostiikkaan Dept .; Prof. Mai Helali, johtaja Anathesia ja Pain ohjaus Dept .; Prof. Nelly Hassan, johtaja Cancer Epidemiology ja biostatistiikan Dept.and Dr. Atef Badran, Senior of Clinical Data Manager. Organisaatio No.IORG0003381. IRB NO.IRB00004025.

seeruminäytteitä kokoelma

alkaen kunkin potilaan ja valvonnan kohteena, 5 ml laskimoverta saatiin, sentrifugoitiin ja seerumi erotettiin. Kaikki seeruminäytteet varastoitiin -80 ° C: ssa, kunnes ne käytettiin.

RNA ja qRT-PCR

Kokonais-RNA mukaan lukien miRNA uutettiin seerumista käyttäen miRNeasy Mini Kit (Qiagen, Saksa, Cat . No.217004). Mukaan valmistajan ohjeiden, c-DNA-synteesi suoritettiin käyttäen miScript II RT -kittiä (Qiagen, Cat. No.218161). Kvantitatiivisen tosiaikaisen PCR: n (qRT-PCR) suoritettiin käyttäen miScript syber vihreä PCR -kittiä (Qiagen, Cat. No.218075). Geeniekspressioprofiilien syntyi 96-taulukoihin käyttäen mukautettua miScript miRNA PCR array seuraaville MikroRNA (

miR-17

,

miR-18a

,

miR-19a

,

miR-19b

,

miR-20a

,

miR-21

,

miR-146a

,

miR-223

,

miR-24

,

miR-454

,

miR-183

,

asennuspalveli- 135a

,

asennuspalveli- 135b ja miR – 92a

) B (Qiagen, Cat. No. CM1HS0064C) mukaan valmistajan ohjeen seuraavasti: 15 min 95 ° C: ssa 1 sykli, 15s 94 ° C: ssa, 30 s 55 ° C: ssa , ja 30 s 70 ° C: ssa 40 sykliä käyttäen AB 7500 Fast Real-Time PCR-järjestelmä. Kynnyssyklistä tulokset analysoitiin käyttämällä RT2 Profiler-ohjelmiston (versio 3.4; SABiosciences). Suhteellinen geeniekspressiotasot normalisoitiin housekeeping-geeni (SNORD 68) ja kannen muutokset kohdegeenin (t) ekspressio suhteessa kuin kontrolliryhmän analysoitiin 2-ΔΔCT menetelmällä.

Tilastollinen analyysi

suhteellinen ilmentyminen miRNA analysoitiin käyttämällä SABiosciences ohjelmistoja ja p-arvo laskettiin Studentin t-testi rinnakkaisten 2 ^ (- Delta Ct) arvot kullekin geenin kontrolli- ja hoitoryhmien. P-arvo alle 0,05 pidettiin merkittävänä. Vastaanotin-toiminta-(ROC) käyriä ja alue käyrän alla (AUC) arviointiin käytettiin diagnostista tarkkuutta seerumin miRNA. Asiaa kliinis määritettiin yksisuuntaisella ANOVA kvantitatiivista tietoa ja X

2 testi laadullista tietoa. Kaikki testit olivat 2-puolinen ja p-arvo 0,05 katsottiin tilastollisesti merkitsevä. Tilastollinen analyysi tukeutunut SPSS 17.0 ohjelmistolla (SPSS Ltd., UK) ja kuvaajat muodostettiin kanssa Graph pad Prism 5.0 (GraphPad Software Inc, USA).

Tulokset

Kliiniset piirteet tutki ryhmiä

Mitä harjoitussetti keskimääräinen ikä CRC potilaista (51,10 ± 10) oli merkittävästi suurempi kuin muissa ryhmissä (p-arvo 0,05). Kuitenkaan mitään merkittävää eroa raportoitu välinen keskimääräinen ikä kontrolliryhmässä (43,7 ± 14,2) ja ne, joilla CP (40,00 ± 15,0) ja IBD (41,6 ± 15,4) tai sukupuoli kaikkien ryhmien (p-arvo 0,48) . Lisäksi oli tilastollisesti merkitseviä eroja tutkituissa ryhmissä suhteessa vatsakipua, lima, painonlasku ja anemia (p-arvo 0,05). Mitä validointi asetettu, ei ollut merkitsevää eroa keski-ikä CRC ryhmässä (46,7 ± 14,5) ja kontrolliryhmän (43,7 ± 14,2) tai sukupuoli näiden kahden ryhmän välillä. Oli kuitenkin tilastollisesti merkitseviä eroja CRC ryhmän ja kontrolliryhmän suhteessa vatsakipua, lima, painonlasku ja anemia (p-arvo 0,05), kuten on esitetty (taulukko 1).

Differential ilmentymistä tutkittiin miRNA on tutkittu ryhmissä verrattuna kontrolliryhmään koulutuksessa asetettu

kaikista tutkittu miRNA vain

miR-19b

oli merkitsevästi säädellään ylöspäin IBD ryhmä (fold muutos = 5,24, p-arvo = 0,016) (kuvio 1 ja taulukko 2), kun taas

miR-18a

oli merkitsevästi ylös säädellään CP ryhmässä (fold muutos = 3.49, p-arvo = 0,018) (kuvio 2 ja taulukko 3) ja

miR-17

,

miR-19a

,

miR-20a ja miR-223

merkittävästi säädellään ylöspäin CRC ryhmä (fold muutos = 2,35, 3,07, 2,38 10,35 ja p-arvo = 0,021, 0,015, 0,017 0,0166 vastaavasti), kuten on esitetty (kuvio 3 ja taulukko 4).

A) Volcano tontti näyttää ero ilmentymistä 14-miRNA in IBD ryhmässä verrattuna kontrolliryhmään.

miR-19b

merkittävästi ylös säännelty. B) ROC-käyrä analyysi

miR-19b

välillä IBD ryhmän ja kontrolliryhmän.

A) Volcano tontti näyttää ero ilmentymistä 14-miRNA paksusuolen polyypit ryhmä vs. kontrolliryhmässä.

miR-18a

merkittävästi ylös säännelty. B) ROC-käyrä analyysi

miR-18a

välillä koolonpolyyppien ryhmän ja kontrolliryhmän.

miR-17

,

miR-19a

.

miR-20a ja miR-233

kasvoi merkittävästi säädellä. B) ROC-käyrä analyysi

miR-17

,

miR-19a

.

miR-20a ja miR-233

välillä CRC ryhmän ja kontrolliryhmän. C) clustergram suorittaa hierarkkinen klusterointi koko aineisto näyttää lämmön kartta dendrogrammissa osoittaa co geenien poikki ohjaus, IBD, paksusuolen polyypit ja CRC potilaista.

Kun verrataan CRC ryhmä (pahanlaatuinen) vs. muut ryhmät (ei-pahanlaatuinen); vain miR-223 oli merkittävästi ylöspäin säädetty (fold muutos = 4,49, p-arvo = 0,002), kuten on esitetty (taulukko 5).

Kuitenkin vain

miR-135b

ja

miR-454

laskivat tuntuvasti säännelty CRC ryhmässä verrattuna IBD ryhmään (fold muutos = 0,24 0,44 ja p-arvo = 0,023 0,018 vastaavasti), kuten on esitetty S2 taulukossa. Vaikka

miR-135a

ja

miR-135b

olivat merkittävästi säädellä vähentävästi CP ryhmässä verrattuna IBD ryhmään (fold muutos = 0,12, 0,09 ja p-arvo = 0,019 ja 0,018 vastaavasti ) kuten on esitetty S3 taulukossa.

Differential ilmentymistä tutkittiin miRNA CRC ryhmässä verrattuna kontrolliryhmään validoinnissa asetettu

kaikista tutkittu miRNA vain

miR-223

merkittävästi säädellään ylöspäin CRC ryhmässä (fold muutos = 4,06, p-arvo = 0,04), kuten on esitetty (taulukko 6). Kun jakaminen CRC potilaiden validointi asetettu osaksi miesten ja naisten ryhmiä; huomasimme, että

miR-19a

,

miR-19b

, ja

miR-20a

merkittävästi ylöspäin säännelty naisten CRC potilaista verrattuna kontrolliryhmään (kertainen muutos = 2,8, 4,1 2,2 ja p-arvo = 0,021, 0,023 0,04 vastaavasti), kuten on esitetty S4 taulukossa. Toisaalta, vain

miR-17

oli merkitsevästi säädellään ylöspäin miesten CRC potilaista verrattuna kontrolliryhmään (kertainen muutos = 2,1, p-arvo = 0,03), kuten esitetään S5 taulukossa.

ROC käyrä analyysi ilmentyvät eri miRNA

erotteleva CRC ryhmä kontrolliryhmässä; olemme havainneet, että

miR-223

(AUC 0,838), miR-17 (AUC 0,813),

miR-19a

(AUC 0,825) hallussaan tarkempaa diagnostista suorituskykyä kuin

miR-20a

(AUC 0,788). Toisaalta,

miR-18a

(AUC 0,8) osoitti hyvää diagnostinen suorituskyky erottelee IBD ryhmä kontrolliryhmässä. Myös

miR-19b

(AUC 0,875) oli hyvä diagnostinen suorituskyky erotteleva CP ryhmä kontrolliryhmän esitetyllä tavalla (taulukko 7).

Keskustelu

tutkimuksessa arvioitiin mahdollisuutta käyttää eri kiertävän miRNA kuin serologisen biomarkkereita havaitsemiseen CRC. Tutkimuksemme oli asianmukaisesti suunniteltu myös tapauksia eri vaiheissa peräsuolen liittyvien sairauksien eli potilailla, joilla on tulehduksellinen suolistosairaus (IBD), adenomatous koolonpolyyppien (CP) ja CRC.

Tulokset paljastivat, että oli merkittävää säätelyn

miR-17

,

miR-19a

,

miR-20a

ja

miR-223

CRC ryhmässä verrattuna kontrolliryhmään.

miR-17

,

miR-20a ja miR-19a

kuuluvat Polykistroninen

miR17-92

klusteri (

miR-17

,

miR-18a

,

miR-19a

,

miR-19b

,

miR-20a

,

ja miR-92a

), joka sijaitsee 13q31.3; kasvupaikalla, joka on usein monistettu kolorektaalisyövässä [13, 14]. Meidän havainto merkittävistä säätely ylöspäin

miR-20a

tuli mukaisesti aiempien tulosten Xu ym., Jotka havaitsivat, että säätely ylöspäin

miR-20

liittyi kasvain invaasion ja imusolmuke etäpesäke HCC potilaista [15]. Joten,

miR-20a

saattaa olla mahdollinen kasvain kasvaimia synnyttävän toiminnon CRC. Lisäksi

miR-20a

edistää epiteelin ja mesenkymaalitransitioon (EMT), tärkeä askel tuumorimetastaasissa, johon pyritään tuumorisuppressorigeenin (kudos estäjä matriisimetalloproteinaasi 3 (TIMP-3)); negatiivinen säätelijä matriisin metalloproteinaasi 2 (MMP2) ja matriksin metalloproteinaasi 9 (MMP-9), joka välittämä soluväliaineen (ECM) hajoaminen [15]. Myös miR-20a kohdistuu aktivoimalla jäsenet

E2F

perheelle, myös solusyklin ja apoptoosin säätelygeenit, mikä G1 S-vaiheeseen siirtymistä. Kuitenkin korkea E2F proteiinien, erityisesti E2F1, voi aiheuttaa apoptoosin joka toimii hätäjarruna yli jakautuvat solut. Kasvaimia synnyttävän toiminnon

miR-20a

ehdotettiin estää tämän hätäjarrun toiminta E2F tekijöitä ja siten stimuloida kasvaimen kasvua [16]. Lisäksi

miR-20a

ohjaa solusyklin etenemisen kohdistamalla sykliiniriippuvainen estäjät, CDKN1A /p21; tärkeä säätelijä G2 /S siirtyminen [17]. Lisäksi miR-20a tavoitteet tuumorisuppressoriproteiinia PTEN; joka on negatiivinen säätelijä onkogeenisten prosurvival PI3K \\ AKT-reitin aktivaation [18, 19]. Tuloksemme koskevat säätelyä

miR-17a

ja

miR-19a

CRC potilaat ovat verrattavissa aikaisempien raporttien kirjallisuudessa [9, 16-19]. Samoin

miR-20a

,

miR-17a

osoitettiin edistää solusyklin etenemisen kohdistamalla CDKN1A /p21 ja E2F [16, 17], kun taas kasvaimia synnyttävän potentiaalin

miR -19a

saavutetaan pääasiassa suunnattu PTEN; siten edistäen onkogeenisel- pro-selviytymisreittiin [9, 18-20].

koskevat tiedot

miR-223

yli ilmentymistä CRC ryhmässä ovat yhdenmukaisia ​​niiden kanssa Huang

et al

joka arvioi ekspressiotasojen miRNA plasmassa 100 CRC potilailla ja 37 potilailla, joilla on paksusuolen adenoomia verrattuna 59 terveillä henkilöillä. Joukossa niiden paneeli, 12 miRNA olivat jopa säännelty, kuten

miR-223

[21]. Samoin Li

et al

. raportoitu, että yli-ilmentyminen

miR-223

in neoplastiset paksusuolen kudoksiin verrattuna viereiseen ei-syöpä ne [22]. Kasvaimia synnyttävän toiminnon

miR-223

CRC saavutettiin kohdentamalla FOXO1 [23] ja RASA1 [24]. FOXO1 kuuluu FOX transkriptiotekijöiden-O subfamily. Se säätelee transkription aktiivisuus eri geenejä, mukaan lukien p21, ja siten estää solusyklin etenemisen [25, 26] osuutensa oli Toisaalta, RASA1, RAS signalointi terminaattori, joka liittyy kasvaimen etenemistä [27]. Lisäksi Li

et al

. osoittivat, että

miR-223

voidaan pitää huono prognostinen markkeri, koska se on ohi ilmaisu korreloi merkittävästi korkean TNM, solmukohtien ja etäinen etäpesäkkeitä sekä pienemmällä eloonjäämiseen hinnat [22]. Tuloksemme osoittivat myös, että merkittävä säätelyn

miR-18a

potilailla, joilla on CP verrattuna kontrolliryhmään. Tuloksemme tukevat aiemman raportin Wu et al., [28], jotka osoittivat, että

miR-18a

näyttelee onkogeenisessä rooli peräsuolen syövän synnyn kautta alas sääntely ataksia teleangiektasiaa mutatoitunut geeni (ATM); keskeinen entsyymi korjaus DNA double-säikeen katkoksia. Lisäksi, se fosforyloi useita tärkeitä proteiineja, jotka aloittavat aktivointi DNA-vaurion tarkistuspisteen, mikä johtaa solusyklin pysähtymisen, DNA: n korjaukseen tai apoptoosin [29].

Kuten

miR-19b

merkittäviä up asetus raportoitu potilailla, joilla IBD verrattuna kontrolliryhmään. Jiang et al. osoitti, että sekä

miR17

ja

miR-19b

kuuluva

miR-17-92

klusteri, estävät Treg solujen erilaistumista ja edistää Th1 vastaukset [30]. Th1 on vastuussa tulehdusta vasteen kautta erittävien ja IL12, IL2, IL6, IFN ja TNF [31]. Jälkimmäinen (TNF) on tärkeä rooli tulehduksen prosessin kautta NF-kB-reitin; prototyyppinä tulehdusta signalointireitille [32]. Mahdollisia mekanistinen tärkeässä tehtävässä miRNA CRC, IBD ja paksusuolen polyypit ryhmissä verrattuna kontrolliryhmään ja niiden loppupään tavoitteita havainnollistetaan ehdotetut sarjakuva (kuvio 4).

Red tähti osoittaa merkittävää miRNA CRC kun taas keltainen tähti osoittaa huomattavia miRNA IBD ja vihreä tähti osoittaa miRNA paksusuolen polyypit. Nuoli osoittaa aktivoitumisen kun ympyrän lopussa viiva osoittaa eston.

Red tähti osoittaa merkittävää miRNA CRC kun keltainen tähti osoittaa merkittävää miRNA IBD ja vihreä tähti osoittaa miRNA paksusuolen polyypit. Nuoli osoittaa aktivoitumisen kun ympyrän lopussa viiva osoittaa eston.

lisäanalyysi dataa (ROC) analyysi käyrä ja vastaava AUC yritettiin varten merkittävä miRNA kussakin Parittainen vertailu tutkia niiden diagnostinen tarkkuus. ROC-käyrä analyysi yksittäisten miRNA paljasti, että

miR-17

,

miR-19a

,

miR-20a miR-223

voidaan tehokkaasti erottaa CRC ryhmän ja kontrolliryhmän. Kuitenkin

miR-18a

oli hyvä diagnostinen tarkkuus erotteleva CP ryhmä kontrolliryhmässä. Toisaalta,

miR-19b

oli hyvä diagnostinen tarkkuus erottelee IBD ryhmä kontrolliryhmään.

Johtopäätöksenä

Aberrant miRNA ilmaisuja erittäin mukana lukuisiin peräsuolen syövän synnyn. Olemme havainneet, että (

miR-17

,

miR-19a

,

miR-20a

ja

miR-223

) voitaisiin käyttää diagnostisina biomarkkereita CRC. Toisaalta,

miR-19b

ja

miR-18a

voitaisiin käyttää diagnostisia biomarkkereita CP ja IBD vastaavasti.

tukeminen Information

S1 Taulukko. Rationaalinen valita tutkituissa 14 miRNA perustuu ennalta viittauksia.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0154130.s001

(DOC)

S2 Taulukko. Differential ilmentyminen tutkittiin miRNA CRC ryhmässä verrattuna IBD ryhmä.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0154130.s002

(DOC)

S3 Taulukko. Differential ilmentyminen tutkittiin miRNA CP ryhmässä verrattuna IBD ryhmä.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0154130.s003

(DOC)

S4 Taulukko. Differential ilmentyminen tutkittiin miRNA naisten CRC ryhmässä verrattuna kontrolliryhmään ”Validation Set”.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0154130.s004

(DOC)

S5 Taulukko. Differential ilmentyminen tutkittiin miRNA miespuolisilla CRC potilailla verrattuna kontrolliryhmään ”Validation Set”.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0154130.s005

(DOC) B

Kiitokset

Tunnustamme Yasser Mabrouk Bakr hänen neuvoja tilastolliseen analyysiin.