Krooninen sairaus

tiivistelmä

lymfotoksiini-alfa (LTA) on tulehdusta edistävä sytokiini, jolla on tärkeä rooli tulehdus- ja immunologisten vastauksen. Lukuisat tutkimukset ovat osoittaneet

LTA

polymorfismien riskitekijöiksi syöpiin, mutta tulokset eivät ole olleet yksimielisiä. Tavoitteena olevan meta-analyysit on luoda assosiaatioita syövät ja neljä

LTA

variantteja (rs1041981, rs2239704, rs2229094 ja rs746868). Kaikkiaan 30 tapausverrokkitutkimukset mukana 58649 osallistujaa sisällytettiin nykyiseen meta-analyysit. Tuloksemme osoittivat merkitseviä lisääntynyt syöpäriski rs1041981 (odds ratio (OR) = 1,15, 99% luottamuksellisia välein (CI) = 1,07-1,25, P 0,0001, I

2 = 12,2%), rs2239704 (OR = 1,08, 99% CI = 1,01-1,16, p = 0,021, I

2 = 0,0%) ja rs2229094 (OR = 1,28, 99% CI = 1,09-1,50, p = 0,003, I

2 = 0.0 %). Mitään näyttöä ei löytynyt yhteydestä rs746868 ja syövän riskiä (OR = 1,01, 99% CI = 0,93-1,10, p = 0,771, I

2 = 0,0%). Alaryhmää meta-analyysi viittasi siihen, että rs2239704 todennäköisesti lisäävät hematologiseen pahanlaatuisuuteen (OR = 1,10, 99% CI = 1,01-1,20, p = 0,023, I

2 = 0,0%), ja rs2229094 oli spesifinen lisääntynyt riskiä adenokarsinooma (OR = 1,33, 99% CI = 1,11-1,59, p = 0,002, I

2 = 0,0%). Lopuksi todettakoon, että meta-analyysit ehdotti, että

LTA

rs1041981, rs2239704 ja rs2229094 polymorfismien osaltaan suurentunut syöpiä. Tulevaisuuden toiminnallinen tutkimukset olivat tarpeen selventää mekanistinen rooleja kolme varianttien syöpäriskin.

Citation: Huang Y, Yu X, Wang L, Zhou S, Sun J, Feng N, et al. (2013) Neljä geneettisten polymorfismien lymfotoksiini-alfa-geenin ja syöpäriski: järjestelmällinen katsaus ja meta-analyysi. PLoS ONE 8 (12): e82519. doi: 10,1371 /journal.pone.0082519

Editor: Anil Kumar, University of Missouri-Kansas City, Yhdysvallat

vastaanotettu: 18 elokuu 2013; Hyväksytty: 24 lokakuu 2013; Julkaistu: 12 joulukuu 2013

Copyright: © 2013 Huang et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tutkimus tukivat avustuksia National Natural Science Foundation of China (31100919), Natural Science Foundation of Zhejiang (LR13H020003), Lääketiede ja terveys tieteen ja teknologian hankkeita Zhejiangin maakunnassa (2010KYB094, 2013KYB233), KC Wong Magna Fund Ningbo University, Ningbo sosiaalisen kehityksen tutkimushankkeisiin (2011C50028, 2012C50027, 2012C50032), ja tieteellinen Innovation Team Project Ningbo (2011B82014), ja Advanced keskeisillä tieteen ja teknologian ohjelmat Ningbo (2011C51005). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Kun suuri esiintyvyys ja kuolleisuus, syövät on tullut yksi pääsyistä sairastuvuutta ja kuolleisuutta maailmanlaajuisesti [1]. On yli 200 erilaista tunnettuihin syöpiin ihmisissä, ja mekanismeja syövän synnyssä hämärän peitossa [2]. Suuret epidemiologiset ja kliiniset tutkimukset ovat osoittaneet, että tulehdus voi liittyä syövän kehittyminen [3,4]. Lisääntyvä todistusaineisto viittaa siihen, että syöpäherkkyys liittyy sytokiinien [5,6], kuten tuumorinekroositekijät (TNF) [7,8].

lymfotoksiini-alfaa (LTA) on pro-inflammatoristen sytokiinien kuuluvat TNF-perhe, joka on tärkeä rooli tulehdus- ja immuunivaste [9]. LTA on tuote, stimuloitujen T-solujen [10,11], ja se voi auttaa kommunikoimaan lymfosyyttien ja stroomasolujen ja sen jälkeen saamaan aikaan sytotoksisia vaikutuksia syöpäsolujen [9,12].

LTA

-geeni sijaitsee 6p21.3, jossa sijaitsee luokan III alueen major histocompatibility complex (MHC) lokukseen [13]. Geneettisiä variaatioita tulehdukseen liittyviä geenejä on esitetty muuttamaan sekä asetuksen tulehdusreaktion ja modulaation herkkyys säteilyn aiheuttama normaalin kudoksen vaurioita [14].

LTA

geenipolymorfismien esitetään liittyvän tulehduksellisten ja immunomodulaarisia sairauksia kuten syöpää [15,16]. Yhdistys on merkittävä välillä

LTA

polymorfismien ja syöpiä, kuten mahalaukun [15] ja rintojen [17] syöpiä aasialaisilla, peräsuolen syöpä [18] vuonna saksalaiset, ja Non-Hodgkin-lymfooma (NHL) in eurooppalaiset [19- 21]. Kuitenkin poikkeamat säilyä yhdistyksen

LTA

polymorfismien kanssa syövät eri etnisten ryhmien [15,16,22-24].

neljä

LTA

polymorfismien (rs1041981: Thr26Asn, rs2239704, rs2229094: Cys13Arg; rs746868) on tutkittu laajasti mahdollisina syöpäriskin. Nämä mutaatiot voivat käyttää mahdollisimman sääntelyn asetukseksi geenien ilmentymisen ja taso sytokiinituotannossa [25,26]. Yhden nuk- polymorfismi (SNP) rs1041981 (Thr26Asn) [27] liittyy transkription säätelyyn LTA, joka voi aktivoida lymfosyyttejä ja aiheuttavat apoptoosia [27]. SNP rs2239704 voivat muuntaa sekä LTA tasoilla ja myöhempien tulehdusreaktiota taudinaiheuttajia [28]. SNP rs746868 on osoitettu olevan korkean kytkentäepätasapainossa (LD) kanssa rs1041981 (r

2 0,8) [29]. SNP rs746868 ja rs2239704 ovat merkittäviä ennustavia muuttujia LTA proteiinin tuotantoa [28]. Haplotyypin SNP rs2229094 on osoitettu liittyvän muuttuneeseen LTA ilme ja kohonneeseen vascular- ja autoimmuunisairauksien tulehduksen [30].

yhteenliittymät

LTA

vaihtelut syöpäriskiä ovat olleet arvioitiin useita tapausverrokkitutkimukset [18-20,31-52]. Aiemmat tutkimukset ovat osoittaneet, että funktionaalinen polymorfismi rs909253 liittyy mahan [15] ja rintojen [17] syöpiä aasialaisilla. Vaikka neljä SNP (rs1041981, rs2239704, rs2229094 ja rs746868) esiintyy korkeita LD rs909253 [27,28], ristiriitaisia ​​tuloksia neljästä SNP ja syöpäriski havaitaan eri syöpiä Aasian, Pohjois-Amerikan ja Euroopan populaatiot [18 -20,22-24,31-51]. Nykyisessä tutkimuksessa, teemme kattavan meta-analyysin vaikutusten arvioimiseksi neljän toiminnallisen SNP (rs1041981, rs2239704, rs2229094 ja rs746868) syöpäriskiin.

Materiaalit ja menetelmät

Julkaisu

kirjallisuutta mukana analyysissä saatiin tietokannoista PubMed, Web of Science, ja Kiinan kansallinen Knowledge Infrastructure (CNKI). Avainsanoja sovelsi Medical Subject Headings (MeSH) Yhdysvalloissa National Library of Medicine termejä kuten ”

LTA

”, ”lymfotoksiini alfa”, ”TNF-beeta”, ”polymorfismi”, ja ”rs1041981″, ” Thr26Asn ”,” rs746868 ”,” rs2229094 ”,” Cys13Arg ”tai” rs2239704 ”pariksi” syöpä ”tai” kasvain ”. Samaan aikaan käsikirjoituksia olisi julkaistava Kiinan tai Englanti heinäkuuhun 2013. Koko tekstejä luettiin valitsemiseksi tarvittavat tiedot. Niihin liittyvät artikkelit MEDLINE sekä viiteluettelot kaikkien haettu tutkimukset tarkistettiin myös lainaukset muiden asiaan liittyvistä julkaisuista, joita ei ole tunnistettu perin.

Mukaanottokriteerit

Artikkelit kirjoilla meidän meta -analyses täyttivät seuraavat kriteereillä: (1) arvioidaan yhdistyksen välillä

LTA

polymorfismi rs1041981, rs2239704, rs2229094 tai rs746868 ja syövän riskiä; (2) tapauskontrollitutkimuksessa; (3) tulokset riittävästi julkaistujen tietojen arvioimiseksi OR, jossa on 95% CI; (4) genotyyppijakauman kontrolleissa täyty Hardy-Weinberg tasapaino (HWE).

Data louhinta

Kaksi tutkijat (YH ja XY) itsenäisesti uutetaan tietoja kaikista hyväksyttävistä julkaisuista perusteella valinnasta yllä lueteltuja ehtoja. Erimielisyydet vahvistettiin keskustelu kunnes päästiin. Jos oli lukuisia julkaisuja samasta tutkimusryhmä, täydellisin ja viimeaikaiset tulokset purettu. Hyödyllistä tietoa kerätään kunkin tutkimuksen käsittävät ensimmäisen tekijän sukunimi, julkaisuvuotta, maa, etninen väestö, lähde ohjaus ryhmien (väestöpohjainen tai sairaala-pohjainen), syöpä tyyppi, koko otoksen koko, genotyypitysmenetelmää ja määrä genotyyppijakauman tapauksissa ja valvontaa.

Tilastolliset analyysit

syrjäisimpien ja 99% CI siinä tapausverrokkitutkimukset käytettiin arvioimaan assosiaatiota

LTA

polymorfismien ja syöpäriskiä. Yhdistetty syrjäisimmillä alueilla tehtiin alle lisäaine, hallitseva, ja väistyvä malleja. Z testi käytettiin arvioimaan merkitystä yhdistetään OR. Lähtöä HWE varten genotyyppijakauman kontrolleissa analysoitiin Arlequin ohjelmaa (versio 3.5) [53]. Meta-analyysit tehtiin käyttämällä Review Manger ja Stata (versio 11.0, Stata Corporation, College Station, TX) [54]. Chi-neliö perustuva Q-tilastoa testi laskettiin heterogeenisuus tutkimusten meta-analyysi [55,56]. Epäjohdonmukaisuus indeksin (I

2 tilastoa) tutkittiin arvioida heterogeenisuus tutkimusten välillä [56]. I

2 50% ehdotti merkittävä heterogeenisyys meta-analyysi. Random-vaikutus [57] tai kiinteän vaikutus [55,58] malleja käytettiin, meta-analyysi merkittävää heterogeenisyyttä (I

2 50%) tai yksi minimaalinen tai kohtalainen heterogeenisuus (I

2 50%), vastaavasti. Alaryhmä meta-analyysit tehtiin syövän tyypin, väestö, ja lähde ohjaus. Herkkyysanalyysi suoritettiin myös sulkemalla pois kunkin tutkimuksen. Begg n suppilo tonttien ja Egger testausalusta käytettiin arvioimaan julkaisu bias [59]. Kahden pyrstö P 0,05 katsottiin tilastollisesti merkitsevä.

Tulokset

Kirjallisuus virtaus

Kuten kuviossa 1, kirjallisuudesta havaintojen mukaan yhteensä 248 mahdollisesti tarpeelliset asiakirjat. Luettuaan nimityksessä tai tiivistelmässä, 50 koskevia tutkimuksia yhdistyksen neljän

LTA

polymorfismien ja syöpäriski otettiin huomioon seuraavassa vaiheessa. Yhteensä 16 artikkelia ei otettu riittävästi genotyypityksen tietoja tai kelpaamaton näytteitä, tai muut

LTA

polymorfismi tai monistaa tutkimuksia. Lopuksi, keräsimme 24 artikkelit [18-20,31-52] (mukaan lukien 30 tutkimus vaiheet) keskitytään suhdetta rs1041981, rs2239704, rs2229094 tai rs746868 polymorfismien syöpäriskiä.

Tutkimus ominaisuudet

Ominaisuudet otetuista tutkimuksia yhteenveto taulukossa 1. Niistä 24 oikeutettu tutkimuksissa 8 artikkelit [18,20,31,34,35,39,48,52] (mukaan lukien 11 vaiheissa 7483 tapauksia ja 11938 valvontaa ) keskittyi yhdistyksen välillä rs1041981 ja syövät. Yhteensä 10 tutkimuksissa [19,33,36,38,40,41,43,46,47], raportoitu yhdistys syöpiä rs2239704 lukien 13 vaiheissa keskuudessa 6049 tapauksia ja 7621 tarkastuksia. Ja 5 tutkimukset (mukaan lukien 9 vaiheet) [19,31,46,51,52] keskuudessa 7133 tapauksissa ja 10305 valvonta arvioitiin osuus rs2229094 riski syöpiä. Oli 7 (myös 3487 tapaukset ja 4633 tarkastukset) [32,37,42,44-46,49] mukana yhdistyksen välillä rs746868 ja syövät. Kaikkien tietojen kerättiin Englanti julkaisuista. Oli 7 Aasian tutkimuksen, 9 Euroopan tutkimuksia, ja 14 Pohjois-Amerikan tutkimus. Useimmat syöpätyyppeihin olivat adenokarsinooma ja hematologisista sairauksista kuten mahalaukun [31,34,42,45,46,49], rintojen [32,51,52], keuhko [31], eturauhas- [38,44], ja kohdunkaulan syöpiä [35,39,48], suolen kasvainten [18,37], Non-Hodgkin-lymfooma (NHL) [19,20,33,36,40,47] Krooninen lymfosyyttinen leukemia (KLL) [43] ja Kivesten sukusolujen kasvaimet (TGCT) [41]. 30 Valittujen tutkimusten meta-analyysissä mukana 13 tutkimusten kanssa sairaalan perustuvan valvonnan, 17 tutkimukset väestöön perustuvia tarkastuksia. Kontrollit olivat lähinnä väestöpohjainen niitä oli sovitettu etnisen alkuperän, iän, sukupuolen tai tutkimusalueet.

Ensimmäisen tekijän (vuosi)

Case /ohjaus

Cancer tyyppi

populaatiot

SNP

Source valvonta-

Yhteensopiva

Takei K (2008) 570 /581ACAsianrs2229094, rs1041981HBEthnicity, tutkimus regionTakei K (2008) 159 /581ACAsianrs2229094, rs1041981HBEthnicity, tutkimus regionTakei K (2008) 177 /581ACAsianrs2229094, rs1041981HBEthnicity, tutkimus regionMahajan R (2008) 301 /415ACEuropeanrs2229094, rs2239704, rs746868PBAge, sukupuoli, tutkimus alue, ethnicityWang SS (2009) 990 /827HMNorth Americanrs2229094, rs2239704PBEthnicity, frequencyWang SS (2009) 434 /515HMNorth Americanrs2229094, rs2239704PBEthnicity, frequencyWang SS (2009) 518 /462HMNorth Americanrs2229094, rs2239704PBEthnicity, frequencyAbbas S (2010) 3136 /5477ACEuropeanrs2229094, rs1041981PBAge, tutkimus alue, ethnicityMadeleine MM (2011) 848 /866ACNorth Americanrs2229094PBAge, ethnicityWang SS (2006) 1029 /842HMNorth Americanrs2239704PBAge, genderLan Q (2006) 417 /499HMNorth Americanrs2239704PBAge, etnisyys, residenceLiu X (2006) 822 /861ACNorth Americanrs2239704PBAge, etnisyys, jona veri collectionPurdue MP (2007) 210 /602OC

bNorth Americanrs2239704PBAge, sukupuoli, kansallisuus, päivämäärä collectionPurdue MP (2007) 296 /602OC

bNorth Americanrs2239704PBAge, sukupuoli, kansallisuus, jona collectionPurdue MP (2007) 352 /463HMEuropeanrs2239704HBAge, sukupuoli, residenceCerhan JR (2008) 441 /474HMNorth Americanrs2239704HBAge, sukupuoli, residenceJacobs EJ (2008) 453 /1184ACNorth Americanrs2239704, rs746868HBAge, etnisyys, jona veri collectionEnnas MG (2008) 38 /112HMEuropeanrs2239704PBAge, genderLee SG (2004) 328 /253ACAsianrs1041981PBGender, tutkimus regionNiwa Y (2005) 44 /320ACAsianrs1041981HBGender, tutkimus regionNiwa Y (2005) 87 /320SC

bAsianrs1041981HBGender, tutkimus regionNiwa Y (2007) 110 /220ACAsianrs1041981HBAge, genderAissani B (2009) 135 /140HMNorth Americanrs1041981HBCD4 + laskee, kesto HIV infectionCastro FA (2009) 951 /1707SC

bEuropeanrs1041981PBAge, etnisyys, tutkimus regionSainz J (2012) 1760 /1727ACEuropeanrs1041981PBAge, sukupuoli, tutkimus regionGunter MJ (2006) 219 /205ACNorth Americanrs746868HBAge, sukupuoli, etnisyys, tutkimus regionGaudet MM (2007) 1622 /1288ACNorth Americanrs746868PBAge, residenceGarcia-Gonzalez (2007) 404 /404ACEuropeanrs746868HBAge, sukupuoli, kansallisuus, residenceCrusius JB (2008) 428 /1124ACEuropeanrs746868PBAge, sukupuoli, asuinpaikka, jona collectionGarcía-González (2009) 57 /24ACEuropeanrs746868HBEthnicity, tutkimus regionTable 1. Ominaisuudet sisältämien tutkimusten meta-analyysit

a.

a: PB, Väestölähtöinen; HB, sairaala perustuu; AC: Adenokarsinooma; HM: Hematologiset pahanlaatuisiksi; SC: squamous karsinooma; OC: Muut cancerb: Kaksi tutkimukset squamous kohdunkaulan ovat kohdunkaulan syöpä; kahdessa tutkimuksessa muiden syöpä ovat kivesten sukusolujen kasvaimet (TGCT) sisältäen seminooman eikä seminoomasta. CSV Lataa CSV

Kuten on esitetty taulukossa 2, genotyyppi jakauma neljän SNP: ja genotyypin määritysmenetelmällä kerätyt tutkimukset haettiin huolellisesti. Genotyyppi jaettuihin neljä polymorfismien kaikissa kontrollit täyttivät HWE (P 0,05).

SNP

Ensimmäisen tekijän (vuosi) B Case (AA /Aa /aa) B-ohjaus (AA /Aa /aa) B HWE

genotyypin

rs2229094 Takei K (2008) 374/179/17396/172 /130.30Melting käyrä (TT /TC /CC) Takei K (2008) 98/52/9396/172 /130.30Melting käyrä Takei K (2008) 110/58/9396/172 /130.30Melting käyrä Mahajan R (2008) 206/74/21247/150 /180.48TaqManWang SS (2009) 530/387/73433/333 /610.86TaqManWang SS ( 2009) 231/167/36269/209 /370.74TaqManWang SS (2009) 282/179/39276/160 /260.69TaqManAbbas S (2010) 1686/1199/2512965/2153 /3590.23MassArrayMadeleine MM (2011) 444/329/75475 /334 /570.93SNPlex rs2239704Wang SS (2006) 421/446/162332/370 /1400.05TaqMan (CC /AC /AA) Lan Q (2006) 165/189/63186/226 /870.23TaqManLiu X (2006) 285/537351/510 0.05TaqManPurdue MP (2007) 82/99/29221/290 /910.86TaqManPurdue MP (2007) 89/154/53221/290 /910.86TaqManPurdue MP (2007) 138/168/46162/229 /720.63TaqManCerhan JR (2008) 169 /217/55170 /225 /790.78TaqManEnnas MG (2008) 14/17/736/53 /230.70TaqManMahajan R (2008) 85/138/76105/223 /850.12TaqManWang SS (2009) 357/373/132284/311 /1160.06TaqManWang SS (2009) 143/152/51162/189 /740.15TaqManWang SS (2009) 197/229/58153/214 /660.62TaqManrs1041981 Lee SG (2004) 109/156/6374/132 /470.44PCR-sekvensointi (CC /AC /AA) Niwa Y (2005) 17/23/4107/165 /480.25AmpliTaq GoldNiwa Y (2005) 43/36/8107/165 /480.25AmpliTaq GoldNiwa Y (2007) 51/43/1671/114 /350.40AmpliTaq GoldTakei K ( 2008) 211/280/87195/304 /890.11Melting käyrä Takei K (2008) 73/71/20195/304 /890.11Melting käyrä Takei K (2008) 74/73/32195/304 /890.11Melting käyrä Aissani B (2009) 50/63/2271/61 /80.39BeadArrayCastro FA (2009) 341/456/154557/813 /3370.20MassArrayAbbas S (2010) 1498/1317/3322481/2399 /6070.47MassArraySainz J (2012) 833/729/198794/760 /1730.69KASPar Assayrs746868Gunter MJ (2006) 85/107/2776/102 /270.46TaqMan (GG /GC /CC) Gaudet MM (2007) 576/769/277446/621 /2210.86AmpFlSTRGarcia-Gonzalez (2007) 135/194/75142 /191 /710.48TaqManMahajan R (2008) 83/143/74108/220 /840.16TaqManCrusius JB (2008) 151/205/72398/545 /1810.85TaqManGarcía-González (2009) 19/26/129/10 /50.67RFLPTable 2. Jakelu neljän SNP genotyyppiä syövän ja kontrolliryhmän sisältyvät meta-analyysit

c.

c: tulokset Jacobs EJ et al (2008) ei ole lueteltu taulukossa, koska ne vain osoittautui A-alleelin frekvenssi . Tutkimuksessa Liu X et al (2006) vain osoittaa numero CC /CA + AA. CSV Lataa CSV

Meta-analyysi rs1041981

tärkeimmät tulokset meta-analyysi rs1041981 polymorfismin esitettiin taulukossa 3. Ei heterogeenisuus oli olemassa mukana tutkimuksissa (I

2 = 16,0% P = 0,29). Yhteenvedossa vaikutus OR oli 1,10 G-alleelin (99% CI = 1,04-1,16, p = 0,001, kuva 2). Alaryhmäanalyysi ehdotti, että rs1041981 lisäsi riskiä useiden syöpätyyppien, kuten adenokarsinooma (OR = 1,07, 99% CI = 1,01-1,14, p = 0,030, I

2 = 0,08%), suomuinen karsinooma (OR = 1,19 , 99% CI = 1,03-1,37, p = 0,018, I

2 = 46,0%), hematologiseen pahanlaatuisuuteen (OR = 1,73, 99% CI = 1,08-2,77, p = 0,023). Merkittävä yhdistys löydettiin myös monia populaatioita lukien aasialaiset (OR = 1,18, 99% CI = 1,04-1,34, p = 0,010, I

2 = 0,0%) ja eurooppalaisista (OR = 1,07, 99% CI = 1.00- 1,14, P = 0,047, I

2 = 0,0%). Lisäksi lähde analyysi osoitti positiivinen yhteys sekä sairaalan johdolla ryhmä (OR = 1,24, 99% CI = 1,09-1,42, p = 0,001, I

2 = 0,0%) ja väestöpohjainen (OR = 1,07 , 99% CI = 1,00-1,14, p = 0,042, I

2 = 0,0%, taulukko 3).

muuttujat

lisäaine malli

Dominant malli

Peittyvä malli

N

P, OR (99% CI) B P

(Q-testi), I

2

P, OR ( 99% CI) B P

(Q-testi), I

2

P, OR (99% CI) B P

(Q-testi), I

2

Total110.001, 1,10 (1,04-1,16) 0,29, 16,0% 0,0001, 1,15 (1,07-1,25) 0,33, 12,2% 0,035, 1,13 (1,01-1,27) 0,76, 0,0% Cancer tyyppi Adenokarsinooma 80,030, 1,07 (1,01-1,14) 0,69, 0,08% 0,003, 1,14 (1,04-1,24) 0,43, 0,0% 0,246, 1,08 (0,95-1,23) 0,99, 0,0% Squamous carcinoma20.018, 1,19 (1,03-1,37) 0,17, 46,0% 0,061, 1,21 (0,99-1,49) 0,12, 58,3% 0,053, 1,30 (1,00-1,69) 0,56, 0,0% Hematologinen malignancy10.023, 1,73 (1,08-2,77) NA0.083, 1,75 (0,93-3,29) NA0.040, 3,21 (1,05 -9,80) NAPopulationAsian70.010, 1,18 (1,04-1,34) 0,64, 0,0% 0,0001, 1,39 (1,16-1,66) 0,35, 11,4% 0,357, 1,12 (0,88-1,43) 0,93, 0,0% Pohjois American10.023, 1,73 ( 1,08-2,77) NA0.083, 1,75 (0,93-3,29) NA0.040, 3,21 (1,05-9,80) NAEuropean30.047, 1,07 (1,00-1,14) 0,38, 0,0% 0,035, 1,10 (1,01-1,20) 0,84, 0,0% 0,096, 1,12 (0,98-1,28) 0,52, 0,0% Lähde controlHospital based70.001, 1,24 (1,09-1,42) 0,44, 0,0% 0,0001, 1,45 (1,20-1,74) 0,68, 0,0% 0,121, 1,23 (0,95-1,60 ) 0,61, 0,0% Population based40.042, 1,07 (1,00-1,14) 0,58, 0,0% 0,027, 1,10 (1,01-1,20) 0,92, 0,0% 0,114, 1,11 (0,98-1,26) 0,66, 0,0% Taulukko 3. Meta-analyysi of rs1041981.

NA: ei sovellettavissa heterogeenisyys testiä. CSV Lataa CSV

Meta-analyysi tulos rs2239704

Kuva 3 osoitti metsän tontin rs2239704 ositettu syöpätyypin. Runsaasti lisää syöpäriskiä löydettiin G vs. malli perustuu tutkimuksiin (OR = 1,08, 99% CI = 1,01-1,16, p = 0,021, I

2 = 0,0%, taulukko 4). Alaryhmässä meta-analyysin syövän tyypistä, rs2239704-G havaittiin positiivinen yhteys hematologiseen pahanlaatuisuuteen (OR = 1,10, 99% CI = 1,01-1,20, p = 0,023, I

2 = 0,0%, taulukko 4 ). Merkittävä yhdistykset rs2239704 hematologiseen pahanlaatuisuuteen syöpiä löytyi myös Pohjois-Amerikan populaatioiden (OR = 1,09, 99% CI = 1,01-1,17, p = 0,025, I

2 = 2,7%) ja väestöpohjainen (OR = 1,08, 99% CI = 1,00-1,17, p = 0,044, I

2 = 2,2%, taulukko 4).

muuttujat

lisäaine malli

Dominant malli

Peittyvä malli

N

P, OR (99% CI) B P

(Q-testi), I

2

P, OR (99% CI) B P

(Q-testi), I

2

P, OR (99% CI) B P

(Q-testi) , I

2

Total130.021, 1,08 (1,01-1,16) 0,60, 0,0% 0,019, 1,11 (1,02-1,21) 0,76, 0,0% 0,027, 1,12 (1,01-1,24) 0,70, 0,0% Cancer tyyppi Hematologiset malignancy80.023, 1,10 (1,01-1,20) 0,99, 0,0% 0,072, 1,12 (0,99-1,26) 0,99, 0,0% 0,051, 1,17 (1,00-1,38) 0,99, 0,0% adenokarsinooma 30,132 1,10 (0,97-1,25) 0,11, 55,1% 0,036, 1,16 (1,01-1,34) 0,25, 27,6% 0,135, 1,11 (0,97-1,28) 0,05, 65,8% Muut cancer20.440, 0,93 (0,76-1,13) 0,18, 44,7% 0,414, 0,89 (0,67-1,18) 0,18, 45,1 % 0,691, 0,93 (0,63-1,35) 0,44, 0,0% PopulationNorth American100.025, 1,09 (1,01-1,17) 0,41, 2,7% 0,039, 1,10 (1,00-1,21) 0,53, 0,0% 0,015, 1,14 (1,03-1,27) 0,75, 0,0% European30.532, 1,06 (0,88-1,28) 0,64, 0,0% 0,214, 1,19 (0,90-1,57) 0,99, 0,0% 0,727, 0,94 (0.68-1.31) 0,38, 0,0% Lähde controlHospital based30.257, 1,08 (0,94 -1,24) 0,61, 0,0% 0,444, 1,07 (0,90-1,26) 0,72, 0,0% 0,386, 1,09 (0,90-1,31) 0,44, 0,0% Population based100.044, 1,08 (1,00-1,17) 0,42, 2,2% 0,022, 1,13 ( 1,02-1,24) 0,60, 0,0% 0,038, 1,14 (1,01-1,28) 0,61, 0,0% Taulukko 4. Meta-analyysi rs2239704.

CSV Lataa CSV

Meta-analyysi tulos rs2229094

tärkeimmät yhdistetyt tiedot rs2229094 polymorfismin lueteltiin taulukossa 5. yleistä data ilmoittautunut 9 tutkimuksen vaiheissa merkittävä yhdistys rs2229094 polymorfismi syöpäriskiä näytettiin kuviossa 4 (OR = 1,28, 99% CI = 1,09-1,50, P = 0,003, I

2 = 0,0%). Vuonna lisäanalyysi, merkittävästi lisääntyneitä riskejä havaittiin adenokarsinooma (OR = 1,33, 99% CI = 1,11-1,59, p = 0,002, I

2 = 0,0%). Vuonna kerrostunut analyysi väestön voimakas yhdistys rs2229094 adenokarsinooma syöpiä todettiin aasialaisilla (OR = 1,92, 99% CI = 1,04-3,57, p = 0,038, I

2 = 0,0%) ja eurooppalaisista (OR = 1,26 , 99% CI = 1,02-1,56, p = 0,029, I

2 = 0,0%). Edelleen alaryhmäanalyysin peittyvästi mallissa tilastollisesti yhdistysten esiteltiin sekä sairaala-pohjainen (OR = 1,92, 99% CI = 1,04-3,57, p = 0,038, I

2 = 0,0%) ja väestöpohjainen ryhmät (OR = 1,24, 99% CI = 1,05-1,46, p = 0,010, I

2 = 0,0%, taulukko 5).

muuttujat

lisäaine malli

Dominant malli

Peittyvä malli

N

P, OR (99% CI) B P

(Q-testi), I

2

P, OR (99 % CI) B P

(Q-testi), I

2

P, OR (99% CI) B P

(Q-testi), I

2

Total90.076, 1,06 (0,99-1,13) 0,55, 0,0% 0,476, 1,03 (0.95-1.12) 0,46, 0,0% 0,003, 1,28 (1,09-1,50) 0,82, 0,0% Cancer tyyppi Adenokarsinooma 60,064, 1,07 (1.00- 1,15) 0,37, 7,0% 0,415, 1,04 (0,95-1,14) 0,25, 24,8% 0,002, 1,33 (1,11-1,59) 0,70, 0,0% Hematologinen malignancy30.762, 1,06 (0,99-1,13) 0,57, 0,0% 0,996, 1,00 (0,85 -1,18) 0,64, 0,0% 0,456, 1,13 (0,82-1,57) 0,70, 0,0% PopulationAsian30.041, 1,23 (1,01-1,50) 0,65, 0,0% 0,104, 1,21 (0,96-1,52) 0,79 0,0% 0,038, 1,92 (1.04- 3,57) 0,82, 0,0% European20.457, 1,03 (0,95-1,13) 0,19, 42,4% 0,868, 0,99 (0,89-1,11) 0,06, 71,4% 0,029, 1,26 (1,02-1,56) 0,52, 0,0% North American40.347, 1,06 (,94-+1,18) 0,62, 0,0% 0,645, 1,03 (0,90-1,19) 0,71, 0,0% 0,168, 1,21 (0,92-1,58) 0,76, 0,0% Lähde controlHospital based30.041, 1,23 (1,01-1,50) 0,65, 0,0% 0,104, 1,21 (0,96-1,52) 0,79 0,0% 0,038, 1,92 (1,04-3,57) 0,63, 0,0% Population based60.244, 1,04 (0,97-1,12) 0,61, 0,0% 0,877, 1,01 (0,92-1,10) 0,40, 1,9% 0,010, 1,24 (1,05-1,46) 0,90, 0,0% Taulukko 5. meta-analyysi rs2229094.

CSV Lataa CSV

Meta-analyysi tulos rs746868

ei ollut todisteita assosiaatio rs746868 ja syövän riskiä (OR = 1,01, 99% CI = 0,93-1,10, p = 0,771, I

2 = 0,0%, taulukko S1). Vaihtoehtoiset geneettisiä malleja ja alaryhmään meta-analyysit eivät paljastaneet mitään merkittäviä tuloksia (taulukko S1).

Herkkyysanalyysit ja julkaisu bias

Herkkyysanalyysit suoritettiin sulkemalla pois kunkin tutkimuksen. Tilastollinen merkitsevyys ei muutettu (tuloksia ei ole esitetty). Egger väestöstä bias juoni ei osoittanut visuaalista julkaisua bias meta-analyysi (kuvio 5, P = 0,084 varten rs1041981; P = 0,602 varten rs2239704; P = 0,433 varten rs2229094; P = 0,343 varten rs746868).

keskustelu

järjestelmällinen katsaus ja meta-analyysi, analysoimme 30 tapausverrokkitutkimukset joukossa 58649 osallistujia tarkistaa yhdistyksen välillä neljän SNP ja syöpäriskiä. Tulosten perusteella näyttää, että rs1041981, rs2239704 ja rs2229094 voivat lisätä syöpäriskiä merkitsevä assosiaatiotulosten eri geneettisiä malleja. Ei ole todisteita ei löytynyt yhdistyksen välillä rs746868 ja syöpäriskiä.

alaryhmä meta-analyysit ositettu syövän tyypin, tuloksemme osoittavat, että rs2239704 ja rs2229094 todennäköisesti lisäävät riskiä hematologiseen pahanlaatuisuuteen ja adenokarsinooma, vastaavasti. Hematologiseen pahanlaatuisuuteen on syöpä kontrolloimattoman leviämisen klonaalisia B-solujen, T-solu tai NK-solun eri vaiheissa maturations [60]. Adenokarsinooma voi syntyä monissa elimistön kudoksissa, mukaan lukien vatsa, rinta, haima, paksusuoli ja niin edelleen [61]. Sekä adenokarsinooma ja hematologiseen pahanlaatuisuuteen ovat monitekijäinen sairauksia monimutkaisia ​​vuorovaikutuksia geneettisten ja ympäristötekijöiden [62]. Kertyvät todisteita ovat ilmoittaneet, että geneettisiä vaihteluita immuuni geenit alttiuslokukset hematologiseen pahanlaatuisuuteen [47,63].

LTA

rs2239704 polymorfismi on tärkein ennustaja LTA tuotantoa ihmisen B-soluista [28]. Adenokarsinooma on yleisin histologinen syöpätyyppi.

LTA

variantteja on esitetty liittyvän syöpäriskejä eri geneettisten mallien. Nämä geneettiset mallit koostuvat lisäainetta (per variantti alleeli vs. yhteinen alleeli), hallitseva (variantti alleeli kantajia vs. homotsygoottisia yhteisen alleelin) ja resessiivinen (homotsygoottisia variantin alleelin vs. kaikki muut) geneettistä mallia [64,65].

LTA

rs1041981 liittyy merkittävästi pienempi läsnäolo Japani mies keuhkosyöpään alla hallitseva malli (CA + AA vs. CC) [28];

LTA

rs909253 liittyy suuri riski Aasian mahasyövän heterozygoottiset verrattuna (GA vs. AA) [15];

LTA

rs2009658 on osoitettu liittyvän merkittävästi kohonnut riski sairastua rintasyöpään keskuudessa valkoihoinen vuotiaiden naisten 45-64 vuotta alle lisäaineen malli (C vs. G) [51]. Tuloksemme osoittivat, että

LTA

rs1041981 ja rs2239704 polymorfismien korreloivat syöpää kolme geneettistä mallia, mikä viittaa additiivinen vaikutus näiden kahden polymorfismien siitä syöpäriskiä. Sen sijaan, rs2229094 liittyi riski adenokarsinooma väistyvä malli, mikä puute rahoitusosuus heterozygoottiset riskin adenokarsinooma. Tuloksia voitaisiin osittain johtua eri

LTA

polymorfismien että pelata erilaisia ​​rooleja eri syöpien ja eri populaatioissa. Lisäksi eri kasvaimia ihmisissä voidaan generoida erikois- karsinogeenisia järjestelyjä, jotka voisivat johtaa useita yhteyksiä yhdellä sama geneettinen lokus [66].

alaryhmä meta-analyysit etnisyys huomaavat rs1041981 negatiivisesti suhteet syöpiä aasialaisilla alla väistyvä malli. SNP rs2239704 näkyy positiivinen yhteys Pohjois amerikkalaiset mutta ei eurooppalaiset. Lisäksi rs2229094 liittyy syöpään aasialaisilla muttei pohjoisamerikkalaisia ​​tai eurooppalaisia. Tämä saattaa selittyä eri genotyypin ja alleelifrekvenssit näiden SNP henkilöillä, joilla eri kliinisiä piirteitä, maantieteelliset jakaumat, ja etninen syntyperä. Siksi emme voi sulkea pois, että negatiivinen yhdistys eurooppalaisten tai pohjoisamerikkalaisten voi johtua tehottomuudesta. Siten vastaavat kriteerit ja valinta bias sekä vaiheissa syöpien tulisi harkita tulevaisuudessa tapaus-verrokki tutkimuksissa. Suuri otoskoko ja eri väestöryhmiin tutkimus saisi enemmän uskottava tulos tulevaisuudessa.

Tässä tutkimuksessa olemme koonneet joukon parametreja (kuten syövän tyyppi, väestö, lähde ohjaus, genotyypitysmenetelmää, ja matching ehto) antamaan luotettavan tuloksen meta-analyysit. Edellytämme genotyyppijakauman kontrolleissa täyttänyt HWE (P 0,05). Olemme myös suorittaa alaryhmä meta-analyysit, joita kerätään parametrit vähentää mahdollisia kerrostuneisuus joukossa mukana tapaus-verrokki tutkimuksissa. On kuitenkin olemassa rajoituksia myös meta-analyysi olisi mainittava. Ensinnäkin meidän meta-analyysit yhdistää geneettiset tutkimukset eri syöpiä, jotka voivat ottaa käyttöön dramaattinen stratifications meta-analyysit, vaikka olemme hallinnassa useita parametreja. Toiseksi Tuloksemme voi kertoa todellinen syy variantti syöpäriski kolmesta merkittäviä SNP (rs1041981, rs2239704, rs2229094), koska ne ovat korkeat LD. Lisäksi on mahdollista, että todellinen syy variantti voi olla myös muita muunnos korkean LD niiden kanssa. Tulevaisuuden tutkimus mekaanista roolit niitä tarvitaan. Kolmanneksi, on olemassa vain muutamia tutkimuksia on Afrikkalainen väestö. Tulevaisuuden tutkimus Afrikkalainen populaatioiden täytyi suorittaa suuri koko kohortin tutkia negatiiviset tulokset alaryhmän meta-analyysi Afrikkalainen väestö johtuu tehottomuudesta tai geneettinen heterogeenisyys.

Yhteenvetona yleinen tiedot esillä olevalle analyysien mukaan kolme

LTA

variantteja (rs1041981, rs2239704 ja rs2229094) voi merkittävästi lisätä riskiä syöpiä. Edelleen hyvin suunniteltu tutkimuksia Näiden varianttien tarvitaan tutkia niiden mekanistinen roolit synnyssä syöpiä.

tukeminen Information

tarkistuslista S1.

PRISMA tarkistuslista.

doi: 10,1371 /journal.pone.0082519.s001

(DOC) B Taulukko S1.

Meta-analyysi rs746868.

doi: 10,1371 /journal.pone.0082519.s002

(DOCX) B