Krooninen sairaus

tiivistelmä

Johdanto

Tässä tutkimuksessa 27 geneettisten polymorfismien että raportoitiin aiemmin liittyvän hoitotuloksia peräsuolen syöpäpotilailla tutkittiin suhteessa yleiseen eloonjäämiseen (OS) ja sairauksien elinaika (DFS) ja peräsuolen syöpäpotilailla Newfoundlandista.

Methods

löytö ja validointi kohortteja koostuu 532 ja 252 potilaista. Genotyyppien 27 polymorfismien ensin saatu löytö kohortti ja selviytymisen analyysit suoritettiin olettaen yhteistyössä hallitseva geneettinen malli. Polymorfismit liittyvät tautiin tulosten löytö kohortin Sitten tutkittiin validointi kohortissa.

Tulokset

oikaistu sukupuolen, iän, kasvaimen vaiheen ja mikrosatelliittien epävakaus (MSI) tila, neljä polymorfismit olivat riippumattomia ennustajia OS löytö kohortin

MTHFR

Glu429Ala (HR: 1,72, 95% CI: 1,04-2,84, p = 0,036),

ERCC5

His46His (HR: 1,78, 95% CI : 1,15-2,76, p = 0,01),

SERPINE1 –

675indelG (HR: 0,52, 95% CI: ,32-,84, p = 0,008), ja homotsygoottinen deleetio

GSTM1

geenin (HR: 1,4, 95% CI: 1,03-1,92, p = 0,033). Validoinnissa kohortin

MTHFR

Glu429Ala polymorfismi liittyi lyhyempi OS (HR: 1,71, 95% CI: 1,18-2,49, p = 0,005), on tosin erilainen genotyyppi kuin löytö kohortti (CC-genotyyppi löytö kohortti ja AC genotyypin validoinnissa kohortissa). Kun kerrostunut perustuva hoito 5-fluorourasiilin (5-FU) -pohjaisen hoito, tämä polymorfismi oli yhteydessä heikentyneeseen OS vain potilailla, joita ei ole hoidettu 5-FU. Vuonna DFS analyysissä, kun oikaistu muiden muuttujien, TT genotyyppi

ERCC5

His46His polymorfismi oli yhteydessä lyhyempi DFS molemmissa kohorteissa (löytö kohortti: HR: 1,54, 95% CI: 1,04-2,29, p = 0,032 ja replikointi kohortti: HR: 1,81, 95% CI: 1,11-2,94, p = 0,018).

Johtopäätökset

tässä tutkimuksessa yhdistysten

MTHFR

Glu429Ala polymorfismi OS ja

ERCC5

His46His polymorfismi DFS tunnistettiin kaksi peräsuolen syövän potilasaineistoihin. Tuloksemme viittaavat myös siihen, että

MTHFR

Glu429Ala polymorfismi voi olla haitallinen ennustetekijöiden markkeri potilailla joita ei ole hoidettu 5-FU.

Citation: Negandhi AA, Hyde A, Dicks E, Pollett W, Younghusband BH, Parfrey P, et ai. (2013)

MTHFR

Glu429Ala ja

ERCC5

His46His polymorfismit liittyvät ennusteeseen peräsuolen syövän Potilaat: Analysis of Two Independent Kohorteissa Newfoundlandista. PLoS ONE 8 (4): e61469. doi: 10,1371 /journal.pone.0061469

Editor: Xiao-Ping Miao, MOE Key laboratorio ympäristöä ja terveyttä, School of Public Health, Tongji Medical College, Huazhong tiede ja teknologia, Kiina

vastaanotettu: 25 lokakuu 2012; Hyväksytty: 08 maaliskuu 2013; Julkaistu 23. huhtikuuta 2013

Copyright: © 2013 Negandhi et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus rahoitetaan avustusta Memorial University; 2010 Cox palkinnon lääketieteellisen tiedekunnan, Memorial University; Kanadan Institute of Health Research (CIHR) rahasto peräsuolen syövän Interdisciplinary Health Research Team Toronton yliopiston ja Memorial University, National Cancer Institute of Canada (myöntää 18223 ja 18226) ja Atlantin juhlarahasto tieteidenvälisessä Research Teamiin Human Genetics. AAN tukivat CIHR Interdisciplinary Health Research Team Fellowship. AH tukivat Walter ja Jessie Boyd Charles Scriver MD /PhD stipendi Award (Canadian Institute of Health Research Institute of Genetics ja Kanadan Gene Cure Foundation). Rahoituslähteitä ei ollut työosuuteensa suunnittelu; keräämiseen, analysointiin tai tietojen tulkinnassa; kirjoittamassa raportissa; tai päätöksessä toimittamaan julkaisua.

Kilpailevat edut: Vastaava kirjoittaja on akateeminen editori PLoS ONE. Muut kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

peräsuolen syöpä on korkea esiintyvyys kehittyneissä maissa [1]. Vuonna 2004 tämän taudin oli 4

th kuolinsyy johtuu syövästä yli 600000 kuolemantapausta maailmanlaajuisesti [2]. Kanadassa, se on suuri terveysongelma, joiden arvioitu 22200 uutta tapausta ja 8900 kuolemantapausta odotetaan vuonna 2011 [3]. On huomattava välinen maakunta vaihtelut ilmaantuvuus ja kuolleisuus, ja maakunnassa Newfoundland ja Labrador (NL) on korkein Ikävakioitu ilmaantuvuus ja kuolleisuus ja peräsuolen syövän joukossa Kanadan provinssit [3]. Sekä geneettiset ja ympäristötekijät osansa paksunsuolen syöpään altistava. Vaikka suurin osa paksusuolen syövän potilaat ovat satunnaisia ​​tapauksia, lähes 5% paksusuolen ja peräsuolen syöpiä aiheuttavat periytyvät korkean läpäisevät mutaatioita [4]. Kolmekymmentäviisi prosenttia riski kehittää satunnaista peräsuolen syöpä on myös johtuvan perinyt tekijöistä [5].

Tärkeää peräsuolen syövän tuloksia sisältävät uusiutuminen, etäpesäke ja kuolema. Tällä hetkellä arvokkain ennustetekijöiden kriteeriksi peräsuolen syövän potilailla on TNM (tuumori-solmu-etäpesäke) lavastus määritellyt American sekakomitean Cancer [6]. Yleensä potilas ennustetta pahenee yhä vaiheessa.

Useat kliinisten ja molekyylitason parametrit ovat myös tutkittu niiden ennustetekijöiden hyödyllisyys kolorektaalisyövässä. Esimerkiksi Popat et al [7] ilmoitetaan niiden meta-analyysissä, että potilailla, joilla mikrosatelliittien epävakaus-korkea (MSI-H) kasvaimet ovat edullisempia ennuste verrattuna potilaisiin, joilla mikrosatelliittien epävakaus-low (MSI-L) tai microsatellite vakaa (MSS) kasvaimia. Useat muut kliinis ja molekyylitason ominaisuuksia on myös raportoitu liittyvän ennusteen, kuten korkea kasvaimen [8], mucinous histologia [9], lymphovascular invaasio [10], kromosomi epävakaus [11], ja läsnäolo

BRAF1

Val600Glu somaattinen mutaatio tuumoreissa [12], vaikka ristiriitaisia ​​raportteja on myös julkaistu [13] – [15]. Ristiriitaiset tuloksia yhdistyksen välillä familiaalinen riski on ja selviytymisen peräsuolen syövän potilaista saivat myös raportoitu [16], [17]. Lisäksi demografiset tekijät kuten sukupuolen ja etnisen alkuperän voi olla määritteet ennusteen [6]. Nämä tekijät vain osittain selittää vaihtelut syövän hoitotuloksia ja on mahdollista, että geneettiset tekijät (kuten yhden emäksen monimuotoisuus (SNP), lisäys /poisto (Indel) polymorfismit, ja somaattisista mutaatioista) voivat vaikuttaa ennusteeseen. Niiden tutkimus voi siten auttaa ymmärtämään syitä potilaiden väliset tuloksen vaihtelua ja taustalla biologisten mekanismien.

Useat tutkimukset ovat aiemmin raportoitu merkittäviä assosiaatioita geneettisiä variaatioita ja tulosten peräsuolen syöpäpotilailla. Esillä olevassa tutkimuksessa olemme tutkineet 27 kuten polymorfismien (taulukko 1) mahdollisina ennustetekijöiden on peräsuolen syövän potilaan kohortin (löytö kohortti, n = 532) ja sen jälkeen testattiin pätevyyden positiivisen yhdistysten lisäksi peräsuolen syöpä potilaan kohortin (validointi kohortti, n = 252).

Materiaalit ja menetelmät

Ethics lausunto

tutkimus sisältää kaksi potilasaineistoihin. Sekä ikäluokat, kokoelma potilaan kliinisten tietojen ja biospecimens hyväksyttiin tutkimustarkoituksiin alueellisen Health Boards ja Human Investigation komitea (HIC) Memorial University of Newfoundland. Löytö kohortin kirjallinen suostumus saatiin potilailta palvelukseen tai niiden välityspalvelimia. Human Investigation komitean Memorial University of Newfoundland luopua tarpeesta kirjallinen suostumus osanottajilta replikointi kohortissa. Etiikka hyväksyntä tähän hankkeeseen saatiin myös Human Investigation komitean Memorial University of Newfoundland.

potilasaineistoihin

a) löytö kohortti.

Tämä ryhmä koostui 532 peräsuolen syövän potilaiden Newfoundlandin peräsuolen syövän Registry (NFCCR). NFCCR perustettiin vuonna 1999 ja palvelukseen 736 vaiheen I-IV peräsuolen syövän potilaiden vuosien 1999 ja 2003 [18]. Kaikki potilaat olivat ≤75 vuotias ja niiden diagnoosi varmistettiin patologinen tutkimus. Molekyyli- ja geneettisiä ominaisuuksia tämän kohortin ja muista yksityiskohdista on aikaisemmin raportoitu muut [19], [20]. Kaikille potilaille, kliiniset tiedot kerättiin (joskin myös puuttuvat arvot joidenkin muuttujien, taulukko 2). Tässä tutkimuksessa 532 736 kolorektaalisyövän potilaita NFCCR tutkittiin joiden genomi-DNA: ta (uutettu veri) oli myös saatavilla. Potilaan tiedot kliinis-, toistuminen ja etäpesäke, ja kuolinpäivä haettiin kliinisen raportit (lääketieteellinen, patologia, radiologia, ruumiinavaus, ja kirurgiset raportteja, lab tutkimukset, lääkäreiden arviointi ja edistymistä toteaa, laitoshoito vastuuvapauden yhteenvetoja), Newfoundlandin Cancer Treatment and Research Foundation tietokanta, tai potilas seurantalomakkeet. Tässä kohortissa, 62% potilaista hoidettiin 5-FU kemoterapiaan joko neoadjuvant tai adjuvantti asetuksia tai kun diagnoosi paikallisten ja kaukaisten uusiutumisen, kun taas muut potilaat ei joko kemoterapiaa, tai käsiteltiin sisplatiinin /etoposidin (n = 1). Potilaat tässä kohortissa seurasi vasta huhtikuussa 2010. mediaani seuranta-ajan tässä kohortissa varten eloonjäämiseen ja taudista vapaan eloonjäämisen oli 6,4 ja 6 vuotta, vastaavasti (taulukko 2).

b) validointi kohortti.

Tämä on retrospektiivinen kohortti koostuu 280 aikaisemmin kerätyt peräsuolen syövän potilaita Avalon Peninsula Newfoundlandin. Kaikkien 280 potilasta kliinisten kerättiin kuitenkin genomista DNA (uutettu kuin kasvain kudosten) oli saatavilla vain 252 potilasta. Näin ollen 252 280 potilasta sisällytettiin tässä tutkimuksessa. Potilaat tässä kohortissa diagnosoitu primääri peräsuolen syövän kahden vuoden aikana (välillä 1997-1998). Potilas valintakriteerit ovat seuraavat: a) potilaille, joilla on syöpä in polyyppi sisällytettiin vain, jos kasvain tunkeutunut osaksi varsi, b) potilaille, joiden peräsuolen syöpä oli toistuminen aikaisemman peräsuolen syövän tai etäpesäke kaukaisesta elin, ja ne Karsinoidikasvaimista familiaalinen adenomatoottisen polypoosin, karsinooma in situ ja limakalvon syöpä suljettiin, ja c) potilasta valittiin iästä diagnoosin. Prognostiset tiedot näistä potilaista kerättiin lääketieteen ja sairaalan tallentaa ja Newfoundlandin ja Labradorin Centre for Health Information. Vuonna validointi kohortissa, 34,9% potilaista hoidettiin 5-FU-kemoterapiaan joko neoadjuvant tai adjuvantti asetuksia tai kun diagnoosi paikallisen tai kaukana toistuminen. Loput potilaat saivat joko ei kemoterapiaa tai hoidettiin muiden aineiden, kuten irinotekaani, tomudex tai oksaliplatiini. Potilaat tässä kohortissa seurasi vasta heinäkuussa 2009. mediaani seuranta-aika Kohortin oli 5,4 ja 3,3 vuotta eloonjäämiseen ja taudista vapaan eloonjäämisen, vastaavasti (taulukko 2).

valinta polymorfismit

dbCPCO tietokannan [21] (https://www.med.mun.ca/cpco/) tiivistää kirjallisuutta geneettisiä markkereita tutkittu niiden ennustetekijöiden yhdistysten peräsuolen syöpäpotilailla. Elokuussa 2010 etsimään merkintöjä tähän tietokantaan olemassaolostaan ​​toimenpiteitä (esim eloonjäämiseen) suoritettiin. Seurauksena tämä haku, 31 polymorfioita havaittu. Out of 31, yksi polymorfismi (

EGFR

(CA)

n toisto) ei ollut mukana tässä tutkimuksessa, koska puute sopiva laitteisto meidän lab hankittava sen genotyyppejä. Lisäksi kolme polymorfismit (

EGF

A61G,

TP53

Arg72Pro ja

PTGS2 –

765 G /C) ei voida genotyyppi käyttäen MassArray® tekniikkaa. Tämän seurauksena 27 polymorfismit 24 eri geeniä, jotka olivat a) raportoitu liittyvän eloonjäämiseen ainakin yhdessä tutkimuksessa (joko yhden muuttujan tai monimuuttuja analyysit) (taulukko S1 File S1), b) soveltuu genotyyppi käyttäen genotyypityksen tekniikoita käytetään tässä projektissa (esim yhden nukleotidin polymorfismien, indeleitä, mikrosatelliitti toistoja, geeni poistot), ja c) onnistuneesti genotyyppi (eli ei jättänyt joiden genotyyppi käyttäen MassArray® menetelmä) tutkittiin nykyisessä tutkimuksessa (taulukko 1).

genotyypitysmenetelmiä

genotyyppien 27 polymorfismien saatiin löytö kohortin ja genotyyppien neljän polymorfismien jotka liittyivät OS löytö kohortin (

MTHFR

Glu429Ala,

ERCC5

His46His,

SERPINE1 –

675indelG, ja

GSTM1

geeni poistetaan) saatiin validointi kohortissa. Genotyypit saatiin käyttämällä Sequenom MassArray® alustan, TaqMan® SNP genotyypin määritysten ja geelielektroforeesilla PCR-monistettujen fragmenttien. Lisätietoja liittyvät genotyypitys kokeiluja löytyy Menetelmät S1 ja taulukossa S2 File S1. Jokainen genotyypitys reaktio sisältyvät ei-mallia monistuksissa negatiivisina kontrolleina. Vähintään 5,9%: n genotyyppien onnistuneesti monistaa vähintään 99,7% vastaavuutta korko. Näytteet, joiden ristiriitainen genotyypit olivat joko uudelleen genotyyppi (genotyypit on saatu käyttämällä TaqMan® SNP genotyypin määritysten ja geelielektroforeesilla PCR-monistetut fragmentit) tai pois analyysistä (genotyypit on saatu käyttämällä Sequenom MassArray® tekniikka). Pienin onnistunut genotyypityksen hinnat olivat 97,4% löytämisen kohortin ja 94,44% validoimiseksi kohortin. Kun kyseessä on in-house genotyypin kokeissa (eli TaqMan® SNP genotyypin määritysten ja geeli-elektroforeesi PCR-monistettujen fragmenttien), genotyypin reaktioita ei ole DNA-näytteet yritettiin ainakin kaksi kertaa, riippuen saatavuudesta DNA: ta.

TILASTOANALYYSI

a) Hardy Weinberg Equilibrium (HWE) testi.

HWE testi manuaalisesti suoritettiin polymorfismien käyttämällä Pearsonin khiin neliö -testi (taulukko S3 File S1) . Sillä

GSTM1

ja

GSTT1

geenin deleetioiden HWE ei testattu, koska heterotsygoottinen genotyyppejä ei voida havaita käyttäen genotyypin menetelmää sovellettiin tässä tutkimuksessa.

b) elossaolopäätetapahtumiin.

OS oli siihen aikaan diagnoosista paksusuolisyövän kunnes kuolema mistä tahansa syystä. DFS oli siihen aikaan diagnoosista paksusuolisyövän esiintymiseen asti etäpesäke, uusiutuminen tai kuolema mistä tahansa syystä, kumpi oli aikaisempi. Potilaat, jotka eivät ole kokeneet tulos edun sensuroitiin aikaan viime seurata.

c) Muuttujat.

Categorical muuttujat analysoitiin olivat sukupuoli (miehet vs naaraat), kasvainhistologiaa (mucinous vs ei-mucinous), kasvaimen sijainti (peräsuolen vs paksusuoli), vaiheen (vaiheiden II, III ja IV vs vaihe I), kasvaimen (huonosti eriytetty /erilaistumaton vs hyvin /kohtuullisesti eriytetty), verisuonten ja imusuonten invasions (läsnä vs poissa) , familiaalinen riski (korkea /keskitason riski vs alhainen riski), mikrosatelliittien epävakaus asema (MSI-H vs MSI-L /MSS) ja

BRAF1

Val600Glu mutaatiostatus (läsnä vs villityypin). Löytämisen asetettu, familiaalinen riskistatus määritettiin aiemmin antamat NFCCR tutkijat käyttäen Amsterdamin II ja tarkistetut Bethesda kriteerien [18]. Kasvain MSI tila ja

BRAF1

Val600Glu tila analyysit myös aiemmin suoritettiin NFCCR [19], [20], [22]. Verisuonten ja imusuonten invasions korreloivat voimakkaasti löytö kohortin ( 95% kasvaimista verisuoni- invaasiota oli myös imusuonten hyökkäystä). Huomaa, että joissakin malleissa, luottamusväli vaiheen IV potilaat olivat leveä, mikä pieni otoskoko tässä potilasryhmässä. Näin ollen nämä tulokset tulee tulkita varovaisesti.

luokitteli genotyyppien jokaisen polymorfismin olettaen yhteistyössä hallitseva geneettinen malli (eli pienet alleeli homozygoottien ja heterotsygootit yksitellen verrattiin pääalleelille homotsygootit). Kun kyseessä on

MTHFR

Glu429Ala polymorfismi, voimme myös tehdä monimuuttuja analyysit alle väistyvä (CC vs CA + AA genotyyppien) ja hallitseva (CC + CA vs AA genotyyppien) geneettistä mallia.

PTGS2

c.3618A /G-polymorfismi sisällytetä tilastolliseen analyysiin, koska sen erittäin alhainen vähäinen alleelin taajuus (1,63%). Sillä VNTR polymorfismi

TYMS

geeni (rs34743033), 0,93% näytteistä on löytö kohortissa oli harvinainen 4R alleeli. Nämä potilaat yhdistettiin 3R /3R genotyyppien analyysejä varten. Ikä oli ainoa jatkuva muuttuja analyysimme.

d) Univariate analysoi.

Aika-to-tapahtuman selviytymisen tontteja rakennettiin käyttäen Kaplan-Meier menetelmällä ja verrattiin log-rank testi.

e) Monimuuttujalähettimet analyysi.

muuttujia käytetään rakentamisessa lopullisen monimuuttuja mallien valittiin taaksepäin eliminointimenetelmä OS ja DFS erikseen Coxin regressiomallin menetelmällä. Valitut muuttujia sitten palasi lopullisessa malleissa. Suhteellisuuden olettamus varmistettiin tutkimalla log-miinus-log (log (-log (S (t)))) tontteja. Testasimme myös vuorovaikutusta

MTHFR

Glu429Ala genotyyppejä (co-hallitseva geneettinen malli) ja 5-FU hoidossa käytetty Cox regressiomenetelmä.

f) ositettu analysoi.

Koska MTHFR entsyymin (siis Glu429Ala polymorfismin muuttamalla MTHFR entsymaattinen aktiivisuus) soittaa biologinen rooli 5-FU aineenvaihdunnan /tehoa (katso keskustelu), 5-FU kerrostuminen tehtiin vain tämän polymorfismin. Koska tämä polymorfismi ei liittynyt DFS, 5-FU kerrostuminen analyysi DFS ei suoritettu.

g) Vertailut kohortteja.

Voit testata, jos erot perustason ominaisuudet löytö ja validointi kohortit huomattava, suoritimme Chi-neliö testi kategorisen muuttujia. Koska iän ei normaalisti jakautunut niin ikäluokat, ei-parametrinen Mannin Whitney-U-testiä käytettiin vertaamaan erojen jakautuminen ikään näiden kahden ikäryhmät. Samanlaisia ​​analyysejä suoritettiin myös verrata koko NFCCR kohortti (n = 736) ja Discovery kohortti (n = 532) sekä myös koko toinen kohortti (n = 280) ja validointi kohortti mukana meidän analyysi (n = 252).

PASW Statistics 18 ohjelmistoversio 18.0.2 (IBM, NY, USA) käytettiin suorittamaan tilastolliset analyysit. Kaikki testit olivat kaksipuolisia ja merkitys oli vahvistettu p = 0,05. Väärien negatiivisten tulosten korjaaminen moninkertainen testaaminen ei tehty löytö kohortin analyysissä. Vaikka tämä lisää myös potentiaalinen määrä vääriä positiivisia yhdistysten analyysi yhdistysten havaittu löytö kohortin ylimääräinen potilaalla kohortin (eli replikointi kohortti) auttoi poistaa väärät positiiviset tulokset.

Tulokset

Discovery Cohort ominaisuudet

Baseline ominaisuudet löytö kohortin on lueteltu taulukossa 2. mediaani-ikä diagnoosin ajankohtana oli 61,4 vuotta. Kolmasosa (33,3%) potilaista oli kuollut ja 39%: lla potilaista oli ollut toistuminen, etäpesäke tai kuoleman aikaan viime seurannan. Löytö kohortti on merkittävästi pienempi osuus vaiheen IV potilaista (9,8%) verrattuna koko NFCCR kohortin (20,9%) (p 0,001). Löytö kohortti myös merkittävästi erosi NFCCR kohortin kannalta suhteissa kasvainten verisuonten (p = 0,007) ja imusuonten invasions (p = 0,021), ja kuolleen potilaat (p 0,001).

Overall Survival Analysis Discovery Cohort

Out of 26 polymorfismien tutkittu, neljä polymorfiat liittyivät merkittävästi OS kun oikaistu sukupuolen, iän, vaiheen ja MSI tila (taulukko 3). Lyhyesti, että

MTHFR

Glu429Ala polymorfismi, potilaat homotsygoottisia C-alleelin oli lyhyempi elinaika (HR: 1,72, 95% CI: [1,04-2,84], p = 0,036) verrattuna potilaisiin homotsygoottisia A-alleelin . Sillä

ERCC5

His46His polymorfismi, potilailla, joilla on TT genotyyppi oli suurempi kuolemanriski (HR: 1,78, 95% CI: [1,15-2,76], p = 0,01) kuin potilailla, joilla oli CC-genotyyppi . Siinä tapauksessa, että

SERPINE1 –

675indelG polymorfismi, vähäinen alleelin homotsygootit (insG /insG) oli kasvanut eloonjäämisen (HR: 0,52, 95% CI: [,32-,84], p = 0,008), verrattuna potilaalla on delg /delg genotyyppi. Genotyyppi jakaumat näiden kolmen polymorfismien olivat HWE (p 0,05, taulukko S3 File S1). Lisäksi potilailla, joilla on ainakin yksi kopio

GSTM1

geeni oli suurempi kuolemanriski kuin potilailla, joilla ei ole kopio geenistä (HR: 1,40, 95% CI: [1,03-1,92], p = 0,033) (taulukko 3).

Tautivapaa Survival Analysis Discovery Cohort

Out of 26 polymorfismien,

ERCC5

His46His ja

OGG1

Ser326Cys polymorfismien liittyivät lyhyempi DFS löytö kohortin korjattuna muiden muuttujien (taulukko 4). Erityisesti potilaat homotsygoottisia T-alleelin

ERCC5

His46His (HR: 1,54, 95% CI: [1,04-2,29], p = 0,032) ja G-alleelin

OGG1

Ser326Cys (HR: 1,81, 95% CI: [1,08-3,04], p = 0,025) oli elinajan verrattuna pääalleelille homotsygootit.

Euroopan Validation Cohort ominaisuudet

Baseline ominaisuudet validoinnin kohortin on lueteltu taulukossa 2. mediaani-ikä diagnoosin oli 68,7 vuotta. Mennessä viime seurannan 61,5%: lla potilaista oli kuollut ja 66,3%: lla potilaista oli kokenut uusiutuminen, etäpesäke tai kuolema. Ei ollut tilastollisesti merkittäviä eroja alkuperäisen 280 potilasta tässä kohortissa ja 252 potilasta mukana tässä tutkimuksessa kliinisistä ja molekyylitason ominaisuuksia (

tuloksia ei ole esitetty

).

Kuitenkin olivat merkittäviä eroja löydön ja validointi kohortteja suhteen kliinis ominaisuuksista. Ensin oli suurempi osuus vaihe IV potilaista validointi kohortissa (16,3%) verrattuna löytö kohortissa (9,8%) (p = 0,034). Toiseksi, mediaani ikä diagnoosin validoinnissa kohortin (68,7 vuotta) oli merkitsevästi korkeampi (p 0,001) verrattuna löytö kohortin (61,4 vuotta). Niiden potilaiden osuus mitattuna sukupuoli, kasvaimen sijainti, laatu, OS ja DFS tila, verisuonten ja imusuonten valloitusten, ja hoito 5-FU-pohjaiset hoidot olivat myös erilaiset kahden ikäluokat (taulukko 2).

Kaiken Survival Analysis Validation Cohort

genotyyppi jakauma neljän polymorfismien testattu validointi kohortissa ei poikennut HWE. Näistä neljästä polymorfismien vain

MTHFR

Glu429Ala polymorfismi oli yhteydessä lyhyemmät eloonjäämisajasta korjattuna muiden muuttujien (taulukko 3). Kuitenkin toisin kuin löytö asettaa, että validointi kohortin heterozygootit (Glu /Ala) oli lyhyempi eloonjäämisen (HR: 1,71, 95% CI: [1,18-2,49], p = 0,005) verrattuna homotsygoottisia glutamaatin ( glu /Glu) (kuvio 1). Siten genotyyppi liittyy elinajan validoinnissa kohortin (AC) oli erilainen kuin genotyyppi liittyy löytö kohortin (CC). Siksi me myös suorittaa monimuuttuja analyysit olettaen väistyvä ja hallitseva geneettinen malleja näissä kahdessa ikäryhmät (taulukko 3, taulukot S4-S7 File S1). Tämän seurauksena löytö asetettu,

MTHFR

Glu429Ala polymorfismi liittyi OS resessiivinen geneettinen malli (CC vs AC + AA, HR: 1,80, 95% CI: [1,13-2,86], p = 0,014), mutta ei hallitseva geneettinen malli. Sen sijaan, että validointi asetettu, tämä polymorfismi liittyi OS hallitseva geneettinen malli (CC + AC vs AA, HR: 1,56, 95% CI: [1,12-2,17], p = 0,009), mutta ei resessiivinen geneettinen malli. Analyysi tämän polymorfismin olettaen lisäaineen geneettistä mallia ei tuottanut merkittävää yhteyttä OS joko kohortin (

tuloksia ei ole esitetty

). Niinpä yhdistys

MTHFR

Glu429Ala polymorfismi OS näissä kahdessa ikäryhmät havaitaan eri geneettinen malleja.

Tutkiva Analyysit Kaiken Survival ja

MTHFR

Glu429Ala polymorfismi

Vaikka tämä mielenkiintoinen yhdistys mallia

MTHFR

Glu429Ala polymorfismi OS kahdessa kohortit voidaan myös selittää alennetun tilastollinen voima havaita vaikutuksia kunkin genotyyppiryhmien, me myös suorittanut vielä tutkivan analyysejä tutkia muita mahdollisuuksia. Ensinnäkin testata onko yhdistys erilaisten genotyyppien voisi johtua suhteellisesti korkeampi mediaani-ikä validoinnissa kohortti verrattuna löytö kohortti (ks Keskustelu), suoritimme monimuuttuja-analyysi potilaille validointielinten joukko, jotka olivat alle 75 vuotta ikä aikaan diagnoosi (n = 149). Silti, huomasimme, että kuvio yhdistyksen havaittu tässä analyysissä (AC vs AA, HR: 2,02, 95% CI: [1,20-3,41], p = 0,008) oli samanlainen kuin saatu validointi kohortissa, mikä viittaa siihen, ikä diagnoosin ei ollut syy tähän eron. Toiseksi, koska 5-FU tehokkuus saattaisi modifioitu aktiivisuus MTHFR entsyymin (ks Keskustelu), testasimme myös yhdistys

MTHFR

Glu429Ala genotyypit kanssa OS potilasryhmissä kerrostunut perustuu niiden käsittely ominaisuudet (hoidetuilla potilailla 5-FU pohjaiset hoidot versus potilaita ei hoidettu sitä). Mielenkiintoista on, että tämä analyysi, olemme havainneet, että kun ikä-, vaiheessa MSI tila, tämä polymorfismi merkitsevästi yhteydessä OS potilailla joita ei ole hoidettu 5-FU (molemmat CC vs AA ja AC vs AA genotyyppien löytö asettaa ja AC vs AA genotyyppien validointi kohortissa), mutta ei potilailla, joita hoidettiin 5-FU pohjaiset hoidot (taulukot 5 ja 6). Analyysi vuorovaikutuksesta

MTHFR

Glu429Ala polymorfismi ja 5-FU hoitostatus sekä löytö ja validointi kohortteja ei havaittu tilastollisesti merkittävää vuorovaikutusta näiden kahden muuttujan.

Tautivapaa Survival Analysis Validation Cohort

monimuuttuja analyysiä DFS validointi kohortin yhdistys

ERCC5

His46His polymorfismi DFS havaittiin myös seuraavasti: kuin potilailla, joilla oli CC-genotyyppi, potilailla, joilla on TT ja CT genotyyppien oli lyhyempi DFS (HR: 1,81, 95% CI: [1,11-2,94], p = 0,018 ja HR: 1,48, 95% CI: [1,02-2,17 ], p = 0,041), vastaavasti (taulukko 4).

keskustelu

tärkein tulos Tutkimuksemme on, että yhdistysten

MTHFR

Glu429Ala polymorfismi kanssa yleisen selviytyminen ja

ERCC5

His46His polymorfismi kanssa tautivapaan elinajan havaittiin kahdessa erillisessä ikäluokat paksusuolisyövän potilaista.

kaksi muuta tutkimukset ovat myös raportoineet

MTHFR

Glu429Ala polymorfia liittyvän OS peräsuolen syöpäpotilailla. Eräässä tutkimuksessa on espanjalainen kohortin [23], potilaat kuljettaa C-alleelin (AC + CC-genotyyppi) oli elinajan kuin AA genotyyppi, kun oikaistu kliinis muuttujia. Vastaavasti toisessa tutkimuksessa [24] suoritetaan metastaattinen paksusuolen syövän potilaille, naispotilaiden AC + CC genotyyppien varten

MTHFR

Glu429Ala oli huonompi OS kuin naispotilaiden AA genotyypin univariate analyysiin. Kuitenkin kuudessa muussa tutkimuksissa ei havaittu yhteyttä välillä

MTHFR

Glu429Ala polymorfismi ja OS peräsuolen syövän Yksiulotteisissa tai monimuuttuja analyysit [25] – [30].

rooli MTHFR entsyymin ja sen Glu429Ala polymorfismi kolorektaalisyövässä ennuste ei ole tunnettu. Kuitenkin MTHFR on biologisesti tutkittu hyvin yksityiskohtaisesti (ts rooliaan foolihappometaboliaan ja 5-FU vaikutusmekanismi). Lisäksi Glu429Ala polymorfismi on aikaisemmin osoitettu aiheuttavan kohtalainen väheneminen aktiivisuuden MTHFR entsyymin; Ala /Ala homozygoottien on lähes 60% normaalista MTHFR toiminnan ja heterotsygootit ovat -80% normaalista MTHFR toimintaa [31], [32].

foolihappometaboliaan yksi biologisia vaikutuksia MTHFR entsyymin on muuntaa 5,10-metyleenitetrahydrofolaattia (5,10-MTHF) 5-methyltetrahydrofolate (5-MTHF) [33]. 5,10-MTHF käytetään pääasiallisesti synteesissä puriinien ja tymidiiniä, nukleotidit, jota jakautuvien solujen DNA-synteesissä. Lisäksi 5-MTHF käytetään synteesi S-adenosyyli-metioniinin (SAM), joka on keskeinen välittäjäaine useita metylaation reaktioita, kuten DNA: n metylaatio [33]. Siten vähentäminen MTHFR entsymaattinen aktiivisuus johtuu Glu429Ala polymorfismi voi johtaa kertyminen 5,10-MTHF ja samanaikainen väheneminen 5-MTHF jossain määrin (kuvio 2). Kertyminen 5,10-MTHF muodossa folaatti voi tarjota lisää määriä nukleotidin DNA-synteesiin on nopeasti lisääntyvien syöpäsolujen kasvua. Tätä teoriaa tukee viimeaikaisista tiedoista, joiden mukaan kerran suolen kasvainten kehittämä, folaatti voi tukea sen kasvua ja etenemistä [34] – [37], oletettavasti helpottamalla suuria määriä nukleotidin lähtöaineiden tuumorikasvulle [33], [35 ], [36]. Toisessa tutkimuksessa, folaatti todettiin liittyvän etenemistä jo kehitetty kolorektaalisyövän rotilla [36]. Myös Aspirin /Folaatti polyyppi Prevention Study [34], [36], folaatti liittyy suurempi riski kehittyneitä adenoomia sekä lisääntynyt määrä adenoomia potilailla, joilla on aikaisemmin kehitettyjen peräsuolen adenoomia. Nämä havainnot viittaavat siihen negatiivinen vaikutus korkea folaatin tasot peräsuolen syövän ennustetta. Siksi meidän ikäluokat, yhdistys

MTHFR

Glu429Ala polymorfismi kanssa huonompi ennuste paksusuolisyövän potilaat saattavat johtua alhaisempaa MTHFR ja kertymistä folaatin mikä voi helpottaa kasvaimen kasvua.

nuolet osoittavat mahdolliset seuraukset polymorfismin biologisista prosesseista kuvattu.

lisäksi johtuen tehoton MTHFR entsyymin toimintaa (esim johtuen Glu429Ala polymorfismi), optimaalinen konversio 5,10 -MTHF 5-MTHF voidaan myös pienentää, jolloin tasojen aleneminen 5-MTHF. Tämä voi lopulta johtaa vähenemiseen synteesi SAM (kuvio 2). SAM on tärkeä metyyli avunantaja useita reaktioita ja sen puute voi aiheuttaa DNA hypometylaatio.