Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

MikroRNA (miRNA) ovat luokka pienet ei-koodaavat RNA: t säätelemään solujen erilaistumista, lisääntymistä, kehitys, ja apoptoosin. Yksittäinen nukleotidin polymorfismi (SNP) rs895819 sijaitsee terminaalissa silmukan

pre-miR-27a

. Täällä me pyrittiin tutkimaan, onko SNP rs895819 liittyi kehittämiseen munuaissyövän (RCC) kiinalaisessa väestöstä.

Methods

Tässä tapauskontrollitutkimuksessa rekrytoimme 594 RCC potilaiden ja 600 syöpää vapaa säätimet taajuus sovitettava iän ja sukupuolen. Me genotyyppi tämä polymorfia käyttäen TaqMan määritystä ja arvioi vaikutus tämän polymorfismin vaikutus RCC selviytymistä. Logistinen regressio mallia käytettiin arvioimaan geneettisiä vaikutuksia kehittämisestä RCC ja vuorovaikutukset rs895819 polymorfismin ja riskitekijöitä.

Tulokset

Verrattuna AA homotsygootti, yksilöiden kuljettaa AG /GG genotyyppien oli tilastollisesti merkitsevä alentunut herkkyys RCC (oikaistu OR = 0,71, 95% CI = ,56-+0,90). Lisäksi AG /GG genotyypit liittyy alentunut RCC alttius lokalisoitu kliinisessä vaiheessa (oikaistu OR = 0,71, 95% CI = 0,55-0,91), ja samanlaisia ​​vaikutuksia havaittiin hyvin eriytetty ja huonosti eriytetty RCC (oikaistu OR = 0,71, 95 % CI = 0,55-0,93 reilusti eriytetty, säätää tai = 0,51, 95% CI = +0,28-,93 huonosti eriytetty). Havaitsimme myös, että rs895819 oli multiplicative vuorovaikutusta iän ja verenpainetauti. Kuitenkin polymorfismi ei vaikuttanut selviytymistä RCC.

Johtopäätös

Tuloksemme viittaavat siihen, että

pre-miR-27a

rs895819 polymorfismi voi ennustaa RCC riski kiinalaisessa väestöstä. Suurempi väestöpohjainen tulevaisuudentutkimuksista tulisi käyttää vahvistamaan havaintomme.

Citation: Shi D, Li P, Ma L, Zhong D, Chu H, Yan F, et ai. (2012) geneettinen Variant

pre-miR-27a

liittyy munuaisten Cell syöpäriski kiinalaisessa väestöstä. PLoS ONE 7 (10): e46566. doi: 10,1371 /journal.pone.0046566

Editor: Rui Medeiros, IPO, Inst Port Oncology, Portugali

vastaanotettu: 19 kesäkuu 2012; Hyväksytty: 31 elokuu 2012; Julkaistu: 30 lokakuu 2012

Copyright: © 2012 Shi et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus osittain tuettu National Natural Science Foundation of China (81230068, 30972444, 81102089 ja 81201571), Key Program of Natural Science Foundation of Jiangsun maakunnassa (BK2010080), ja National Science Foundation of Jiangsun maakunnassa (BK2011773 ja BK2011775), Qin Lan Project Jiangsu Provincial Department of Education, ja Priority Academic ohjelmasuunnitteluosastolle Jiangsun korkeakouluista (terveys- ja ehkäisevän lääketieteen). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

munuaissyövän (RCC) osuus on yli 90% munuaisten karsinoomien, ja kirkkaalla cell munuaisten karsinooma on yleisin RCC [1], [2]. Ilmaantuvuus RCC vaihtelevat huomattavasti eri puolilla maailmaa, korkeampia Euroopassa ja Pohjois-Amerikassa ja alhaisimpia Aasiassa ja Etelä-Amerikassa [1]. Keskuudessa naaraat ovat yleensä noin puolet miesten keskuudessa [1]. Vaikka harvat riskitekijät laaditaan RCC, on olemassa useita altistavia tekijöitä, joiden tiedetään liittyvän kehittämiseen RCC, kuten tupakointi, lihavuus, kohonnut verenpaine, diabetes, suvussa syöpää, ja toiset [3], [4], [5]. Kuitenkin vain osa yksilöiden alttiina näiden riskitekijöiden kehittävät RCC niiden elämän ajan, mikä viittaa siihen, että yksilölliset erot kuten geneettinen alttius tekijät voivat olla yksi kriittisimmistä agenttien munuaissolukarsinooman karsinogeneesissä.

MikroRNA ( miRNA) ovat luokka endogeenisiä, pienten ja ei-koodaavat RNA: t (~22 nt), jotka on alun perin transkriboitu genomisesta DNA: sta ja pitkän ensisijaisen transkriptit (pri-miRNA), ja sitten pilkotaan ydin- Drosha osaksi 60-70 nt hairpin- muotoinen esiaste-RNA: t (pre-miRNA) [6], [7]. Pre-miRNA viedään sytoplasmassa Exportin-5 ja käsitellään edelleen ~22 nt kypsä miRNA duplekseista pilkkomista Dicer [8], [9]. Yhteistyössä RNA aiheuttama hiljentäminen kompleksi (RISC), miRNA voi aiheuttaa mRNA: n hajoamisen tai translaation tukahduttaminen sitoutumalla 3′-alue niiden kohdegeenien on posttranskriptionaalisella tasolla [10]. Tähän mennessä on arvioitu, että miRNA ilmentymisen moduloimiseksi noin 30% ihmisen geenien [11]. MiRNA ovat mukana monenlaisia ​​biologisia prosesseja kuten solukierron säätelyssä, apoptoosin ja kantasolujen ylläpito, kehittäminen, aineenvaihduntaa ja ikääntyminen [11]. On osoitettu, että miRNA osallistuvat ihmisen karsinogeneesissä joko tuumorisuppressoreilla tai onkogeenien [12], [13]. Kumulatiivinen tutkimukset ovat viitanneet siihen, että yhden emäksen monimuotoisuus (SNP: t) tai mutaatiot voivat antaa merkittävän panoksen tautiherkkyyteen ja lopputulos. Geneettisiä variantteja tai mutaatioita miRNA tai ennalta miRNA voi muuttaa miRNA ilmaisun ja /tai kypsymistä [14], [15].

Yksi tutkimus on järjestelmällisesti tunnistettu 323 SNP 227 tunnettujen ihmisen miRNA, ja 12 SNP sijaitsevat sisällä miRNA esiasteita [14]. SNP rs895819 sijaitsee silmukan

pre-miR-27a

ja siihen kuuluu A G nukleotidin siirtyminen. Sun

et al.

[16] ilmoitetaan polymorfismin voi johtaa prosessi vaihtelua, korkeampi ilmentyminen miR-27a ja lopulta alttiutta mahasyövän [16]. Vaikka Yang

et al.

[17] todettiin, että G-alleelin rs895819 saattaisi heikentää kypsymisen miR-27a, siten, nähtiin lisääntynyt perinnöllinen rintasyövän riskiä. Lisäksi Mertens-Talcott

et al.

Raportoitu, että rintasyövän soluissa, transfektio antisense miR-27a johtaa lisääntyneen ilmentymisen Zinc finger ja BTB domeenin, joka sisältää 10 (ZBTB10) (oletettu Sp repressori), ja nämä vasteet liitetään vähentynyt ilmentyminen Sp-riippuvaa eloonjäämistä ja angiogeenisten geenien, mukaan lukien

surviviini

, verisuonen endoteelin kasvutekijä (

VEGF

), ja VEGF-reseptori 1 (

VEGFR1

) [18]. Kuitenkin yli-surviviinin ilmentyminen havaitaan usein eri syöpätyyppien, kuten RCC [19]. Tähän mennessä ei ole tutkimuksen yhdistyksen välillä

pre-miR-27a

polymorfismi ja RCC alttius.

Koska meillä tietämyksen uusi polymorfismi ja biologiseen toimintaan

asennuspalveli- 27a

, me arveltu, että

pre-miR-27a

polymorfismi oli yhteydessä RCC alttiuteen. Tämän hypoteesin testaamiseksi, me genotyyppi tässä SNP rs895819 ja arvioinut yhdessä riski RCC meidän meneillään tapauskontrollitutkimuksessa kiinalaisessa väestöstä.

Materiaalit ja menetelmät

Tutkittavat

Tämä tutkimus käsitti 594 potilasta ja 600 syöpää vapaa valvontaa. Kaikki koehenkilöt tutkimuksessamme ovat etninen Han-kiinalaiset ilman geneettistä suhdetta. Kaikki potilaat olivat vasta diagnosoitu histopatologisesti vahvistettu tapaus RCC. Niissä tapauksissa, jotka saivat kemoterapiaa tai radio-hoitoa ennen leikkausta tai oli muita syöpätyyppi jätettiin tämän tutkimuksen. Peräkkäiset RCC potilasta rekrytoitiin välillä toukokuu 2004 ja elokuun 2010 Ensimmäinen Affiliated sairaala Nanjing Medical University, Nanjing, Kiina. Tauti oli luokiteltu Maailman terveysjärjestön kriteerien ja lavastettuja mukaan American sekakomitean Cancer TNM luokittelu. Fuhrman asteikko avulla arvioitiin kasvaimen Ydinteollisuudessa [20]. Kontrollit rekrytoitiin jotka etsivät terveydenhuoltoa poliklinikoilla samaan sairaalaan. Syöpä-vapaa verrokit taajuus sovitettava sukupuolen ja iän (± 5 vuotta) tapauksiin ilman yksilöllinen syövän ja perheen liity tapauksiin. Opastettu kyselylomake väestöstä ja elämäntapaan liittyvien tekijöiden annettiin kautta face-to-face haastattelut koulutettu haastattelijat. Kukin potilas lahjoitti 5 ml verta genomista DNA: n eristämiseksi jälkeen kirjallinen suostumus saamiseksi kaikista aiheista. Tutkimus hyväksyi Institutional Review Board of Nanjingin Medical University.

selviytymisen analyysin 296 RCC tapauksissa ilmoittautunut jatkuvaa kohorttitutkimuksessa toukokuusta 2004 lokakuu 2009 käytettiin. Potilaita seurattiin jopa takautuvasti 6 kuukauden välein alkaen sai diagnosoitu kunnes kuolema tai viimeisen kerran seuranta. Suurin seuranta-aika oli 72 kuukautta (viimeinen seurannan elokuussa 2010) ja mediaani seuranta-aika oli 19,3 kuukautta.

genotyypin

Perimän DNA eristettiin leukosyyteistä laskimoiden verestä proteinaasi K ruoansulatusta ja uutetaan fenoli /kloroformilla. Genotyypin suoritettiin TaqMan SNP genotyypin määritys käyttäen 384-hyvin 7900HT reaaliaikainen PCR System ja SDS 2.3 -ohjelmisto alleelinen syrjintä (Applied Biosystems, Foster City, CA). Sekvenssi alukkeiden ja koettimien on esitetty taulukossa S1. Genomi-DNA: ta 50 ng ja 0,5 x mix (TaKaRa Bio, USA) käytettiin kunkin reaktion ja monistus suoritettiin seuraavissa olosuhteissa: 50 ° C 2 min, 95 ° C: ssa 10 min, mitä seurasi 45 sykliä 95 ° C: ssa 15 s, ja 60 ° C 1 min. Polymorfismi analyysi suoritettiin kaksi henkilöä itsenäisesti pidennetyn tavalla. Noin 10% näytteistä valittiin satunnaisesti toistuvaa genotyypityksen validointiin, ja tulokset olivat 100% yhtäpitävät. PCR-tuotteet SNP eri genotyypit on valittu ja varmistettiin suoralla sekvensoinnilla (kuvio 1).

(A) Kahden piikit on merkitty nuolella edusti heterotsygoottinen genotyyppi TC (AG). (B) yhden piikin merkitty nuolella edusti homotsygoottinen genotyyppi TT (AA). (C) yhden piikin merkitty nuolella edusti homotsygoottinen genotyyppi CC (GG).

Analyysi HSA-miR-27a ilmaisu

edelleen arvioimista korrelaatiota HSA-asennuspalveli- 27a ilmaisun ja rs895819 polymorfismi

in vivo

, 25 poistettiin kirurgisesti normaali munuaisten kudosnäytteitä, joka sisältää 100% normaalit solut vieressä kasvainten potilaista eri genotyypit kerättiin. Kokonais-RNA uutettiin näistä näytteistä käyttämällä Trizol-reagenssia (Invitrogen, Carlsbad, CA, Yhdysvallat) mukaan valmistajan protokollaa. Applied Biosystems 7900HT Real Time PCR System käytettiin tehdä reaaliaikaisia ​​kvantifiointiin PCR (Foster City, CA, US), joka perustuu SYBR-Green menetelmän (Takara Bio, JPN). Käytetyt alukkeet monistusta HSA-miR-27a-mRNA oli 5’ACACTCCAGCTGGGTTCACAGTGGCTAAG-3 ’(eteenpäin) ja 5′-TGGTGTCGTGGAGTCG-3’ (taaksepäin), ja alukkeet U6 olivat 5’CTCGCTTCGGCAGCACA-3 ’(forward ) ja 5’- AACGCTTCACGAATTTGCGT-3 ’(reverse). Kaikki reaktiot suoritettiin kolminkertaisina. Kertamuutoksia normalisoitiin ilmentymistasojen U6.

Tilastollinen

Erot jakaumat valitun demografiset muuttujat ja taajuudet genotyyppien välillä tapausten ja kontrollien arvioitiin käyttämällä Studentin

t

-testi (jatkuvien muuttujien) tai Pearsonin χ

2-testi (kategorisen muuttujat). Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) valvonnan ”genotyyppi taajuuksia arvioitiin jonka hyvyys fit χ

2 testiä. Yhdistys välinen SNP rs895819 polymorfia ja RCC riski arvioitiin laskemalla kertoimet suhdeluvut (syrjäisimmillä alueilla) ja niiden 95% luottamusväli (CI) alkaen ehdoton regressioanalyysimme kanssa mahdollisten sekoittavien tekijöiden mukauttamisen. Kaplan-Meier menetelmä, log-rank testi, yhden ja usean Coxin Regressioanalyysistä käytettiin vaikutusten arvioimiseksi

pre-miR-27a

genotyyppien yleiseen eloonjäämiseen sairastavien potilaiden RCC.

P

0,05 katsottiin tilastollisesti merkitsevä. Kaikki tilastolliset analyysit tehtiin kanssa Tilastollinen analyysi System ohjelmisto (9.1.3; SAS Institute, Cary, NC, Yhdysvallat) kaksipuolisella

P

arvoja. Tilastollinen teho laskettiin käyttämällä PS ohjelmistoa (https://biostat.mc.vanderbilt.edu/twiki/bin/view/Main/PowerSampleSize).

Results

Characteristics Tutkimukseen osallistuneista

frekvenssijakaumat valittujen demografisia ominaisuuksia tapausten ja kontrollien on esitetty taulukossa 1. ei ollut eroja potilaiden ja verrokkien iästä (

P

= 0,642) , painoindeksi (BMI) (

P

= 0,074), sukupuoli (

P

= 0,222), tupakoinnista (

P

= 0,127), pakkaus-vuotta tupakointi (

P

= 0,251) ja juominen tila (

P

= 0,714). Oli kuitenkin enemmän sairastaneista potilaista (36,4%), ja diabeetikoille (13,5%) joukossa tapauksia kuin keskuudessa säätimet (kaikki

P

0,05). Suurin osa potilaista (84,0%) oli tavanomainen selkeä cell carcinoma. Muut potilailla, joilla oli papillaarinen karsinooma, kromofobista leikettä syöpä ja luokkiin laskettiin yhdeksänkymmentäviisi (16%). Noin 63,5% potilaista oli vaiheessa I, 18,4%, 6,7%, ja 11,4% todettiin olevan vaiheen II, III, ja IV vastaavasti. Lisäksi taajuudet ydinvoiman vuosiluokat I-IV oli 18,2%, 48,0%, 24,7%, ja 9,1%: lla.

välisestä assosiaatiosta

pre-miR-27a

polymorfismi ja RCC riski

alleelifrekvenssit ja genotyyppi jakaumien

pre-miR-27a

rs895819 polymorfismi potilaiden ja verrokkien on esitetty taulukossa 2. Havaittu genotyyppi taajuudet kontrollien olivat yhdenmukaisia että odotettavissa HWE mallista (χ

2 = 0,795,

P

= 0,373). Taajuudet jakautuminen G-alleelin merkittävästi erottuvat alleelin joukosta tapausten ja kontrollien (

P

= 0,019). Säätämisen jälkeen mahdollisten sekoittavien tekijöiden (ikä, sukupuoli, tupakointi asema, juominen tila, korkea verenpaine ja diabetes), logistinen regressio analyysi paljasti, että verrattaessa AA homotsygootti, AG heterotsygoottinen liittyi vähensi merkitsevästi RCC riski (oikaistu OR = 0,68, 95% CI = 0,53-0,87) ja yksilöiden AG /GG-genotyyppi oli myös alentunut herkkyys RCC (oikaistu OR = 0,71, 95% CI = 0,56-0,90).

lisäksi siinä kerrostunut analyysi iän, BMI, sukupuoli, tupakointi asema, juominen tila, kohonnut verenpaine ja diabetes, huomasimme, että pienempi riski oli selvempi nuorilla (oikaistu OR = 0,56, 95% CI = 0,40-0,78), potilailla, joilla oli BMI≤ 24 (oikaistu OR = 0,67, 95% CI = 0,48-0,93), miehillä (oikaistu OR = 0,66, 95% CI = 0,49-0,88), tupakoimattomien (oikaistu OR = 0,71, 95% CI = 0,53-0,95), raittiita (oikaistu OR = 0,72, 95% CI = 0,55-,95), joilla ei ollut verenpainetauti (oikaistu OR = 0,61, 95% CI = 0,46-0,81) ja joilla ei ollut diabetesta (oikaistu OR = 0,69, 95% CI = 0,54 -0,88) (taulukko 3).

Association between

pre-miR-27a

polymorfismi ja kliiniset ominaisuudet RCC

lisäksi yhdistyksen välillä

pre-miR-27a

rs895819 polymorfismi ja kliiniset ominaisuudet RCC tutkittiin myös. Tulokset osoittivat, että AG /GG-genotyyppi liittyy alentunut alttius lokalisoitu kliinisessä vaiheessa (oikaistu OR = 0,71, 95% CI = ,55-+0,91) ja samanlaisia ​​vaikutuksia havaittiin hyvin eriytetty ja huonosti eriytetty RCC (oikaistu OR = 0,71, 95% CI = ,55-+0,93 reilusti eriytetty, säätää tai = 0,51, 95% CI = ,28-,93 huonosti eriytetty) (taulukko 4).

Vuorovaikutus analyysit rs895819 polymorfismin ja riskitekijät

Olemme arvioineet, oliko olemassa vuorovaikutukset rs895819 polymorfismin ja ikä, painoindeksi, sukupuoli, tupakointi, juominen tila, kohonnut verenpaine ja diabetes. Kuten taulukossa S2, verrattuna henkilöt, jotka olivat sekä ≤57 vuotta ja AA kantajia, vähensi merkitsevästi riski havaittiin jotka olivat ≤57 vuotta AG /GG-genotyyppi (oikaistu OR = 0,57, 95% CI = 0,41-0,79) ja ne, jotka olivat 57 sekä AA ja AG /GG genotyyppien (oikaistu OR = 0,64, 95% CI = 0,46-0,89 AA oikaistuna OR = 0,60, 95% CI = ,42-,85 AG /GG). Samanlaisia ​​vaikutuksia havaittiin AG /GG harjoittajat, jotka olivat 24 kg /m

2, urokset, tupakoimattomien, nondrinkers, joilla ei ollut verenpainetauti ja aiheita ilman diabetesta verrattuna AA harjoittajille. Olemme edelleen havaittu rs895819 oli multiplicative vuorovaikutusta iän ja verenpainetauti (

P

vuorovaikutus = 0,035 ikä ja

P

vuorovaikutus = 0,030 verenpainetauti).

lisäksi Kaplan-Meier käyrät ja log-rank testejä käytettiin arvioimaan assosiaatio genotyyppien ja selviytymisen RCC. Emme kuitenkaan ei löytänyt rs895819 genotyypit liittyvän potilaiden kokonaiselinaika. Vuonna vaiheittain Coxin, tulokset ehdottivat, että kliinisessä vaiheessa oli paras ennustetekijä RCC selviytymisen minkä jälkeen kasvaimen (tietoja ei esitetty).

ry rs895819 polymorfismin kanssa ekspressiotasot HSA-miR-27a

Olemme keränneet 25 poistaa kirurgisesti normaali munuaisten kudosnäytteitä vieressä kasvaimia eri genotyypit rs895819, ja taajuus jakelu AA, AG, GG genotyyppiä oli 13, 10, ja 2, vastaavasti. Olemme edelleen arvioinut assosiaatiota polymorfismin ja HSA-miR-27a ilmentymisen tasot käyttäen kvantitatiivisen tosiaikaisen RT-PCR. Näytteet GG-genotyyppi lisättiin näytteitä AG genotyypin analyysiä varten. Kuitenkin johtuen pieniä näytteitä GG genotyyppiä, emme löytäneet yhdistyksen välillä rs895819 ja ilmaisu HSA-miR-27a (

P

= 0,08) (tuloksia ei ole esitetty). Lisäksi toiminnallinen tutkimuksia syytä, kun keräsimme suuria näytteitä.

Keskustelu

Tässä tutkimuksessa olemme tutkineet yhdistyksen välillä

pre-miR-27a

rs895819 polymorfismia ja RCC riski. Ottaen huomioon suhteellisen vähän taajuuksia GG genotyypin ja vastaavat asteikot syrjäisimpien alueiden heterotsygoottianalyysiin (AG) ja homotsygoottisia (GG) yhdenvertaisuus että testattujen tarkkailla nonsignificant

P

-arvo of 0,568 viittaa hallitseva malli, me Yhdistetyt AG ja GG genotyyppiä kuin hallitseva geneettinen malli seuraavissa yhdistys analyysi. Huomasimme, että yksilöiden AG /GG genotyypit liittyi merkitsevästi vähensi RCC riski, verrattuna kuljettavat AA genotyyppi. Lisäksi vaikutus oli vielä voimakkaampi tupakoimattomilla, nuorilla, miehillä ja yksilöille verenpainetauti tai diabetes. Lisäksi aiheet kuljettaa G-alleeli oli myös alentunut herkkyys lokalisoitu kliiniseen vaiheeseen, hyvin eriytetty ja huonosti eriytetty RCC. Tietääksemme tämä on ensimmäinen tutkimus tutkia roolia

pre-miR-27a

rs895819 polymorfismi riski RCC.

Nykyään yhä tutkimukset ovat ehdottaneet, että miRNA, joka on tärkeä rooli syövän kehitykseen kasvain onkogeenien tai tuumorisuppressoreilla osallistuvat ratkaiseva biologisissa prosesseissa, kuten kehitys-, erilaistuminen, apoptoosi ja lisääntymistä [12], [21]. Geneettisiä vaihteluita miRNA on raportoitu liittyvän monia kasvaimia, kuten rintasyövän [22], mahasyöpä [23], paksusuolen ja peräsuolen syövän [24] ja keuhkosyövän [15]. Vaikka SNP miRNA on tutkittu laajasti, yhdistyksen välillä SNP miRNA ja munuaissyövän syöpäriskiä pysyy vielä tunneta. Horikawa

et al.

Määritelty 7 SNP 7 pre-miRNA, ja 10 SNP 8 pri-miRNA, mutta yksikään niistä ei ollut merkittävä vaikutus RCC riski [25]. Kuitenkin Horikawa

et al.

Ehdotti, että geneettisten polymorfismien n miRNA-koneiden geenit saattavat vaikuttaa RCC alttiuteen erikseen ja yhdessä.

SNP rs895819 löytyi ennalta miRNA alueet HSA-asennuspalveli- 27a, joka on kromosomissa 19, ja se sijaitsee asemassa 40 suhteessa ensimmäiseen nukleotidin. On raportoitu, että vaihtelu aiheuttaa rakennemuutos ratkaisevan alueella miRNA voi vaikuttaa kypsymisen ja prosessi miRNA [26], [27]. Käytimme RNA-kertainen ohjelma ennustaa vakain sekundaarirakenteen on

pre-miR-27a

, jossa on kaksi erilaista sekvenssiä, mutta G vaihtelu rs895819 ei vaikuttaisi konformaation eikä vapaa energia

pre -miR-27a

(tuloksia ei ole esitetty). Sanalla, käsittely ja kypsymisen miRNA oli monimutkaisempi ja hienovarainen kuin ennustettu. Zeng

et al.

Havaittu, että Drosha selektiivisesti lohkaisee RNA pinnit joissa suuri terminaali silmukka. Kun silmukka lyhenee mutaatio tai poistoja, kypsymisen prosessi heikkenee [28]. Mukaan ennustettu rakenne

pre-miR-27a

, rs895819 sijaitsee keskellä päätelaitteen silmukassa rs895819 A G siirtyminen voi pienentää silmukan. Näin ollen lohkaisu Drosha estyisi, ja kypsytys on siten estetty. Lopuksi rs895819 voisi olla tärkeä rooli kypsymistä miR-27a. Kuitenkin, koska meillä oli vain 2 yksilöiden GG genotyyppiä, emme löytäneet yhdistyksen välillä rs895819 ja ilmaisu HSA-miR-27a, nämä havainnot on vahvistettu lisätutkimuksia.

Tietääksemme monet ihmisen miRNA selostukset on kohdesekvenssien 3′-UTR johon miRNA sitoa ja käyttää posttranskriptionaalisella tukahduttaminen. Liu

et al.

Löytyi

miR-27a

toimii onkogeenin mahalaukun adenokarsinooman kohdentamalla prohibitin [29] ja Chintharlapalli

et al.

Ehdotti, että onkogeeniset

miR-27a

oli tavoite syöpälääke koolonkarsinoomasoluissa [30]. Tuloksemme osoittivat, että villi genotyyppi AA

pre

–

miR-27a

oli tiheämmin tapauksissa kuin verrokeilla, kun taas henkilöt kuljettaa variantti G-alleeli oli pienentynyt RCC vaara, mikä osoittaa, että

miR-27a

oli todennäköisemmin onkogeenin, joka oli yhdenmukainen aiempien tutkimusten [29], [30]. Mertens-Talcott

et al.

Raportoitu, että rintasyövän soluissa, transfektio antisense miR-27a johtaa lisääntyneeseen ekspressioon ZBTB10 ja nämä vasteet olivat mukana vähentynyt ilmentyminen

surviviini

, Lisäksi surviviiniin on rakenteellisesti ainutlaatuinen jäsen apoptoosi-inhibiittori-proteiinin perheen, joka estää apoptoosin ja säätelee solujen jakautumista. Huolimatta redundanssi solukuoleman polkuja surviviiniperäiset näyttää vaaditaan syöpäsolun elinkelpoisuuden, ja häiriöt surviviinipeptidillä ilme /toiminta on yhdistetty katastrofaalisia vikoja mitoosi siirtymisen ja induktio mitokondrioiden-solukuolema [31]. Yli-ilmentyminen surviviinin mRNA: ta ja proteiinia havaittiin RCC solulinjoissa, mutta ei normaalissa ihmisen munuaisen epiteelisolulinja [19]. Kohonnut surviviinin ilmentyminen havaittiin myös RCC kudoksissa verrattuna viereisten normaaleissa kudoksissa [19], [32]. RCC potilailla, joilla on korkea surviviinista tasoja oli huomattavasti lyhyempi kokonaiselossaoloaika aikaa kuin ne, joilla on alhainen [33], [34]. Toisin sanoen, vähentynyt miR-27a tasot voivat vähentämään RCC läpi ilmentymisen estämiseksi survivn epäsuorasti. Se oli miksi me keskitymme

pre-miR-27a

polymorfismi RCC potilailla.

Tässä tutkimuksessa oli enemmän sairastaneista potilaista ja diabeetikoille joukossa tapauksia kuin keskuudessa tarkastuksia, mikä osoittaa, että oli mahdollisia yhteyksiä kahden tekijöitä ja RCC. Olemme myös havainneet, että rs895819 oli multiplicative vuorovaikutus verenpainetauti. On raportoitu, että tietyntyyppiset munuaisten kasvaimia ja syövän hoito voisi aiheuttaa verenpaineesta [35], [36] ja diabetes on yhdistetty munuaissyövän riskiä useissa kohorttitutkimusten [37], mutta sen rooli riippumattomia lihavuuden ja verenpainetauti ei ole osoitettu lopullisesti. Lisäksi tuloksemme osoittivat, että yksilöiden G-alleelin on alennettu RCC riski tupakoimattomilla. Tupakointi on kaikkein johdonmukaisesti vahvistettu syy riskitekijä RCC, noin 20% tapauksista RCC [38]. Verrattuna tupakoimattomia, riski kasvoi noin 50% miesten ja 20% naisilla tupakoitsijoita [39]. Lisäksi kun ositusta RCC kliinisessä vaiheessa näytti siltä, ​​että rs895819 GG-genotyyppi oli pienentynyt riski RCC paikallisluonteisia kliinisessä vaiheessa. Siten oli mahdollista, että vaihtelu oli mukana alempaan vaiheessa RCC. Kuitenkin tämän hypoteesin tulee varmistaa jatkotutkimuksissa.

Mitä tulee yhdistyksen välillä genotyyppien ja eloonjäämisaste RCC, ei ollut merkittävää tulosta. Syynä tähän ero saattaa olla, että kuolleisuus selviytymisen analyysi on pieni johtuen meidän lyhyen seuranta-ajan ja biologisten mekanismien taustalla olevia esiintyvyys RCC voi olla erilaiset kuin taustalla ennusteen, ja vaikka

miR-27a

polymorfismi on mukana etiologiassa RCC, se ei välttämättä tarkoita, että se vaikuttaa lopputulokseen.

tulkittaessa tuloksemme, useita rajoituksia pitäisi olla huolissaan. Ensinnäkin meidän tapauskontrollitutkimuksessa oli sairaalassa perustuva tutkimus ja se ei voinut antaa hyvän edustuksen yleisen väestön. Kuitenkin G-alleelin frekvenssi meidän valvonta oli samanlainen että HapMap tietokantaan. Sitä paitsi genotyyppi jakaumat polymorfismin meidän valvonnan sopeutui HWE. Siten valinta bias oli todennäköisesti ole merkittäviä. Toiseksi, meidän otoskoko oli suhteellisen pieni. Kuitenkin meillä oli 83% voima havaita minimaalinen OR 0,68 altistumisen taajuus 30% alle nykyisen näytteen koon. Kolmanneksi, emme suorita geeni-ympäristö vuorovaikutus analyysin puutteen vuoksi yksityiskohtaisia ​​tietoja ympäristön tekijät, kuten työperäinen altistus, ruokavalio ja liikunnan. Kuitenkin meidän Tutkimuksessa oli useita vahvuuksia. Ensinnäkin se oli ensimmäinen tutkimus tutkia yhdistyksen välillä

pre-miR-27a

rs895819 polymorfismin ja alttius RCC. Toiseksi Hyväksytty tapausten ja kontrollien iän ja sukupuolen ja saimme tuloksia säätämällä iän, sukupuolen, tupakointi, alkoholinkäyttö tila, korkea verenpaine ja diabetes, joka voisi vähentää vaikutusta sekoittuneita tekijöitä.

Yhteenvetona tuloksemme mikäli ensimmäisen käsityksen osuus

pre-miR-27a

rs895819 polymorfia riskin RCC Kiinan väestöstä. Vaikka yhdistys näytti olevan tilastollisesti merkitsevä Väestön nämä havainnot olisi vielä validoitu suurempi, mieluiten tulevaisuudentutkimusta. Sillä polymorfismit usein vaihtelevat eri etnisten ryhmien, lisätutkimuksia tarvitaan myös selvittämään yhdistyksen tämän polymorfismin kanssa RCC riskin etninen populaatioissa.

tukeminen Information

Taulukko S1.

Alukkeiden sekvenssit ja käytettävä koetin genotyypin rs895819 polymorfismi.

doi: 10,1371 /journal.pone.0046566.s001

(DOC) B Taulukko S2.

vuorovaikutus analyysit rs895819 polymorfismin ja riskitekijät.

doi: 10,1371 /journal.pone.0046566.s002

(DOC) B