Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Koska epäjohdonmukaisia ​​ja heikot tulokset, teimme meta analyysi johtaa tarkemman arvion assosiaatiota

miR-499

rs3746444 polymorfismi ja syöpäriskiä.

Menetelmät /Principal havainnot

systemaattinen etsimään PubMed, Excerpta Medica Database (EMBASE) ja Kiinan biolääketieteellisen kirjallisuuden tietokanta (CBM) tietokannat suoritettiin viimeinen haku päivitetty 6. toukokuuta 2012. kerroinsuhde (OR) ja sen 95%: n luottamusväli (95% CI) arviointiin käytettiin vahvuus yhdistyksen. Kaikkiaan 15 riippumattomien tutkimusten mukaan lukien 7188 tapaukset ja 8548 verrokkia käytettiin meta-analyysi. Esillä olevassa meta-analyysissä, löysimme merkittävä yhdistyksen välillä

miR-499

rs3746444 polymorfismi ja syöpäriskin kokonaiserittelyä (G vs.: OR = 1,10, 95% CI 1,01-1,19,

P

= 0,03; GG + AG versus AA: OR = 1,15, 95% CI 1,02-1,30,

P

= 0.02; GG versus AG + AA: OR = 1,07, 95% CI 0,89-1,28

P

= 0,50; GG vs. AA: OR = 1,13, 95% CI 0,98-1,31,

P

= 0,09; AG versus AA: OR = 1,16, 95% CI 1,02-1,33

P

= 0,03). Vuonna alaryhmäanalyysi etnisyys,

miR-499

rs3746444 polymorfismi merkitsevästi yhteydessä syöpäriskin Aasian väestöstä. Vuonna alaryhmäanalyysi syöpätyyppejä,

miR-499

rs3746444 polymorfismi merkitsevästi yhteydessä rintasyöpään.

Johtopäätökset /merkitys

Tämä meta-analyysi viittaa Merkitsevä yhteys

miR-499

rs3746444 polymorfismi ja syöpäriskiä. Laajamittainen ja hyvin suunniteltu tapausverrokkitutkimukset ovat tarpeen vahvistaa tunnistetun riskin olevassa meta-analyysi.

Citation: Wang F, Sun G, Zou Y, Li Y, Hao L, Pan F (2012) yhdistys

microRNA-499

rs3746444 polymorfismin kanssa syöpäriski: Evidence from 7188 Kotelot ja 8548 Controls. PLoS ONE 7 (9): e45042. doi: 10,1371 /journal.pone.0045042

Editor: Amanda Ewart Toland, Ohio State University Medical Center, Yhdysvallat

vastaanotettu: 23 kesäkuu 2012; Hyväksytty: 11 elokuu 2012; Julkaistu: 10 syyskuu 2012

Copyright: © Wang et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat avustuksia National Natural Science Foundation of China (81071986, 81001283, 30971530). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Syöpä edelleen merkittävä kuolinsyy maailmanlaajuisesti [1]. Perustuu uuden painoksen World Cancer raportti International Agency for Research Cancer, noin 12,7 miljoonaa syöpätapausta ja 7,6 miljoonaa syöpäkuolemaan arvioidaan tapahtuneen vuonna 2008 [2]. Toistaiseksi on vielä paljon oppinut mekanismia syövän. Lisääntynyt ilmaantuvuus ja kuolleisuus johtavat tutkijat spekuloida, että ruokavalion, tarttuva, kulttuuriin, ympäristöön ja /tai geneettisistä tekijöistä voidaan etiologiassa taudin. Erityisesti on selvää näyttöä, että geneettiset tekijät on tärkeä rooli yksittäisten syöpäherkkyys [3].

MikroRNA (miRNA) ovat osajoukko lyhyt, endogeenisten ei-koodaavat RNA: t, jotka säätelevät geenien ilmentymistä asemalla -transcriptional tason kautta joko translaation tukahduttamisen tai mRNA: n hajoamisen [4]. MiRNA pidetään keskeinen säätelyelementti geenien ilmentymisessä verkoissa, jotka voivat vaikuttaa monet biologiset prosessit kuten solujen erilaistuminen, proliferaatio, apoptoosin ja kasvaimen kehittymisen [5]. Yhden nukleotidin polymorfismi (SNP) on yleisin geneettinen vaihtelu ihmisen genomista. SNP alueella asuville miRNA geenit saattavat muuttaa eri biologisten prosessien vaikuttamalla miRNA biogeneesiä ja muuttamalla tavoitevaihtoehdon [6]. Lisäksi aiemmat tutkimukset ovat osoittaneet, että muuttunut ilmaukset miRNA kriittisiä rooleja syövän kehitykseen [7] – [8]. Niinpä SNP miRNA voi puolestaan ​​vaikuttaa yksilön alttiuden syöpiin.

Tärkeä polymorfismi

miR-499

jossa A-G muutos (rs3746444) tunnistettiin.

miR-499

rs3746444 polymorfismi liittyy A G Nukleotidisubstituution joka johtaa muutokseen A: U parin G: U epäsuhta varren rakenteen

miR-499

esiaste [ ,,,0],9]. Tähän mennessä useat tapausverrokkitutkimukset on suoritettu tutkimaan yhdistyksen välillä tämän polymorfismin ja syöpäriskin eri väestöryhmien ja useiden syöpätyyppien [9] – [22]. Nämä raportoidut tulokset olivat epäjohdonmukaisia ​​ja tuloksettomia. Sikäli kuin tiedämme, ei ole meta-analyysissä pyrittiin selvittämään yhdistyksen

miR-499

rs3746444 polymorfismi syöpäriskiä. Siksi teimme meta-analyysi johtaa tarkemman arvion yhdistyksen auttaa meitä paremmin ymmärtämään suhdetta polymorfismin ja syöpäriskiä.

Materiaalit ja menetelmät

tunnistetiedot voivat tutkimusten

tutkia yhdistyksen välillä

miR-499

rs3746444 polymorfismi ja syövän riskiä, ​​järjestelmällinen haku Yhdysvaltain National Library of Medicinen PubMed tietokantaan, Excerpta Medica Database (EMBASE) ja Kiinan Biomedical kirjallisuuden Database (CBM) suoritettiin viimeisen haku päivitetty 6. toukokuuta 2012. käytettävät hakusanat olivat: ”microRNA OR mir TAI miRNA”, ”syöpä tai kohdunkaulan tai kasvain tai kasvain”, ”geeni tai polymorfia tai alleeli TAI vaihtelu”, ja ”499 OR rs3746444”. Haetaan tehtiin ilman rajoituksia kielen tai julkaisun vuotta.

ja poissulkukriteereitä

kriteereillä olivat: 1) arviointi

miR-499

rs3746444 polymorfismi ja syövät; 2) tapaus-verrokki suunnittelu; 3) riittävän julkaistujen tietojen arvioimiseksi kertoimet suhde (OR), jossa 95%: n luottamusväli (CI); 4) vain teksti-käsikirjoituksia mukana. Hylkäämisperusteet sisältyvät: 1) päällekkäisyyttä edellisen julkaisujen 2) abstrakti, kommentoida, lue ja toimituksellisen. Kun oli useita julkaisuja samasta väestöstä, vain suurimmat tutkimuksessa oli mukana. Kun tutkimus raportoi tuloksista eri etnisten ryhmien, käsittelimme niitä erillisissä tutkimuksissa. Kun tutkimukseen kuului potilaita eri maiden, poimimamme tiedot erikseen.

Data louhinta

Tietoa huolellisesti poimittu kaikki voivat julkaisuista riippumatta kaksi laatijoiden mukaan pääsyn kriteerit yllä. Erimielisyydet ratkaistiin keskustelua kahden kirjoittajat. Jos nämä kaksi tekijää ei päästä yksimielisyyteen, niin kolmas tekijä kuultiin riidan ratkaisemiseksi. Artikkelit tunnistettu tähän meta-analyysi sisälsi tapauskontrollitutkimuksessa ja täydelliset tiedot, mukaan lukien ensimmäinen tekijän nimi, koehenkilöiden alue /maa, julkaisuvuosi, syöpätyyppien, määrittely ja numerot tapausten ja kontrollien, alleeli sekä genotyyppi lisätaajuuksia sekä tapauksessa ja kontrolliryhmiin. Heidän viiteluetteloihin etsittiin manuaalisesti tunnistamaan uusia tukikelpoisia tutkimuksia. Jos alkuperäinen genotyypin frekvenssi tiedot olivat saatavilla asiaa artikkeleita, pyyntö lisätiedot lähetettiin vastaavan tekijän.

Tilastolliset menetelmät

Käytimme PRISMA tarkistuslistan protokolla meta-analyysi ja seurasi ohje (taulukko S1) [23]. Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) arvioitiin tutkimusta varten käyttäen Chi-square testi kontrolliryhmissä.

P

0,05 katsottiin edustavan poikkeamista HWE. Meta-analyysi, OR ja 95%: n luottamusväli laskettiin arvioida yhdistyksen välillä

miR-499

rs3746444 polymorfismi ja syöpäriskin raportoitujen taajuuksien alleelien ja genotyyppien tapauksissa ja valvontaa. Yhdistetty syrjäisimmillä alueilla tehtiin alleelinen vertailu (G vs. A), hallitseva malli (GG + AG versus AA), resessiivinen malli (GG vs. AG + AA), homotsygoottinen vertailu (GG vs. AA) ja heterotsygoottianalyysiin vertailu (AG vs. AA), vastaavasti. Merkitys Yhdistettyjen OR määritettiin

Z

-testissä. Heterogeenisuus tutkimuksissa arvioitiin käyttämällä Chi-square testillä Q-tilastoa, ja, kun se ei ole tilastollisesti merkitsevä (perustuen

P

0,10), joka on kiinteiden vaikutusten malli (käyttäen Mantel-Haenszel menetelmä ) käytettiin meta-analyysi [24] – [25]. Muussa tapauksessa satunnainen vaikutus malli (käyttäen Dersimonian ja Laird menetelmää) käytettiin arvioitaessa yhteenveto OR ja 95% CI [26]. Heterogeenisyys kvantitoitiin myös käyttämällä

I

-squared tilastotieto,

I

2

= 100% x (Q-df) /Q [27].

arviointi julkaisu bias

Kanavan tontteja luotiin graafisesti todisteita julkaisun bias, joissa keskivirhe logaritmi OR piirrettiin sen OR. Epäsymmetrinen juoni ehdotti mahdollista julkaisemista bias. Suppilo juoni epäsymmetria tutkittiin lisäksi menetelmällä Egger n lineaarisen regression testi [28]. Merkitys siepata määritettiin

t

-testi (

P

0,05 katsottiin edustavan tilastollisesti merkitsevä julkaisun bias). Leikkauspisteen

antaa mitan epäsymmetria, ja sitä suurempi sen poikkeama nollasta enemmän lausutaan epäsymmetria.

Analyysit suoritettiin käyttäen ohjelmistoa Review Manager 4.2 (Cochrane Collaboration, http: //www.cc-ims.net/RevMan/relnotes.htm/) ja Stata versio 10 (StataCorp LP, College Station, Texas, USA).

P

arvo alle 0,05 pidettiin tilastollisesti merkitsevä tutkimuksessa, ja kaikki

P

arvot olivat kaksipuolisia.

Tulokset

Ominaisuudet tutkimukset

oli 104 artikkeleita merkitystä tutkiva sanat (PubMed: 27; EMBASE: 60; CBM: 17). Vuokaavio kuviossa 1 esitetään yhteenveto tutkimuksen valintaprosessia. Näistä 14 julkaisut täytti kriteereillä [9] – [22]. Tutkimuksessa Catucci et al. [20], että syrjäisimmät alueet esiteltiin erikseen mukaan eri maissa, Saksassa ja Italiassa. Siksi me käsitellään niitä erillisinä tutkimuksia. Siten yhteensä 15 riippumattomia tutkimuksia, mukaan lukien 7188 tapauksissa ja 8548 verrokkia käytettiin meta-analyysi. Taulukossa 1 luetellaan tutkimukset tunnistettu ja pääpiirteistä. Oli yksitoista tutkimuksiin aasialaista syntyperää [9] – [14], [16], [17], [19], [21] – [22] ja neljä tutkimukset valkoihoinen syntyperää [15], [18], [20 ]. Tulokset Hardy-Weinberg tasapaino testi jakeluun genotyyppi hallitsee väestöstä on esitetty taulukossa 1. genotyypit jakauma kontrollien 11 15 tutkimuksissa oli yhtä mieltä HWE [9] – [12], [16] , [18] – [22].

tärkeimmät tulokset

tärkeimmät tulokset meta-analyysi ja heterogeenisyys koe on esitetty taulukossa 2. Me ensin analysoitu yhdistyksen koko väestöstä. Sitten saadakseen tarkan seuraus suhdetta

miR-499

rs3746444 polymorfismia syöpäalttiutta, kerrostunut analyysit etnisyys ja syöpätyyppeihin tehtiin. Kun Q-testi heterogeenisyys ei ollut merkittävä, teimme analyysit käyttäen kiinteän vaikutuksen mallia. Satunnaisen vaikutus malleja tehtiin, kun havaitsimme merkittävää Tutkimusten välisten heterogeenisuus.

Kaiken vaikutuksia meta-analyysissä.

kokonaiserittelyä, löysimme merkittävä yhdistyksen välillä

miR-499

rs3746444 polymorfismi ja syöpäriskin alleelinen sijaan hallitseva malli ja heterotsygoottianalyysiin vertailu (G vs. V: OR = 1,10, 95% CI 1,01-1,19,

P

= 0,03; GG + AG versus AA: OR = 1,15, 95% CI 1,02-1,30,

P

= 0.02; GG versus AG + AA: OR = 1,07, 95% CI 0,89-1,28,

P

= 0,50; GG vs. AA: OR = 1,13, 95% CI ,98-+1,31,

P

= 0,09; AG versus AA: OR = 1,16, 95% CI 1,02-1,33,

P

= 0,03).

Alaryhmäanalyysissä varten kansallisuus.

Alaryhmäanalyysissä stratifioitiin etnisyys. Meta-analyysiin sisältyi 11 tutkimukset (4278 tapausta ja 5029 tarkastukset) Aasian väestön ja 4 tutkimuksia (2910 tapausta ja 3519 tarkastukset) valkoihoisilla väestöstä.

Aasian väestöstä,

miR-499

rs3746444 polymorfismi merkitsevästi liittyy suurentunut syöpäriski kaikissa geneettiset mallit paitsi väistyvä malli (G vs. V: OR = 1,16, 95% CI 1,04-1,28,

P

= 0,005; GG + AG versus AA: OR = 1,25, 95% CI 1,08-1,45,

P

= 0,003; GG versus AG + AA: OR = 1,05, 95% CI 0,78-1,41,

P

= 0,75; GG versus AA: OR = 1,23, 95% CI 1,01-1,50,

P

= 0,04; AG versus AA: OR = 1,28, 95% CI 1,08-1,52,

P

= 0,004). Vuonna valkoihoinen väestö, ei merkittävää yhteyttä ei havaittu

miR-499

rs3746444 polymorfismi ja syöpäriskin geneettistä mallia (G vs. V: OR = 0,98, 95% CI 0,90-1,07,

P

= 0,68; GG + AG versus AA: OR = 0,96, 95% CI 0,87-1,06,

P

= 0,43; GG versus AG + AA: OR = 1,06, 95% CI 0,87-1,29,

P

= 0,60; GG vs. AA: OR = 1,03, 95% CI 0,83-1,28,

P

= 0,78; AG versus AA: OR = 0,95, 95% CI 0,85-1,06,

P

= 0,34).

Alaryhmäanalyysissä varten syöpätyyppeihin.

Alaryhmäanalyysissä myös ositettiin syöpätyyppeihin. Meta-analyysiin sisältyi 4 tutkimuksiin (2688 tapausta ja 3360 tarkastukset), joka perustuu rintasyöpä ja 3 tutkimuksista (508 tapausta ja 805 valvontaa), joka perustuu maksasyövän.

Eri syöpätyyppien,

asennuspalveli- 499

rs3746444 polymorfismi oli merkitsevästi liittyy suurentunut riski rintasyövän alleelinen kontrastia ja hallitseva malli (G vs. V: OR = 1,10, 95% CI 1,01-1,20,

P

= 0,04; GG + AG versus AA: OR = 1,13, 95% CI 1,01-1,26,

P

= 0,03; GG versus AG + AA: OR = 1,07, 95% CI 0,71-1,59,

P

= 0.76; GG vs. AA: OR = 1,16, 95% CI 0,92-1,48,

P

= 0,21; AG versus AA: OR = 1,16, 95% CI ,95-+1,42,

P

= 0,14). Ei ole todisteita yhdistyksen löydetty geneettistä mallia välillä

miR-499

rs3746444 polymorfismi ja maksasyövän riskiä (G vs. V: OR = 1,29, 95% CI 0,89-1,87,

P

= 0,18; GG + AG versus AA: OR = 1,23, 95% CI 0,94-1,60,

P

= 0,12; GG versus AG + AA: OR = 1,34, 95% CI +0,97-+1,85,

P

= 0,08; GG vs. AA: OR = 1,56, 95% CI 0,69-3,48,

P

= 0,28; AG versus AA: OR = 1,15, 95% CI 0,86-1,52,

P

= 0,34).

arviointi julkaisun bias

suppilo juoni ja Egger testi tehtiin arvioimaan julkaisemisen bias mukana tutkimuksissa. Tulokset Egger n lineaarisen regression testi on esitetty taulukossa 3. Egger n testiä käytettiin antamaan tilastollista näyttöä suppilon juoni symmetria. Vuonna yleisanalyysi, Egger testi havaittu todisteita julkaisu puolueellisuudesta alleelinen kontrasti (P ​​= 0,022), hallitseva malli (P = 0,006) ja heterotsygoottianalyysiin vertailu (P = 0,008). Vuonna Alaryhmäanalyysissä, Egger testi ainoa havaittu todisteita julkaisu puolueellisuudesta Aasian väestön hallitseva malli (P = 0,023) ja heterotsygoottianalyysiin vertailu (P = 0,019). Muoto suppilon tonttien osoittivat samanlaisia ​​tuloksia.

Keskustelu

Tässä meta-analyysi 7188 tapauksia ja 8548 tarkastuksia, löysimme merkittävä yhdistyksen välillä

asennuspalveli- 499

rs3746444 polymorfismi ja syöpäriskiä. Vuonna alaryhmäanalyysissä Aasian väestöstä,

miR-499

rs3746444 polymorfismi oli merkitsevästi liittyy suurentunut syöpäriski. Samoin vuonna alaryhmäanalyysissä rintasyövän, meidän tiedot osoittivat myös, että tämä polymorfismi voisi olla riskitekijä.

Viime vuosina useat meta-analyysit ovat keskittyneet geneettisiä variantteja

miR-146a

ja

miR-196a2

geenien yleisen syöpäriskin [29] – [33]. Sillä

miR-146a

rs2910164 polymorfismi, Xu et al. [29] ja Qiu et ai. [31] molemmat osoittivat, että merkittävää yhdistysten oli seassa yleistä analyysiä. Kuitenkin neljä meta-analyysit ovat kaikki tunnistetut että

miR-196a2

C-alleeli on alhainen läpäisevät syöpäriskin kehittämiseen, erityisesti rintasyöpää ja aasialaisilla [29], [30], [ ,,,0],32], [33]. Tämä havainto on samanlainen kuin meidän meta-analyysi, joka osoittaa, että kaksi perimä (

miR-196a2

rs11614913 ja

miR-499

rs3746444) voi olla toimiva polymorfismeja mahdollista arvoa syövän kehittäminen.

SNP vaihtelua sisällä miRNA sekvenssi voi joko heikentää tai vahvistaa välistä sitoutumista miRNA ja sen tavoite. Siksi tämä johtaisi todennäköisesti vastaavan sääntelyn kohde-mRNA käännös [5], [34]. Aiemmassa tutkimuksessa suorittaa Jazdzewski et al. [35], aineistosta ilmeni, että yhteinen G /C polymorfismi sisällä

pre-miR-146a

sekvenssin vähensi sukupolven esi- ja kypsä

miR-146a

ilme, johti vähemmän tehokas esto kohdegeenien, ja osaltaan geneettinen alttius papillaarinen kilpirauhassyövän. Lisäksi on osoitettu, että poikkeava ilmentyminen miRNA geenit voivat vaikuttaa sääntelyn kohdegeenien ja kasvaimien syntyyn liittyvien. Viimeaikaiset todisteet osoittivat, että klusterin

miR-143

ja

miR 145

vaikutti riskiä ruokatorven okasolusyöpä kautta säädellään kasvaimia synnyttävän Fascin Homologi 1 (FSCN1) [36]. Alshatwi et ai. [10] ovat tutkineet miRNA ekspressiotasot veressä ja totesi, että

miR-499

voisi syrjiä rintasyöpäpotilaiden terveistä yksilöistä postmenopausaalisilla potilailla, jotka voivat edustaa uusia biomarkkereiden. Perustuen edellä mainituista syistä, se voidaan hypoteesi, että rs3746444 polymorfismi

miR-499

esiaste voi muuttaa miRNA käsittelyä, ja lopulta muuttaa kypsä miRNA tasolla. Altered miRNA ilme voi vaikuttaa syöpäalttiutta. Tämän seurauksena

miR-499

rs3746444 polymorfismi voisi osaltaan syöpäriskiä.

Huolimatta huomattavista ponnisteluista tutkia mahdollista yhteyttä välillä

miR-499

rs3746444 polymorfismi ja syövän riskiä, ​​joitakin rajoituksia olisi käsiteltävä. Ensinnäkin tulokset olisi tulkittava varoen seurauksena ilmeinen heterogeenisyys joitakin vertailuja. Toiseksi säätimet useat tutkimukset eivät sopineet Hardy-Weinberg tasapaino odotuksia, mikä saattaa vääristää tuloksia. Kuitenkin, kun nämä tutkimukset, joissa oli merkkejä poikkeamat HWE jätettiin analyysin merkittävä yhdistys voi edelleen havaita. Kolmanneksi julkaisu bias olemassa joitakin vertailuja, jotka saattavat vaikuttaa tuloksiin meidän meta-analyysi. Neljänneksi puuttuu riittävät hyväksyttävät tutkimukset rajoittanut edelleen kerrostunut analyysiä lisää syöpien, kuten keuhkosyövän, peräsuolen syöpä ja mahasyöpä. Viidenneksi, kullekin valitulle tapauskontrollitutkimuksessa, tuloksemme perustuivat oikaisemattomaan arvioihin, kun taas tarkempaa analyysiä voitaisiin suorittaa, jos yksittäiset tiedot olivat saatavilla.

Johtopäätöksenä meidän meta-analyysi osoittaa merkittävää yhdistyksen välillä

miR-499

rs3746444 polymorfismi ja syöpäriskiä. Tulevaisuudessa laajamittainen ja hyvin suunniteltu tapausverrokkitutkimukset ovat tarpeen vahvistaa tunnistetun riskin olevassa meta-analyysi.

tukeminen Information

Taulukko S1.

tarkistuslista kohteita sisällyttää tähän meta-analyysiin.

doi: 10,1371 /journal.pone.0045042.s001

(DOC) B

Kiitokset

Kiitämme kaikkia, jotka antavat apua tämän tutkimuksen.