Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

tunnistaminen veripohjaisten diagnostinen markkeri on tavoite monilla lääketieteen, mukaan lukien varhainen diagnosointi eturauhassyövän. Kuvaamme käyttöä keskimäärin ero näytön tehokas tapa varmistaa, biomarkkereiden löytö kokoveressä RNA. Prosessi keskiarvon vähentää ongelma kliinisen heterogeenisyys ja samalla minimoida näytteen käsittelyyn.

Menetelmät /Principal Havainnot

RNA eristettiin verestä eturauhassyövän potilaiden ja terveiden verrokkien. Näytteet yhdistettiin ja alistettiin keskimäärin ero näytön prosessi. Tekstitystiedostojen läsnä eri tasoilla välillä potilaiden ja verrokkien puhdistettiin ja sekvensoitiin tunnistamiseen. Transcript veressä eturauhassyövän potilaiden ja verrokkien todennettiin kvantitatiivisella RT-PCR. Keinot verrattiin käyttäen t-testiä ja vastaanotin-käyttöjärjestelmä käyrä luotiin. Nimetön sormi proteiini 19A (RNF19A) transkripti tunnistettiin olevan korkeampi eturauhassyöpäpotilailla verrattuna terveillä miehillä läpi keskimäärin ero näytön prosessi. Kvantitatiivinen RT-PCR-analyysi vahvisti, enemmän kuin 2 kertaa korkeampi RNF19A mRNA veressä potilaiden eturauhassyövän kuin terveillä verrokeilla (p = 0,0066). Tarkkuus erottaa syöpäpotilaiden terveistä miehistä käyttää RNF19A mRNA-tasot veressä määritettynä pinta-ala vastaanottavan operaattorin käyrä oli 0,727.

Johtopäätökset /merkitys

keskiarvon ero näyttö tarjoaa yksinkertaistetun lähestymistavan kattavasta seulonnan kehon nesteiden, kuten veren, tunnistamaan biomarkkereita potilailla, joilla on eturauhasen syöpä. Lisäksi tämä proof-of-concept tutkimus ansaitsee tarkempi analysointi RNF19A kuin kliinisesti merkittävästä biomarkkeri eturauhassyövän havaitsemiseen.

Citation: Bai VU, Hwang O, Divine GW, Barrack ER, Menon M, Reddy GP- V, et ai. (2012) Keskimääräiset Differential Expression Discovery biomarkkereiden veressä Potilaat, joilla on eturauhassyöpä. PLoS ONE 7 (4): e34875. doi: 10,1371 /journal.pone.0034875

Toimittaja: Rakesh K. Srivastava, University of Kansas Medical Center, Yhdysvallat

vastaanotettu: 12 lokakuu 2011; Hyväksytty: 10 maaliskuu 2012; Julkaistu: 06 huhtikuu 2012

Copyright: © 2012 Bai et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus rahoittivat Vattikuti urologian Institute. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Vaikka metastaattinen eturauhassyöpä on edelleen parantumaton sairaus [1], interventio kun tauti on edelleen paikallisia, ja yleensä oireeton, on usein parantava [2], [3], [4]. Koska varhainen puuttuminen tiedetään vähentävän kuolleisuutta miesten eturauhassyövän [5], varhainen havaitseminen pitää lupauksen vähentää eturauhassyövän aiheuttamaa kuolleisuutta hinnat mutta sen tehokkuutta ei ole vielä vahvistettu. Eturauhasen-antigeenin (PSA) on ainoa biomarkkereiden yleisesti käytössä tähän tarkoitukseen, mutta on rajoituksia epätäydellinen spesifisyys ja herkkyys. Normaali PSA ei sulje pois saattaa johtaa kuolemaan eturauhassyöpää [6], kun eturauhasen hyvänlaatuinen sairaus voi aiheuttaa kohonneita PSA jotka saattavat vaatia eturauhasen biopsia diagnoosin. Rajoitukset PSA vähentää eturauhasen syövän kuolleisuus havaittiin selvästi, kun kaksi suurta satunnaistetussa kontrolloiduissa kokeissa julkaistu ristiriitaisia ​​tuloksia [7], [8]. Vaikka tulkitaan suotuisassa valossa, tulosten ehdotti, että selviytyminen hyötyvät PSA oli pieni, jossa 50 miestä tarvitsematta läpikäydä eturauhasen pelastaa yhden elämän [7]. Tämä tulos tuo esiin myös ongelma eturauhassyövän ylidiagnostiikka, kun monet miehet ovat diagnosoitu veltto eturauhassyövän joka ei vaikuta niiden kuolleisuutta, vaikka ne jätetään hoitamatta. Kuitenkin se, että eturauhasen syöpä on toiseksi suurin syy syöpään liittyvät kuolemat miehillä [9] on muistutus siitä, miten tärkeää havaita mahdollisesti tappava eturauhassyöpää, kun se on vielä parannettavissa. Siten löytää uusia biomarkkerit parantaa suorituskykyä PSA edelleen tärkeä päämäärä eturauhassyövän varhaiseen havaitsemiseen, erityisesti havaitsemiseen aggressiivinen tauti.

Kuvaamme tässä että on tarpeen käydä keskimäärin differentiaalikaavojen (ADE ) lähestymistapa tunnistaa biomarkkereita verinäytteistä miesten eturauhassyövän. Differential näyttö metodologia ei vaadi etukäteen tietoa RNA-transkriptien. Differential näyttö tarjoaa näin ”avoin” järjestelmä, jossa sekä tunnetut ja tuntemattomat RNA-transkriptien liittyvät tautiin tila voidaan tunnistaa, tosiasia, joka erottaa sen sirutekniikalla [10], [11]. Differential näyttö vaatii pieniä määriä alkaen RNA (niin vähän kuin 20 ng kokonais-RNA), ja tarjoaa vertaansa vailla mahdollisuuksia tunnistaa nopeasti RNA-transkriptien läsnä eri tasoilla testissä verrattuna vertailunäytteiden; se on erityisen tehokas tunnistamaan vähäisessä määrin selostukset [11], että ei voida havaita hybridisoimalla perustuvien mikrosirujen rasterointitekniikat. Differential näyttö tarjoaa myös erinomaisen mahdollisuuden kuulustella koko transcriptome. Perustuu teoreettisiin laskelmiin, 240 paria mielivaltaisia ​​ja ankkuri alukkeita odotetaan monistamiseen -96% ilmennettyjen RNA-transkriptien [12]. Seuraavan sukupolven transcriptome sekvensointi (esim RNA-kohdat) jakaa joitakin näistä vahvuuksia (koko transcriptome analyysi, etukäteen tietoa transkriptin sekvenssi, jota ei tarvita, pieniä määriä alkaen RNA tarvitaan), mutta tarjoaa myös mahdollisuuden erottaa alleeliset ja silmukointivariantteja, että eivät ole helposti arvioida ero näyttö [13]. Kuitenkin RNA-seq sekvensointi tiedot vinossa kohti korkea runsautta selostukset ja pysyminen ajan 100-kertaisesti kalliimpia kuin ero näyttö [13].

ADE etunaan tasauspyörästön näytön tekniikka helpottaa samalla analyysi heterogeenisen näytteitä. Yhdistämistä heterogeeninen näytteiden tehokkaasti tunnistaa selostukset, jotka ilmentyvät eri suuressa osassa näytteistä, jotka käsittävät kaksi ryhmää [10]. Olemme pyrkineet parantamaan edelleen ADE menetelmiä nopeuttamalla eturauhassyövän biomarkkereiden löytö kliinisesti merkittäviä näytteitä. Vaikka kultakantaan eturauhassyövän diagnoosia on eturauhasen koepala, tämä menettely on kivulias, invasiivisia ja jollei mahdollisia komplikaatioita verenvuoto ja infektio. Näin ollen, biomarkkerit, jotka voidaan tunnistaa näytteistä, kuten verestä ovat toivottavia. Koska kaikki kasvaimeen liittyvät biomarkkerit on havaittavissa veressä, aloittaen löytö prosessi kasvainkudoksessa myöhemmin edellyttää edelleen ajankäyttöä ja resursseja validointi verinäytteistä. Lisäksi veripohjaisten biomarkkerit, jotka edustavat isännän vaste kasvain ei voida tunnistaa, jos biomarkkereiden löytö aloitetaan Tuumorinäytteissä. Special verinäytteen media mahdollistaa tehokkaan talteenoton vahingoittumattomia RNA kokoverestä, vaikka Pitkän inkuboinnin jälkeen huoneenlämmössä, joten tämä käytännöllinen valinta kliiniseen käyttöön. Meillä on siis päättänyt käynnistää biomarkkereiden löytö jossa käytetään koko verinäytteistä.

Vaikka ADE on tyypillisesti käytetty arvioitaessa selostukset jotka ilmentyvät eri kudoksissa (siis, terminologia ”keskimäärin ero expression”), me mukauttaa tämä tekniikka tunnistaa RNA-transkriptien, jotka ovat läsnä eri tasoilla kokoverestä RNA kaksi ryhmää potilaita. Nämä selostukset eivät välttämättä ekspressoituu differentiaalisesti solut, jotka ovat läsnä veressä, tai jopa kasvaimen verrattuna normaaliin kudokseen, mutta niiden läsnäolo veressä voidaan erottaa näiden kahden ryhmän välillä. Tässä tutkimuksessa kuvaamme automatisoidun tiedonvaihdon tunnistaa RNA-transkriptin, RNF19A (Gene ID: 25897), joka on läsnä korkeammilla tasoilla veressä eturauhassyöpäpotilaisiin kuin terveillä verrokeilla. Nämä tulokset vahvistaa proof-of-periaate, jonka mukaan keskimäärin differentiaalikaavojen (ADE) menetelmiä voidaan käyttää löytämisen RNA merkkiaineiden kehon nesteissä miesten eturauhassyövän ja tukea tutkimusta RNF19A mahdollisena eturauhassyövän biomarkkereiden.

menetelmät

Ethics lausunto

Kaikki tutkimukseen liittyy ihmisen osallistujat hyväksyttiin Henry Ford Health System (HFHS) Institutional Review Board. Kirjallinen suostumus saatiin kaikille osallistujille ja kaikkien kliinisten tutkimuksen suorittanut periaatteiden mukaisesti ilmaistu Helsingin julistuksen.

Potilaille ja Verinäytteenotto

Eturauhassyöpä potilaita tunnistettiin laitoksella Urology klo Henry Ford Health System (HFHS). Terveet verrokit rekrytoitiin väestössä ja HFHS sisätautien klinikoilla. Kokoveri (2,5 ml) kerättiin PAXgene Veren RNA putket (Qiagen, Valencia, CA), joka mahdollistaa liikenteen huoneenlämmössä ilman RNA: n hajoamisen. Näytteet pakastettiin -80 ° C: ssa, kunnes RNA: n suoritettiin.

RNA: n eristäminen

Blood PAXgene Veren RNA putkia sentrifugoitiin. Pelletti pestiin RNaasi-vapaata vettä ja suspendoitiin uudelleen Trizol-reagenssia (Invitrogen, Carlsbad, CA). RNA uutettiin valmistajan mukaan protokollia. Eristetty RNA käsiteltiin RNaasi-vapaata DNaasia (Invitrogen, Carlsbad, CA) ja konsentraatio kokonais-RNA määritettiin käyttäen Qubit fluorometri (Invitrogen, Carlsbad, CA).

keskiarvon Differential Expression (ADE)

Yhteensä RNA verestä 10 potilasta ja 10 tervettä miestä, yhdistettiin erikseen, käänteistranskriptio ja alistettiin ADE kuten on kuvannut Bai et al [10]. Ankkuri ja mielivaltaisia ​​alukkeita käytettiin PCR olivat H-T11A ja H-AP17 (GenHunter Corporation, Nashville, TN). PCR-reaktiot suoritettiin kahtena kappaleena. PCR-tuotteet ajettiin elektroforeesissa ja vanteet autoradiografialla. Bändejä, jotka erosivat intensiteetin välillä eturauhassyövän potilailla ja terveillä miehillä leikattiin geelistä, monistettiin uudelleen käyttäen samaa ankkuri ja mielivaltainen alukkeita H-T11A ja H-AP17, ja sekvensoitiin suoraan.

qRT-PCR

RNA käänteiskopioitiin käyttämällä satunnaisia ​​heksameerialukkeita ja Transcriptor käänteistranskriptaasia (Roche Applied Science, Indianapolis, IN) mukaan valmistajan protokollaa. Sen jälkeen, kun käänteisen transkription, RNA: ta altistettiin qPCR Applied Biosystems 7500 Fast Real-Time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, CA) käyttäen sekvenssi-spesifisiä alukkeita RNF19A (määritys Id: Hs00968447_m1) ja 18S RNA: n (määritys Id: Hs03928985_g1 ). Sykli numero, jossa reaktio ylitti kynnyksen fluoresenssi (C

T) määritettiin kullekin transkriptio, ja taso kunkin testin geenin suhteen 18S RNA: n (viite transkripti) määritettiin käyttämällä yhtälöä 2

-ΔC

T jossa ACk

T = C

T, testi – C

T, viite [14].

tilastolliset menetelmät

Means verrattiin käyttäen t -testata. Tasa Ryhmän varianssien testattiin, ja Satterthwaite p-arvo oli raportoitu jakaumat epätasainen varianssit. Pearsonin korrelaatiokerroin käytettiin arvioimaan lineaarinen korrelaatio. Vastaanotin operaattori käyrä (ROC) tuotettiin piirtämällä herkkyys vastaan ​​väärien positiivisten määrä (1 – spesifisyys) kuin syrjintä testin vaihdeltiin. Käyrän alapuolinen alue (AUC) laskettiin. Kaikki tilastolliset laskelmat tehtiin SAS.

Tulokset ja keskustelu

Verinäytteet saatiin terveen miehen valvontaa ja miesten paikallinen eturauhassyöpä ennen lopullista hoitoa. Sen jälkeen, kun RNA: n uutto, 20 ng kokonais-RNA kustakin 10 eturauhassyöpäpotilaalla tai kustakin 10 tervettä miestä yhdistettiin kaksi erillistä allasta RNA (eturauhassyöpä vs. terve), jotka analysoitiin sitten ADE, kuten on kuvattu Bai et al [10]. PCR-monistus käyttäen ankkuri ja mielivaltainen alukesarjaa suoritettiin kahtena kappaleena, ja reaktiotuotteet alistettiin geelielektroforeesilla (Fig. 1).

Kuten kuviossa. 1, ADE analyysi identifioi kaksi RNA-transkriptien monistettiin merkitsevästi korkeammilla tasoilla verinäytteistä eturauhassyöpäpotilaalla (Ca) kuin niillä, terveillä miehillä (H). Nukleotidisekvenssi analyysi (Fig. S1, täydentäviä tietoja) paljasti, että nämä kaksi transkriptien oli yhteinen sekvenssi, ja että tämä sekvenssi oli 100% homologia nukleotidisekvenssin nimetön proteiinin 19A (RNF19A) mRNA-transkripti. RNF19A, jota kutsutaan myös Dorfin, on E3 ubikitiinipromoottori ligaasilla tiedetään ilmentyvän patologisessa sulkeumat löytyy Parkinsonin tauti, amyotrofinen lateraaliskleroosi, ja Lewyn kappale -dementia [15]. RNF19A ubiquitinates synphilin-1-geenin ja mutatoituneen superoksididismutaasi 1 (SOD1), jotka patogeneesiin näiden neurodegeneratiivisten sairauksien [16], [17]. RNF19A ei ole aiemmin yhdistetty syöpään, mikä korostaa hyödyllisyyttä ero näytön identifioida uusia yhteenliittymiä. Kuitenkin sekä RNF19A ja sen tavoitteita (SOD1 ja synphilin-1) ovat sekaantuneet solujen eloonjäämistä ja solukuoleman polkuja [18], [19], [20]. SOD1 on erityisesti liittynyt eturauhassyöpään [21], [22] ja voi olla mukana soluvasteen DNA vaurioita kautta rooli oksidatiivisen stressin kautta. Muut E3-ubikitiinipromoottori ligaaseina kuten RNF6, raportoidaan säännellä androgeenireseptorin aktiivisuutta eturauhassyövän soluissa [23].

ADE analyysi tunnisti kaksi RNA-transkriptien kanssa ovat huomattavasti korkeammat kokoverestä RNA eturauhassyöpäpotilaalla ( Ca) kuin terveillä miehillä (H). Nukleotidisekvenssin analyysi paljasti, että nämä kaksi transkriptien oli yhteinen sekvenssi. Tämä sekvenssi oli 100% homologia nukleotidisekvenssin E3-ubikitiinipromoottori ligaasilla Ring Finger Protein 19a (RNF19A) otteen ja sijaitsee 3’alue (UTR).

Kun tunnistaminen RNF19A transkripti mahdollisena biomarkkeri erottaa veri eturauhassyöpäpotilaille verestä terveillä verrokeilla, qRT-PCR käytettiin mittaamaan tasoa tämän transkriptin, että verrattuna 18S RNA, kokoverestä RNA näytteitä yksittäisiä potilaita. Suhteellinen RNF19A tasot mitattiin 33 eturauhassyövän potilailla ja 19 terveen miehen valvontaa. Nämä ikäluokat olivat riippumattomia potilasryhmien käytetään ADE hakuprosessia. Ohjaus näytteistä (mediaani-ikä 40 vuotta, vaihteluväli 31-50 vuotta) otettiin väestössä, ja sellaisenaan, ei samanikäisiin eturauhassyöpää tapauksiin. Baseline kliiniset tiedot eturauhassyövän kohortti on esitetty taulukossa 1. Kaikki eturauhassyöpätapauksia oli tavanomainen adenokarsinooma on patologisen lue ja kukaan dokumentoitiin olla solmukohtien tai kaukaisia ​​etäpesäkkeitä. Suhteellinen RNF19A tasot mitattuna qRT-PCR: llä, on esitetty kuviossa. 2 (vertailun raaka C

T tiedot, katso täydentäviä tietoja, taulukko S1). Keskimääräinen suhteellinen taso RNF19A oli 4,79 ± 0,91 (SE) eturauhassyöpäpotilailla verrattuna 1,96 ± 0,39 (SE) terveillä valvontaa. Tämä ero näiden kahden ryhmän välillä oli tilastollisesti merkitsevä (p = 0,0066). Samanlainen tilastollisesti merkittävä ero RNF19A tasojen eturauhassyöpä potilaiden ja terveiden kontrollien saatiin, kun tasot arvioitiin käyttäen semi-kvantitatiivinen RT-PCR: llä (Fig. S2, täydentävä data).

Kvantitatiivinen RT-PCR suoritettiin kokoveren RNA näytteitä potilaista, joilla oli paikallinen eturauhassyöpä (n = 33) samoin kuin terveen miehen kontrolleihin (n = 19). Tasot RNF19A transkriptin normalisoitiin 18S RNA: n (viite-geeni). Normalisoidut tulokset esitetään rasiakuvaajassa muodossa, laatikot edustavat 25

th, 50

th, ja 75

th persentiilit ja viikset edustavat 10

th ja 90

th prosenttipisteet data. Vieraat havainnot näkyvät myös. Ero keinot oli tilastollisesti merkitsevä (p = 0,0066).

Vastaanotin-toiminta käyrää RNF19A synnytettiin kokonaisarviota herkkyys ja spesifisyys tätä verta biomarkkereiden erottamiseen eturauhassyöpätapauksia vertailuryhmästä (Fig. 3). AUC mallin oli 0,7273, jossa AUC 1 vastaa diagnostista testiä täydellinen (100%), spesifisyys ja herkkyys. Koska vertailukohta, AUC PSA on arvioitu 0,640-0,678, kun taas AUC suosittu nomogram, jossa otetaan huomioon muut eturauhassyövän riskitekijöitä lisäksi PSA on arvioitu 0,691 [24], [ ,,,0],25], [26].

vastaanotin toimineiden käyrä (ROC) synnytettiin alustava arvio tarkkuudesta suhteellisten tasojen RNF19A luokittelussa syöpäpotilailla tai terveiden verrokkien meidän kohortin potilaista. Todellinen positiivisten määrä (herkkyys) piirrettiin väärien positiivisten määrä (1-spesifisyys). Alue käyrän alla laskettiin 0,7273.

Vaikka tämä havainto on rohkaisevaa, on huomattava, että käyttämällä PSA erilaistua potilaille, joilla on eturauhassyöpä verrokkiryhmästä meidän ikäluokat saattanut myös paransivat AUC koska kyse on suhteellisen nuorempi ikä tervettä kohortin. Mediaani-ikä 40, odotettu PSA meidän terve kohortin olisi alle 1,0 ng /ml, huomattavasti pienempi kuin mediaani PSA-arvo 6,4 ng /ml nähty meidän eturauhassyövän kohortissa. Kuitenkin RNF19A tasot eivät korreloineet iän (Pearson kerroin 0,09), joten on epätodennäköistä, että havainnot ovat yksinkertaisesti johtuu iästä vaikutus. On selvää, lisävalidointia on suoritettava populaatioissa lähemmin muistuttavissa reaalimaailman asetus potilaille, jotka ohjataan eturauhasen koepala. Lisäksi on vielä määriteltävä, onko RNF19A tms biomarkkerit lisää lisäarvoa kliinisesti vakiintuneita menetelmiä luoda eturauhassyövän riski, kuten PSA, ikä, rotu ja suvussa. Tämä tutkimus ei ole suunniteltu vastaamaan kriittinen kysymys lisääntynyt havaitseminen saattaa johtaa kuolemaan syövän välttäen ylidiagnostiikka indolent syöpä. Lisätoimia at biomarkkereiden löytö tunnistaa nämä tappavia alatyyppejä ovat olennainen tavoite tulevaisuudessa.

Yhteenvetona kuvaamme tässä käytöstä keskimäärin differentiaalikaavojen tunnistaa RNF19A kuin RNA-transkriptin, joka on läsnä huomattavasti korkeampi veressä eturauhassyöpäpotilaalla terveisiin kontrolleihin verrattuna. Meidän näyte potilaiden, tämä transkriptin pystyi erottamaan eturauhassyövän potilaita säätimet AUC vastaanottimen toimineiden käyrä 0,7273. Tulokset käsitellään tässä perustaa proof-of-periaate, jonka ADE menetelmää voidaan käyttää löytämisen RNA merkkiaineiden veressä miesten eturauhassyövän ja analysoitava tarkemmin of RNF19A kuin kliinisesti merkittävästä biomarkkeri eturauhassyövän varhaiseen havaitsemiseen.

tukeminen Information

Kuva S1.

kromatogrammien ADE-tunnistettu selostukset. Näytteitä terveiden verrokkien ja potilailla, joilla on eturauhassyöpä tehtiin keskimäärin ero ilmentymisanalyysiä. Tekstitystiedostojen (A ja B), läsnä eri tasoilla myös terveiden verrattuna eturauhassyövän potilailla toimitettiin sekvensointiin. Kromatogrammeja päässä sekvenointireaktioita sekä transkripti-A: n ja B on esitetty, osoittaa yhtenäistä yhteistä sekvenssi. Ottaen huomioon resoluutio differential display geeli, ero pituus välillä kaksi nauhaa (A ja B) ei ole enempää kuin muutaman nukleotidin. Eri hehkutus paikka joko satunnainen aluke tai polyA pohjamaali voi selittää tätä tulosta.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0034875.s001

(PPT) B Kuva S2.

RT-PCR-analyysi RNF19A veressä eturauhassyöpää potilaiden ja terveillä miehillä. Tasot RNF19 arvioitiin käyttäen semikvantitatiivinen RT-PCR. RNA käänteistranskriboitiin käyttäen sattumanvaraisia ​​heksameerejä tai oligo (dT) alukkeen ja Transcriptor käänteistranskriptaasia (Roche Applied Science), mukaisesti valmistajan protokollaa. Amplification cDNA tehtiin käyttämällä sekvenssi-spesifisiä alukkeita ja RNF19A ja GAPDH-geenit. PCR-tuotteet ajettiin 2% agaroosigeelissä. Kvantitointi cDNA bändejä geelillä suoritettiin digitaalinen analyysi kaistan intensiteetin käyttämällä Eagle Eye II vielä videojärjestelmä ohjelmiston, jonka Stratagene (La Jolla, CA). RNF19A transkriptio olivat huomattavan suuret eturauhassyöpäpotilailla kontrolleihin verrattuna.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0034875.s002

(PPT) B Taulukko S1.

Raw C

T tiedot esitetään validointia kohorttien eturauhassyövän potilailla (PRCA pts) ja terveillä verrokeilla. Mean C

T-arvot olivat matalammat PRCA pts kontrolleihin verrattuna (28,25 vs. 29,50, p = 0,02). Mean C

T arvot 18S viite geeniä eivät olleet tilastollisesti erilaiset potilaiden ja verrokkien (16,62 vs. 16,67, p = 0,89). Keinot verrattiin käyttäen t-testiä.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0034875.s003

(DOC) B

Kiitokset

Tekijät haluavat kiittää potilaille ja heidän perheilleen, jotka tekivät tämän työn mahdollista.