Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Useat epidemiologiset tutkimukset ovat tutkineet yhdistysten geneettisen vaihtelun

LEP

(G2548A, -2548 nukleotidin ylävirtaan ATG) ja

LEPR

(Q223R, nonsynonymous SNP eksonissa 6) syöpäalttiutta; kuitenkin, havainnot ovat ristiriidassa. Siksi teimme meta-analyysi kattavasti arvioida tällaisten yhdistysten.

Methods

Haimme julkaistuja MEDLINE, EMBASE, Web of Science ja CBM tukikelpoisten julkaisuihin. Olemme myös arvioitiin genotyyppi-pohjainen mRNA ilmaisun tietoja HapMap varten rs7799039 (G2548A) ja rs1137101 (Q223R) normaalissa johdetut solulinjat 270 potilailla, joilla on eri etnisten ryhmien.

Tulokset

kädessä mukana 16 julkaistut tutkimukset 6569 tapauksissa ja 8405 ohjaukset

LEP

G2548A ja 19 tutkimukset 7504 tapauksissa ja 9581 ohjaukset

LEPR

Q223R. Kaiken

LEP

G2548A oli tilastollisesti merkitsevästi liittyy suurentunut riski yleistä syöpään (AA vs. GG: OR = 1,27, 95% CI = 1,05-1,54; väistyvä malli: OR = 1,19, 95% CI = 1,00-1,41). Edelleen stratifications syövän tyypin osoitti suurentunut eturauhassyövän (väistyvä malli: OR = 1,26, 95% CI = 1,05-1,51), mutta ei muita syöpiä. Sillä

LEPR

Q223R, ei tilastollista näyttöä yhdistyksen kanssa syöpäriski todettiin kaikille; kuitenkin edelleen jaottelu etnisyyden osoitti lisääntynyttä riskiä afrikkalaisten mutta ei muita etnisissä ryhmissä. Ei merkittävästi eroja

LEP

ja

LEPR

mRNA ilmaisun oli seassa genotyypit tai etnisen.

Johtopäätökset

huolimatta joitakin rajoituksia, tämä meta-analyysi löysi tilastollista näyttöä yhdistyksen välillä

LEP

2548AA genotyypin ja yleistä syöpäriskiä, ​​erityisesti eturauhassyövän, mutta koska tämä vaihtoehto ei ole vaikutusta mRNA ilmaisun, tämä yhdistys oikeuttaa ylimääräisen suurissa ja hyvin suunniteltu tutkimuksissa.

Citation: Hän J, Xi B, Ruiter R, Shi TY, Zhu ML, Wang MY, et al. (2013) yhdistys

LEP

G2548A ja

LEPR

Q223R polymorfismit syöpä Herkkyys: Todisteet meta-analyysi. PLoS ONE 8 (10): e75135. doi: 10,1371 /journal.pone.0075135

Editor: Qingyang Huang, Keski-Kiinassa Normal University, Kiina

vastaanotettu: 4. toukokuuta 2013 Hyväksytty: 12 elokuu 2013; Julkaistu 17. lokakuuta 2013

Copyright: © 2013 He et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus tukivat avustuksia Kiinan leiviskää Program rekrytointi Fudanin yliopistossa ja National Natural Science Foundation of China (81101808). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Syöpä on tunnustettu yhdeksi johtavista kuolinsyistä taloudellisesti kehittyneissä maissa sekä kehitysmaissa. Arvioituun 12,7 miljoonia syöpätapauksista ja 7.6 miljoonia syöpäkuolemista tapahtui vuonna 2008, syöpä on tullut merkittävä kansanterveydellinen haaste [1]. Koska yhdistelmä aiemmin havaita ja hoito on kehittynyt, yleinen syöpään kuolleisuus vähenee viime vuosikymmenen aikana. Kuitenkin maailmanlaajuinen taakka syövän kasvaa, mikä johtuu suurelta osin lisääntynyt pitkäikäisyys ja niiden kasvua maailman väestön että yhä hyväksyä syöpää aiheuttavia käyttäytymistä [1]. Vaikka mekanismi syövän ei vielä täysin ymmärretä, on ehdotettu, että ympäristötekijät, interplaying matalan penetrance altistavia geenejä, voi olla tärkeä syövän kehittymiseen [2,3].

leptiini (LEP , jota kutsutaan myös OB lihaville), joka on rasvasolujen johdettu hormoni, tuottavat pääasiassa valkoinen rasvakudos, säätelee ruokahalua ja painon, kehon aineenvaihduntaa ja lisääntymistoimintoja yhdessä leptiinin reseptorin (LEPR) (kuvio 1) [4].

LEP

geeni, joka sijaitsee kromosomissa 7q31.3, koodaa 16 kDa: n proteiini, joka on johdonmukaisesti osoitettu liittyvän endokrinologista aineenvaihduntaan [5]. Se on ollut myös, että leptiini voisivat edistää seerumin insuliinin ja kehittymistä tyypin 2 diabeteksen [6] ja että leptiini osallistuu patofysiologiassa lihavuuden [7,8] ja syövän syntymistä [9-14]. Leptiini saa aikaan fysiologisen toiminnan kautta reseptorin (LEPR, kutsutaan myös CD295, ja sen geeni sijaitsee kromosomissa 1p31), joka on yksi transmembraaninen proteiini jaetaan monenlaisia ​​kudoksissa [15].

sijainnit

LEP

G2548A (A) ja

LEPR

Q223R (B) ja mahdollisesti leptiinin toimintoja ja polun säännellä rasvakudoksen massan (C).

LEP

ja

LEPR

ovat erittäin polymorfisia, ja useita yhden nukleotidin polymorfismien (SNP: t), on havaittu näiden kahden geenin [6,8,16,17]. Esimerkiksi on ainakin 383 raportoitu SNP

LEP

geenialueen ja 3117 raportoitu SNP

LEPR

geenialueen (https://www.ncbi.nlm.nih.gov /hankkeet /SNP). Kuitenkin vain harvat näistä raportoitu SNP: t ovat potentiaalisesti toimiva ja koskaan tutkittu niiden yhdistysten kanssa syöpäalttiutta. Sillä

LEP

on kaksi SNP jotka kuulemma muuttaa aminohapon proteiinia, mutta vain G2548A (rs7799039) oli laajalti tutkittu sen yhdessä syöpäriskiä; for

LEPR

on viisi yhteistä (pienet alleelin frekvenssi 0,05) SNP: itä, jotka voivat aiheuttaa aminohappo muutoksia, mutta vain Q223R (rs1137101) tutkittiin sen yhdessä syöpäalttiutta. Koska Näiden tutkimusten tulokset ovat ristiriitaisia ​​[9-14,16,18-40], suoritimme meta-analyysi julkaistut raportit arvioitava edelleen yhdistys näiden kahden SNP kanssa syöpäriskiä.

Materiaalit ja menetelmät

tunnistaminen ja kelpoisuuden asiaankuuluvien tutkimusten

Julkaistut tutkimukset olivat mukana, jos ne täyttivät seuraavat kolme mukaanottokriteerinä: (a) arvioidaan yhdistyksen välillä

LEP

G2548A (tai A19G) ja /tai

LEPR

Q223R SNP ja syövän riskiä, ​​(b) käyttäen tapaus-verrokki suunnittelu, (c) riittävien laskennan kertoimet ratio (OR), jossa 95%: n varmuudella väli (CI).

Haimme sähköisen kirjallisuuden MEDLINE, EMBASE, Web of Science ja Kiinan Biomedical (CBM) (https://www.imicams.ac.cn) tietokannat kaikkien asiaankuuluvien artikkeleita käyttävät hakutermejä : ”leptiini tai LEP”, ”leptiini reseptorin geeni tai LEPR”, ”variantti, muuttaminen tai polymorfismi” ja ”syöpä, kohdunkaulan tai kasvain” (edellinen haku päivitettiin 10. maaliskuuta, 2013). Kaikki kelvolliset tutkimukset haettiin, ja niiden kirjallisuusluettelot manuaalisesti tarkastetaan muista asiaan liittyvistä julkaisuista. Review artikkeleita ja lähdeluetteloissa muita asiaankuuluvia tutkimuksia tunnistettu olivat käsin etsitään sekä löytää uusia tukikelpoisia tutkimuksia. Vain julkaistut tutkimukset koko artikkelia Englanti tai Kiinan olivat mukana. Jos useampi kuin yksi artikkeli on julkaistu käyttäen samaa potilasryhmässä vain viimeisin tai suurimman tutkimuksessa käytettiin tässä meta-analyysi. Kaksi tekijää itsenäisesti arvioi artikkeleita noudattamista kriteereillä, ja erimielisyys ratkaistiin keskustelut kunnes päästiin.

Data louhinta

Seuraavat tiedot kerättiin kunkin tutkimuksen: ensin tekijän sukunimi, julkaisupäivämäärä, etnisen tutkimuksen väestöstä, syöpä tyyppi, lähde käytetään valvonnan kaikista tapauksista ja valvonta, ja numerot tapausten ja kontrollien kanssa AA, AG ja GG genotyyppien varten

LEP

G2548A ja

LEPR

Q223R, vastaavasti.

genotyypin ja geenien ilmentymisen korrelaatioanalyysiä

tiedot

LEP

ja

LEPR

genotyyppi ja transkriptio (mRNA) ekspressiotasot olivat saatavilla verkossa (https://app3.titan.uio.no/biotools/help.php?app=snpexp) [41]. Genotyyppaustulokset tiedot olivat peräisin HapMap vaiheen julkaisu 23 tietokokonaisuus koostuu 3960000 SNP genotyyppiä 270 yksilöitä neljästä populaatioiden (CEU: 90 Utah asukkaille syntyperä Pohjois- ja Länsi-Euroopassa, CHB: 45 etuyhteydettömille han-kiinalaisten Pekingissä; JPT : 45 etuyhteydettömille japani Tokiossa YRI: 90 Yoruba Ibadan, Nigeria) [42,43]. Otteen (mRNA) ilmentyminen tietojen genotyyppejä olivat EBV-transformoituja B lymfoblastoidisolulinjat samasta 270 yksilöiden [44,45].

Tilastolliset menetelmät

vahvuus yhdistysten

LEP

G2548A ja

LEPR

Q223R SNP syöpäriskiä arvioitiin laskemalla syrjäisimpien alueiden vastaaviin 95% CI. Sillä

LEP

G2548A, yhdistettyjen syrjäisimpien alueiden suoritettiin homotsygoottinen mallin (AA vs. GG) heterotsygoottista malli (AG vs. GG), resessiivinen malli (AA vs. AG + GG), ja hallitseva malli (AA + AG vs. GG). Sillä

LEPR

Q223R, yhdistettyjen syrjäisimpien alueiden suoritettiin myös homotsygoottista mallin (GG vs. AA) heterotsygoottista malli (AG vs. AA), resessiivinen malli (GG vs. AG + AA), ja hallitseva malli ( GG + AG vs. AA). Tasalaatuisuus olettamus varmistettiin käyttämällä Chi square-pohjainen Q-testi. Jos tutkimuksissa havaittiin olevan homogeeninen (jossa

P

0,10 Q testi), yhdistettyjen tai arvion kaikista tutkimuksista laskettiin kiinteiden vaikutusten malli (Mantel-Haenszel menetelmä) [46 ]. Jos homogeenisuutta ei voida olettaa, satunnainen-vaikutusten malli (jäljempänä Dersimonian ja Laird menetelmää) käytettiin [47]. Alaryhmäanalyyseissa suoritettiin syöpätyypin, etnisyys, tutkimuksen suunnittelu ja otoskoko (eli ei. Tapauksista ≥150 vs. no. Tapauksista 150). Läsnäolon varmistamiseksi mahdollisten julkaisun harhaa, standardi virhe log (OR) tutkimusta varten piirrettiin sen log (OR). Suppilo juoni epäsymmetria arvioitiin Egger n lineaarisen regression testi [48]. Vaikutuksen arvioimiseksi yksittäisten tutkimusten kokonaisriski syöpiä, herkkyys analyysit tehtiin jättämällä kunkin tutkimuksen erikseen ja lasketaan uudelleen syrjäisimpien alueiden ja 95%: n luottamusväli. MRNA ekspressiotasot välillä kerrostumien arvioitiin käyttämällä Studentin

t

testi, ja suuntaus testit transkriptin ilmentymisen tasoja genotyypit arvioitiin käyttäen General lineaarista mallia. Tämä meta-analyysi suoritettiin käyttäen ohjelmistoa STATA versio 10.0 (Stata Corporation, College Station, TX) ja SAS-ohjelmiston (versio 9.1; SAS Institute, Cary, NC). Kaikki

P

arvot olivat kaksipuolisia, ja

P

0,05 katsottiin tilastollisesti merkitsevä.

Tulokset

Tutkimus ominaisuudet

Kuten kuvassa 2, yhteensä 115 julkaistu kirjaa haettiin, joista 85 on jätetty sen jälkeen, kun tiivistelmät havaittiin olevan merkityksetön, ja kolme paperit suljettiin, kaksi [49,50] joista koskee toinen tutkimuksessa [11], ja yksi oli kirjoitettu venäjäksi [26]. Lopuksi, 27 paperit täytti kriteereillä ja otettiin mukaan meta-analyysissä (taulukko 1). Kaiken kaikkiaan 16 tutkimuksissa 6569 tapauksia ja 8405 tarkastuksia tutkinut

LEP

G2548A (tai A19G) SNP, ja toinen 19 tutkimuksissa 7504 tapauksia ja 9581 tarkastuksia tutkinut

LEPR

Q223R SNP. Tutkimus Teras et al. [29] kahteen SNP sisältyi ainoastaan ​​laskettaessa hallitseva malli, koska genotyyppijakauman ei ole esitetty riittävän yksityiskohtaisesti.

Sukunimi

Year

Maa

Alkuperä

Syöpä tyyppi

tapausta /valvonta

Lähde hallintalaitteiden

genotyyppi menetelmä

polymorfismit

Kote-Jarai2003UKCaucasianProstate cancer273 /262PB * PCR-RFLPQ223RRibeiro2004PortugalCaucasianProstate cancer143 /118HBPCR-RFLPG2548ARibeiro2006PortugalCaucasianLung cancer102 /342HBPCR-RFLPG2548AWoo2006KoreaAsianBreast cancer45 /45HBPCR -sequencingQ223RSnoussi2006TunisiaAfricanBreast cancer308 /222HBPCR-RFLPG2548A, Q223RGallicchio2007USACaucasianBreast cancer53 /872PBTaqManQ223RHan2008ChinaAsianBreast cancer240 /500HBPCR-RFLPQ223ROkobia2008NigeriaAfricanBreast cancer209 /209HBPCR-RFLPQ223RUlybina2008RussiaCaucasianBreast cancer110 /105HBReal ajan PCRQ223RSlattery2008USAMixedColorectal cancer1565 /1965MixedTaqManG2548ADoecke2008AustraliaCaucasianEsophageal cancer261 /1352PBSequenom iPLEX G2548A, Q223RUlybina2008RussiaCaucasianEndometrial cancer191 /105HBReal ajan PCRQ223RTeras2009USACaucasianBreast cancer641 /650PBSNPstreamG2548A, Q223RMoore2009FinlandCaucasianProstate cancer947 /863PBTaqManG2548AWang2009USACaucasianProstate cancer253 /257PBTaqManG2548AYapijakis2009Greece GermanyCaucasianOral cancer150 /152HBPCR-RFLPG2548A, Q223RPechlivanis2009CzechCaucasianColorectal cancer659 /711HBTaqManG2548A, Q223RVašků2009CzechCaucasianColorectal cancer100 /100HBPCR-sequencingG2548A, Q223RTsilidis2009USAMixedColorectal cancer204 /362PBTaqManG2548AChovanec2009CzechCaucasianEndometrial cancer66 /66HBUnknownG2548ACleveland2010USACaucasianBreast cancer1059 /1101PBUnknownG2548A, Q223RPartida-Perez2010MexicoLatin AmericanColorectal cancer68/102HBPCR-RFLPG2548ADai2010ChinaAsianHepatocellular82/102HBPCR-RFLPQ223RNyante2011USAMixedBreast cancer1972 /1775PBIlluminaQ223RKim2012KoreaAsianBreast cancer390 /447HBMassARRAYQ223RLi2012ChinaAsianLung cancer744 /832PBPCR-RFLPQ223RKim2012KoreaAsianGastric cancer48 /48HBPCR-RFLPG2548A, Q223RTable 1. Ominaisuudet sisältämien tutkimusten meta-analyysissä.

Huomautuksia: LEP G2548A on korkea kytkentäepätasapainossa kanssa A19G; * Aviopuoliso sairastavien potilaiden CRC.HB, sairaala perustuu; PB, Väestölähtöinen; RFLP, restriktiofragmenttien pituuspolymorfiaa polymeraasiketjureaktio. CSV Lataa CSV

Meta-analyysin tulokset

kokonaistulokset ehdotti tilastollisesti merkitsevästi yhteydessä

LEP

G2548A (tai A19G) ja syöpäriskiä (AA vs. GG: OR = 1,27 , 95% CI = 1,05-1,54; AA vs. AG + GG: OR = 1,19, 95% CI = 1,00-1,41) (taulukko 2, kuvio 3). Vuonna alaryhmäanalyysi etnisyys, tilastollisesti merkitsevä yhteys todettiin valkoihoisilla (AA vs. GG: OR = 1,24, 95% CI = 1,01-1,53; väistyvä malli: OR = 1,23, 95% CI = 1,01-1,51) ja afrikkalaiset (AA vs. GG: OR = 3,17, 95% CI = 1,54-6,51; väistyvä malli: OR = 2,62, 95% CI = 1,31-5,26), mutta ei muiden etnisten ryhmien. Vuonna alaryhmäanalyysi kasvaintyypistä,

LEP

2548A (tai 19G) alleeli merkitsevästi yhteydessä eturauhassyövän riskiä (AA vs. AG + GG: OR = 1,26, 95% CI = 1,05-1,51) mutta ei syöpää rinnat ja peräsuolen tai muiden erityisten syöpiä. Vuonna alaryhmäanalyysi otoskoko, tilastollisesti merkitsevä yhteys todettiin tutkimuksissa, joissa otoskoot 150 (AA vs. GG: OR = 1,78, 95% CI = 1,24-2,54; AA vs. AG + GG: OR = 1,33 , 95% luottamusväli = 1,00-1,78), mutta ei niille, joilla näytekokoa ≥150.

muuttujat

No. Opintojen

Homozygous yhteistyössä hallitseva

P

het

b

Heterozygous co-dominant

P

het

b

Recessive

P

het

b

Dominant

P

het

b

AA vs. GGAG vs. GG (AA vs. AG + GG) (AA + AG vs. GG) All151.27 (1,05-1,54) 0,003 1,04 (0,96-1,13) 0,154 1,19 (1,00-1,41) 0,000 1,08 (0,97-1,20 ) 0,089 Cancer typeBreast21.91 (0,82-4,45) 0,025 1,02 (0,86-1,21) 0,033 1,74 (0,96-3,17) 0,088 1,12 (0,85-1,46) 0,030 Colorectal50.97 (0,78-1,20) 0,216 1,03 (0,92-1,17) 0,188 0,92 (0,81-1,05) 0,532 1,02 (0,84-1,23) 0,160 Prostate31.42 (0,94-2,12) 0,138 1,13 (0,94-1,36) 0,068 1,26 (1,05-1,51) 0,501 1,30 (0,92-1,84) 0,060 Others51.32 (0,91-1,92 ) 0,270 0,96 (+0,74-+1,24) 0,736 1,27 (0,79-2,08) 0,004 1,02 (0,80-1,32) 0,952 EthnicityCaucasian101.24 (1,01-1,53) 0,036 0,99 (+0,89-+1,10) 0,333 1,23 (1,01-1,51) 0,003 1,03 (0.93- 1.15) 0,299 Latin American12.53 (0.89-7.18) /2.97 (1.17-7.50) /1.08 (0.53-2.21) /2.83 (1.15-6.98) /African13.17 (1.54-6.51) /1.45 (1.01-2.07) /2,62 (1,31-5,26) /1.62 (1,14-2,29) /Asian10.88 (0,05-14,69) 1,29 (0,07-22,42) 0,69 (0,30-1,61) 1,00 (0,06-16,46) /Mixed20.94 (0,79-1,13) 0,455 1,05 (0.91-1.22) 0,796 0,96 (0.76-1.19) 0,213 1,02 (0.89-1.17) 0,899 lähde controlsHospital91.70 (1.10-2.61) 0,002 1,10 (0.94-1.29) 0.0281.39 (0.99-1.95) 0,003 1,28 (0,97 -1,69) 0,011 Population51.22 (1,05-1,41) 0,604 0,99 (0,88-1,13) 0,894 1,15 (+0,95-+1,38) 0,074 1,03 (0,93-1,15) 0,923 Mixed10.92 (0,76-1,11) /1.06 (0,91-1,23) /0,89 (0.75-1.05) /1.02 (0.88-1.17) /Otoskoko tapauksissa 15061,78 (1,24-2,54) 0,677 1,29 (0,98-1,71) 0,060 1,33 (1,00-1,78) 0,397 1,44 (0,98-2,13) ​​0,120 = 15091,16 (,95-+1,43) 0,003 1,02 (0,94-1,11) 0,588 1,16 (+0,95-+1,41 ) 0,000 1,03 (0,95-1,12) 0,360 Taulukko 2. Meta-analyysi yhdistyksen välillä

LEP

G2548A polymorfismi ja syöpäriskiä.

ainoastaan ​​A esitteli tutkimuksen niin tarkasti, yhdessä tutkimuksessa oli sisällytetään ainoastaan ​​laskettaessa hallitsevan mallin.

b

P

arvo Q-testi heterogeenisuus testi. CSV Lataa CSV

LEPR

Q223R SNP ei havaittu tilastollisesti merkittävää yhteyttä syöpäriski todettiin (taulukko 3, kuva 4). Vuonna kerrostunut analyysi etnisyys kuitenkin tilastollisesti merkitsevä assosiaatio havaittiin afrikkalaisten (GG vs. AA: OR = 1,85, 95% CI = 1,23-2,79; GA vs. AA: OR = 1,48, 95% CI = 1.08- 2,01; GG vs. GA + AA: OR = 1,48, 95% CI = 1,07-2,05; GG + GA vs. AA: OR = 1,58, 95% CI = 1,14-2,20), mutta ei valkoihoiset ja muiden etnisten väestöryhmien. Tilastollisesti merkitsevä yhteys todettiin edelleen jaottelu kasvaimen tyyppi, lähde valvonta, ja otoskoko.

Muuttujat

No. Opintojen

Homozygous yhteistyössä hallitseva

P

het

b

Heterozygous co-dominant

P

het

b

Recessive

P

het

b

Dominant

P

het

b

GG vs. AAAG vs. AA (GG vs. AG + AA) (GG + AG vs. AA) All181.02 (0,76-1,39) 0,000 1,08 (+0,88-1,34) 0,000 0,98 (0,82-1,18) 0,000 1,03 (0,83-1,29 ) 0,000 Cancer typeBreast90.94 (+0,62-+1,42) 0,000 0,97 (0,72-1,31) 0,000 0,95 (0,76-1,20) 0,000 0,93 (0,70-1,24) 0,000 Colorectal21.15 (0.86-1.53) 0,507 1,25 (0.70-2.23) 0,090 1,09 (0,85-1,39) 0,789 1,23 (,76-+1,98) 0,130 Prostate10.82 (0.52-1.29) /0.85 (0.58-1.26) /0.89 (0.59-1.34) /0.84 (0.59-1.19) /Others61.09 (0,49-2,39 ) 0,000 1,27 (0,83-1,94) 0,029 1,04 (0,62-1,75) 0,000 1,17 (,90-+1,96) 0,000 EthnicityCaucasian91.08 (,84-+1,40) 0,020 1,10 (0,96-1,26) 0,363 0,98 (0,78-1,24) 0,006 1,06 (0.91- 1,23) 0,075 East Asian60.44 (,08-+2,48) 0.0000.49 (0,11-2,13) ​​0.0000.79 (0,46-1,36) 0,000 0,44 (0,09-2,33) 0.000African21.85 (1.23-2.79) 0.2751.48 (1.08- 2,01) 0.3021.48 (1.07-2.05) 0.4031.58 (1.14-2.20) 0.245Mixed10.91 (0.76-1.09) /0.92 (0.78-1.08) /0.97 (0.84-1.12) /0.92 (0.79-1.06) /Lähde of controlsHospital120.86 (0,49-1,51) 0,000 0,99 (0,69-1,43) 0,000 0,89 (0,66-1,19) 0,000 0,90 (0,60-1,38) 0,000 Population61.22 (+0,84-+1,76) 0,000 1,14 (0,86-1,51) 0,000 1,12 (0,90 -1,39) 0,001 1,11 (0,84-1,46) 0,000 Otoskoko tapauksissa 15060,89 (0,37-2,12) 0,014 1,08 (0,55-2,13) ​​0,046 0,84 (0,51-1,38) 0,040 1,03 (0,53-2,01) 0,034 = 150121,04 (0,75-1,46) 0,000 1,07 (,85-+1,35) 0,000 1,02 (0,84-1,24 ) 0,000 1,02 (0.80-1.31) 0,000 Taulukko 3. Meta-analyysi yhdistyksen välillä

LEPR

Q223R polymorfismi ja syöpäriskiä.

ainoastaan ​​A esitteli tutkimuksen niin tarkasti, yhdessä tutkimuksessa oli sisällytetään ainoastaan ​​laskettaessa hallitsevan mallin.

b

P

arvo Q-testi heterogeenisuus testi. CSV Lataa CSV

mRNA ilmentyminen genotyyppien

mRNA ekspressiotasot

LEP

ja

LEPR

jonka genotyyppien neljä etnisten on esitetty taulukossa 4. Emme löytäneet mitään eroja mRNA ilmentyminen genotyyppejä eri etnisten ryhmien. Ei suuntaus transkriptin ilmentymisen tasoja genotyyppien löydettiin

LEP

tai

LEPR

. Nämä tiedot viittaavat siihen, että variantit tutkittavana ei voi olla merkittävää vaikutusta geeniekspressiota ainakin mRNA.

Populaatiot

LEP

rs7799039 (G2548A) B

LEPR

rs1137101 (Q223R)

genotyypit

nro

keskiarvo ± SD

P

b

P

trendi

c

genotyypit

nro

keskiarvo ± SD

P

b

P

trend

c

CHBGG48.82±0.220.913GG368.70±0.230.819AG158.66±0.230.229AG88.78±0.220.402AA268.73±0.230.422AA18.530.468AG/AA418.70±0.230.311AG/AA98.75±0.220.575JPT

dGG18.410.653GG328.52±0.220.774AG188.51±0.240.688AG128.50±0.150.774AA268.53±0.200.562AA0–AG/AA448.52±0.210.609AG/AA128.50±0.150.774CEU

dGG208.53±0.300.473GG268.49±0.270.427AG448.45±0.240.228AG448.48±0.230.902AA218.47±0.250.492AA198.43±0.220.421AG/AA658.45±0.240.242AG/AA638.46±0.230.674YRI

dGG878.57±0.240.749GG318.57±0.270.698AG28.62±0.050.749AG468.59±0.220.728AA0–AA128.51±0.260.561AG/AA28.62±0.050.749AG/AA588.57±0.220.936Table 4.

LEP

ja

LEPR

mRNA ilmentymisen genotyypin SNP, tietojen avulla HapMap

a.

genotyypitysreaktioseosta data ja mRNA: n ilmentymisen tasot

LEP

tai

LEPR

jonka genotyypit saatu HapMap vaiheen II vapautuminen 23 tietoja EBV-transformoituja lymfoblastoidisolulinjat 270 ihmisellä, joista 45 etuyhteydettömältä han-kiinalaisten Beijing (CHB).

b Kahden puolen Opiskelijan

t

testi sisällä ositteessa.

c

P

arvot suuntaus testi mRNA ilmaisun joukossa kolme genotyyppiä kullekin SNP yleisestä lineaarinen malli.

d on puuttui tietoja, koska Genotyyppaustulokset kuudelle henkilöt eivät olleet käytettävissä

LEP

ja kolme henkilöä eivät olleet käytettävissä

LEPR.

CSV Lataa CSV

Julkaisu bias

LEP

G2548A (tai A19G), oli näyttöä julkaistavaksi bias alle homotsygoottinen lisäaine malli (Egger testi: AA vs. GG:

P

= 0,034); mutta tämä ei havaittu muissa geneettisissä malleissa (AG vs. GG:

P

= 0,174; väistyvä malli:

P

= 0,138; hallitseva malli:

P

= 0,071). Julkaisussa bias voidaan katsoa johtuvan pienestä otoksesta mukana tutkimuksissa oli. Kun tutkimukset tapauksissa pienempi kuin 150 numeroina jätettiin julkaiseminen bias katosi, mutta merkittävää yhteyttä myös katosi.

Ei julkaistu bias havaittu varten

LEPR

Q223R (Egger testi: GG vs. AA:

P

= 0,559, AG vs. AA:

P

= 0,686, väistyvä malli:

P

= 0,600, hallitseva malli:

P

= 0,600).

keskustelu

on hyvin tunnettua, että yksittäiset alttiutta syöpään vaihtelee, vaikka samalla ympäristön altistumista. Siksi rooli geneettinen vaihtelu, kuten SNP: t osallistuvien geenien karsinogeneesissä, on ehdotettu. Epidemiologiset tutkimukset ovat osoittaneet, että ylipaino ja liikalihavuus saattaa liittyä suurentunut riski sairastua sydän- ja verisuonitauteihin ja tyypin II diabetesta; Lisäksi liiallinen kehon paino on suoraan liittynyt syöpäriskiä useissa elinkohdissa, kuten paksusuolessa, rinnat (postmenopausaalisilla naisilla), kohdun limakalvon, ruokatorven, ja munuaisten [51]. Aikaisemmin immuuni toimintahäiriöitä on osoitettu olevan yhteydessä lihavuuteen [20], kun taas leptiini pitoisuudet olivat äskettäin havaittu olevan suurempi afrikkalaiset verrattuna valkoihoiset, oikaistu BMI ja muut tekijät [52].

Q223R SNP (mutta ei K109R tai K656N SNP) on

LEPR

geeni on raportoitu liittyvän lihavuuteen ja ennustaa pieni osa kehon painon ja kehon koostumuksen vaihtelu geneettisesti homogeeninen populaatio [8] . Aiemmat raportit osoittivat, että geneettinen vaihtelu

LEPR

vaikuttaa syöpäalttiutta huomattavasti korkeampi taajuus

LEPR

223Arg alleeli potilailla kuin verrokeilla [9,11,22,24,33]; mutta tämä yhdistys ei saataisi myöhemmissä tutkimuksissa [14,16,19,23,31,36]. Samoin aikaisemmat raportit osoittivat myös, että

LEP

2548AA oli liittyy lisääntynyt syöpäriski [12,13,20,21,33,34]; kuitenkin, replikointi Tämän löydöksen muiden myöskään samoin [25,28,31].

Tässä meta-analyysissä, löysimme tilastollista näyttöä merkittävää mutta viikon yhdistys syöpäriski kanssa

LEP

G2548A (tai A19G) SNP mutta ei

LEPR

Q223R SNP. On olemassa useita biologisesti uskottavia selityksiä tämän löydöksen. Ensinnäkin, se on kuvattu, että geneettiset variantit promoottorialueen

LEP

voi vaikuttaa leptiini ilmentymisen, mahdollisesti transkription tasolla, mikä muuttaa rasva erityksen hormoni [17]. Lisäksi se on myös todennäköistä, että havaitut yhdistys voi johtua parani tutkimuksen valta yhdistämisestä tutkimuksissa pienestä otoksesta, jotka erikseen saattanut olla riittämätön tilastollinen voima havaita heikko vaikutus. Niinpä genotyyppi-pohjainen mRNA-ekspression analyysi tietojen avulla HapMap varten

LEP

G2548A, emme löytäneet tilastollista eroa voidaan katsoa johtuvan pienen otoksen koko eri etnisen tai G2548A saattaa olla heikko vaikutus. Vuonna alaryhmäanalyysi kasvaintyypistä, havaittua yhdistyksen välillä

LEP

2548A (tai 19G) ja eturauhassyövän riskiä viittaa siihen, että tämä SNP voi olla tautikohtaisten, koska kaikki eturauhassyöpäpotilaalla oli valkoihoisia kunnollinen. Vuonna alaryhmäanalyysi otoskoko, huomasimme, että yhdistyksen välillä tutkimuksissa pienestä otoksesta ja syövän riskiä G2548A polymorfismia voidaan katsoa johtuvan joidenkin valinta bias. Toisin toiseen meta-analyysi, mutta emme pystyneet löytämään tilastollisesti merkitsevästi yhteydessä

LEPR

Q223R ja rintasyövän riskiä [53]. Tämä voi selittyä sillä, että olemme mukana uusin tutkimus rintasyövästä, joka sisälsi 1972 tapauksia ja 1775 tarkastukset, null tutkimus, joka ei sisältynyt edellisen meta-analyysi.

kartoittamaan mahdollisia toiminnallisia merkitystä SNP tutkittavana, emme löytäneet mitään eroja tai suuntauksia mRNA ekspressiotasot

LEP

ja

LEPR

niiden genotyyppejä neljässä etnisten ryhmien. Syöpä on monimutkainen ja monitekijäinen sairaus, ja geeni-geeni ja geeni-ympäristön vuorovaikutukset voivat vaikuttaa merkittävästi sen syntymiseen, mutta yhden nukleotidin muutos voi olla riittämätön muuttamaan mRNA ilmaisun, myös niille SNP koodaavat alueet, jotka voivat johtaa aminohappo muutos tai polymorfismeilla promoottori voi olla hiuksenhieno, mahdolliset vaikutukset geenien ilmentymisen.

Vaikka suoritimme tämän meta-analyysin avulla kerättyä tietoa, joka voi tuottaa luotettavampia tai tilastollisesti tehokkaampi tuloksia, useat rajoituksia olisi käsiteltävä. Ensinnäkin, merkittävä heterogeenisyys havaittiin molempien näistä kahdesta polymorfismien jotka voivat vaikuttaa tulosten tulkintaan. Toiseksi yksittäiset otoskoot tapauksissa useimpien tutkimusten mukaan analyysiin olivat suhteellisen pieniä (alle 500) lukuun ottamatta seitsemän tutkimusta [25,27-29,34,36,39], ja siellä oli vain yksi tutkimus, joka perustuu väestöstä Latinalaisen Amerikan, afrikkalaiset ja aasialaiset varten G2548A polymorfismi, vastaavasti, jotka eivät tarjoa riittävää tilastollista voimaa tutkia todellisia -alueella. Kolmanneksi suurin osa tutkimuksissa käytettiin sairaalassa perustuvia tarkastuksia, jotka saattavat johtaa joidenkin valinta harhat. Lopuksi puuttuvat alkuperäisen datan, kuten ikä, sukupuoli, tupakointi ja juominen tila, BMI, ympäristötekijät ja muiden elämäntapojen, rajoittuu kykymme edelleen arvioida geenien geeni ja geeni-ympäristön vuorovaikutukset.

Yhteenvetona tämä meta-analyysissä havaittiin, että

LEP

2548AA genotyyppi liittyy heikosti lisääntynyt riski syövän, erityisesti eturauhassyövän, kun taas

LEPR

Q223R ei ollut. Kun kuitenkin otetaan huomioon suhteellisen vähäistä otoskokoja ja yksityiskohtaisten tietojen puuttumisesta, tämä analyysi ristiriitaisin etnisten ryhmien ei voinut käsitellä syövän tuloksia ja biologiset näyttöä genotyyppi-fenotyyppi (mRNA: n ilmentymisen) korrelaatioita. On selvää, että lisätutkimuksia perusteltua vahvistaa yhdistyksen välillä

LEP

G2548A polymorfismi ja syöpäriskiä.

tukeminen Information

tarkistuslista S1.

doi: 10,1371 /journal.pone.0075135.s001

(DOC) B