PLoS ONE: integroiva toimintamalli Mapping ilmentyvät eri geenien ja väyläkomponentit käyttäminen Novel parametrit valaista Key Regulatory Geenit peräsuolen syövän
tiivistelmä
tutkimalla monimutkaisia biologisia prosesseja koskee peräsuolen syöpä (CRC), joka on Systeemibiologian sisällytetään useita biologisia komponentteja ja muut vaikuttavat tekijät on tärkeää ymmärtää. Suoritimme kattavan järjestelmätason analyysia varten CRC joka avustaa purkamiseen ratkaiseva verkon komponenttien ja monia säätelyelementtejä koordinoidun näkymä. Tällä integroiva lähestymistapa, tarkkanäköinen monimutkaisuus piilotettu biologinen ilmiö on laajasti yksinkertaistettu. Microarray analyysit helpottanut ero ilmentymistä 631 merkittäviä geenejä työskentelee taudin etenemiseen ja toimitetaan mielenkiintoinen liittyvien ylös ja alas geenien kuten
kesäkuu
,
fos
ja
mapk1
. Kopioinnin säätely Näiden geenien pohdittiin laajalti tutkimalla transkriptiotekijät, kuten
hnf4
,
nr2f1
,
znf219
ja
dr1
jotka vaikuttavat suoraan ilmaisu. Edelleen, vuorovaikutukset näiden geenien /proteiinien arvioitiin ja ratkaiseva verkon motiiveja havaittiin yhdistää patofysiologiaan CRC. Tavallisesta tilastolliset parametrit, kuten
z
-score,
p
-arvo ja merkitys profiilin kartoitettiin tunnistamiseksi avaimen allekirjoituksia CRC koulutusjakson taas muutama uusi tunnusluku kuvaamaan yliedustettuina rakenteet myös suunniteltu tutkimuksessa. Levitetty lähestymistapa paljastui 5 avaimen geenejä eli
kras
,
Araf
,
pik3r5
,
ralgds
ja
akt3
kautta romaani suunnitellut parametrit havainnollistaa korkean tilastollista merkittävyyttä. Nämä uudet parametrit voidaan auttaa scrutinizing ehdokas merkkiaineita sairauksiin, joiden tiedetään biologisia polkuja. Edelleen, tutkivat ja kohdentamalla ehdotettu geenit kokeellisiin validointeja, sen sijaan että haltioissaan mutkikkaista reitin varmasti antaa arvokasta tietoa on hyvin ajoitettu järjestelmällinen ymmärtämisen CRC.
Citation: Sehgal M, Gupta R, Moussa Singh TR (2015) integroiva toimintamalli Mapping ilmentyvät eri geenien ja väyläkomponentit käyttäminen Novel parametrit valaista Key Regulatory Geenit peräsuolen syövän. PLoS ONE 10 (7): e0133901. doi: 10,1371 /journal.pone.0133901
Editor: Ying Xu, University of Georgia, Yhdysvallat