Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Suun syöpä, joka on neljänneksi yleisin miesten yleisin, liittyy ympäristö- karsinogeenien Taiwanissa. Verisuonten endoteelin kasvutekijä (VEGF) -C, angiogeeninen /imusuoniston tekijä korkean ilmentymistason tuumorikudoksissa, on merkittäviä rooleja kehityksen useiden pahanlaatuisten kasvainten. Tutkimuksen tavoitteena oli tutkia yhdistysten viisi

VEGF-C

geenipolymorfismien kanssa herkkyys ja kliinis ominaisuuksien suun okasolusyöpä.

Menetelmät /Principal Havainnot

Five yhden nukleotidin polymorfismien (SNP: t) on

VEGF-C

analysoitiin reaaliaikaisen polymeraasiketjureaktion (PCR) in 470 sairastavien miesten suusyövän ja 426 syöpää vapaa valvontaa. Tässä tutkimuksessa havaitsimme, että

VEGF-C

rs7664413 ja rs2046463 polymorfismien liittyi suullinen-syöpäalttiutta mutta ei mitään kliinis parametreja.

GGACA

tai

GACTG

haplotyypin viisi

VEGF-C

SNP: t (rs3775194, rs11947611, rs1485766, rs7664413, ja rs2046463) yhdistetty myös liittyy riski suun syöpä. Niistä 611 tupakoivilla miehillä,

VEGF-C

polymorfismi harjoittajat, jotka myös pureskella betel mälli havaittiin olevan 14,5-24,2-kertainen riski saada suullinen syöpä verrattuna

VEGF-C

villin tyyppi harjoittaja joka ei pureskella betel puntaa. Niistä 461 male betel-mälli chewers,

VEGF-C

polymorfismi harjoittajat, jotka myös savustettu oli 2,7-18,1-kertainen riski saada suullinen syöpä verrattuna niihin, jotka kantoivat villityypin mutta eivät tupakoineet.

Johtopäätökset

Tuloksemme viittaavat siihen, että kaksi SNP

VEGF-C

(rs7664413 ja rs2046463) ja kahdella haplotyyppien viidestä SNP yhdistetyn on potentiaalisia ennustavaa merkitystä suun syövän synnyn. Gene-ympäristön vuorovaikutus

VEGF-C

polymorfismien, tupakointi, ja betel-mälli pureskelu saattaa muuttaa omaa alttiutta suusyöpää.

Citation: Chien MH, Liu YF, Hsin CH, Lin CH Shih CH, Yang SF, et ai. (2013) vaikutus

VEGF-C

geenipolymorfismien ja ympäristötekijöiden vaikutusta Oral Cancer Herkkyys Taiwanissa. PLoS ONE 8 (4): e60283. doi: 10,1371 /journal.pone.0060283

Editor: Chih-Xin Tang, Kiina Medical University, Taiwan

vastaanotettu: 11 tammikuu 2013; Hyväksytty: 25 helmikuu 2013; Julkaistu: 04 huhtikuu 2013

Copyright: © 2013 Chien et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus tukivat tutkimus avustusta National Science Council, Taiwan (NSC 100-2632-B-040-001-MY3) ja apurahan Taipei Medical University-Wan Fang Hospital (myönnä. 101swf03 Dr. Chien ja Dr. Yang) . Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Suun levyepiteelisyöpä (OSCC), yhteinen pahanlaatuinen syöpä pään ja kaulan alueella, on neljänneksi yleisin miesten yleisin ja kuudenneksi yleisin syy syövän kuolemaan Taiwanissa [1]. Kehittäminen OSCC on monivaiheinen prosessi, joka vaatii kertymistä useita geneettisiä muutoksia, vaikuttaa potilaan geneettinen alttius ja ympäristön vaikutukseen, kuten alkoholin ja tupakan kulutusta, betel-mälli pureskelua, krooninen tulehdus, ja virusinfektiot [1] – [6 ]. Geenin ilmentymistä voidaan vaikuttaa yhden nukleotidin polymorfismi (SNP), joka sijaitsee promoottorin tai muiden säätelyalueiden geenin, ja tuotanto tai toiminta sen transloitu moduloidaan vielä. SNP: t, jotka ovat yleisin DNA-sekvenssin vaihtelua, tapahtuu, kun yhden nukleotidin jaetun geenin sekvenssi eroaa lajin jäsenillä tai pariksi kromosomeja yksilössä, ja niiden ajatellaan liittyvän kehityksen tiettyjen sairauksien [7]. Genotyypin liittyvä SNP voi olla yksinkertainen ja arvokas tapa ennustaa riskiä ja ennustetta syövän. Valaista monimutkainen prosessi syövän ja parantaa tieteellisen perustan taudin ennaltaehkäisyyn, tunnistaminen suuria geenejä, jotka liittyvät alttiuden OSCC olisi asetettava etusijalle ja tehokkaita menetelmiä suorittaa.

Monet aikaisemmat tutkimukset osoittivat, että kasvaimeen liittyvät angiogeneesiin ja imusuonten pelata ratkaiseva rooli syövän etenemiseen, ja angiogeenisen ja imusuoniston toiminnan usein korreloivat kasvaimen kasvua, alueellisten imusolmukkeiden etäpesäke, etäinen etäpesäke, ja ennuste maligniteetin [8] – [10]. Verisuonten endoteelin kasvutekijä (VEGF) perheen proteiinien moduloi monia endoteelisolujen toimintoja, etenkin kun on kyse vaskulogeneesiä ja angiogeneesiä [11]. VEGF-A, ensimmäinen kuvattu jäsen VEGF-perheen, indusoi angiogeneesiä aktivoimalla liittyvät tyrosiinikinaasireseptorit, VEGF-R1 ja VEGF-R2, endoteelisoluissa [11], [12]. Vaikka VEGF-A: lla on ensiarvoisen rooli kasvainangiogeneesissä, VEGF-C, tunnettu siitä olennaisena imusuoniston tekijä, joka edistää syövän etäpesäkkeiden [13] – [15]. VEGF-C, on ligandi, sekä VEGF-R3 ja VEGF-R2, mutta on suurempi affiniteetti VEGF-R3 [12]. VEGF-R3 on pääasiassa ilmaistaan ​​imusuonten endoteelisoluissa. VEGF-C aiheuttaa fosforylaatio VEGF-R3, mikä PI3K-riippuvaisen Akt aktivointia ja proteiinikinaasi C: n (PKC): sta riippuvainen aktivaatio p42 /p44-mitogeeniaktivoidun proteiinikinaasin (MAPK) reitti, mikä suojaa imusuonten endoteelisolujen apoptoosia ja stimuloimaan ja muuttoliike

in vitro

[16]. Lisäksi on äskettäin osoitettu, että VEGF-R3 voi myös ajaa angiogeneesiä [17], [18]. Angiogeeninen VEGF-R3-signaali on pääasiassa aktiivinen asettaminen angiogeenisten hyökkäystä kudoksiin, kuten tapahtuu kasvaimia. VEGF-R3 voimistaa vaikutuksia VEGF-R2, ja ne voivat ylläpitää angiogeneesiä, vaikka läsnä VEGF-R2: n estäjät [18]. Nämä tutkimukset esiin merkittävä biologinen rooli VEGF-C /VEGF-R3 akselin verisuonten endoteelisoluissa.

Useat tutkimukset osoittivat, että VEGF-R3 on myös ilmaistu erilaisissa ihmisen maligniteettien [19] – [22 ], ja tämä ilmiö on raportoitu olevan mahdollinen ennustava tekijä määrittää kliinisen lähestymistavan, koska se korreloi imusolmukkeiden etäpesäkkeiden tai huonon ennusteen potilailla, joilla on eturauhasen syöpä, kohdun limakalvon karsinooma, OSCC, ja ei-pienisoluinen keuhkosyöpä [ ,,,0],20], [23] – [25]. Toiminto ja molekyylitason mekanismi VEGF-C /VEGF-R3 akselin syöpäsoluissa, mutta ei ymmärretä hyvin. Aiemmat tutkimukset osoittivat, että tyrosiinifosforylaation VEGF-R3 syöpäsoluissa stimuloi soluproliferaatiota Kaposin sarkooma, pahanlaatuinen mesoteliooma, leukemia, ja mahasyövän [22], [26] – [28]. Toiset ja itse osoitti, että aktivointi VEGF-C /VEGF-R3 signaloinnin syöpäsoluissa tehostaa solun liikkuvuuden ja invasiivisuus ja pyritään edistämään syövän solujen etäpesäke [20], [27], [29]. Nämä havainnot, yhdessä osoittavat, että on tärkeää VEGF-C signalointi syövän etenemiseen (kasvu, invaasio ja etäpesäkkeiden) vaikuttamalla suoraan syöpäsoluihin.

vaikutukset

VEGF-A

polymorfismi ihmisen syöpäalttiutta hyvin dokumentoitu [30] – [33], mutta roolit

VEGF-C

geenin SNP ja ympäristön karsinogeenien suusyövän herkkyys ja kliiniset piirteet ovat edelleen heikosti tutkittu. Tässä tutkimuksessa, joka on tapauskontrollitutkimuksessa suoritettiin viisi SNP, jotka sijaitsevat introni tai alavirtaan

VEGF-C

geeni. Jotkut näistä SNP raportoitu korreloivan riski preeclampsia [34], osteonekroosi reisiluun pään [35], tai eloonjäämisaste munasarjasyöpä [36]. Tässä tutkimuksessa kartoitettiin järjestöjen keskuudessa

VEGF-C

geenin SNP, ympäristö riskitekijöitä, ja suusyövästä alttius. Tietääksemme tämä on ensimmäinen tutkimus, joka osoittaa selkeästi merkittävä yhteenliittymien

VEGF-C

polymorfismien suun kautta syövän syntymistä.

Materiaalit ja menetelmät

Oppiaineet ja Näytteenotto

2007-2011, rekrytoimme 470 miehillä (keski-ikä 54,0 ± 11,3 vuotta) Chung Shan Medical University Hospital Taichung, Changhua Christian sairaala ja Näytä Chwan Memorial Hospital Changhua, Taiwan tapaus ryhmä. Kontrolliryhmän, me satunnaisesti valitsi 426 syöpäsolujen yksilöitä (keski-ikä 50,5 ± 13,9 vuotta), jotka kävivät samat sairaaloiden ja näin olivat peräisin samalta alueelta. Sekä tapausten ja kontrollien, käytimme kyselylomaketta saamaan altistumista tietoa betel-mälli pureskelua, tupakointi ja alkoholinkäyttö. Lääketieteellisen tiedon tapauksista, mukaan lukien TNM kliininen lavastus, primaarikasvaimen koon, imusolmuke osallistuminen, ja histologinen, saatiin niiden potilastietoja. Oral-syöpäpotilasta oli kliinisesti järjestetään aikaan niiden diagnosointi mukaan TNM lavastus järjestelmä American sekakomitean Cancer (AJCC). Kasvaimen erilaistumista tutkittiin patologi mukaan AJCC luokitusta. Tutkimus hyväksyi Institutional Review Board of Chung Shan Medical University Hospital ja tietoisen kirjallisen suostumuksensa osallistua tutkimukseen saatiin kunkin yksittäisen.

Valinta VEGF-C polymorfismit

dbSNP tietokanta, yli 60 SNP on dokumentoitu introni tai alavirtaan

VEGF-C

geenialueen. Saada riittävää tehoa arvioitaessa mahdollisia yhteyksiä, tutkimme rs3775194, rs11947611, rs1485766, rs7664413, ja rs2046463, joilla on pieniä alleelifrekvenssit ≥5%. Lisäksi, nämä SNP

VEGF-C

geeni valittiin tässä tutkimuksessa, koska nämä SNP havaittiin syöpäpotilailla.

Genominen DNA Extraction

Genominen DNA uutettiin käyttäen QIAamp DNA veren mini sarjat (Qiagen, Valencia, CA, USA) valmistajan ohjeiden mukaisesti. Olemme liuotetaan DNA TE-puskuriin (10 mM Tris pH 7,8 ja 1 mM EDTA) ja kvantitoitiin sitten se mittaamalla optinen tiheys 260 nm: ssä. Lopullinen valmiste oli varastoitu -20 ° C: ssa ja käytetään luoda malleja polymeraasiketjureaktiolla (PCR).

Reaaliaikainen PCR

alleeliset erottelemalla rs3775194, rs11947611, rs1485766 , rs7664413 ja rs2046463 polymorfismia

VEGF-C

geeni arvioitiin kanssa ABI StepOne ™ Real-Time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA) ja analysoitiin käyttäen SDS v3.0 ohjelmisto (Applied Biosystems), jossa TaqMan-määritys. FAM-alukkeita käytettiin analysointiin rs3775194, rs11947611, rs1485766, rs7664413 ja rs2046463 geenien polymorfismien suunniteltiin FAM-5′- ATTTAGCACTATTAACTTCAAG; FAM-5′-TTACTTTTGAGAATGTCA; FAM-5′-CTTTTTGATTGCAGTGTTA; FAM-5′-CTTTACTATACTTTACTTGG ja FAM-5’TTTAGCACACGGTTTAGT, vastaavasti. Lopullinen tilavuus Kunkin reaktio oli 5 ui, joka sisälsi 2,5 ui TaqMan genotyypin Master Mix, 0,125 ui TaqMan koetinseosta, ja 10 ng genomista DNA: ta. Real-time PCR sisältyy ensimmäinen denaturaatiovaiheen 95 ° C: ssa 10 min, jota seurasi 40 sykliä 95 ° C 15 s ja 60 ° C 1 min.

Tilastollinen analysointi

erot ryhmien pidettiin merkittävinä, jos

p

arvot olivat 0,05. Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) arvioitiin käyttäen hyvyys fit

Χ

2

-testi varten kaksialleelisten markkerien. Mann-Whitney

U

-testin ja Fisherin testiä käytettiin vertaamaan erojen väestörakenteen ominaisuus jakaumia välisen terveen kontrolliryhmän ja suun-syöpäpotilaille. Oikaistu kertoimet suhdeluvut (AORs) ja 95%: n luottamusvälit (CI) yhdistyksen genotyypin taajuuksien riskejä ja kliinis ominaisuudet arvioitiin käyttämällä useita logistisen regression malleja jälkeen ohjataan muille covariates. Analysoimme kaikki data tilastollisin Analyyttinen System (SAS Institute, Cary, NC, USA) ohjelmiston (vers. 9.1, 2005) for Windows.

Tulokset

tilastollinen analyysi demografisia ominaisuuksia on esitetty taulukossa 1. oli huomattavia eroja jakaumia betel-mälli pureskelua (

p

0,001), alkoholin kulutus (

p

0,001), ja tupakointi (

p

0,001) välillä verrokeilla ja mies- OSCC potilailla. Vähentääksemme mahdolliset häiriöt ympäristötekijöiden, AORs 95% CI arvioitiin useita logistinen regressio mallien jälkeen ohjataan muille covariates kussakin verrattuna.

Meidän palvelukseen kontrolliryhmässä, taajuudet

VEGF-C

rs3775194 (

p

= 0,844, χ

2 arvo: 0,039), rs11947611 (

p

= 0,148, χ

2 arvo: 2.090) , rs1485766 (

p

= 0,566, χ

2 arvo: 0,329), rs7664413 (

p

= 0,115, χ

2 arvo: 2,478), ja rs2046463 (

p

= 0,115, χ

2 arvo: 2,478) oli Hardy-Weinberg tasapaino, vastaavasti. Rekonstruoitu kytkentäepätasapaino- (LD) juoni viidestä SNP on esitetty kuvassa 1. Me määrittää yhden havaitun haploblock jossa rs7664413 ja rs2046463 osoitti 100% kytkentäepätasapaino- tutkimuksessamme. Genotyyppi jakaumat ja assosiaatiot suusyövän ja

VEGF-C

geenipolymorfismien on esitetty taulukossa 2. alleelit korkein jakelu taajuus rs3775194, rs11947611, rs1485766, rs7664413, ja rs2046463 geenit

VEGF-C

molemmissa meidän palvelukseen miehen suun-syöpäpotilasta ja terveillä verrokeilla vastaavasti olivat homotsygoottisia G /G, heterotsygoottinen A /G, heterotsygoottinen C /A, homotsygoottinen C /C, ja homotsygoottisia A /A. Säätämisen jälkeen useita muuttujia, ei ollut merkitsevää eroa ottaa suun syöpä yksilöiden rs3775194, rs11947611, ja rs1485766 polymorfismit on

VEGF-C

geenin verrattuna villin tyypin (WT) yksilöitä. Kuitenkin potilailla, joilla

VEGF-C

Monimuotoinen rs7664413 TT genotyyppien eläintutkimuksissa merkitsevästi (

p

0,05) korkeampi riski 2.541- (95% CI = 1.071~6.027), ottaa OSCC verrattuna niiden vastaavan WT homotsygootit. Lisäksi samanlainen tulos havaittiin myös henkilöillä, joilla

VEGF-C

polymorfisen rs2046463 (taulukko 2).

Yksi havaitut haploblock, ja pareittain LD toimenpide D ’.

Vuorovaikutus vaikutusten välillä ympäristöön liittyvien riskitekijöiden ja geneettisten polymorfismien on

VEGF-C

esitetään taulukoissa 3 ja 4. joukossa 611 tupakoitsijoita, potilailla, joilla on vähintään yksi C-alleelin rs3775194, yksi G-alleelin rs11947611, yhden alleelin ja rs1485766, tai yksi T alleelin rs7664413, ja betel-pähkinä pureskelua tapa oli vastaavat riskit 14,501-kertainen (95% CI: 6.899~30.479), 19.030- (95% CI : 9.239~39.197), 15.676- (95% CI: 7.413~33.150), ja 24.220- (95% CI: 11.601~50.566) ottaa suun syöpä. Yksilöt, joilla on joko vähintään yksi C-alleelin rs3775194, yksi G alleelin rs11947611, yhden alleelin on rs1485766 tai yksi T alleelin rs7664413 tai jotka pureskella pähkinä oli vastaavat riskit 11.688- (95% CI: 6.534~20.907), 2,827 – (95% CI: 1.491~5.360), 2.670- (95% CI: 1.302~5.473) ja 7,241-kertaisesti (95% CI: 3.981~13.172) ottaa suun syöpä verrattuna yksilöiden WT homozygoottien jotka eivät pureskella pähkinä (taulukko 3). Samoin joukossa 461 betel-mälli kuluttajille, potilaalla on

VEGF-C

Monimuotoinen rs3775194, rs11947611 tai rs7664413, geenien ja tupakoivat oli vastaava riskit 2.695- (95% CI: 1.270~10.750), 8.066- ( 95% CI: 2.250~28.913) ja 18.100-kertaisesti (95% CI: 5.427~60.369) ottaa suun syöpä verrattuna betel-mälli chewers WT geeniä, jotka eivät tupakoi (taulukko 4). Ottaen huomioon yllä olevat tulokset, suosittelemme, että

VEGF-C

geenipolymorfismien on voimakas vaikutus suun syövän alttius betel-pähkinä ja /tai tupakointi kuluttajille.

lisäksi tutkineet haplotyyppien arvioimiseksi yhteenlaskettu vaikutus viiden polymorfismien suullisia-syöpäalttiutta. Jakauma taajuudet

VEGF-C

rs3775194, rs11947611, rs1485766, rs7664413, ja rs2046463 haplotyyppien meidän palvelukseen yksilöitä analysoitiin. Oli viisi haplotyyppien taajuuksilla 5% kaikista tapauksista, yleisimmät haplotyyppi kontrolliryhmässä oli GACCA (35,2%), ja se valittiin sen vuoksi viittaus. Verrattuna viittaus, kaksi

VEGF-C

haplotypes, GGACA ja GACTG, merkittävästi (

p

0,001) lisäsivät riskejä OSCC mukaan 1.568- (95% CI: 1.201~2.046 ) ja 1,819-kertaisesti (95% CI: 1.352~2.448), vastaavasti (taulukko 5).

selkeyttämiseksi roolia

VEGF-C

geenin polymorfismien oral- syöpä ennusteeseen viittaavia asema, kuten TNM kliininen lavastus, primäärikasvain koko, imusolmukkeiden osallistumista, ja histologinen, jakelu taajuus kliininen status ja

VEGF-C

genotyypin taajuudet suun-syöpäpotilailla arvioitiin. Mitään merkittävää assosiaatio rs7664413 geenipolymorfismien ja ennusteeseen viittaavia tila havaittiin (taulukko 6).

Keskustelu

Alkoholin käyttö, tupakoinnin ja betel-mälli pureskelua ovat tärkeimmät tunnetut etiologic tekijät suun syöpä. Tässä tutkimuksessa suurempi osuus havaittiin yksilöitä, jotka olivat pureskella betel mälli ja alkoholia ja tupakkaa ryhmässä OSCC potilasta (78,9%, 62,8%, ja 87,0%, tässä järjestyksessä) kuin verrokeilla (21,1%, 43,4%, ja 47,4%, tässä järjestyksessä), mikä osoittaa, että alkoholin ja tupakan kulutusta ja betel-mälli pureskelu ovat erittäin liittyy lisääntynyt riski suun syöpä. On hyvin dokumentoitu, että pitkän aikavälin tupakan ja betel-mälli kulutus lisää suusyövän [3], [4]. Betel-puntaa ainesosia voi lisätä proteiinin tasot c-Fos ja c-Jun proto-onkogeenien [37]. Tupakoinnista myös lisää merkittävästi ilmauksia hypoksian indusoituva tekijä (HIF) -1 [38] ja VEGF-C [39] suun ja kohdunkaulan syöpiä, vastaavasti. Altistuminen ympäristön karsinogeeni saattaa osittain liittyä muodostumista tai patogeneesi suusyövän, mutta yhä näyttöä siitä, että genomista muuttuu vähitellen muuttaa solujen fenotyyppien ja saattaa merkittävämmin johtaa solujen polveuduttava esineoplastiset vaiheessa syöpä [40]. Kerrottiin, että suun limakalvon yksilöiden

hiiren kaksinkertainen minuutti 2 (MDM2) B SNP 309 GG-genotyyppi on alttiimpi ympäristön karsinogeeni altistumista ja johtaa aikaisempaan alkamiseen kasvaimen muodostumisen [41]. Pidempi alleelinen polymorfismi GT dinukleotidi

hemioksigenaasi (HO) -1

promoottori ja toiminnallinen polymorfismin

tumatekijä kappa B1 (NFKB1) B promoottori ovat molemmat liittyy riski betel-mälli liittyviä OSCC [42], [43]. Polymorfismit useiden geenien havaittiin olevan liittyy riski suusyövän [44], [45]. On selvää, että geneettiset tekijät voivat keskeisessä asemassa syövän synnyssä.

VEGF-C on usein tunnistettu kasvainkudoksissa sisällä pään ja kaulan okasolusyöpä, ja laaja ilmaus VEGF-C /VEGFR-3 akselin pään ja kaulan okasolusyöpä ehdottaa osallistumista kasvaimen lymfangiogeneesiä ja angiogeneesin, edistää kasvaimen kasvua, ja eteneminen syöpäsolujen [46]. Taulukon 2 osoittavat, että yksilöiden

VEGF-C

polymorfisia rs7664413 TT tai rs2046463 GG-genotyyppi, suurempia riskejä OSCC verrattuna WT genotyyppi. Vaikka toiminnallinen merkitys näiden kahden SNP ei ole tutkittu kokeellisesti, assosiaatio riski suusyövän ehdotetaan perustuu sijainnit analysoitu vaihtoehtoja. Kuitenkin tiettyjen geenien, SNP syntyvät koodaus, promoottori tai säätelyalue voi olla toiminnallisia vaikutuksia.

rs7664413 SNP sijaitsi introni 5 reunustavan alueen (-33 nt ylävirtaan) ja

VEGF-C

geenin. Monet vaihtoehtoisen silmukoinnin cis-säänneltyjä elementit sijaitsevat tällä alueella [47]. Olemme lisäksi havainneet, että rs7664413 SNP sijaitsee sekvenssin oletetun eksoni liitos äänenvaimennin (työnvälityspalvelujen, [TAAGGTATA]). PESSs ovat cis-säätelyelementtejä, jotka estävät käytön viereisen silmukointikohdista toimimalla vuorovaikutus jäsenten heterogeeninen ydin- ribonukleoproteiinin (hnRNP) perhettä ja usein edistää vaihtoehtoisen silmukoinnin (AS). PESSs säädellä AS rekrytoimalla tekijät, jotka suoraan häiritsevät silmukointikoneisto [48]. Esimerkiksi hnRNP I /PTB sitoo monet eksoni liitos äänenvaimentimia ja näyttää estää pääsyn silmukointikoneisto kautta proteiini multimerisaatiodomeeni [49]. Muut todisteet tukevat tätä havaintoa noin kaksi silmukointivariantit (ENST00000280193 ja ENST00000507638) raportoidaan Ensemble tietokannassa (vers. GRCh37). Yksi koodaa toiminnallista VEGF-C-proteiinia (NM_005429, 420 aminohappoa), mutta muut, käsittelee vain selostukset (CF128431, ilman proteiinin tuoton, EST peräisin kondrosarkooma keuhkometastaasitestissä solulinjat). Nämä tiedot viittaavat siihen, että rs7664413 SNP saattavat vaikuttaa

VEGF-C

mRNA. Kuitenkin edelleen suunniteltu tutkimuksia tarvitaan tarkistaa vaikutusten ja taustalla mekanismi Monimuotoinen rs7664413 ennalta lähetti-RNA silmukointi.

rs2046463 SNP sijaitsi alavirtaan

VEGF-C

geeni mutta lähellä rs7664413 (alavirtaan 5008 nt). Kuten kuviosta 1 käy ilmi, päätimme yksi LD haploblock muodostuu rs7664413 ja rs2046463, jotka todennäköisesti edustavat riippuu geneettisen signaaleja, jotka vaikuttavat riski OSCC, kun taas muut SNP: t ovat ulkopuolella haploblock. Kuitenkin tukeva yksityiskohtainen mekanismi on vielä varmistettava toinen hyvin suunniteltu kokeilu.

tulkinnat tämän tutkimuksen on rajallinen, koska tietoa tietyistä suun syövän riskitekijöitä, kuten marihuana (kannabis) tupakointi, lääkkeiden nikotiinin käyttö ja perinnöllisyys ja familiaalinen riskejä, eivät olleet käytettävissä palvelukseen yksilöitä, ja tämä rajoitus voi rajoittaa säätö näiden mahdollisesti sekoittavia tekijöitä. Tässä tutkimuksessa kuitenkin tärkeimmät riskitekijät suusyöpää, alkoholin ja tupakan kulutusta ja betel-mälli pureskelua, oikaistiin, jotta voitaisiin arvioida vaikutuksia geenipolymorfismien on kliinis kehittämiseen OSCC. Tulevassa tutkimuksessa lisäämällä näytteen määrää ja ottamalla lisää OSCC riskitekijöitä huomioon analyysissä voisi tarkasti vahvistaa näitä havaintoja.

Yhteenvetona

VEGF-C

polymorfisia rs7664413 TT tai rs2046463 GG-genotyyppi saattaa lisätä riskiä OSCC.

GGACA

tai

GACTG

haplotyypin viidestä

VEGF-C

SNP (rs3775194, rs11947611, rs1485766, rs7664413, ja rs2046463) yhdistettiin osoitti myös suuri riski yhdessä OSCC. Tuloksemme viittaavat siihen, että

VEGF-C

rs7664413 ja rs2046463 Monimuotoinen genotyyppien ja haplotyyppien

GGACA

tai

GACTG

viidestä

VEGF-C

SNP kuvattu edellä saattaa edesauttaa ennustettaessa alttiutta OSCC.