Krooninen sairaus

tiivistelmä

MikroRNA (miRNA) ovat pieniä ei-koodaavan RNA-molekyylejä, jotka osallistuvat erilaisiin biologisiin prosesseihin ja saattaa säännellä tuumorisuppressorigeeneille tai onkogeenien. Yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) in miRNA voi edistää erilaisia ​​toiminnallisia seurauksia, mukaan lukien syövän kehitystä, muuttamalla miRNA ilme. Lukuisat tutkimukset ovat osoittaneet yhdistyksen välillä miRNA SNP ja syövän riskiä; Kuitenkin tulokset ovat yleensä kyseenalaisia ​​ja tuloksettomia lähinnä rajallinen tilastollinen voima. Arvioida suhdetta viisi yleisintä SNP: t (miR-146a rs2910164, miR-196a2 rs11614913, miR-499 rs3746444, miR-149 rs2292832, ja miR-27a rs895919) ja riski syövän kehitystä, teimme meta-analyysi 66 julkaistu tapaus-verrokki tutkimuksissa. Raakaöljy kertoimet suhde 95%: n luottamusväli tutkittaessa käytettiin vahvuus yhdistyksen. No association ei havaittu rs2910164 ja syöpäriskin koko ryhmän. Kuitenkin ositettu analyysi, huomasimme, että joko rs2910164 C-alleelin tai CC-genotyyppi oli suojaava virtsarakon syövän, eturauhassyövän, kohdunkaulan syöpä, paksusuolen ja peräsuolen syöpä, kun se oli riskitekijä papillaarinen kilpirauhassyövän ja okasolusyöpä on pään ja kaulan (SCCHN) induktiohoitoon. Edelleen rs11614913 todettiin olevan merkittävästi liittyy pienentynyt syövän riskiä etenkin virtsarakon syövän, mahasyövän, ja SCCHN. Mir-499, joka on merkittävää yhteyttä välillä havaittiin rs3746444 polymorfismin ja syöpäriskin yhdistetyssä analyysissa. Vuonna Alaryhmäanalyysissä, samanlaisia ​​tuloksia havaittiin pääasiassa rintasyöpään. Lopuksi, ei assosioitunut rs2292832 ja rs895919 polymorfismien ja syöpäriskin koko ryhmän ja ositettu analyysi. Yhteenvetona, miR-196a2 rs11614913, miR-146a rs2910164, ja miR-499 rs3746444 ovat syövän riskitekijöitä kehittämisen, kun taas mir-149 rs2292832 ja miR-27a rs895919 ei liity syöpäriskiä.

Johdanto-osan: Ma XP, Zhang T, Peng B, Yu L, Jiang DK (2013) välisestä assosiaatiosta microRNA polymorfismit ja syöpäriski Perustuu Ensimmäisen 66 Case-Control Studies. PLoS ONE 8 (11): e79584. doi: 10,1371 /journal.pone.0079584

Editor: Georgina L. Hold, University of Aberdeen, Yhdistynyt Kuningaskunta

vastaanotettu: 9. elokuuta, 2013 Hyväksytty: 29 syyskuu 2013; Julkaistu: 20 marraskuu 2013

Copyright: © 2013 Ma et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä työ tukivat National Natural Science Foundation of China (31100895 ja 31071193), National Natural Science Foundation of China Luova Tutkimusryhmät (30024001), https://www.nsfc.gov.cn/; National Key Sci-Tech Special Project of China (2008ZX10002-020), https://www.nmp.gov.cn/. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Syöpä on tulosta sääntelemätön geenien ilmentymisen mukana kehityksessä, solujen kasvuun ja erilaistumiseen. Monet tutkimukset ovat osoittaneet, että syöpä ei liity ainoastaan ​​ympäristötekijöistä, vaan myös yksilön geneettinen alttius (taipumus). Äskettäin uusi mekanismi mikroRNA (miRNA) -välitteisen transkription asetus selvitetty [1]. MiRNA ovat luokan yksijuosteisen lyhyt (21~25 nt) RNA: ita, jotka ovat evolutionäärisesti hyvin konservoituneita, mutta ovat ei-proteiini-koodaus. Nämä RNA: t säätelevät laaja biologinen ja patologisen prosessin, mukaan lukien apoptoosin, proliferaatiota, erilaistumista, angiogeneesi, ja immuunivasteen, joiden tiedetään olevan kriittiset roolit karsinogeneesissä [1] – [3]. MiRNA sitoutuvat 3′-transloitumattoman alueen kohde-mRNA: iden, jotka johtavat niiden hajoamisen tai translaation estyminen, mikä ekspressiota sääteleviä kohde- geenien transkription jälkeisellä tasolla [2]. Arvioiden mukaan yhden miRNA voi kohdistaa satoja mRNA: iden ja noin 50% miRNA geenit sijaitsevat syöpään liittyvien kromosomialueita [4] – [7]. Tutkimukset ovat osoittaneet, että kypsät miRNA säätelemään noin 10-30% kaikista ihmisen geeneistä [8]. Lisäksi viimeaikaiset tutkimukset ovat osoittaneet, että miRNA voivat osallistua Karsinogeneesin etenemistä (proliferaatiota, migraatiota, ja invaasio), ja ennusteen useita ihmisen maligniteettien säätelemällä ilmentyminen tuumorisuppressorigeeneille tai proto-onkogeenien [9] – [12].

Yhden nukleotidin polymorfismien (SNP: t) ovat yleisin vaihtelua ihmisen perimän, jotka vaikuttavat sekvenssin koodaus ja liitos, joka voi vaikuttaa väestön monimuotoisuuden, alttius sairauksille, ja yksittäiset vaste lääketieteen [13]. SNP voi muuttaa miRNA ilmaisun ja /tai kypsymistä vaikuttavan toiminnon kolmella tavalla: läpi transkription ensisijaisen transkriptio kautta pri-miRNA ja pre-miRNA käsittelyä, ja vaikuttamalla miRNA-mRNA vuorovaikutusta [14].

Monet epidemiologiset tutkimukset ovat osoittaneet yhdistyksen SNP miRNA kehittämiseen ja etenemiseen syövän [14], [15]. MiR-146a rs2910164, miR-196a2 rs11614913, miR-499 rs3746444, miR-149 rs2292832, ja miR-27a rs895919 ovat vakiintuneita miRNA polymorfismien [16] – [28], jotka on raportoitu liittyvän syöpäriski [14 ]. Kuitenkin Näiden tutkimusten tulokset jäävät epäjohdonmukaista johtuen heterogeenisuus syövän alatyypin, rajallinen otoskoko, ja erot etnisen potilaista. Paremmin arvioida yhdistys miR-146a rs2910164, miR-196a2 rs11614913, miR-499 rs3746444, miR-149 rs2292832, ja miR-27a rs895919 että miRNA geenien syöpäriskiä, ​​teimme meta-analyysi kaikista hyväksyttävistä julkaistu tapaus -Säätimet tutkimukset ja arvioidaan vaikutus viiden SNP yleiseen syöpäriskiä. Vaikutukset kasvaimen tyyppi, etnisyys, lähde valvonta, ja otoksen koko arvioitiin myös.

Materiaalit ja menetelmät

Julkaisut Haku

tunnistaa kaikki mahdollisesti oikeutettuja tutkimuksia miRNA polymorfismit ja syövän riskiä, ​​voimme suorittaa systemaattisen haun PubMed, Web of Science, Science Direct, ja EMBASE, joka kattaa kaikki paperit julkaistut 30. kesäkuuta 2013 käyttämällä hakua termejä: ”microRNA 146a /196a2 /499/149 /27a ”,” mir-146a /196a2 /499 /27a ”,” polymorfismi ”, ja” syöpä ”. Viitteet noudetun artikkeleita ja katsaukset seulottiin myös. Hyväksyttävät tutkimukset oli täytettävä kaikki seuraavat kriteerit: (a) koko teksti tutkimuksessa (b) arviointi yhdistyksen välillä miRNA polymorfismien ja syövän riskiä, ​​(c) jotka eivät liity tapaus-verrokki suunnittelu, ja (d) riittävät tiedot arvioimiseksi kertoimet suhde (OR), jossa 95%: n luottamusväli (CI) ja

P

-arvo. Tutkimukset, jotka sisältävät kaksi tai useampia asia- hallita ryhmiä pidetään kahta tai useampaa erillistä tutkimuksiin.

Data Extraction

Kaksi tutkijat itsenäisesti uudelleen ja uutetaan tiedot kaikista julkaisuista, jotka täyttivät kriteerit. Kun kyseessä on ristiriita, päästyä keskustelemalla kahden arvioijat. Seuraavat tiedot haettiin kustakin julkaisu: ensin tekijän sukunimi, julkaisuvuosi, alkuperämaan, etnisyyden, syöpä tyyppi, genotyypitysmenetelmää, lähde ohjaus ryhmien määrä tapauksia ja säädöt kaikille genotyypin.

Statistical analyysi

ensin arvioitiin lähdön taajuudet miRNA polymorfismien välillä odotus alle Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) tutkimusta varten käyttämällä hyvyys fit testi (chi-neliö tai Fisherin tarkka testi) kontrolleissa . Raakaöljy TAI vastaa 95%: n luottamusväli käytettiin arvioimaan vahvuus yhdistyksen välillä miRNA polymorfismien ja syöpäriski menetelmien mukaisesti julkaiseman Woolf

et al

[29]. Tilastollinen merkitys pooliin OR määritettiin Z-testi, ja

P

-arvo 0,05 katsottiin tilastollisesti merkitsevä. Sillä

miR-146a

G /C, tutkimme yhdistyksen välillä perimä ja syöpäriskin alleelinen sijaan (C vs. G), homotsygoottinen vertailuja (CC vs. GG), heterotsygoottinen vertailuja (GC vs. GG ), hallitseva malli (CC + GC vs. GG) ja resessiivinen mallit (CC vs. GC + GG), tässä järjestyksessä. Samaa menetelmää voidaan hahmottaa muita polymorfismien. Alaryhmäanalyyseissa suoritettiin myös etnisyys (valkoihoinen ja Aasian), syöpätyyppejä (jos syöpä tyyppi oli vain yksi yksittäinen tutkimus se yhdistettiin muihin syövän alaryhmiin), lähde ohjaus (väestöpohjainen ja sairaala-pohjainen), ja näyte koko (pieni näyte: kokonaismäärä valvonnan ja tapauksista alle 1000, suuri näyte: kokonaismäärä valvontaa ja tapauksissa vähintään 1000).

Statistical heterogeenisuus välillä tutkimuksissa tarkastettiin Cocharan n chi-neliö Based Q-testi [30]. Koska Q testi oli herkkä silloin tutkimukset olivat pieniä tai muutaman,

I

2

laskettiin myös, mikä edustaa prosenttiosuus kaikista vaihtelua eri tutkimuksissa ja antaa tuloksena heterogeenisyys sijaan mahdollisuus. Jos

P

-arvo heterogeenisyyden oli 0,05, tai jos

I

2

oli ≥50%, mikä osoittaa huomattavaa heterogeenisuus tutkimuksia, sitten random-vaikutus mallia käyttäen Dersimonian ja Laird menetelmä [31], joka tuotti laajempi CI, valittiin laskemiseksi yhdistettyä OR; muuten kiinteän vaikutuksen mallia käyttäen Mantel-Haenszel menetelmä [32] käytettiin. Yksisuuntainen herkkyys analyysit suoritettiin arvioimaan vakautta meta-analyysin tulokset [33]. Mahdolliset julkaisu bias arvioitiin käyttämällä Egger n lineaarisen regression testi silmämääräinen tarkastus Funnel juoni.

P

arvo 0,05 käytettiin tiedot mahdollisista julkaisun bias [34]. Kaikki tilastolliset analyysit tehtiin kanssa STATA ohjelmistopaketti versio 10.0 (Stata Corporation, College Station, TX).

Tulokset

Tutkimus tunnistaminen

Yhteensä 66 julkaistuja artikkeleita [15] – [20], [22] – [28], [35] – [87] (taulukko 1), jossa on 127 vertailuja, tunnistettiin kirjallisuudesta eri yhdistelmiä keskeiset käsitteet ja valittiin perustuvat sisällyttämisestä kriteerit (kuvio 1). Aikana tiedon louhinta, 85 pois 151 artikkelia jätettiin, mukaan lukien 34 artikkeleita meta-analyysi, 35 artikkeleita, jotka eivät olleet syövästä, 12 artikkeleita, jotka koskivat syövän ennustetta, 1 artikkeli, joka toimitti puutteellisia polymorfismi jakaumatiedot ja 3 artikkeleita, jotka puuttui koko tekstin. Kaksi artikkelia [41], [80], joka ei tarjoa jakamisesta kaikkien kolmen genotyyppiä yksityiskohtaisesti, mutta esitti genotyypit CC + GC ja GG olivat vielä pidettiin analyysimme. Kahdessa tutkimuksessa [70], [85], genotyyppi taajuudet esiteltiin erikseen mukaan alkuperämaan tutkimuksen aiheita, ja täten kukin näistä tutkimuksista käsiteltiin erillisenä tutkimuksena. Lisäksi Zhang

et al.

[46] tutki kaksi syöpätyypit yhdessä tutkimuksessa. Jokainen syöpätyyppi tässä artikkelissa pidettiin erikseen meta-analyysissä.

Kaiken 47, 38, 21, 12, ja 9 tutkimukset yhdistettiin meta-analyysi rs2910164, rs11614913, rs3746444, rs2292832, ja rs895919, vastaavasti. Kaikista sisällytit oli 11 artikkeleita maksasyövän ja rintasyövän kukin, 8 tutkimukset mahalaukun ja paksusuolen ja peräsuolen syövän kukin, 5 Tutkimuksia levyepiteelisyövän pään ja kaulan (SCCHN) induktiohoitoon 4 tutkimuksia keuhkosyöpä, 3 tutkimuksia virtsarakon syövän ja ruokatorven okasolusyöpä (ESCC) kukin, 2 tutkimuksia eturauhassyöpä, gliooma syöpä, munuaissyövän, papillaarinen kilpirauhassyövän (PTC) ja kohdunkaulan syöpä kumpikin, ja 1 tutkimus kukin sappirakon syöpä, pahanlaatuinen melanooma ja rintojen /munasarjasyöpä. Etnistä taustaa tutkimushenkilöt 42 tutkimuksissa ja 24 tutkimukset olivat Aasian ja Kaukasian, vastaavasti. Kontrollit 37 tutkimuksista tuli sairaalan johdolla väestöstä, kun taas 25-tutkimuksessa oli väestöön perustuvia tarkastuksia. Yhdessä tutkimuksessa sekä väestöpohjainen ja sairaala-pohjainen valvonta [83], kun taas kolme tutkimusta puuttui tietoa ohjauslähteen [36], [39], [61]. Määrittää SNP, useita genotyypin menetelmiä käytettiin mukaan lukien polymeraasiketjureaktio-restriktiofragmentin pituuspolymorfismi (PCR-RFLP), TaqMan-määritys, SNPlex, SnuPE Pitoisuus, korkean resoluution sulamisanalyysikokeita (HRMA), polymeraasiketjureaktio-ligaa- detektioreaktiossa ( PCR-LDR), suoralla sekvensoinnilla, SNaPshot, Sequenom n MassARRAY, fluoresenssi leimattujen hybridisaatio- (PCR-FRET), polymeraasiketjureaktio vastatusten kaksi paria alukkeita (PCR-CTTP), Illumina n GoldenGate, aluke otettiin rajoitus analyysi- polymeraasiketjureaktio (PIRA -PCR) ja Tm-shift alleelispesifisillä genotyypitys. Genotyyppisen jakelu useimmissa tutkituissa SNP oli samaa mieltä HWE (

P

0,05) kontrolleihin.

Quantitative Synthesis

miR-146a rs2910164.

miR-146a rs2910164 polymorfismi, tutkimuksemme sisälsi 47 vertailuja 22055 tapauksia ja 29138 valvontaa. Taajuus rs2910164 C alleeli oli huomattavasti suurempi edustus Aasian väestöstä verrattuna valkoihoinen väestö (Asian: 54,3%, 95% CI = 49,1-59,4%, valkoihoinen: 24,2%, 95% CI = 22,9-25,4%;

P

0,001).

tulokset meta-analyysi rs2910164 ja syöpäriskiä on esitetty taulukossa 2. Kaiken kaikkiaan mitään merkittävää assosioitunut rs2910164 ja syövän riskiä missään geneettinen malli kun kaikki voivat tutkimukset yhdistettiin osaksi meta-analyysi. Sen jälkeen poissulkeminen neljä tutkimusta [15], [36], [58], [70], jonka genotyypin jakaumat verrokeilla eivät kanssa HWE, tulokset eivät merkittävästi muutu.

Kuitenkin , että kerrostunut analyysin syöpä tyyppi, C-alleeli CC genotyyppi rs2910164 havaittiin liittyvän käänteinen riski virtsarakon syöpään kaikissa geneettinen mallit, lukuun ottamatta väistyvä malli (C vs. G: OR = 0,838, 95 % CI = 0,762-0,921,

P

H = 0,324; CC vs. GG: OR = 0,724, 95% CI = +0,587-,893,

P

H = 0,241; GC vs. GG: OR = 0,789, 95% CI = 0,689-0,904,

P

H = 0,526; CC + GC vs. GG: OR = 0,781, 95% CI = 0.687- 0,889,

P

H 0,290), kohdunkaulan syöpä kaikissa geneettinen mallit (C vs. G: OR = 0,719, 95% CI = +0,620-0,839,

P

H = 0,796; CC vs. GG: OR = 0,503, 95% CI = 0,370-0,684,

P

H = 0,814; GC vs. GG: OR = 0,721, 95% luottamusväli = +0,545-+0,953,

P

H = 0,254; CC + GC vs. GG: OR = 0,632, 95% CI = 0,485-0,823,

P

H = 0,382 ; CC vs. GC + GG: OR = 0,654, 95% CI = ,520-+0,822,

P

H = 0,359), peräsuolen syöpä alle alleeliset sijaan heterotsygoottinen vertailu ja hallitseva malli (C vs. G: OR = 0,912, 95% CI = +0,833-0,999,

P

H = 0,324; GC vs. GG: OR = 0,854, 95% CI = +0,740-+0,985,

P

H = 0,376; CC + GC vs. GG: OR = 0,859, 95% CI = 0,750-0,984,

P

H = 0,294) ja eturauhassyöpää alle alleeliset kontrastia ja homotsygootti vertailu (C vs. G: OR = 0,801, 95% CI = +0,660-,971,

P

H = 0,200; CC vs. GG: OR = 0,565, 95% CI = 0,354-0,900,

P

H = 0,234). Lisäksi rs2910164 todettiin liittyvän riskejä PTC ja SCCHN in heterozygoottiset verrattuna (CC + GC vs. GG: OR = 1,189, 95% CI = 1,009-1,402,

P

H = 0,164) ja hallitseva malli (GC vs. GG: OR = 1,147, 95% CI = 1,003-1,311,

P

H = 0,366). Kuitenkin suunta syrjäisimpien kahden syöpien oli päinvastainen kuin entisen neljän syöpiä.

Kun kerrostunut analyysi suoritettiin etnistä tutkimusväestöstä, rs2910164 C-alleeli CC genotyyppi osoitettiin liittyvän huomattavia vähennys syöpäriski aasialaisilla kaikissa geneettinen malleissa. Päinvastoin, valkoihoinen C tai CC kantajia olivat alttiimpia syövät kaikissa geneettinen mallit, lukuun heterotsygoottianalyysiin vertailua. Edelleen alaryhmäanalyysissä paljasti C-alleeli tai CC-genotyyppi liittyvän vähentynyt syöpäriskin tutkimuksissa sairaalassa perustuvan tutkimuksen suunnittelu kaikki geneettiset malleja, mutta ei tutkimuksissa väestöpohjainen tutkimus suunnitteluun. Kun kerrostunut perusteella otoskoko, CC genotyyppi vaikutus oli vähentynyt syöpäriski pieni koko alaryhmään verrattuna GG genotyypin tai G-alleelin kantajia.

miR-196a2 rs11614913.

miR-196a2 rs11614913 polymorfismi analysoitiin 38 vertailuja 16414 tapauksia ja 19465 valvontaa. Havaitsimme myös laaja vaihtelu T-alleelin frekvenssi eri etnisten ryhmien (Asian: 49,8%, 95% CI = 45,3% -54,3%, valkoihoinen: 38,8%, 95% CI = 35,9% -41,7%;

P =

0,002).

taulukossa 3 esitetään yhteenveto tuloksista meta-analyysi miR-196a2 rs11614913 ja syöpäriskiä. Vuonna yleisanalyysi löysimme merkitsevästi yhteydessä rs11614913 ja vähentää syöpäriskiä alleelinen kontrasti (OR = 0,949, 95% CI = +0,902-+0,998,

P

H 0,001), homotsygootti vertailu (OR = 0,861, 95% CI = 0,772-0,959

P

H 0,001) ja väistyvä malli (OR = 0,865, 95% CI = 0,802-0,934,

P

H = 0,002). Poistaminen neljä tutkimusta genotyypin taajuudet kontrolleissa, jotka poikkesivat HWE ei muuttanut yhdistetyissä tuloksissa [15], [43], [53], [62].

alaryhmäanalyysi syöpä tyyppi, merkitsevästi yhteydessä rs11614913 ja laski syöpäriski todettiin keuhkosyöpä (T vs. C: OR = 0,893, 95% CI = +0,821-+0,971,

P

H = 0,149; TT vs. CC: OR = 0,794, 95% CI = 0,627-0,938,

P

H = 0,259; TT vs. CT + CC: OR = 0,842, 95% CI = 0,737-0,962,

P

H = 0,201) ja peräsuolen syöpä (TT vs. CC: OR = 0,754, 95% CI = 0,627-0,907,

P

H = 0,108; TT + CT vs. CC : OR = 0,848, 95% CI = ,735-,979,

P

H = 0,082; TT vs. CT + CC: OR = 0,838, 95% CI = +0,721-,974,

P

H = 0,165). Maksasyövän, T-alleelin kantajia osoitti vähentynyt syöpäalttiutta verrattuna homozygoottisia CC (OR = 0,859, 95% CI = +0,748-+0,986,

P

H = 0,334). Ei kuitenkaan assosioitunut rs11614913 ja virtsarakon syöpä, rintasyöpä, ESCC, mahasyöpä tai SCCHN.

etninen Alaryhmäanalyysissä, vahva assosioitunut rs11614913 ja syövän riski alleeliset vastoin homotsygootti vertailun ja väistyvä malli keskuudessa aasialaiset, kun taas negatiiviset tulokset saatiin valkoihoiset kaikki geneettiset malleissa. Suhteen Ohjauslähteen laski riski havaittiin sekä sairaala- ja väestöpohjainen hallintalaitteet homotsygootti vertailua ja väistyvä malli. Olemme myös löytäneet pienempi riski alleelinen kontrastin sairaalassa perustuvat tutkimukset. In ositettu analyysi otoskoko, merkittävä yhdistys laski syöpäriskin havaittiin molemmissa alaryhmissä.

miR-499 rs3746444.

miR-499 rs3746444, 21 vertailuja 8888 tapauksia ja 10292 kontrollia sisällytettiin. Ei ole merkittävää eroa C-alleelin frekvenssi välillä aasialaiset ja valkoihoiset havaittiin (Asian: 22,2%, 95% CI = 16,7% -27,7%; valkoihoinen: 29,9%, 95% CI = 14,4% -45,4%;

P =

0,178).

tulokset meta-analyysi miR-499 rs3746444 ja syöpäriskiä on esitetty taulukossa 4. Kaiken havaitsimme, että rs3746444 saattaa vähentää syöpäriskiä alleelinen kontrasti ( OR = 1.106, 95% CI = 1,005-1,218,

P

H 0,001) ja hallitseva malli (OR = 1,148, 95% CI = 1,020-1,292,

P

H 0,001). Kuitenkin tämä yhdistys katosi poissulkeminen kuudessa tutkimuksessa [15], [35], [40], [52], [62], [80], jonka genotyypin jakelu kontrolleissa oli peräisin HWE.

kerrostunut analyysi syövän tyypin, merkitseviä vasta yllä rintasyövän alle alleelinen kontrasti (OR = 1,101, 95% CI = 1,006-1,204,

P

H = 0,214), mutta ei ole merkittävää yhteyttä ei havaittu peräsuolen syöpä, keuhkosyöpä, maksasyöpä, SCCHN, ja muut syövät missään geneettistä mallia. Alaryhmäanalyysi etnisyys osoitti vähentynyt syöpäriskin Aasian väestöstä (TC vs. TT: OR = 1,234, 95% CI = 1,035-1,471,

P

H 0,001; TC + CC vs . TT: OR = 1,220, 95% CI = 1,032-1,442,

P

H 0,001), mutta ei Kaukasian väestöstä. Perustuen tutkimuksen suunnittelu, tutkimukset sairaala perustuvan valvonnan osoitti kohonnut (CC vs. TC + TT: OR = 1,224, 95% CI = 1,004-1,491,

P

H = 0,045). Kuitenkin tutkimukset väestöpohjainen kontrolleilla ei ollut merkittävää yhteyttä. Edelleen alaryhmäanalyysi otoskoko paljasti kasvanut syöpäriski vain pieni näyte ryhmä käyttäen hallitseva mallia (TC + ​​CC vs. TT: OR = 1,241, 95% CI = 1,038-1,485,

P

H 0,001).

miR-149 rs2292832.

kaksitoista vertailuja 5926 tapauksia ja 5961 tarkastuksia arvioitiin yhdistyksen välillä miR-149 rs2292832 polymorfismi ja syöpäriskiä. Taajuus T alleelin oli merkittävä korkeampi Aasian väestöstä verrattuna valkoihoisilla väestö (Asian: 65,1%, 95% CI = 53,2% -77,0%; valkoihoinen: 30,6%, 95% CI = 25,2% -36,0%;

P =

0,003).

Kaiken yksikään geneettisten mallien tuotti merkitsevästi yhteydessä rs2292832 ja syövän riskiä. Vastaavasti mitään positiivista tulosta havaittiin useimmissa alaryhmien, paitsi että homotsygoottinen TT vaikutti lisätä riskiä muiden syöpien verrattuna C-alleelin kantajia (OR = 1,388, 95% CI = 1,083-1,778,

P

H = 0,427) ja merkittävää yhteyttä lisääntynyt syöpäriskiä löytyi myös pieni näyte ryhmässä alleelinen kontrastin (OR = 1,106, 95% CI = 1,012-1,209,

P

H = 0,461) ja väistyvä malli (OR = 1,217, 95% CI = 1,078-1,373,

P

H = 0,380). Nämä tulokset on esitetty yhteenvetona taulukossa 5.

miR-27a rs895919.

miR-27a rs895919, keräsimme yhdeksän vertailuja 4662 tapauksissa ja 5625 valvontaa. Ei ole merkittävää eroa G-alleelin frekvenssi välillä aasialaiset ja valkoihoiset havaittiin (Asian: 32,4%, 95% CI = 21,2% -43,6%; valkoihoinen: 32,1%, 95% CI = 28,7% -35,6%;

P =

0,949).

kaiken ollut merkittävää yhteyttä havaittiin kaikissa vertailuissa. Kuitenkin Alaryhmäanalyysissa, alentunut riski havaittiin muissa syövissä (AG vs. AA: OR = 0,828, 95% CI = 0,698-0,982,

P

H = 0,030; GG + AG vs . AA: OR = 0,821, 95% CI = 0,698-0,966,

P

H = 0,017), suuri näyte ryhmät (G vs. V: OR = 0,875, 95% CI = 0,811-0,945

P

H = 0,001; AG vs. AA: OR = 0,806, 95% CI = +0,726-+0,895,

P

H 0,001; GG + AG vs. AA: OR = 0,815, 95% CI = 0,738-0,900,

P

H 0,001), valkoihoisesta väestöstä (AG vs. AA: OR = 0,879, 95% CI = 0,792 -0,975,

P

H = 0,015) ja väestön perustuvat tutkimukset (G vs. V: OR = 0,900, 95% CI = 0,830-0,975,

P

H = 0,010) (taulukko 6).

testaus heterogeenisuus

heterogeenisyys välillä tutkimuksissa havaittiin yleistä vertailuja ja alaryhmäanalyyseissa poikki tutkimukset rs2910164, rs11614913, rs3746444, ja rs895919 . Sitten arvioitiin lähde heterogeenisyys varten alleelinen kontrastia syöpätyypin, etnisyys, lähde valvonnan ja otoskoko. Sillä rs2910164, syöpätyypin (= 51,58, df = 11,

P

0,001), kansallisuus (= 24,43, df = 1,

P

0,001) ja valvonta tyyppi (= 29.55, df = 3,

P

0,001) ovat mahdollisia lähteitä Tutkimusten välisten heterogeenisuus. Sillä rs11614913, syöpätyypin (= 17,84, df = 8,

P =

0,002) ja ohjaustyypin (= 13,08, df = 3,

P =

0,004) havaittiin edistää merkittävällä heterogeenisyys. Sillä rs3746444, etnisyyden (= 4,92, df = 1,

P =

0,027) ja otoskoko (= 4,6, df = 1,

P =

0,032) edistäneet merkittävästi heterogeenisuus. Mir-27a rs895919, otoskoko (= 5,74, df = 1,

P =

0,017) oli pääasiallinen lähde Tutkimusten välisten heterogeenisuus.

Herkkyysanalyysi

Influence kukin tutkimus mukana meta-analyysi yhdistettyjen syrjäisimmille alueille kunkin tutkittu SNP tutkittiin toistamalla meta-analyysi ja jättämällä kunkin tutkimuksen yksi kerrallaan. Vastaavien yhdistettyjen syrjäisimpien ei olennaisesti muuttunut.

Julkaisu Bias

Olemme suorittaneet Begg n suppilo juoni ja Egger testi arvioida julkaisun bias mukana tutkimuksissa kaikkien SNP. Mir-146a rs2910164 (kuva S1), miR-196a2 rs11614913 (kuva S2) ja miR-499 rs3746444 (kuva S3), mitään todisteita julkaisun bias ehdotettiin saatujen tulosten Begg n suppilo juoni ja Egger n testi alleeliset kontrastia. Samanlaisia ​​tuloksia havaittiin muissa malleissa (tuloksia ei ole esitetty). Kuitenkin miR-149 rs2292832 (kuva S4), merkittävä julkaisu bias todettiin alleelinen sijaan (

P

= 0,006), homotsygoottinen vertailu (

P

= 0,005) ja resessiivinen malli (

P

= 0,007). Mir-27a rs895919 (kuva S5), mitään todisteita julkaisun bias havaittiin varten alleelinen vastoin mutta julkaisu bias löydettiin heterozygoottiset verrattuna (

P

= 0,039), mikä johtui todennäköisesti pieni määrä mukana tutkimuksissa.

keskustelu

Tässä tutkimuksessa, teimme viisi riippumatonta meta-analyysit tutkimaan yhdistyksen välillä syöpäriskiä ja polymorfismit miRNA (miR-146a rs2910164, miR-196a2 rs11614913, miR -499 rs3746444, miR-149 rs2292832, ja miR-27a rs895919). Tulokset osoittivat, että rs2910164 C-alleeli tai CC-genotyyppi, oli suojaava tekijä virtsarakon syövän, eturauhassyövän, kohdunkaulan syöpä ja paksusuolen ja peräsuolen syöpä, mutta riskitekijä PTC ja SCCHN. Merkittävä assosiaatio rs2910164 ja syövän riski havaittiin sekä aasialaiset ja valkoihoiset, vaikka vastakkaisiin suuntiin. MIR-196a2 rs11614913 T-alleelin havaittiin olevan merkitsevästi yhteydessä alentuneeseen syöpäriski, erityisesti keuhkosyövän ja paksusuolen ja peräsuolen syövän, erityisesti Aasian väestöstä. MIR-499 rs3746444 C-alleelin lisääntynyt syöpäriskin alleelinen kontrastia mallia ja hallitseva malli, erityisesti rintasyövän. Kuitenkin tämä yhdistys havaittu vain aasialaiset, ei valkoihoisilla. Toisaalta, mir-149 rs2292832 ja miR-27a rs895919 eivät olleet merkitsevästi yhteydessä syöpään alttiuteen.

Useat meta-analyysit on tehty yhdelle miRNA SNP [88] – [110] tai useamman miRNA SNP [21], [111] – [120] liittyy syöpäriskiä (s). Kuitenkaan mikään meta-analyysit ovat kattavasti kaikki tutkimukset tietyllä miRNA SNP tai kaikki yleisesti tutkittu miRNA SNP. Tässä tutkimuksessa olemme mukana kaikki julkaistuista tasalla viisi useimmin tutkittu miRNA SNP liittyy syövän alttius, ja näin sisällyttää enemmän tutkimuksia ja syöpätyyppien kuin aiemmin julkaistu meta-analyysit. Esimerkiksi verrattuna äskettäin julkaistun meta-analyysin Hän

et al

. [112], meidän paperi sisällytetään useita uusia tutkimuksia kullekin miRNA SNP. Mir-146a rs2910164, 19 uusia tutkimuksia lisättiin; Mir-196a rs11614913, 11 uusia tutkimuksia lisättiin; Mir-499 rs3746444, 6 uusia tutkimuksia lisättiin; ja mir-149 rs2292832, 5 uusia tutkimuksia lisättiin. Lisäksi olemme analysoineet 9 tapausverrokkitutkimukset Mir-27a rs895919, jotka eivät sisälly meta-analyysin Hän

et al

. [112]. Niinpä parhaan tietomme mukaan tässä tutkimuksessa on kattavin ja vankka meta-analyysissä verrattuna aiemmin julkaistu meta-analyysit tällä alalla [21], [88] – [120].

rs2910164 (miR-146a) lokuksen sijaitsee asemassa +60 suhteessa ensimmäisen nukleotidin pre-miR-146a-geenin. Tämä polymorfismi esittelee muutosta G: stä C: matkustamon lohkon, jolloin muutos G: U parikytkeytymään C: U epäsuhta varren rakenteen miR-146a esiaste [17]. C-alleeliset miR-146a esiasteen pienempi transkriptionaalinen aktiivisuus kuin G-alleelin alentuneeseen ydinaseiden primiR-146a käsittelyn tehokkuutta; Tämä johtaa alhainen kypsän miR-146A ja vaikuttaa kohde-mRNA sitova [84], [85]. Vähentynyt määrä miR-146a vähentää eston kohdegeenien mukana Toll-kaltainen reseptori ja sytokiinien signalointireitin (TRAF6, IRAK1) ja heikentynyt tumatekijä (NF) -κB aktiivisuus [85], [121]. Tutkimukset ovat osoittaneet, että miR-146a on tärkeä rooli solujen lisääntymisen ja metastaattinen kyky joidenkin syöpien ja että sen vapauttaminen on mahdollisesti osallisena karsinogeneesissä [84], [85], [121] – [123]. Kuitenkin meta-analyysin tulokset viittasivat ole merkittävää yhdistyksen välillä tämän polymorfismin ja syöpäalttiutta yleisessä yhdistetyssä tuloksen. Kun kyseessä on alaryhmäanalyysissä jaettuna syövän tyypistä, rs2910164 C-alleeli, joka liittyy alentuneeseen virtsarakon syöpä, kohdunkaulan syöpä, peräsuolen syöpä ja eturauhassyöpä, mutta lisääntynyt riski PTC ja SCCHN. Toisin kuin aiemmin julkaistu tulokset Hän

et al

. [112], ei merkittävää assosioitunut rs2910164 ja HCC tai ESCC. Nämä tulokset viittaavat siihen, että assosiaatiota miR-146a rs2910164 polymorfismi ja syöpäalttiutta oli syöpä-tyyppiriippuvainen. Mahdollinen selitys tälle ilmiölle voi olla, että erilaiset syövät ovat erilaiset synnyssä. Lisäksi olemme havainneet, että yhdistyksen välillä rs2910164 polymorfismin ja syövän riski oli etnisyys riippuvainen, kuten tukemana Wang

et al.

[88]. Tämä saattaa johtua siitä, että ero geneettiset taustat rotujen johtuu alleelin taajuus tai eri karsinogeenisia mekanismit kasvain sivustoja; toinen mahdollisuus voi olla, että polymorfismi voi olla kytkentäepätasapainossa kanssa syy variantti [124]. Toisin kuin meidän tuloksia, hän

et

al

. [112] ei havaittu yhteyttä tämän polymorfismin ja syöpäriskiä valkoihoisilla.

MiR-196a2 koostuu kahdesta eri kypsän miRNA (miR-196a-5P ja miR-196a-3P), jotka on jalostettu sama varsi-silmukka [125]. rs11614913, joka sijaitsee kypsän sekvenssin miR-196a-3P, voisi vaikuttaa tuotannon tasoa kypsän miR-196a ja voi vaikuttaa ilmaus sen kohdegeenin.