Krooninen sairaus

tiivistelmä

Background

Useat genomin laajuinen yhdistys tutkimukset keuhkosyöpä (LC ) ovat raportoineet samanlaisia ​​havaintoja uuden herkkyyden lokuksen, 3q28. Sen jälkeen, useissa tutkimuksissa on raportoitu, että rs10937405, ja rs4488809 polymorfismi kromosomissa 3q28 on liitetty LC riskiä. Kuitenkin tutkimukset ovat tuottaneet ristiriitaisia ​​tuloksia.

Methods

PubMed, ISI Web of Science, EMBASE ja Kiinan kansallisen Knowledge Infrastructure tietokannoista systemaattisesti etsitään tunnistavat sellaiset tutkimukset. Aineisto otetun itsenäisesti kaksi arvioijat. Meta-analyysi tehtiin tutkia yhdistyksen välillä rs10937405, rs4488809 polymorfismi 3q28 ja alttius LC. Kertoimet suhde (syrjäisimmillä alueilla) ja 95%: n luottamusväli (95% CI) laskettiin. Heterogeenisyys ja julkaisu bias testattiin myös.

Tulokset

yhteensä 9 tutkimusten mukaan lukien 35961 LC tapauksissa ja 57790 kontrolleja mukana tässä meta-analyysi. Yleistä random-vaikutukset per-alleelin OR of1.19 (95% CI: 1,14-1,25; P 10

-5) ja 1,19 (95% CI: 1,13-1,25; P 10

-5) havaittiin, että rs10937405 ja rs4488809 polymorfismi vastaavasti. Samanlaisia ​​tuloksia havaittiin myös käyttämällä hallitseva tai resessiivinen geneettinen malli. Sen jälkeen stratifioitu etnisyys, merkitseviä oli seassa Itäaasialaiset (per-alleeli OR = 1,22, 95% CI: 1,17-1,27; P 10

-5); kun taas mitään merkittävää yhdistysten löytynyt valkoihoisilla varten rs10937405. Vuonna alaryhmä analyysi otoskoko, merkittävästi lisääntyneitä riskejä havaittiin näiden polymorfismien kaikki geneettiset malleissa. Kun analysoidaan mukaan histologinen tyyppi, vaikutukset rs10937405, ja rs4488809 klo 3q28 riskiin sairastua keuhkosyöpään olivat merkittäviä lähinnä keuhkoadenokarsinooma.

Johtopäätökset

havainnot osoittivat, että rs10937405-G-alleelin ja rs4488809-G-alleelin ehkä riski antavia tekijöitä kehittämiseen keuhkosyövän, erityisesti Itä-Aasian väestölle.

Citation: Zhang L, Wang XF, Ma YS, Xia Q, Zhang F, Fu D, et ai. (2014) kvantitatiivinen arviointi vaikutus TP63 geenipolymorfismien ja Lung Cancer Risk: Evidence Perustuu 93751 aiheet. PLoS ONE 9 (1): e87004. doi: 10,1371 /journal.pone.0087004

Editor: John Souglakos, University General Hospital Heraklionin ja laboratorio kasvain solubiologian, School of Medicine, University of Kreeta, Kreikka

vastaanotettu: lokakuu 2, 2013; Hyväksytty: 16 joulukuu 2013; Julkaistu: 23 tammikuu 2014

Copyright: © 2014 Zhang et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: National Natural Science Foundation of China (81201535, 81302065), tiedon Innovation Program Shanghai Institutes for Biological Sciences, Kiinan tiedeakatemia (2012KIP203) ja Shanghai Natural Science Foundation (12ZR1436000). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

Keuhkosyöpä (LC) on yleisin maligniteetti ja johtava syy syövän kuoleman maailmanlaajuisesti, arviolta 5 vuoden pysyvyys oli 15% [1]. Eri histologinen muodot LC jaetaan tyypillisesti pienisoluinen keuhkosyöpä (SCLC) ja ei-pienisoluinen keuhkosyöpä (NSCLC), joka käsittää adenokarsinooma ja squamous kasvaimia. Kukin LC tyypit on erilainen kliinis ominaisuudet heijastavat eroja syövän synnyn [2]. Huolimatta paljon tutkinnan syitä ei vielä täysin ymmärretä. Epidemiologiset todisteet osoittavat, että altistuminen tupakansavulle liittyvä karsinogeenien on selvästi sekaantunut sen etiologiassa [3]. Kuitenkin on myös raportoitu, että vain 20% tupakoitsijoista kehittyy LC, mikä viittaa siihen, että geneettiset variaatiot ja muut ympäristötekijät myös tärkeä rooli määritettäessä yksilöllisiä eroja LC alttiuteen [4], [5].

äskettäin näyttäviä ennakko tehtiin tunnistamisessa alttiita geenien LC kautta genomin laajuinen yhdistys strategia (GWAS). Genomialuetta kromosomeja 15q25.1 (CHRNA5, CHRNA3 ja CHRNA4) [6] – [8], 5p15.33 (tert- CLPTM1L) [9], [10] ja 6p21.33 (BAT3-MSH5) [9] on todettu olevan yhteydessä alttiuteen LC GWAS populaatioissa eurooppalaista syntyperää. Kuitenkin tutkimukset ovat myös osoittaneet läsnäolo geneettinen heterogeenisyys LC alttius populaatioiden välillä eurooppalaista syntyperää ja aasialaiset [6] – [8]. Tuore GWAS keuhkojen adenokarsinooma riski Japanin ja Korean väestön tunnistettu uusi lokuksen, 3q28 (TP63) [11]. Myöhemmin merkittävä mutta heikompi yhdistys 3q28 vaihtelut keuhkoadenokarsinooma riski oli validoitu eurooppalaiset [12]. Tähän mennessä monet tapausverrokkitutkimukset on suorittaa roolin tutkimiseksi TP63 klo 3q28 polymorfismi geneettinen alttius LC keskuudessa eri populaatioissa. Geneettiset yhdistys tutkimukset voivat olla ongelmallista jäljentää riittämättömän tehon, useita hypoteesin testaukseen, väestö kerrostuneisuus, lähde hallintalaitteiden, julkaisu bias, ja fenotyyppinen heterogeenisyys. Siksi toteutimme kattavan meta-analyysi kaikki voivat tutkimuksia, joissa arvioidaan yleinen LC riski 3q28 polymorfismin sekä määrällisesti Tutkimusten välisten heterogeenisuus ja mahdollinen harha.

Materiaalit ja menetelmät

Literature Etsi strategia

Genetic assosiaatiotutkimuksiin julkaistu ennen lokakuun loppua 2013 LC ja polymorfismien sisällä kromosomin 3q28 tunnistettiin etsimään PubMed, Web of Science, EMBASE, ja CNKI (Kiinan kansallisen Knowledge Infrastructure) ilman kielirajoituksia. Hakusana yhdistelmät olivat avainsanoja, jotka liittyvät kromosomiin 3q28 (esim, ”3q28”, ”rs10937405”, ”rs4488809”, ”tp63”) yhdessä liittyviä sanoja LC (esim, keuhkosyöpä ”tai” keuhkokarsinooma ”tai” pahanlaatuinen keuhkojen kasvain). Lisäksi tutkimukset tunnistettiin manuaalisesti etsimään viiteluetteloihin katsauksissa ja noudetaan tutkimuksia. Kaikki tutkimukset arvioitava huolellisesti tunnistaa päällekkäiset tiedot. Määritysperusteet päällekkäiset tiedot sisältyvät tutkimuksen aikana, sairaala, hoito tiedotus ja muita kriteerit.

hyväksyttävät tutkimukset ja Data Extraction

sisältävät asiaankuuluvat tutkimukset tähän meta-analyysissä, seuraavat kriteerit käytettiin: (1) tapaus-kontrolli tai kohorttitutkimuksessa, (2) arvioida yhdistyksen välillä 3q28 polymorfismien ja LC riski, (3) tunnistaminen LC tapauksissa vahvistettiin histologisesti tai patologisesti, ja (4) antaa riittävät tiedot laskea kertoimet (OR), jossa on 95 luottamusväli (CI) ja P-arvo. Tärkeimmät syyt sulkeminen tutkimukset olivat (1) päällekkäin tiedot, (2) tapauksessa vain tutkimuksia, (3) perhe-perustuvat tutkimukset ja katsaus artikkeleita. Jos useampi kuin yksi artikkeli käyttäen samoja tietoja julkaistiin ainoastaan ​​tutkimuksessa suurin aineisto sisällytettiin meta-analyysissä.

Kaksi tutkijat uutettu tietoja kaikilta oikeutettuja julkaisuista itsenäisesti mukaan pääsyn kriteerit yllä. Ristiriitaisia ​​arviointi, sovittiin seuraava keskustelun kaikkien tekijöille. Jokaisessa tutkimuksessa on seuraavat ominaisuudet kerättiin: ensin tekijän nimi, julkaisuvuosi, etnisyyden, tunnistaminen syöpätapauksista, histologinen tyyppi, ikä, sukupuoli, tupakointi (tupakoimattomia tai koskaan tupakoitsijoita), lähde ohjaus ryhmien (väestöpohjainen valvonta ja sairaala-pohjainen valvonta), matching tekijät, Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) tila kontrollien joukossa, tapausten määrä ja valvonnan, genotyyppi taajuus ja genotyypitysmenetelmiä. Tutkimuksia varten myös aiheita eri etnisten ryhmien, tiedot poimittiin erikseen ja luokiteltu Itäaasialaiset ja valkoihoiset.

Laadunarviointi

assosiaatiotutkimuksiin epäyhtenäisiä tuloksia samalla polymorfismien, metodologinen laatu olisi arvioitava asianmukaisilla kriteerit riskin rajoittamiseksi käyttöön bias osaksi meta-analyysit tai järjestelmällistä arvioita. Menettely tunnetaan nimellä ”laajennettu laadun pisteet”, on kehitetty laadun arvioimiseksi assosiaatiotutkimuksilla. Menettely tulokset kunkin paperin luokittelemalla se olevan ”korkea”, ”mediaani” tai ”huonoksi” laatu. Yksityiskohtainen menettely laadun arviointi on aiemmin kuvattu [13].

tilastolliset menetelmät

Poikkeaminen HWE valvontaa tutkittiin χ

2 testiä. OR 95% CI avulla arvioitiin lujuuden välisen assosiaation 3q28 polymorfismien (rs10937405, ja rs4488809) ja LC riski. Per-alleelin tai riski alleelin arvioitiin. Sitten arvioidaan riskejä näiden polymorfismien LC alla hallitseva ja väistyvä geneettisiä malleja. Random-tehosteet ja kiinteän vaikutus yhteenveto toimenpiteitä laskettiin käänteinen-varianssi painotettu keskiarvo tukin riskisuhde. Tulokset random-vaikutusten yhteenveto raportoitu tekstiin, koska siinä otetaan huomioon vaihtelusta tutkimuksissa. Heterogeenisuus yksittäisissä tutkimuksissa laskettiin Cochran χ

2 perustuu Q testi ja I

2 testi seuraa tytäryhtiö analyysiä tai satunnaisotannalla-vaikutukset regressiomallien rajoitetusti suurimman uskottavuuden estimointi [14], [15]. Yleensä I

2 arvojen 25% vastaavat vähän tai ei ollenkaan heterogeenisyys, arvot 25-50% vastaavat kohtalainen heterogeenisyys, ja arvot 50% vastaavat vahva heterogeenisuus tutkimusten välillä. Lähteet heterogeenisyys tutkittiin ositettu meta-analyysit perustuvat etnisyyteen, ja otoskoko (nro tapauksissa ≥1000 tai 1000). Etninen ryhmä määriteltiin Itäaasialaiset (ts kiinalainen, japani ja korea), ja valkoihoisten (eli ihmiset eurooppalaista alkuperää). Lisäksi etnisyys, otoskoko, ikä, sukupuoli ja genotyypitysmenetelmää analysoitiin kovariantteja meta-regressio. Merkitys Yhdistettyjen OR määritettiin Z testi. Julkaisu bias arvioitiin kanssa Egger testi ja Begg testi [16], [17]. Herkkyysanalyysi suoritettiin poistamalla kunkin yksittäisen tutkimuksen vuorotellen kokonaismäärästä ja uudelleen analysointi loput. Analyysi tehtiin käyttäen Stata ohjelmistoversio 10.0 (Stata Corporation, College Station, TX). Kaikki P-arvot olivat kaksipuolista analyysiä ja arvot P 0,05 katsottiin tilastollisesti merkitsevä.

Tulokset

Ominaisuudet Studies

Perustuu hakustrategia, ensisijainen seulonta tuotti 97 mahdollisesti merkitystä artikkeleita. 88 artikkelia ulkopuolelle, koska he eivät selvästikään täytä mukaanottokriteerinä tai päällekkäisiä viittauksia. Kaikkiaan 9 tukikelpoisten tutkimusten [11], [12], [18] – [24] otettiin mukaan meta-analyysissä, johon 35961 LC tapauksissa ja 57790 valvontaa. Kirjallisuudessa valintaprosessi osoitti kuvassa S1. Niistä 23 aineistoja ei tiedetä olevan rs10937405 polymorfismi, mukaan lukien yhteensä 31109 tapausta ja 51999 valvontaa sekä rs4488809 polymorfismin 18 tietokokonaisuudet tunnistettiin kattaa yhteensä 19790 tapausta ja 26264 valvontaa. Genotyyppi jakaumat kontrolleissa kaikkien tutkimukset olivat yhdenmukaisia ​​HWE. Severn tutkimuksissa annettiin korkea laatu, ja kaksi tutkimusta annettiin mediaani laatua. Ei ”heikkolaatuisia” tutkimuksessa todettiin. Ominaisuudet tutkimusten sisälly nykyiseen meta-analyysi on esitetty taulukossa 1.

Association of rs10937405 polymorfismin keuhkosyöpä

Kaikkialla oli näyttöä yhdistyksen välillä suurentunut LC ja rs10937405 polymorfismin eri geneettisten mallien, kun kaikki voivat tutkimukset yhdistettiin osaksi meta-analyysi. Käyttäen satunnainen vaikutus mallissa yhteenveto per-alleelin tai että rs10937405 G variantin LC oli 1,19 [95% CI: 1,14-1,25, P (Z) 10

-5, P (Q) 10

-5; Kuva 1], jossa vastaaviin tuloksiin alla hallitseva ja väistyvä geneettisissä malleissa 1,27 [95% CI: 1,15-1,40, P (Z) 10

-5, P (Q) 10

-4] ja 1,25 [95% CI: 1,19-1,33, P (Z) 10

-5, P (Q) 10

-4], tässä järjestyksessä. Säätämisen jälkeen useita testejä käyttäen Bonferroni korjausta, kaikki merkittävät yhdistykset rs10937405 erilaisissa geneettisissä malleissa säilyi. Merkittävät heterogeenisuus oli läsnä joukossa 23 aineistoja (P 0,05). Meta-regressioanalyysi, ikä (P = 0,26), sukupuoli (P = 0,11), otoskoko (P = 0,06), ja genotyypitysmenetelmää (P = 0,78), ei merkittävästi selittää tällaista heterogeenisyys. Sen sijaan etnisyys (P = 0,001) korreloi merkitsevästi suuruuteen geneettinen vaikutus.

Kun tutkimuksia ositettu varten etnisyyden huomattavia riskejä oli seassa Itäaasialaiset kaikissa geneettinen malli [G-alleelin : OR = 1,22, 95% CI: 1,17-1,27; hallitseva malli: OR = 1,26, 95% CI: 1,13-1,38; väistyvä malli: OR = 1,28, 95% CI: 1,17-1,36]. Ei kuitenkaan ole merkittäviä tuloksia havaittiin valkoihoinen väestö [G-alleelin: OR = 1,07, 95% CI: 1,00-1,16; hallitseva malli: OR = 1,08, 95% CI: 0,99-1,21; väistyvä malli: OR = 1,10, 95% CI: 1,00-1,21]. Tytäryhtiö analyysit otoskoko saatiin per-alleelin tai pieniä tutkimuksia 1,27 [95% CI: 1,17-1,37, P (Z) 10

-5] ja suurille tutkimuksiin 1,16 [95% CI: 1,10 -1,22, P (Z) 10

-5; Taulukko 2].

alaryhmäanalyyseissa histologisia tyyppejä LC, huomasimme, että rs10937405 polymorfismi oli merkitsevästi yhteydessä keuhkoadenokarsinooma [G-alleelin: OR = 1,26, 95% CI: 1,21-1,30, P (Z) 10

-5] ja okasolusyöpä [G-alleelin: OR = 1,14, 95% CI: 1,06-1,22, P (Z) 10

-4], kun taas mitään merkittävää yhdistysten havaittiin pieniä cell carcinoma (taulukko 3). Olemme tutkineet suhde polymorfismin ja tunnetut ympäristön tupakan vastuita. Vaikutus ympäristön tupakansavulle oli samanlainen tupakoimattomia kanssa per-alleeli OR 1,27 (95% CI: 1,21-1,33) verrattuna koskaan tupakoitsijoita (OR = 1,26, 95% CI: 1,18-1,34). Lisäksi olemme ositettu mukana tutkimuksiin sukupuolen. Samoin tilastollisesti merkitseviä tuloksia havaittiin myös sekä miesten että naisten (taulukko 3).

Association of rs4488809 polymorfismin keuhkosyöpä

LC riskiä ja rs4488809 polymorfismi, meidän meta -analyysiohjelman antoi yleinen OR 1,19 (95% CI: 1,13-1,25, P 10

-5; kuva 2) tilastollisesti merkitsevä Tutkimusten välisten heterogeenisuus (P 10

-5). Runsaasti lisää LC riskit havaittiin myös käyttämällä hallitseva [OR = 1,24, 95% CI: 1,11-1,38, P (Z) 10

-5; P (Q) 10

-4] ja väistyvä malli [OR = 1,25, 95% CI: 1,14-1,37, P (Z) 10

-5; P (Q) = 0,01]. Koska kaikki mukana koskevat tutkimukset rs4488809 polymorfismi tehtiin Itä-Aasian populaatiot, me sitten suoritti alaryhmäanalyysi otoskoko. Vuonna ositettu analyysi otoskoko huomattavia riskejä oli seassa suurempia tutkimuksia kaikissa geneettinen malleissa (G-alleelin: OR = 1,24, 95% CI: 1,20-1,28, P 10

-5, hallitseva malli: OR = 1,39 , 95% CI: 1,31-1,48, P 10

-5; väistyvä malli: OR = 1,30, 95% CI: 1,22-1,37, P 10

-5) ilman merkittävää Tutkimusten välisten heterogeenisuus (P 10

-5] ei kuitenkaan ole merkittäviä järjestöjä havaittu okasolusyöpään tai pienisoluinen karsinooma (taulukko 3). Associations of polymorfismin kanssa LC riski havaittiin niin koskaan tupakoitsijoita ja tupakoimattomia ja sekä miesten ja naisten (taulukko 3).

meta-regressio, otoskoko (P = 0,02) selittyy suurelta osa heterogeenisyys, kun taas sukupuoli jakelu (P = 0,29), keski-ikä (P = 0,14), ja genotyypitysmenetelmää (P = 0,31) selitti vähän epäyhtenäisyys.

herkkyysanalyysi ja julkaiseminen Bias

yksi tutkimuksessa mukana meta-analyysissä poistettiin joka kerta heijastamaan yksittäisten tietojen asetettu yhdistettiin syrjäisimmille alueille, ja vastaavien yhdistettyjen syrjäisimpien ei laadullisesti muuttunut (Kuva S2 ja S3). Muoto suppilon tontteja oli symmetrinen näiden polymorfismien (kuva S4 ja S5). Tilastolliset tulokset eivät vieläkään näytä pienessä tutkimuksessa vaikutuksia näissä tutkimuksissa rs4488809 (Egger testi, P = 0,30) ja rs10937405 (Egger testi, P = 0,06).

Keskustelu

GWAS ovat johtaneet tunnistaminen useiden uusien geneettisiä variantteja liittyy keuhkosyövän riskiä. Useimmat näistä keuhkosyövän GWAS ja replikointi tutkimuksia on tehty Euroopan populaatiot [6] – [10] ja vähemmässä määrin Itäaasialaiset [11], [18], [19]. On kuitenkin olemassa merkittäviä eroja alleelifrekvenssit ja esiintyvyys keuhkosyövän eri populaatioissa. Sen vuoksi tärkeää arvioida määrällisesti vaikutuksia GWAS-tunnistettu markkereita eri etnisten väestöryhmien ja tutkia mahdollisia heterogeenisuus Julkaistujen tietojen. Meta-analyysi on keino lisätä otoskoko tutkittavana koottava yhteen tietoja yksittäisistä yhdistys tutkimuksista, mikä parantaa tilastollinen voima analyysin estimointijärjestelmässä geneettisiä vaikutuksia [25]. Tämä on ensimmäinen laaja meta-analyysi, joka on yhteensä 35961 tapausta ja 57790 säätimet 9 tapausverrokkitutkimukset, tutkimalla yhdistys kahden yhteisesti tutkittu polymorfismia 3q28 (rs10937405, ja rs4488809) keuhkosyöpään riskiä. Tuloksemme osoittivat, että rs10937405-G-alleelin, ja rs4488809-G-alleeli on riskitekijä sairastua keuhkosyöpään.

kerrostunut analyysi etnisyys, merkitseviä löytyivät Itäaasialaiset varten rs10937405 polymorfismi kaikki geneettiset mallit ; vaikka ei yhdistysten löytyivät valkoihoisista, mikä viittaa mahdolliseen rooliin etnisten geneettisen taustan eroista ja ympäristö he asuivat [26]. Itse asiassa, jakelun riskin G-alleelin vaihtelee laajasti eri rotuja, joiden esiintyvyys -70% joukossa Itäaasialaiset [19] – [22], ja noin 55% valkoihoisilla [12], [23]. Siten se ei ole havainnut mitään merkittävää yhdistyksen valkoihoinen väestö voisi johtua huomattavasti pienempi tilastollinen teho aiheuttama suhteellisesti vähemmän yleisyys G-alleelin rs10937405. Siksi lisätutkimuksia taataan edelleen vahvistaa etnisten eroa vaikutus tämän polymorfismin vaikutus keuhkosyövän riskiä. Lisäksi tutkimuksen suunnittelu tai pieni otoskoko tai jotkin ympäristötekijät voivat vaikuttaa tuloksiin. On mahdollista, että vaihtelu tässä lokuksessa on vähäinen vaikutus keuhkosyöpään, mutta ympäristötekijät voivat vallita edistymistä keuhkosyövän, ja naamio vaikutukset tämän vaihtelun. Erityiset ympäristötekijät kuten elämäntapa ja tupakointi, jotka ovat jo hyvin tutkittu viime vuosikymmeninä [1]. Lisäksi eri populaatioissa yleensä eri kytkentäepätasapaino- kuvioita. Polymorfismi voi olla tiiviit kytkökset toiseen lähellä syy muunnos yhdessä etninen väestö, mutta ei toisessa. Nämä polymorfismit voivat olla tiiviit kytkökset eri lähellä syy variantit eri populaatioissa. Kuten rs4488809, vain tutkimuksissa keskuudessa Itäaasialaiset olivat saatavilla tällä hetkellä, lisätutkimuksia myös laajempi kirjo aiheita tutkia roolia tämän variantin eri etnisten väestöissä tarvitaan vahvistaa tuloksemme.

Kun analysoidaan ja histologinen tyyppi, vaikutukset rs10937405, ja rs4488809 klo 3q28 riskiin sairastua keuhkosyöpään olivat merkittäviä lähinnä adenokarsinooma. Kuitenkin adenokarsinooma osuus on noin 50% kaikista histologisia keuhkosyöpään [11]. Syynä havaitun kasvainspesifisen ero tuomien riskien näiden polymorfismien on tuntematon. Kuitenkin eri karsinogeeninen prosessit voivat olla mukana synnyssä eri kasvaintyypeissä koska läsnäolo toiminnallisesti eri 3q28 polymorfismit. Siksi tulevissa tutkimuksissa tulisi käyttää homogeeninen syöpäpotilailla. Kun ositettu tupakointi käyttäytyminen ja sukupuoli, nämä SNP yleensä on samanlainen tai naisilla ja miehillä, tupakoimattomia ja koskaan tupakoitsijoita.

Vaikka se on haastavaa tunnistaa tarkkaa mekanismia, jolla 3q28 vaihtelu vaikuttaa keuhkosyöpää kehittäminen kertyminen DNA-vaurion ja puute vastaus genotoksinen stressi tunnustetaan edistää keuhkojen syövän synnyn. TP63 (tunnetaan myös nimellä p63) on jäsen tuumorisuppressorigeenin P53-geenin perhe, joka on keskeinen solun erilaistumista ja vastata solustressiä [27]. Altistuminen solujen DNA-vauriota johtavat induktioon TP63 ja molemmat isomuodot on kyky transaktivoida TP53 kohdegeenien siten vaikuttavat solujen reagoida DNA-vaurioita [28], [29]. TP63 saadaan pääasiassa kaksi isoformia, TA ja N-terminaalisen-katkaistu (Dn) muodostaa, ja sen biologinen rooli näyttää olevan monimutkaisempi kuin klassinen tuumorisuppressorin [30]. TAp63 isoformit näyttää olevan erittäin transkriptionaalisesti tehokas ja on tärkeää säilyttää aikuisten orvaskeden kantasolujen [31], solujen lisääntymisen, erilaistumisen ja eloonjäämisen, kun NF-KB: n aktivaation [32]. TP63 yli-ilmennetään ja monistettiin saattaa lisätä invasiivisuus ja aggressiivisuutta solujen normaalin tai hyperplastista epiteelisolujen [33], [34]. Kertyminen DNA-vaurioita ja puute vastaus genotoksisten stressi myötävaikuttaa aikaisempaan vaiheeseen karsinogeneesissä. Koska mahdollinen ehdokas SNP sijaitsee introni 1 TP63, joka koodaa TAp63 isomuotoja, nämä tulokset viittaavat siihen, että yksi tai useampi näistä SNP voi olla toiminnallinen rooli säätelyssä TP63-geenin ilmentymisen.

vahvuuksia tutkimus sisältää erittäin suuri otoskoko, ei poikkeama HWE, ja korkea laatu pätevä tutkimuksissa. Kuitenkin nykyinen tutkimus olisi tulkittava useita teknisiä rajoituksia ajatellen. Ensinnäkin valtaosa valkoiset kohteet tutkimuksessa ovat Itä-Aasian syntyperää, ja tilastollinen voima analyyseihin muissa etnisissä ryhmissä on rajallinen. Koska otoksen koko oli suhteellisesti pienempi Kaukasian tutkimuksissa pääasiallisena johtopäätökset käsikirjoitus perustuu analyyseihin keskuudessa valkoinen Aasian populaatiot. Jatkotutkimuksissa myös suurempia määriä valkoihoinen tai Afrikkalainen selventämiseksi johdonmukaisuuden havainnoista yli etnisten ryhmien. Toiseksi, meidän tulokset perustuvat oikaisemattomaan arvioihin, kun taas tarkemman analyysin tulisi tehdä, jos yksittäiset tiedot olivat käytettävissä, joka mahdollistaisi säädön muiden covariates kuten ikä, suvussa, ympäristötekijöiden ja elintapojen. Kolmanneksi alaryhmä meta-analyysit huomioon järjestöjen välillä polymorfismien ja nikotiiniriippuvuus, sukupuoli, sekä eri histologinen keuhkosyövän tehtiin perusteella murto-osa kaikista mahdollisista tiedot jaettavan, joten valinta bias voi on tapahtunut ja meidän tulokset voidaan Ylipaineistettu. Kuitenkin, kokonaismäärä aiheita tähän osaan analyysin käsittää suurimman näytteen koko toistaiseksi.

Näistä rajoituksista huolimatta meidän meta-analyysi osoitti, että rs10937405, ja rs4488809 polymorfismi 3q28 voi olla riski antavan tekijä kehittämiseen keuhkosyövän, erityisesti Aasian populaatiot. Suurempi tutkimuksia eri etnisten väestöryhmien, erityisesti yksityiskohtaisia ​​yksittäisiä tietoja, joita tarvitaan vahvistaa havaintomme. Koska on epätodennäköistä, että geneettinen vaihtelu yksin selittää keuhkosyövän taakkaa, tarvitaan lisätutkimuksia tunnistaa ympäristöaltisteiden ja geenien ja ympäristön vuorovaikutukset näissä potilasryhmissä. Lisäksi geneettisiä variantteja ja mekanismien taustalla tämä yhdistys vaatii lisätutkimuksia.

tukeminen Information

Kuva S1.

Study valintaprosessi.

doi: 10,1371 /journal.pone.0087004.s001

(TIF) B Kuva S2.

tulos herkkyysanalyyseja varten 3q28-rs10937405 polymorfismi ja LC riskiä.

doi: 10,1371 /journal.pone.0087004.s002

(TIF) B Kuva S3.

tulos herkkyysanalyyseja varten 3q28

–

rs4488809 polymorfismi ja LC riskiä.

doi: 10,1371 /journal.pone.0087004.s003

(TIF) B Kuva S4.

Begg n suppilo käyrä 3q28-rs10937405 polymorfismi ja keuhkosyövän riskiä.

doi: 10,1371 /journal.pone.0087004.s004

(TIF) B Kuva S5.

Begg n suppilo juoni 3q28

–

rs4488809 polymorfismi ja keuhkosyöpää.

doi: 10,1371 /journal.pone.0087004.s005

(TIF)

tarkistuslista S1.

doi: 10,1371 /journal.pone.0087004.s006

(DOC) B