Krooninen sairaus

tiivistelmä

taustaa ja tarkoitus

Useat tutkimukset on tehty tutkimaan assosiaatioita osteopontiinissa (OPN) promoottori geenin

SPP1

polymorfismien ihmisen syövistä Kiinan väestön, mutta tulokset jäävät epäjohdonmukainen. Tavoitteena meta-analyysi on selventää assosiaatioita

SPP1

polymorfismien ja syöpäalttiutta.

Methods

Kaikki kelvolliset tapausverrokkitutkimukset julkaistaan ​​maaliskuuhun 2015 mennessä tunnistetaan etsimällä PubMed, Web of Science, EMBASE, ja Cochrane Library ilman kieltä rajoituksia. Yhdistettiin kerroinsuhde (OR) ja 95%: n luottamusväli (95% CI) laskettiin käyttäen kiinteä- tai random-vaikutus malli.

Tulokset

yhteensä 11 tapausverrokkitutkimukset sisällytettiin ; näistä oli yksitoista tutkimuksia (3130 tapausta ja 3828 kontrollit) varten -443T C polymorfismi, kymmenen tutkimukset (3019 tapausta ja 3615 kontrollit) varten -156G GG polymorfismi, kahdeksan tutkimukset (2258 tapausta ja 2846 kontrollit) varten -66T G-polymorfismi. Kaiken kaikkiaan ei näytön mukaan -443 T C polymorfismi liittyy syövän riskiä (OR = 0,93, 95% CI +0,62-+1,38 varten hallitseva malli, OR = 1,06, 95% CI 0,73-1,55 varten väistyvä malli, OR = 0,88 , 95%: n luottamusväli 0,62-1,26 CT vs TT malli, OR = 1,03, 95% CI 0,61-1,73 SK vs TT malli). Vaikka huomattavasti lisätä riskiä havaittiin -156 G GG polymorfismi (OR = 1,22, 95% CI 1,10-1,35 varten hallitseva malli, OR = 1,25, 95% CI 1,10-1,41 varten väistyvä malli, OR = 1,18, 95% CI 1,06-1,32 GGG vs GG malli, OR = 1,35, 95% CI 1,09-1,68 varten GGGG vs GG malli). Sillä -66T G polymorfismi, löysimme laskua syöpäriski (OR = 0,84, 95% CI 0,71-0,98 varten hallitseva malli), mutta tämä tulos muuttunut (OR = 0,93, 95% CI 0,77-1,12 varten hallitseva malli), kun me ulkopuolelle tutkimus.

Johtopäätös

Tämä meta-analyysin mukaan Kiinan väestöstä, -156G GG polymorfismi

SPP1

saattaa olla riskitekijä ihmisen syövissä, kun taas -443T C-mutaatio ei liity syöpäriskiä. Sillä -66T G-polymorfismi, se voi olla suojaava tekijä ihmisen syövissä.

Citation: Liu Y, Lei H, Zhang J, Wang J, Li K, Dong W (2015) assosiaatioiden geneettisten polymorfismien of Osteopontin promoottori ja Alttius syövän Kiinan väestö: meta-analyysi. PLoS ONE 10 (8): e0135318. doi: 10,1371 /journal.pone.0135318

Editor: Jian-Xin Gao, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine, Kiina

vastaanotettu: 14 huhtikuu 2015; Hyväksytty: 20 heinäkuu 2015; Julkaistu: 12 elokuu 2015

Copyright: © 2015 Liu et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään

Data Saatavuus: kaikki asiaankuuluvat tiedot kuuluvat paperin ja sen tukeminen Information tiedostoja.

rahoitus: kirjoittajat eivät tuki ja rahoitus raportoida.

kilpailevat edut: kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä olemassa.

Johdanto

Syövät osaltaan suurin paljon kuolemaan maailmanlaajuisesti [1], seurauksena vuorovaikutukset geneettisestä mutaatiosta kertymisen ja ympäristö riskitekijöitä. Geneettinen vaihtelu on tärkeä rooli kasvainten synnyssä kanssa vaikutus geenien rakenteeseen ja proteiinin ilmentyminen [2]. Useat polymorfismit, joilla on suhde syöpiä ihmisen osteopontiinissa (OPN) koodaavan geenin,

SPP1

on haettu.

OPN on erittyvä glycophosphoprotein joka voi fysiologisesti toimia sytokiinin ja soluväliaineen molekyyli . Se ilmaistaan ​​ja erittävät eri solut, ja on rooli luun, kokoonpanon muutoksia kudoksen eheys aikana tulehduksia, sepelvaltimon restenoosi, ja syöpä metastasoitunut [3-6]. On osoitettu, että OPN liittyy yli 30 syöpiä toistaiseksi ja markkeri rintasyövän, kohdunkaulan, peräsuolen, pään ja kaulan, maksa-, keuhko-, munasarja- ja eturauhas- syöpien, sekä sarkooma [7,8]. Tiukka korrelaatio kasvaimen metastaattista ja etenemiseen alun perin raportoitu vuonna 1979 [9] ja oli hyväksytty monet tutkimukset ovat kuitenkin yhdistyksen välillä OPN ja syövän syntymistä on juuri tutkittu äskettäin [10,11]. Ilmentyminen OPN vaikutti merkittävästi sen geneettisten polymorfismien promoottorin [12],

SPP1

(kartoitettu kromosomiin 4q24-q25), joka on pääasiassa säädellään transkriptionaalisesti geenin erittäin konservoitunut promoottori [13]. Useat polymorfismien

SPP1

geeni vaikuttaa OPN ilmentymisen ja taso sen erittymiseen Naudanmaidon [14]. Yhteinen yhden emäksen monimuotoisuus (SNP), kuten -443C T (rs11730582), -156G GG (rs17524488) ja -66T G (rs28357094) saattaa suurentaa ilmentymistä

SPP1

geeni ja kasvaimen riski. Tulokset ovat edelleen epäselviä ja kattava analyysi on tarpeen. Siksi toteutimme meta-analyysi, joka integroitu kaikki tutkimukset

SPP1

polymorfismien ja riskien kaikentyyppisten ihmisen syövän saadakseen tarkan arvion.

Materiaalit ja menetelmät

haku strategia

kirjallisuuden tutkimus suoritettiin käyttäen PubMed, Web of Science, EMBASE, ja Cochrane Library maaliskuuhun 2015 saakka ilman kieltä rajoituksia. Asiaankuuluvat tutkimukset etsittiin käyttäen termejä [osteopontiinissa tai OPN tai

SPP1

] JA [-443C T tai rs11730582 tai -156G GG tai rs17524488 tai -66T G tai rs28357094] ja [variantin tai geneettistä polymorfismia tai polymorfismi tai mutaatio]. Lisätutkimukset tunnistettiin seulomalla viittaukset noudetun artikkeleita ja edeltävien katsauksia aiheeseen.

Mukaanottokriteerit ja poissulkemisperusteet

Tutkimukset otettiin tutkimukseen, jos ne täyttävät seuraavat kriteerit: (1) tapaus- control study; (2) noin yhdistysten välillä

SPP1

polymorfismien (-443T C tai -156G GG tai -66T G) ja syöpäriski; ja (3) oli käytettävissään genotyyppi taajuudet tapausten ja kontrollien tai voitiin laskea paperin. Niinpä poissulkemisperusteet olivat (1) kaksoiskappale tiedot, (2) vain syöpänäytteissä, (3) ainoastaan ​​hyvänlaatuinen tauti verrattuna kontrolleihin, ja (4) lukumäärä tapauksista alle 30.

Data louhinta ja laadun arviointi

Kaksi kirjoittajien valittu itsenäisesti artikkelin ja uutetaan tietoja yksimielisyys kaikista ehdoista. Jos tiedot eivät identtisiä, kaksi tutkijat olisivat tarkistaa tiedot uudelleen päästä sopimukseen. Jos he eivät päässeet sopimukseen, asiantuntijan (Weiguo Dong) voisi osallistua keskusteluun. Seuraavat erät kerättiin tukikelpoisten artikkeleista: ensimmäinen tekijän nimi, julkaisuvuosi, alkuperämaan, etnisyyden, syöpä tyyppi, tapausten määrä ja valvonnan, ikä, sukupuoli, OPN tasot ja genotyyppejä jakaumat tapauksissa ja valvontaa.

laatu valittujen tutkimuksista riippumattomasti arvioitiin perusteella Newcastle-Ottawa asteikko (NOS) [15]. Tutkimukset kuusi tai enemmän tähtiä pidettiin laadukkaita.

Tilastollinen

Meta-analyysi tehtiin käyttämällä Cochrane Collaboration Revman 5,3 (Kööpenhamina, 2014) ja TILASTOT paketin versio 9.2 (Stata Corporation , College Station, Texas). Syöpäriskiä liittyy kolme polymorfismit vastaavasti

SPP1

geeni arvioitiin kunkin tukikelpoisten tutkimuksen kerroinsuhde (OR) ja 95%: n luottamusväli (95% CI). Käytimme χ

2-pohjainen Q tilastoa teksti [16] ja

I

2

indeksi [17] arvioida heterogeenisuus tutkimusten välistä. Kun heterogeenisuus tutkimuksissa (Q testi P≤0.05 tai

I

2

50%) oli osoitti, random-vaikutus mallia käytettiin [18], muuten kiinteän -effects mallia käytettiin [19]. Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) hallitsee ihmisiä arvosteli χ

2 tekstiä. Olemme arvioineet yhdistysten kolmen polymorfismien syöpäriskiä alla hallitseva, resessiivinen, codominant, ja heterotsygoottinen malleja vastaavasti. Sitten analysoimme herkkyys stabiilisuuden arvioimiseksi tulosten poistamisen jälkeen tutkimukset poiketen HWE. Julkaisu bias oli diagnosoitu Begg n suppilo juoni [20] ja Egger n lineaarinen regressio [21]. P 0,05 pidettiin tilassa epätasapainoa.

Tulokset

Tutkimus ominaisuudet

Hakustrategia haettu 40 potentiaali asiaa koskevat tutkimukset ja yhdessä tutkimuksessa tunnistettiin viittauksia. Mukaan ja poissulkukriteereitä, 11 tutkimukset [10,12,22-30] kanssa koko tekstin olivat oikeutettuja tähän meta-analyysi ja 30 tutkimukset suljettiin pois. Vuokaaviossa tutkimuksen valinta on koottu kuvioon 1. Kaikki tutkimukset toteutetaan Kiinan ja kaikkien participators tulivat Kiinan väestöstä. Oli yksitoista tapausverrokkitutkimukset kanssa 3130 syöpätapausta ja 3828 koskevien tarkastusten -443T C polymorfismi, kymmenen tapausverrokkitutkimukset kanssa 3019 tapauksia ja 3615 koskevien tarkastusten -156 G GG, ja kahdeksan tapausverrokkitutkimukset kanssa 2258 tapauksia ja 2846 tarkastukset koskevat -66T G. Syöpätyyppejä ovat gliooma, ei-pienisoluinen keuhkosyöpä (NSCLC), suun levyepiteelisyöpä (OSCC), mahasyöpä (GC), papillaarinen kilpirauhassyöpä (PTC), nenänielun karsinooma (NPC), kohdunkaulan syöpä, akuutti myelooinen leukemia ( AML), ja maksansisäisten kolangiokarsinooma (ICC). Verinäytteet käytettiin määrittämään geneettisten polymorfismien kaikissa mukana tutkimuksessa. Jakautuminen genotyyppien valvonnan oli sopusoinnussa HWE kaikkien valittujen tutkimusten paitsi kahdessa tutkimuksessa [23,29]. Ominaisuuksia kaikki mukana tutkimuksissa luokiteltiin laadukkaita. Taulukko 1 osoitti ominaisuudet ja NOS laatua kirjoilla tutkimuksista.

Quantitative data synteesi

-443T C polymorfismi, yksitoista tapausverrokkitutkimukset [10,12 , 22-30] kanssa 3130 tapausta ja 3828 kontrolliraskauksiin. Kaiken kaikkiaan ei ole merkittävää eroa -443T C genotyypin jakautuminen syövän ja valvonta [hallitseva malli (OR = 0,93, 95% CI 0,62-1,38,

P

0,0001); väistyvä malli (OR = 1,06, 95% CI 0,73-1,55,

P

0,0001); CT vs. TT malli (OR = 0,88, 95% CI 0,62-1,26,

P

0,0001); CC vs TT malli (OR = 1,03, 95% CI +0,61-+1,73,

P

0,0001)] (taulukko 2).

-156G GG polymorfismi, kymmenen tapausverrokkitutkimukset [12,22-30] kanssa 3019 tapausta ja 3615 kontrolliraskauksiin. Kaiken kaikkiaan merkittävä kohonnut todettiin kaikkien neljän mallia [hallitseva malli (OR = 1,22, 95% CI 1,10-1,35,

P

= 0,09); väistyvä malli (OR = 1,25, 95% CI 1,10-1,41,

P

= 0,07); GGG vs GG malli (OR = 1,18, 95% CI 1,06-1,32,

P

= 0,15); GGGG vs GG malli (OR = 1,35, 95% CI 1,09-1,68,

P

= 0,03)] (taulukko 2). Arvioimme vaikutus näiden tutkimukset yhdistettiin TAI poistamalla tutkimukset, jotka eivät olleet HWE meta-analyysi. Arvioitu yhdistettiin pariton suhde vieläkään ei muuttunut lainkaan (taulukko 2).

-66T G-polymorfismi, kahdeksan tapausverrokkitutkimukset [23-30] kanssa 2258 tapausta ja 2846 kontrolliraskauksiin. Kaiken kaikkiaan olemme havainneet, että merkittävä pienentynyt riski nojalla hallitseva malli (OR = 0,84, 95% CI +0,71-+0,98,

P

= 0,15), mutta ei merkittävää havaittu yhteyttä muihin kolme mallia (taulukko 2).

heterogeenisuus ja herkkyysanalyysi

-443T C polymorfismi oli merkittävä heterogeenisyys yleistä vertailuja kaikkien neljän mallia (

P

0,0001). Sillä -156G GG polymorfismi, merkittävä heterogeenisyys välillä tutkimuksissa havaittiin yleistä vertailuissa alle GG /GG verrattuna GG malli (

I

2 = 52%,

P

= 0,03). Ja -66T G-polymorfismi, merkittävä heterogeenisyys välillä tutkimuksissa havaittiin yleistä vertailuissa alle väistyvä malli ja TG vs. TT malli (

I

2

= 57%,

P

= 0,07;

I

2

= 0,006,

P

= 70%, tässä järjestyksessä). (Kuvio 2). Sitten, herkkyys analyysi suoritettiin stabiilisuuden arvioimiseksi tulosten poistamalla yksi tutkimuksessa yksi kerrallaan. Sillä -156G GG polymorfismi, heterogeenisyys pieneni, kun sulje pois tutkimuksen Mu GY, niin se viittaa siihen, että Mu GY voi olla lähde heterogeenisyys. Sillä -66 T G-polymorfismi, heterogeenisyys laskenut nollaan, kun tutkimus Xu Q jätettiin, joten tutkimuksella voi olla lähde heterogeenisyys.

(a) -443 T C. (B) -156G GG. (C) -156G GG kanssa HWE. (D) -66T G.

Julkaisu bias

Begg n suppilo juoni ja Egger testi tehtiin käsittelemään mahdollisia julkaisu puolueellisuudesta kirjallisuutta. Muoto suppilo tontteja ei osoittanut mitään merkkejä suppilon juoni epäsymmetrian (kuvio 3). Egger testi paljastaa myös, ettei tilastollista merkitystä arvioinnissa julkaisun bias alle hallitseva malli (-443T C:

P

= 0,818, -156G GG:

P

= 0.418, – 66T G:

P

= 0,842).

(a) -443T G. (B) -156G GG. (C) -66T G

Keskustelu

Osteopontin kuuluu pienen intrgrin sitovan ligandin N-glykoproteiinien (sisarukset) perhe. On olemassa monta kappaletta todisteita osoittaa, että osteo- syvästi säätelevät kehittymistä ja etenemistä eri kasvaimia. Lisäksi OPN ilme oli merkitsevästi korkeampi ihmisen syövissä kudoksissa kuin vastaaviin normaaleihin kudoksiin ja se oli merkitsevästi yhteydessä solmukohtien etäpesäkkeitä ja kehittyneempi kliinisessä vaiheessa. Siksi lukuisia julkaisuja ovat testanneet OPN biomarkkerina syövän invasiivisuus [31-34]. Kuitenkin yhdistykset tuumorigeneesiin ei ole näytetty toteen hyvin. Polymorfismien OPN geeni,

SPP1

, voivat mahdollisesti muuttaa ilmaus OPN ja sitten moduloida syöpäriskiä. Viime vuosina SNP on todettu tehokas työkalu ennustamiseen monimutkaisia ​​sairauksia. Kuitenkin aikaisemmat geneettiset epidemiologisia tutkimuksia yhdistysten välillä OPN geenipolymorfismien ja riski ihmisen syövän ovat rajalliset, ja tulokset olivat vakuuttavia. Tietääksemme tämä on ensimmäinen meta-analyysi jossa selvitettiin mahdollisia korrelaatioita rs11730582 (-443 T C), rs17524488 (-156G GG), ja rs28357094 (-66T G) polymorfismit

SPP1

geeni syöpäalttiutta.

tulokset paljastivat, että -443T C polymorfismin välttämättä ole suhteessa patogeneesin syövän. Ja huomasimme, että eri tutkimuksista oli ristiriitaisia ​​tuloksia tästä polymorfismin jopa saman syöpä. Esimerkiksi Chen JX [22] sanoi, että resessiivinen geneettinen malli TC + CC genotyypit merkittävästi pienentää riskiä gliooma verrattuna TT, mutta Shen ZP [26] katsoi, että gliooma potilailla oli selvästi tiheä -443CC genotyyppi kuin valvontaa. Toinen kaksi tutkimusta [29,30] osoitti, että ei ollut merkittävää eroa jakelussa -443 välillä syöpäpotilaiden ja valvontaa. Mitä enemmän, suuri heterogeenisuus havaittiin neljässä geenissä mallia (P 0,0001). Edellinen meta-analyysissä noin ihmisen syöpäriski todettiin, että syöpä tyyppi voisi edistää eniten lähde heterogeenisyys [35,36]. Tässä tutkimuksessa alaryhmä analyysi perusteella syöpätyyppien ei ole laskettu, koska rajallinen määrä tutkimuksia. Joten tämä tulos on tulkittava varoen.

-156G GG, meidän tutkimuksessa todettiin, että GG-alleeli oli merkittävä suuri riski syövän kaikkien neljän geneettinen mallia, ja tämä tulos vahvistettiin joukossa tutkimuksia HWE. Kun me sulkea tutkimuksen Mu GY [25], jotka voivat olla lähde heterogeenisyys, tulokset säilyvät ennallaan. Tämä tarkoittaa, että SNP on -156G GG voi huomattavasti toimia mahdollisena ehdokkaana biomarkkeri syöpäriskiä.

Meta-analyysi -66T G on kahdeksan tutkimukset ovat kuitenkin kaksi tutkimusta [24,29], että ei arvioitavissa meta-analyysi (kuvio 2). Tulokset polymorfismin määräävässä malli osoitti, että genotyypit TG + GG vähensi syöpäriskiä verrattuna TT. Huomionarvoista yhdistys oli häviävät sulkea tutkimuksessa Xu Q [27], jotka voivat olla peräisin heterogeenisyys. Joten, tuloksena on epävakaa ja lisätutkimuksia selventämiseksi yhdistyksen.

Korkea OPN ilmentymistä primäärikasvaimissa liittyy syöpäriski, etäpesäke ja huono kliinistä tulosta [37-39]. Aikaisempi tutkimus osoitti, että -443 promoottorialue kykenee vaikuttamaan OPN geeniekspressiossa melanoomasoluissa [40]. Meidän lukien tutkimukset, neljä tutkimusta [10,25,26,28] havaittiin yhdistyksen OPN tasoilla ja

SPP1

polymorfismit. Mu GY [25] ja Zhang R [28] havaittiin, että korkea OPN ilmaisu oli yleisempää näytteissä -443 CC harjoittajat kuin TT harjoittajille, Kuitenkin Shen ZP [26] todettiin, että yksikään polymorfismien vaikuttanut seerumin OPN tasot, Wang JL [10] ajatellut, että kantajia CC ja CT genotyyppi -443 esitetään alemman seerumin osteopontiinissa tasoja kuin TT genotyypin. Niistä neljä tutkimusta vain kaksi antoi tarkkoja tietoja, joten emme voi tarjota uusia tilastoja. Tulos voi johtua seuraavista syistä: (1)

SPP1

polymorfismien vaikuttanut kasvaimen OPN ilmaisun tasolla, mutta ei seerumin OPN tasolla; (2) yhdistys on todellakin liittyvä ja lisätutkimuksia vain tarpeen; (3)

SPP1

polymorfismien tee mitään eroa OPN tasolla.

Jotkut etu voitaisiin käsitellä tässä meta-analyysi. Toisaalta tämä tutkimus irtoa valot suhteesta geneettisten polymorfismien

SPP1

geenin ja lisääntynyt alttius ihmisen syöpiä Kiinan väestön systemaattisesti. Yksi Toisaalta tyhjentävä kriteereillä ja artikkeleita monenlaisia ​​syöpiä parannettu voimaa ja suostuttelun johtopäätöksemme. Lisäksi kaikki kirjallisuus mukana oli hyväksyttävä laatupisteet (sijoitettiin ainakin 6). Samalla olemme olleet tietoisia myös useita rajoituksia Tutkimuksemme. Ensinnäkin, kaikki voivat tutkimukset tulevat Kiinasta ja potilaat ovat Kiinan väestöstä. Toiseksi määrä tutkimuksia, erityisesti -66T G-polymorfismi, ei ollut riittävän suuri, kolmas, sillä -443T C polymorfismi, heterogeenisyys oli suuri, kattava analyysi olisi selitettävä varoen.

johtopäätökset

Tämä meta-analyysi osoitti, että kiinalaisen väestöön -156G GG polymorfismi

SPP1

saattaa lisätä alttiutta ihmisen syövissä, kun taas -443T C mutaatiota ei liity syöpäriskiä . Sillä -66T G-polymorfismi, se voi olla suojaava tekijä ihmisen syövissä. Vastaavasti suuri ja hyvin suunniteltu tutkimuksia perusteltua vahvistaa havaintomme. Populaatiot tässä tutkimuksessa vain tuli Kiinasta. Siten populaatiot muiden etnisten ryhmien tulisi osallistua tulevissa tutkimuksissa.

tukeminen Information

S1 tarkistuslista. Meta-analyysi Genetic Association Studies tarkistuslista.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0135318.s001

(DOCX) B S1 tarkistuslista. PRISMA muistilista.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0135318.s002

(DOC) B