Krooninen sairaus

tiivistelmä

Ruokatorven syöpä on kahdeksas yleisin syöpä ja kuudenneksi yleisin syy syövän liittyvän kuoleman maailmanlaajuisesti. Lisäksi ympäristön riskitekijät, geneettiset tekijät saattavat olla tärkeä rooli ruokatorven syöpä syövän synnyn. Teimme sairaaloiden tapauskontrollitutkimuksessa arvioida geneettinen alttius toiminnallisten yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) on MikroRNA kehittämiseen ruokatorven syöpään. Kaikkiaan 629 ruokatorven okasolusyöpä (ESCC) tapaukset ja 686 valvontaa rekrytoitiin tätä tutkimusta varten.

HSA-miR-34b /c

rs4938723 T C,

pri-miR-124-1

rs531564 C G,

pre-miR-125a

rs12975333 G T ja

HSA-miR-423

rs6505162 C genotyypit määritettiin käyttäen Ligation Detection Reaction (LDR) menetelmällä. Tuloksemme osoittivat, että

HSA-miR-34b /c

rs4938723 CC-genotyyppi oli pienentynyt riski ESCC. Yhdistys oli ilmeinen potilailla, jotka eivät koskaan juo.

Hsa-miR-423

rs6505162 C voimin liittyi merkitsevästi suurentunut riski ESCC potilailla, jotka tupakoinnin. Nämä havainnot osoittivat, että toiminnallisia polymorfismit

HSA-miR-34b /c

rs4938723 T C ja

HSA-miR-423

rs6505162 C saattavat muuttaa yksilöllinen herkkyytensä ESCC. Kuitenkin meidän tuloksia saatiin rajoitetun näytteen koon. Future suurempi tutkimukset muiden etnisten väestö on vahvistettava tutkimuksen tuloksiin.

Citation: Yin J, Wang X, Zheng L, Shi Y, Wang L, Shao A, et al. (2013)

Hsa-miR-34b /c

rs4938723 T C ja

HSA-miR-423

rs6505162 C polymorfismit liittyvät riskiä ruokatorven syöpä kiinalaisessa väestöstä. PLoS ONE 8 (11): e80570. doi: 10,1371 /journal.pone.0080570

Editor: Xin-Yuan Guan, The University of Hong Kong, Kiina

vastaanotettu: 28 elokuu 2013; Hyväksytty: 04 lokakuu 2013; Julkaistu: 18 marraskuu 2013

Copyright: © 2013 Yin et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.

Rahoitus: Tämä tutkimus tuettiin osittain National Natural Science Foundation of China (81101889, 81000028), Jiangsu Natural Science Foundation (BK2010333, BK2011481), Social Development Foundation Zhenjiang (SH2010017) ja Changzhou Young Talents ja Science-Technology Foundation of Health Bureau (QN201102 ). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.

Johdanto

MikroRNA (miRNA) ovat pieniä ei-koodaavaa RNA: t, jotka toimivat posttranskriptionaalisella geenin säätelyelementtejä [1]. Erityisesti miRNA teko sitoutumalla 3′-alueella kohde- geenejä ja näin ollen alas-säädellä ilmaisun [2]. MiRNA ovat tärkeitä toimijoita karsinogeneesissä [3].

Geneettiset tekijät, kuten yhden emäksen monimuotoisuus (SNP), voivat edistää syövän synnyn [4]. SNP genomisessa miRNA sekvenssit voivat vaikuttaa miRNA-riippuvainen sääntelyn, vaikuttaa lopullinen taso ja toiminta miRNA ja muuttaa näin kasvain alttius [5].

jäsenet miR-34 perhe ovat suoria p53 tavoitteita, ja niiden ilmentyminen on suoraan indusoi p53 vastauksena DNA vaurioita tai onkogeenisten stressi [6]. Aikaisemmissa tutkimuksissa kolorektaalisyövässä [7], suusyövästä [8] ja pahanlaatuisen melanooman [9], alas-säätely mir-34b /c metylointi todettiin.

Hsa-miR-34b /c

rs4938723 polymorfismi sijaitsee sisällä CpG saaren pri-miR-34b /c, ja voi olla ennustettu sitoutumiskohta GATA-X transkriptiotekijöiden [10].

Hsa-miR-34b /c

rs4938723 T C polymorfismi liittyy riski nenänielun karsinooman [11], maksasyövän [12], peräsuolen syöpä [13] ja rintasyöpä selviytymistä [14].

lisäksi

HSA-miR-34b /c

rs4938723 T C,

pri-miR-124-1

rs531564 C G,

pre-miR-125a

rs12975333 G T ja

HSA-miR-423

rs6505162 C ia oli myös liittyy riski eri syöpiä. Rs531564 C G SNP

pri-miR-124-1

liittyi suurentunut virtsarakon syövän [15] ja ruokatorven syöpä miehillä [16].

pre-miR-125a

rs12975333 G T polymorfismi oli perustaja mutaatio ominaisia ​​Antwerpenin alue ja liittyy suuri riski sairastua rintasyöpään [17].

Hsa-miR-423

rs6505162 C polymorfismi oli yhteydessä vähensi rintasyövän riskiä [18].

Hsa-miR-423

rs6505162 C polymorfismi oli myös merkitsevästi yhteydessä sekä eloonjäämiseen ja uusiutumisen elinaika paksusuolisyövän [19].

aiemmin tutkittu

miR-196a2

rs11614913 T C,

miR-146a

rs2910164 C G,

miR-499

rs3746444 T C,

miR-26a-1

rs7372209 C T ja

miR-27a

rs895819 T C SNP ja ruokatorven okasolusyöpä (ESCC) riski 380 syöpätapausta ja 380 valvontaa [20]. Löysimme

miR-196a2

rs11614913 T C voisi edistää laski ESCC riskiä naisilla ja potilailla, jotka eivät koskaan tupakointi tai juominen [20]. Nyt tavoite Tämän tutkimuksen tarkoituksena oli arvioida yhdistyksen välillä

HSA-miR-34b /c

rs4938723 T C,

pri-miR-124-1

rs531564 C G,

pre-miR-125a

rs12975333 G T ja

HSA-miR-423

rs6505162 C genotyypit ja ESCC riski. Suoritimme genotyypitys analysoi neljän

miRNA

SNP kanssa 629 ESCC tapauksissa ja 686 kontrollit Kiinan väestön.

Materiaalit ja menetelmät

Eettinen hyväksyntä tutkimussuunnitelman

Tämä sairaala-pohjainen tapauskontrollitutkimuksessa hyväksyi Review Board of Jiangsu University (Zhenjiang, Kiina). Olemme noudattaneet Maailman lääkäriliiton Helsingin julistuksen eettisten tutkimuksen suorittamisessa ihmiseen kohdistuvan ja /tai eläimiä. Kaikki koehenkilöt edellyttäen kirjallinen lupa olla mukana tutkimuksessa.

Potilaille ja säätimet

629 potilaalla on ruokatorven syöpä oli peräkkäin rekrytoitiin Affiliated Kansan sairaalan Jiangsu yliopiston ja Affiliated sairaala Jiangsu University (Zhenjiang, Kiina) välillä lokakuussa 2008 ja joulukuussa 2010. Diagnoosi tehtiin koepala ja kaikissa tapauksissa ruokatorven syöpään oli ESCC. Poissulkukriteerit joillain potilailla aiemmin: syöpä; mitään etäpesäkkeitä syöpä; sädehoidon tai kemoterapian. 686 kontrollit olivat potilaita ilman syövän taajuus-sovitettu tapauksiin iän suhteen (± 5 vuotta) ja sukupuoli rekrytoidaan kaksi sairaalaa edellä mainittujen samana ajanjaksona. Useimmat tarkastukset otettiin sairaaloihin hoitoon trauma.

Kullekin koehenkilölle henkilökohtaisesti kyseenalaiseksi koulutettu haastattelijat käyttämällä esitestattuja kyselyn saada tietoa väestötietoja (esim, ikä, sukupuoli) ja siihen liittyvät riskitekijöitä (kuten tupakoinnin ja alkoholin kulutus). Haastattelun jälkeen, 2 ml näytettä laskimoverta kerättiin kustakin aiheesta. Yksilöt, jotka savustettu yhden savukkeen päivässä 1 vuosi määriteltiin ”tupakoitsijat”. Koehenkilöt, jotka kulutetaan ≥3 alkoholijuomia viikossa 6 kuukautta katsottiin ”alkoholi juovat”.

DNA: n eristäminen ja genotyypitys Ligaatioseoksista detektioreaktiossa

otettiin verinäytteet potilailta käyttämällä vacutainers ja siirrettiin putkiin vuorattu etyleenidiamiinitetra-etikkahappoa (EDTA). Perimän DNA eristettiin kokoverestä kanssa QIAamp DNA Veren Mini Kit (Qiagen, Berliini, Saksa) [21]. Näyte-DNA monistettiin PCR: llä mukaisesti valmistajan suositusten mukaisesti. Näytteet genotyyppi käyttäen Ligation Detection Reaction (LDR) menetelmä teknistä tukea Shanghai Biowing Applied Biotechnology Company kuten aikaisemmin on kuvattu [22]. Laadunvalvontaan, toistuvat analyysit tehtiin 160 (12,17%) satunnaisesti valitut näytteet korkea DNA laatu.

TILASTOANALYYSI

Erot jakaumia demografisten ominaisuuksien, valittujen muuttujien ja genotyyppien

HSA-miR-34b /c

rs4938723 T C,

pri-miR-124-1

rs531564 C G,

pre-miR-125a

rs12975333 G T ja

HSA-miR-423

rs6505162 C variantit välillä tapausten ja kontrollien arvioitiin käyttämällä Studentin t testiä ja

χ

2 testiä. Liitot välinen neljän SNP ja riski ESCC arvioitiin laskemalla syrjäisimpien alueiden ja niiden 95% CI logistisen regressiomallin analyysit raakaöljyn syrjäisimmille alueille ja säätää syrjäisimpien säädettäessä ikä, sukupuoli, tupakointi ja juominen tila. Hardyn-Weinberg tasapaino (HWE) testattiin hyvyyttä-of-fit

χ

2 testiä verrata havaittuun genotyyppi taajuudet odotettu niitä joukossa verrokkien. Kaikki tilastolliset analyysit suoritettiin SAS 9.1.3 (SAS Institute, Cary, NC, USA).

Tulokset

Ominaisuudet tutkimuspopulaation

Ominaisuudet tapausten ja kontrollien tutkimuksessa mukana on koottu taulukkoon 1. tapausten ja kontrollien näytti riittävästi Hyväksytty iän ja sukupuolen ehdottivat

χ

2 testit (

p

= 0,541 ja

p

= 0,185, tässä järjestyksessä). Kuten taulukosta 1, merkitsevä ero havaittiin tupakoinnista tapausten välillä ja säätimet (

p

0,001), ja juominen oli suurempi ESCC potilailla kuin verrokeilla (

p

0,001). Ensisijainen tieto neljä genotyyppi SNP oli taulukossa 2. Genotyyppaustulokset onnistumisprosentti on välillä 95,13%: sta 96,81% kaikissa 1315 näytteissä. Konkordanssi luokallejääminen analyysit olivat 100% kaikkien neljän SNP. Minor alleelin taajuus (MAF) meidän valvonta oli samanlainen MAF Kiinan tietokannassa kaikkien neljän SNP (taulukko 2). Havaittu genotyyppi taajuudet

HSA-miR-34b /c

rs4938723 T C,

pri-miR-124-1

rs531564 C G ja

HSA-miR-423

rs6505162 C polymorfismit tarkastukset olivat HWE (

p

= 0,675,

p

= 0,400 ja

p

= 0,299) paitsi

ennen miR-125a

rs12975333 G T (ei saatavilla) (taulukko 2).

Associations välillä HSA-miR-34b /c rs4938723 T C, pri-miR-124 -1 rs531564 C G, pre-miR-125a rs12975333 G T ja HSA-miR-423 rs6505162 C polymorfismit ja riski ESCC

genotyyppi jakaumat

HSA-miR-34b /c

rs4938723 T C,

pri-miR-124-1

rs531564 C G,

pre-miR-125a

rs12975333 G T ja

HSA-asennuspalveli- 423

rs6505162 C A tapauksissa ja säätimet on esitetty taulukossa 3. yhden lokuksen analyysien genotyyppi taajuudet

HSA-miR-34b /c

rs4938723 T C oli 46,2% (TT), 46,3% (TC), ja 7,5% (CC) jos potilaalla ja 46,1% (TT), 43,1% (TC), ja 10,8% (CC) on verrokeilla, ja ero ei ollut tilastollisesti merkitsevä (

p

= 0,101). Vuonna väistyvä mallissa, kun

HSA-miR-34b /c

rs4938723 TT /TC genotyypit käytettiin vertailuryhmään, CC homotsygoottinen genotyyppi liittyi tilastollisesti merkitsevästi vähentynyt riski ESCC (CC vs. TT /TC: säätää OR = 0,65, 95% CI = +0,44-,97,

p

= 0,036). Kun

HSA-miR-34b /c

rs4938723 TT homozygoottisia genotyyppi käytettiin vertailuryhmään, TC genotyyppi ei liittynyt riski ESCC (TC vs. TT: säätää OR = 1,11, 95% CI = 0,88-1,40,

p

= 0,397); CC genotyyppi ei liittynyt riski ESCC (CC vs. TT: säätää OR = 0,69, 95% CI = 0,45-1,04,

p

= 0,076). Vuonna hallitseva mallissa

HSA-miR-34b /c

rs4938723 TC /CC variantit eivät liittyneet riski ESCC verrattuna

HSA-miR-34b /c

rs4938723 TT-genotyyppi (oikaistu OR = 1,02, 95% CI = 0,82-1,28,

p

= 0,853) (taulukko 3).

Ei havaittu yhteyttä välillä

yksi- miR-124-1

rs531564 C G ja

HSA-miR-423

rs6505162 C polymorfismien ja riski ESCC (taulukko 3). Sillä

pre-miR-125a

rs12975333 G T, kaikki genotyypit ovat GG homozygoottien (taulukko 3).

ositus analysoi HSA-miR-34b /c rs4938723 T C, yksi- miR-124-1 rs531564 C G ja HSA-miR-423 rs6505162 C A ja riski ESCC

vaikutusten arvioimiseksi

HSA-miR-34b /c

rs4938723 T C,

pri-miR-124-1

rs531564 C G ja

HSA-miR-423

rs6505162 C genotyypit on ESCC riskin mukaan eri ikä, sukupuoli, tupakointi ja alkoholin juominen status; suoritimme ositus analyysit (taulukko 4). Merkitsevästi vähentynyt riski ESCC liittyvä

HSA-miR-34b /c

rs4938723 T C polymorfismin näkyi potilailla, jotka eivät koskaan juo (CC vs. TT /TC: säätää OR = 0,57, 95% CI = 0,34-0,94,

p

= 0,029) (taulukko 4). Potilailla, jotka tupakointi,

HSA-miR-423

rs6505162 C voimin liittyi merkitsevästi suurentunut ESCC (AA vs. CC /CA: säätää OR = 4,94, 95% CI = 1,42-17,21,

p

= 0,012) (taulukko 4).

keskustelu

tässä sairaalan johdolla tapauskontrollitutkimuksessa of ESCC, tutkimme yhdistysten

HSA-miR-34b /c

rs4938723 T C,

pri-miR-124-1

rs531564 C G,

pre-miR-125a

rs12975333 G T ja

HSA-miR-423

rs6505162 C A riski ESCC korkean riskin Kiinan väestön. Meidän monimuuttujaisen logistinen analyysi paljasti, että

HSA-miR-34b /c

rs4938723 CC-genotyyppi oli pienentynyt riski ESCC. Yhdistys oli ilmeinen potilailla, jotka eivät koskaan juo.

Hsa-miR-423

rs6505162 C voimin liittyi merkitsevästi suurentunut riski ESCC potilailla, jotka tupakoinnin.

On tunnettua, että jäsenet miR-34 perheen ilme on suoraan aiheuttama p53 vastauksena DNA vaurioita tai onkogeenisten stressi [6]. Rotan malli koe osoitti, että muuttuminen miR-34b /C tulehduksellinen mikroympäristön voidaan vaikuttaa p53 [23]. DNA metylaatio sen oma promoottori, miR-34 perhe on vaiennettu lukuisissa syövissä [24]. Laukaisemalla Wnt signa-, menetys miR-34 heikentää p53-välitteistä solukuolemaa. Yliekspressio miR-34 voi indusoida apoptoosia [25] – [27]. Rooli miR-34a tukahduttamiseen kasvaimen kasvu on havaittu in vivo [28]. Aiemmassa tutkimuksessa, alas-säätely mir-34b /c metylointi todettiin kolorektaalisyövässä [7], suusyövästä [8] ja pahanlaatuisen melanooman [9].

HSA-miR-34b /c

rs4938723 T C SNP sijaitsee sisällä CpG saaren pri-miR-34b /C ja voivat vaikuttaa ennustetun GATA-X transkriptiotekijän sitova [10].

Hsa-miR-34b /c

rs4938723 T C polymorfismi liittyy riski nenänielun karsinooman [11], maksasyövän [12], peräsuolen syöpä [13] ja rintasyöpä selviytymistä [14].

Hsa-miR-423

rs6505162 C polymorfismi oli yhteydessä vähensi rintasyövän riskiä [18] ja sekä kokonaiselinaika ja uusiutumisen elinaika paksusuolisyövän [19]. Tutkimuksessamme löysimme

HSA-miR-34b /c

rs4938723 CC-genotyyppi oli pienentynyt riski ESCC potilailla, jotka eivät koskaan juo,

HSA-miR-423

rs6505162 C voimin liittyi merkitsevästi suurentunut riski ESCC potilailla, jotka tupakoinnin, mikä osoittaa geenin-ympäristön vuorovaikutus.

taajuudet geneettisten polymorfismien vaihtelevat usein etnisten ryhmien välillä. Esillä Kiinan tutkimuksessa alleelin taajuus

HSA-miR-34b /c

rs4938723 C oli 0,324 joukosta 686 verrokeilla, mikä on hieman korkeampi kuin japanilaisten väestöstä (0,261) ja samankaltainen kuin eurooppalaisten väestöstä (0,310) ja Saharan eteläpuolisessa Afrikkalainen väestöstä (0,305). Alleeli taajuus

HSA-miR-423

rs6505162 A oli 0,188 joukosta 686 verrokeilla, mikä on sen mukaisesti Kiinan väestöstä (0,200) ja Japani väestöstä (0,178). Mutta alleelin taajuus on huomattavasti alhaisempi kuin Euroopan väestöstä (0,575) ja Saharan eteläpuolisessa Afrikkalainen väestö (0,783) (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP, http: //hapmap.ncbi.nlm .nih.gov /).

käyttäminen Virta ja Sample Size laskeminen (PS, versio 3.0, 2009, https://biostat.mc.vanderbilt.edu/twiki/bin/view/Main/PowerSampleSize), harkitsee

HSA-miR-34b /c

rs4938723 T C mutanttialleelit kontrolliryhmässä, OR, ESCC näytteitä ja kontrollinäytteitä, voima meidän analyysi (α = 0,05) oli 0,929 600 ESCC tapauksissa ja 673 säätimet säätää OR 0,65. Voima meidän analyysi (α = 0,05) oli 0,962 vuonna 404 ESCC tapauksissa ja 519 säätimet säätää OR 0,57 ei- juominen alaryhmä. Sillä

HSA-miR-423

rs6505162 C A valtaa meidän analyysi (α = 0,05) oli 1,000 263 ESCC tapauksissa ja 179 säätimet säätää OR 4,94 tupakoinnin alaryhmään.

tässä tapauskontrollitutkimuksessa, useita rajoituksia on puututtava. Ensinnäkin potilaiden ja verrokkien otettiin sairaaloista ja ei voi edustaa väestössä. Toiseksi tilastollisen tehon Tutkimuksemme oli rajoittanut erityisesti kerrostuneisuus analyysien, on parempi, että kontrolliryhmässä on suurempi kuin tapauksessa ryhmä; siksi on mahdollista saada enemmän tilastollinen voima. Kolmanneksi yksityiskohtaista tietoa syöpäsolujen leviämiseen ja selviytymisen eivät palvelukseen asti, joka rajoittuu edelleen analysoidaan roolista neljän polymorfismien ESCC etenemisen ja ennusteen. Lopuksi tietoja virusinfektiot ja immuunijärjestelmän parametreihin ei ollut saatavilla, mikä rajoitti voimaa meidän analyysejä.

Yhteenvetona Tutkimuksemme antaa näyttöä, että toiminnallinen polymorfismit

HSA-miR-34b /c

rs4938723 T C ja

HSA-miR-423

rs6505162 C saattavat muuttaa yksilöllinen herkkyytensä ESCC. Future suurempia tutkimuksia muiden etnisten väestöryhmien ja toiminnallinen analyysi on vahvistettava tutkimuksen tuloksiin.