PLoS ONE: Functional Geneettiset variaatiot klo microRNA Binding-Site in CD44 Gene liittyvät paksusuolisyövän riskin Kiinan Populations
tiivistelmä
CD44 kuin yksi otaksuttu kantasolu markkereita avainasemassa monissa solun toiminnoissa, kuten syöpäsolujen kasvua ja muuttoliike. Toiminnallinen yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) on
CD44
voivat muuttaa sen -geenifunktioiden ja siten syöpäriskiä. Nykyisessä tutkimuksessa selvitimme jos polymorfismien 3′-alue (UTR) on
CD44
liittyy lisääntynyt alttius peräsuolen syöpä (CRC) suorittamalla tapauskontrollitutkimuksessa 946 CRC potilaiden ja 989 syöpää vapaa valvontaa. Kolme polymorfismien (rs13347C /T, rs10836347C /T, rs11821102G /A) 3′-UTR
CD44
genotyypattiin. Huomasimme, että variantti genotyypit (CT ja TT) on rs13347 (oikaistu kerroinsuhde (OR) = 1,79, 95%: n luottamusväli (CI) = 1,50-2,17) kasvoi yksilön herkkyys CRC verrattuna rs13347CC homotsygoottinen genotyypit. Olemme myös havainneet, että CRC potilaiden kanssa TT /TT-genotyyppi oli 1,6-kertainen suuressa riskissä sairastua kehittynyt (vaihe III + IV) CRC. Lisäksi toiminnalliset analyysit osoittivat, että C-T emäsmuutos rs13347C /T häiritsee sitoutumiskohdan microRNA HSA-mir-509-3p, mikä lisää
CD44
transkriptionaalisen aktiivisuuden ja ilmentymisen tasolla. Nämä havainnot viittaavat siihen, että rs13347C /T microRNA sitoutumiskohdassa, saattavat olla mahdollisia biomarkkereita geneettinen alttius CRC.
Citation: Wu XM, Yang HG, Zheng BA, Cao HF, Hu ZM, Wu WD (2015) toiminnallinen Geneettiset variaatiot klo microRNA Binding-Site
CD44
Gene liittyvät paksusuolisyövän riskin Kiinan populaatiot. PLoS ONE 10 (5): e0127557. doi: 10,1371 /journal.pone.0127557
Academic Editor: Yifeng Zhou, Medical College of Soochow yliopisto, Kiina
vastaanotettu: 13 helmikuu 2015; Hyväksytty: 16 huhtikuu 2015; Julkaistu: toukokuu 26, 2015
Copyright: © 2015 Wu et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään
Data Saatavuus: kaikki asiaankuuluvat tiedot ovat paperi.
Rahoitus: Tämä tutkimus tukee Zhejiangin maakunnan Natural Science Foundation (nro 2013C33106). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.
Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.
Johdanto
peräsuolen syöpä (CRC) on kolmanneksi yleisin diagnosoitu ruoansulatuskanavassa maailmanlaajuisesti [1], ja sen esiintyvyys ja kuolleisuus on kasvanut nopeasti useiden viime vuosikymmenten Kiinassa [2]. Epidemiologiset tutkimukset ovat osoittaneet, että ympäristö- riskitekijät sekä elintapoihin liittyvistä tekijöistä, kuten ruokavalion, tupakointi ja alkoholin juominen pidetään osallistujien etiologiassa CRC [3, 4]. Yhä useammat tutkimukset ovat jo tunnustettu, että geneettiset tekijät voivat merkittävästi mukauttaa paksunsuolen syöpään altistava. Erityisesti, yhden nukleotidin polymorfismit (SNP: t) geenien muuttaa ekspressio tai aktiivisuus muuttamalla aminohapposekvenssiä voidaan altistaa CRC tumorgenesis [5-7].
Syöpä on luokan sairauksia tunnusomaista hallitsematon solukasvu ja jakaa. Pienenä populaatio solujen kasvain, syöpä kantasolut (CSC) voisi edistää aggressiivinen tautimuodoille kanssa pystyy aloittamaan kasvaimen kasvua ja huumeiden kestävyys. Kertyvät tutkimukset ovat keskittyneet olemassaolosta peräsuolen syövän kantasolujen paksu- ja peräsuolisyövän [8-10]. Siten tarkka tunnistaminen paksusuolen CSC ja niiden ominaisuudet voivat auttaa merkittävästi edistää tehokasta syövän hoidossa. Otaksuttu paksusuolen CSC populaatiot voidaan tunnistaa spesifisten CSC markkereita. CD44 on yksi tunnettu kantasolujen markkerina CRC [11].
CD44
geeni koodasi pintaglykoproteiinille mukana monissa biologisissa prosesseissa kuten lymfosyyttien aktivointi, hematopoieesin, itseohjautuva ja sikiön kehitystä [12]. Samaan aikaan,
CD44
on korvaamaton rooli tuumorisolun kasvuun, erilaistumiseen, invaasion ja liikkuvuuteen vastauksena solun mikroympäristön, mikä parantaa solujen aggregaatiota ja edistää kehittymistä ja etenemistä kasvaimia [13-15]. Viimeaikaiset tutkimukset ovat osoittaneet, että merkittävä korrelaatio tason
CD44
ilmaisun ja rintasyöpä solujen korkeammat tuumorigeenisyyteen ja metastaattista potentiaalia [13, 16], mikä korostaa tärkeä rooli
CD44
kasvaimen etenemistä ja etäpesäke. Vastaavasti knockdovvn
CD44
erityisiä siRNA (Sirna) ihmisen paksusuolen syöpäsoluissa voisi dramaattisesti suppresse solujen kasvua ja syövän etenemistä
in vitro
ja
in vivo
, voimakkaasti mikä voimakas säätelijä
CD44
etenemisessä CRC [17, 18]. Lisäksi uusia tutkimukset ovat myös todenneet, että geneettisiä variantteja
CD44
geeni liittyi syöpäriski ja ennusteeseen [19, 20]. 3′-UTR (transloimattomat alueet) geenien ovat tärkeimmät alueet kohteena MikroRNA ja on keskeinen rooli rooli geenin mRNA vakautta ja lopulta moduloida säätelyyn liittyvien proteiinien. SNP: t sijaitsevat microRNA-sitoutumiskohdat voivat vaikuttaa sitomiskykyä mikroRNA ja teoreettisesti häiritse ilmentymisen
CD44
ja voi siten predisposite taudin alttius. Oletamme, että SNP
CD44
3′-UTR liittyy CRC riskiä vaikuttamalla geenin ilmentymisen.
Nykyisessä sairaalan johdolla tapauskontrollitutkimuksessa meidän genotyyppi kolme polymorfismit (rs13347C /T, rs10836347C /T, rs11821102G /A) 3′-UTR
CD44
ja analysoi yhdistyksen välillä geenimuunnelmat ja CRC riski. Myöhemmin funktionaalisia määrityksiä suoritetaan lisäksi tutkia merkitystä ja biologinen toimintoja näiden SNP.
Materiaalit ja menetelmät
Tutkimuskanta
Tutkimus koostui 946 Han-kiinalaisten CRC potilaita ja 989 etnisesti sovitetun syöpää vapaa valvontaa. Tutkimuksessa, paksusuolen ja peräsuolen syövän potilaiden tai terveiden verrokkien, jotka äskettäin oli verensiirtoja suljettiin pois. Syöpäpotilaiden histopatologisia vahvistettu CRC peräkkäin palvelukseen Zhejiangin maakunnan Kansan sairaalan (Hangzhou). Lisäksi ei ollut ikä, vaihe ja histologia rajoitus peräsuolen syövän potilaille. Samaan aikaan kaikki terveet yksilöt satunnaisesti palvelukseen tutkimuksessa ei ollut dokumentointia syövän ja sukupuolen taajuus-sovitetun syöpää vapaa valvonnan iän perusteella (± 5 vuotta). He olivat myös satunnaisesti rekrytoitiin 3500 yksittäisistä ravitsemuksellinen kyselyn Zhejiangin maakunnassa lähes samana ajanjaksona, jossa syöpäpotilaiden otettiin verinäytteet, joiden vaste oli 90%. Kasvain, solmu, etäpesäkkeitä (TNM) luokitus ja tuumorin luokitus oli arvioitu vuonna 2002 American sekakomitean Cancer pysähdyspaikan järjestelmä. Tietoon perustuva suostumus allekirjoitettiin kultakin osallistujalta analysointiin molekyyli korrelaatteja, ja jokainen osallistuja oli määrä haastattelussa valittu tietoja, kuten savu tila, alkoholin kulutus, suvussa ja muita mahdollisia sekoittavat tekijät. Jakaumia valittujen kliinisiä piirteitä asia valvonta-asema on koottu taulukkoon 1. 5 ml verinäytteitä kerättiin ilmoittautuminen kunkin aiheista. Tutkimus hyväksyttiin lääketieteen eettinen komitea Zhejiangin maakunnan Kansan sairaalan.
Genotyyppausanalyysiin
Genominen DNA uutettiin kustakin verinäytteestä saadun kaikki osallistujat käyttämällä Veri Mini Kit (Qiagen, Valencia, CA), ja säilytettiin -80 ° C: ssa. Kolme polymorfismien (rs13347C /T, rs10836347C /T, rs11821102G /A) 3′-UTR
CD44
valittiin ja genotyypitettiin Alleelispesifisiä MALDI-TOF-massaspektrometria-analyysi, kuten aiemmin on kuvattu [21]. Primerit paria ja multiplex reaktiot suunnitellut Reals NP.com sivuston. Noin 10% MALDI-TOF-massaspektrometrialla analysoiduista näytteistä valittiin satunnaisesti sokkoutettujen toista. Laadunvalvontatarkoituksiin, 50 näytteet analysoitiin uudelleen suoralla sekvensoinnilla ja tulokset olivat 100% sopimukseen.
rakentaminen lusiferaasin Toimittajat
Genotyping varten
CD44
SNP osoitti rs13347C /T oli merkitsevästi yhteydessä CRC riski. Perustuu bioinformatiikan analyysi (SNPinfo Web-palvelin: https://snpinfo.niehs.nih.gov/), The rs13347C jotta rs13347T siirtyminen sai uuden sitoutumisen mikroRNA HSA-mir-509-3p. Siksi me arveltu, että SNP rs13347C /T klo microRNA sitovat kohdat saattavat vaikuttaa sitova kyky HSA-mir-509-3p, ja siten ollut vaikutusta
CD44
ilme. Tämän hypoteesin testaamiseksi, The 358bp 3′-UTR-fragmentti ihmisen
CD44
geenin reunustavien rs13347C tai rs13347T alleeli syntetisoitiin Genewiz Company (Suzhou, Kiina), ja sitten ne kloonattiin psiCHECK2 perusvektoriin (Promega, Madison, WI, USA) ja renilla ja tulikärpäsen lusiferaasi-geenin sekvenssejä (kuvio 1A). Kaksi konstruktioita (psiCHECK2-
CD44
-rs13347C ja psiCHECK2-
CD44
-rs13347T) sekvensoitiin vahvistamaan alleelin ja eheyden kunkin insertin.
(A) edustaja kuvaaja lusiferaasin aktiivisuuden variantin alleelin lusiferaasireportterista geenejä, joissa on 358bp 3′-UTR fragmentti ihmisen
CD44
geenin reunustavien rs13347C /T-polymorfismi. Suhteellinen lusiferaasin aktiivisuus psiCHECK2-
CD44
-rs13347C ja psiCHECK2-
CD44
-rs13347T konstruktioita kotransfektoitiin tai ilman 40pmol HSA-mir-509-3p tai 40pmol HSA-mir-509-3p estäjän suoritetaan SW260-soluja (B) ja SW116-solut (C). Kuusi rinnakkaista tehtiin kullekin ryhmälle, ja koe toistettiin ainakin kolme kertaa. Tähti osoittaa merkittävä muutos (
P
0,05). Tiedot ovat keskiarvo ± SEM. (D)
CD44
ekspressiotaso 37 CRC kudoksissa yksilöiden eri rs13347C /T genotyyppien (15 rs13347CC, 16 rs13347CT ja 6 rs13347TT);
CD44
ilmaus normalisoitiin
GAPDH
geenin ja esitetään keskiarvona ± SEM. Esitetyt tiedot edustavat vähintään kolmen riippumattoman kokeen. (E) ekspressoitumistaso HSA-miR-509-3p 37 CRC kudoksissa ryhmitelty rs13347C /T genotyypit. HSA-miR-509-3p mRNA: n ekspressio laskettiin suhteessa ilmentymisen
U6
mRNA laskemalla suhteellisia ekspressiotasoja. Tiedot ovat keskiarvo ± SEM,
P
= 0,579. Erot ekspressiotasoja analysoitiin yksisuuntaisella ANOVA testi.
Transient transfektiot ja Lusiferaasimäärityksiä
Kaksi paksu- ja solulinjat SW116 ja SW620 pidettiin L-15 väliaineessa (Gibco, Los Angeles, Kalifornia, USA), jossa 10% naudan sikiön seerumia (Sigma-Aldrich, MO) 37 ° C: ssa kosteutetussa ilmakehässä 5% CO
2. 1 x 10
5 solua kuoppaa kohti ympättiin 24-kuoppaisille levyille (BD Bio tieteet, Bedford, MA, USA) ennen transfektiota. 24 tunnin kuluttua solut sitten transfektoitiin ohimenevästi kuten aiemmin on kuvattu [22, 23] kanssa 1.5μg toimittaja plasmideilla (rs13347C tai rs13347T alleeli) kanssa tai ilman 40pmol on-mir-509-3p jäljittelee tai 40pmol inhibiittoreiden Lipofectamine 2000 protokollan mukaisesti (Invitrogen, Carlsbad, CA). Lusiferaasin määrityksiä, solut otettiin talteen sen jälkeen, kun transfektio 24, ja renilla lusiferaasiaktiivisuus kvantifioitiin Dual-Luciferase Reporter Assay System (Promega, Madison, WI).
Reaaliaikainen PCR
RNA: t 37 CRC kudoksista erilaisilla rs13347C /T genotyypit poimittiin ja käänteiskopioitiin cDNA käyttäen oligo-dT-aluketta. Allelic syrjintä rs13347 polymorfismien
CD44
geeni suoritettiin ABI Prism 7500 Sequence Detection järjestelmä arvioi
CD44
ja
GAPDH
mRNA-tasot perustuvat SYBR-Green menetelmä. Al l kvantitatiivinen tehtiin
GAPDH
sisäisenä standardina. Lisäksi TaqMan MicroRNA määritykset (Applied Biosystems) käytettiin havaitsemaan tausta ilmentyminen on-mir-509-3p CRC kudoksissa mukaan valmistajan protokollaa. Ilmentäminen yleisesti ilmaistu
U6
pieni ydin- RNA käytettiin myös sisäisen valvonnan. Suhteellinen kvantifiointi
CD44
ilmentyminen analysoitiin 2
-ΔΔCT menetelmällä. Kukin määritys tehtiin kolmena kappaleena.
Tilastollinen
Kaksipuoliset chi-neliö testejä käytettiin vertailla eroja jakaumat kliinis-tapausten välillä ja syöpää vapaa valvontaa. Jotta tapauskontrollitutkimuksessa, Hardy-Weinberg tasapaino (HWE) testattiin verrata odotettavissa genotyypin taajuuksia havaitun genotyypin taajuuksia kontrolleissa jonka hyvyys fit chi-neliö testi. Korrelaatio geneettisiä variantteja ja kliinisiä parametrejä tutkittiin käyttäen Chi square testi tarvittaessa. Kertoimet suhteet (syrjäisimmillä alueilla) ja 95%: n luottamusvälit (CI) arvioitiin arvioida korrelaatio rs13347C /T-polymorfismi ja CRC riskiä käyttämällä ehdoton logistisen regression malleja. Kerrostunut analyysi suoritettiin myös arvioida mahdollista vuorovaikutusta
CD44
polymorfismien ja valitut muuttujat CRC riskiä. Tilastolliset vertailut useamman kuin kahden ryhmän arvioitiin yksisuuntaisella ANOVA testejä. Tilastollinen teho laskettiin käyttämällä PS Software (https://biostat.mc.vanderbilt.edu/twiki/bin/view/Main/PowerSample-Size). Tilastolliset analyysit tehtiin käyttäen STATA (versio 10; STATA Corporation). Yhdistys pidetään merkittävinä, kun
P
-arvo oli alle 0,05.
Tulokset
genotyypit ja riski CRC
yhteensä 946 CRC tapausten ja 989 tervettä verrokkia rekrytoitiin analyysimme ja genotyyppi arvioimaan assosiaatioita
CD44
rs13347C /T, rs10836347C /T, rs11821102G /A ja CRC riskiä. Genotyyppi jakaumat kolmen polymorfismien välillä tapausten ja kontrollien on koottu taulukkoon 2. Havaittu genotyyppi taajuudet näistä SNP tutkittu terveillä verrokeilla todettiin olevan sopusoinnussa HWE. Genotyypin tulokset osoittivat, että vain rs13347 oli tilastollisesti merkitsevää yhteyttä CRC riski, ei merkittävää yhdistysten havaittiin muissa SNP. Potilaat, joilla on
CD44
polymorfismi rs13347TT genotyypit liittyi lisääntynyt paksusuolen syövän riskiä tapausten välillä ja valvontaa. Lisäksi kantaja yhdistetyn variantti genotyyppi CT /TT osoitti huomattavasti suurempi riski CRC (OR = 1,79, 95% (CI) = 1,50-2,17),
P
10
-4) verrattuna genotyyppi CC.
suoritetaan lisäksi kerrostunut analyysi rs13347C /T kliinisesti tai patologinen ominaisuudet, kuten ikä, sukupuoli, tupakointi, alkoholin kulutus ja suvussa syöpää. Kuten on esitetty taulukossa 3, oli merkittävä vuorovaikutusta polymorfismin rs13347C /T ja kasvaimen vaiheessa. Havaitsimme, että verrattuna rs13347CC genotyypin potilaiden kanssa TT /TT-genotyyppi oli yli 1,6-kertainen riski kehittää edistyneitä (vaihe III + IV) CRC (
P
= 0,004). Kuitenkaan mitään eroja muiden alaryhmien löytynyt.
vaikutus SNP rs13347C /T reportterigeenin aktiivisuus
kaksi lusiferaasireportteri- konstrukteja, jotka sisältävät rs13347C tai rs13347T alleeli lyhytaikaisesti kotransfektoitiin kanssa matkivat tai estäjä HSA-mir-509-3p jotka ensi kädessä sitoutuminen rs13347C /T polymorfisen mukaan bioinformatiikan analyysi vaikutuksen tutkimiseksi SNP rs13347C /T
CD44
3′-UTR transkription aktiivisuutta. Kuten kuviossa 1B ja 1C microRNA HSA-mir-509-3p matkivat transfektoitujen CRC-soluja voisi merkittävästi vähentää lusiferaasiaktiivisuus reportterigeenin kanssa rs2735383C alleeli verrattuna rs2735383T alleeli (
P
= 0,007 ja SW620 ja
P
= 0,02 SW116). Sitä vastoin aktiivisuus reportterigeenin kanssa rs13347C alleeli merkittävästi tiettyjä kehityssuuntia kääntää lapäisen transfektion jälkeen solujen HSA-mir-509-3p matkivat ja sen vastaavan estäjä. Ei kuitenkaan mitään merkittäviä vaikutuksia reportterigeenit kanssa rs2735383T alleeli hoitoon HSA-mir-509-3p matkivat ja todettiin inhibiittoreita. Nämä tulokset osoittivat, että C T pohja muutosta rs13347C /T häiritsee sitoutumiskohta HSA-mir-509-3p, lisäsivät transkriptionaalista aktiivisuutta
CD44
geeni.
Association välillä rs13347C /T genotyypit ja
CD44
ilmaisu
suorittaa reaaliaikaisia PCR arvioida vaikutuksia rs13347C /T
CD44
ilmaisua käyttäen 37 tuumorikudoksia käsittelemättömästä CRC potilaalla on eri genotyypit. Kuten on esitetty kuviossa 1D, tulokset osoittivat, että potilailla, joilla on rs13347T genotyypit (CT ja TT) kanna merkittävästi suurempi
CD44
mRNA-tasot (keskiarvo ± keskivirhe keskiarvon (SEM): 0,565 ± 0,057), verrattuna kantajia rs13347CC genotyyppien (keskiarvo ± SEM: 0,305 ± 0,050, ANOVA testi:
P
= 0,003). Ja me analysoidaan yhdistyksen välillä HSA-mir-509-3p ilmaisun ja
CD44
rs13347C /T genotyypit. HSA-mir-509-3p ilmentyy jatkuvasti 37 tuumorikudoksissa käsittelemättömästä CRC potilaalla on eri genotyypit; kuitenkin, ei ollut merkittävää yhdistyksen välillä taustan ilmaisun HSA-mir-509-3p ja
CD44
rs13347C /T genotyyppien (0.037 ± 0.008 CC; 0,027 ± 0,005 CT ja 0,029 ± 0,011 TT ; ANOVA testi:
P
= 0,579) (kuvio 1 E).
keskustelu
tässä esillä molekyyli epidemiologinen tutkimus, tutkimme yhdistysten kolmen SNP 3 ’ -UTR on
CD44
geenin paksusuolisyövän riskin Kiinan väestön ja totesi, että rs13347C /T oli merkitsevästi liittyy suurentunut riski CRC. Havaitsimme myös merkittävää kohonnut CRC kasvaimen vaiheesta liittyy rs13347T muunnos alleeli annoksen tavalla. Lisäksi toiminnalliset kokeet osoittivat, että rs13347T variantti voi merkittävästi muuttaa HSA-mir-509-3p välittämä
CD44
transkriptionaalisen aktiivisuuden ja ilme aktiivisuutta. Tulokset osoittavat, että variantit
CD44
geeni voi olla arvokas riskinarviointia, diagnoosi ja geneettinen epidemiologinen analyysi CRC.
CD44
geeni sijaitsee sen kromosomilokuksen 11p13 ja koodaa laajalti ilmaistaan solun pinnan läpäisevä glykoproteiini eri solutyyppejä. Proteiini pääasiassa sisältää kanssa N-päässä (tähteet 38-46) ja C-terminaalinen osa ekstrasellulaarisen domeenin (tähteet 150-162), jonka tiedetään olevan tarpeen sitoutumista monipuolinen ohjelmistoon ligandien, kuten hyaluronihappo (HA), osteopontiinin ja matriksimetalloproteinaasi [24]. On olemassa useita rivejä kokeellinen todiste rooli
CD44
mukana laaja valikoima soluprosesseja lukien lymfosyyttien aktivointi, apoptoosin, hematopoieesin, kierrätystä ja itseohjautuva [25-27].
CD44
on hyvin dokumentoitu kasvainta edistävää aktiivisuutta, joka on muun muassa edistää kasvainsolujen kasvua, erilaistumista ja etäpesäkkeiden [28]. Monet molekyylibiologian tutkimuksissa on todettu, että
CD44
ilmentyminen liittyy läheisesti eri syöpäsairauksia esiintymistä, etenemisen ja ennusteen [29-32]. Poikkeuksellisen,
CD44
havaittiin myös tärkeä rooli CRC kehittämisessä. Tuore tutkimus perustuu 234 CRC potilaat ovat osoittaneet, että lisääntynyt
CD44
ilmentyminen CRC korreloi etäpesäkkeitä, lisääntynyt varhainen kasvaimen uusiutumisen ja chemoresistance [33]. Viimeaikaiset kokeellista näyttöä sekä
in vitro
klonogeeniset ja
in vivo
tuumorigeenisia määritys paljasti, että CD44 (+) CRC solujen ominaisuudet näyttöön syövän kantasolujen [18], mikä osoittaa toiminnallinen merkitys
CD44
CRC aloittamisen ja kehittämisen. Tasaisen, olemme laatineet geneettisiä assosiaatio ilmaus
CD44
ja riski CRC. Lisäksi toiminnalliset analyysit osoittivat, että
CD44
rs13347C /T SNP voi vaikuttaa
CD44
ilmentymistä muuttamalla HSA-mir-509-3p sitoutumisen 3′-UTR
CD44
geeni. Aiemmat tutkimukset ovat raportoineet, että HSA-mir-509-3p voi olla tärkeä rooli tuumorisuppressorigeeniä aikana syövän muodostumisen [34, 35]. Eikä merkittävää assosiaatiota taustan ilmaisun HSA-mir-509-3p ja
CD44
rs13347C /T genotyyppien havaittiin tutkimuksessa, mikä osoittaa, että jotkut tunnistamattomia mekanismit moduloiva vaikutus HSA-mir-509- 3p on rs13347T genotyypit voi olla olemassa. Tuloksemme osoittivat, että C-T-emäs muutos rs13347C /T mahdollisesti häiritsee sitoutumiskohta HSA-mir-509-3p, lisää transkriptionaalista aktiivisuutta
CD44
-geenin ja siten oli alttiimpi CRC.
Tässä tutkimuksessa olemme ensimmäinen osoitti, että
CD44
rs13347C /T vaihtelua myötävaikuttaa lisääntynyt riski CRC. Nykyinen tutkimus perustuu suhteellisen suuri, satunnainen, etnisesti homogeenista, mikä tarkoittaa, että on mahdollista välttää sekoittavia puolueellisuudesta. On huomioitava, että tilastollinen teho nostettiin olevan 0,91 (kaksipuolinen testi, α = 0,05) havaitsemisessa OR = N varten rs13347CT + TT-genotyyppien (esiintyvät taajuudella 41.56% keskuudessa kontrollit) verrattuna rs13347CC genotyyppi . Lisäksi yhdistys on biologisesti uskottava, mikä viittaa siihen, tämä havainto on huomionarvoista.
Kaiken kaikkiaan tämä on ensimmäinen raportti löytää yhdistyksen välillä polymorfismin rs13347C /T sijaitsevat HSA-mir-509-3p sitoutumiskohta, jotka voivat vaikuttaa
CD44
mRNA ekspressiotason ja riski CRC. Lisäksi meidän tutkimus osoitti, että verrattuna CD44 rs13347CC genotyyppi, variantti genotyyppien (CT + TT) annetaan suurentunut CRC väestölle. Lisäksi riski vaikutus tämän polymorfismi on selvempi kasvain vaiheessa (III + IV) CRC potilaista. Suuremmat, mieluiten väestöpohjainen tapaus-verrokki-tutkimukset ovat tarpeen vahvistaa assosiaatioita
CD44
polymorfismien eri ihmisen maligniteettien eri etnisten ryhmien välillä.
Kiitokset
Tutkimus oli tukee Zhejiangin maakunnan Natural Science Foundation (nro 2013C33106).