Krooninen sairaus

tiivistelmä

ylläpito tasapaino kommensaali bakteerien ja limakalvon immuunijärjestelmän järjestelmä on ratkaisevan tärkeää ja suoliston dysbiosis voi olla keskeinen tapahtuma patogeneesissä peräsuolen syöpä (CRC). Tietulli kaltainen reseptori 4 (TLR4) on tärkeä malli tunnustamatta reseptorin, joka säätelee tulehdusta ja suojavaikutuksen suolistossa mekanismilla, joka käsittää aktivaation Nukleaaritekijä-KB (NF-KB) transkriptiotekijä. Ruokavalion ja elämäntapa tekijät voivat vaikuttaa näitä toimintoja. Siksi käytetään tanskalainen tulevaisuuteen tapauskohtaisesti kohorttitutkimuksen 1010 CRC tapauksissa ja 1829 satunnaisesti valittua osallistujaa Tanskan Diet, Cancer ja terveys kohortti tutkia kolme polymorfismien

NFKB1

ja

TLR4

ja niiden mahdollisia yhteisvaikutuksia ruokavalion ja elämäntapa tekijöitä suhteessa riskin CRC. Homotsygoottinen kuljetus variantin alleelin

TLR4 Twitter /rs5030728 polymorfismi liittyi suurentunut CRC (esiintyvyys suhde (IRR) = 1,30; 95%: n luottamusväli (CI): 1,05-1,60; p = 0,02 (geeni-annos malli); IRR = 1,24; 95% CI: 1,01-1,51; p = 0,04 (väistyvä malli)). Del-harjoittajien

NFKB1 Twitter /rs28362491 polymorfismi oli 17% (95% CI: 1,03-1,34; p = 0,02) kohonnut CRC verrattuna homotsygoottisia kantajia ins-alleelin. Kuitenkaan mikään näistä riskiarvioita kestäneet säätö monivertailuja. Emme löytäneet vahvaa geeni-ympäristö vuorovaikutukset tutkittiin polymorfismin ja ruokavalio ja elämäntavat tekijät suhteessa CRC riskiä.

Citation: Kopp TI, Andersen V, Tjonneland A Vogel U (2015) polymorfismit

NFKB1

ja

TLR4

ja Vuorovaikutus ruokavalion ja Yksityiselämä tekijät Suhde peräsuolen syövän tanskalaisessa tulevaisuudentutkimuksen asia-seurantatutkimus. PLoS ONE 10 (2): e0116394. doi: 10,1371 /journal.pone.0116394

Academic Toimittaja: Jeffrey S. Chang, National Health Research Institutes, Taiwan

vastaanotettu: 21 elokuu 2014; Hyväksytty: 09 joulukuu 2014; Julkaistu: 23 helmikuu 2015

Copyright: © 2015 Kopp et ai. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään

Data Saatavuus: kaikki asiaankuuluvat tiedot kuuluvat paperin ja sen tukeminen Information tiedostoja.

Rahoitus: hanke tukivat PhD stipendi Tanskan toimikuntien ohjelmassa ”yhdennetty lähestymistapa riskien ja hyötyjen arviointi ihmisen terveysvaikutuksia elintarvikkeita ja ruoka epäpuhtaudet ”(Forskeruddannelse 2009-10), ja jonka Mobility PhD apurahan (09-06 7572) Tanskan neuvoston riippumattomia Research (www.ufm.dk) ja osana projektin:” Naudanlihan versus sianlihan kulutus etiologia syövistä paksusuolen ja peräsuolen: tutkimukset suoritettu Diet, Cancer ja terveys kohortti ”myös Tanskan neuvoston riippumattomia Research; Medical Sciences (myönnä. 09-073597) (www.ufm.dk). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.

Kilpailevat edut: Kirjoittajat lukenut lehden politiikan ja ovat seuraavat kilpailevia intressejä: VA saa korvausta konsulttina Merck Co., Inc. (MSD) ja Janssen. Tämä ei muuta tekijöiden noudattaminen PLoS One politiikkaa jakaa tietoja ja materiaaleja.

Johdanto

peräsuolen syöpä (CRC) on kolmanneksi yleisin syöpä tyyppi miehillä ja toiseksi naisilla maailmanlaajuisesti [1]. Perinnöllinen tekijät arvioidaan edistää vain 35% riski [2] korostetaan ympäristötekijöiden etiologiassa CRC. Todellakin, ruokavalion ja elintapojen tekijät ovat intensiivisesti tutkittu niiden rooli peräsuolen syövän synnyn; ja alkoholi, tupakointi, liikalihavuus ja korkea lihan nauttiminen on nyt vakiintunut riskitekijöitä CRC [3-5]. Saanti punaista ja lihajalosteiden on potentiaalia asiakkuutta syövän kemiallisilla karsinogeenien muodostuu kypsennyksen aikana lihan korkeissa lämpötiloissa [6], myrkyllisten käyminen yhdisteiden [7-9] tai indusoimalla tulehdus muutoksista johtuvat bakteerien koostumuksessa [10] . Kääntäen, kuitu, hedelmät ja vihannekset tarjoavat lyhytketjuisia rasvahappoja (SCFAs) ja paksusuolen epiteelin käymisen imeytymättömän ravintokuidun ja tärkkelyksen [11-15]. SCFA-butyraatti on tärkeä koolonin eheys [14], inhiboi syöpäsolujen kasvua

in vitro

[16,17] ja on anti-inflammatorisia ominaisuuksia pääasiassa estämällä tumatekijä-KB: n (NF-KB) aktivointi [18].

Toll-like-reseptorien (TLR) ovat tärkeitä kuvio tunnustamisesta reseptoreja, jotka säätelevät tulehdusta ja suojavaikutuksen suolistossa jolloin säilytetään tasapaino kommensaali bakteerien ja limakalvon immuunijärjestelmää [19,20] . Reseptori gram-negatiivisten bakteerien lipopolysakkaridin (LPS), TLR4, säätelee solujen lisääntymistä vasteena solun vammoja induktion syklo-oksigenaasi-2: n ilmentymisen [21] kaskadiin, johon NF-KB: n ja epidermaalinen kasvutekijä [22] viittaa siihen, että TLR4 on tärkeä tekijä siirtymistä tulehdus neoplasiaksi [19]. Todellakin, lisääntynyt ekspressio TLR4 on yhdistetty kehittämiseen tulehdukseen liittyvä neoplasia [23-26]. Lisäksi olemme aiemmin löytänyt todisteita siitä, että tulehdus voi myötävaikuttaa CRC syövän synnyn. Siten geneettisesti määritetty korkea IL-1β: n ja COX-2-tasot liittyy lisääntynyt riski CRC [27].

dysbiosis suolistossa voi olla keskeinen tapahtuma patogeneesissä sekä tulehduksellisten suolistosairauksien (IBD) ja CRC. Käyttämällä toiminnallinen yhden emäksen monimuotoisuus (SNP) ja niiden vuorovaikutus ruokavalio ja elämäntyyli voivat paljastaa tärkeitä reittejä ja peräsuolen syövän synnyn [28]. Koska

TLR

polymorfismit on liitetty IBD [29], pyrittiin tutkimaan mahdollisia keskinäisen mekanismi IBD ja CRC.

Olemme aiemmin osoittaneet, että kuljettaminen variantin del-alleeli toiminnallinen ins /del

NFKB1 Twitter /rs28362491 polymorfismi liittyy lisääntynyt riski CRC ja vuorovaikutuksessa lihan saanti osajoukko nykyisen tutkimusryhmän [30] kanssa johtuu kahdesta muista tutkimuksista myös raportointi lisääntynyt riski CRC keskuudessa variantti kantajia polymorfismin keskuudessa malesialainen [31] ja Ruotsin väestöstä [32], mutta ei kiinalainen tutkimusryhmän [32]. Toimiva SNP

TLR4

(rs4986790) on tutkittu laajasti ja on liittynyt neoplastisia etenemiseen

in vitro

[33], aggressiivinen ihmisen paksusuolen syöpä [33], IBD [34-37 ] ja CRC [38-40]. Kuitenkin toiset eivät kyenneet löytämään yhdistyksen välillä CRC ja SNP [41-43]. Kanadalaisessa tutkimuksessa [44], saanti ruokavalion tyydyttyneiden rasvahappojen kääntäen verrannollinen veren HDL-kolesteroli yksilöissä, jotka ovat homotsygoottisia

TLR4

/rs5030728 G-alleelin.

TLR4 Twitter /rs5030728 voi siis vuorovaikutuksessa ravinnon komponenttien suolistossa.

Niinpä odotimme, että tulehdus on tärkeä tekijä peräsuolen syövän synnyn ja siten tutki ruokavaliota ja elämäntapaa tekijät (ei- steroideihin kuulumattomien tulehduskipulääkkeiden (NSAID) ja tupakointi) muuttaa CRC riskiä muuttamalla limakalvon immuunivasteen suolistossa kautta vuorovaikutuksessa TLR4 ja NF-KB. Siksi arvioidaan kolmen polymorfismien

NFKB1

ja

TLR4

ja niiden mahdolliset vuorovaikutusta ruokavalion ja elämäntapa tekijöitä prospektiivisessa kohortissa 1010 CRC tapauksissa ja 1829 satunnaisesti valittua osallistujaa Tanskan Diet, Cancer ja Health Study.

Materiaalit ja menetelmät

Opintoja aiheista

Diet, Cancer ja terveys tutkimus on jatkuva tanskalainen kohorttitutkimuksessa tarkoitus on tutkia suhdetta ruokavalion, elintapojen ja syöpäriski [45]. Kohortti koostuu 57053 henkilöiden palvelukseen joulukuun 1993 ja toukokuun 1997 Kaikki aiheet syntyivät Tanskassa, ja yksilöt olivat 50-64 vuotta ikää ja ei ollut aikaisempaa syövät tutkimuksen alkaessa. Verinäytteet ja kyselyn tiedot ruokavalion ja elintapojen kerättiin tutkimuksen alussa.

Seuranta ja päätepisteet

Seuranta perustui väestöpohjaiset syöpärekisterit. Vuosina 1994 ja 31 joulukuu 2009, 1010 CRC tapausta ei todettu. Sub-kohortti 1829 henkilöiden valittiin satunnaisesti sisällä kohortti. 28 henkilöä olivat molemmissa tapauksissa ja osa-kohortti johtuen käytetyn tutkimuksen suunnittelu [46]. 245 puuttuvien genotyyppitietoja ja 16 puuttuvat tiedot riskitekijöistä suljettiin pois. Kaikki tiedot genotyyppejä ja ruokavalion ja elintapojen tekijöitä oli käytettävissä 915 CRC tapauksissa ja 1719 osa-kohortti jäsentä.

Ruokavalion ja elintapojen kyselylomake

Tietoa ruokavalion, elintapojen, paino, pituus, sairaanhoidon ympäristöaltistuminen, ja muut sosioekonomiset tekijät kerättiin ilmoittautuminen kyselylomakkeiden ja haastattelujen avulla ja on kuvattu yksityiskohtaisesti muualla [27,47-49]. Lyhyesti, ruoka-taajuus kyselylomake, ruokavalio kulutus arvioitiin 12 luokkiin ennalta vastauksia, ranking ”ei koskaan” on ”vähintään kahdeksan kertaa päivässä”. Päivittäinen saanti laskettiin sitten FoodCalc [45]. Tupakointi asema luokiteltiin koskaan menneet tai nykyiset. Henkilöt, tupakointi vähintään 1 savuke päivässä viime vuoden aikana luokiteltiin tupakoitsijoita. NSAID käyttö ( ”Aspirin”, ”Parasetamoli”, ”Ibuprofeeni” tai ”Muut kipulääkkeiden) arvioitiin ≥ 2 pilleriä kuukaudessa yhden vuoden aikana lähtötilanteessa.

genotyypin

Valkosolukerros valmisteita säilytettiin miinus 150 ° C: ssa käyttöön asti. DNA uutettiin, kuten on kuvattu [50]. DNA genotyypitettiin LGC KBioscience (LGC KBioscience, Hoddesdon, Yhdistynyt kuningaskunta) PCR-pohjainen KASP genotyypitysmääritys (Error! Hyperlinkki viittaus ei kelpaa. Www.lgcgenomics.com/).

NFKB1 Twitter /rs28362491 analysoitiin ja raportoitu osajoukko nykyisen tutkimusryhmän [30]. Kaksi polymorfismien (

NFKB1 Twitter /rs28362491 ja

TLR4 Twitter /rs4986790) valittiin perustuen tunnettuja toimintoja ja niiden yhdessä CRC [30-33] ja IBD [34-37] alkaen kirjallisuudesta.

TLR4 Twitter /rs5030728 polymorfia, toisaalta, ei ole tunnettuja toimintoja. Kuitenkin

TLR4 Twitter /rs4986790 on tiiviisti sidoksissa

TLR4 Twitter /rs5030728 (D ’: 1,0; r

2: 0,017) käyttäen Haploview versio 4.2 (Broad Institute of MIT ja Harvard, Cambridge) [51] kanssa HapMap3 Genome Browser julkaisu # 2 (vaihe 3) [52]; ja koska

TLR4 Twitter /rs5030728 on suurempi vähäinen alleelin esiintymistiheys valkoihoisilla kuin

TLR4 Twitter /rs4986790 (0,305 vs. 0,035), tämä polymorfismi sopii paremmin geenien ympäristön vuorovaikutus analyysit. Vahvista toistettavuus, genotyypitys toistettiin 10% näytteistä saatiin 100% identiteetti.

Tilastollinen

Poikkeaminen Hardy-Weinberg tasapaino arvioitiin käyttäen Chi-square test.

Esiintyvyys korko suhteet (IRR) ja 95%: n luottamusväli (CI) laskettiin periaatteiden mukaisesti analysoimaan tapauskohtaisesti kohorttitutkimusten käyttäen un painotettu lähestymistapa [46]. Ikä käytettiin ajassa Coxin regressio malleja. Testit ja luottamusvälit perustuivat Wald testit käyttäen robusti arvio varianssi-kovarianssimatriisi regressioparametrit Coxin regressiomalleihin [53] kuten aikaisemmin on kuvattu [27,46,48,54-61].

Kaikki mallit oikaistiin perusarvoja riskitekijöitä ja peräsuolen syövän kuten painoindeksi (BMI) (kg /m

2, jatkuva), käyttö hormonikorvaushoito (HRT) (ei koskaan /ohi /nykyinen, naisilla), saanti ravintokuitua (g /päivä, jatkuva), ja punaista lihaa ja lihajalosteita (g /päivä, jatkuva) ja lisäksi epäiltyjen riskitekijöiden, kuten NSAID käyttö (kyllä ​​/ei) ja tupakoinnista (ei koskaan /ohi /nykyinen). Vilja, kuitu, hedelmät ja vihannekset lisäksi kirjattiin lineaarisesti. Kaikki analyysit ositettiin sukupuolen, niin että perus (taustalla) vaarat olivat sukupuolen mukaan jaoteltuina. Kaikkien polymorfismien, IRR laskettiin erikseen heterotsygoottinen ja homotsygoottinen variantti alleelin kantajia. Sillä

TLR4 Twitter /rs4986790 ja

NFKB1 Twitter /rs28362491, variantti alleelin kantajia myöhemmin ryhmitelty vuorovaikutuksen analyysit koska mitään väistyvä vaikutuksia ei havaittu.

TLR4 /

rs5030728 päätellyt sekä geeni-annoksen ja väistyvä tila myöhemmissä analyyseissä.

Lisäksi arvioimme viikoittain käyttöä NSAID tulosten perusteella tutkimuksen paksusuolisyövän sisällä Diet, Cancer ja terveys kohortti [62] raportoi, että pitkäaikainen johdonmukainen käyttö aspiriinia tai ei-aspiriini NSAID näyttää saavuttamiseksi tarpeen suojaava vaikutus. Kuitenkin, ei ollut eroja riskiestimaattien välillä kuukausittain tai viikoittain käyttö siten säilyttää tilastollinen voima kerroksissa; käytimme kuukausittain NSAID käytettäväksi analyyseissä.

uskottavuusosamäärä käytettiin vuorovaikutuksen analyysit välillä tutkittu polymorfismien ja saanti punaista ja lihajalosteiden, ravintokuitua, viljat, kala, hedelmät, vihannekset, alkoholin käyttö, tupakoinnista ja NSAID käyttöä. Vuorovaikutuksessa analysoi jossa ruokavaliotekijät kirjattiin kategorisen muuttujia, tertile cutpoints perustuivat empiirinen jakaminen miehen ja naisen tapauksissa vastaavasti. Mahdollisia yhteisvaikutuksia tutkittiin käyttämällä uskottavuusosamäärä.

Kaikki analyysit suoritettiin käyttäen SAS versiossa 9,3 (SAS Institute Inc., Cary, NC). A s 0,05 pidettiin merkittävänä. Lisäksi testata useita vertailuja, Bonferronin korjausta käytettiin.

Ethics selvitys

Kaikki osallistujat antoivat suullinen ja kirjallinen suostumus. Ruokavalio, Cancer ja terveys Tutkimuksen hyväksynyt kansallisen komitean Health Research Ethics (aikakauslehti nr. (KF) 01-345 /93) ja Tanskan tietosuojavirasto.

Tulokset

Baseline ominaisuudet tutkimusväestöstä esitetään taulukossa 1. Niistä osa-kohortin jäsentä, genotyyppi jakauma SNP ei poikennut Hardy-Weinberg tasapaino (tuloksia ei esitetä).

Yhdistykset välillä polymorfismien ja CRC

Homozygous variantti kantajia

TLR4 Twitter /rs5030728 polymorfismi oli 1,30-kertainen (95% CI: 1,05-1,60) lisääntynyt riski CRC geenin annoksen mallin ja 1,24 kertainen (95% CI: 1,01-1,51) suurentunut CRC verrattuna villin tyypin ja heterotsygoottinen harjoittajien resessiivinen mallissa (taulukko 2). Lisäksi kantajia

NFKB1

del-alleeli oli 17% (95% CI: 1,03-1,34) suurentunut CRC verrattuna homotsygoottisia kantajia ins-alleelin (taulukko 2). Nämä riskiestimaattien ei kuitenkaan päästä tilastollisesti merkittäviä jälkeen Bonferroni korjauksen. Ei ollut vuorovaikutusta kahden riskin genotyyppiä

TLR4 Twitter /rs5030728 ja

NFKB1 Twitter /rs28362491 mutta toisaalta ei ollut additiivista vaikutusta on homotsygoottisia kantaja kummankin variantin alleelien (S1 taulukko ).

Gene-ympäristön analyysit

Emme löytäneet vuorovaikutusta tahansa ruokavaliotekijät ja tutkittu polymorfismien suhteessa riskin CRC lineaarisen analyyseissä (S2 taulukko). Vuonna tertile analyysissä oli heikko vuorovaikutus

TLR4 Twitter /rs5030728 ja saanti vihannekset (Gene-annos malli: P-arvo vuorovaikutus (P

int) = 0,05; Peittyvä malli: P

int = 0,03) (taulukko 3). Lisäksi tilastollisesti merkittävän rajoilla vuorovaikutusta lihan saannin ja

NFKB1 Twitter /rs28362491 polymorfismi (P

int = 0,06) havaittiin (taulukko 3). For ins-kantajia, riskiestimaattien olivat vertailukelpoisia eri kolmannekseen lihan saannin. Toisaalta joukossa del-kantajia, saanti lihan toisen (IRR = 1,46; 95% CI: 1,17-1,83) ja kolmas tertile (IRR = 1,24; 95% CI: ,99-+1,56) liittyi riski CRC, kun taas del-alleelin kantajia eivät olleet vaarassa ensimmäisellä tertile alhainen lihan saanti (IRR = 0,98; 95% CI: 0,78-1,23). Mitä alkoholia, variantti kantajia

NFKB1 Twitter /rs28362491 ja homotsygoottinen A-alleelin kantajia

TLR4 Twitter /rs5030728 liittyivät CRC riski verrattuna PCR-tuotteiden harjoittajat osallistujien on alhainen alkoholin. Lisäksi muunnokseen harjoittajien kaikkien kolmen polymorfismien, alhainen saanti (ensimmäinen tertile) alkoholia liittyi korkein CRC riski verrattuna kohtalainen (toinen tertile) nauttiminen-, joka liittyi pienin riski-ja runsas alkoholin nauttiminen (kolmas tertile ) (taulukko 3).

ei ollut vuorovaikutusta NSAID käytön tai tupakoinnista ja tutkituilla genotyyppien (S3 ja S4 taulukot). Niistä tupakoimattomien (S4 taulukko), mutta

TLR4 Twitter /rs5030728 polymorfismin osoitti geenin annoksen vaikutus, joka on verrattavissa tuloksiin nähnyt osallistujien alhainen alkoholin (taulukko 3). Mallissa, jossa riski CRC oli päätelty per 25 g saanti lihaa päivässä jaettu NSAID käytön riskiä CRC mukaan lihan määrä kasvoi annoksesta riippuvalla tavalla keskuudessa variantti alleelin kantajia

TLR4 Twitter /rs5030728 puuttuessa NSAID käytön, mutta ei joukossa NSAID-käyttäjille (S5 taulukko). Siten liha saanti ei liittynyt riskiä keskuudessa homotsygoottisia kantajia villityypin alleelin, kun taas lihan saanti liittyi 4% suurempi riski kohti 25 g lihaa /vrk (95% CI: 1,00-1,09) keskuudessa heterotsygooteilla ja 11% lisääntynyt riskien joukossa homotsygoottinen variantti alleelin kantajia (95% CI: 1,02-1,22). Kuitenkin, ei ollut tilastollisesti merkittäviä yhteisvaikutuksia (S5 taulukko).

Keskustelu

Tässä tutkimuksessa olemme huomanneet, että homotsygoottinen variantti kuljettaminen

TLR4 Twitter /rs5030728 ja variantti vaunun on

NFKB1 Twitter /rs28362491 polymorfismi liittyi suurentunut CRC, mutta ei korjauksen jälkeen useita testejä. Olemme vain löytänyt heikko vuorovaikutus muutaman ruokavaliotekijät ja siten emme pystyneet toistamaan aiemmin havaittu vuorovaikutus

NFKB1 Twitter /rs28362491 polymorfismi ja lihan saanti. Puute yhdistyksen välillä

TLR4 Twitter /rs4986790 ja CRC löytyy tässä tutkimuksessa voisi johtua erittäin alhainen muunnos alleelifrekvensseiltään Tanskan väestöstä. Vain yksi henkilö oli homotsygoottinen variantti alleelin kantaja. Siksi ei voida sulkea pois, että toiminnallinen vaikutus tämän SNP vaikuttaa peräsuolen syövän syntymistä.

NFKB1 Twitter /rs28362491 polymorfismi on melko johdonmukaisesti liitetty CRC riski [30-32], ja jossain määrin lisäksi IBD [29,63,64]. Kuten aiemmin on kuvattu [65,66],

NFKB1

koodaa p50 /p105 alayksikön transkriptiotekijän NF-KB: n. NF-KB koostuu homo- tai heterodimeerejä useita eri alayksiköiden p65, p50, p105, C-rel ja relB [67,68] ja yhdistelmä määrittää kohdegeenin spesifisyyden. Koska p65 /p50-heterodimeerin, kompleksi on tulehdusta [68], kun taas p50-homodimeeri on anti-inflammatorisia ominaisuuksia [65,67,69,70]. Suhteellinen runsaus p50 /p65-heterodimeerien ja p50-homodimeerien näin ollen määrittää suuruuden tulehduksen tasapainottamalla proinflammatoristen ja anti-inflammatorinen vaste [67].

NFKB1

/rs28362491 polymorfismi tuottaa deleetion neljän nukleotidin promoottorialueella aiheuttaa alensi transkription tasoa ja näin ollen osittain väheneminen p50 [63]. Tästä samaa mieltä, todettiin, että mRNA tasot

NFKB1

olivat alhaisempia paksusuolen koepaloja tervettä kudosta homotsygoottinen del-kantajia verrattuna heterozygootit [71]. Tämä haittaavasta anti-inflammatorinen vaste muodostamisesta lähtien proinflammatoristen p65 /p50-heterodimeerin riippuu pitoisuudesta p50, kun taas muodostumista tulehdusta p50-homodimeeri riippuu pitoisuudesta p50 potenssiin [65].

TLR4 Twitter /rs5030728 polymorfismi ei ole vielä liitetty CRC [20] ja sen toiminta on tuntematon [72].

TLR4 Twitter /rs4986790, joka on liittynyt IBD ja CRC, on tiiviisti sidoksissa

TLR4 Twitter /rs5030728. On siis epäselvää, kumpi polymorfismien on biologisesti relevantti yksi. Kuitenkin meidän tulokset osoittavat, että kuljettaminen

TLR4 Twitter /rs4986790 ei liittynyt vaaraa CRC, kun taas kuljettaminen

TLR4 Twitter /rs5030728 liittyi riski. Tämä viittaa siihen, että tuomien riskien

TLR4 Twitter /rs5030728 kuljetus ei johtunut sidonnaisuudet

TLR4 Twitter /rs4986790. Mielenkiintoista, variantti kuljettaminen

TLR4 Twitter /rs5030728 A-alleeli on liittynyt hyödyllinen vaste anti-TNF-hoidon potilailla, joilla on IBD [73], mikä tarkoittaa, että näillä potilailla saattaa olla suurentunut lähtötilanteessa aktiivisuutta tai ilmentymistä TLR4.

kaksi

TLR4

SNP ovat läsnä useita yleisesti käytetty GWAS paneelit (https://www.broadinstitute.org/mpg/snap/ldsearch.php) taas ins /del

NFKB1 Twitter /rs28362491 polymorfismi ei valvota sidoksen GWAS [65]. Mikään kaksi TLR4: SNP liittyivät CRC GWAS. Kuitenkin pääpaino oli etsiä geenin ympäristön vuorovaikutukset sijaan tunnistaa lokusten vahva yhdistysten CRC. Gene ympäristön vuorovaikutukset ovat harvoin arvioidaan GWAS.

Emme löytäneet vahvoja viitteitä geenien ja ympäristön vuorovaikutukset. Muunnokseen kantajia

NFKB1 Twitter /rs28362491 ja homotsygoottinen A-alleelin kantajia

TLR4 Twitter /rs5030728, riski CRC keskuudessa matalan lihan kuluttajien oli pienempi kuin keski- ja korkean lihan kuluttajia, joilla oli riski arvioiden välillä 1,24 ja 1,70 osoittaa vahvempi rooli lihan peräsuolen syövän synnyn keskuudessa potilailla, joilla on geneettisesti määritetty korkea tulehdusreaktiota. Vaihtoehtoisesti liha saanti covaries muiden elintapatekijät että

sinänsä

aiheuttaa tulehdusvasteen, että emme ole pystyneet säätämään varten.

löytyi vuorovaikutusta vihanneksia ja

TLR4

/rs5030728 esillä olevassa tutkimuksessa ei ole suoraan tulkittavissa ja saattaa johtua pienten ryhmien kolmannekseen. Kuitenkin vihanneksia näytti hieman lisätä riskiä CRC tässä tutkimuksessa, joka olisi käsiteltävä muiden mahdollisten tutkimuksissa.

rajoitti tilastollinen voima havaita geeni ympäristön vuorovaikutukset. Kuitenkin ennakoiva tutkimus suunnittelussa käytettiin tässä tutkimuksessa on hyvin geeni-ympäristö vuorovaikutus analyysejä johtuen kokoelma ruokavalion ja elämäntapojen tekijät ennen diagnoosia, poistaa vaaran muistaa puolueellisuudesta. Muuttaminen ruokavalion ja elämäntapa tottumukset seurannan aikana on kuitenkin mahdollista, mutta ei odoteta aiheuttavan ero Luokitteluvirheillä tapausten välillä ja vertailuryhmä. Lisäksi tässä tutkimuksessa ryhmä on homogeeninen koostuu tanskalaisista ja kaksi tutkittu polymorfismien on korkea alleeli taajuuksilla. Käyttäen esillä Study Group, olemme aikaisemmin löytäneet geenin ympäristön vuorovaikutukset ruokavalion ja

IL10

rs3024505 (P

int; liha = 0,04, kala = 0,007, kuitu = 0,0008, vihannekset = 0,0005),

IL1B

C-3737T (P

int; NSAID käyttö = 0,040),

PTGS2

G-765C (P

int; liha = 0,006, kuitu = 0,0003, hedelmiä 0,004) ja

PTGS2

T8473C (P

int; hedelmä = 0,03) ja

PTGS2

A-1195G (P

int, kuitua 0.020 ja tupakointi = 0,046) [27] . Sopeutimme riskiestimaattien epäiltyjen riskitekijöiden ja huolellisesti valittu polymorfismien perustuva toiminta ja /tai aiemmin päätelmiä yhdessä ruokavaliotekijät, CRC tai IBD. Kuitenkaan yksikään analyysien kesti säätämällä useita testejä. Siten emme voi sulkea pois, että havainnot johtuvat sattumasta eikä niitä sen vuoksi ei voida pitää merkittävinä yhdistyksiä.

Yhteenvetona tämä tutkimus ei pystynyt osoittamaan assosiaatioita tutkittu polymorfismien tulehduksellinen välittäjänä geenit

NFKB1

ja

TLR4

kuin mikään todettu yhdistysten kesti säätö monivertailuja. Emme löytäneet vahvaa geeni-ympäristö vuorovaikutukset tutkittiin polymorfismien ja ruokavalio ja elämäntavat tekijät suhteessa CRC riskiä.

tukeminen Information

S1 Taulukko. IRR CRC suhteessa yhdistelmiä

NFKB1 Twitter /rs2836249 ja

TLR4 Twitter /rs5030728 genotyyppien.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0116394.s001

(DOCX)

S2 Taulukko. Vuorovaikutus ruokavaliotekijät ja tutkittu polymorfismien suhteen CRC riskiä.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0116394.s002

(DOCX)

S3 Taulukko. Vuorovaikutus NSAID käytön ja tutkittu polymorfismien suhteen CRC riskiä.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0116394.s003

(DOCX)

S4 Taulukko. Vuorovaikutus tupakoinnista ja tutkituilla polymorfismien suhteessa riskin CRC.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0116394.s004

(DOCX)

S5 Taulukko. Vuorovaikutus NSAID käytön ja tutkittu polymorfismien per 25 g punaista ja lihajalosteiden saanti päivässä suhteessa CRC riskiä.

Doi: 10,1371 /journal.pone.0116394.s005

(DOCX) B

Kiitokset

Kiitämme Nick Martinussen ja Katja Boll teknistä apua tietojen hallintaan; ja Jane Christensen tilastollisiin konsultointi. Hanke tukivat PhD stipendi Tanskan toimikuntien ohjelmassa ”yhdennetty lähestymistapa riski-hyötysuhteen arvioinnissa ihmisten terveysvaikutusten Elintarvikkeiden ja epäpuhtaudet” (Forskeruddannelse 2009-10), ja jonka Mobility PhD apurahan (09 -06 7572) Tanskan neuvoston riippumattomia Research (www.ufm.dk) ja osana projektin: ”Naudanlihan versus sianlihan kulutus etiologiassa syöpiä paksusuolen ja peräsuolen: tutkimukset suoritettu Diet, Cancer ja terveys kohortti ”myös Tanskan neuvoston riippumattomia Research; Medical Sciences (myönnä. 09-073597) (www.ufm.dk). Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.