PLoS ONE: genomiikkaa syytöksiä EGFR alavirran välittäjänä NKX2-1 Amplified ei-pienisoluinen keuhkosyöpä
tiivistelmä
NKX2-1
, joka koodaa homeobox transkriptiotekijä, monistetaan noin 15% ei-pienisoluisen keuhkosyövässä (NSCLC), missä sen ajatellaan ajaa syöpä solujen lisääntymisen ja eloonjäämisen. Kuitenkin sen toimintamekanismi on edelleen suurelta osin tuntemattomia. Tunnistavat sellaiset alavirtaan transkription tavoitteet, tässä toteutimme yhdistetyn NKX2-1 transcriptome (NKX2-1 Knockdown seuraa RNAseq) ja cistrome (NKX2-1 sitoutumiskohdat by ChIPseq) analyysi neljässä
NKX2-1
– monistettu ihmisen NSCLC solulinjoissa. Vaikka NKX2-1 geenien erosivat yksi neljästä solulinjoista määritettiin, soluproliferaatiota muodostunut yhteinen teema. Lisäksi 3 4 solulinjojen, epidermaalisen kasvutekijän reseptorin (EGFR) oli joukossa NKX2-1 voimistunut tavoitteita, jota vahvistettiin proteiinin tason Western blot. Mielenkiintoista, EGFR knockdown johti säätelyä NKX2-1, mikä viittaa negatiivinen kierre. Sopusoinnussa tämän havainnon yhdistetyn knockdovvn NKX2-1 ja EGFR NCI-H1819 keuhkosyövän soluja vähentää solujen lisääntymistä (sekä MAP-kinaasin ja PI3-kinaasi signalointi) yli knockdovvn joko yksinään. Samoin NKX2-1 pudotus parantaa kasvua estävä vaikutus, että EGFR-inhibiittorin erlotinibi. Yhdessä meidän Pääteltiin EGFR kuin alavirtavaikuttajainhibiittorit NKX2-1 in
NKX2-1
monistetaan NSCLC, joilla voi olla kliinistä merkitystä, ja tarjoavat runsaasti aineisto tutkimiseksi lisää välittäjiä NKX2-1 ajettu oncogenesis.
Citation: Clarke N, Biscocho J, Kwei KA, Davidson JM, Sridhar S, Gong X, et al. (2015) genomiikkaa syytöksiä EGFR alavirran välittäjänä
NKX2-1
Amplified ei-pienisoluinen keuhkosyöpä. PLoS ONE 10 (11): e0142061. doi: 10,1371 /journal.pone.0142061
Editor: Jen-Tsan Ashley Chi, Duke University, Yhdysvallat