PLoS ONE: KRAS, BRAF ja PIK3CA mutaatiot ja menetys PTEN Expression Kiinan Potilaat, joilla on peräsuolen syövän
tiivistelmä
Background
tutkimiseksi taajuus ja suhde
KRAS
,
BRAF
ja
PIK3CA
mutaatioita ja menetys PTEN ilmaisun Chinese potilailla, joilla on kolorektaalisyöpä (CRC).
Menetelmät /Principal Ensimmäisen
Genominen DNA uutettiin formaliinilla kiinnitetyt, parafiiniin upotettuja (FFPE) kudoksissa 69 potilasta histologisesti vahvistettu CRC. Automatisoitu sekvenssianalyysi tehtiin havaitsemiseksi mutaatioita
KRAS
(kodonit 12, 13, ja 14),
BRAF
(kodoni 600) ja
PIK3CA
(kodonit 542, 545 ja 1047). PTEN-proteiinin ilmentymistä arvioitiin immunohistokemiallisesti 3 mm FFPE kudosleikkeiden. Tilastollinen analyysi suoritettiin käyttäen SPSS 16.0 ohjelmistoa. Taajuus
KRAS
,
BRAF
ja
PIK3CA
mutaatioita ja menetys PTEN ilmaisun oli 43,9% (25/57), 25,4% (15/59), 8.2 % (5/61) ja 47,8% (33/69), vastaavasti. Yleisimmät mutaatio
KRAS
,
BRAF
ja
PIK3CA
oli V14G (26,7% kaikista mutaatioista), V600E (40,0% kaikista mutaatioista) ja V600L (40,0 % kaikista mutaatiot), ja H1047L (80,0% kaikista mutaatiot), respectivly. Kuusi
KRAS
mutatant potilasta (24,0%) kanna
BRAF
mutaatioita.
BRAF
ja
PIK3CA
mutaatiot olivat toisensa poissulkevia. Mitään merkittävää korrelaatiota ei havaittu neljän biomarkkereita ja potilaiden ominaisuuksista.
Johtopäätökset /merkitys
BRAF
mutaatio on selvästi korkeampi tässä tutkimuksessa kuin muissa tutkimuksissa, ja päällekkäisiä paljon jossa
KRAS
mutaatioita. Sitä paitsi tietyn tyyppisten
KRAS
ja
PIK3CA
mutaatioita Kiinan potilaat voivat olla aivan erilainen kuin potilaiden muissa maissa. Lisätutkimukset ovat perusteltuja tutkimaan niiden vaikutuksia ennustetta ja vastauksena kohdennetun hoidon.
Citation: Mao C, Zhou J, Yang Z, Huang Y, Wu X, Shen H, et al. (2012)
KRAS
,
BRAF
ja
PIK3CA
mutaatiot ja menetys PTEN Expression Kiinan Potilaat, joilla on peräsuolen syövän. PLoS ONE 7 (5): e36653. doi: 10,1371 /journal.pone.0036653
Editor: Tšad Creighton, Baylor College of Medicine, Yhdysvallat
vastaanotettu: 04 tammikuu 2012; Hyväksytty: 08 huhtikuu 2012; Julkaistu: 7. 2012
Copyright: © 2012 Mao et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään.
Rahoitus: No current ulkopuolisen rahoituksen lähteet tässä tutkimuksessa.
kilpailevat edut: kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.
Johdanto
Kaksi monoklonaalisia vasta-aineita (MoAb) suunnattu kasvutekijän (EGFR), kimeerinen IgG1 MoAb setuksimabia ja täysin humanisoidun IgG2 panitumumabi, ovat osoittautuneet tehokkaiksi yhdessä kemoterapian tai ainoana lääkkeenä metastasoituneen kolorektaalisyövän (metastasoitunutta kolorektaalisyöpää) [1], [2], [3] . Kuitenkin tehoa MoAb ei vastaa jokaiselle potilaalle; jotkut potilaat kokevat dramaattisen vastaus Moab, kun taas toiset eivät osoita vastetta [4], [5], [6]. Helpottaakseen valintaa metastasoitunutta kolorektaalisyöpää potilaille, jotka saattavat hyötyä anti-EGFR MoAbs hoitoja, on olemassa selkeä tarve tunnistaa ennustavan biomarkkerit, jotka osoittavat todennäköisyyttä vasteen keskuudessa mahdollisten vastaanottajien.
On raportoitu, että onkogeenisia aktivointien solunsisäinen signalointi reittejä alavirtaan EGFR, kuten RAS-RAF-MAPK ja PI3K-PTEN-AKT signalointireittien ovat tärkeitä mekanismeja tuottaa vastustuskykyä EGFR MoAbs. RAS-RAF-MAPK-reitin, aktiivinen mutaatiot
KRAS
tai
BRAF
eivät ole harvinaisia, koska tällaiset mutaatiot ovat läsnä 35,0-45,0% ja 4,0-15,0% of metastasoituneen kolorektaalisyövän potilaista vastaavasti [7]. Vuonna PI3K-PTEN-AKT-reitin aktivaation, mutaatiot
PI3KCA
tai menetys PTEN ilmentymisen havaitaan 10,0-18,0% ja 19,0-42,0% ja metastasoituneen kolorektaalisyövän lla potilaista [7]. Mutaatiot
PIK3CA
, voivat toimia joko
KRAS
tai
BRAF
samassa kasvain [8], mutta
KRAS
ja
BRAF
mutaatiot näyttävät olevan toisensa poissulkevia [7].
Toistaiseksi
KRAS
mutaatioita on tunnistettu ennustava markkeri resistenssin EGFR MoAbs potilailla, joilla metastasoituneen kolorektaalisyövän, ja käyttää anti-EGFR MoAbs enää vain metastasoitunutta kolorektaalisyöpää sairastavien potilaiden villityypin
KRAS
[9]. Kuitenkin esiintyminen
KRAS
mutaatiot osuus on vain noin 30%: sta 40%: nonresponsive potilaista [10]. Potilailla, joilla
KRAS
villityypin kasvaimia, jää epäselväksi, miksi suuri määrä potilaita ei ole vielä reagoi hoitoon. Viime aikoina muita kasvaimia synnyttävän mutaatioita, kuten
BRAF
[11], [12],
PIK3CA
mutaatioita [10] tai menetyksen PTEN ilmaisun [12], [13], löytyy todennäköisesti lupaava ennustavat vastus metastasoitunutta kolorektaalisyöpää sairastavilla potilailla villityypin
KRAS
.
Useimmat tutkimukset, jotka selvitettiin ennustearvo
KRAS
,
BRAF
,
PIK3CA
mutaatioita ja menetys PTEN ilmaisun tehtiin länsimaissa. Tiedetään vain vähän suhteesta näiden biomarkkereiden kanssa kliinisiä tuloksia MoAb hoidon kiinalaisille potilaille metastasoituneen kolorektaalisyövän. Emme edes tiedä, kuinka usein näiden biomarkkereiden esiintyi Chinese potilailla. Tässä tutkimuksessa selvitimme tila
KRAS
,
BRAF
,
PI3KCA
mutaatio ja PTEN ilmentymisen primaarikasvaimen 69 Chinese metastasoitunutta kolorektaalisyöpää potilaita, selventää nopeudella mutaatiot ja havaita korrelaatio mutaatioiden ja kliinis tekijöistä.
Materiaalit ja menetelmät
potilaiden ja kudosnäytteiden
analyysi suoritettiin 69 potilasta, joilla on histologisesti vahvistettu peräsuolen syöpä ( 40 urosta ja 29 naarasta, joiden keski-ikä 54 vuotta), joille tehtiin tuumoriresektion at Nanfang sairaalan aikana heinäkuun 2010 maaliskuuhun 2011. Kuusikymmentä yhdeksän primaarikasvaimen kerättiin kirurgisista näytteistä. Kaikki kerätyt näytteet ovat formaliinilla kiinnitetyt, parafiiniin upotettuja (FFPE) kudoksiin. Tutkimus hyväksyi institutionaalisten eettisen komitean Nanfang sairaalan ja suoritettiin institutionaalisten suuntaviivoja. Kirjallinen suostumus antoivat potilaiden tietonsa tallennetaan sairaalan tietokantaan ja käyttää tutkimustarkoituksiin. Tutkimuksessamme kirjallinen suostumus ei saatu osallistujat, koska tutkimus oli retrospektiivinen ja meidän analysoitiin anonyymisti. Yhteenveto demografiset ja kliinis Aineisto lueteltu taulukossa 1. Potilaat, jotka koskaan tupakoinut vähintään yhden savukkeen päivässä vähintään 6 kuukautta luokiteltiin tupakoitsijoita, kuten tupakoivat ja edellinen tupakoitsijoita. Loput potilaat luokiteltiin tupakoimattomia. Mietimme potilaita, joilla on vähintään 3 annosta viikossa keskimäärin kahden viime vuoden juovat, kun taas loput potilaat luokiteltiin ei-juomari.
DNA: n eristämistä ja mutaatioanalyysiin KRAS, BRAF ja PIK3CA
kaksi asianmukaista FFPE näytteet valittiin kullekin potilaalle. Jokaista näytettä, kolme 5-10 um: n leikkeitä valmistettiin. Genominen DNA uutetaan standardi SDS-proteinaasi K menettely. Uuton jälkeen DNA puhdistettiin.
etsitään mutaatioita
KRAS
eksonin 2,
BRAF
eksonin 15 ja
PIK3CA
eksonit 9 ja 20.
KRAS
eksoni 2 sisältää kodonit 12, 13 ja 14,
BRAF
eksoni 15 sisältää kodonin 600,
PIK3CA
eksoni 9 sisältää kodoneja 542 ja 545 ja
PIK3CA
eksoni 20 sisältää kodonin 1047, jossa valtaosa mutaatioita tapahtuu näiden geenien [11]. Kymmenen eri mutaatioiden
KRAS
kodonien 12, 13 ja 14 (G12C, G12D, G12V, G12R, G12A, G12G, G13D, G13G, V14G ja V14A), 4 eri mutaatioiden
BRAF
kodoni 600 (V600E, V600Q, V600L ja V600V), 4 eri mutaatioiden
PIK3CA
Kodonit 542 ja 545 (E542K, E545K, E545G ja E545A) ja kaksi
PIK3CA
kodoni 1047 (H1047R ja H1047L) havaittiin. Nukleotidisekvenssin, joka vastaa jokaisen eksonin monistettiin uutettu genomi-DNA: sta. Taulukossa 2 esitetään luettelo alukkeita käytetään kunkin eksonin. Edellytykset monistamiseen eksonin tietyillä alueilla genomisesta DNA: sta PCR: llä, on kuvattu aikaisemmassa tutkimuksessa [11]. PCR-tuotteet altistettiin automatisoitu sekvensointi ABI PRISM 3730 (Applied Biosystems, Foster City, CA, USA). Kaikki mutatoidut tapausta vahvistettiin kahdesti riippumattoman PCR-reaktioissa. Uusia tietoja ei tuotettu tutkimuksessamme. Tulokset mutaation analyysit esitetään liitteessä S1 ja S2 (luvut sekvensointi tulokset).
PTEN ilmaisu
PTEN-proteiinin ilmentymistä arvioitiin immunohistokemiallisesti 3
mm
FFPE kudosleikkeiden raportoitu edellisessä tutkimuksessa [13]. Monoklonaalinen anti-hiiri anti-ihmis-PTEN-vasta-ainetta käytettiin 1: 50 laimennus. Jokainen ajaa mukana asianmukaisten positiivisten ja negatiivisten kontrolli dioja. Puolikvantitatiivista pisteet annettiin PTEN värjäystä kasvainkudoksen kaksi riippumatonta patologia ilman tietoa kliinisten tietojen tai tulosten molekyyli- analyysejä: negatiivinen (-), mitään värjäytymistä lainkaan; heikko (+), heikko värjäytyminen riippumatta positiivinen solu prosenttiosuuksien tai kohtalainen värjäytymisen ≤30% soluista; kohtalainen (++), kohtalainen värjäys 30% soluista tai vahvoja värjäytymisen ≤50% soluista; voimakas (+++), vahva värjäys 50%: ssa soluista. Kasvainten PTEN tulokset -, + tai ++ katsottiin olevan PTEN menetys. Luvut immunohistokemiallista analyysia varten esitetään liitteessä S3.
Tilastollinen
Tilastollinen analyysi suoritettiin SPSS 16.0 (SPSS, Inc., Chicago, IL). Χ
2 testiä ja Fisherin testiä käytettiin vertaamaan osuus
KRAS
,
BRAF PIK3CA
mutaatioita ja menetys PTEN ilmaisun eri ennusteeseen viittaavia ryhmissä. Vaikutusten tutkimiseksi kovarianttien geenimutaatioita, useita regressioanalyysimme käyttäen eteenpäin vaiheittain (todennäköisyys suhde) menetelmää suoritettiin kerroinsuhde (OR) laskettuna. Alustava testaus mukana ikä, sukupuoli, tupakointi historia, juominen historia, kasvain sivusto ja erilaistumista. Vain muuttujat osoittavat tilastollisesti merkittävää yhteyttä geenimutaatioita tehtiin lopullinen regressioanalyysillä. Kaksipuolinen merkitys asetettiin arvoon P 0,05.
Tulokset
KRAS
mutaatio
KRAS
mutaatiostatuksesta asema oli testattu 57 tuumorikudoksissa, joista 25 (43,9%) kanna ainakin yksi mutaatio kodoneissa 12, 13 tai 14. spektri näiden mutaatioiden on esitetty yhteenvetona taulukossa 3. Kahdeksantoista (31,6%) kudoksiin oli mutaatio kodonissa 12, 4 (7,0%), kodonissa 13 ja 8 (14,0%), kodonissa 14. yleisin mutaatio oli V14G, joka edusti 26,7% kaikista mutaatioita, minkä jälkeen G12D (20,0% kaikista mutaatioita). Viisi kudokset oli samanaikainen mutaatiot kaksi kodonia (liite 1). Emme löytäneet mitään merkittävää yhdistyksen välillä KRAS mutaatioita ja potilaiden ominaisuuksien perusteella yhden muuttujan analyysin (taulukko 4) ja monimuuttujamenetelmin (tuloksia ei esitetty).
BRAF
mutaatio
Olemme havainneet
BRAF
kodonin 600 mutaation 15 (25,4%) ulos 59 kasvain kudosten. Yleisin mutaatio oli V600E (40,0% kaikista mutaatioita) ja V600L (40,0% kaikista mutaatioita) (taulukko 3).
BRAF
ja
KRAS
mutaatiot eivät ole toisiaan poissulkevia, jossa 24,0%
KRAS
mutatoitunut potilaista ja 29,0% villin tyypin
KRAS
potilaiden kätkeminen
BRAF
mutaatioita (kuvio 1). Mitään merkittävää assosiaatio
KRAS
mutaatioita ja potilaiden ominaisuuksien havaittiin yhden muuttujan analyysin (taulukko 4) ja monimuuttujamenetelmin (tuloksia ei esitetty).
PIK3CA
mutaatio
tila
PIK3CA
mutaatiot analysoitiin 61 tuumorikudoksissa 5 myönteisiä tuloksia, eli yhteensä mutaatioaste 8,2%.
PIK3CA
Exon9 mutaatio havaittiin ainoastaan yksi (1,7%) ulos 58 kasvaimen testatuissa kudoksissa (taulukko 3). Sitä vastoin,
PIK3CA
Exon20 mutaatioita tunnistettiin 4 ulos 57 kasvaimen kudokset (7,0%), jotka kaikki ovat H1047L (taulukko 3).
KRAS
ja
PIK3CA
mutaatiot eivät ole toisiaan poissulkevia (kuvio 1). Kolme (12,0%)
KRAS
mutatoitunut potilailla oli
PIK3CA
mutaatioita, jotka kaikki sijaitsevat Exon20, kun taas kaksi (6,3%)
KRAS
villin tyypin potilaiden kanna
PIK3CA
mutaatioita, yksi Exon9 ja toinen Exon20. Huomattavaa on, että
BRAF
ja
PIK3CA
mutaatiot olivat toisensa poissulkevia esillä potilasryhmässä. Mitään merkittävää assosiaatio
PIK3CA
mutaatioita ja potilaiden ominaisuuksien havaittiin yhden muuttujan analyysin (taulukko 4) ja monimuuttujamenetelmin (tuloksia ei esitetty).
Menetys PTEN ilmaisun
testasimme PTEN ilmentymistä 69 tuumorikudoksissa. Menetys PTEN ekspressiota havaittiin 33 heistä (47,8%), ja ei toisiaan poissulkevia kanssa
KRAS
,
BRAF
tai
PIK3CA
mutaatiot (kuva 1). Neljätoista (56,0%)
KRAS
mutatoitu potilaista oli menetys PTEN ekspression (kuvio 1). Emme havainneet mitään tilastollisesti merkitsevästi yhteydessä PTEN ilmaisun ja potilaiden ominaisuuksien perusteella yhden muuttujan analyysin (taulukko 4) ja monimuuttujamenetelmin (tuloksia ei esitetty).
Keskustelu
Tässä tutkimuksessa havaitsimme eri mutaatiot KRAS, BRAF ja PIK3CA geenien sekä menetys PTEN ilmentymisen 69 Kiinan CRC potilailla. Lisäksi olemme myös yrittäneet korreloivan mutaatiot joitakin kliinisiä ja patologisia piirteitä. Jotkin aiemmat tutkimukset ovat tutkineet suhde näiden molekyylitason tapahtumien ja erilaisten kliinispatologiset ominaisuudet. Tulokset olivat kuitenkin epäjohdonmukaisia. Esimerkiksi Sartore-Bianchi et ai havaittu, että
KRAS
mutaatiot olivat merkitsevästi enemmän naisilla kuin miehillä, kun taas
PIK3CA
mutaatioita ja menetys PTEN eivät merkittävästi yhteydessä sukupuoleen, ikään tai sivusto kasvaimen [14]. Sen sijaan Barault et al ja Benvenuti et al havaitsivat, että
PIK3CA
ja
BRAF
mutaatioita, mutta ei mutaatioiden
KRAS
, tapahtuu suuremmalla taajuudella naisilla kuin miehillä [10]. Kiinalaisessa CRC potilailla, Shen et al havaitsivat, että sukupuoli oli ainoa tekijä, joka osoitti ilmeinen suhde
KRAS
mutaatioita (female 44,7% vs. uros 28,2%, P = 0,037) [15]; Liou ym raportoitu useammin
KRAS
mutaatioita naisilla ja tupakoimattomilla, ja
KRAS
ja
BRAF
mutaatioita liittyi merkittävästi proksimaalisen sijainti syöpä [16 ]. Kuitenkin tutkimuksessa Li et al,
BRAF
mutaatiota ei korreloinut iän, sukupuolen, histologinen tyyppi tai Dukes pysähdyspaikan, mutta yhteistyössä olemassa
KRAS
ja
PIK3CA
mutaatiot olivat todennäköisemmin kehittyä maksan etäpesäke [17].
Tässä tutkimuksessa, emme löytäneet mitään merkittäviä korrelaatioita näiden molekyylitason tapahtumia ja eri kliinis-(taulukko 4), joka voi olla osittain johtuvat suhteellisen pieni otoskoko. Havaitsimme joitakin mahdollisia suuntauksia. Esimerkiksi
KRAS
mutaatioita ja menetys PTEN näytti olevan suurempi naisilla kuin miehillä. Lisäksi
KRAS
,
BRAF
ja
PIK3CA
mutaatioita näytti olevan useammin ne, joilla juomista tai tupakointia historiaa. Kuitenkin suurempia tutkimuksia tarvitaan tehdä selvää päätöstä näistä kysymyksistä.
KRAS
geeni koodaa 21 kDa RAS proteiinia, joka on jäsen GTPaaseja perheen mukana signaalitransduktioprosesseista. Mutaatiot
KRAS
voi konstitutiivisesti aktivoida proteiini signalointi poistamalla GTPaasi toimintaa [15]. On todettu, että
KRAS
mutaatiot ovat ennustavia biomarkkeri kestävyys EGFR monoklonaalisia vasta-aineita (MoAbs) käsittely suhteen vaste, ilman taudin etenemistä ja kokonaiselinaika. Aiempien raporttien,
KRAS
mutaatioaste CRC potilaiden vaihtelee 20,0%: sta 50,0%, useimmiten noin 35,0% -45,0% [10], [15]. Tässä tutkimuksessa 43,9%: lla oli mutantti
KRAS
genotyyppi, mikä tarkoittaa, että jos
KRAS
mutaatiostatuksesta riippumatta testaus kohdistetaan valita ehdokkaita EGFR MoAbs hoidon osuus Kiinan CRC potilaat, jotka eivät kuulu on samanlainen kuin muissa maissa.
on kuitenkin syytä huomata, että tässä tutkimuksessa, 14,0%: lla potilaista oli kodonin 14 mutaatiota (V14G). Niistä harvoissa tutkimuksissa, joita on kiinnostusta kodonissa 14, iso sarja Yhdysvaltain osoitti, että kodonin 14 mutaatiota (V14I) esiintyi vain 0,1% CRC potilaista [18]. Eikä tiedetä, ovatko nämä variantit ovat erityisiä patogeenisyyden [18]. Näin ollen olisi mielenkiintoista nähdä ovatko tulokset ovat toistettavissa tulevaisuudessa Kiinan potilaille metastasoituneen kolorektaalisyövän. Vielä tärkeämpää on, lisätutkimuksia perusteltua tutkia vaikutuksia kodonin 14 mutaatiota potilaiden ennustetta ja vastaus anti-EGFR MoAbs. Jos nämä mutaatiot eivät resistenssiä hoidon jälkeen enemmän kiinalaisia metastasoitunutta kolorektaalisyöpää potilaat voivat hyötyä anti-EGFR MoAbs.
Aiemmissa raporteissa Länsi väestön, G12D siirtymät olivat useimmin havaittu laji
KRAS
kodonin 12 mutaatiota, jonka jälkeen G12V, G12C, G12S ja G12A [18], [19]. Kuitenkin Tutkimuksessamme vastaava järjestys on G12D, G12V, G12A, G12G ja G12C, joista G12G nähtiin harvoin muissa tutkimuksissa. Kuten kodonin 13 mutaatiota, joista suurin osa oli G13D, jonka jälkeen G13C ja G13R Länsi-populaatioissa [18], [19]. Esillä olevassa tutkimuksessa vain G13G, äskettäin löydetty variantti, ja G13D havaittiin. Nämä tiedot viittaavat siihen, että saattaa olla rotuun eroja malleja
KRAS
mutaatioita. On raportoitu, että käyttämällä setuksimabia liittyy pidentymistä ja ilman taudin etenemistä potilailla, joilla on kemoterapian tulenkestävä peräsuolen syövän G13D-mutatoitunut kasvaimia kuin potilailla, joilla muut
KRAS
-mutated kasvaimissa [20]. Onko joitakin harvoin tai uusia mutaatioita löytyi tutkimuksessamme liittyy myös parempia hoitotuloksia vielä tiedetä ja ansaitsee lisätutkimuksia.
Samanlainen KRAS-geeniä,
BRAF
koodaa myös proteiineja, jotka toimivat RAS-RAF-MAPK signalointireitin. Aiemmat tutkimukset, kiinalaisen ja länsimaisen, kertoi, että
BRAF
mutaatioita havaittiin 5,0% -10,0% CRC potilaista. Yllättäen tutkimuksemme osoitti melko korkea mutaationopeus, 25,4%, ja
BRAF
. Mahdollinen selitys on, että useimmat tutkimukset on
BRAF
mutaatio keskittyivät V600E vain [21], kun taas meidän Tutkimuksessa analysoitiin neljä erilaista mutaatiota, eli V600E, V600Q, V600L ja V600V. Kuitenkin myös De Roock tutkimuksessa on tunnistanut D594G, V600E, V600M ja K601E, mutaatio oli vain 10,9% [22]. Siksi mutatoituvan voimakkaasti tutkimuksessamme voi johtua muista syistä, kuten rotuun ero ja ympäristötekijät. Ei vielä ole yksimielisyyttä ennakoivan roolin
BRAF
mutaatioita EGFR MoAbs hoidossa metastasoituneen kolorektaalisyövän. Jotkut havaittu, että V600E mutaatio liittyi huonompi tulos metastaattisen CRC hoidetuilla potilailla anti-EGFR MoAbs [23]. Toiset ehdottivat, että tämä mutaatio oli vain yleinen ennustetekijä sijaan ennakoiva tekijä erityinen anti-EGFR monoklonaalisia vasta-aineita, koska sen suhde huonoon ennusteeseen on riippumaton annetusta hoito [24]. Mutaatiot
KRAS
ja
BRAF
geenit ovat usein todettu olevan toisensa poissulkevia kolorektaalisyövässä, sekä Länsi-ja kiinalaisten potilaiden [25], [26]. Niinpä yleensä, jossa on
KRAS
mutaatioaste oli 40,0% ja
BRAF
mutaatioaste 10,0%, yksi kuudesosa eli 16,7%
KRAS
villin tyyppi potilaat tunsivat
BRAF
mutaatioita. Huomattavaa on, että
BRAF
mutaatioiden päällekkäin paljon jossa
KRAS
mutaatiot tässä tutkimuksessa, jossa 29,0% villin tyypin
KRAS
potilaiden kätkeminen
BRAF
mutaatioita. Jos
BRAF
mutaatioita käytettiin edelleen valita villityypin
KRAS
potilaiden anti-EGFR MoAbs hoidon jälkeen merkitsevästi enemmän kiinalaisia metastasoitunutta kolorektaalisyöpää potilaita voidaan sulkea pois.
PIK3CA geeni koodaa p110 katalyyttisen alayksikön PI3K joka säätelee reitit [27]. Yhteisymmärryksessä aiempien tutkimusten kanssa, huomasimme, että mutaatio korko
PIK3CA
on 8,7%, ja
PIK3CA
mutaatiot ovat samanaikainen kanssa
KRAS
mutaatioita [10], [23 ], [28]. Lisäksi havaitsimme useamman mutaation eksonissa 20 kuin eksoni 9, joka on johdonmukaista tutkimusten kanssa, Kiinan potilaista [29], [30], mutta aivan eri tuloksia Western populaatioissa. Tämä on erittäin tärkeää, koska eksonin 9 ja eksonin 20 mutaatiot poikkeavat suuresti vaikuttaa vastauksena anti-EGFR MoAbs. Aikaisemmat systemaattinen tarkastelun perusteella, että
PIK3CA
eksoni 20 mutaatioita liittyi pienempi vasteprosentti, lyhyempi ilman taudin etenemistä ja kokonaiselinaika ja voi siten olla mahdollinen biomarkkeri vastustuskykyä EGFR MoAbs in
KRAS
villityypin metastasoituneen kolorektaalisyövän, kun taas
PIK3CA
eksoni 9 mutaatiot näyttänyt olevan mitään tällaista roolia [31]. Siksi testaamalla
PIK3CA
mutaatiostatus, useammat kiinalaiset metastasoitunutta kolorektaalisyöpää potilaita voidaan estää saamasta EGFR MoAbs, johon ne ovat kestäviä.
retrospektiivinen yhteenliittymä analyysi yli 1000 kasvaimia kerätty seitsemästä Euroopan maasta, De Roock havaittu, että E542K, E545K ja Q546K mutaatiot eksoni 9 osuus oli 15,6%, 26,8% ja 4,2% kaikista
PIK3CA
mutaatioita, kun taas H1047R ja H1047L mutaatioiden eksonissa 20 osuus 20,5% ja 3,8% kaikista mutaatioista [22]. Esillä olevassa tutkimuksessa, kuitenkin, yleisin tyyppi mutaatioiden havaitsimme ei H1047L, ei edellä mainittua kohteiden, kuten E542K, E545K tai H1047R. Tämä osoittaa, että voi olla suuria vaihteluita eri rotuja. Kiinnostavaa kyllä, huomasimme, että jokainen potilas, joka toteutetaan
PIK3CA
mutaation analyysi kanna E542K ja E545K mutaatioita. Me katsotaan näitä ”vääriä positiivisia” tuloksia, joita on raportoitu muiden [32].
Menetys PTEN ilmaisun, joka oli raportoitu esiintyvän 19,0% -42,0% Länsi- ja 30,0% -64,0 % Kiinan CRC kasvaimia [13], [33], [34], [35], [36], [37], indusoi kasvua PIP-3 pitoisuus ja
PIK3CA
reitin aktivointi [23] . Olemme havainneet menetys PTEN ilmentymisen 47,8%: lla potilaista, sopusoinnussa aikaisempien tutkimusten. Menetys PTEN ekspression on raportoitu antaa kasvaimen vastustuskykyä EGFR MoAbs [38]. Koska tämä PTEN menetys voi elää rinnakkain
PIK3CA
mutaatioita, mikä näkyy esillä ja muista tutkimuksista, on usein vaikea erottaa osuus menetys PTEN tästä on
PIK3CA
mutaatioita puutteesta vastausta [28].
vahvuus tutkimuksen on kattava analyysi neljä biomarkkereita Kiinan metastasoituneen kolorektaalisyövän potilaalla. Kuitenkin näytteiden koko on suhteellisen pieni, mikä tekee joitakin havaintoja tuloksettomia. Lisäksi emme kerää tietoja hoitoon ja kliinisiin tuloksiin, jotka otetaan esille tulevissa tutkimuksissa.
Yhteenvetona, tämä tutkimus lisää todisteita siitä, että
KRAS
ja
PIK3CA
mutaatiot ja menetys PTEN ilmaisun Kiinan metastasoituneen kolorektaalisyövän potilaalla esiintyy vastaavalla tasolla kuin Länsi potilailla. Kuitenkin
BRAF
mutaatio on selvästi korkeampi tässä tutkimuksessa kuin aiemmissa tutkimuksissa. Lisäksi tietyn tyyppisten
KRAS
ja
PIK3CA
mutaatioita Kiinan väestön voisi olla melko erilainen kuin potilaiden muissa maissa, varsinkin kun otetaan huomioon suhteellisen tiheä
KRAS
kodonin 14 mutaatiota ja
PIK3CA
eksonin 20 mutaatioita. Nämä havainnot on tärkeitä vaikutuksia yksilöllisten kiinalaisen metastasoituneen kolorektaalisyövän potilaista. Lisätutkimukset ovat perusteltuja tutkimaan vaikutuksia joidenkin
KRAS
,
BRAF
ja
PIK3CA
mutaatioiden ennustetta ja vastauksena kohdennetun hoidon.
tukeminen Information
Liite S1.
Patterns of KRAS, BRAF ja PIK3CA mutaatioita.
doi: 10,1371 /journal.pone.0036653.s001
(DOC) B Lisäys S2.
sekven- KRAS, BRAF ja PIK3CA mutaatioita.
doi: 10,1371 /journal.pone.0036653.s002
(DOCX) B Lisäys S3.
immunohistokemiallinen värjäys PTEN kolorektaalisyövässä kudoksessa ja normaalissa kudoksessa.
doi: 10,1371 /journal.pone.0036653.s003
(DOC) B