PLoS ONE: geneettinen Sian Model of Cancer
tiivistelmä
suuri koko sian ja sen samankaltaisuus anatomiaa, fysiologiaa, aineenvaihduntaa, ja genetiikan ihmisille tekevät siitä ihanteellisen pohjan kehittää geneettisesti määritelty, suuri eläinmallissa syöpä. Tätä varten olemme luoneet transgeeninen ”oncopig” linja koodausta Cre rekombinaasin indusoituva sian siirtogeenien, jotka koodaavat KRAS
G12D ja TP53
R167H, jotka edustavat yleisesti mutatoitunut onkogeeni ja tuumorisuppressoriproteiinia ihmisen syövissä, vastaavasti. Solujen käsittely johdettu näistä oncopigs kanssa adenovirus koodaus Cre (AdCre) johti KRAS
G12D ja TP53
R167H ilmaisua, joka teki solut muunnettava kulttuuriin ja tuumorigeenisia kun Siirto tehty osaksi heikentynyt immuunivaste hiiriin. Lopuksi, injektio AdCre suoraan näihin oncopigs johti nopeaan ja toistettavissa kasvainten kehittymistä mesenkymaaliset. Siirtogeenisiä eläimiä sai AdGFP (vihreää fluoresoivaa proteiinia) ei ollut mitään syöpäkasvaimen muodostumisen tai muuttaa histopatologia. Tämä oncopig linja voisi siten toimia geneettisesti tempervalurautaisten malli mahdollisesti monenlaisia syöpiä, kontrolloimalla ajallinen tai alueellinen genesis, joka pitäisi olla korvaamaton tutkimuksiin haitanneet puute suuren eläinmallin syöpää.
Citation: Schook LB, Collares TV, Hu W, Liang Y, Rodrigues FM, Rund LA, et ai. (2015) geneettinen Sian Model of Cancer. PLoS ONE 10 (7): e0128864. doi: 10,1371 /journal.pone.0128864
Academic Editor: Wilfried A. Kues, Friedrich-Loeffler-instituutti, SAKSA
vastaanotettu 15 joulukuuta 2014; Hyväksytty: 03 toukokuu 2015; Julkaistu: 01 heinäkuu 2015
Copyright: © 2015 Schook et al. Tämä on avoin pääsy artikkeli jaettu ehdoilla Creative Commons Nimeä lisenssi, joka sallii rajoittamattoman käytön, jakelun ja lisääntymiselle millä tahansa välineellä edellyttäen, että alkuperäinen kirjoittaja ja lähde hyvitetään
Data Saatavuus: kaikki asiaankuuluvat tiedot ovat sisällä paperia ja koko RNA-seq tiedot saatavilla ArrayExpress tietokannassa (www.ebi.ac.uk/arrayexpress) hakunumerolla E-MTAB-3382.
Rahoitus: Tätä työtä tukivat seuraavat: Kiina Scholarship neuvosto (CSC): WH; Brasilian stipendiohjelmassa ”Science ilman rajoja” edistää National Counsel tekninen ja tieteellinen kehitys (https://www.iie.org/Programs/Brazil-Scientific-Mobility): FMR, TVC ja FKS; American Cancer Society (https://www.cancer.org/research/applyforaresearchgrant/) (ACS178898): YL; American Cancer Society (https://www.cancer.org/research/applyforaresearchgrant/) (ACS178898): CMC; Yhdysvaltain National Institutes of Health (https://grants.nih.gov/grants/oer.htm) (CA123031) ja Edward Spiegel Fund on lymfooma Foundation (https://www.lymphomafoundation.org/): CMC; United States Department of Agriculture (USDA) (https://www.csrees.usda.gov/) (AG 58-5438-2-307), Yhdysvaltain National Institutes of Health (https://grants.nih.gov/avustukset /oer.htm) (CA 153.132), Edward William Jane Marr Gutgsell Foundation (https://provost.illinois.edu/about/chairs.html), ja osuuskunnan tutkimusohjelma maatalouden Science Technology Development (https://www.csrees.usda.gov/)(PJ009103); Maaseudun kehittäminen hallinto, Korean tasavalta (https://www.rda.go.kr/foreign/eng/): LBS; ja US National Institutes of Health (U42 OD011140): RSP. Rahoittajat ollut mitään roolia tutkimuksen suunnittelu, tiedonkeruu ja analyysi, päätös julkaista tai valmistamista käsikirjoituksen.
Kilpailevat edut: Kirjoittajat ovat ilmoittaneet, etteivät ole kilpailevia intressejä ole.
Johdanto
suuri eläinmallissa syövän olisi hyödyllistä asetuksista vaativat koko, anatomia, aineenvaihduntaan tai genetiikkaa heijastava ihmisten, kuten tutkimuksiin invasiivisen kuvaohjatut teknologioita, säteily onkologia, lääkeainemetaboliaan, kirurgikoulutuksen, teknologian kehitys (esim seurantatutkimuksen), vain muutaman [1,2]. Tässä suhteessa sika on ihanteellinen suuri eläin pohjan kehittää tällaista mallia. Nämä ovat suuria nisäkkäitä samanlaisia anatomian ihmisille [1,2]. Molemmat perusinsuliininsa aineenvaihdunta kiihtyy ja niiden xenosensor pregnaania X-reseptori, joka säätelee
CYP3A
ilme, joka vastaa metaboliaan puolet kaikista reseptilääkkeiden [3], ovat myös hyvin samankaltaisia ihmisille [4,5]. Kuten ihmisillä, siat myös vaativat useita geneettisiä muutoksia syövän kehittymiseen [6].
Kehittää sian malli syövän, päätimme kerrata ne mutaatiot, yleisimmin todettu ihmisen syövän. Aiemmin olimme osoittaneet, että ihmisen mutaatiot kun annetaan geeniekspressiotutkimuksissa käyttäen autologisia sian fibroblasteja johti onkogeenien molecularly samankaltainen kuin ihmisillä ja vastaavien patologian [6]. Tässä tutkimuksessa olemme kohdistettu
RAS
geeni, joka on mutatoitunut neljännes kaikista ihmisen syövistä, jossa
KRAS
isoformin ollessa yleisimmin mutatoitunut [7], jolloin saadaan konstitutiivisesti aktiivinen, onkogeeniset proteiini [7], että kokeellisesti aiheuttaa syöpää hiirillä [8] ja ihmisen soluja [9], lisäksi taustalla useita perinnöllisiä syöpien hoitamiseksi [10]. Geeni
TP53
on mutatoitunut kolmasosa ihmisen syövissä [11] vaientaa tämän kasvain tukahduttava reitin, mikä samalla tiedetään edistää syövän sekä hiiren [12] ja sian [13] geneettisten mallien sekä ihmissoluissa [9], ja liittyy syöpään alttius Li-Fraumeni oireyhtymä [14]. Mutaatiot näissä kahdessa geenejä esiintyy konsertissa ihmisen syövissä (COSMIC) [15]. Lisäksi hiiret geneettisesti läpikäydä rekombinaatiota muuttamaan villityypin
Kras
ja
TP53
alleelien kasvaimia ja hallitseva negatiiviset tai null versioita, vastaavasti, nopeasti kehittyä aggressiivinen syövät at sivustoja rekombinaatio [16,17]. Mitä tulee sikoja, sekä onkogeenisiä
Kras
ja dominanttinegatiivivaikutus
p53
edistää kasvaimia muuntaminen normaalien sian soluja kasvaimia tilaan [6], ja siat suunniteltu kanssa mutantti TP53 alleeli ovat alttiita kehittämään lymfoomat ja osteogeenisen kasvaimia [13]. Viimeksi ehdollisesti aktivoitu kasvaimia synnyttävän KRAS mutaatio sioissa on raportoitu [18]. Sinänsä päätimme insinööri sikojen indusoituvan ilmentymisen näistä yleisesti muuntunut ja voimakas onkogeeni ja tuumorisuppressorigeeneille.
Tulokset
luominen oncopigs koodaavat indusoituvia onkogeeninen KRAS ja dominanttinegatiivivaikutus TP53
Jos haluat luoda indusoituvaa sian malli syövän, jota termi ”oncopig”, ensin kloonattiin sian
KRAS
ja
TP53
cDNA päässä Duroc sika (2-14, TJ Tabasco), jota käytettiin sekvensoimaan sian genomin [19]. Kohdennettu mutageneesi käytettiin sitten esitellä onkogeenisen G12D mutaatio sian
KRAS
cDNA. Tämä mutaatio valittiin asparagiinihapon korvaaminen osuus on yli kolmannes mutaatioiden G12 asemassa ihmisen syövissä [7] ja Kyseisellä mutaatio hiiren endogeenisen
Kras
geeni edistää kasvainten synnyssä [8,20] . Samoin R167H mutaatio valittiin sen ihmisen vastaavan (R175H) on yleisesti todettu ihmisen syövissä, [11], samoin kuin syövän alttiuden Li-Fraumeni oireyhtymä [14], ja kun se tuodaan endogeeniseen hiiren [12], tai sian [ ,,,0],13]
TP53
geenin, aiheuttaa kasvaimia. Nämä kaksi cDNA johdettiin sitten Cre-indusoituva vektori, jolloin saatiin ilmentymisrakenne, joka sisälsi CAG-promoottorin, jota seuraa edellä mainitun LSL sekvenssin,
KRAS
G12D
, IRES-sekvenssi jotta bisistroninen ilmaisun
TP53
R167H
ja poly-A-sekvenssin (kuvio 1a). Tämä muotoilu mahdollistaa koekspressoimalla molemmat
KRAS
G12D
ja
TP53
R167H
in näennäisesti tahansa soluissa sika ohimenevä infektio AdCre, mikä periaatteessa pitäisi sallia induktion monenlaisten syöpien tietyissä kudokseen sivustoja ja valitun ajan.
(
) kaavakuva, joka koodaa Cre-indusoituva
KRAS
G12D
ja
TP53
R167H
. (
b
) PCR-analyysi läsnäolo
KRAS
G12D
ja
TP53
R167H
genomisessa DNA eristettiin osoitti kloonatun jälkeläisiä.
Normaali sian alkion fibroblastit [21] transfektoitiin edellä mainittu plasmidi ja transfektoitiin stabiilisti solun kloonit valittiin G418-täydennetty väliaine. Genominen DNA solusta pesäkkeistä käytettiin tarkistaa läsnäolo molempien siirtogeenien (
KRAS
G12D
ja
TP53
R167H
) PCR määritettiin käyttämällä spesifisiä alukkeita nämä opintosuoritusotteet, ja sittemmin laajennettiin lähde ytimiä tumansiirron. Nuclei Näistä soluista eristettiin sitten ja siirrettiin enukleoidaan sian varhaismunasolujen ja alkionkehityksen päällä, prosessin kutsutaan somaattisten solujen tuman siirron (SCNT) [21]. Kaikkiaan 100 tällaista alkiot siirrettiin korvike kylvää, joka tuotti neljä miespuolista oncopig jälkeläisiä (63-1, 63-2, 63-3, 63-4). PCR-analyysi eristetyn genomisen DNA: n käyttäen alukkeita, jotka ovat spesifisiä näiden siirtogeenien vahvisti stabiiliin integroitumiseen
KRAS
G12D
ja
TP53
R167H
cDNA (kuvio 1 b).
Cre aktivointi
KRAS
G12D
ja
TP53R167H
siirtogeenien fibroblasteissa, jotka ovat peräisin oncopigs on muuttamassa
Sen arvioimiseksi, onko
KRAS
G12D
ja
TP53
R167H
siirtogeenien voisi olla aktivoitu edistää kasvaimien syntyyn, ihon biopsiat eristettiin edellä mainituista neljästä oncopig jälkeläisiä, ja käytetään muodostamaan fibroblastien linjat. Nämä yksittäiset solulinjat siirtogeenisistä oncopigs infektoitiin joko koodaava adenovirus markkeri vihreä fluoresoiva proteiini (AdGFP) tai adenovirus, joka koodaa Cre-rekombinaasia (AdCre), ja tuloksena pareittain tartunnan viljelmistä analysoitiin transformoitiin ja tuumorigeenisiä fenotyyppejä. Kuten odotettua, vain AdCre altistuneet solut osoittivat havaittavia määriä
KRAS
G12D
ja
TP53
R167H
mRNA, kuten arvioidaan RT-PCR: llä (kuvio 2a). Lisäksi, oli selvä ero morfologia AdCre solujen kontrolliin verrattuna AdGFP soluja. Erityisesti, entinen menetti karan morfologia ominaisuus joko samoissa soluissa ennen AdCre infektiota tai infektoitiin AdGFP ohjaus virus, ja sen sijaan olivat pienempiä, pyöreämpiä paljon löysästi kiinnitetty levyyn ja se spontaanisti muodostaa pesäkkeitä (kuvio 2
B
). Tämä ero enteili muut fenotyyppi on muuntunut. Tarkemmin, FACS-analyysi paljasti keskimääräisen solusyklin kaikkien neljän riviä lyhennettiin 22 tuntia AdGFP ohjaus väestöstä 13 tuntia AdCre väestöstä (kuvio 2c). AdCre solut myös omasivat keskimääräisen 2,8 kertainen nousu solujen kulkeutumista kaikki neljä riviä koko ajan kuluessa havainnon (kuvio 2d), joka arvioidaan naarmu määrityksen, ja tuotti keskimäärin 143 pesäkettä maljattaessa pehmeässä agarissa verrattuna ei pesäkkeet havaitaan kontrolli AdGFP soluja (kuvio 2e). Olemme päätellä, että fibroblasti linjat kehitetty itsenäisesti johdettu
KRAS
G12D Twitter /
TP53
R167H
oncopig kloonit indusoitiin olevan transformoitu aktivoitaessa ilmentymistä näiden siirtogeenien Cre-rekombinaasilla. AdGFP käsitelty siirtogeenisten solujen yllä fenotyyppejä samanlaisia kuin ei-siirtogeenisten solulinjoissa.
(
) RT-PCR-analyysi
KRAS
G12D
ja
TP53
R167H
mRNA: n ilmentymisen on fibroblastisolulinjat kustakin 4 siirtogeenisten kloonien käsitelty AdCre tai AdGFP. (
b
) vertailu solumorfologian välillä AdCre ja käsittelemättömän verrokin viljeltyjen solujen värjättiin H * p-arvo ≤ 0,05 ; ** p-arvo ≤ 0,01).
Cre aktivointi
KRAS
G12D
ja
TP53
R167H
siirtogeenien fibroblasteissa johdettu oncopigs on tuumorigeenisen
rohkaisemana kehittämällä fenotyyppi on muuntunut, me seuraavaksi arvioitava AdCre voisi aiheuttaa edellä fibroblastien kasvaa kasvaimia tavalla. Näin ollen, AdCre käsitellyt solut, jotka ovat peräisin neljästä toisistaan riippumattomasti johdettu siirtogeenisten oncopigs injektoitiin immuunivajavaisissa naarashiirillä ja injektiokohdan tarkkailtiin kasvainten kehittymisen. Kouraantuntuva kasvaimet olivat saavuttaneet 2000 mm
3 (maksimaalinen sallittu koko) välillä 32 ja 63 päivää injektion-täydellinen penetrance päivää (taulukko 1). Sitä vastoin ei havaittu kasvaimia havaittiin kohdissa, joihin injektoitiin soluja siirtogeenisestä oncopig käsiteltyjen solujen AdGFP yli 130 päivän ajan havainnon (Taulukko 1). Olemme päätellä, että fibroblastit eristetty itsenäinen
KRAS
G12D Twitter /
TP53
R167H
oncopigs indusoitiin olevan kasvaimia synnyttäviä aktivoinnin ilmentymisen näiden siirtogeenien Cre rekombinaasilla. Kasvainmassat johtuvat AdCre aktivoinnin solujen siirtogeenisestä oncopigs (kuvio 3) paljasti kohdassa sekä korkean että matalan suurennus näyttöä kiinteä kasvain (kuvio 3b) ja ei ollut seurausta tulehduksesta tai nesteen kertymistä.
Samanlaisia kasvaimia (a) kehittynyt kaikilta AdCre solulinjoista eikä kasvaimia kehittyi AdGFP solun injektiot; Histologinen analyysi (b) paljasti kasvaimia olla tiheästi solujen non kapseloitu ja infiltratiivinen kasvain. 10x ja aseta 40X H (G-i) H in olevaa kudosta (d-f); tai kun histologinen tutkimus (g-i).
Eri kasvaintyypeille voidaan indusoituu oncopig perustuu pistoskohdan on AdCre
Tutkiakseen, onko injektio AdCre muissa kudoksissa voi johtaa kasvaimia, joka on kives on oncopig-1 sai injektiona AdCre. Jälleen käsin kosketeltavan massa havaittiin 10 päivää injektion jälkeen, että nopeasti kehittynyt kasvain (kuvio 4
c
, 4
f
, 4
i
ja taulukko 2) . Histopatologia tämä kasvain paljastui huonosti eriytetty kasvain todennäköisesti sukupuoleen johto strooman alkuperää. Vastaavasti korvan, vatsan ja kaulan oncopig-3 injektoitiin subkutaanisesti AdCre, mikä johti jälleen kasvainmassoja kaikissa kolmessa sivustoja patologian sarkooma alueellisiin sileän lihaksen eriytyminen (leiomyosarkooma) (kuvio 4
b
, 4
e
, 4
h
ja taulukko 2). Siten anto AdCre toistettavasti aiheuttamaa tuumorigeneesiä siirtogeenisissä oncopigs kussakin injektiokohdassa. Anto AdGFP muiksi oncopigs ei johtanut sukupolven syöpäkasvaimen tai patologian (kuvio 5).
Keskustelu
sika on monia ominaisuuksia, jotka tekevät siitä ihanteellisen alustan kehittää geneettisesti määritelty, suuri eläinmallissa syöpä. Nyt raportoivat luomista siirtogeenisen oncopig linja koodaa Cre rekombinaasia indusoituvan koodaavan siirtogeenin
KRAS
G12D
ja
TP53
R167H
, yleisesti mutatoitunut onkogeeni [7] ja tuumorisuppressoriproteiinia [11], vastaavasti, ihmisen syövissä. Tämä tutkimus on jatkoa meidän edellisestä työstä [6] jossa osoitimme, että mutaatioita geeneissä tunnistettu ihmisen tutkimuksissa kun työnnetään sian geenit eivät johda kasvaimen synnyssä ja patologian että toistettu kasvainten kliinisesti.
validointi sian syöpä eläinmalli on välttämätöntä, että tuloksena kasvaimen massojen validoidaan, mitä havaitaan ihmisten lääkinnässä. Tämä tarve on selvästi julki Cardiffissa [22-24], joissa neoplastiset etenemistä hiirellä rintasyöpään käytetään ihmisen mutaatiot eivät jäljitellä kasvainten klinikalla. Näin ollen tämä tutkimus keskittyi osoittaa, että geneettisesti sian kasvaimia aiheuttaa histopatologisia fenotyyppejä, jotka ulottuvat allekirjoitus fenotyyppejä ja jäljittelee ihmisen syöpiin [24].
Näin sian malli vahvistanut sen osoittaminen, että johdettu fibroblasteista siirtogeenisiä oncopigs käsitelty AdCre osoittivat aktivointi siirtogeenin, joka johtaa kaikki
in vitro
tunnusmerkkejä kasvaimia, kuten transformoitu solu morfologia, lisääntynyt proliferaatio ja migraatio, ja kyky kasvuun kiinnityskohdassa-riippumaton muoti. Yhteisymmärryksessä, nämä solut olivat erittäin tuumorigeenisia kun irrotetut osaksi heikentynyt immuniteetti hiirissä. Tämä vaikutus oli erittäin toistettava, vastaan puhuu hankinta ainutlaatuinen geneettinen tausta altistavia solulinjan tulla muuttaneet, koska sama fenotyypit havaittiin saaduissa fibroblasteissa yhteensä neljä yksittäisten oncopigs. Yhdessä nämä tiedot tukevat päätelmää, että johdettu oncopig fibroblastit ovat indusoitavasti tuumorigeenisia.
Yhdenmukainen kykyä johdettujen oncopig fibroblastien olla tuumorigeenisia, injektio lihakseen AdCre siirtogeenisiin oncopigs johti kehittämään mesenkymaaliset kasvain viittaavia leiomyosarkooma klo injektiokohdassa. Tämäkin tulos oli erittäin toistettava, noudatetaan paitsi eri paikkaan saman sika, mutta myös eri pesuetoverissa oncopigs. Koska leiomyosarkooma ovat sileän lihaksen alkuperää, oletettavasti nämä kasvaimet syntyi infektion tämän lihaksen tyyppisen, ehkä verisuonistossa tai piloerektorilihaksiin. AdCre ruiskutus kivekset synnytti eriytettyä kasvain todennäköisesti sukupuoleen johto strooman alkuperää. Lisäksi, ei valvonta ei-siirtogeenisiä sikoja injektoitu AdCre eikä ohjaus oncopigs injektoitiin AdGFP kehittänyt syöpäkasvaimen tai patologisia muutoksia. Yhdessä nämä tiedot tukevat päätelmää, jonka aktivoinnin solujen in vivo AdCre indusoi kasvainten synnyssä. Lisäksi nämä tiedot viittaavat myös siihen, että induktio rekombinaation muissa kudoksissa,
nähden suhteessa
toimitus AdCre eri keinoin kuin sitoutunut tässä tai tulevaisuudessa kudosten vapaan ilmentymisen Cre siirtogeenin, voidaan johtaa monia muita syöpiä. Sellaisenaan tämä ”oncopig” linja tarjoaa geneettisesti tempervalurautaisten malli mahdollisesti monenlaisia syöpiä, joita pitäisi olla korvaamaton tutkimuksiin haitanneet puute suuren eläinmallin syöpää.
Materiaalit ja menetelmät
Kaikki eläin työ tehtiin noudattaen niitä kansallisia ja kansainvälisiä ohjeita. Kaikki eläinkokeet ja menettelyt hyväksyttiin University of Illinois Institutional Animal Care ja Käytä komitean (IACUC; pöytäkirja numerot 11221 sian ja 12170 hiiren tutkimukset).
kloonaus ja sekvensointi sian
KRAS
ja
TP53
geenien TOPO-sukkulavektoriin
TJ Tabasco sian luuytimen solut eristettiin ja pakastettiin -80 ° C: ssa. Kokonais-RNA uutettiin näistä solujen RNeasy mini kit (QIAGEN, CA), 1 ug joista käänteiskopioitiin cDNA kanssa QuantiTect Reverse Transcription Kit (QIAGEN, CA). Ensembl genomin selaimen käytettiin suunnitella PCR-alukesekvenssit monistamiseen sian erityisiä
KRAS
(ENSSSCG00000000561) ja
TP53
geenejä (ENSSSCT00000019534). Eteenpäin ja taaksepäin-aluke sekvenssejä
KRAS
olivat 5′-CTGCTGAAAATGACTGAATATAAACTT-3 ’ja 5′-TTACATAATTATACACTTTGTCTTTGA-3’, vastaavasti. PCR lämpökäsittelyyn edellytykset
KRAS
vahvistus oli 94 ° C: ssa 10 min, jota seurasi 30 sykliä 94 ° C 30 sekuntia, 55 ° C: ssa 3 min, ja 65 ° C 1 min, jossa on lopullinen 72 ° C: ssa vaiheessa 10 min. Eteenpäin ja taaksepäin aluketta käytetyt sekvenssit
TP53
olivat 5′-TGCAATGGCGGAGTCGCAG-3 ’ja 5′-TCAGTCTGAGTCAGGTCCTTC-3’, vastaavasti. PCR lämpökäsittelyyn olosuhteet olivat 94 ° C: ssa 10 min, jota seurasi 30 sykliä 94 ° C 30 sekuntia, 55 ° C 30 sekuntia, ja 68 ° C 1 min ja sen lopullinen 72 ° C vaiheessa 10 min.
ACTB
käytettiin endogeenista ohjaus. Eteenpäin ja taaksepäin-aluketta sekvenssien käytettiin 5′-GACATCCGCAAGGACCTCTA-3 ’ja 5′-ACATCTGCTGGAAGGTGGAC-3’, vastaavasti. PCR-olosuhteet olivat täysin samat kuin
TP53
. PCR-monistettiin
KRAS
ja
TP53
cDNA kloonattiin sitten pCR2.1-TOPO vektoreita käyttäen TOPO TA-kloonausvektoriin mukainen pakkaus valmistajan ohjeiden (Invitrogen, CA) ja cDNA: iden vahvistettu olevan 100% nukleotidin identiteetti sian
KRAS
ja
TP53
(https://useast.ensembl.org/index.html).
mutageneesiä on
KRAS
ja
TP53
cDNA
QuikChange Site-Directed Mutagenesis Kit (Stratagene, CA) käytettiin tehdä muutoksia nukleotidisekvenssiin, joka vastaa G12D mutaatio kloonattiin sian
KRAS
cDNA ja R167H mutaatio kloonatun sian
TP53
cDNA. Käytetyt alukkeet tuottaa G12D mutaatio
KRAS
olivat 5′-TGGTAGTTGGAGCTGATGGCGTAGGCAAGAG-3 ’ja 5′-CTCTTGCCTACGCCATCAGCTCCAACTACCA-3’. Käytetyt alukkeet tuottaa R167H mutaatio
TP53
olivat 5′-GAGGTGGTGAGGCACTGTCCCCACCAT-3 ’ja 5′-ATGGTGGGGACAGTGCCTCACCACCTC-3’. Mutaatiot varmistettiin sekvensoimalla.
kloonaus
KRAS
G12D
ja
TP53
R167H
cDNA osaksi pIRES vektoriin
Edellä mainitut
KRAS
G12D
cDNA monistettiin PCR: llä alukkeilla 5′-CTAGCTAGCTAGCTGCTGAAAATGACTGAATAT-3 ’ja 5′-CCGCTCGAGCGGTTACATAATTATACAC-3’ 30 sykliä 94 ° C 1 min, 94 ° C 30 sekuntia, 60 ° C 1 min, ja 68 ° C 1 min, ja tuloksena saatu fragmentti kloonattiin Nhel ja Xhol pIRESiin (Clontech, CA ). Edellä mainittujen
TP53
R167H
cDNA monistettiin PCR: llä alukkeilla 5′-ACGCGTGGACGTCTTGGCCATATGCAATGGAGGA3 ’ja 5′-ATAAGAATGCGGCCGCTAAACTATTCAGTCTGAGTCAGGTCC-3’ 30 sykliä 94 ° C 1 min, 94 ° C: ssa 30 sekuntia, 65 ° C 1 min, ja 68 ° C 1 min, ja tuloksena saatu fragmentti kloonattiin
Sal
I ja
Ei
I-kohtiin pIRES sisälsi
KRAS
G12D
cDNA. cDNA-sekvenssit on
KRAS
G12D
ja
TP53
R167H
vahvistettiin oikein tuloksena vektori sekvensoimalla.
Cloning CAG-promoottorin osaksi loxP-STOP (polyA) -loxP sisältävän vektorin
pkw15 sisältävä plasmidi CAG-promoottorin ja pkw13 plasmidin, joka sisältää loxP-STOP (polyA) -loxP käytettiin vektorin rakentaminen. CAG-promoottorin, eristettiin Spel /MfeI ruoansulatusta ja kloonattiin pkw13 plasmidin Spel /EcoRI-kloonauskohdilla.
rakentaminen indusoituvan
KRAS
G12D
ja
TP53
R167H
oncopig ekspressiovektorin
KRAS
G12D
–
TP53
R167H
-pIRES vektori pilkottiin PvuI ja NheI, ja tuloksena
KRAS
G12D
-IRES-
TP53
R167H
-polyA fragmentit puhdistettiin geelillä ja kloonattiin CAG-LSL-pkw13 vektoreihin PacI /Nhel-sivustoja. cDNA-sekvenssit on
KRAS
G12D
ja
TP53
R167H
lopullisessa vektori vahvistettiin oikein tuloksena vektoriin sekvensointi.
Generation sikiön fibroblastien kantojen
Male sikiön fibroblasteja solujen FFCS () kohteesta Minnesota miniatyyri siat (NSRRC: 0005) kerättiin kuvatulla [25] joitakin muutoksia. Lyhyesti, sen jälkeen poistamalla pää ja sisäelimet, sikiö oli jauhettu ja hajotettiin erikseen 20 ml: aan ruoansulatusta median (Dulbeccon Modified Eagle Medium (DMEM), jota oli täydennetty 15% (v /v) naudan sikiön seerumia (FBS), 200 yksikköä /ml kollagenaasia ja 25 yksikköä /ml DNaseI) 4-5 tunnin ajan 38,5 ° C: ssa ja 5% CO
2 ilmassa. Digestoidut solut pestiin DMEM täydennetty 15% FBS: ää (Hyclone, Logan, UT) ja 10 ug /ml gentamysiini, viljeltiin yön yli, ja sitten kerätään ja pakastetaan -80 ° C: ssa FBS täydennetty 10% dimetyylisulfoksidia (DMSO) ( v /v) ja varastoitiin nestemäisessä typessä.
siirtogeenisten solujen
Early kanavan numero metsäsertifiointijärjestelmän FFCs (P1-2) viljeltiin soluviljelmässä (DMEM, johon oli lisätty 15% (v /v) FBS: ää, 2,5 ng /ml emäksistä fibroblastikasvutekijää ja 10 ug /ml gentamysiini) yön yli ja kasvatettiin 75-85% konfluenssiin. Media korvattiin 4 tuntia ennen transfektiota. Metsäsertifiointijärjestelmän FFCs pestiin 1-2 min fosfaattipuskuroidulla suolaliuoksella (PBS; Invitrogen) ja kerättiin 0,05% trypsiini-EDTA: ta (Invitrogen, 1 ml per 75cm
2 pulloon). Solut suspendoitiin uudelleen solujen elatusaineeseen, pelletoitiin 600 x g 10 minuuttia, suspendoitiin uudelleen 10 ml Opti-MEM (Invitrogen), ja kvantitoitiin sitten hemosytometrillä ja pelletoitiin. Solut suspendoitiin uudelleen transfektointiväliainetta (75% cytosalts [120 mMKCl, 0,15 mM CaCl
2, 10 mM K
2HPO4, pH 7,6, 5 mM MgCl
2] [26] ja 25% Opti-MEM [Gibco BRL, Grand Island, NY)]. Solupitoisuus säädettiin 1 x 10
6 solua /ml ja 200 ui solut ko-transfektoitiin elektroporaatiolla käyttäen linearisoitua mutantti
KRAS
ja
TP53
rakentamiseksi, joka sisältää Neo valittavissa kasetti (2 ug). Elektroporaatiota käytetään kolme peräkkäistä 250-V, 1 ms kanttia pulsseja antaa sekä BTX ECM 2001 (BTX, San Diego, CA) on 2 mm: n rako kyvettiin. Elektroporaation jälkeen solut maljattiin 100 mm: n malja 3000 solua per malja soluviljelyelatusainetta. Sen jälkeen, kun 36 tuntia, solut valikoitiin lisäämällä genetisiiniä (G418, 400 ug /ml) 10-14 päivä, kunnes muodostumista solun pesäkkeitä. Genomi-DNA: ta solun pesäkkeistä käytettiin läsnäolon varmistamiseksi sekä siirtogeenien PCR: llä. Nämä solut sitten varastoitiin nestemäisessä typessä käyttöön asti, koska luovuttajan solujen SCNT.
Munasolut kypsymisen, SCNT, ja alkion jälleenrakennukseen
Fibroblast solujen tunnistettu olevan integraation siirtogeenien (
KRAS
ja
TP53
) käytettiin luovuttajan solujen SCNT osaksi enukleoidaan oosyytteihin seuraa sähkö- fuusio ja aktivointi kuten aikaisemmin on kuvattu [27]. Lyhyesti, cumulus-oosyytti solu kompleksit (yhdistelmäehkäisytabletit) saatiin vaiheen I kypsymisen väliaineen ART Inc. (Madison, WI) noin 24 tuntia sadonkorjuun jälkeen. Yhdistelmäehkäisytablettien viljeltiin sitten tuoreeseen vaiheen II kypsymistä väliaine yhteensä 40 tuntia kostutetussa ilmakehässä 5% CO
2 38,5 ° C: ssa. I ja II vaiheen väliaineen toimitti ART Inc. laajennettu yhdistelmäehkäisytablettivalmisteet olivat sitten pyöritettiin 0,1% hyaluronidaasia Hepes-puskuroidussa Tyroden väliaineessa, joka sisälsi 0,01% PVA 4 min poistamiseksi cumulus-solut.